| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| XP_004136028.1 serine/arginine-rich-splicing factor SR34 isoform X1 [Cucumis sativus] | 1.2e-134 | 86.15 | Show/hide |
Query: MSGRASRTIYVGNLPGDIREKEVDDLFYKYGRIAHIELKVPPRPPGYAFVEFEDSEDAEDAIRGRDGYDFDGHRLRVELAHGGRGHSSSSDRYSSQGGSR
MS RASRT+YVGNLPGDIREKEV+DLFYKYGRIAHI+LKVPPRPPGYAFVEFED+EDA+DAIRGRDGYDFDGHRLRVELAHGGRGHSSS+DRYSS GGSR
Subjt: MSGRASRTIYVGNLPGDIREKEVDDLFYKYGRIAHIELKVPPRPPGYAFVEFEDSEDAEDAIRGRDGYDFDGHRLRVELAHGGRGHSSSSDRYSSQGGSR
Query: GARGVSRRTDFRVLVSGLPSSASWQDLKDHMRRAGDVCFAQVFRDGSGTTGIVDYTNSDDMKYAIKKLDDSEFRNAFSRSYVRVREYDSKRDLSRSPSRG
G RGVSRR+D+RVLV+GLPSSASWQDLKDHMRRAGDVCF+QVFRDGSGTTGIVDYTN DDMKYAIKKLDDSEFRNAFSR+YVRVREYDSKRDLSRSPSRG
Subjt: GARGVSRRTDFRVLVSGLPSSASWQDLKDHMRRAGDVCFAQVFRDGSGTTGIVDYTNSDDMKYAIKKLDDSEFRNAFSRSYVRVREYDSKRDLSRSPSRG
Query: RSRSRGRSYSRS----RSRSKSRSRSKSPKAKSSRRSPVKSRSRSASPARSRSKSSSLSGSRSRSRSPVPNREKRASKSPKRRDASKSPKRRDASKSPKR
RS SRGRSYSRS RSRSKS SRSKSPKAK S+RSPVKSRSRSASP RSRSKSSSLSGSRSRSRSPVPNREKR SKSPKRRDASKSP R
Subjt: RSRSRGRSYSRS----RSRSKSRSRSKSPKAKSSRRSPVKSRSRSASPARSRSKSSSLSGSRSRSRSPVPNREKRASKSPKRRDASKSPKRRDASKSPKR
Query: RDASKSPSRSRSRSRSMSKSKSPTR
SRSRSRS+S SKSKSP+R
Subjt: RDASKSPSRSRSRSRSMSKSKSPTR
|
|
| XP_008451568.1 PREDICTED: serine/arginine-rich-splicing factor SR34-like isoform X1 [Cucumis melo] | 5.9e-137 | 87.69 | Show/hide |
Query: MSGRASRTIYVGNLPGDIREKEVDDLFYKYGRIAHIELKVPPRPPGYAFVEFEDSEDAEDAIRGRDGYDFDGHRLRVELAHGGRGHSSSSDRYSSQGGSR
MS RASRT+YVGNLPGDIREKEV+DLFYKYGRIAHI+LKVPPRPPGYAFVEFED+EDA+DAIRGRDGYDFDGHRLRVELAHGGRGHSSSSDRYSS GGSR
Subjt: MSGRASRTIYVGNLPGDIREKEVDDLFYKYGRIAHIELKVPPRPPGYAFVEFEDSEDAEDAIRGRDGYDFDGHRLRVELAHGGRGHSSSSDRYSSQGGSR
Query: GARGVSRRTDFRVLVSGLPSSASWQDLKDHMRRAGDVCFAQVFRDGSGTTGIVDYTNSDDMKYAIKKLDDSEFRNAFSRSYVRVREYDSKRDLSRSPSRG
G RGVSRR+D+RVLV+GLPSSASWQDLKDHMRRAGDVCF+QVFRDGSGTTGIVDYTN DDMKYAIKKLDDSEFRNAFSR+YVRVREYDSKRDLSRSPSRG
Subjt: GARGVSRRTDFRVLVSGLPSSASWQDLKDHMRRAGDVCFAQVFRDGSGTTGIVDYTNSDDMKYAIKKLDDSEFRNAFSRSYVRVREYDSKRDLSRSPSRG
Query: RSRSRGRSYSRS----RSRSKSRSRSKSPKAKSSRRSPVKSRSRSASPARSRSKSSSLSGSRSRSRSPVPNREKRASKSPKRRDASKSPKRRDASKSPKR
RS SRGRSYSRS RSRSKS SRSKSPKAKSS+RSPVKSRSRSASPARSRSKSSSLSGSRSRSRSPVPNREKR SKSPKRRDASKSP R
Subjt: RSRSRGRSYSRS----RSRSKSRSRSKSPKAKSSRRSPVKSRSRSASPARSRSKSSSLSGSRSRSRSPVPNREKRASKSPKRRDASKSPKRRDASKSPKR
Query: RDASKSPSRSRSRSRSMSKSKSPTR
S+S SRSRSRS+S SKSKSP+R
Subjt: RDASKSPSRSRSRSRSMSKSKSPTR
|
|
| XP_022148198.1 serine/arginine-rich-splicing factor SR34-like isoform X1 [Momordica charantia] | 1.1e-135 | 87.04 | Show/hide |
Query: MSGRASRTIYVGNLPGDIREKEVDDLFYKYGRIAHIELKVPPRPPGYAFVEFEDSEDAEDAIRGRDGYDFDGHRLRVELAHGGRGHSSSSDRYSSQGGSR
MS RASRT+YVGNLPGDIREKEV+DLFYKYGRIAHI+LKVPPRPPGYAFVEFED+EDA+DAIRGRDGYDFDGHRLRVELAHGGRGHSSSSDRYSS GGSR
