CuGenDBv2

Gene ID	Sed0015003
Organism	Sechium edule (Chayote v1)
Description	DUF1279 domain-containing protein
Genome location	LG01:1478885..1479859
RNA-Seq Expression	Sed0015003
Synteny	Sed0015003
Gene Ontology terms	GO:0005739 - mitochondrion (cellular component)
InterPro domains	IPR009688 - Protein FAM210A/B-like domain

Homology

Show/hide homology

GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

KAG6604946.1 hypothetical protein SDJN03_02263, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]

2.4e-61

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XP_022146083.1 uncharacterized protein LOC111015379 [Momordica charantia]

3.5e-60

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XP_022947464.1 uncharacterized protein LOC111451320 [Cucurbita moschata]

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XP_022971121.1 uncharacterized protein LOC111469888 [Cucurbita maxima]

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XP_023533856.1 uncharacterized protein LOC111795580 [Cucurbita pepo subsp. pepo]

6.4e-62

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TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A6J1CXM4 uncharacterized protein LOC111015379

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A0A6J1FU56 uncharacterized protein LOC111448454

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A0A6J1G6W3 uncharacterized protein LOC111451320

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A0A6J1I2F7 uncharacterized protein LOC111469888

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A0A6J1JD52 uncharacterized protein LOC111483951

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SwissProt top hits	e value	%identity	Alignment
No hits found

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT2G20940.1 Protein of unknown function (DUF1279)

6.1e-34

58.16

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        R +E+++KYGKVA+GVHFSVS  SI+G Y+AIKNNVDVESLLEK  +  FSSK+ P  S               K E Q +   D    N+T +LA S G
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        GALALAVLCNKALFPIRVPIT+ALTPPIAR L +R I+++G
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Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGGCTTTCTTCTCCGGCGGCGGCCGATTCCGCGAGCTTCTCAGGAAGTACGGCAAGGTCGCGATCGGAGTTCATTTCTCGGTCTCGGCGGCTTCGATCACCGGCCTCTA
CGTCGCAATCAAGAACAATGTCGATGTTGAATCGCTTCTCGAGAAGCTCCACATGGATGGATTCTCCTCCAAAGATCAGCCGCAGACGAGTCCTTCCGAAATCACATCGT
CCGTAGACGATGGATCCGCGATCGAGAAACCGGAAATTCAATCAACGACGCCGCAGGATCCGAGGACGAGGAATCGTACGGCCGAGCTCGCGGCGTCGACTGGCGGCGCG
TTGGCTTTGGCCGTGCTTTGCAACAAGGCATTGTTTCCGATTCGGGTTCCGATCACGATTGCGCTCACTCCGCCGATCGCGAGGATTCTGGCCAGGCGAGGGATCATGAG
AAGTGGTTAA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

GTCGAACTTGATGGGCTTTTGGCCCATTAACTGGGGTTCCTATGATGGGCTGACTGGCCCACTGAACCAGATTCTGTTGAGTATTGAGTTTAATATAACTTCAAAACGAG
GTCGTATTGACATTCCCTCAGGAAAATAAATTGCTAATAGAACCGCAGATTTTGAAACTTCGAAACCCTAGCCGCCGCCCTGCACCGCCAAGTTTCCGATTCGCCGCCGC
TCTTTCCCGGAAATTTTCCCTTCACTTTCATCCATGGCTTTCTTCTCCGGCGGCGGCCGATTCCGCGAGCTTCTCAGGAAGTACGGCAAGGTCGCGATCGGAGTTCATTT
CTCGGTCTCGGCGGCTTCGATCACCGGCCTCTACGTCGCAATCAAGAACAATGTCGATGTTGAATCGCTTCTCGAGAAGCTCCACATGGATGGATTCTCCTCCAAAGATC
AGCCGCAGACGAGTCCTTCCGAAATCACATCGTCCGTAGACGATGGATCCGCGATCGAGAAACCGGAAATTCAATCAACGACGCCGCAGGATCCGAGGACGAGGAATCGT
ACGGCCGAGCTCGCGGCGTCGACTGGCGGCGCGTTGGCTTTGGCCGTGCTTTGCAACAAGGCATTGTTTCCGATTCGGGTTCCGATCACGATTGCGCTCACTCCGCCGAT
CGCGAGGATTCTGGCCAGGCGAGGGATCATGAGAAGTGGTTAACGAACTGAATCCGTTTTTCTTCTTCATCTTACTTCTACGTTGGATCGGCGATGGCGAATTCGAGTTT
TGATTTCTCATCGCTTTGCATCTTCTCGCAAATCAATCAACAGAGTAATGTTATCTATCTATCTTCTACTTCCTTTCGAGAATTTTTTTTTTCAAGAAAGATTTGTAGTT
GTGTTGATTTTAACACACACATTCAGAACAGATATATCTGCTCACATTGTCAAAAAAAAAAGCAAATGAATAAGATCTGGCCCTTAGTTCTTCCA

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MAFFSGGGRFRELLRKYGKVAIGVHFSVSAASITGLYVAIKNNVDVESLLEKLHMDGFSSKDQPQTSPSEITSSVDDGSAIEKPEIQSTTPQDPRTRNRTAELAASTGGA
LALAVLCNKALFPIRVPITIALTPPIARILARRGIMRSG

Sed0015003 (gene) of Chayote v1 genome