| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAG6599320.1 Histone H1.2, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia] | 2.0e-59 | 66.67 | Show/hide |
Query: MSSAADEL----------SVVEPVK-----------KASKAKKPSAAKRTKSSPSHPPFFQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFNEEKHKQLPSNFRKLL
MSSAAD + +V +PV+ KASKAKKPS AKRT+SSP+HPPFF+MISEAIVSLKERTGSSQYAITKF+EEKHKQLPSNFRKLL
Subjt: MSSAADEL----------SVVEPVK-----------KASKAKKPSAAKRTKSSPSHPPFFQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFNEEKHKQLPSNFRKLL
Query: LVQLKKLVAADKIVKIKNSYKLPSARSVKEKTAAA-------ASAEVAAAPVASKKTVAAKSKAKTAAKPK----SKPMTVAKSKAAA-------VKPKA
LV LKKLVAADK+VK+KNSYKLPSARS K AAA AS+++ AA V+ KK AK KAKTA KPK +KP AKSK A K KA
Subjt: LVQLKKLVAADKIVKIKNSYKLPSARSVKEKTAAA-------ASAEVAAAPVASKKTVAAKSKAKTAAKPK----SKPMTVAKSKAAA-------VKPKA
Query: AEKVKKVAPKPKPVAKPAKAARTSSRTSPGKRAAPAAKTKKVAAKSKKIAKSPAKKVQARKVKK
AEKVKKVAPKPKP AKPAK A+T SRTSPGK+AAPAAK KKVAAK K KSPA+KVQARKVKK
Subjt: AEKVKKVAPKPKPVAKPAKAARTSSRTSPGKRAAPAAKTKKVAAKSKKIAKSPAKKVQARKVKK
|
|
| XP_004139246.1 histone H1 [Cucumis sativus] | 2.8e-61 | 67.3 | Show/hide |
Query: MSSAADEL--------SVVEPVK-----------KASKAKKPSAAKRTKSSPSHPPFFQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFNEEKHKQLPSNFRKLLLV
MSSAAD + +V +P + KASKAKKPS AK+ +SSP+HPPF QMISEAIVSLKERTGSSQYAITKF EEKHKQLPSNFRKLLLV
Subjt: MSSAADEL--------SVVEPVK-----------KASKAKKPSAAKRTKSSPSHPPFFQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFNEEKHKQLPSNFRKLLLV
Query: QLKKLVAADKIVKIKNSYKLPSARSVKEKTAAAASAEVAA-APVAS-------KKTVAAKSKAKTAAKP------KSKPMTVAKSKA-----AAVKPKAA
LKKLVAA+K+VK+KNSYKLPSARS++ K AAAA+A V A PV+S KK AKSKAKTAAKP K KP TVAKSK A K KAA
Subjt: QLKKLVAADKIVKIKNSYKLPSARSVKEKTAAAASAEVAA-APVAS-------KKTVAAKSKAKTAAKP------KSKPMTVAKSKA-----AAVKPKAA
Query: EKVKKVAPKPKPVAKPAKAARTSSRTSPGKRAAPAAKTKKVAAKSKKIAKSPAKKVQARKVKK
EKVKKVAPKPKP AK AK A+T SRTSPGKRAAPA K KKVAAK K KSPA+KVQARKVKK
Subjt: EKVKKVAPKPKPVAKPAKAARTSSRTSPGKRAAPAAKTKKVAAKSKKIAKSPAKKVQARKVKK
|
|
| XP_022946127.1 histone H1-like [Cucurbita moschata] | 4.5e-59 | 66.29 | Show/hide |
Query: MSSAADEL----------SVVEPVK-----------KASKAKKPSAAKRTKSSPSHPPFFQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFNEEKHKQLPSNFRKLL
