; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Sed0015027 (gene) of Chayote v1 genome

Gene IDSed0015027
OrganismSechium edule (Chayote v1)
DescriptionRING-type E3 ubiquitin transferase
Genome locationLG02:44525986..44527644
RNA-Seq ExpressionSed0015027
SyntenySed0015027
Gene Ontology termsGO:0016567 - protein ubiquitination (biological process)
GO:0005737 - cytoplasm (cellular component)
GO:0061630 - ubiquitin protein ligase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR001841 - Zinc finger, RING-type
IPR010543 - Domain of unknown function DUF1117
IPR013083 - Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0044102.1 E3 ubiquitin-protein ligase RING1-like [Cucumis melo var. makuwa]2.1e-14784.01Show/hide
Query:  MYHDEAS-DDPSFVPRLRRSGRRIGEDRSPFNRIIVLRDPSNVGVIRNNGFGVGGNYEIYYDDGTGASLRPLPSNISEFLMGSGFDRLLNQLAQLEVNGV
        MYHD+AS  +PSFVPRLRRSGR  GEDRSPFNR IVLRDPSN GV+ NNG G GGNYEI+ DDGTGASLRPLPSNISEFLMGSGFDRLLNQLA+LEVN V
Subjt:  MYHDEAS-DDPSFVPRLRRSGRRIGEDRSPFNRIIVLRDPSNVGVIRNNGFGVGGNYEIYYDDGTGASLRPLPSNISEFLMGSGFDRLLNQLAQLEVNGV

Query:  GPMLDHPPASKAAIESLPVVKILASLVPMESHCAVCKEPFELESVAREMPCKHIYHSDCILPWLSIRNSCPVCRHQLPSDVHNSGGRSSPASAEEVVGLT
         P L++PPASKAAIESLPVVKILAS VPMESHCAVCKEPFEL+S AREMPCKHIYH DCILPWLSIRNSCPVCRHQLP+DVH+S GR+SPASAEEVVGLT
Subjt:  GPMLDHPPASKAAIESLPVVKILASLVPMESHCAVCKEPFELESVAREMPCKHIYHSDCILPWLSIRNSCPVCRHQLPSDVHNSGGRSSPASAEEVVGLT

Query:  IWRLPGGGFAVGRFTWGREAAEHDLPVVYTEIDGGFSTTSGVPRRITWASSGRRSSESGGFRRVFRSFFSFLGRFRSSSHHSNSEPGLVRRSLSATLFNR
        IWRLPG GFAVGRFTWGR AAEHDLPVVYTEIDGGFSTTSG+PRRITW SSGRRS ESGGFRR+FR+ FSFLGRFRSSS HS S PG +RRS SA LFNR
Subjt:  IWRLPGGGFAVGRFTWGREAAEHDLPVVYTEIDGGFSTTSGVPRRITWASSGRRSSESGGFRRVFRSFFSFLGRFRSSSHHSNSEPGLVRRSLSATLFNR

Query:  RSRRNNHPTASEANDIFTS
        RSRRNN P AS+ N +F++
Subjt:  RSRRNNHPTASEANDIFTS

XP_008442524.1 PREDICTED: E3 ubiquitin-protein ligase RING1-like [Cucumis melo]2.1e-14784.01Show/hide
Query:  MYHDEAS-DDPSFVPRLRRSGRRIGEDRSPFNRIIVLRDPSNVGVIRNNGFGVGGNYEIYYDDGTGASLRPLPSNISEFLMGSGFDRLLNQLAQLEVNGV
        MYHD+AS  +PSFVPRLRRSGR  GEDRSPFNR IVLRDPSN GV+ NNG G GGNYEI+ DDGTGASLRPLPSNISEFLMGSGFDRLLNQLA+LEVN V
Subjt:  MYHDEAS-DDPSFVPRLRRSGRRIGEDRSPFNRIIVLRDPSNVGVIRNNGFGVGGNYEIYYDDGTGASLRPLPSNISEFLMGSGFDRLLNQLAQLEVNGV

Query:  GPMLDHPPASKAAIESLPVVKILASLVPMESHCAVCKEPFELESVAREMPCKHIYHSDCILPWLSIRNSCPVCRHQLPSDVHNSGGRSSPASAEEVVGLT
         P L++PPASKAAIESLPVVKILAS VPMESHCAVCKEPFEL+S AREMPCKHIYH DCILPWLSIRNSCPVCRHQLP+DVH+S GR+SPASAEEVVGLT
Subjt:  GPMLDHPPASKAAIESLPVVKILASLVPMESHCAVCKEPFELESVAREMPCKHIYHSDCILPWLSIRNSCPVCRHQLPSDVHNSGGRSSPASAEEVVGLT

Query:  IWRLPGGGFAVGRFTWGREAAEHDLPVVYTEIDGGFSTTSGVPRRITWASSGRRSSESGGFRRVFRSFFSFLGRFRSSSHHSNSEPGLVRRSLSATLFNR
        IWRLPG GFAVGRFTWGR AAEHDLPVVYTEIDGGFSTTSG+PRRITW SSGRRS ESGGFRR+FR+ FSFLGRFRSSS HS S PG +RRS SA LFNR
Subjt:  IWRLPGGGFAVGRFTWGREAAEHDLPVVYTEIDGGFSTTSGVPRRITWASSGRRSSESGGFRRVFRSFFSFLGRFRSSSHHSNSEPGLVRRSLSATLFNR

Query:  RSRRNNHPTASEANDIFTS
        RSRRNN P AS+ N +F++
Subjt:  RSRRNNHPTASEANDIFTS

XP_022145737.1 probable E3 ubiquitin-protein ligase RHC2A [Momordica charantia]2.2e-15288.42Show/hide
Query:  MYHDEASD-DPSFVPRLRRSGRRIGEDRSPFNRIIVLRDPSNVGVIRNNGFGVGGNYEIYYDDGTGASLRPLPSNISEFLMGSGFDRLLNQLAQLEVNGV
        MYHD+ASD DPSFVPRLRRS RR GEDR+PFNRIIVLRDPSN G I NNG G GGNYEIYYDDGTG++LRPLPSNISEFLMGSGFDRLLNQLAQLEVNGV
Subjt:  MYHDEASD-DPSFVPRLRRSGRRIGEDRSPFNRIIVLRDPSNVGVIRNNGFGVGGNYEIYYDDGTGASLRPLPSNISEFLMGSGFDRLLNQLAQLEVNGV

