; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Sed0014523 (gene) of Chayote v1 genome

Gene IDSed0014523
OrganismSechium edule (Chayote v1)
DescriptionRetrotransposon protein
Genome locationLG03:13418400..13419630
RNA-Seq ExpressionSed0014523
SyntenySed0014523
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR027806 - Harbinger transposase-derived nuclease domain


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0035620.1 retrotransposon protein [Cucumis melo var. makuwa]4.1e-11861.1Show/hide
Query:  RHHFRQMTFFSMIRQSDLACRETTRMNRSCFETLCDMLRTHGGLRGTDYIDVEEMVAMFLHIMAHDVKNRVVRRIFTRSGETVSRHFQSVLTAVIRCLDI
        RH  RQ+ +F MI  SDL CR++TRM+R CF  LC +LRT  GL  T+ +DVEEMVAMFLHI+AHDVKNRV++R F RSGET+SRHF  VL AVIR  + 
Subjt:  RHHFRQMTFFSMIRQSDLACRETTRMNRSCFETLCDMLRTHGGLRGTDYIDVEEMVAMFLHIMAHDVKNRVVRRIFTRSGETVSRHFQSVLTAVIRCLDI

Query:  LFKKPEPIQPSCTDSRWKWFENCLGALDGTHIELQVPVENRASFRNRKGIITTNVLVVCAPSGEFIYVLAGWEGSAADSRVLRDALSRNNGFQVPHVFID
        L KKP+P+   CTD RW+WFENCLGALDGT+I++ VP  +RA +R RKG + TNVL VC   G+F+YVLAGWEGSAADSR+LRDALSR N  +VP     
Subjt:  LFKKPEPIQPSCTDSRWKWFENCLGALDGTHIELQVPVENRASFRNRKGIITTNVLVVCAPSGEFIYVLAGWEGSAADSRVLRDALSRNNGFQVPHVFID

Query:  PRYYYLCDAGYPNADGFLAPYRGERYHLSDWRG-SNPPRNPREFFNEAHSSARNIIERAFGALKNCWAILRHKSYYPPKVQVKIITACCLLHNLICREMG
          YYYL DAGYPNA+GFLAPYRG+RYHL +WRG  N P   +EFFN  HSSARN+IERAFG LK  WAILR KSYYP +VQ + I ACCLLHNLI REM 
Subjt:  PRYYYLCDAGYPNADGFLAPYRGERYHLSDWRG-SNPPRNPREFFNEAHSSARNIIERAFGALKNCWAILRHKSYYPPKVQVKIITACCLLHNLICREMG

Query:  STIGLEILGENDATLYQEEMDDTPTINFVETSPLWTAFRDSMAQRMF
        +    + + E D+T      DD   I+++ETS  W+ +RD++A+ MF
Subjt:  STIGLEILGENDATLYQEEMDDTPTINFVETSPLWTAFRDSMAQRMF

KAA0046727.1 retrotransposon protein [Cucumis melo var. makuwa]1.4e-11861.38Show/hide
Query:  RHHFRQMTFFSMIRQSDLACRETTRMNRSCFETLCDMLRTHGGLRGTDYIDVEEMVAMFLHIMAHDVKNRVVRRIFTRSGETVSRHFQSVLTAVIRCLDI
        RH  RQ+ +F MI  SDL CR++TRM+R CF  LC +LRT  GL  T+ +DVEEMVAMFLHI+AHDVKNRV++R F RSGET+SRHF  VL AVIR  D 
Subjt:  RHHFRQMTFFSMIRQSDLACRETTRMNRSCFETLCDMLRTHGGLRGTDYIDVEEMVAMFLHIMAHDVKNRVVRRIFTRSGETVSRHFQSVLTAVIRCLDI

Query:  LFKKPEPIQPSCTDSRWKWFENCLGALDGTHIELQVPVENRASFRNRKGIITTNVLVVCAPSGEFIYVLAGWEGSAADSRVLRDALSRNNGFQVPHVFID
        L KKP+P+   CTD RW+WFENCLGALDGT+I++ VP  +RA +R RKG + TNVL VC   G+F+YVLAGWEGSAADSR+LRDALSR N  +VP     
Subjt:  LFKKPEPIQPSCTDSRWKWFENCLGALDGTHIELQVPVENRASFRNRKGIITTNVLVVCAPSGEFIYVLAGWEGSAADSRVLRDALSRNNGFQVPHVFID

Query:  PRYYYLCDAGYPNADGFLAPYRGERYHLSDWRG-SNPPRNPREFFNEAHSSARNIIERAFGALKNCWAILRHKSYYPPKVQVKIITACCLLHNLICREMG
          YYYL DAGYPNA+GFLAPYRG+RYHL +WRG  N P   +EFFN  HSSARN+IERAFG LK  WAILR KSYYP +VQ + I ACCLLHNLI REM 
Subjt:  PRYYYLCDAGYPNADGFLAPYRGERYHLSDWRG-SNPPRNPREFFNEAHSSARNIIERAFGALKNCWAILRHKSYYPPKVQVKIITACCLLHNLICREMG

Query:  STIGLEILGENDATLYQEEMDDTPTINFVETSPLWTAFRDSMAQRMF
        +    + + E D+T      DD   I+++ETS  W+ +RD++A+ MF
Subjt:  STIGLEILGENDATLYQEEMDDTPTINFVETSPLWTAFRDSMAQRMF