MSSAAD + +V +PV+ KASKAKKPS AKRT+SSP+HPPFF+MISEAIVSLKERTGSSQYAITKF+EEKHK+LPSNFRKLL
Subjt: MSSAADEL----------SVVEPVK-----------KASKAKKPSAAKRTKSSPSHPPFFQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFNEEKHKQLPSNFRKLL
Query: LVQLKKLVAADKIVKIKNSYKLPSARSVKEKTAAA-------ASAEVAAAPVASKKTVAAKSKAKTAAKPK----SKPMTVAKSKAAA-------VKPKA
LV LKKLVAADK+VK+KNSYKLPSARS K AAA AS+++ AA V+ KK AK KAKTA KPK +KP + AKSK A K KA
Subjt: LVQLKKLVAADKIVKIKNSYKLPSARSVKEKTAAA-------ASAEVAAAPVASKKTVAAKSKAKTAAKPK----SKPMTVAKSKAAA-------VKPKA
Query: AEKVKKVAPKPKPVAKPAKAARTSSRTSPGKRAAPAAKTKKVAAKSKKIAKSPAKKVQARKVKK
AEKVKKVAPKPKP AKPAK A+T SRTSPGK+AAPAAK KKVAAK K KSPA+KVQARKVKK
Subjt: AEKVKKVAPKPKPVAKPAKAARTSSRTSPGKRAAPAAKTKKVAAKSKKIAKSPAKKVQARKVKK
|
|
| XP_022999095.1 histone H1-like [Cucurbita maxima] | 7.7e-59 | 70.59 | Show/hide |
Query: DELSVVEPVKKASKAKKPSAAKRTKSSPSHPPFFQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFNEEKHKQLPSNFRKLLLVQLKKLVAADKIVKIKNSYKLPSAR
D S KASKAKKPS AKRT+SSP+HPPFF+MISEAIVSLKERTGSSQYAITKF+EEKHKQLPSNFRKLLLV LKKLVAADK+VK+KNSYKLPSAR
Subjt: DELSVVEPVKKASKAKKPSAAKRTKSSPSHPPFFQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFNEEKHKQLPSNFRKLLLVQLKKLVAADKIVKIKNSYKLPSAR
Query: SVKEKTAAA-------ASAEVAAAPVASKKTVAAKSKAKTAAKPK----SKPMTVAKSK-------AAAVKPKAAEKVKKVAPKPKPVAKPAKAARTSSR
S K AAA AS+++ AA V+ KK AK KAKTA KPK +KP AKSK A K KAAEKVKKVAPKPKP AKPAK A+T SR
Subjt: SVKEKTAAA-------ASAEVAAAPVASKKTVAAKSKAKTAAKPK----SKPMTVAKSK-------AAAVKPKAAEKVKKVAPKPKPVAKPAKAARTSSR
Query: TSPGKRAAPAAKTKKVAAKSKKIAKSPAKKVQARKVKK
SPGK+AAPAAK KKVAAK K KSPA+KVQARKVKK
Subjt: TSPGKRAAPAAKTKKVAAKSKKIAKSPAKKVQARKVKK
|
|
| XP_023521173.1 histone H1-like [Cucurbita pepo subsp. pepo] | 1.6e-59 | 71.01 | Show/hide |
Query: DELSVVEPVKKASKAKKPSAAKRTKSSPSHPPFFQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFNEEKHKQLPSNFRKLLLVQLKKLVAADKIVKIKNSYKLPSAR
D S KASKAKKPS AKRT+SSP+HPPFF+MISEAIVSLKERTGSSQYAITKF+EEKHKQLPSNFRKLLLV LKKLVAADK+VK+KNSYKLPSAR
Subjt: DELSVVEPVKKASKAKKPSAAKRTKSSPSHPPFFQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFNEEKHKQLPSNFRKLLLVQLKKLVAADKIVKIKNSYKLPSAR