Subjt: MSGRASRTIYVGNLPGDIREKEVDDLFYKYGRIAHIELKVPPRPPGYAFVEFEDSEDAEDAIRGRDGYDFDGHRLRVELAHGGRGHSSSSDRYSSQGGSR
Query: GARGVSRRTDFRVLVSGLPSSASWQDLKDHMRRAGDVCFAQVFRDGSGTTGIVDYTNSDDMKYAIKKLDDSEFRNAFSRSYVRVREYDSKRDLSRSPSRG
G RGVSRR+D+RVLV+GLPSSASWQDLKDHMRRAGDVCF+QVFRDGSGTTGIVDYTN DDMKYAIKKLDDSEFRNAFSRSYVRVREYDSKRDLSRSPSRG
Subjt: GARGVSRRTDFRVLVSGLPSSASWQDLKDHMRRAGDVCFAQVFRDGSGTTGIVDYTNSDDMKYAIKKLDDSEFRNAFSRSYVRVREYDSKRDLSRSPSRG
Query: RSRSRGRSYSRS----RSRSKSRSRSKSPKAKSSRRSPVKSRSRSASPARSRSKSSSLSGSRSRSRSPVPNREKRASKSPKRRDASKSPKRRDASKSPKR
RS SRGRSYSRS RSRSKSRSRSKSPKAKSS+RSPVKSRSRSASPARSRSKSSSLSGSRSRSRSP+PNR KR SKSPKRRDASKSP R
Subjt: RSRSRGRSYSRS----RSRSKSRSRSKSPKAKSSRRSPVKSRSRSASPARSRSKSSSLSGSRSRSRSPVPNREKRASKSPKRRDASKSPKRRDASKSPKR
Query: RDASKSPSRSRSRSRSMSKSKSPT
S+SRSRSRS SKSKSP+
Subjt: RDASKSPSRSRSRSRSMSKSKSPT
|
|
| XP_023547992.1 serine/arginine-rich-splicing factor SR34-like [Cucurbita pepo subsp. pepo] | 2.7e-134 | 86.15 | Show/hide |
Query: MSGRASRTIYVGNLPGDIREKEVDDLFYKYGRIAHIELKVPPRPPGYAFVEFEDSEDAEDAIRGRDGYDFDGHRLRVELAHGGRGHSSSSDRYSSQGGSR
MS RASRT+YVGNLPGDIREKEV+DLFYKYGRIAHI+LKVPPRPPGYAFVEFED+EDA+DAIRGRDGYDFDGHRLRVELAHGGRGHSSSSDRYSS G SR
Subjt: MSGRASRTIYVGNLPGDIREKEVDDLFYKYGRIAHIELKVPPRPPGYAFVEFEDSEDAEDAIRGRDGYDFDGHRLRVELAHGGRGHSSSSDRYSSQGGSR
Query: GARGVSRRTDFRVLVSGLPSSASWQDLKDHMRRAGDVCFAQVFRDGSGTTGIVDYTNSDDMKYAIKKLDDSEFRNAFSRSYVRVREYDSKRDLSRSPSRG
G RGVSRR+DFRVLV+GLPSSASWQDLKDHMRRAGDVCF+QVFRDGSGTTGIVDYTN DDMKYAIKKLDDSEFRNAFSRSYVRVREYDSKRD S+SPSRG
Subjt: GARGVSRRTDFRVLVSGLPSSASWQDLKDHMRRAGDVCFAQVFRDGSGTTGIVDYTNSDDMKYAIKKLDDSEFRNAFSRSYVRVREYDSKRDLSRSPSRG
Query: RSRSRGRSYSRS----RSRSKSRSRSKSPKAKSSRRSPVKSRSRSASPARSRSKSSSLSGSRSRSRSPVPNREKRASKSPKRRDASKSPKRRDASKSPKR
RS SRGRSYSRS RSRSKSRSRSKSPK KSS+RSPVKSRSRSASPARSRSKSS+LSGSRSRSRSP PNREKR SKSPKRR+ASKSP
Subjt: RSRSRGRSYSRS----RSRSKSRSRSKSPKAKSSRRSPVKSRSRSASPARSRSKSSSLSGSRSRSRSPVPNREKRASKSPKRRDASKSPKRRDASKSPKR
Query: RDASKSPSRSRSRSRSMSKSKSPTR
S+S SRSRSRS+S SKSKSP+R
Subjt: RDASKSPSRSRSRSRSMSKSKSPTR
|
|
| XP_038898762.1 serine/arginine-rich-splicing factor SR34-like isoform X1 [Benincasa hispida] | 1.7e-136 | 87.38 | Show/hide |
Query: MSGRASRTIYVGNLPGDIREKEVDDLFYKYGRIAHIELKVPPRPPGYAFVEFEDSEDAEDAIRGRDGYDFDGHRLRVELAHGGRGHSSSSDRYSSQGGSR
MS RASRT+YVGNLPGDIREKEV+DLFYKYGRIAHI+LKVPPRPPGYAFVEFED+EDA+DAIRGRDGYDFDGHRLRVELAHGGRGHSSSSDRYSS GGSR
Subjt: MSGRASRTIYVGNLPGDIREKEVDDLFYKYGRIAHIELKVPPRPPGYAFVEFEDSEDAEDAIRGRDGYDFDGHRLRVELAHGGRGHSSSSDRYSSQGGSR
Query: GARGVSRRTDFRVLVSGLPSSASWQDLKDHMRRAGDVCFAQVFRDGSGTTGIVDYTNSDDMKYAIKKLDDSEFRNAFSRSYVRVREYDSKRDLSRSPSRG
G RGVSRR+D+RVLV+GLPSSASWQDLKDHMRRAGDVCF+QVFRDGSGTTGIVDYTN DDMKYAIKKLDDSEFRNAFSR+YVRVREYDSKRDLSRSPSRG