KAA0047510.1 retrotransposon protein [Cucumis melo var. makuwa]1.7e-11660.52Show/hide
Query:  RHHFRQMTFFSMIRQSDLACRETTRMNRSCFETLCDMLRTHGGLRGTDYIDVEEMVAMFLHIMAHDVKNRVVRRIFTRSGETVSRHFQSVLTAVIRCLDI
        RH  RQ+ +F MI  SDL CRE+TRM+R CF  LC +LRT  GL  T+ +DVEEMVAMFLHI+AHDVKNRV++R F RSGET+S HF  VL AVIR  + 
Subjt:  RHHFRQMTFFSMIRQSDLACRETTRMNRSCFETLCDMLRTHGGLRGTDYIDVEEMVAMFLHIMAHDVKNRVVRRIFTRSGETVSRHFQSVLTAVIRCLDI

Query:  LFKKPEPIQPSCTDSRWKWFENCLGALDGTHIELQVPVENRASFRNRKGIITTNVLVVCAPSGEFIYVLAGWEGSAADSRVLRDALSRNNGFQVPHVFID
        L KKP+P+   CTD RW+WFENCLGALDGT+I++ VP  +RA +R RKG + TNVL VC   G+F+YVLAGWEGSAADSR+LRDALSR NG +VP     
Subjt:  LFKKPEPIQPSCTDSRWKWFENCLGALDGTHIELQVPVENRASFRNRKGIITTNVLVVCAPSGEFIYVLAGWEGSAADSRVLRDALSRNNGFQVPHVFID

Query:  PRYYYLCDAGYPNADGFLAPYRGERYHLSDWRG-SNPPRNPREFFNEAHSSARNIIERAFGALKNCWAILRHKSYYPPKVQVKIITACCLLHNLICREMG
          YYYL DAGYPN +GFLAPYRG+RYHL +W G  N P   +EFFN  H SARN+IERAFG LK  WAILR KSYYP +VQ + I ACCLLHNLI REM 
Subjt:  PRYYYLCDAGYPNADGFLAPYRGERYHLSDWRG-SNPPRNPREFFNEAHSSARNIIERAFGALKNCWAILRHKSYYPPKVQVKIITACCLLHNLICREMG

Query:  STIGLEILGENDATLYQEEMDDTPTINFVETSPLWTAFRDSMAQRMF
        +    + + E D+T      DD   I+++ETS  W+ +RD +A+ MF
Subjt:  STIGLEILGENDATLYQEEMDDTPTINFVETSPLWTAFRDSMAQRMF

KAA0048361.1 retrotransposon protein [Cucumis melo var. makuwa]7.7e-11760.81Show/hide
Query:  RHHFRQMTFFSMIRQSDLACRETTRMNRSCFETLCDMLRTHGGLRGTDYIDVEEMVAMFLHIMAHDVKNRVVRRIFTRSGETVSRHFQSVLTAVIRCLDI
        RH  RQ+ +F MI  SDL CR++TRM+R CF  LC +LRT  GL  T+ +DVEEMVAMFLHI+AHDVKNRV++R F RSGET+SRHF  VL AVIR  + 
Subjt:  RHHFRQMTFFSMIRQSDLACRETTRMNRSCFETLCDMLRTHGGLRGTDYIDVEEMVAMFLHIMAHDVKNRVVRRIFTRSGETVSRHFQSVLTAVIRCLDI

Query:  LFKKPEPIQPSCTDSRWKWFENCLGALDGTHIELQVPVENRASFRNRKGIITTNVLVVCAPSGEFIYVLAGWEGSAADSRVLRDALSRNNGFQVPHVFID
        L KKP+P+   CTD RWKWFENCLGALDGT+I++ VP  +RA +R RKG + TNVL VC   G+F+YVLAGWEG AADSR+LRDALSR N  +VP     
Subjt:  LFKKPEPIQPSCTDSRWKWFENCLGALDGTHIELQVPVENRASFRNRKGIITTNVLVVCAPSGEFIYVLAGWEGSAADSRVLRDALSRNNGFQVPHVFID

Query:  PRYYYLCDAGYPNADGFLAPYRGERYHLSDWRG-SNPPRNPREFFNEAHSSARNIIERAFGALKNCWAILRHKSYYPPKVQVKIITACCLLHNLICREMG
          YYYL DAGY NA+GFLAPYRG+RYHL +WRG  N P   +EFFN  HSSARN+IERAFG LK  WAILR KSYYP +VQ + I ACCLLHNLI REM 
Subjt:  PRYYYLCDAGYPNADGFLAPYRGERYHLSDWRG-SNPPRNPREFFNEAHSSARNIIERAFGALKNCWAILRHKSYYPPKVQVKIITACCLLHNLICREMG

Query:  STIGLEILGENDATLYQEEMDDTPTINFVETSPLWTAFRDSMAQRMF
        +    + + E D+T      DD   I+++ETS  W+ +RD++A+ MF
Subjt:  STIGLEILGENDATLYQEEMDDTPTINFVETSPLWTAFRDSMAQRMF

KAA0051057.1 retrotransposon protein [Cucumis melo var. makuwa]2.2e-11660.23Show/hide
Query:  RHHFRQMTFFSMIRQSDLACRETTRMNRSCFETLCDMLRTHGGLRGTDYIDVEEMVAMFLHIMAHDVKNRVVRRIFTRSGETVSRHFQSVLTAVIRCLDI
        RH  RQ+ +F MI  SDL C ++TRM+R CF  LC +LRT  GL  T+ +DVEEMVAMFLHI+ HDVKNRV++R F RSGET+SRHF  VL AVIR  + 
Subjt:  RHHFRQMTFFSMIRQSDLACRETTRMNRSCFETLCDMLRTHGGLRGTDYIDVEEMVAMFLHIMAHDVKNRVVRRIFTRSGETVSRHFQSVLTAVIRCLDI