Query: SVKEKTAAA-------ASAEVAAAPVASKKTVAAKSKAKTAAKPK----SKPMTVAKSKAAA-------VKPKAAEKVKKVAPKPKPVAKPAKAARTSSR
S K AAA AS+++ AA V+ KK AK KAKTA KPK +KP AKSK A K KAAEKVKKVAPKPKP AKPAK A+T SR
Subjt: SVKEKTAAA-------ASAEVAAAPVASKKTVAAKSKAKTAAKPK----SKPMTVAKSKAAA-------VKPKAAEKVKKVAPKPKPVAKPAKAARTSSR
Query: TSPGKRAAPAAKTKKVAAKSKKIAKSPAKKVQARKVKK
TSPGK+AAPAAK KKVAAK K KSPA+KVQARKVKK
Subjt: TSPGKRAAPAAKTKKVAAKSKKIAKSPAKKVQARKVKK
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A1S3C278 histone H1-like | 2.7e-57 | 69.04 | Show/hide |
Query: DELSVVEPVKKASKAKKPSAAKRTKSSPSHPPFFQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFNEEKHKQLPSNFRKLLLVQLKKLVAADKIVKIKNSYKLPSAR
D S KASKAKKPS AK+ +SSP+HPPF QMISEAIVSLKERTGSSQYAITKF EEKHKQLPSNFRKLLLV LKKLVAADK+VK+KNSYKLPSAR
Subjt: DELSVVEPVKKASKAKKPSAAKRTKSSPSHPPFFQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFNEEKHKQLPSNFRKLLLVQLKKLVAADKIVKIKNSYKLPSAR
Query: SVKEKTAAAASAEVAAAPVAS--------KKTVAAKSKAKTAAK------PKSKPMTVAKSKA-----AAVKPKAAEKVKKVAPKPKPVAKPAKAARTSS
S++ K AAAA PV+S KK AK KAKTAAK K KP TV KSK A K KAAEKVKKVAPKPK AK K A+T S
Subjt: SVKEKTAAAASAEVAAAPVAS--------KKTVAAKSKAKTAAK------PKSKPMTVAKSKA-----AAVKPKAAEKVKKVAPKPKPVAKPAKAARTSS
Query: RTSPGKRAAPAAKTKKVAAKSKKIAKSPAKKVQARKVKK
RTSPGKRAAPAAK KKVAAK K KSPA+KVQARKVKK
Subjt: RTSPGKRAAPAAKTKKVAAKSKKIAKSPAKKVQARKVKK
|
|
| A0A5D3D4H1 Histone H1-like | 3.2e-58 | 69.46 | Show/hide |
Query: DELSVVEPVKKASKAKKPSAAKRTKSSPSHPPFFQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFNEEKHKQLPSNFRKLLLVQLKKLVAADKIVKIKNSYKLPSAR
D S KASKAKKPS AK+ +SSP+HPPF QMISEAIVSLKERTGSSQYAITKF EEKHKQLPSNFRKLLLV LKKLVAADK+VK+KNSYKLPSAR
Subjt: DELSVVEPVKKASKAKKPSAAKRTKSSPSHPPFFQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFNEEKHKQLPSNFRKLLLVQLKKLVAADKIVKIKNSYKLPSAR
Query: SVKEKTAAAASAEVAAAPVAS--------KKTVAAKSKAKTAAKP------KSKPMTVAKSKA-----AAVKPKAAEKVKKVAPKPKPVAKPAKAARTSS
S++ K AAAA PV+S KK AK KAKTAAKP K KP TV KSK A K KAAEKVKKVAPKPK AK K A+T S
Subjt: SVKEKTAAAASAEVAAAPVAS--------KKTVAAKSKAKTAAKP------KSKPMTVAKSKA-----AAVKPKAAEKVKKVAPKPKPVAKPAKAARTSS
Query: RTSPGKRAAPAAKTKKVAAKSKKIAKSPAKKVQARKVKK
RTSPGKRAAPAAK KKVAAK K KSPA+KVQARKVKK
