CuGenDBv2

Gene ID	Sed0014476
Organism	Sechium edule (Chayote v1)
Description	Unknown protein
Genome location	LG02:45066005..45068186
RNA-Seq Expression	Sed0014476
Synteny	Sed0014476
Gene Ontology terms	GO:0016020 - membrane (cellular component)
InterPro domains	NA

Homology

Show/hide homology

GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

KAG7017332.1 hypothetical protein SDJN02_19196 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]

1.5e-35

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        MLIG VIAPR FFSR+K+KSS SS SSS           S A+PLCSGR  +DP              STDWDKAWSKFRKRGKKTIFSDFSP+KYVSWN
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        PRRSDYPL +                TSPRFTLAGAIVIVTFLLVYTILA INK
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XP_004137799.1 uncharacterized protein LOC101211971 [Cucumis sativus]

1.1e-35

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        ML+G +IAPRSFFSR+K+K SPSS SSSSSS        S  IPLCSGR  KDP             LSTDWDKAWSKF+KRGKKT+FSDFSP+KYVSWN
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        PRRS+YPL +                TSPRFTLAGAIVI+TFLLVYTILA INK
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XP_008442626.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103486442 [Cucumis melo]

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        ML+G +IAPRSFFS +KRKSS SSSS SSS         S  IPLCSGR  KDP             LSTDWDKAWSKF+KRGKKTIFSDFSPDKYVSWN
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        PRRS+YPL +                TSPRFTLAGAIVI+ FLLVYTILA INK
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XP_022145494.1 uncharacterized protein LOC111014931 [Momordica charantia]

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67.76

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        IG +IAP SFFSR+K+KS  SSS SSSSSSSSS YNCS  +PLC GR  KDP              STDWDKAWSKFRKRGKKTIFSDFSPDKYVSWNPR
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        RS+YPL +                TSPRFTLAGAIVIVTFLLVYTILA INK
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XP_038906326.1 uncharacterized protein LOC120092168 [Benincasa hispida]

4.2e-38

66.88

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        MLIG +IAPRSFFSR+K+KSS SSSSSSSS         S  IPLCSGR  KDP             LSTDWDKAWSKFRKRGKKTIFSDFSP+KYVSWN
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TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A0A0LAB4 Uncharacterized protein

5.5e-36

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        ML+G +IAPRSFFSR+K+K SPSS SSSSSS        S  IPLCSGR  KDP             LSTDWDKAWSKF+KRGKKT+FSDFSP+KYVSWN
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        PRRS+YPL +                TSPRFTLAGAIVI+TFLLVYTILA INK
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A0A1S3B6W3 uncharacterized protein LOC103486442

3.2e-36

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        ML+G +IAPRSFFS +KRKSS SSSS SSS         S  IPLCSGR  KDP             LSTDWDKAWSKF+KRGKKTIFSDFSPDKYVSWN
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        PRRS+YPL +                TSPRFTLAGAIVI+ FLLVYTILA INK
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A0A6J1CVE7 uncharacterized protein LOC111014931

5.3e-39

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        IG +IAP SFFSR+K+KS  SSS SSSSSSSSS YNCS  +PLC GR  KDP              STDWDKAWSKFRKRGKKTIFSDFSPDKYVSWNPR
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        RS+YPL +                TSPRFTLAGAIVIVTFLLVYTILA INK
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A0A6J1F162 uncharacterized protein LOC111441439 isoform X1

1.6e-35

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A0A6J1J3V4 uncharacterized protein LOC111482428

3.0e-34

61.69

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        MLIG VIAPR FFSR+K+KSS SS  SS           S  +PLCSGR  +DP              STDWDKAWSKFRKRGKKTIFSDFSP+KYVSWN
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        PRRS+YPL +                TSPRFTLAGAIVIVTFLLVYTILA INK
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SwissProt top hits	e value	%identity	Alignment
No hits found

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT3G53470.1 unknown protein

7.1e-20

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Query:  SSSSGYNCSSAIPLCSGRSSK----DPLSTDWDKAWSKFRKRGKKTIFSDFSPDKYVSWNPRRSDYPLDQ----------------TSPRFTLAGAIVIV
        SSSS + CS+  P   G  S     D  STDWDKAW  F+K+ KK++FS F+ DKYV+WNP RS++ L +                TSPRFTL GAIVIV
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Query:  TFLLVYTILATI
        +FLL+YTILA +
Subjt:  TFLLVYTILATI

AT3G53470.2 unknown protein

9.3e-20

49.56

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Query:  SSSSGYNCSSAIPLCSGRSSK-----DPLSTDWDKAWSKFRKRGKKTIFSDFSPDKYVSWNPRRSDYPLDQ----------------TSPRFTLAGAIVI
        SSSS + CS+  P   G  S      D  STDWDKAW  F+K+ KK++FS F+ DKYV+WNP RS++ L +                TSPRFTL GAIVI
Subjt:  SSSSGYNCSSAIPLCSGRSSK-----DPLSTDWDKAWSKFRKRGKKTIFSDFSPDKYVSWNPRRSDYPLDQ----------------TSPRFTLAGAIVI

Query:  VTFLLVYTILATI
        V+FLL+YTILA +
Subjt:  VTFLLVYTILATI

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGCTAATCGGAGCCGTAATCGCACCTCGTAGCTTTTTCTCGAGAGACAAACGAAAATCTTCTCCGTCTTCGTCTTCATCGTCGTCGTCGTCGTCGTCTTCTTCTGGCTA
TAACTGCTCGTCGGCGATTCCTCTGTGTTCGGGAAGAAGCTCTAAAGATCCGCTCTCAACAGACTGGGACAAGGCTTGGTCGAAGTTCAGAAAGCGAGGTAAAAAGACGA
TCTTCTCCGATTTCTCGCCAGACAAATACGTAAGCTGGAATCCGCGGAGGTCAGATTATCCCTTAGATCAAACCAGTCCAAGATTTACTCTAGCAGGTGCAATTGTAATT
GTCACATTCTTGTTGGTCTATACAATTCTTGCAACAATTAATAAGTGA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MLIGAVIAPRSFFSRDKRKSSPSSSSSSSSSSSSSGYNCSSAIPLCSGRSSKDPLSTDWDKAWSKFRKRGKKTIFSDFSPDKYVSWNPRRSDYPLDQTSPRFTLAGAIVI
VTFLLVYTILATINK

Sed0014476 (gene) of Chayote v1 genome