| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAA0043047.1 nuclear pore complex protein NUP98A-like [Cucumis melo var. makuwa] | 3.4e-92 | 46.31 | Show/hide |
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S SPF S PV QTANA NN FA KPFG +TSPFGSQTGN VF GG S GVFG AQSS+PFPSTTTF SSP FG+T STFGS+ TPAFGSSSSSSFGG
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Query: SSIFGQNS-NGGFGYIPTQTNPLGSTNQQSQPALESNVF--SSPFDSSSYSALGASSTPSFST---------------ASSTPTFAATNTSTFGATSTPA
SSIFGQ GGFG P QTNP GSTNQQSQPA SNVF SSPF + S SA GA+STP+F A+STP F AT+T FGATSTPA
Subjt: SSIFGQNS-NGGFGYIPTQTNPLGSTNQQSQPALESNVF--SSPFDSSSYSALGASSTPSFST---------------ASSTPTFAATNTSTFGATSTPA
Query: FGTTSNPVIGTTSTLAFGTTSTPAFGSSSTHAFGSIGNAL-------------------------STPSFGGCCC--------------CTPSFCRPTSA
FG TS P G ST AFG TS+PAFGS+ST AFGS GNA STP+FG TP+F + TS
Subjt: FGTTSNPVIGTTSTLAFGTTSTPAFGSSSTHAFGSIGNAL-------------------------STPSFGGCCC--------------CTPSFCRPTSA
Query: FRSSTF-------------------------------------GSRVALYASTTEPNDVLGRS-PSGEFQSISAMPDYKYKSHEELRWEDYLSGDKGGRL
F SSTF GSRV YA T EP+ G + +G+ +SISAMP YK KSHEELRWEDY GDKGG L
Subjt: FRSSTF-------------------------------------GSRVALYASTTEPNDVLGRS-PSGEFQSISAMPDYKYKSHEELRWEDYLSGDKGGRL
Query: PAGQSTA---------QPNLQGSSTFSQSNSSPFSTAESTNPPANKPSSFGFFG------LNPSSFAPSIPSHHFATMPVISRNPFGSTTAASTSSFPPI
PAGQS + QPN SSTFSQS+ +PFST+ TNP A KPS FG FG N S+FAPS PS NPF STTAASTS+F
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Query: SSNHFA---------TMPAISRNPSASTTAAATSSFSSISLN---------HFATTPA------------------------VSSNRFASTTSAPTFSFP
+++ F T S++ +STT+ T+ SLN +TTPA V N F+S+ S T S P
Subjt: SSNHFA---------TMPAISRNPSASTTAAATSSFSSISLN---------HFATTPA------------------------VSSNRFASTTSAPTFSFP
Query: SLPKPEPPVPFSIPSNHGLIQPSRHSTNTSFDGQLGR
+ + PFS+P QP++ TSF LG+
Subjt: SLPKPEPPVPFSIPSNHGLIQPSRHSTNTSFDGQLGR
|
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| TYK01639.1 nuclear pore complex protein NUP98A-like [Cucumis melo var. makuwa] | 3.4e-92 | 45.89 | Show/hide |
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S SPF S PV QTANA NN FA KPFG +TSPFGSQTGN VF GG S GVFG AQSS+PFPSTTTF SSP FG+T STFGS+ TPAFGSSSSSSFGG
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Query: SSIFGQNS-NGGFGYIPTQTNPLGSTNQQSQPALESNVF--SSPFDSSSYSALGASSTPSFST---------------ASSTPTFAATNTSTFGATSTPA
SSIFGQ GGFG P QTNP GSTNQQSQPA SNVF SSPF + S SA GA+STP+F A+STP F AT+T FGATSTPA
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Query: FGTTSNPVIGTTSTLAFGTTSTPAFGSSSTHAFGSIGNAL---------------------------------STPSFGGCCC--------------CTP
FG TS P G ST AFG TS+PAFGS+ST AFGS GNA STP+FG TP
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+F + TS F SSTF GSRV YA T EP+ G + +G+ +SISAMP YK KSHEELRWEDY
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Query: SGDKGGRLPAGQSTA---------QPNLQGSSTFSQSNSSPFSTAESTNPPANKPSSFGFFG------LNPSSFAPSIPSHHFATMPVISRNPFGSTTAA
GDKGG LPAGQS + QPN SSTFSQS+ +PFST+ TNP A KPS FG FG N S+FAPS PS NPF STTAA
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STS+F +++ F T P S++ +STT+ T+ SLN +TTPA V N F+S+
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S T S P + + PFS+P QP++ TSF LG+
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| XP_008462776.1 PREDICTED: nuclear pore complex protein NUP98A-like [Cucumis melo] | 3.4e-92 | 45.89 | Show/hide |
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S SPF S PV QTANA NN FA KPFG +TSPFGSQTGN VF GG S GVFG AQSS+PFPSTTTF SSP FG+T STFGS+ TPAFGSSSSSSFGG