Query:  GPMLDHPPASKAAIESLPVVKILASLVPMESHCAVCKEPFELESVAREMPCKHIYHSDCILPWLSIRNSCPVCRHQLPSDVHNSGGRSSPASAEEVVGLT
        G  L+HPPASKAAIESLPVVKILAS VP+ESHCAVCKEPFEL+S AREMPCKHIYHSDCILPWLSIRNSCPVCRHQLP+D H S GRSSPASAEEVVGLT
Subjt:  GPMLDHPPASKAAIESLPVVKILASLVPMESHCAVCKEPFELESVAREMPCKHIYHSDCILPWLSIRNSCPVCRHQLPSDVHNSGGRSSPASAEEVVGLT

Query:  IWRLPGGGFAVGRFTWGREAAEHDLPVVYTEIDGGFSTTSGVPRRITWASSGRRSSESGGFRRVFRSFFSFLGRFRSSSHHSNSEPGLVRRSLSATLFNR
        IWRLPGGGFAVGRFTWGR AAEHDLPVVYTEIDGGFSTTSG+PRRI+WASSGRRSSE GGFRRVFR+FFSF GRFRSSSHHS+S  GL+RRS S+TLFNR
Subjt:  IWRLPGGGFAVGRFTWGREAAEHDLPVVYTEIDGGFSTTSGVPRRITWASSGRRSSESGGFRRVFRSFFSFLGRFRSSSHHSNSEPGLVRRSLSATLFNR

Query:  RSRRNNHPTAS
        RSRRNNH TAS
Subjt:  RSRRNNHPTAS

XP_023526166.1 E3 ubiquitin-protein ligase RDUF1-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.3e-14784.95Show/hide
Query:  MYHDEASD-DPSFVPRLRRSGRRIGEDRSPFNRIIVLRDPSNVGVIRNNGFGVGGNYEIYYDDGTGASLRPLPSNISEFLMGSGFDRLLNQLAQLEVNGV
        M HD+ASD DPSFVPRLRRS RR GEDRS FNRIIVLRDPSN G I NNG G GGNYEIYYDDGTGASLR LPSNISEFLMGSG DRLLNQLAQLEVNGV
Subjt:  MYHDEASD-DPSFVPRLRRSGRRIGEDRSPFNRIIVLRDPSNVGVIRNNGFGVGGNYEIYYDDGTGASLRPLPSNISEFLMGSGFDRLLNQLAQLEVNGV

Query:  GPMLDHPPASKAAIESLPVVKILASLVPMESHCAVCKEPFELESVAREMPCKHIYHSDCILPWLSIRNSCPVCRHQLPSDVHNSGGRSSPASAEEVVGLT
        GP L+HPPASKAAIESLPVVKILAS VP+ESHCAVCKEPFEL+S AR+MPCKHIYHSDCI PWLSIRNSCPVCRHQLP+D H S GRSSPASAEEVVGLT
Subjt:  GPMLDHPPASKAAIESLPVVKILASLVPMESHCAVCKEPFELESVAREMPCKHIYHSDCILPWLSIRNSCPVCRHQLPSDVHNSGGRSSPASAEEVVGLT

Query:  IWRLPGGGFAVGRFTWGREAAEHDLPVVYTEIDGGFSTTSGVPRRITWASSGRRSSESGGFRRVFRSFFSFLGRFRSSSHHSNSEPGLVRRSLSATLFNR
        IWRLPGGGFAVGRFTWGR AAEHDLPVVYTEIDGGFSTTSGVPR ITWASSG RSSESGGFRR+FR+FFSF GRFRS+S  S S  GL+RRS S TLFNR
Subjt:  IWRLPGGGFAVGRFTWGREAAEHDLPVVYTEIDGGFSTTSGVPRRITWASSGRRSSESGGFRRVFRSFFSFLGRFRSSSHHSNSEPGLVRRSLSATLFNR

Query:  RSRRNNHPTASEANDIFTS
        RSRRNNH   S+AN  F++
Subjt:  RSRRNNHPTASEANDIFTS

XP_038906308.1 E3 ubiquitin-protein ligase RDUF1-like [Benincasa hispida]1.8e-15489.81Show/hide
Query:  MYHDEASD-DPSFVPRLRRSGRRIGEDRSPFNRIIVLRDPSNVGVIRNNGFGVGGNYEIYYDDGTGASLRPLPSNISEFLMGSGFDRLLNQLAQLEVNGV
        MYHD+ASD DPSFVPRLRRSGR  GEDRSPFNRIIVLRDPSN G I NNG G GGNYEIYYDDGTGASLRPLPSNISEFLMGSGFDRLLNQLAQLEVNGV
Subjt:  MYHDEASD-DPSFVPRLRRSGRRIGEDRSPFNRIIVLRDPSNVGVIRNNGFGVGGNYEIYYDDGTGASLRPLPSNISEFLMGSGFDRLLNQLAQLEVNGV

Query:  GPMLDHPPASKAAIESLPVVKILASLVPMESHCAVCKEPFELESVAREMPCKHIYHSDCILPWLSIRNSCPVCRHQLPSDVHNSGGRSSPASAEEVVGLT
        GP L++PPASKAAIESLPVVKILAS VPMESHCAVCKEPFEL+S AREMPCKHIYHSDCILPWLSIRNSCPVCRHQLPSDVH S GRSSPASAEEVVGLT
Subjt:  GPMLDHPPASKAAIESLPVVKILASLVPMESHCAVCKEPFELESVAREMPCKHIYHSDCILPWLSIRNSCPVCRHQLPSDVHNSGGRSSPASAEEVVGLT