Query:  LFKKPEPIQPSCTDSRWKWFENCLGALDGTHIELQVPVENRASFRNRKGIITTNVLVVCAPSGEFIYVLAGWEGSAADSRVLRDALSRNNGFQVPHVFID
        L KKP+P+   CTD RW+WFENCLGALDGT+I++ VP  +RA +R RKG + TNVL VC   G+F+YVLAGWEGSAADSR+LRDALSR N  +VP     
Subjt:  LFKKPEPIQPSCTDSRWKWFENCLGALDGTHIELQVPVENRASFRNRKGIITTNVLVVCAPSGEFIYVLAGWEGSAADSRVLRDALSRNNGFQVPHVFID

Query:  PRYYYLCDAGYPNADGFLAPYRGERYHLSDWRG-SNPPRNPREFFNEAHSSARNIIERAFGALKNCWAILRHKSYYPPKVQVKIITACCLLHNLICREMG
          YYYL DAGYPNA+GFLAPYRG+RYHL +WRG  N P   +EFFN  HS ARN+IERAFG LK  WAILR KSYYP +VQ + I ACCLLHNLI REM 
Subjt:  PRYYYLCDAGYPNADGFLAPYRGERYHLSDWRG-SNPPRNPREFFNEAHSSARNIIERAFGALKNCWAILRHKSYYPPKVQVKIITACCLLHNLICREMG

Query:  STIGLEILGENDATLYQEEMDDTPTINFVETSPLWTAFRDSMAQRMF
        +    + + E D+T      DD   I+++ETS  W+ +RD++A+ MF
Subjt:  STIGLEILGENDATLYQEEMDDTPTINFVETSPLWTAFRDSMAQRMF

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A5A7TWH8 Retrotransposon protein8.3e-11760.52Show/hide
Query:  RHHFRQMTFFSMIRQSDLACRETTRMNRSCFETLCDMLRTHGGLRGTDYIDVEEMVAMFLHIMAHDVKNRVVRRIFTRSGETVSRHFQSVLTAVIRCLDI
        RH  RQ+ +F MI  SDL CRE+TRM+R CF  LC +LRT  GL  T+ +DVEEMVAMFLHI+AHDVKNRV++R F RSGET+S HF  VL AVIR  + 
Subjt:  RHHFRQMTFFSMIRQSDLACRETTRMNRSCFETLCDMLRTHGGLRGTDYIDVEEMVAMFLHIMAHDVKNRVVRRIFTRSGETVSRHFQSVLTAVIRCLDI

Query:  LFKKPEPIQPSCTDSRWKWFENCLGALDGTHIELQVPVENRASFRNRKGIITTNVLVVCAPSGEFIYVLAGWEGSAADSRVLRDALSRNNGFQVPHVFID
        L KKP+P+   CTD RW+WFENCLGALDGT+I++ VP  +RA +R RKG + TNVL VC   G+F+YVLAGWEGSAADSR+LRDALSR NG +VP     
Subjt:  LFKKPEPIQPSCTDSRWKWFENCLGALDGTHIELQVPVENRASFRNRKGIITTNVLVVCAPSGEFIYVLAGWEGSAADSRVLRDALSRNNGFQVPHVFID

Query:  PRYYYLCDAGYPNADGFLAPYRGERYHLSDWRG-SNPPRNPREFFNEAHSSARNIIERAFGALKNCWAILRHKSYYPPKVQVKIITACCLLHNLICREMG
          YYYL DAGYPN +GFLAPYRG+RYHL +W G  N P   +EFFN  H SARN+IERAFG LK  WAILR KSYYP +VQ + I ACCLLHNLI REM 
Subjt:  PRYYYLCDAGYPNADGFLAPYRGERYHLSDWRG-SNPPRNPREFFNEAHSSARNIIERAFGALKNCWAILRHKSYYPPKVQVKIITACCLLHNLICREMG

Query:  STIGLEILGENDATLYQEEMDDTPTINFVETSPLWTAFRDSMAQRMF
        +    + + E D+T      DD   I+++ETS  W+ +RD +A+ MF
Subjt:  STIGLEILGENDATLYQEEMDDTPTINFVETSPLWTAFRDSMAQRMF

A0A5A7TXW1 Retrotransposon protein6.8e-11961.38Show/hide
Query:  RHHFRQMTFFSMIRQSDLACRETTRMNRSCFETLCDMLRTHGGLRGTDYIDVEEMVAMFLHIMAHDVKNRVVRRIFTRSGETVSRHFQSVLTAVIRCLDI
        RH  RQ+ +F MI  SDL CR++TRM+R CF  LC +LRT  GL  T+ +DVEEMVAMFLHI+AHDVKNRV++R F RSGET+SRHF  VL AVIR  D 
Subjt:  RHHFRQMTFFSMIRQSDLACRETTRMNRSCFETLCDMLRTHGGLRGTDYIDVEEMVAMFLHIMAHDVKNRVVRRIFTRSGETVSRHFQSVLTAVIRCLDI

Query:  LFKKPEPIQPSCTDSRWKWFENCLGALDGTHIELQVPVENRASFRNRKGIITTNVLVVCAPSGEFIYVLAGWEGSAADSRVLRDALSRNNGFQVPHVFID
        L KKP+P+   CTD RW+WFENCLGALDGT+I++ VP  +RA +R RKG + TNVL VC   G+F+YVLAGWEGSAADSR+LRDALSR N  +VP     
Subjt:  LFKKPEPIQPSCTDSRWKWFENCLGALDGTHIELQVPVENRASFRNRKGIITTNVLVVCAPSGEFIYVLAGWEGSAADSRVLRDALSRNNGFQVPHVFID