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Query: SSIFGQNS-NGGFGYIPTQTNPLGSTNQQSQPALESNVF--SSPFDSSSYSALGASSTPSFST---------------ASSTPTFAATNTSTFGATSTPA
SSIFGQ GGFG P QTNP GSTNQQSQPA SNVF SSPF + S SA GA+STP+F A+STP F AT+T FGATSTPA
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Query: FGTTSNPVIGTTSTLAFGTTSTPAFGSSSTHAFGSIGNAL---------------------------------STPSFGGCCC--------------CTP
FG TS P G ST AFG TS+PAFGS+ST AFGS GNA STP+FG TP
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+F + TS F SSTF GSRV YA T EP+ G + +G+ +SISAMP YK KSHEELRWEDY
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GDKGG LPAGQS + QPN SSTFSQS+ +PFST+ TNP A KPS FG FG N S+FAPS PS NPF STTAA
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STS+F +++ F T P S++ +STT+ T+ SLN +TTPA V N F+S+
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S T S P + + PFS+P QP++ TSF LG+
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| XP_023512469.1 nuclear pore complex protein NUP98A-like [Cucurbita pepo subsp. pepo] | 2.4e-93 | 50.09 | Show/hide |
Query: SCSPFVSLPVISQTANA-NNHFALKPFGNNTSPFGSQTGNLVFGGGKSMGVFGEAQSSAPFPSTTTFCDLSSPMFGSTLSTFGSTPTPAFGSSSSSSFGG
S SPFVS PV QTANA NN FA KPFG +TSPFGSQTGN VF GG S GVFG AQSS+PFPS TTF SSP FG+T STFG++ TPAFGSSSSSSFGG
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Query: SSIFGQNS-NGGFGYIPTQTNPLGSTNQQSQPALESNVF--SSPFDSSSYSALGASSTPSFST---------------ASSTPTFAATNTSTFGATSTPA
SSIFGQ GGFG PTQTNP G+TNQQSQPA SNVF +SPF + S SA GA+STP+F A+STP F AT+T FGATSTPA
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Query: FGTTSNPVIGTTSTLAFGTTSTPAFGSSSTHAFGSIGNAL-------------------------STPSFGGCCC----------------------CTP
FG TS P G ST AFG TSTPAFGS+ST AFGS GNA STP+FG TP
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+F + TSAF SSTF GSRVA Y TTEP+ G S +G+ +SISAMP YK KSHEELRWEDY
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Query: SGDKGGRLPAGQ----------STAQPNLQGSSTFSQSNS-SPFSTAESTNPPANKPSSFGFFG------LNPSSFAPSIPSHHFATMPVISRNPFGSTT
SGDKGG LPAGQ S AQPN SSTF+QS+S +PFSTA STNP A K S FG FG N S+FAPS S NPF STT
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Query: AASTSSFPPISSNHFAT---------MPAISRNPSASTTAAATSSFSSISLNHFATTPAVSSNRFASTT
AASTSSF P +++ F + P S++ +STT+ T+ SLN F+ T +S+ F STT
Subjt: AASTSSFPPISSNHFAT---------MPAISRNPSASTTAAATSSFSSISLNHFATTPAVSSNRFASTT
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| XP_038902900.1 nuclear pore complex protein NUP98A [Benincasa hispida] | 5.6e-95 | 52.36 | Show/hide |
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S SPF S PV QTANA NN FA KPFG +TSPFGSQTGN VF GG S GVFG AQSS+PFPSTTTF SSP FGSTLSTFGS+ TPAFGSSSSSSFGG
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Query: SSIFGQNS-NGGFGYIPTQTNPLGSTNQQSQPALESNVFS--SPFDSSSYSALGASSTPSFST-------ASSTPTFAATNTSTFGATSTPAFGTTSNPV
SSIFGQ GGFG PTQTNP GSTNQQSQPA SNVF SPF + S SA GA+STP+F T A+STP F AT+T FGA STPAFG TS+P
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Query: IGTTSTLAFGTT---------------------STPAFGSSSTHAFGSIG----NALSTPSFGGCCCCTPSFCRPTSAFRSSTF----------------
G+TST AFG+T STPAFG+SST AFG+ A STPSF TP+F + TSAF SSTF
Subjt: IGTTSTLAFGTT---------------------STPAFGSSSTHAFGSIG----NALSTPSFGGCCCCTPSFCRPTSAFRSSTF----------------
Query: ---------------------GSRVALYASTTEPNDVLGRS-PSGEFQSISAMPDYKYKSHEELRWEDYLSGDKGGRLPAGQ---------STAQPNLQG
GSRV YA TTEP+ G + +G+ +SISAMP YK KSHEELRWEDY GDKGG LPAGQ S+AQPN