Query:  IWRLPGGGFAVGRFTWGREAAEHDLPVVYTEIDGGFSTTSGVPRRITWASSGRRSSESGGFRRVFRSFFSFLGRFRSSSHHSNSEPGLVRRSLSATLFNR
        IWRLPGGGFAVGRFTWGR AAEHDLPVVYTEIDGGFSTTSGVPRRITWASSGRRSSESGGFRR+FR+FFSF  RFRSSS HS S  GL+RRS SATLFNR
Subjt:  IWRLPGGGFAVGRFTWGREAAEHDLPVVYTEIDGGFSTTSGVPRRITWASSGRRSSESGGFRRVFRSFFSFLGRFRSSSHHSNSEPGLVRRSLSATLFNR

Query:  RSRRNNHPTASEAN
        RSRRNN P AS+ N
Subjt:  RSRRNNHPTASEAN

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3B6J2 E3 ubiquitin-protein ligase RING1-like1.0e-14784.01Show/hide
Query:  MYHDEAS-DDPSFVPRLRRSGRRIGEDRSPFNRIIVLRDPSNVGVIRNNGFGVGGNYEIYYDDGTGASLRPLPSNISEFLMGSGFDRLLNQLAQLEVNGV
        MYHD+AS  +PSFVPRLRRSGR  GEDRSPFNR IVLRDPSN GV+ NNG G GGNYEI+ DDGTGASLRPLPSNISEFLMGSGFDRLLNQLA+LEVN V
Subjt:  MYHDEAS-DDPSFVPRLRRSGRRIGEDRSPFNRIIVLRDPSNVGVIRNNGFGVGGNYEIYYDDGTGASLRPLPSNISEFLMGSGFDRLLNQLAQLEVNGV

Query:  GPMLDHPPASKAAIESLPVVKILASLVPMESHCAVCKEPFELESVAREMPCKHIYHSDCILPWLSIRNSCPVCRHQLPSDVHNSGGRSSPASAEEVVGLT
         P L++PPASKAAIESLPVVKILAS VPMESHCAVCKEPFEL+S AREMPCKHIYH DCILPWLSIRNSCPVCRHQLP+DVH+S GR+SPASAEEVVGLT
Subjt:  GPMLDHPPASKAAIESLPVVKILASLVPMESHCAVCKEPFELESVAREMPCKHIYHSDCILPWLSIRNSCPVCRHQLPSDVHNSGGRSSPASAEEVVGLT

Query:  IWRLPGGGFAVGRFTWGREAAEHDLPVVYTEIDGGFSTTSGVPRRITWASSGRRSSESGGFRRVFRSFFSFLGRFRSSSHHSNSEPGLVRRSLSATLFNR
        IWRLPG GFAVGRFTWGR AAEHDLPVVYTEIDGGFSTTSG+PRRITW SSGRRS ESGGFRR+FR+ FSFLGRFRSSS HS S PG +RRS SA LFNR
Subjt:  IWRLPGGGFAVGRFTWGREAAEHDLPVVYTEIDGGFSTTSGVPRRITWASSGRRSSESGGFRRVFRSFFSFLGRFRSSSHHSNSEPGLVRRSLSATLFNR

Query:  RSRRNNHPTASEANDIFTS
        RSRRNN P AS+ N +F++
Subjt:  RSRRNNHPTASEANDIFTS

A0A5A7TL92 E3 ubiquitin-protein ligase RING1-like1.0e-14784.01Show/hide
Query:  MYHDEAS-DDPSFVPRLRRSGRRIGEDRSPFNRIIVLRDPSNVGVIRNNGFGVGGNYEIYYDDGTGASLRPLPSNISEFLMGSGFDRLLNQLAQLEVNGV
        MYHD+AS  +PSFVPRLRRSGR  GEDRSPFNR IVLRDPSN GV+ NNG G GGNYEI+ DDGTGASLRPLPSNISEFLMGSGFDRLLNQLA+LEVN V
Subjt:  MYHDEAS-DDPSFVPRLRRSGRRIGEDRSPFNRIIVLRDPSNVGVIRNNGFGVGGNYEIYYDDGTGASLRPLPSNISEFLMGSGFDRLLNQLAQLEVNGV

Query:  GPMLDHPPASKAAIESLPVVKILASLVPMESHCAVCKEPFELESVAREMPCKHIYHSDCILPWLSIRNSCPVCRHQLPSDVHNSGGRSSPASAEEVVGLT
         P L++PPASKAAIESLPVVKILAS VPMESHCAVCKEPFEL+S AREMPCKHIYH DCILPWLSIRNSCPVCRHQLP+DVH+S GR+SPASAEEVVGLT
Subjt:  GPMLDHPPASKAAIESLPVVKILASLVPMESHCAVCKEPFELESVAREMPCKHIYHSDCILPWLSIRNSCPVCRHQLPSDVHNSGGRSSPASAEEVVGLT

Query:  IWRLPGGGFAVGRFTWGREAAEHDLPVVYTEIDGGFSTTSGVPRRITWASSGRRSSESGGFRRVFRSFFSFLGRFRSSSHHSNSEPGLVRRSLSATLFNR
        IWRLPG GFAVGRFTWGR AAEHDLPVVYTEIDGGFSTTSG+PRRITW SSGRRS ESGGFRR+FR+ FSFLGRFRSSS HS S PG +RRS SA LFNR
Subjt:  IWRLPGGGFAVGRFTWGREAAEHDLPVVYTEIDGGFSTTSGVPRRITWASSGRRSSESGGFRRVFRSFFSFLGRFRSSSHHSNSEPGLVRRSLSATLFNR