Subjt: GARGVSRRTDFRVLVSGLPSSASWQDLKDHMRRAGDVCFAQVFRDGSGTTGIVDYTNSDDMKYAIKKLDDSEFRNAFSRSYVRVREYDSKRDLSRSPSRG
Query: RSRSRGRSYSRS----RSRSKSRSRSKSPKAKSSRRSPVKSRSRSASPARSRSKSSSLSGSRSRSRSPVPNREKRASKSPKRRDASKSPKRRDASKSPKR
RS SRGRSYSRS RSRSKS SRSKSPKAKSS+RSPVKSRSRSASPARSRSKSSSLSGSRSRSRSPVPNREKR SKSPKRRDASKSP R
Subjt: RSRSRGRSYSRS----RSRSKSRSRSKSPKAKSSRRSPVKSRSRSASPARSRSKSSSLSGSRSRSRSPVPNREKRASKSPKRRDASKSPKRRDASKSPKR
Query: RDASKSPSRSRSRSRSMSKSKSPTR
SRSRSRSRS SKSKSP+R
Subjt: RDASKSPSRSRSRSRSMSKSKSPTR
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A1S3BR66 serine/arginine-rich-splicing factor SR34-like isoform X1 | 2.9e-137 | 87.69 | Show/hide |
Query: MSGRASRTIYVGNLPGDIREKEVDDLFYKYGRIAHIELKVPPRPPGYAFVEFEDSEDAEDAIRGRDGYDFDGHRLRVELAHGGRGHSSSSDRYSSQGGSR
MS RASRT+YVGNLPGDIREKEV+DLFYKYGRIAHI+LKVPPRPPGYAFVEFED+EDA+DAIRGRDGYDFDGHRLRVELAHGGRGHSSSSDRYSS GGSR
Subjt: MSGRASRTIYVGNLPGDIREKEVDDLFYKYGRIAHIELKVPPRPPGYAFVEFEDSEDAEDAIRGRDGYDFDGHRLRVELAHGGRGHSSSSDRYSSQGGSR
Query: GARGVSRRTDFRVLVSGLPSSASWQDLKDHMRRAGDVCFAQVFRDGSGTTGIVDYTNSDDMKYAIKKLDDSEFRNAFSRSYVRVREYDSKRDLSRSPSRG
G RGVSRR+D+RVLV+GLPSSASWQDLKDHMRRAGDVCF+QVFRDGSGTTGIVDYTN DDMKYAIKKLDDSEFRNAFSR+YVRVREYDSKRDLSRSPSRG
Subjt: GARGVSRRTDFRVLVSGLPSSASWQDLKDHMRRAGDVCFAQVFRDGSGTTGIVDYTNSDDMKYAIKKLDDSEFRNAFSRSYVRVREYDSKRDLSRSPSRG
Query: RSRSRGRSYSRS----RSRSKSRSRSKSPKAKSSRRSPVKSRSRSASPARSRSKSSSLSGSRSRSRSPVPNREKRASKSPKRRDASKSPKRRDASKSPKR
RS SRGRSYSRS RSRSKS SRSKSPKAKSS+RSPVKSRSRSASPARSRSKSSSLSGSRSRSRSPVPNREKR SKSPKRRDASKSP R
Subjt: RSRSRGRSYSRS----RSRSKSRSRSKSPKAKSSRRSPVKSRSRSASPARSRSKSSSLSGSRSRSRSPVPNREKRASKSPKRRDASKSPKRRDASKSPKR
Query: RDASKSPSRSRSRSRSMSKSKSPTR
S+S SRSRSRS+S SKSKSP+R
Subjt: RDASKSPSRSRSRSRSMSKSKSPTR
|
|
| A0A1S3BRU3 serine/arginine-rich-splicing factor SR34-like isoform X2 | 8.6e-134 | 86.77 | Show/hide |
Query: MSGRASRTIYVGNLPGDIREKEVDDLFYKYGRIAHIELKVPPRPPGYAFVEFEDSEDAEDAIRGRDGYDFDGHRLRVELAHGGRGHSSSSDRYSSQGGSR
MS RASRT+YVGNLPGDIREKEV+DLFYKYGRIAHI+LKVPPRPPGYAFVEFED+EDA+DAIRGRDGYDFDGHRLRVELAHGGRGHSSSSDRYSS GGSR
Subjt: MSGRASRTIYVGNLPGDIREKEVDDLFYKYGRIAHIELKVPPRPPGYAFVEFEDSEDAEDAIRGRDGYDFDGHRLRVELAHGGRGHSSSSDRYSSQGGSR
Query: GARGVSRRTDFRVLVSGLPSSASWQDLKDHMRRAGDVCFAQVFRDGSGTTGIVDYTNSDDMKYAIKKLDDSEFRNAFSRSYVRVREYDSKRDLSRSPSRG
G RGVSRR+D+RVLV+GLPSSASWQDLKDHMRRAGDVCF+QVFRDGS GIVDYTN DDMKYAIKKLDDSEFRNAFSR+YVRVREYDSKRDLSRSPSRG
Subjt: GARGVSRRTDFRVLVSGLPSSASWQDLKDHMRRAGDVCFAQVFRDGSGTTGIVDYTNSDDMKYAIKKLDDSEFRNAFSRSYVRVREYDSKRDLSRSPSRG
Query: RSRSRGRSYSRS----RSRSKSRSRSKSPKAKSSRRSPVKSRSRSASPARSRSKSSSLSGSRSRSRSPVPNREKRASKSPKRRDASKSPKRRDASKSPKR
RS SRGRSYSRS RSRSKS SRSKSPKAKSS+RSPVKSRSRSASPARSRSKSSSLSGSRSRSRSPVPNREKR SKSPKRRDASKSP R
Subjt: RSRSRGRSYSRS----RSRSKSRSRSKSPKAKSSRRSPVKSRSRSASPARSRSKSSSLSGSRSRSRSPVPNREKRASKSPKRRDASKSPKRRDASKSPKR