Query:  PRYYYLCDAGYPNADGFLAPYRGERYHLSDWRG-SNPPRNPREFFNEAHSSARNIIERAFGALKNCWAILRHKSYYPPKVQVKIITACCLLHNLICREMG
          YYYL DAGYPNA+GFLAPYRG+RYHL +WRG  N P   +EFFN  HSSARN+IERAFG LK  WAILR KSYYP +VQ + I ACCLLHNLI REM 
Subjt:  PRYYYLCDAGYPNADGFLAPYRGERYHLSDWRG-SNPPRNPREFFNEAHSSARNIIERAFGALKNCWAILRHKSYYPPKVQVKIITACCLLHNLICREMG

Query:  STIGLEILGENDATLYQEEMDDTPTINFVETSPLWTAFRDSMAQRMF
        +    + + E D+T      DD   I+++ETS  W+ +RD++A+ MF
Subjt:  STIGLEILGENDATLYQEEMDDTPTINFVETSPLWTAFRDSMAQRMF

A0A5A7U476 Retrotransposon protein3.7e-11760.81Show/hide
Query:  RHHFRQMTFFSMIRQSDLACRETTRMNRSCFETLCDMLRTHGGLRGTDYIDVEEMVAMFLHIMAHDVKNRVVRRIFTRSGETVSRHFQSVLTAVIRCLDI
        RH  RQ+ +F MI  SDL CR++TRM+R CF  LC +LRT  GL  T+ +DVEEMVAMFLHI+AHDVKNRV++R F RSGET+SRHF  VL AVIR  + 
Subjt:  RHHFRQMTFFSMIRQSDLACRETTRMNRSCFETLCDMLRTHGGLRGTDYIDVEEMVAMFLHIMAHDVKNRVVRRIFTRSGETVSRHFQSVLTAVIRCLDI

Query:  LFKKPEPIQPSCTDSRWKWFENCLGALDGTHIELQVPVENRASFRNRKGIITTNVLVVCAPSGEFIYVLAGWEGSAADSRVLRDALSRNNGFQVPHVFID
        L KKP+P+   CTD RWKWFENCLGALDGT+I++ VP  +RA +R RKG + TNVL VC   G+F+YVLAGWEG AADSR+LRDALSR N  +VP     
Subjt:  LFKKPEPIQPSCTDSRWKWFENCLGALDGTHIELQVPVENRASFRNRKGIITTNVLVVCAPSGEFIYVLAGWEGSAADSRVLRDALSRNNGFQVPHVFID

Query:  PRYYYLCDAGYPNADGFLAPYRGERYHLSDWRG-SNPPRNPREFFNEAHSSARNIIERAFGALKNCWAILRHKSYYPPKVQVKIITACCLLHNLICREMG
          YYYL DAGY NA+GFLAPYRG+RYHL +WRG  N P   +EFFN  HSSARN+IERAFG LK  WAILR KSYYP +VQ + I ACCLLHNLI REM 
Subjt:  PRYYYLCDAGYPNADGFLAPYRGERYHLSDWRG-SNPPRNPREFFNEAHSSARNIIERAFGALKNCWAILRHKSYYPPKVQVKIITACCLLHNLICREMG

Query:  STIGLEILGENDATLYQEEMDDTPTINFVETSPLWTAFRDSMAQRMF
        +    + + E D+T      DD   I+++ETS  W+ +RD++A+ MF
Subjt:  STIGLEILGENDATLYQEEMDDTPTINFVETSPLWTAFRDSMAQRMF

A0A5A7U9H2 Retrotransposon protein1.1e-11660.23Show/hide
Query:  RHHFRQMTFFSMIRQSDLACRETTRMNRSCFETLCDMLRTHGGLRGTDYIDVEEMVAMFLHIMAHDVKNRVVRRIFTRSGETVSRHFQSVLTAVIRCLDI
        RH  RQ+ +F MI  SDL C ++TRM+R CF  LC +LRT  GL  T+ +DVEEMVAMFLHI+ HDVKNRV++R F RSGET+SRHF  VL AVIR  + 
Subjt:  RHHFRQMTFFSMIRQSDLACRETTRMNRSCFETLCDMLRTHGGLRGTDYIDVEEMVAMFLHIMAHDVKNRVVRRIFTRSGETVSRHFQSVLTAVIRCLDI

Query:  LFKKPEPIQPSCTDSRWKWFENCLGALDGTHIELQVPVENRASFRNRKGIITTNVLVVCAPSGEFIYVLAGWEGSAADSRVLRDALSRNNGFQVPHVFID
        L KKP+P+   CTD RW+WFENCLGALDGT+I++ VP  +RA +R RKG + TNVL VC   G+F+YVLAGWEGSAADSR+LRDALSR N  +VP     
Subjt:  LFKKPEPIQPSCTDSRWKWFENCLGALDGTHIELQVPVENRASFRNRKGIITTNVLVVCAPSGEFIYVLAGWEGSAADSRVLRDALSRNNGFQVPHVFID

Query:  PRYYYLCDAGYPNADGFLAPYRGERYHLSDWRG-SNPPRNPREFFNEAHSSARNIIERAFGALKNCWAILRHKSYYPPKVQVKIITACCLLHNLICREMG
          YYYL DAGYPNA+GFLAPYRG+RYHL +WRG  N P   +EFFN  HS ARN+IERAFG LK  WAILR KSYYP +VQ + I ACCLLHNLI REM 
Subjt:  PRYYYLCDAGYPNADGFLAPYRGERYHLSDWRG-SNPPRNPREFFNEAHSSARNIIERAFGALKNCWAILRHKSYYPPKVQVKIITACCLLHNLICREMG