Query:  RSRRNNHPTASEANDIFTS
        RSRRNN P AS+ N +F++
Subjt:  RSRRNNHPTASEANDIFTS

A0A6J1CXJ7 probable E3 ubiquitin-protein ligase RHC2A1.1e-15288.42Show/hide
Query:  MYHDEASD-DPSFVPRLRRSGRRIGEDRSPFNRIIVLRDPSNVGVIRNNGFGVGGNYEIYYDDGTGASLRPLPSNISEFLMGSGFDRLLNQLAQLEVNGV
        MYHD+ASD DPSFVPRLRRS RR GEDR+PFNRIIVLRDPSN G I NNG G GGNYEIYYDDGTG++LRPLPSNISEFLMGSGFDRLLNQLAQLEVNGV
Subjt:  MYHDEASD-DPSFVPRLRRSGRRIGEDRSPFNRIIVLRDPSNVGVIRNNGFGVGGNYEIYYDDGTGASLRPLPSNISEFLMGSGFDRLLNQLAQLEVNGV

Query:  GPMLDHPPASKAAIESLPVVKILASLVPMESHCAVCKEPFELESVAREMPCKHIYHSDCILPWLSIRNSCPVCRHQLPSDVHNSGGRSSPASAEEVVGLT
        G  L+HPPASKAAIESLPVVKILAS VP+ESHCAVCKEPFEL+S AREMPCKHIYHSDCILPWLSIRNSCPVCRHQLP+D H S GRSSPASAEEVVGLT
Subjt:  GPMLDHPPASKAAIESLPVVKILASLVPMESHCAVCKEPFELESVAREMPCKHIYHSDCILPWLSIRNSCPVCRHQLPSDVHNSGGRSSPASAEEVVGLT

Query:  IWRLPGGGFAVGRFTWGREAAEHDLPVVYTEIDGGFSTTSGVPRRITWASSGRRSSESGGFRRVFRSFFSFLGRFRSSSHHSNSEPGLVRRSLSATLFNR
        IWRLPGGGFAVGRFTWGR AAEHDLPVVYTEIDGGFSTTSG+PRRI+WASSGRRSSE GGFRRVFR+FFSF GRFRSSSHHS+S  GL+RRS S+TLFNR
Subjt:  IWRLPGGGFAVGRFTWGREAAEHDLPVVYTEIDGGFSTTSGVPRRITWASSGRRSSESGGFRRVFRSFFSFLGRFRSSSHHSNSEPGLVRRSLSATLFNR

Query:  RSRRNNHPTAS
        RSRRNNH TAS
Subjt:  RSRRNNHPTAS

A0A6J1F5C6 E3 ubiquitin-protein ligase RDUF1-like1.4e-14784.64Show/hide
Query:  MYHDEASD-DPSFVPRLRRSGRRIGEDRSPFNRIIVLRDPSNVGVIRNNGFGVGGNYEIYYDDGTGASLRPLPSNISEFLMGSGFDRLLNQLAQLEVNGV
        M HD+ASD DPSFVPRLRRS RR GEDRS FNRIIVLRDPSN G I NNG G GGNYEIYYDDGTGASLR LPSNISEFLMGSG DRLLNQLAQLEVNGV
Subjt:  MYHDEASD-DPSFVPRLRRSGRRIGEDRSPFNRIIVLRDPSNVGVIRNNGFGVGGNYEIYYDDGTGASLRPLPSNISEFLMGSGFDRLLNQLAQLEVNGV

Query:  GPMLDHPPASKAAIESLPVVKILASLVPMESHCAVCKEPFELESVAREMPCKHIYHSDCILPWLSIRNSCPVCRHQLPSDVHNSGGRSSPASAEEVVGLT
        GP L+HPPASKAAIESLPVVKILAS VP+ESHCAVCKEPFEL+S AR+MPCKHIYHSDCI PWLSIRNSCPVCRHQLP+D H S GRSSPASAEEVVGLT
Subjt:  GPMLDHPPASKAAIESLPVVKILASLVPMESHCAVCKEPFELESVAREMPCKHIYHSDCILPWLSIRNSCPVCRHQLPSDVHNSGGRSSPASAEEVVGLT

Query:  IWRLPGGGFAVGRFTWGREAAEHDLPVVYTEIDGGFSTTSGVPRRITWASSGRRSSESGGFRRVFRSFFSFLGRFRSSSHHSNSEPGLVRRSLSATLFNR
        IWRLPGGGFAVGRFTWGR AAEHDLPVVYTEIDGGFSTTSGVPR ITWASSG RS+ESGGFRR+FR+FFSF GRFRS+S  S S  GL+RRS S TLFNR
Subjt:  IWRLPGGGFAVGRFTWGREAAEHDLPVVYTEIDGGFSTTSGVPRRITWASSGRRSSESGGFRRVFRSFFSFLGRFRSSSHHSNSEPGLVRRSLSATLFNR

Query:  RSRRNNHPTASEANDIFTS
        RSRRNNH   S+AN  F++
Subjt:  RSRRNNHPTASEANDIFTS

A0A6J1J964 E3 ubiquitin-protein ligase RDUF1-like5.1e-14784.64Show/hide
Query:  MYHDEASD-DPSFVPRLRRSGRRIGEDRSPFNRIIVLRDPSNVGVIRNNGFGVGGNYEIYYDDGTGASLRPLPSNISEFLMGSGFDRLLNQLAQLEVNGV
        M HD+ASD DPSFVPRLRRS RR GEDRS FNRIIVLRDPSN G I NNG G GGNYEIYYDDGTGASLR LPSNISEFLMGSG DRLLNQLAQLEVNGV
Subjt:  MYHDEASD-DPSFVPRLRRSGRRIGEDRSPFNRIIVLRDPSNVGVIRNNGFGVGGNYEIYYDDGTGASLRPLPSNISEFLMGSGFDRLLNQLAQLEVNGV

Query:  GPMLDHPPASKAAIESLPVVKILASLVPMESHCAVCKEPFELESVAREMPCKHIYHSDCILPWLSIRNSCPVCRHQLPSDVHNSGGRSSPASAEEVVGLT
        GP L+HPPASKAAIESLPVVKILAS VP+ESHCAVCKEPFEL+S AR+MPCKHIYHSDCI PWLSIRNSCPVCRHQLP+DVH S GRSSPASAEEVVGLT
Subjt:  GPMLDHPPASKAAIESLPVVKILASLVPMESHCAVCKEPFELESVAREMPCKHIYHSDCILPWLSIRNSCPVCRHQLPSDVHNSGGRSSPASAEEVVGLT