Query: RDASKSPSRSRSRSRSMSKSKSPTR
S+S SRSRSRS+S SKSKSP+R
Subjt: RDASKSPSRSRSRSRSMSKSKSPTR
|
|
| A0A6J1D3F5 serine/arginine-rich-splicing factor SR34-like isoform X1 | 5.4e-136 | 87.04 | Show/hide |
Query: MSGRASRTIYVGNLPGDIREKEVDDLFYKYGRIAHIELKVPPRPPGYAFVEFEDSEDAEDAIRGRDGYDFDGHRLRVELAHGGRGHSSSSDRYSSQGGSR
MS RASRT+YVGNLPGDIREKEV+DLFYKYGRIAHI+LKVPPRPPGYAFVEFED+EDA+DAIRGRDGYDFDGHRLRVELAHGGRGHSSSSDRYSS GGSR
Subjt: MSGRASRTIYVGNLPGDIREKEVDDLFYKYGRIAHIELKVPPRPPGYAFVEFEDSEDAEDAIRGRDGYDFDGHRLRVELAHGGRGHSSSSDRYSSQGGSR
Query: GARGVSRRTDFRVLVSGLPSSASWQDLKDHMRRAGDVCFAQVFRDGSGTTGIVDYTNSDDMKYAIKKLDDSEFRNAFSRSYVRVREYDSKRDLSRSPSRG
G RGVSRR+D+RVLV+GLPSSASWQDLKDHMRRAGDVCF+QVFRDGSGTTGIVDYTN DDMKYAIKKLDDSEFRNAFSRSYVRVREYDSKRDLSRSPSRG
Subjt: GARGVSRRTDFRVLVSGLPSSASWQDLKDHMRRAGDVCFAQVFRDGSGTTGIVDYTNSDDMKYAIKKLDDSEFRNAFSRSYVRVREYDSKRDLSRSPSRG
Query: RSRSRGRSYSRS----RSRSKSRSRSKSPKAKSSRRSPVKSRSRSASPARSRSKSSSLSGSRSRSRSPVPNREKRASKSPKRRDASKSPKRRDASKSPKR
RS SRGRSYSRS RSRSKSRSRSKSPKAKSS+RSPVKSRSRSASPARSRSKSSSLSGSRSRSRSP+PNR KR SKSPKRRDASKSP R
Subjt: RSRSRGRSYSRS----RSRSKSRSRSKSPKAKSSRRSPVKSRSRSASPARSRSKSSSLSGSRSRSRSPVPNREKRASKSPKRRDASKSPKRRDASKSPKR
Query: RDASKSPSRSRSRSRSMSKSKSPT
S+SRSRSRS SKSKSP+
Subjt: RDASKSPSRSRSRSRSMSKSKSPT
|
|
| A0A6J1D4F6 serine/arginine-rich-splicing factor SR34-like isoform X2 | 1.6e-132 | 86.11 | Show/hide |
Query: MSGRASRTIYVGNLPGDIREKEVDDLFYKYGRIAHIELKVPPRPPGYAFVEFEDSEDAEDAIRGRDGYDFDGHRLRVELAHGGRGHSSSSDRYSSQGGSR
MS RASRT+YVGNLPGDIREKEV+DLFYKYGRIAHI+LKVPPRPPGYAFVEFED+EDA+DAIRGRDGYDFDGHRLRVELAHGGRGHSSSSDRYSS GGSR
Subjt: MSGRASRTIYVGNLPGDIREKEVDDLFYKYGRIAHIELKVPPRPPGYAFVEFEDSEDAEDAIRGRDGYDFDGHRLRVELAHGGRGHSSSSDRYSSQGGSR
Query: GARGVSRRTDFRVLVSGLPSSASWQDLKDHMRRAGDVCFAQVFRDGSGTTGIVDYTNSDDMKYAIKKLDDSEFRNAFSRSYVRVREYDSKRDLSRSPSRG
G RGVSRR+D+RVLV+GLPSSASWQDLKDHMRRAGDVCF+QVFRDGS GIVDYTN DDMKYAIKKLDDSEFRNAFSRSYVRVREYDSKRDLSRSPSRG
Subjt: GARGVSRRTDFRVLVSGLPSSASWQDLKDHMRRAGDVCFAQVFRDGSGTTGIVDYTNSDDMKYAIKKLDDSEFRNAFSRSYVRVREYDSKRDLSRSPSRG
Query: RSRSRGRSYSRS----RSRSKSRSRSKSPKAKSSRRSPVKSRSRSASPARSRSKSSSLSGSRSRSRSPVPNREKRASKSPKRRDASKSPKRRDASKSPKR
RS SRGRSYSRS RSRSKSRSRSKSPKAKSS+RSPVKSRSRSASPARSRSKSSSLSGSRSRSRSP+PNR KR SKSPKRRDASKSP R
Subjt: RSRSRGRSYSRS----RSRSKSRSRSKSPKAKSSRRSPVKSRSRSASPARSRSKSSSLSGSRSRSRSPVPNREKRASKSPKRRDASKSPKRRDASKSPKR
Query: RDASKSPSRSRSRSRSMSKSKSPT
S+SRSRSRS SKSKSP+
Subjt: RDASKSPSRSRSRSRSMSKSKSPT
|
|
| A0A6J1GP36 serine/arginine-rich-splicing factor SR34-like isoform X1 | 3.0e-134 | 86.15 | Show/hide |
Query: MSGRASRTIYVGNLPGDIREKEVDDLFYKYGRIAHIELKVPPRPPGYAFVEFEDSEDAEDAIRGRDGYDFDGHRLRVELAHGGRGHSSSSDRYSSQGGSR
MS RASRT+YVGNLPGDIREKEV+DLFYKYGRIAHI+LKVPPRPPGYAFVEFED+EDA+DAI GRDGYDFDGHRLRVELAHGGRGHSSSSDRYSS G SR