Query:  STIGLEILGENDATLYQEEMDDTPTINFVETSPLWTAFRDSMAQRMF
        +    + + E D+T      DD   I+++ETS  W+ +RD++A+ MF
Subjt:  STIGLEILGENDATLYQEEMDDTPTINFVETSPLWTAFRDSMAQRMF

A0A5D3BDX0 Retrotransposon protein2.0e-11861.1Show/hide
Query:  RHHFRQMTFFSMIRQSDLACRETTRMNRSCFETLCDMLRTHGGLRGTDYIDVEEMVAMFLHIMAHDVKNRVVRRIFTRSGETVSRHFQSVLTAVIRCLDI
        RH  RQ+ +F MI  SDL CR++TRM+R CF  LC +LRT  GL  T+ +DVEEMVAMFLHI+AHDVKNRV++R F RSGET+SRHF  VL AVIR  + 
Subjt:  RHHFRQMTFFSMIRQSDLACRETTRMNRSCFETLCDMLRTHGGLRGTDYIDVEEMVAMFLHIMAHDVKNRVVRRIFTRSGETVSRHFQSVLTAVIRCLDI

Query:  LFKKPEPIQPSCTDSRWKWFENCLGALDGTHIELQVPVENRASFRNRKGIITTNVLVVCAPSGEFIYVLAGWEGSAADSRVLRDALSRNNGFQVPHVFID
        L KKP+P+   CTD RW+WFENCLGALDGT+I++ VP  +RA +R RKG + TNVL VC   G+F+YVLAGWEGSAADSR+LRDALSR N  +VP     
Subjt:  LFKKPEPIQPSCTDSRWKWFENCLGALDGTHIELQVPVENRASFRNRKGIITTNVLVVCAPSGEFIYVLAGWEGSAADSRVLRDALSRNNGFQVPHVFID

Query:  PRYYYLCDAGYPNADGFLAPYRGERYHLSDWRG-SNPPRNPREFFNEAHSSARNIIERAFGALKNCWAILRHKSYYPPKVQVKIITACCLLHNLICREMG
          YYYL DAGYPNA+GFLAPYRG+RYHL +WRG  N P   +EFFN  HSSARN+IERAFG LK  WAILR KSYYP +VQ + I ACCLLHNLI REM 
Subjt:  PRYYYLCDAGYPNADGFLAPYRGERYHLSDWRG-SNPPRNPREFFNEAHSSARNIIERAFGALKNCWAILRHKSYYPPKVQVKIITACCLLHNLICREMG

Query:  STIGLEILGENDATLYQEEMDDTPTINFVETSPLWTAFRDSMAQRMF
        +    + + E D+T      DD   I+++ETS  W+ +RD++A+ MF
Subjt:  STIGLEILGENDATLYQEEMDDTPTINFVETSPLWTAFRDSMAQRMF

SwissProt top hitse value%identityAlignment
B0BN95 Putative nuclease HARBI12.0e-1128.98Show/hide
Query:  LGALDGTHIELQVPVENRASFRNRKGIITTNVLVVCAPSGEFIYVLAGWEGSAADSRVLRDALSRNNGFQVPHVFIDPRYYYLCDAGYPNADGFLAPYRG
        +GA+D  H+ ++ P     S+ NRKG+ + N LVVC   G  + V   W GS  D  VL+ + S ++ F               + G P     L     
Subjt:  LGALDGTHIELQVPVENRASFRNRKGIITTNVLVVCAPSGEFIYVLAGWEGSAADSRVLRDALSRNNGFQVPHVFIDPRYYYLCDAGYPNADGFLAPYRG

Query:  ERYHLSDW--RGSNPPRNPREF-FNEAHSSARNIIERAFGAL---KNCWAILRHKSYYPPKVQVKIITACCLLHNL
          + L  W     + P  P E+ +N AHS+  ++IE+    L     C    +    Y P+    II ACC+LHN+
Subjt:  ERYHLSDW--RGSNPPRNPREF-FNEAHSSARNIIERAFGAL---KNCWAILRHKSYYPPKVQVKIITACCLLHNL

Q17QR8 Putative nuclease HARBI11.6e-1128.74Show/hide
Query:  LGALDGTHIELQVPVENRASFRNRKGIITTNVLVVCAPSGEFIYVLAGWEGSAADSRVLRDALSRNNGFQVPHVFIDPRYYYLCDAGYPNADGFLAPYRG
        +G +D  H+ ++ P     S+ NRKG+ + N L+VC   G  + V   W GS  D  VL+ + S ++ F+     +    + L D+ +     FL  +  
Subjt:  LGALDGTHIELQVPVENRASFRNRKGIITTNVLVVCAPSGEFIYVLAGWEGSAADSRVLRDALSRNNGFQVPHVFIDPRYYYLCDAGYPNADGFLAPYRG

Query:  ERYHLSDWRGSNPPRNPREF-FNEAHSSARNIIERAFGALKNCWAIL---RHKSYYPPKVQVKIITACCLLHNL
           H+        P  P E+ +N AHS+  ++IE+ F  L + +  L   +    Y P+    II ACC+LHN+
Subjt:  ERYHLSDWRGSNPPRNPREF-FNEAHSSARNIIERAFGALKNCWAIL---RHKSYYPPKVQVKIITACCLLHNL