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Query: SSTFSQSNSSPFSTAESTNPPANKPSSFGFFG------LNPSSFAPSIPSHHFATMPVISRNPFGSTTAASTSSFPPISSNHFA---------TMPAISR
STF QS+ +PFSTA STNP A KPS FG FG N S+FAPS S NPF STTAASTS+F +++ F T P S+
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Query: NPSASTTAAATSSFSSISLNHFATTPAVSSNRFASTTSA-----PTFSFP
+ +STT+ T+ SLN F T SS+ F STT A P F P
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| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
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| A0A0A0LN95 Peptidase S59 domain-containing protein | 2.2e-92 | 46.15 | Show/hide |
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S SPF S PV QTANA NN FA KPFG +TSPFG QTGN VF GG S GVFG AQSS+PFPSTTTF SSP FG+T STFGS+ TPAFGSSSSSSFGG
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Query: SSIFGQNS-NGGFGYIPTQTNPLGSTNQQSQPALESNVF--SSPFDSSSYSALGASSTPSFST---------------ASSTPTFAATNTSTFGATSTPA
SSIFGQ GGFG P QTNP GSTNQQSQPA SNVF SSPF + S SA GA+STP+F + A+STP F AT+T FGATSTPA
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Query: FGTTSNPVIGTTSTLAFGTTSTPAFGSSSTHAFGSIGNAL-------------------------STPSFGGCCC--------------CTPSFCRPTSA
FG S P G ST AFG TS+PAFGS+ST AFGS GNA STP+FG TP+F + TS
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Query: FRSSTF-------------------------------------GSRVALYASTTEPNDVLGRS-PSGEFQSISAMPDYKYKSHEELRWEDYLSGDKGGRL
F SSTF GSRV YA T EP+ G + +G+ +SISAMP YK KSHEELRWEDY GDKGG L
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PAGQS + QPN SSTFSQS+ +PFST+ TNP A KPS FG FG N S+FAPS PS NPF STTAASTS+F
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Query: SSNHFA---------TMPAISRNPSASTTAAATSSFSSISLN---------HFATTPA------------------------VSSNRFASTTSAPTFSFP
+++ F T P S++ +STT+ T+ SLN +TTPA V N F+ST S T S P
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+ + PFS+P QP++ TSF +G+
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| A0A5A7TMM6 Nuclear pore complex protein NUP98A-like | 1.7e-92 | 46.31 | Show/hide |
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S SPF S PV QTANA NN FA KPFG +TSPFGSQTGN VF GG S GVFG AQSS+PFPSTTTF SSP FG+T STFGS+ TPAFGSSSSSSFGG
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SSIFGQ GGFG P QTNP GSTNQQSQPA SNVF SSPF + S SA GA+STP+F A+STP F AT+T FGATSTPA
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Query: FGTTSNPVIGTTSTLAFGTTSTPAFGSSSTHAFGSIGNAL-------------------------STPSFGGCCC--------------CTPSFCRPTSA
FG TS P G ST AFG TS+PAFGS+ST AFGS GNA STP+FG TP+F + TS
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Query: FRSSTF-------------------------------------GSRVALYASTTEPNDVLGRS-PSGEFQSISAMPDYKYKSHEELRWEDYLSGDKGGRL
F SSTF GSRV YA T EP+ G + +G+ +SISAMP YK KSHEELRWEDY GDKGG L
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PAGQS + QPN SSTFSQS+ +PFST+ TNP A KPS FG FG N S+FAPS PS NPF STTAASTS+F
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+++ F T S++ +STT+ T+ SLN +TTPA V N F+S+ S T S P
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Query: SLPKPEPPVPFSIPSNHGLIQPSRHSTNTSFDGQLGR
+ + PFS+P QP++ TSF LG+
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| A0A6J1DUF9 nuclear pore complex protein NUP98A-like isoform X2 | 1.3e-89 | 51.85 | Show/hide |
Query: SCSPFVSLPVISQTANA-NNHFALKPFGNNTSPFGSQTGNLVFGGGKSMGVFGEAQSSAPFPSTTTFCDLSSPMFGSTLSTFGSTPTPAFGSSSSSSFGG
S SPF S PV QTANA NN FA KPFG +TSPFGSQTGN VF GG S GVFG AQSS+PF S+TTF SSP FG+T STFGS+ TPAFGSSSSSSFGG