Query:  IWRLPGGGFAVGRFTWGREAAEHDLPVVYTEIDGGFSTTSGVPRRITWASSGRRSSESGGFRRVFRSFFSFLGRFRSSSHHSNSEPGLVRRSLSATLFNR
        IWRLPGGGFAVGRFTWGR AAEHDLPVVYTEIDGGFSTT GVPR ITWASSG RSSESGGFR +FR+FFSF GRFRS+S  S S  GL+RRS S TLFNR
Subjt:  IWRLPGGGFAVGRFTWGREAAEHDLPVVYTEIDGGFSTTSGVPRRITWASSGRRSSESGGFRRVFRSFFSFLGRFRSSSHHSNSEPGLVRRSLSATLFNR

Query:  RSRRNNHPTASEANDIFTS
        RSRRNNH   S+AN  F++
Subjt:  RSRRNNHPTASEANDIFTS

SwissProt top hitse value%identityAlignment
O22283 Probable E3 ubiquitin-protein ligase RHC2A4.4e-6345.48Show/hide
Query:  HDEASDDPSFVPRLRRSGRRIGEDRSPFNRIIVLRDPSNVGVIRNNGFGVGGN-YEIYYDDGTGASLRPLPSNISEFLMGSGFDRLLNQLAQLEVNGVGP
        H + S  P+ V R R        +RSP N +IVLR  +          G+  + +++YYDDGT + LRPLP +++EFL+GSGFDRLL+Q++Q+E+N    
Subjt:  HDEASDDPSFVPRLRRSGRRIGEDRSPFNRIIVLRDPSNVGVIRNNGFGVGGN-YEIYYDDGTGASLRPLPSNISEFLMGSGFDRLLNQLAQLEVNGVGP

Query:  M--LDHPPASKAAIESLPVVKILAS--LVPMESHCAVCKEPFELESVAREMPCKHIYHSDCILPWLSIRNSCPVCRHQLPSDVHNSGGRSS----PASAE
        +   +HPPASK+AIE+LP+++I  +  L   +SHCAVCKE F L+S AREMPC HIYH DCILPWL+IRNSCPVCRH+LP++    G  ++     A+AE
Subjt:  M--LDHPPASKAAIESLPVVKILAS--LVPMESHCAVCKEPFELESVAREMPCKHIYHSDCILPWLSIRNSCPVCRHQLPSDVHNSGGRSS----PASAE

Query:  E----VVGLTIWRLPGGGFAVGRFTWGREAAEHDLPVVYTEIDGGFSTTSGVPRRITWAS------SGRRSSESGGFR-RVFRSFFSFLGRFRS------
        E      GLTIWRLPGGGFAVGR   G    +  +PVVYTE+DGG      +PRR+ W S       G      GGF  R+ R F  F G   S      
Subjt:  E----VVGLTIWRLPGGGFAVGRFTWGREAAEHDLPVVYTEIDGGFSTTSGVPRRITWAS------SGRRSSESGGFR-RVFRSFFSFLGRFRS------

Query:  SSHHSNSEPGLVRRSLSATLF---NRRSRRNN
        +S  S S   + RR+ S ++F   +  SRR N
Subjt:  SSHHSNSEPGLVRRSLSATLF---NRRSRRNN

P0CH30 E3 ubiquitin-protein ligase RING11.3e-2751.82Show/hide
Query:  LPSNISEFLMGSGFDRLLNQLAQLEVNGVGPMLDHPPASKAAIESLPVVKILASLVPME-SHCAVCKEPFELESVAREMPCKHIYHSDCILPWLSIRNSC
        LP+NI ++ +G G ++L+ QLA+ + N  G     PPASK+AIE+LP+V I  S +  E + CAVC + FE  + A++MPCKH+YH DC+LPWL + NSC
Subjt:  LPSNISEFLMGSGFDRLLNQLAQLEVNGVGPMLDHPPASKAAIESLPVVKILASLVPME-SHCAVCKEPFELESVAREMPCKHIYHSDCILPWLSIRNSC

Query:  PVCRHQLPSD
        PVCRH+LP+D
Subjt:  PVCRHQLPSD

Q8LPN7 E3 ubiquitin-protein ligase RING1-like1.6e-2540.44Show/hide
Query:  GGNYEIYYDDGTGASLRPLPSNISEFLMGSGFDRLLNQLAQLEVNGVGPMLDHPPASKAAIESLPVVKILASLVPME-SHCAVCKEPFELESVAREMPCK
        G ++E   ++        +P N  ++  G G ++L+ QLA+ + N  G     PPASK+AI++LP VK+   ++  E + CAVC + FE  S  ++MPCK
Subjt:  GGNYEIYYDDGTGASLRPLPSNISEFLMGSGFDRLLNQLAQLEVNGVGPMLDHPPASKAAIESLPVVKILASLVPME-SHCAVCKEPFELESVAREMPCK

Query:  HIYHSDCILPWLSIRNSCPVCRHQLPSDVHNSGGRS
        H++H DC+LPWL + NSCPVCR +LP+D  +   RS
Subjt:  HIYHSDCILPWLSIRNSCPVCRHQLPSDVHNSGGRS

Q940T5 E3 ubiquitin-protein ligase RDUF21.3e-6247.59Show/hide
Query:  VPRLRRSGRRIGEDRSPFNRIIVLRDPSNVGVIRNNGFGVGGN--YEIYYDDGTGASLRPLPSNISEFLMGSGFDRLLNQLAQLEVNGVG-PMLDHPPAS
        V R RRSGR     R  FN +IVL+  +        G        +E YYDDG+G+ LRPLP ++SE LMGSGF+RLL QL+Q+E +  G     +PPAS
Subjt:  VPRLRRSGRRIGEDRSPFNRIIVLRDPSNVGVIRNNGFGVGGN--YEIYYDDGTGASLRPLPSNISEFLMGSGFDRLLNQLAQLEVNGVG-PMLDHPPAS