Subjt: RTSPGKRAAPAAKTKKVAAKSKKIAKSPAKKVQARKVKK
|
|
| A0A6J1CNP7 histone H1-like | 7.0e-58 | 66.67 | Show/hide |
Query: SSAADELSVVEPVK-------KASKAKKPSAAKRTKSSPSHPPFFQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFNEEKHKQLPSNFRKLLLVQLKKLVAADKIVK
+ AA+ L+V K KASKAKKPS AKR KSSP+HPPFFQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKF+EEKHKQLPSNFRKLLLV LKKLVAADK+VK
Subjt: SSAADELSVVEPVK-------KASKAKKPSAAKRTKSSPSHPPFFQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFNEEKHKQLPSNFRKLLLVQLKKLVAADKIVK
Query: IKNSYKLPSARSVKEKTAA------AASAEVAAAPVASKKTVAAKSKAKTAAKPKS----KPMTVAKSK--------AAAVKPKAAEKVKKVAPKPKPVA
+KNSYKLPSARS++ K AA AS+++ AA KK K KAKTA KPK KP T++KSK AAA KPKAA KV K A K KP A
Subjt: IKNSYKLPSARSVKEKTAA------AASAEVAAAPVASKKTVAAKSKAKTAAKPKS----KPMTVAKSK--------AAAVKPKAAEKVKKVAPKPKPVA
Query: KPAKAARTSSRTSPGKRAAPAAKTKKVAAKSKKIAKSPAKKVQARKVKK
+PAK A+T ++TSPGKRAAPAAK KKVAAK K KSPA+KVQARKVKK
Subjt: KPAKAARTSSRTSPGKRAAPAAKTKKVAAKSKKIAKSPAKKVQARKVKK
|
|
| A0A6J1G2W2 histone H1-like | 2.2e-59 | 66.29 | Show/hide |
Query: MSSAADEL----------SVVEPVK-----------KASKAKKPSAAKRTKSSPSHPPFFQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFNEEKHKQLPSNFRKLL
MSSAAD + +V +PV+ KASKAKKPS AKRT+SSP+HPPFF+MISEAIVSLKERTGSSQYAITKF+EEKHK+LPSNFRKLL
Subjt: MSSAADEL----------SVVEPVK-----------KASKAKKPSAAKRTKSSPSHPPFFQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFNEEKHKQLPSNFRKLL
Query: LVQLKKLVAADKIVKIKNSYKLPSARSVKEKTAAA-------ASAEVAAAPVASKKTVAAKSKAKTAAKPK----SKPMTVAKSKAAA-------VKPKA
LV LKKLVAADK+VK+KNSYKLPSARS K AAA AS+++ AA V+ KK AK KAKTA KPK +KP + AKSK A K KA
Subjt: LVQLKKLVAADKIVKIKNSYKLPSARSVKEKTAAA-------ASAEVAAAPVASKKTVAAKSKAKTAAKPK----SKPMTVAKSKAAA-------VKPKA
Query: AEKVKKVAPKPKPVAKPAKAARTSSRTSPGKRAAPAAKTKKVAAKSKKIAKSPAKKVQARKVKK
AEKVKKVAPKPKP AKPAK A+T SRTSPGK+AAPAAK KKVAAK K KSPA+KVQARKVKK
Subjt: AEKVKKVAPKPKPVAKPAKAARTSSRTSPGKRAAPAAKTKKVAAKSKKIAKSPAKKVQARKVKK
|
|
| A0A6J1KEC3 histone H1-like | 3.7e-59 | 70.59 | Show/hide |
Query: DELSVVEPVKKASKAKKPSAAKRTKSSPSHPPFFQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFNEEKHKQLPSNFRKLLLVQLKKLVAADKIVKIKNSYKLPSAR