Subjt: SCSPFVSLPVISQTANA-NNHFALKPFGNNTSPFGSQTGNLVFGGGKSMGVFGEAQSSAPFPSTTTFCDLSSPMFGSTLSTFGSTPTPAFGSSSSSSFGG
Query: SSIFGQNS-NGGFGYIPTQTNPLGSTNQQSQPALESNVF--SSPFDSSSYSALGASSTPSFST-------ASSTPTFAATNTSTFGATSTPAFGTTSNPV
SSIFGQ GGFG TQTNP GS NQQSQPA SNVF SSPF + S SA GA+S P+F A+STP F AT+T FGATSTPAFG TS P
Subjt: SSIFGQNS-NGGFGYIPTQTNPLGSTNQQSQPALESNVF--SSPFDSSSYSALGASSTPSFST-------ASSTPTFAATNTSTFGATSTPAFGTTSNPV
Query: IGTTSTLAFGTTSTPAFGSSSTHAFGSIGNAL-------------------------STPSFGGC------CCCTPSFC--------RPTSAFRSSTF--
G TST AFG +STPAFGS+ST AFGS GNA STP+FG TPSF + TSAF SS F
Subjt: IGTTSTLAFGTTSTPAFGSSSTHAFGSIGNAL-------------------------STPSFGGC------CCCTPSFC--------RPTSAFRSSTF--
Query: -----------------------------------GSRVALYASTTEPNDVLGRS-PSGEFQSISAMPDYKYKSHEELRWEDYLSGDKGGRLPAGQST--
GSR A YA TTEP+ G + +G+ +SISAMP YK KSHEELRWEDY GDKGG LPAGQST
Subjt: -----------------------------------GSRVALYASTTEPNDVLGRS-PSGEFQSISAMPDYKYKSHEELRWEDYLSGDKGGRLPAGQST--
Query: -------AQPNLQGSSTFSQSNSSPFSTAESTNPPANKPSSFGFFGLNPSSFAPSIPSHHFATMPVISRNPFGSTTAASTSSFPPISSNHFATMPAI-SR
AQPNL +STFSQ +S+PFSTA S+NP A KPS FG FG S S S FAT S N F STT+ASTSSF P +S+ F + S
Subjt: -------AQPNLQGSSTFSQSNSSPFSTAESTNPPANKPSSFGFFGLNPSSFAPSIPSHHFATMPVISRNPFGSTTAASTSSFPPISSNHFATMPAI-SR
Query: NPSASTTAAATSSFSSISLNHFATTPAVSSNRFASTTSAPTF
N A + A SS +S N T P SS F++T S+ F
Subjt: NPSASTTAAATSSFSSISLNHFATTPAVSSNRFASTTSAPTF
|
|
| A0A6J1FU81 nuclear pore complex protein NUP98A-like isoform X1 | 5.0e-89 | 49.55 | Show/hide |
Query: SCSPFVSLPVISQTANA-NNHFALKPFGNNTSPFGSQTGNLVFGGGKSMGVFGEAQSSAPFPSTTTFCDLSSPMFGSTLSTFGSTPTPAFGSSSSSSFGG
S SPF S PV Q ANA NN FA KPFG +TSPFGSQTGN VF GG S GVFG AQSS+PFPS TTF SSP FG++ TPAFGSSSSSSFGG
Subjt: SCSPFVSLPVISQTANA-NNHFALKPFGNNTSPFGSQTGNLVFGGGKSMGVFGEAQSSAPFPSTTTFCDLSSPMFGSTLSTFGSTPTPAFGSSSSSSFGG
Query: SSIFGQNS-NGGFGYIPTQTNPLGSTNQQSQPALESNVF--SSPFDSSSYSALGASSTPSFST-------ASSTPTFAATNTSTFGATSTPAFGTTSNPV
SSIFGQ GGFG PTQTNP G+TNQQSQPA SNVF +SPF + S SA GA+STP+F A+STP F A +T FGATSTPAFG TS P
Subjt: SSIFGQNS-NGGFGYIPTQTNPLGSTNQQSQPALESNVF--SSPFDSSSYSALGASSTPSFST-------ASSTPTFAATNTSTFGATSTPAFGTTSNPV
Query: IGTTSTLAFGTTSTPAFGSSSTHAFGSIGNAL-------------------------STPSFGGCCC----------------------CTPSFCRPTSA
G TST AFG TSTPAFGS+ST AFGS GNA STP+FG TP+F + TSA
Subjt: IGTTSTLAFGTTSTPAFGSSSTHAFGSIGNAL-------------------------STPSFGGCCC----------------------CTPSFCRPTSA
Query: FRSSTF-------------------------------------GSRVALYASTTEPNDVLGRS-PSGEFQSISAMPDYKYKSHEELRWEDYLSGDKGGRL
F SSTF GSRVA Y TTEP+ G S +G+ +SISAMP YK KSHEELRWEDY SGDKGG L
Subjt: FRSSTF-------------------------------------GSRVALYASTTEPNDVLGRS-PSGEFQSISAMPDYKYKSHEELRWEDYLSGDKGGRL
Query: PAGQ----------STAQPNLQGSSTFSQSNS-SPFSTAESTNPPANKPSSFGFFG------LNPSSFAPSIPSHHFATMPVISRNPFGSTTAASTSSFP
PAGQ S AQPN SSTF+QS+S +PFSTA STNP A K S FG FG N S+FAPS S NPF STTAASTSSF
Subjt: PAGQ----------STAQPNLQGSSTFSQSNS-SPFSTAESTNPPANKPSSFGFFG------LNPSSFAPSIPSHHFATMPVISRNPFGSTTAASTSSFP
Query: PISSNHFAT---------MPAISRNPSASTTAAATSSFSSISLNHFATTPAVSSNRFASTT
P +++ F + P S++ +STT+ T+ SLN F+ T +S+ F STT
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| A0A6J1FXG3 nuclear pore complex protein NUP98A-like isoform X2 | 5.0e-89 | 49.55 | Show/hide |
Query: SCSPFVSLPVISQTANA-NNHFALKPFGNNTSPFGSQTGNLVFGGGKSMGVFGEAQSSAPFPSTTTFCDLSSPMFGSTLSTFGSTPTPAFGSSSSSSFGG
S SPF S PV Q ANA NN FA KPFG +TSPFGSQTGN VF GG S GVFG AQSS+PFPS TTF SSP FG++ TPAFGSSSSSSFGG
Subjt: SCSPFVSLPVISQTANA-NNHFALKPFGNNTSPFGSQTGNLVFGGGKSMGVFGEAQSSAPFPSTTTFCDLSSPMFGSTLSTFGSTPTPAFGSSSSSSFGG
