CuGenDBv2

Gene ID	Sed0015186
Organism	Sechium edule (Chayote v1)
Description	Unknown protein
Genome location	LG01:67166515..67171764
RNA-Seq Expression	Sed0015186
Synteny	Sed0015186
Gene Ontology terms	NA
InterPro domains	NA

Homology

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GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

KAG7035504.1 hypothetical protein SDJN02_02300 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]

2.1e-21

76.92

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XP_004143853.1 uncharacterized protein LOC101205349 [Cucumis sativus]

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XP_008437426.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103482844 [Cucumis melo]

2.5e-22

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XP_023534508.1 uncharacterized protein LOC111796047 [Cucurbita pepo subsp. pepo]

1.6e-21

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XP_038875405.1 uncharacterized protein LOC120067868 [Benincasa hispida]

1.7e-23

85.53

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TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A0A0KMD8 Uncharacterized protein

1.0e-21

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A0A1S3AUJ6 uncharacterized protein LOC103482844

1.2e-22

82.89

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A0A6J1DS43 uncharacterized protein LOC111023342

6.9e-18

72.37

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A0A6J1H0Q6 uncharacterized protein LOC111459363

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A0A6J1K8D8 uncharacterized protein LOC111491585

8.7e-21

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SwissProt top hits	e value	%identity	Alignment
No hits found

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT4G23885.1 unknown protein

6.6e-13

57.35

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Query:  MKRIPRINFPKRHSGSTSKTPSSSGVD--DQIFFSSLNENASKTYGGKASLQPKRIPLSNEEIEAILL
        +KRIPRI FP+RH   ++    S   +  D +FFS+LN N  KT GGKAS QPKR P+SNEE+EAILL
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AT5G24165.1 unknown protein

5.2e-10

53.52

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Query:  MKRIPRINFPKRHSGSTSKTP---SSSGVDDQIFFSSLNENASKTY--GGKASLQPKRIPLSNEEIEAILL
        M+RIPRI FP+RHS S+   P   S SGV   +  SS    A K    GGKASLQPKR P+S++EIE+I+L
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Sequences

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CDS sequence

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ATGGGCGGAGCTCAGGCCCTGATGAAGAGGATTCCTCGCATCAACTTCCCCAAACGCCATTCTGGTTCTACTTCCAAGACTCCATCAAGCAGTGGGGTGGATGATCAAAT
TTTCTTCTCATCTTTAAATGAAAATGCATCCAAAACTTATGGAGGAAAAGCTTCCCTTCAGCCTAAAAGGATTCCATTGTCCAATGAGGAGATTGAAGCTATTTTGTTGT
GCTACTGA

mRNA sequence

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Protein sequence

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MGGAQALMKRIPRINFPKRHSGSTSKTPSSSGVDDQIFFSSLNENASKTYGGKASLQPKRIPLSNEEIEAILLCY

Sed0015186 (gene) of Chayote v1 genome