D S KASKAKKPS AKRT+SSP+HPPFF+MISEAIVSLKERTGSSQYAITKF+EEKHKQLPSNFRKLLLV LKKLVAADK+VK+KNSYKLPSAR
Subjt: DELSVVEPVKKASKAKKPSAAKRTKSSPSHPPFFQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFNEEKHKQLPSNFRKLLLVQLKKLVAADKIVKIKNSYKLPSAR
Query: SVKEKTAAA-------ASAEVAAAPVASKKTVAAKSKAKTAAKPK----SKPMTVAKSK-------AAAVKPKAAEKVKKVAPKPKPVAKPAKAARTSSR
S K AAA AS+++ AA V+ KK AK KAKTA KPK +KP AKSK A K KAAEKVKKVAPKPKP AKPAK A+T SR
Subjt: SVKEKTAAA-------ASAEVAAAPVASKKTVAAKSKAKTAAKPK----SKPMTVAKSK-------AAAVKPKAAEKVKKVAPKPKPVAKPAKAARTSSR
Query: TSPGKRAAPAAKTKKVAAKSKKIAKSPAKKVQARKVKK
SPGK+AAPAAK KKVAAK K KSPA+KVQARKVKK
Subjt: TSPGKRAAPAAKTKKVAAKSKKIAKSPAKKVQARKVKK
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| P08283 Histone H1 | 2.8e-27 | 50.44 | Show/hide |
Query: VEPVKKASKAKKPSAAKRTKSSPSHPPFFQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFNEEKHKQLPSNFRKLLLVQLKKLVAADKIVKIKNSYKLPSARSVKEK
VE KKA K KP A + ++ SHP + +MI +AIVSLKE+ GSSQYAI KF EEK KQLP+NF+KLLL LKK VA+ K++K+K S+KL +A K+
Subjt: VEPVKKASKAKKPSAAKRTKSSPSHPPFFQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFNEEKHKQLPSNFRKLLLVQLKKLVAADKIVKIKNSYKLPSARSVKEK
Query: TAAAASAEVAAAPVASKKTVAAKSKAKTAAKPK--SKPMTV-AKSKAAAVKPK-AAEKVKKVAPKPKPV------AKPAKAARTSSRTSPGKRAAPAAK-
A A+ AA + K AAK KAK KPK SK V AK K AA KPK A K K A KPK V KPAK A+TS +T+PGK+ A K
Subjt: TAAAASAEVAAAPVASKKTVAAKSKAKTAAKPK--SKPMTV-AKSKAAAVKPK-AAEKVKKVAPKPKPV------AKPAKAARTSSRTSPGKRAAPAAK-
Query: -TKKVAAKS--KKIAKSPAKKVQARK
KKV KS K KSP KKV ++
Subjt: -TKKVAAKS--KKIAKSPAKKVQARK
|
|
| P23444 Histone H1 | 1.2e-27 | 51.58 | Show/hide |
Query: ASKAKKPSAAKRTKSSPSHPPFFQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFNEEKHK-QLPSNFRKLLLVQLKKLVAADKIVKIKNSYKLPSARSVKEKTAAA-
A+KAKK +A K+ ++SP+H P+ +M+SEAI SLKERTGSS YAI KF E+KHK +LP NFRKLL VQLKKLVA K+ K+KNSYKL SA K AA
Subjt: ASKAKKPSAAKRTKSSPSHPPFFQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFNEEKHK-QLPSNFRKLLLVQLKKLVAADKIVKIKNSYKLPSARSVKEKTAAA-
Query: ----ASAEVAAAPVASKKTVAAKSKAKTAAKPKSKPMTVAKSKAAA---VKPKAAEKVKKVAPKPKPVAKP---AKAARTSSRTSPGKRAAPAAKTKKVA
A+ A K AK+K T KP +KP V K K A KP A K K KPKP+AK AKAA+TS++ +PGK+ APA K A