Q5U538 Putative nuclease HARBI11.9e-0923.62Show/hide
Query:  LGALDGTHIELQVPVENRASFRNRKGIITTNVLVVCAPSGEFIYVLAGWEGSAADSRVLRDALSRNNGFQVPHVFIDPRYYYLCDAGYPNADGFLAPYRG
        LG +D T + ++ P     S+ N +G+ + N L+VC   G  ++      GS  D+ VL  +   +  F+     +  + + L D  +      + P + 
Subjt:  LGALDGTHIELQVPVENRASFRNRKGIITTNVLVVCAPSGEFIYVLAGWEGSAADSRVLRDALSRNNGFQVPHVFIDPRYYYLCDAGYPNADGFLAPYRG

Query:  ERYHLSDWRGSNPPRNPREF-FNEAHSSARNIIERAFGALK---NCWAILRHKSYYPPKVQVKIITACCLLHNLICREMGSTIGLEILGENDATLYQEE
                     P +P ++ +N AH++  +++ER   +L+    C    R    Y P+   +I+ ACC+LHN+  +       L+I+ E+ AT  + E
Subjt:  ERYHLSDWRGSNPPRNPREF-FNEAHSSARNIIERAFGALK---NCWAILRHKSYYPPKVQVKIITACCLLHNLICREMGSTIGLEILGENDATLYQEE

Q96MB7 Putative nuclease HARBI11.6e-1128.74Show/hide
Query:  LGALDGTHIELQVPVENRASFRNRKGIITTNVLVVCAPSGEFIYVLAGWEGSAADSRVLRDALSRNNGFQVPHVFIDPRYYYLCDAGYPNADGFLAPYRG
        +G +D  H+ ++ P     S+ NRKG+ + N L+VC   G  + V   W GS  D  VL+ + S ++ F+     +    + L D+ +     FL  +  
Subjt:  LGALDGTHIELQVPVENRASFRNRKGIITTNVLVVCAPSGEFIYVLAGWEGSAADSRVLRDALSRNNGFQVPHVFIDPRYYYLCDAGYPNADGFLAPYRG

Query:  ERYHLSDWRGSNPPRNPREF-FNEAHSSARNIIERAFGALKNCWAIL---RHKSYYPPKVQVKIITACCLLHNL
           H+        P  P E+ +N AHS+  ++IE+ F  L + +  L   +    Y P+    II ACC+LHN+
Subjt:  ERYHLSDWRGSNPPRNPREF-FNEAHSSARNIIERAFGALKNCWAIL---RHKSYYPPKVQVKIITACCLLHNL

Q9M2U3 Protein ALP1-like1.1e-1725.7Show/hide
Query:  RMNRSCFETLCDMLRTHGGLRGTDYID-------VEEMVAMFLHIMAHDVKNRVVRRIFTRSGETVS----RHFQSVLTAVIRCLDILFKKPEPIQPSCT
        +++R  F+ +C +++     +  ++ D       + + VA+ L  +       V+   F  +  TVS    R  +S+    I  L           PS  
Subjt:  RMNRSCFETLCDMLRTHGGLRGTDYID-------VEEMVAMFLHIMAHDVKNRVVRRIFTRSGETVS----RHFQSVLTAVIRCLDILFKKPEPIQPSCT

Query:  DSRWKWFE------NCLGALDGTHIELQVPV---ENRASFRNRKGIITTNVLVVCAPSGEFIYVLAGWEGSAADSRVLRDA--------LSRNNGFQVP-
        D     FE      NC GA+D THI + +P     N+      K    T +  V  P   F+ V+AGW GS  D  VL+++          R NG ++P 
Subjt:  DSRWKWFE------NCLGALDGTHIELQVPV---ENRASFRNRKGIITTNVLVVCAPSGEFIYVLAGWEGSAADSRVLRDA--------LSRNNGFQVP-

Query:  HVFIDPRYYYLCDAGYPNADGFLAPYRGERYHLSDWRGSNPPRNPREFFNEAHSSARNIIERAFGALKNCWAILRHKSYYPPKVQV-KIITACCLLHNLI
            + R Y + D+G+P     L PY+G+           P   P+  FN+ HS A    + A   LK+ W I+    + P + ++ +II  CCLLHN+I
Subjt:  HVFIDPRYYYLCDAGYPNADGFLAPYRGERYHLSDWRGSNPPRNPREFFNEAHSSARNIIERAFGALKNCWAILRHKSYYPPKVQV-KIITACCLLHNLI

Query:  CREMGSTIGLEILGENDATLYQE
              T+  + L +     Y++
Subjt:  CREMGSTIGLEILGENDATLYQE

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G43722.1 unknown protein1.3e-4238.58Show/hide
Query:  IRQSDLACRETTRMNRSCFETLCDMLRTHGGLRGTDYIDVEEMVAMFLHIMAHDVKNRVVRRIFTRSGETVSRHFQSVLTA--VIRCLDI-------LFK
        ++Q   AC +  RM+  CF TLC+ML+T+  L+ T  I +EE VAMFL I  H+   R V   F R+ ETV R F+ VLTA  ++ C  I       L++
Subjt:  IRQSDLACRETTRMNRSCFETLCDMLRTHGGLRGTDYIDVEEMVAMFLHIMAHDVKNRVVRRIFTRSGETVSRHFQSVLTA--VIRCLDI-------LFK

Query:  KPEPIQPSCTDSR-WKWFENCLGALDGTHIELQVPVENRASFRNRKGIITTNVLVVCAPSGEFIYVLAGWEGSAADSRVLRDALSRNNGFQVPHVFIDPR
         PE +Q    D R W +F   +GA+DGTH+ ++V  + +  + NR    + N++ +C     F Y+  G  GS  D+ VL+ A   ++ F +P       
Subjt:  KPEPIQPSCTDSR-WKWFENCLGALDGTHIELQVPVENRASFRNRKGIITTNVLVVCAPSGEFIYVLAGWEGSAADSRVLRDALSRNNGFQVPHVFIDPR