Query: SSIFGQNS-NGGFGYIPTQTNPLGSTNQQSQPALESNVF--SSPFDSSSYSALGASSTPSFST-------ASSTPTFAATNTSTFGATSTPAFGTTSNPV
SSIFGQ GGFG PTQTNP G+TNQQSQPA SNVF +SPF + S SA GA+STP+F A+STP F A +T FGATSTPAFG TS P
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Query: IGTTSTLAFGTTSTPAFGSSSTHAFGSIGNAL-------------------------STPSFGGCCC----------------------CTPSFCRPTSA
G TST AFG TSTPAFGS+ST AFGS GNA STP+FG TP+F + TSA
Subjt: IGTTSTLAFGTTSTPAFGSSSTHAFGSIGNAL-------------------------STPSFGGCCC----------------------CTPSFCRPTSA
Query: FRSSTF-------------------------------------GSRVALYASTTEPNDVLGRS-PSGEFQSISAMPDYKYKSHEELRWEDYLSGDKGGRL
F SSTF GSRVA Y TTEP+ G S +G+ +SISAMP YK KSHEELRWEDY SGDKGG L
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Query: PAGQ----------STAQPNLQGSSTFSQSNS-SPFSTAESTNPPANKPSSFGFFG------LNPSSFAPSIPSHHFATMPVISRNPFGSTTAASTSSFP
PAGQ S AQPN SSTF+QS+S +PFSTA STNP A K S FG FG N S+FAPS S NPF STTAASTSSF
Subjt: PAGQ----------STAQPNLQGSSTFSQSNS-SPFSTAESTNPPANKPSSFGFFG------LNPSSFAPSIPSHHFATMPVISRNPFGSTTAASTSSFP
Query: PISSNHFAT---------MPAISRNPSASTTAAATSSFSSISLNHFATTPAVSSNRFASTT
P +++ F + P S++ +STT+ T+ SLN F+ T +S+ F STT
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| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| F4ID16 Nuclear pore complex protein NUP98B | 5.7e-50 | 36.41 | Show/hide |
Query: FEQQSCSHSCSPF--VSLPVISQTAN--ANNHFALKPFGNNTSPFGSQTGNLVFGGGKSMGVFGEAQSSAPFPSTTTFCDLSSPMFGSTLSTFGSTPTPA
F Q S S SPF + + QT N +NN FA KPFG +T PFG+QTG+ +F GG S GVFG Q+S+PF + S FGS+ FG++ TP+
Subjt: FEQQSCSHSCSPF--VSLPVISQTAN--ANNHFALKPFGNNTSPFGSQTGNLVFGGGKSMGVFGEAQSSAPFPSTTTFCDLSSPMFGSTLSTFGSTPTPA
Query: FGSSSSSSFGGSSIFGQNSNGGFGYIPTQTNPLGSTNQQSQPALESNVF--SSPFDSSSYSALGASSTPSFST-------ASSTPTFAATNTSTFGATST
FG SS+S FGG+S FGQ S FG Q++P GST QQSQPA ++ F S+PF +S+ A GASSTP+F A++TP F ATNT+ FG +ST
Subjt: FGSSSSSSFGGSSIFGQNSNGGFGYIPTQTNPLGSTNQQSQPALESNVF--SSPFDSSSYSALGASSTPSFST-------ASSTPTFAATNTSTFGATST
Query: PAFGTTSNPVIGTTSTLAFGTTSTPAFGSSST--------HAFGSIGNAL--------------STPSFGGCCC--------------CTPSFCRPTSAF
P FG +S P G+T+T AFG +STP FGSSS+ AFGS GNA STP+FG +P+F + TSAF
Subjt: PAFGTTSNPVIGTTSTLAFGTTSTPAFGSSST--------HAFGSIGNAL--------------STPSFGGCCC--------------CTPSFCRPTSAF
Query: RSSTFGSRVALYASTTEPNDVLG------------------------------------RSPSGEFQSISAMPDYKYKSHEELRWEDYLSGDKGGRLPAG
SS+FGS + ST P G S S QSISAMP +K K+ EELRWEDY GDKGG+ G
Subjt: RSSTFGSRVALYASTTEPNDVLG------------------------------------RSPSGEFQSISAMPDYKYKSHEELRWEDYLSGDKGGRLPAG
Query: QS---------TAQPNLQGSS-TFSQSNSSPFSTAESTNPPANKPSSFGFFGLNPSSFA-PSIPSHHFATMPVISRNPFGSTTAASTSSFPPISSNHFAT
QS +QP++ +S FSQ+ +P + T P +N S F SF P+ PS F + + + FGS+++ +T++ P+ S+ F +
Subjt: QS---------TAQPNLQGSS-TFSQSNSSPFSTAESTNPPANKPSSFGFFGLNPSSFA-PSIPSHHFATMPVISRNPFGSTTAASTSSFPPISSNHFAT
Query: MPAISRNPSASTTAAATSSFSSISLNHFATTPAVSSNRF-ASTTSAPTFSFPSLPK-PEPPVPFSIPSNHGLIQPSRHST-NTSFDGQLGRIASTT
PA P S S S + F + P+ + N A + ++P F + P + F +N L+Q + ST +T F +S T
Subjt: MPAISRNPSASTTAAATSSFSSISLNHFATTPAVSSNRF-ASTTSAPTFSFPSLPK-PEPPVPFSIPSNHGLIQPSRHST-NTSFDGQLGRIASTT
|
|
| G0SBQ3 Nucleoporin NSP1 | 1.0e-06 | 32.33 | Show/hide |
Query: FGSQTGNLVFGGGKSMGVFGEAQSSAPFPSTTTFCDLSSPMFGSTLST--FGSTPTPAFGSSSSSSFGGSSIFGQNSN-GGFGYIPTQTNPLGSTNQQSQ
FGS TG+ S G QS + F TT + +FG+T ST G+ T FG S+SSS G S+FG S G + T T+ GS S
Subjt: FGSQTGNLVFGGGKSMGVFGEAQSSAPFPSTTTFCDLSSPMFGSTLST--FGSTPTPAFGSSSSSSFGGSSIFGQNSN-GGFGYIPTQTNPLGSTNQQSQ