Subjt: ----ASAEVAAAPVASKKTVAAKSKAKTAAKPKSKPMTVAKSKAAA---VKPKAAEKVKKVAPKPKPVAKP---AKAARTSSRTSPGKRAAPAAKTKKVA
Query: AKSKKIAKSPAKKVQARKVKK
A SKK A +P +K +RK KK
Subjt: AKSKKIAKSPAKKVQARKVKK
|
|
| P26569 Histone H1.2 | 1.5e-33 | 51.61 | Show/hide |
Query: EPVKKASKAKKPSAAKRT------------KSSPSHPPFFQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFNEEKHKQLPSNFRKLLLVQLKKLVAADKIVKIKNSY
+P K K+KK + AK T K++ SHP + +MI +AIV+LKERTGSSQYAI KF EEKHK LP FRKLLLV LK+LVA++K+VK+K S+
Subjt: EPVKKASKAKKPSAAKRT------------KSSPSHPPFFQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFNEEKHKQLPSNFRKLLLVQLKKLVAADKIVKIKNSY
Query: KLPSARS---------VKEKTAAAA--SAEVAAAPVASKKTVAAKSKAKTAAKPKSKPMTVAKSKA--AAVKPK-----AAEKVKKVAPKPKPVAKPAKA
K+PSARS VK+K A +VAAA +K AAK K AAK +K AK KA A KPK A K K VA KPK +PAKA
Subjt: KLPSARS---------VKEKTAAAA--SAEVAAAPVASKKTVAAKSKAKTAAKPKSKPMTVAKSKA--AAVKPK-----AAEKVKKVAPKPKPVAKPAKA
Query: ARTSSRTSPGKR-AAPAAK---TKKVAAKSKKIAKSPAKKVQARKVKK
+RTS+RTSPGK+ AAPA K TKK AKS K+ KSPAK+ RK KK
Subjt: ARTSSRTSPGKR-AAPAAK---TKKVAAKSKKIAKSPAKKVQARKVKK
|
|
| P37218 Histone H1 | 2.2e-32 | 47.62 | Show/hide |
Query: KKASKAKKPSAAKRTKSSPSHPPFFQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFNEEKHKQLPSNFRKLLLVQLKKLVAADKIVKIKNSYKLPSA----------
KK +KAKKP+A ++ ++P+HPP+F+MI +AIV+LKERTGSSQ+AITKF EEK K LPSNF+KLLL QLKK VA++K+VK+KNSYKLPS
Subjt: KKASKAKKPSAAKRTKSSPSHPPFFQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFNEEKHKQLPSNFRKLLLVQLKKLVAADKIVKIKNSYKLPSA----------
Query: ----------------RSVKEKTAAAASAEVAA-APVASKKTVAAKSKAKTAAKPKSKPMTVAKSK---AAAVKPKAAEKVKKVAPKPKPVAKP------
+VK K AA A+ AA A A+K AAK+K AKP +K VAK+K AAA KPKAA K K K K KP
Subjt: ----------------RSVKEKTAAAASAEVAA-APVASKKTVAAKSKAKTAAKPKSKPMTVAKSK---AAAVKPKAAEKVKKVAPKPKPVAKP------
Query: --AKAARTSSRTSPGKRAAP---AAKTKKVAAKSKKIAKSPAKKVQARKVKK
AK A+T++RT+P ++AAP AK + V K KSPAKK ++ +K
Subjt: --AKAARTSSRTSPGKRAAP---AAKTKKVAAKSKKIAKSPAKKVQARKVKK
|
|
| Q9M5W4 Histone H1 | 5.4e-31 | 53.42 | Show/hide |
Query: ADELSVVEPVKKASKAKKPSAAKRTKSSPSHPPFFQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFNEEKHKQLPSNFRKLLLVQLKKLVAADKIVKIKNSYKLPSA
A + V + KK AKKP ++K + SHP FF+MIS+AI +LKERTGSSQYAI KF E+KHKQLPSNFRKLLL LKKLVA+ K+VK+KNS+KLPSA