Query:  YYYLCDAGYPNADGFLAPYRGE-----RYHLSDWRGSNPPRNPREFFNEAHSSARNIIERAFGALKN
         YYL D+GYPN  G LAPYR       RYH+S +     PRN  E FN+ H+S R++IER F   KN
Subjt:  YYYLCDAGYPNADGFLAPYRGE-----RYHLSDWRGSNPPRNPREFFNEAHSSARNIIERAFGALKN

AT4G10890.1 unknown protein1.6e-1139.36Show/hide
Query:  DSRVLRDALSRNNGFQVPHVFIDPRYYYLCDAGYPNADGFLAPYRGERYHLSDWRGSNPPRNPREFFNEAHSSARNIIERAFGALKNCWAILRH
        D++VL+   +RN  F  PH     R YYL ++ YP   G+L P+R   YHL  +    PP   +E FN  H   R++I+R FG  K  W IL H
Subjt:  DSRVLRDALSRNNGFQVPHVFIDPRYYYLCDAGYPNADGFLAPYRGERYHLSDWRGSNPPRNPREFFNEAHSSARNIIERAFGALKNCWAILRH

AT5G28950.1 unknown protein6.1e-1941.38Show/hide
Query:  WKWFENCLGALDGTHIELQVPVENRASFRNRKGIITTNVLVVCAPSGEFIYVLAGWEGSAADSRVLRDALSRNNGFQVPHVFIDPRYYYLCDAGYPNADG
        + +F++C+GA+D THI   V  +   SFRNRKG I+ N+L  C    EF+YVL+GWEGSA DS+VL DAL+RN+  ++P    D     + +    N D 
Subjt:  WKWFENCLGALDGTHIELQVPVENRASFRNRKGIITTNVLVVCAPSGEFIYVLAGWEGSAADSRVLRDALSRNNGFQVPHVFIDPRYYYLCDAGYPNADG

Query:  FLAPYRGERYHLSDWR
         L     +R + + WR
Subjt:  FLAPYRGERYHLSDWR

AT5G35695.1 CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Putative harbinger transposase-derived nuclease (InterPro:IPR006912)8.7e-2637.31Show/hide
Query:  FIYVLAGWEGSAADSRVLRDALSRNNGFQVPHVFIDPRYYYLCDAGYPNADGFLAPYRGERYHLSDWRGS-NPPRNPREFFNEAHSSARNIIERAFGALK
        FIYVL+GWEGSA DSRVL DAL               R +YL D G+ N   FLAP+RG RYHL ++ G    P  P E FN  H S RN+IER FG  K
Subjt:  FIYVLAGWEGSAADSRVLRDALSRNNGFQVPHVFIDPRYYYLCDAGYPNADGFLAPYRGERYHLSDWRGS-NPPRNPREFFNEAHSSARNIIERAFGALK

Query:  NCWAILRHKSYYPPKVQVKIITACCLLHNLI---CREMGSTIGLEILGENDA------TLYQEEMDDTPTINFV----ETSPLWTAFRDSMAQRMFDTAQ
        + +AI +    +  K Q  ++  C  LHN +   CR   +    E+  E D        +   E+D+   +       E + +W   R SMA+ M+  A 
Subjt:  NCWAILRHKSYYPPKVQVKIITACCLLHNLI---CREMGSTIGLEILGENDA------TLYQEEMDDTPTINFV----ETSPLWTAFRDSMAQRMFDTAQ

Query:  N
        N
Subjt:  N

AT5G41980.1 CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Putative harbinger transposase-derived nuclease (InterPro:IPR006912)5.8e-5441.67Show/hide
Query:  CRETTRMNRSCFETLCDMLRTHGGLRGTDYIDVEEMVAMFLHIMAHDVKNRVVRRIFTRSGETVSRHFQSVLTAVIRCLDILFKKPEPIQPSCT-DSRWK
        C E  RM++  F  LCD+L+T G LR T+ I +E  +A+FL I+ H+++ R V+ +F  SGET+SRHF +VL AVI      F   +P   S T ++   
Subjt:  CRETTRMNRSCFETLCDMLRTHGGLRGTDYIDVEEMVAMFLHIMAHDVKNRVVRRIFTRSGETVSRHFQSVLTAVIRCLDILFKKPEPIQPSCT-DSRWK

Query:  WFENCLGALDGTHIELQVPVENRASFRNRKGIITTNVLVVCAPSGEFIYVLAGWEGSAADSRVLRDALSRNNGFQVPHVFIDPRYYYLCDAGYPNADGFL
        +F++C+G +D  HI + V V+ +  FRN  G++T NVL   +    F YVLAGWEGSA+D +VL  AL+R N  QVP        YY+ D  YPN  GF+
Subjt:  WFENCLGALDGTHIELQVPVENRASFRNRKGIITTNVLVVCAPSGEFIYVLAGWEGSAADSRVLRDALSRNNGFQVPHVFIDPRYYYLCDAGYPNADGFL

Query:  APYRGERYHLSDWRGSNPPRNPREFFNEAHSSARNIIERAFGALKNCWAILRHKSYYPPKVQVKIITACCLLHNLI
        APY G          +N     +E FNE H      I R FGALK  + IL     YP + QVK++ A C LHN +
Subjt:  APYRGERYHLSDWRGSNPPRNPREFFNEAHSSARNIIERAFGALKNCWAILRHKSYYPPKVQVKIITACCLLHNLI