Subjt: MSGRASRTIYVGNLPGDIREKEVDDLFYKYGRIAHIELKVPPRPPGYAFVEFEDSEDAEDAIRGRDGYDFDGHRLRVELAHGGRGHSSSSDRYSSQGGSR
Query: GARGVSRRTDFRVLVSGLPSSASWQDLKDHMRRAGDVCFAQVFRDGSGTTGIVDYTNSDDMKYAIKKLDDSEFRNAFSRSYVRVREYDSKRDLSRSPSRG
G RGVSRR+DFRVLV+GLPSSASWQDLKDHMRRAGDVCF+QVFRDGSGTTGIVDYTN DDMKYAIKKLDDSEFRNAFSRSYVRVREYDSKRD S+SPSRG
Subjt: GARGVSRRTDFRVLVSGLPSSASWQDLKDHMRRAGDVCFAQVFRDGSGTTGIVDYTNSDDMKYAIKKLDDSEFRNAFSRSYVRVREYDSKRDLSRSPSRG
Query: RSRSRGRSYSRS----RSRSKSRSRSKSPKAKSSRRSPVKSRSRSASPARSRSKSSSLSGSRSRSRSPVPNREKRASKSPKRRDASKSPKRRDASKSPKR
RS SRGRSYSRS RSRSKSRSRSKSPK KSS+RSPVKSRSRSASPARSRSKSSSLSGSRSRSRSP PNREKR SKSPKRR+ASKSP R
Subjt: RSRSRGRSYSRS----RSRSKSRSRSKSPKAKSSRRSPVKSRSRSASPARSRSKSSSLSGSRSRSRSPVPNREKRASKSPKRRDASKSPKRRDASKSPKR
Query: RDASKSPSRSRSRSRSMSKSKSPTR
SRSRSRSRS SKSKSP+R
Subjt: RDASKSPSRSRSRSRSMSKSKSPTR
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A2RVS6 Serine/arginine-rich splicing factor SR34A | 5.1e-83 | 63.85 | Show/hide |
Query: MSGRASRTIYVGNLPGDIREKEVDDLFYKYGRIAHIELKVPPRPPGYAFVEFEDSEDAEDAIRGRDGYDFDGHRLRVELAHGGRGHSSSSDR--------
MSGR SR+IYVGNLPGDIRE E++D+FYKYGRI IELKVPPRPP Y FVEFE S DAEDAI+GRDGY+ DG RLRVELAHGGRG SSS R
Subjt: MSGRASRTIYVGNLPGDIREKEVDDLFYKYGRIAHIELKVPPRPPGYAFVEFEDSEDAEDAIRGRDGYDFDGHRLRVELAHGGRGHSSSSDR--------
Query: -YSSQGGSRGAR--GVSRRTDFRVLVSGLPSSASWQDLKDHMRRAGDVCFAQVFRDGSGTTGIVDYTNSDDMKYAIKKLDDSEFRNAFSRSYVRVREYDS
Y GG G+ GVSR ++FRV+V GLPSSASWQDLKDHMR+AGDVCFA+V RD GT G+VDYTN DDMKYAI+KLDD+EFRN ++R ++RV++Y+S
Subjt: -YSSQGGSRGAR--GVSRRTDFRVLVSGLPSSASWQDLKDHMRRAGDVCFAQVFRDGSGTTGIVDYTNSDDMKYAIKKLDDSEFRNAFSRSYVRVREYDS
Query: KRDLSRSPSRGRSRSRGRSYSRSR----SRSKSRSRSKSPK---AKSSRRSPVKSRSRSASPARSRSKSSSLSGSRSRSRSPVPNREKRASKSPKR
R SRSPSR RSRSR RS SR R SRS+S SRSKSP+ +KS RRS +S S+S SP+ + KS + SRS+SRS +R + SKSP +
Subjt: KRDLSRSPSRGRSRSRGRSYSRSR----SRSKSRSRSKSPK---AKSSRRSPVKSRSRSASPARSRSKSSSLSGSRSRSRSPVPNREKRASKSPKR
|
|
| F4JHI7 Serine/arginine-rich splicing factor SR34B | 3.6e-89 | 72.76 | Show/hide |
Query: MSGRASRTIYVGNLPGDIREKEVDDLFYKYGRIAHIELKVPPRPPGYAFVEFEDSEDAEDAIRGRDGYDFDGHRLRVELAHGGRGHS-SSSDRYSSQG-G
MS R+SRTIYVGNLPGDIRE+EV+DLF KYG + I+LK+PPRPPGYAFVEFED+ DA+DAI GRDGYDFDGH LRVELAHGGR S + YS +G G
Subjt: MSGRASRTIYVGNLPGDIREKEVDDLFYKYGRIAHIELKVPPRPPGYAFVEFEDSEDAEDAIRGRDGYDFDGHRLRVELAHGGRGHS-SSSDRYSSQG-G
Query: SRGA-------RGVSRRTDFRVLVSGLPSSASWQDLKDHMRRAGDVCFAQVFRDGSGTTGIVDYTNSDDMKYAIKKLDDSEFRNAFSRSYVRVREYDSKR
RG RG SRR+++RV+VSGLPSSASWQDLKDHMR+ G+VCF+QVFRDG GTTGIVDYT+ +DMKYA LDD+EFRNAFS YVRVREYDS+R
Subjt: SRGA-------RGVSRRTDFRVLVSGLPSSASWQDLKDHMRRAGDVCFAQVFRDGSGTTGIVDYTNSDDMKYAIKKLDDSEFRNAFSRSYVRVREYDSKR
Query: DLSRSPSRGR----SRSRGRSYSRSRSRSKSRSRSKSPKAKSSRRSPVKSRSRSASPARSRSKSSSLS