Subjt: ADELSVVEPVKKASKAKKPSAAKRTKSSPSHPPFFQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFNEEKHKQLPSNFRKLLLVQLKKLVAADKIVKIKNSYKLPSA
Query: RSVKEKTAAAASAEVAAAPVASKKTVAAKSK-AKTAAKPKSKPMTVAKSKA----AAVKPKAAEKVKKVAPKPKPV-AKPAKAARTSSRTSPGKRAAPAA
R AA + +A P K VAAK K AK AKPK+K AK+KA A K AA+ K A KPK V AKPAK A+T++ SPGK+
Subjt: RSVKEKTAAAASAEVAAAPVASKKTVAAKSK-AKTAAKPKSKPMTVAKSKA----AAVKPKAAEKVKKVAPKPKPV-AKPAKAARTSSRTSPGKRAAPAA
Query: KTKKVAAKSKKIAKSPAKK
K V K K KSPA K
Subjt: KTKKVAAKSKKIAKSPAKK
|
|
| Arabidopsis top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AT1G06760.1 winged-helix DNA-binding transcription factor family protein | 3.2e-26 | 48.44 | Show/hide |
Query: VKKASKAKKPSAAKRTKSSPSHPPFFQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFNEEKHKQLPSNFRKLLLVQLKKLVAADKIVKIKNSYKLPSA-------RS
VK+ + K +AA + ++ SHP + +MI +AIV+LKERTGSSQYAI KF EEK K+LP FRKLLL+ LK+LVA+ K+VK+K S+KLPSA ++
Subjt: VKKASKAKKPSAAKRTKSSPSHPPFFQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFNEEKHKQLPSNFRKLLLVQLKKLVAADKIVKIKNSYKLPSA-------RS
Query: VKEKTAAAASAEVAAAPVASKKTVAAKSKAK--TAAKPKS----KPMTVAKSKAAAVKPKAAEKVKKVAPKPKPVAKPAKAARTSSRTSPGKRAAPAAKT
EK+A A A +K+ VAA SKAK A KPK+ K AK+K AA K K V KPK A+PAKAA+T+ TSP K+A A T
Subjt: VKEKTAAAASAEVAAAPVASKKTVAAKSKAK--TAAKPKS----KPMTVAKSKAAAVKPKAAEKVKKVAPKPKPVAKPAKAARTSSRTSPGKRAAPAAKT
Query: KKVAAKSKKIAKSPAKKVQARKVKK
KKVA + K K+P KKV K K
Subjt: KKVAAKSKKIAKSPAKKVQARKVKK
|
|
| AT2G18050.1 histone H1-3 | 8.0e-14 | 42.14 | Show/hide |
Query: VKKASKAKKPSAAKRTKSSPSHPPFFQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFNEEKHKQ-LPSNFRKLLLVQLKKLVAADKIVKIKNSYKLPSARSV-----
+KK AKKP K T +HPP+FQMI EA++ LKE+ GSS YAI K EEKHK LP +FRK L +QLK VA K+VKI+ SYKL +
Subjt: VKKASKAKKPSAAKRTKSSPSHPPFFQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFNEEKHKQ-LPSNFRKLLLVQLKKLVAADKIVKIKNSYKLPSARSV-----
Query: ------------KEKTAAAASAEVAAAPVASKKTVAAKSKAKTAAKPKSKPMTVAKSKA
KE T S+ S K K K A +PKS +V K KA
Subjt: ------------KEKTAAAASAEVAAAPVASKKTVAAKSKAKTAAKPKSKPMTVAKSKA
|
|
| AT2G18050.2 histone H1-3 | 8.1e-06 | 39.13 | Show/hide |