Query: PALESNVFSSPFDSSSYSALGASSTPSFSTASSTPTFAATNTSTFGA---TSTPAFGTTSNPVIGTTSTLAFGTTSTPAFGSSSTHAFGSIGNALSTPSF
PA ++F S ++ ++ GASST +TA S F +T +T G+ TST FG +S T S FG+T+TPA G+S + + P F
Subjt: PALESNVFSSPFDSSSYSALGASSTPSFSTASSTPTFAATNTSTFGA---TSTPAFGTTSNPVIGTTSTLAFGTTSTPAFGSSSTHAFGSIGNALSTPSF
Query: GGCCCCTPSFCRPTSAFRSSTFGSRVALYASTTEPNDVLGRSPSGEFQSISAMPDYKYKSHEELRWEDYLSGDKGGRLPAGQSTAQ--PNLQGSSTFSQS
G TP+ PT A +++ ++ A+T L S S Q S+ P + K E + G PA + A P L G +T + S
Subjt: GGCCCCTPSFCRPTSAFRSSTFGSRVALYASTTEPNDVLGRSPSGEFQSISAMPDYKYKSHEELRWEDYLSGDKGGRLPAGQSTAQ--PNLQGSSTFSQS
Query: ---NSSPFSTAESTNPPANKPSSFGFFGLNPSSFAPSIPSHHFATMPVISRNPFGSTTAASTSSFPPISSNHFATMPAISRNPSASTTAAATSSFSSISL
S+ STA ++ P A KP FG ++ AP S AT + S P +TTAA+ SS +S F T PA + +AS+T AATS+ S+
Subjt: ---NSSPFSTAESTNPPANKPSSFGFFGLNPSSFAPSIPSHHFATMPVISRNPFGSTTAASTSSFPPISSNHFATMPAISRNPSASTTAAATSSFSSISL
Query: NHFATTPAVSSNRFASTTSAPTFSFPSLPKPEP
+ A+T A +S +TT+ + S P+ P
Subjt: NHFATTPAVSSNRFASTTSAPTFSFPSLPKPEP
|
|
| Q555D2 Nuclear pore complex protein DDB_G0274915 | 1.7e-06 | 30.63 | Show/hide |
Query: FGNNTSPFGSQTGNLVFGGGKSMGVFGEAQSSAPFPSTTTFCDLSSPMFGSTLSTFGSTPTPAFG--SSSSSSFGGSSIFGQNSNGGFGYIPTQTNPLGS
FG+++S S + + G+FG S +TT + S+ +FGST +T +T TP+ G SSSS+ + +FG +S+ T GS
Subjt: FGNNTSPFGSQTGNLVFGGGKSMGVFGEAQSSAPFPSTTTFCDLSSPMFGSTLSTFGSTPTPAFG--SSSSSSFGGSSIFGQNSNGGFGYIPTQTNPLGS
Query: TNQQSQPALESNVFSSPFDSSSYSALGASSTPSFSTASSTPTFAATNTSTFGATSTPAFGTTSNPVIG--TTSTLAFGTTSTPAFGSSSTHAFGSIGNAL
+ S+ FS P S+ ++ S P F T+S T + +++ FGA S + T+S+ + G TTST A T+TP+FGSS FG+ +
Subjt: TNQQSQPALESNVFSSPFDSSSYSALGASSTPSFSTASSTPTFAATNTSTFGATSTPAFGTTSNPVIG--TTSTLAFGTTSTPAFGSSSTHAFGSIGNAL
Query: STP----SFGG-CCCCTPSFCRPTSAFRSSTFGSRVALYASTTEPNDVLGRSPSGEFQSISAMPDYKYKSHEELRWEDYLSGDKGGRLPAGQSTAQPNLQ
STP FG +P F PTSA S+ FG A ST+ ++ G + S +A P ++S G + + S++ +L
Subjt: STP----SFGG-CCCCTPSFCRPTSAFRSSTFGSRVALYASTTEPNDVLGRSPSGEFQSISAMPDYKYKSHEELRWEDYLSGDKGGRLPAGQSTAQPNLQ
Query: -GSSTFSQSNSSPF-------STAESTNP---PANKPSSFGFFGLNPSSF-APSIPSHHFATMPVISRNPFGSTTAASTSSF
G+ T S S+S+PF S A +T+P PA PS FG +PS F AP+ F + P + NPFG+ A + F
Subjt: -GSSTFSQSNSSPF-------STAESTNP---PANKPSSFGFFGLNPSSF-APSIPSHHFATMPVISRNPFGSTTAASTSSF
|
|
| Q8RY25 Nuclear pore complex protein NUP98A | 9.8e-50 | 37.77 | Show/hide |
Query: SHSCSPFVSLPVISQTAN--ANNHFA-LKPFGNNTSPFGSQTGNLVFGGGKSMGVFGEAQSSAPFPSTTTFCDLSSPMFGSTLSTFGSTPTPAFGSS-SS
S SPF S + QT+N +NN FA PFG ++PF +Q+G+ +F G S GVFG Q+S+PF ST TF SSP FG++ TPAFG+S +S
Subjt: SHSCSPFVSLPVISQTAN--ANNHFA-LKPFGNNTSPFGSQTGNLVFGGGKSMGVFGEAQSSAPFPSTTTFCDLSSPMFGSTLSTFGSTPTPAFGSS-SS
Query: SSFGGSSIFGQNSNGGFGYIPTQTNPLGSTNQQSQPALESNVF--SSPFDSSSYSALGASSTPSFST-------ASSTPTFAATNTSTFGATSTPAFGTT
S FGGSS FGQ G+ Q+NP G++ QQSQPA + F S+PF +++ A GA STPSF ASSTP F ATNT FGA+++P+FG T
Subjt: SSFGGSSIFGQNSNGGFGYIPTQTNPLGSTNQQSQPALESNVF--SSPFDSSSYSALGASSTPSFST-------ASSTPTFAATNTSTFGATSTPAFGTT
Query: SNPVIGTTSTLAFGTT------------------STPAFGSSSTHAFGSIG--------------------NALSTPSFGGCCC--------------CT
+ P G + T AFG+T +TPAFG+S T AFG+ G A STP+FGG +
Subjt: SNPVIGTTSTLAFGTT------------------STPAFGSSSTHAFGSIG--------------------NALSTPSFGGCCC--------------CT
Query: PSFCRPTSAFRSSTF--------------------------------GSRVALYASTTEPNDVLGRSPSGEFQSISAMPDYKYKSHEELRWEDYLSGDKG
P+F + TSAF SS F GSR YA T E + G P+G+ +SISAMP YK K++EELRWEDY GDKG
Subjt: PSFCRPTSAFRSSTF--------------------------------GSRVALYASTTEPNDVLGRSPSGEFQSISAMPDYKYKSHEELRWEDYLSGDKG
Query: GRLPAGQ---------STAQPN-LQGSSTFSQSN---SSPFSTAESTNP--PANKPSSFGFFGLNPSSFAPSIPSHHFATMPVISRNPFGSTTAASTSSF