D SRSPSRGR SRSRGRS SRSRSRS+SRS+S+SPKAKS RRSP KS SRS +RSRSKS SLS
Subjt: DLSRSPSRGR----SRSRGRSYSRSRSRSKSRSRSKSPKAKSSRRSPVKSRSRSASPARSRSKSSSLS
|
|
| O22315 Serine/arginine-rich-splicing factor SR34 | 1.4e-96 | 68.93 | Show/hide |
Query: MSGRASRTIYVGNLPGDIREKEVDDLFYKYGRIAHIELKVPPRPPGYAFVEFEDSEDAEDAIRGRDGYDFDGHRLRVELAHGGRGHSSSSDRYSSQGGSR
MS R+SRT+YVGNLPGDIRE+EV+DLF KYG + I+LKVPPRPPGYAFVEF+D+ DAEDAI GRDGYDFDGHRLRVELAHGGR SS R S GG R
Subjt: MSGRASRTIYVGNLPGDIREKEVDDLFYKYGRIAHIELKVPPRPPGYAFVEFEDSEDAEDAIRGRDGYDFDGHRLRVELAHGGRGHSSSSDRYSSQGGSR
Query: ---------GARGVSRRTDFRVLVSGLPSSASWQDLKDHMRRAGDVCFAQVFRDGSGTTGIVDYTNSDDMKYAIKKLDDSEFRNAFSRSYVRVREYDSKR
G+RG SRR++FRVLV+GLPSSASWQDLKDHMR+ GDVCF+QV+RD GTTG+VDYT +DMKYA+KKLDD+EFRNAFS YVRVREYDS++
Subjt: ---------GARGVSRRTDFRVLVSGLPSSASWQDLKDHMRRAGDVCFAQVFRDGSGTTGIVDYTNSDDMKYAIKKLDDSEFRNAFSRSYVRVREYDSKR
Query: DLSRSPSRGRSRSRGRSYSR----SRSRSKSRSRSKSPKAKSSRRSPVKSRSRSASPARSRSKSSSLSGSRSRSRSPVPNREKRASKSPKRRDASKSPKR
D SRSPSRGRS S+ RS SR SRSRS+SRSRS+SPKAKSSRRSP KS SRS P RS+S+S S SRSRSRSP+P+ +K SKSP + +KSP
Subjt: DLSRSPSRGRSRSRGRSYSR----SRSRSKSRSRSKSPKAKSSRRSPVKSRSRSASPARSRSKSSSLSGSRSRSRSPVPNREKRASKSPKRRDASKSPKR
Query: RDASKSPKR
++SP R
Subjt: RDASKSPKR
|
|
| Q0VCY7 Serine/arginine-rich splicing factor 1 | 5.3e-56 | 56.56 | Show/hide |
Query: SGRASRTIYVGNLPGDIREKEVDDLFYKYGRIAHIELKVPPRPPGYAFVEFEDSEDAEDAIRGRDGYDFDGHRLRVELAHGGRGHSSSSDRYSSQGGSRG
+G IYVGNLP DIR K+++D+FYKYG I I+LK P +AFVEFED DAEDA+ GRDGYD+DG+RLRVE GRG G RG
Subjt: SGRASRTIYVGNLPGDIREKEVDDLFYKYGRIAHIELKVPPRPPGYAFVEFEDSEDAEDAIRGRDGYDFDGHRLRVELAHGGRGHSSSSDRYSSQGGSRG
Query: ARG-VSRRTDFRVLVSGLPSSASWQDLKDHMRRAGDVCFAQVFRDGSGTTGIVDYTNSDDMKYAIKKLDDSEFR-NAFSRSYVRVREYDSKRDLSRSPSR
G SRR++ RV+VSGLP S SWQDLKDHMR AGDVC+A V+RDG TG+V++ +DM YA++KLD+++FR + +Y+RV K D RSPS
Subjt: ARG-VSRRTDFRVLVSGLPSSASWQDLKDHMRRAGDVCFAQVFRDGSGTTGIVDYTNSDDMKYAIKKLDDSEFR-NAFSRSYVRVREYDSKRDLSRSPSR
Query: GRSRSRGRSYSRSRSRSKSRSRSKSPKAK--SSRRSPVKSRSRS
GRSRSR RS SRSRSRS SRSRS SP+ S R SP SRSRS
Subjt: GRSRSRGRSYSRSRSRSKSRSRSKSPKAK--SSRRSPVKSRSRS
|
|
| Q9XFR5 Serine/arginine-rich splicing factor SR30 | 1.2e-79 | 66.67 | Show/hide |
Query: MSGRASRTIYVGNLPGDIREKEVDDLFYKYGRIAHIELKVPPRPPGYAFVEFEDSEDAEDAIRGRDGYDFDGHRLRVELAHGGRGHSSSSDRYSSQGGSR
MS R +RTIYVGNLPGDIR+ EV+DLFYKYG I I+LK+PPRPPGYAFVEFED DA+DAI GRDGYDFDG RLRVE+AHGGR S S DRYSS +
Subjt: MSGRASRTIYVGNLPGDIREKEVDDLFYKYGRIAHIELKVPPRPPGYAFVEFEDSEDAEDAIRGRDGYDFDGHRLRVELAHGGRGHSSSSDRYSSQGGSR
Query: GARGVSRRTDFRVLVSGLPSSASWQDLKDHMRRAGDVCFAQVFRDGSGTTGIVDYTNSDDMKYAIKKLDDSEFRNAFSRSYVRVREYDSKRDLSRSPS--
+R SRR+D+RVLV+GLP SASWQDLKDHMR+AGDVCF++VF D G +G+VDY+N DDMKYAI+KLD +EFRNAFS +Y+RVREY+S R +SRSP
Subjt: GARGVSRRTDFRVLVSGLPSSASWQDLKDHMRRAGDVCFAQVFRDGSGTTGIVDYTNSDDMKYAIKKLDDSEFRNAFSRSYVRVREYDSKRDLSRSPS--