Query:  KAAIESLPVVKILASLVPMESHCAVCKEPFELESVAREMPCKHIYHSDCILPWLSIRNSCPVCRHQLPSDVHNSGGRSSPASAEEVVGLTIWRLPGGGFA
        K+AIESLP V+I    +  E++CAVC E FE E+ AREMPCKH++H DCI+PWLSIRNSCPVCR +LPS+ +    RS+    +  VG+TIWRLPGGGFA
Subjt:  KAAIESLPVVKILASLVPMESHCAVCKEPFELESVAREMPCKHIYHSDCILPWLSIRNSCPVCRHQLPSDVHNSGGRSSPASAEEVVGLTIWRLPGGGFA

Query:  VGRFTWGREAAEHDLPVVYTEID-GGFSTTSGVPRRITWASS-----------GRRSSESGGFRRVFRSFFSFLGRFRSSSHHSNSEPGL
        VGRF       E  LPVV TE+D GG   +   PRRI+W  S           G  S   G  RR+ R   S + R R +   S+S   +
Subjt:  VGRFTWGREAAEHDLPVVYTEID-GGFSTTSGVPRRITWASS-----------GRRSSESGGFRRVFRSFFSFLGRFRSSSHHSNSEPGL

Q9SNB6 E3 ubiquitin-protein ligase RDUF16.8e-6450.35Show/hide
Query:  RLRRSGRRIGEDRSPFNRIIVLRDPSNVG----VIRNNGFGVGGN---YEIYYDDGTGASLRPLPSNISEFLMGSGFDRLLNQLAQLEVNGVG-PMLDHP
        R RRS R     R+ FN +IVL      G    V    G G       YE YYDDG+G+ LRPLP ++SE LMGSGF+RLL QL+Q+E +G G     +P
Subjt:  RLRRSGRRIGEDRSPFNRIIVLRDPSNVG----VIRNNGFGVGGN---YEIYYDDGTGASLRPLPSNISEFLMGSGFDRLLNQLAQLEVNGVG-PMLDHP

Query:  PASKAAIESLPVVKILASLVPMESHCAVCKEPFELESVAREMPCKHIYHSDCILPWLSIRNSCPVCRHQLPSDVHNSGGRSSPASAEEVVGLTIWRLPGG
        PASK+AIESLP V+I       E++CAVC E FE     REMPCKHI+H DCI+PWLSIRNSCPVCR +LPSD             E  VG+TIWRLPGG
Subjt:  PASKAAIESLPVVKILASLVPMESHCAVCKEPFELESVAREMPCKHIYHSDCILPWLSIRNSCPVCRHQLPSDVHNSGGRSSPASAEEVVGLTIWRLPGG

Query:  GFAVGRFTWGREAAEHDLPVVYTEIDGGFSTTSGVPRRITW---------ASSGRRSSESGGFRRVFRSFFSFLGRFRSSSHHSNS
        GFAVGRF  G    E  LPVV TE+DGG   ++  PRRI+W         + +G RS   G  RR  R   SF+ R R S   SNS
Subjt:  GFAVGRFTWGREAAEHDLPVVYTEIDGGFSTTSGVPRRITW---------ASSGRRSSESGGFRRVFRSFFSFLGRFRSSSHHSNS

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G39720.1 RING-H2 finger C2A3.2e-6445.48Show/hide
Query:  HDEASDDPSFVPRLRRSGRRIGEDRSPFNRIIVLRDPSNVGVIRNNGFGVGGN-YEIYYDDGTGASLRPLPSNISEFLMGSGFDRLLNQLAQLEVNGVGP
        H + S  P+ V R R        +RSP N +IVLR  +          G+  + +++YYDDGT + LRPLP +++EFL+GSGFDRLL+Q++Q+E+N    
Subjt:  HDEASDDPSFVPRLRRSGRRIGEDRSPFNRIIVLRDPSNVGVIRNNGFGVGGN-YEIYYDDGTGASLRPLPSNISEFLMGSGFDRLLNQLAQLEVNGVGP

Query:  M--LDHPPASKAAIESLPVVKILAS--LVPMESHCAVCKEPFELESVAREMPCKHIYHSDCILPWLSIRNSCPVCRHQLPSDVHNSGGRSS----PASAE
        +   +HPPASK+AIE+LP+++I  +  L   +SHCAVCKE F L+S AREMPC HIYH DCILPWL+IRNSCPVCRH+LP++    G  ++     A+AE
Subjt:  M--LDHPPASKAAIESLPVVKILAS--LVPMESHCAVCKEPFELESVAREMPCKHIYHSDCILPWLSIRNSCPVCRHQLPSDVHNSGGRSS----PASAE

Query:  E----VVGLTIWRLPGGGFAVGRFTWGREAAEHDLPVVYTEIDGGFSTTSGVPRRITWAS------SGRRSSESGGFR-RVFRSFFSFLGRFRS------
        E      GLTIWRLPGGGFAVGR   G    +  +PVVYTE+DGG      +PRR+ W S       G      GGF  R+ R F  F G   S      
Subjt:  E----VVGLTIWRLPGGGFAVGRFTWGREAAEHDLPVVYTEIDGGFSTTSGVPRRITWAS------SGRRSSESGGFR-RVFRSFFSFLGRFRS------

Query:  SSHHSNSEPGLVRRSLSATLF---NRRSRRNN
        +S  S S   + RR+ S ++F   +  SRR N
Subjt:  SSHHSNSEPGLVRRSLSATLF---NRRSRRNN