G LPAGQ S +QPN S F Q++ ++PFS++ STNP P + FG S+F S F S N FGS ++ +TS F
Subjt: GRLPAGQ---------STAQPN-LQGSSTFSQSN---SSPFSTAESTNP--PANKPSSFGFFGLNPSSFAPSIPSHHFATMPVISRNPFGSTTAASTSSF
Query: PPISSNHFATMPAISRNPSASTTAAATSSFSSISLNHFATTPAVSSNRFASTTSAPTFSFPSLP
SS+ F T PS +++T F S S + F + P + A S P+ F S P
Subjt: PPISSNHFATMPAISRNPSASTTAAATSSFSSISLNHFATTPAVSSNRFASTTSAPTFSFPSLP
|
|
| Arabidopsis top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AT1G10390.1 Nucleoporin autopeptidase | 7.0e-51 | 37.77 | Show/hide |
Query: SHSCSPFVSLPVISQTAN--ANNHFA-LKPFGNNTSPFGSQTGNLVFGGGKSMGVFGEAQSSAPFPSTTTFCDLSSPMFGSTLSTFGSTPTPAFGSS-SS
S SPF S + QT+N +NN FA PFG ++PF +Q+G+ +F G S GVFG Q+S+PF ST TF SSP FG++ TPAFG+S +S
Subjt: SHSCSPFVSLPVISQTAN--ANNHFA-LKPFGNNTSPFGSQTGNLVFGGGKSMGVFGEAQSSAPFPSTTTFCDLSSPMFGSTLSTFGSTPTPAFGSS-SS
Query: SSFGGSSIFGQNSNGGFGYIPTQTNPLGSTNQQSQPALESNVF--SSPFDSSSYSALGASSTPSFST-------ASSTPTFAATNTSTFGATSTPAFGTT
S FGGSS FGQ G+ Q+NP G++ QQSQPA + F S+PF +++ A GA STPSF ASSTP F ATNT FGA+++P+FG T
Subjt: SSFGGSSIFGQNSNGGFGYIPTQTNPLGSTNQQSQPALESNVF--SSPFDSSSYSALGASSTPSFST-------ASSTPTFAATNTSTFGATSTPAFGTT
Query: SNPVIGTTSTLAFGTT------------------STPAFGSSSTHAFGSIG--------------------NALSTPSFGGCCC--------------CT
+ P G + T AFG+T +TPAFG+S T AFG+ G A STP+FGG +
Subjt: SNPVIGTTSTLAFGTT------------------STPAFGSSSTHAFGSIG--------------------NALSTPSFGGCCC--------------CT
Query: PSFCRPTSAFRSSTF--------------------------------GSRVALYASTTEPNDVLGRSPSGEFQSISAMPDYKYKSHEELRWEDYLSGDKG
P+F + TSAF SS F GSR YA T E + G P+G+ +SISAMP YK K++EELRWEDY GDKG
Subjt: PSFCRPTSAFRSSTF--------------------------------GSRVALYASTTEPNDVLGRSPSGEFQSISAMPDYKYKSHEELRWEDYLSGDKG
Query: GRLPAGQ---------STAQPN-LQGSSTFSQSN---SSPFSTAESTNP--PANKPSSFGFFGLNPSSFAPSIPSHHFATMPVISRNPFGSTTAASTSSF
G LPAGQ S +QPN S F Q++ ++PFS++ STNP P + FG S+F S F S N FGS ++ +TS F
Subjt: GRLPAGQ---------STAQPN-LQGSSTFSQSN---SSPFSTAESTNP--PANKPSSFGFFGLNPSSFAPSIPSHHFATMPVISRNPFGSTTAASTSSF
Query: PPISSNHFATMPAISRNPSASTTAAATSSFSSISLNHFATTPAVSSNRFASTTSAPTFSFPSLP
SS+ F T PS +++T F S S + F + P + A S P+ F S P
Subjt: PPISSNHFATMPAISRNPSASTTAAATSSFSSISLNHFATTPAVSSNRFASTTSAPTFSFPSLP
|
|
| AT1G10390.2 Nucleoporin autopeptidase | 7.0e-51 | 37.77 | Show/hide |
Query: SHSCSPFVSLPVISQTAN--ANNHFA-LKPFGNNTSPFGSQTGNLVFGGGKSMGVFGEAQSSAPFPSTTTFCDLSSPMFGSTLSTFGSTPTPAFGSS-SS
S SPF S + QT+N +NN FA PFG ++PF +Q+G+ +F G S GVFG Q+S+PF ST TF SSP FG++ TPAFG+S +S
Subjt: SHSCSPFVSLPVISQTAN--ANNHFA-LKPFGNNTSPFGSQTGNLVFGGGKSMGVFGEAQSSAPFPSTTTFCDLSSPMFGSTLSTFGSTPTPAFGSS-SS
Query: SSFGGSSIFGQNSNGGFGYIPTQTNPLGSTNQQSQPALESNVF--SSPFDSSSYSALGASSTPSFST-------ASSTPTFAATNTSTFGATSTPAFGTT
S FGGSS FGQ G+ Q+NP G++ QQSQPA + F S+PF +++ A GA STPSF ASSTP F ATNT FGA+++P+FG T
Subjt: SSFGGSSIFGQNSNGGFGYIPTQTNPLGSTNQQSQPALESNVF--SSPFDSSSYSALGASSTPSFST-------ASSTPTFAATNTSTFGATSTPAFGTT
Query: SNPVIGTTSTLAFGTT------------------STPAFGSSSTHAFGSIG--------------------NALSTPSFGGCCC--------------CT
+ P G + T AFG+T +TPAFG+S T AFG+ G A STP+FGG +
Subjt: SNPVIGTTSTLAFGTT------------------STPAFGSSSTHAFGSIG--------------------NALSTPSFGGCCC--------------CT
Query: PSFCRPTSAFRSSTF--------------------------------GSRVALYASTTEPNDVLGRSPSGEFQSISAMPDYKYKSHEELRWEDYLSGDKG
P+F + TSAF SS F GSR YA T E + G P+G+ +SISAMP YK K++EELRWEDY GDKG
Subjt: PSFCRPTSAFRSSTF--------------------------------GSRVALYASTTEPNDVLGRSPSGEFQSISAMPDYKYKSHEELRWEDYLSGDKG
Query: GRLPAGQ---------STAQPN-LQGSSTFSQSN---SSPFSTAESTNP--PANKPSSFGFFGLNPSSFAPSIPSHHFATMPVISRNPFGSTTAASTSSF