Query: ---RGRSRSRGRSYSRSRSRSKSRSRSKSPKAKSSRRSPVKSRSRSASPARSRSKSSSLSGSRSRSRSPV
R RSRSRG S S S S+SRS SP S RS SRSRS + SRS+S S S SRSRS SPV
Subjt: ---RGRSRSRGRSYSRSRSRSKSRSRSKSPKAKSSRRSPVKSRSRSASPARSRSKSSSLSGSRSRSRSPV
|
|
| Arabidopsis top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AT1G02840.1 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 9.8e-98 | 68.93 | Show/hide |
Query: MSGRASRTIYVGNLPGDIREKEVDDLFYKYGRIAHIELKVPPRPPGYAFVEFEDSEDAEDAIRGRDGYDFDGHRLRVELAHGGRGHSSSSDRYSSQGGSR
MS R+SRT+YVGNLPGDIRE+EV+DLF KYG + I+LKVPPRPPGYAFVEF+D+ DAEDAI GRDGYDFDGHRLRVELAHGGR SS R S GG R
Subjt: MSGRASRTIYVGNLPGDIREKEVDDLFYKYGRIAHIELKVPPRPPGYAFVEFEDSEDAEDAIRGRDGYDFDGHRLRVELAHGGRGHSSSSDRYSSQGGSR
Query: ---------GARGVSRRTDFRVLVSGLPSSASWQDLKDHMRRAGDVCFAQVFRDGSGTTGIVDYTNSDDMKYAIKKLDDSEFRNAFSRSYVRVREYDSKR
G+RG SRR++FRVLV+GLPSSASWQDLKDHMR+ GDVCF+QV+RD GTTG+VDYT +DMKYA+KKLDD+EFRNAFS YVRVREYDS++
Subjt: ---------GARGVSRRTDFRVLVSGLPSSASWQDLKDHMRRAGDVCFAQVFRDGSGTTGIVDYTNSDDMKYAIKKLDDSEFRNAFSRSYVRVREYDSKR
Query: DLSRSPSRGRSRSRGRSYSR----SRSRSKSRSRSKSPKAKSSRRSPVKSRSRSASPARSRSKSSSLSGSRSRSRSPVPNREKRASKSPKRRDASKSPKR
D SRSPSRGRS S+ RS SR SRSRS+SRSRS+SPKAKSSRRSP KS SRS P RS+S+S S SRSRSRSP+P+ +K SKSP + +KSP
Subjt: DLSRSPSRGRSRSRGRSYSR----SRSRSKSRSRSKSPKAKSSRRSPVKSRSRSASPARSRSKSSSLSGSRSRSRSPVPNREKRASKSPKRRDASKSPKR
Query: RDASKSPKR
++SP R
Subjt: RDASKSPKR
|
|
| AT1G02840.2 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 1.5e-93 | 69.75 | Show/hide |
Query: MSGRASRTIYVGNLPGDIREKEVDDLFYKYGRIAHIELKVPPRPPGYAFVEFEDSEDAEDAIRGRDGYDFDGHRLRVELAHGGRGHSSSSDRYSSQGGSR
MS R+SRT+YVGNLPGDIRE+EV+DLF KYG + I+LKVPPRPPGYAFVEF+D+ DAEDAI GRDGYDFDGHRLRVELAHGGR SS R S GG R
Subjt: MSGRASRTIYVGNLPGDIREKEVDDLFYKYGRIAHIELKVPPRPPGYAFVEFEDSEDAEDAIRGRDGYDFDGHRLRVELAHGGRGHSSSSDRYSSQGGSR
Query: ---------GARGVSRRTDFRVLVSGLPSSASWQDLKDHMRRAGDVCFAQVFRDGSGTTGIVDYTNSDDMKYAIKKLDDSEFRNAFSRSYVRVREYDSKR
G+RG SRR++FRVLV+GLPSSASWQDLKDHMR+ GDVCF+QV+RD GTTG+VDYT +DMKYA+KKLDD+EFRNAFS YVRVREYDS++
Subjt: ---------GARGVSRRTDFRVLVSGLPSSASWQDLKDHMRRAGDVCFAQVFRDGSGTTGIVDYTNSDDMKYAIKKLDDSEFRNAFSRSYVRVREYDSKR
Query: DLSRSPSRGRSRSRGRSYSR----SRSRSKSRSRSKSPKAKSSRRSPVKSRSRSASPARSRSKSSSLSGSRSRSRSPVPNR
D SRSPSRGRS S+ RS SR SRSRS+SRSRS+SPKAKSSRRSP KS SRS P RS+SRSP P R
Subjt: DLSRSPSRGRSRSRGRSYSR----SRSRSKSRSRSKSPKAKSSRRSPVKSRSRSASPARSRSKSSSLSGSRSRSRSPVPNR
|
|
| AT1G02840.3 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 9.8e-98 | 68.93 | Show/hide |
Query: MSGRASRTIYVGNLPGDIREKEVDDLFYKYGRIAHIELKVPPRPPGYAFVEFEDSEDAEDAIRGRDGYDFDGHRLRVELAHGGRGHSSSSDRYSSQGGSR
MS R+SRT+YVGNLPGDIRE+EV+DLF KYG + I+LKVPPRPPGYAFVEF+D+ DAEDAI GRDGYDFDGHRLRVELAHGGR SS R S GG R