AT3G19950.1 RING/U-box superfamily protein1.2e-2640.44Show/hide
Query:  GGNYEIYYDDGTGASLRPLPSNISEFLMGSGFDRLLNQLAQLEVNGVGPMLDHPPASKAAIESLPVVKILASLVPME-SHCAVCKEPFELESVAREMPCK
        G ++E   ++        +P N  ++  G G ++L+ QLA+ + N  G     PPASK+AI++LP VK+   ++  E + CAVC + FE  S  ++MPCK
Subjt:  GGNYEIYYDDGTGASLRPLPSNISEFLMGSGFDRLLNQLAQLEVNGVGPMLDHPPASKAAIESLPVVKILASLVPME-SHCAVCKEPFELESVAREMPCK

Query:  HIYHSDCILPWLSIRNSCPVCRHQLPSDVHNSGGRS
        H++H DC+LPWL + NSCPVCR +LP+D  +   RS
Subjt:  HIYHSDCILPWLSIRNSCPVCRHQLPSDVHNSGGRS

AT3G46620.1 zinc finger (C3HC4-type RING finger) family protein4.9e-6550.35Show/hide
Query:  RLRRSGRRIGEDRSPFNRIIVLRDPSNVG----VIRNNGFGVGGN---YEIYYDDGTGASLRPLPSNISEFLMGSGFDRLLNQLAQLEVNGVG-PMLDHP
        R RRS R     R+ FN +IVL      G    V    G G       YE YYDDG+G+ LRPLP ++SE LMGSGF+RLL QL+Q+E +G G     +P
Subjt:  RLRRSGRRIGEDRSPFNRIIVLRDPSNVG----VIRNNGFGVGGN---YEIYYDDGTGASLRPLPSNISEFLMGSGFDRLLNQLAQLEVNGVG-PMLDHP

Query:  PASKAAIESLPVVKILASLVPMESHCAVCKEPFELESVAREMPCKHIYHSDCILPWLSIRNSCPVCRHQLPSDVHNSGGRSSPASAEEVVGLTIWRLPGG
        PASK+AIESLP V+I       E++CAVC E FE     REMPCKHI+H DCI+PWLSIRNSCPVCR +LPSD             E  VG+TIWRLPGG
Subjt:  PASKAAIESLPVVKILASLVPMESHCAVCKEPFELESVAREMPCKHIYHSDCILPWLSIRNSCPVCRHQLPSDVHNSGGRSSPASAEEVVGLTIWRLPGG

Query:  GFAVGRFTWGREAAEHDLPVVYTEIDGGFSTTSGVPRRITW---------ASSGRRSSESGGFRRVFRSFFSFLGRFRSSSHHSNS
        GFAVGRF  G    E  LPVV TE+DGG   ++  PRRI+W         + +G RS   G  RR  R   SF+ R R S   SNS
Subjt:  GFAVGRFTWGREAAEHDLPVVYTEIDGGFSTTSGVPRRITW---------ASSGRRSSESGGFRRVFRSFFSFLGRFRSSSHHSNS

AT3G56580.2 RING/U-box superfamily protein4.9e-2547.86Show/hide
Query:  SNISEFLMGSGFDRLLNQLAQLEVNGVGPMLDHPPASKAAIESLPVVKILAS-LVPMESHCAVCKEPFELESVAREMPCKHIYHSDCILPWLSIRNSCPV
        +N  ++  G G + L+ QL+    +  GP    PPA K++I++LP +KI    L   +SHC VCK+ FEL+S A++MPC HIYHSDCI+PWL   NSCPV
Subjt:  SNISEFLMGSGFDRLLNQLAQLEVNGVGPMLDHPPASKAAIESLPVVKILAS-LVPMESHCAVCKEPFELESVAREMPCKHIYHSDCILPWLSIRNSCPV

Query:  CRHQLPSDVHNSGGRSS
        CR +LPS   +S  +SS
Subjt:  CRHQLPSDVHNSGGRSS

AT5G59550.1 zinc finger (C3HC4-type RING finger) family protein9.2e-6447.59Show/hide
Query:  VPRLRRSGRRIGEDRSPFNRIIVLRDPSNVGVIRNNGFGVGGN--YEIYYDDGTGASLRPLPSNISEFLMGSGFDRLLNQLAQLEVNGVG-PMLDHPPAS
        V R RRSGR     R  FN +IVL+  +        G        +E YYDDG+G+ LRPLP ++SE LMGSGF+RLL QL+Q+E +  G     +PPAS
Subjt:  VPRLRRSGRRIGEDRSPFNRIIVLRDPSNVGVIRNNGFGVGGN--YEIYYDDGTGASLRPLPSNISEFLMGSGFDRLLNQLAQLEVNGVG-PMLDHPPAS

Query:  KAAIESLPVVKILASLVPMESHCAVCKEPFELESVAREMPCKHIYHSDCILPWLSIRNSCPVCRHQLPSDVHNSGGRSSPASAEEVVGLTIWRLPGGGFA
        K+AIESLP V+I    +  E++CAVC E FE E+ AREMPCKH++H DCI+PWLSIRNSCPVCR +LPS+ +    RS+    +  VG+TIWRLPGGGFA
Subjt:  KAAIESLPVVKILASLVPMESHCAVCKEPFELESVAREMPCKHIYHSDCILPWLSIRNSCPVCRHQLPSDVHNSGGRSSPASAEEVVGLTIWRLPGGGFA

Query:  VGRFTWGREAAEHDLPVVYTEID-GGFSTTSGVPRRITWASS-----------GRRSSESGGFRRVFRSFFSFLGRFRSSSHHSNSEPGL
        VGRF       E  LPVV TE+D GG   +   PRRI+W  S           G  S   G  RR+ R   S + R R +   S+S   +
Subjt:  VGRFTWGREAAEHDLPVVYTEID-GGFSTTSGVPRRITWASS-----------GRRSSESGGFRRVFRSFFSFLGRFRSSSHHSNSEPGL