Query: MISEAIVSLKERTGSSQYAITKFNEEKHKQ-LPSNFRKLLLVQLKKLVAADKIVKIKNSYKLPSARSV--------KEKTAAAASAEVA----AAPVASK
MI EA++ LKE+ GSS YAI K EEKHK LP +FRK L +QLK VA K+VKI+ SYKL + +K E+ ++ K
Subjt: MISEAIVSLKERTGSSQYAITKFNEEKHKQ-LPSNFRKLLLVQLKKLVAADKIVKIKNSYKLPSARSV--------KEKTAAAASAEVA----AAPVASK
Query: KTVAA-KSKAKTAAKPKSKPMTVAKS--KAAAVKPKAA
KTV+ K + K K +P ++ S K A+K AA
Subjt: KTVAA-KSKAKTAAKPKSKPMTVAKS--KAAAVKPKAA
|
|
| AT2G30620.1 winged-helix DNA-binding transcription factor family protein | 1.1e-34 | 51.61 | Show/hide |
Query: EPVKKASKAKKPSAAKRT------------KSSPSHPPFFQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFNEEKHKQLPSNFRKLLLVQLKKLVAADKIVKIKNSY
+P K K+KK + AK T K++ SHP + +MI +AIV+LKERTGSSQYAI KF EEKHK LP FRKLLLV LK+LVA++K+VK+K S+
Subjt: EPVKKASKAKKPSAAKRT------------KSSPSHPPFFQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFNEEKHKQLPSNFRKLLLVQLKKLVAADKIVKIKNSY
Query: KLPSARS---------VKEKTAAAA--SAEVAAAPVASKKTVAAKSKAKTAAKPKSKPMTVAKSKA--AAVKPK-----AAEKVKKVAPKPKPVAKPAKA
K+PSARS VK+K A +VAAA +K AAK K AAK +K AK KA A KPK A K K VA KPK +PAKA
Subjt: KLPSARS---------VKEKTAAAA--SAEVAAAPVASKKTVAAKSKAKTAAKPKSKPMTVAKSKA--AAVKPK-----AAEKVKKVAPKPKPVAKPAKA
Query: ARTSSRTSPGKR-AAPAAK---TKKVAAKSKKIAKSPAKKVQARKVKK
+RTS+RTSPGK+ AAPA K TKK AKS K+ KSPAK+ RK KK
Subjt: ARTSSRTSPGKR-AAPAAK---TKKVAAKSKKIAKSPAKKVQARKVKK
|
|
| AT2G30620.2 winged-helix DNA-binding transcription factor family protein | 1.1e-26 | 45.65 | Show/hide |
Query: EPVKKASKAKKPSAAKRT------------KSSPSHPPFFQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFNEEKHKQLPSNFRKLLLVQLKKLVAADKIVKIKNSY
+P K K+KK + AK T K++ SHP + +MI +AIV+LKERTGSSQYAI KF EEKHK LP FRKLLLV LK+LVA++K+VK+K S+
Subjt: EPVKKASKAKKPSAAKRT------------KSSPSHPPFFQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFNEEKHKQLPSNFRKLLLVQLKKLVAADKIVKIKNSY
Query: KLPSARSVKEKTAAAASAEVAAAPVASKKTVAAKSKAKTAAKPKSKPMTVAKSKAAAVKPKAAEKVKKVAPKPKPVAKPAKAARTSSRTSPGKR-AAPAA
K+PSARS A+ AAPV K TV VAKP KA+RTS+RTSPGK+ AAPA
Subjt: KLPSARSVKEKTAAAASAEVAAAPVASKKTVAAKSKAKTAAKPKSKPMTVAKSKAAAVKPKAAEKVKKVAPKPKPVAKPAKAARTSSRTSPGKR-AAPAA
Query: K---TKKVAAKSKKIAKSPAKKVQARKVKK
K TKK AKS K+ KSPAK+ RK KK
Subjt: K---TKKVAAKSKKIAKSPAKKVQARKVKK
|
|