Subjt: MSGRASRTIYVGNLPGDIREKEVDDLFYKYGRIAHIELKVPPRPPGYAFVEFEDSEDAEDAIRGRDGYDFDGHRLRVELAHGGRGHSSSSDRYSSQGGSR
Query: ---------GARGVSRRTDFRVLVSGLPSSASWQDLKDHMRRAGDVCFAQVFRDGSGTTGIVDYTNSDDMKYAIKKLDDSEFRNAFSRSYVRVREYDSKR
G+RG SRR++FRVLV+GLPSSASWQDLKDHMR+ GDVCF+QV+RD GTTG+VDYT +DMKYA+KKLDD+EFRNAFS YVRVREYDS++
Subjt: ---------GARGVSRRTDFRVLVSGLPSSASWQDLKDHMRRAGDVCFAQVFRDGSGTTGIVDYTNSDDMKYAIKKLDDSEFRNAFSRSYVRVREYDSKR
Query: DLSRSPSRGRSRSRGRSYSR----SRSRSKSRSRSKSPKAKSSRRSPVKSRSRSASPARSRSKSSSLSGSRSRSRSPVPNREKRASKSPKRRDASKSPKR
D SRSPSRGRS S+ RS SR SRSRS+SRSRS+SPKAKSSRRSP KS SRS P RS+S+S S SRSRSRSP+P+ +K SKSP + +KSP
Subjt: DLSRSPSRGRSRSRGRSYSR----SRSRSKSRSRSKSPKAKSSRRSPVKSRSRSASPARSRSKSSSLSGSRSRSRSPVPNREKRASKSPKRRDASKSPKR
Query: RDASKSPKR
++SP R
Subjt: RDASKSPKR
|
|
| AT3G49430.1 SER/ARG-rich protein 34A | 3.6e-84 | 63.85 | Show/hide |
Query: MSGRASRTIYVGNLPGDIREKEVDDLFYKYGRIAHIELKVPPRPPGYAFVEFEDSEDAEDAIRGRDGYDFDGHRLRVELAHGGRGHSSSSDR--------
MSGR SR+IYVGNLPGDIRE E++D+FYKYGRI IELKVPPRPP Y FVEFE S DAEDAI+GRDGY+ DG RLRVELAHGGRG SSS R
Subjt: MSGRASRTIYVGNLPGDIREKEVDDLFYKYGRIAHIELKVPPRPPGYAFVEFEDSEDAEDAIRGRDGYDFDGHRLRVELAHGGRGHSSSSDR--------
Query: -YSSQGGSRGAR--GVSRRTDFRVLVSGLPSSASWQDLKDHMRRAGDVCFAQVFRDGSGTTGIVDYTNSDDMKYAIKKLDDSEFRNAFSRSYVRVREYDS
Y GG G+ GVSR ++FRV+V GLPSSASWQDLKDHMR+AGDVCFA+V RD GT G+VDYTN DDMKYAI+KLDD+EFRN ++R ++RV++Y+S
Subjt: -YSSQGGSRGAR--GVSRRTDFRVLVSGLPSSASWQDLKDHMRRAGDVCFAQVFRDGSGTTGIVDYTNSDDMKYAIKKLDDSEFRNAFSRSYVRVREYDS
Query: KRDLSRSPSRGRSRSRGRSYSRSR----SRSKSRSRSKSPK---AKSSRRSPVKSRSRSASPARSRSKSSSLSGSRSRSRSPVPNREKRASKSPKR
R SRSPSR RSRSR RS SR R SRS+S SRSKSP+ +KS RRS +S S+S SP+ + KS + SRS+SRS +R + SKSP +
Subjt: KRDLSRSPSRGRSRSRGRSYSRSR----SRSKSRSRSKSPK---AKSSRRSPVKSRSRSASPARSRSKSSSLSGSRSRSRSPVPNREKRASKSPKR
|
|
| AT4G02430.2 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 2.6e-90 | 72.76 | Show/hide |
Query: MSGRASRTIYVGNLPGDIREKEVDDLFYKYGRIAHIELKVPPRPPGYAFVEFEDSEDAEDAIRGRDGYDFDGHRLRVELAHGGRGHS-SSSDRYSSQG-G
MS R+SRTIYVGNLPGDIRE+EV+DLF KYG + I+LK+PPRPPGYAFVEFED+ DA+DAI GRDGYDFDGH LRVELAHGGR S + YS +G G
Subjt: MSGRASRTIYVGNLPGDIREKEVDDLFYKYGRIAHIELKVPPRPPGYAFVEFEDSEDAEDAIRGRDGYDFDGHRLRVELAHGGRGHS-SSSDRYSSQG-G
Query: SRGA-------RGVSRRTDFRVLVSGLPSSASWQDLKDHMRRAGDVCFAQVFRDGSGTTGIVDYTNSDDMKYAIKKLDDSEFRNAFSRSYVRVREYDSKR
RG RG SRR+++RV+VSGLPSSASWQDLKDHMR+ G+VCF+QVFRDG GTTGIVDYT+ +DMKYA LDD+EFRNAFS YVRVREYDS+R
Subjt: SRGA-------RGVSRRTDFRVLVSGLPSSASWQDLKDHMRRAGDVCFAQVFRDGSGTTGIVDYTNSDDMKYAIKKLDDSEFRNAFSRSYVRVREYDSKR
Query: DLSRSPSRGR----SRSRGRSYSRSRSRSKSRSRSKSPKAKSSRRSPVKSRSRSASPARSRSKSSSLS
D SRSPSRGR SRSRGRS SRSRSRS+SRS+S+SPKAKS RRSP KS SRS +RSRSKS SLS
Subjt: DLSRSPSRGR----SRSRGRSYSRSRSRSKSRSRSKSPKAKSSRRSPVKSRSRSASPARSRSKSSSLS
|
|