G LPAGQ S +QPN S F Q++ ++PFS++ STNP P + FG S+F S F S N FGS ++ +TS F
Subjt: GRLPAGQ---------STAQPN-LQGSSTFSQSN---SSPFSTAESTNP--PANKPSSFGFFGLNPSSFAPSIPSHHFATMPVISRNPFGSTTAASTSSF
Query: PPISSNHFATMPAISRNPSASTTAAATSSFSSISLNHFATTPAVSSNRFASTTSAPTFSFPSLP
SS+ F T PS +++T F S S + F + P + A S P+ F S P
Subjt: PPISSNHFATMPAISRNPSASTTAAATSSFSSISLNHFATTPAVSSNRFASTTSAPTFSFPSLP
|
|
| AT1G59660.1 Nucleoporin autopeptidase | 4.1e-51 | 36.41 | Show/hide |
Query: FEQQSCSHSCSPF--VSLPVISQTAN--ANNHFALKPFGNNTSPFGSQTGNLVFGGGKSMGVFGEAQSSAPFPSTTTFCDLSSPMFGSTLSTFGSTPTPA
F Q S S SPF + + QT N +NN FA KPFG +T PFG+QTG+ +F GG S GVFG Q+S+PF + S FGS+ FG++ TP+
Subjt: FEQQSCSHSCSPF--VSLPVISQTAN--ANNHFALKPFGNNTSPFGSQTGNLVFGGGKSMGVFGEAQSSAPFPSTTTFCDLSSPMFGSTLSTFGSTPTPA
Query: FGSSSSSSFGGSSIFGQNSNGGFGYIPTQTNPLGSTNQQSQPALESNVF--SSPFDSSSYSALGASSTPSFST-------ASSTPTFAATNTSTFGATST
FG SS+S FGG+S FGQ S FG Q++P GST QQSQPA ++ F S+PF +S+ A GASSTP+F A++TP F ATNT+ FG +ST
Subjt: FGSSSSSSFGGSSIFGQNSNGGFGYIPTQTNPLGSTNQQSQPALESNVF--SSPFDSSSYSALGASSTPSFST-------ASSTPTFAATNTSTFGATST
Query: PAFGTTSNPVIGTTSTLAFGTTSTPAFGSSST--------HAFGSIGNAL--------------STPSFGGCCC--------------CTPSFCRPTSAF
P FG +S P G+T+T AFG +STP FGSSS+ AFGS GNA STP+FG +P+F + TSAF
Subjt: PAFGTTSNPVIGTTSTLAFGTTSTPAFGSSST--------HAFGSIGNAL--------------STPSFGGCCC--------------CTPSFCRPTSAF
Query: RSSTFGSRVALYASTTEPNDVLG------------------------------------RSPSGEFQSISAMPDYKYKSHEELRWEDYLSGDKGGRLPAG
SS+FGS + ST P G S S QSISAMP +K K+ EELRWEDY GDKGG+ G
Subjt: RSSTFGSRVALYASTTEPNDVLG------------------------------------RSPSGEFQSISAMPDYKYKSHEELRWEDYLSGDKGGRLPAG
Query: QS---------TAQPNLQGSS-TFSQSNSSPFSTAESTNPPANKPSSFGFFGLNPSSFA-PSIPSHHFATMPVISRNPFGSTTAASTSSFPPISSNHFAT
QS +QP++ +S FSQ+ +P + T P +N S F SF P+ PS F + + + FGS+++ +T++ P+ S+ F +
Subjt: QS---------TAQPNLQGSS-TFSQSNSSPFSTAESTNPPANKPSSFGFFGLNPSSFA-PSIPSHHFATMPVISRNPFGSTTAASTSSFPPISSNHFAT
Query: MPAISRNPSASTTAAATSSFSSISLNHFATTPAVSSNRF-ASTTSAPTFSFPSLPK-PEPPVPFSIPSNHGLIQPSRHST-NTSFDGQLGRIASTT
PA P S S S + F + P+ + N A + ++P F + P + F +N L+Q + ST +T F +S T
Subjt: MPAISRNPSASTTAAATSSFSSISLNHFATTPAVSSNRF-ASTTSAPTFSFPSLPK-PEPPVPFSIPSNHGLIQPSRHST-NTSFDGQLGRIASTT
|
|
| AT1G63540.1 hydroxyproline-rich glycoprotein family protein | 1.7e-04 | 30.4 | Show/hide |
Query: PFGNNT---------SPFGSQTGNLVFGGGKSMGVFG-----EAQSSAPFPSTTTF----CDLSSPMFGSTL--STFGSTPTPAFGSSSSSSFGGSS--I
PFGNN SP S + + G +F +A A ST+TF C SP GS+L S FGS P P SSS+ FG SS +
Subjt: PFGNNT---------SPFGSQTGNLVFGGGKSMGVFG-----EAQSSAPFPSTTTF----CDLSSPMFGSTL--STFGSTPTPAFGSSSSSSFGGSS--I
Query: FGQN-SNGGFGYIPTQTNPLGSTNQQSQPALESNVFSSPFDSSSYSALGASSTPSFSTASSTPTFAATNTSTFGATSTPAFGTTSNPVIGTTSTLAFGTT
GQN S G GY+P SP +SS+ G P S+ +N FG S A G G S L
Subjt: FGQN-SNGGFGYIPTQTNPLGSTNQQSQPALESNVFSSPFDSSSYSALGASSTPSFSTASSTPTFAATNTSTFGATSTPAFGTTSNPVIGTTSTLAFGTT
Query: STPAFGSSSTHAFGSIGNALSTPSFGGCCCCTPSFCRPTSAFRSSTFGSRVALYASTTEPNDVLG----RSPSGEFQSISAMPDYKYKSHEELRWEDYLS
P+ S + AF S N S P + + RPT GS YA T E ++ G S + SISA Y +KSHEELRWEDY
Subjt: STPAFGSSSTHAFGSIGNALSTPSFGGCCCCTPSFCRPTSAFRSSTFGSRVALYASTTEPNDVLG----RSPSGEFQSISAMPDYKYKSHEELRWEDYLS
Query: GDKGGRLPAGQS--------------TAQPNLQG----SSTFSQSNSSPFSTAESTNPPANKPSSFGFFGLNPSSFAPSIPSHHFA---TMPVISRNP
GDKGG PA + T P G +T S S S F+ +T+PP+ + G F + FAP + + A T P + P
Subjt: GDKGGRLPAGQS--------------TAQPNLQG----SSTFSQSNSSPFSTAESTNPPANKPSSFGFFGLNPSSFAPSIPSHHFA---TMPVISRNP
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