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAACTACAACCCTAGGACCAAAAACTATAGCTCTTTCTTTAGACACCATTTTCGCCAAATGACCTTTTTCTCGATGATAAGACAAAGCGATTTAGCTTGTCGTGAGAC
AACTAGAATGAATCGTAGCTGCTTTGAAACTTTGTGCGACATGCTAAGGACCCACGGTGGTCTTCGAGGTACAGATTACATCGACGTGGAGGAAATGGTAGCCATGTTTC
TACATATCATGGCTCATGATGTTAAGAACCGTGTCGTTCGAAGAATATTTACAAGATCCGGTGAAACAGTGTCGCGACACTTTCAATCTGTCCTTACTGCTGTTATTCGT
TGTCTTGACATTTTGTTCAAGAAACCCGAACCTATCCAACCATCATGCACCGATAGTAGATGGAAGTGGTTTGAGAATTGCCTAGGTGCATTGGATGGTACTCATATAGA
GTTACAAGTCCCAGTTGAAAATCGTGCCTCCTTTAGAAATAGGAAGGGTATCATCACAACGAACGTTCTTGTTGTATGCGCTCCAAGCGGAGAGTTCATATACGTACTAG
CTGGGTGGGAGGGATCAGCAGCTGACTCTAGAGTTCTTAGGGATGCTTTATCTCGTAACAATGGATTTCAAGTCCCTCATGTGTTTATTGATCCAAGATACTATTACCTT
TGTGATGCGGGTTATCCAAATGCTGATGGATTCCTAGCTCCCTATAGAGGCGAACGTTATCACCTATCGGATTGGAGGGGTAGCAATCCACCACGGAATCCAAGAGAGTT
TTTTAATGAGGCACACTCCTCGGCGCGAAATATAATAGAAAGAGCGTTCGGTGCATTAAAAAATTGTTGGGCTATTCTGCGACACAAGTCTTACTATCCTCCAAAAGTGC
AAGTGAAGATCATAACAGCTTGTTGTCTCCTACATAATTTAATATGTAGGGAGATGGGCTCTACGATTGGTTTAGAGATATTAGGGGAGAACGATGCTACACTATACCAA
GAGGAAATGGACGATACCCCAACGATTAATTTCGTCGAGACATCGCCTCTTTGGACTGCATTTCGAGATTCCATGGCCCAAAGAATGTTTGACACAGCCCAAAACTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGAACTACAACCCTAGGACCAAAAACTATAGCTCTTTCTTTAGACACCATTTTCGCCAAATGACCTTTTTCTCGATGATAAGACAAAGCGATTTAGCTTGTCGTGAGAC
AACTAGAATGAATCGTAGCTGCTTTGAAACTTTGTGCGACATGCTAAGGACCCACGGTGGTCTTCGAGGTACAGATTACATCGACGTGGAGGAAATGGTAGCCATGTTTC
TACATATCATGGCTCATGATGTTAAGAACCGTGTCGTTCGAAGAATATTTACAAGATCCGGTGAAACAGTGTCGCGACACTTTCAATCTGTCCTTACTGCTGTTATTCGT
TGTCTTGACATTTTGTTCAAGAAACCCGAACCTATCCAACCATCATGCACCGATAGTAGATGGAAGTGGTTTGAGAATTGCCTAGGTGCATTGGATGGTACTCATATAGA
GTTACAAGTCCCAGTTGAAAATCGTGCCTCCTTTAGAAATAGGAAGGGTATCATCACAACGAACGTTCTTGTTGTATGCGCTCCAAGCGGAGAGTTCATATACGTACTAG
CTGGGTGGGAGGGATCAGCAGCTGACTCTAGAGTTCTTAGGGATGCTTTATCTCGTAACAATGGATTTCAAGTCCCTCATGTGTTTATTGATCCAAGATACTATTACCTT
TGTGATGCGGGTTATCCAAATGCTGATGGATTCCTAGCTCCCTATAGAGGCGAACGTTATCACCTATCGGATTGGAGGGGTAGCAATCCACCACGGAATCCAAGAGAGTT
TTTTAATGAGGCACACTCCTCGGCGCGAAATATAATAGAAAGAGCGTTCGGTGCATTAAAAAATTGTTGGGCTATTCTGCGACACAAGTCTTACTATCCTCCAAAAGTGC
AAGTGAAGATCATAACAGCTTGTTGTCTCCTACATAATTTAATATGTAGGGAGATGGGCTCTACGATTGGTTTAGAGATATTAGGGGAGAACGATGCTACACTATACCAA
GAGGAAATGGACGATACCCCAACGATTAATTTCGTCGAGACATCGCCTCTTTGGACTGCATTTCGAGATTCCATGGCCCAAAGAATGTTTGACACAGCCCAAAACTAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MNYNPRTKNYSSFFRHHFRQMTFFSMIRQSDLACRETTRMNRSCFETLCDMLRTHGGLRGTDYIDVEEMVAMFLHIMAHDVKNRVVRRIFTRSGETVSRHFQSVLTAVIR
CLDILFKKPEPIQPSCTDSRWKWFENCLGALDGTHIELQVPVENRASFRNRKGIITTNVLVVCAPSGEFIYVLAGWEGSAADSRVLRDALSRNNGFQVPHVFIDPRYYYL
CDAGYPNADGFLAPYRGERYHLSDWRGSNPPRNPREFFNEAHSSARNIIERAFGALKNCWAILRHKSYYPPKVQVKIITACCLLHNLICREMGSTIGLEILGENDATLYQ
EEMDDTPTINFVETSPLWTAFRDSMAQRMFDTAQN