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTATCACGATGAAGCTTCGGATGATCCTTCCTTCGTCCCGAGATTACGTCGCAGTGGCCGAAGGATCGGTGAGGATCGTTCCCCTTTTAATCGCATCATTGTTCTACG
CGATCCCTCTAATGTTGGGGTTATTAGAAATAATGGTTTTGGTGTTGGGGGGAATTATGAGATTTATTATGATGATGGTACTGGGGCTAGTTTGCGCCCCTTGCCTTCTA
ATATATCTGAGTTCTTGATGGGATCCGGGTTCGATCGCCTTCTCAATCAATTGGCGCAGCTGGAGGTGAATGGGGTTGGTCCAATGTTGGATCACCCACCGGCTTCTAAG
GCTGCAATTGAGTCTTTGCCTGTTGTTAAGATTCTTGCTAGCCTTGTGCCAATGGAATCGCATTGTGCGGTGTGTAAGGAGCCGTTTGAGCTCGAGTCTGTGGCTCGAGA
GATGCCGTGTAAGCATATTTACCATTCGGATTGTATACTTCCTTGGCTTTCTATTCGGAATTCGTGTCCTGTATGTCGGCATCAGTTGCCTTCTGATGTGCATAATAGCG
GTGGGAGGAGCTCCCCTGCGTCTGCTGAAGAAGTTGTTGGATTAACGATTTGGAGGCTGCCCGGTGGGGGGTTTGCGGTTGGGAGGTTTACTTGGGGTAGGGAAGCTGCT
GAACATGACCTTCCTGTTGTTTACACTGAAATTGATGGTGGTTTTAGTACCACCAGTGGTGTTCCAAGGAGGATTACATGGGCATCAAGCGGAAGAAGATCAAGTGAAAG
TGGTGGTTTTCGTCGTGTTTTTCGTAGTTTCTTCTCCTTTTTGGGGAGGTTTAGAAGTTCATCCCATCATTCTAATTCAGAGCCTGGTTTAGTGAGAAGGAGCCTCTCTG
CTACATTATTCAATAGACGGTCAAGGAGGAATAATCACCCTACGGCATCCGAGGCAAATGATATATTTACTTCTTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CTAAACCTCCATTTTCGTCTGCTTCGAATCTCTCTGTCTCTCCATTTCACTACACCGCTTCAATCCCAAGCTTTTTCTGCAAATTCGAACGCAATCATTTTTGGGTTCTC
GAAATTTGTTCGTCGATTTGCAAGCATCGAATCCGAATCGATTTGGTCTTTTGTTCTGATTGCGGTGGCGGTTTCGATCTTCGGCTGATCATCGGTTTCAGTCTGCTGCG
ATGTATCACGATGAAGCTTCGGATGATCCTTCCTTCGTCCCGAGATTACGTCGCAGTGGCCGAAGGATCGGTGAGGATCGTTCCCCTTTTAATCGCATCATTGTTCTACG
CGATCCCTCTAATGTTGGGGTTATTAGAAATAATGGTTTTGGTGTTGGGGGGAATTATGAGATTTATTATGATGATGGTACTGGGGCTAGTTTGCGCCCCTTGCCTTCTA
ATATATCTGAGTTCTTGATGGGATCCGGGTTCGATCGCCTTCTCAATCAATTGGCGCAGCTGGAGGTGAATGGGGTTGGTCCAATGTTGGATCACCCACCGGCTTCTAAG
GCTGCAATTGAGTCTTTGCCTGTTGTTAAGATTCTTGCTAGCCTTGTGCCAATGGAATCGCATTGTGCGGTGTGTAAGGAGCCGTTTGAGCTCGAGTCTGTGGCTCGAGA
GATGCCGTGTAAGCATATTTACCATTCGGATTGTATACTTCCTTGGCTTTCTATTCGGAATTCGTGTCCTGTATGTCGGCATCAGTTGCCTTCTGATGTGCATAATAGCG
GTGGGAGGAGCTCCCCTGCGTCTGCTGAAGAAGTTGTTGGATTAACGATTTGGAGGCTGCCCGGTGGGGGGTTTGCGGTTGGGAGGTTTACTTGGGGTAGGGAAGCTGCT
GAACATGACCTTCCTGTTGTTTACACTGAAATTGATGGTGGTTTTAGTACCACCAGTGGTGTTCCAAGGAGGATTACATGGGCATCAAGCGGAAGAAGATCAAGTGAAAG
TGGTGGTTTTCGTCGTGTTTTTCGTAGTTTCTTCTCCTTTTTGGGGAGGTTTAGAAGTTCATCCCATCATTCTAATTCAGAGCCTGGTTTAGTGAGAAGGAGCCTCTCTG
CTACATTATTCAATAGACGGTCAAGGAGGAATAATCACCCTACGGCATCCGAGGCAAATGATATATTTACTTCTTAGTTTACTTGCACAGAGGTTGAATTCCCACAACAA
TTTTCCTTTTGGTTGACGATGTAGATGTACAATTTTTGTTTTACTAGGTGTATATAGCTATACATCAGAAAGAAACACTGTATTCAATTACTTAAATGTAGTTGACTGGA
AAAATTTTGCCATGGTGGGAGACAAGTATGTGTACGAAGGTAGAGAGCTGTACAATCGGCCGCAATCGGTTTTTTCAGCAGTTCCAAGTATTTGATAGTCTTTTGCTGTT
TGATGTTAGAAGGAAAAAGATGGGTAAGGAGTTCTTGTTAATGTCAGTAGGTGCAGTTTTTTCCTTTTATGCAATGTAACATTGTAACTTCACTGCAAAGCAGG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MYHDEASDDPSFVPRLRRSGRRIGEDRSPFNRIIVLRDPSNVGVIRNNGFGVGGNYEIYYDDGTGASLRPLPSNISEFLMGSGFDRLLNQLAQLEVNGVGPMLDHPPASK
AAIESLPVVKILASLVPMESHCAVCKEPFELESVAREMPCKHIYHSDCILPWLSIRNSCPVCRHQLPSDVHNSGGRSSPASAEEVVGLTIWRLPGGGFAVGRFTWGREAA
EHDLPVVYTEIDGGFSTTSGVPRRITWASSGRRSSESGGFRRVFRSFFSFLGRFRSSSHHSNSEPGLVRRSLSATLFNRRSRRNNHPTASEANDIFTS