; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Sed0015197 (gene) of Chayote v1 genome

Gene IDSed0015197
OrganismSechium edule (Chayote v1)
Descriptionmultiprotein bridging factor 1B
Genome locationLG04:43876353..43886699
RNA-Seq ExpressionSed0015197
SyntenySed0015197
Gene Ontology termsGO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0003677 - DNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001387 - Cro/C1-type helix-turn-helix domain
IPR010982 - Lambda repressor-like, DNA-binding domain superfamily
IPR013729 - Multiprotein bridging factor 1, N-terminal


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6572392.1 Sec1 family domain-containing protein MIP3, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]3.6e-6292.96Show/hide
Query:  MAGIGPLSQDWEPIVMRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRSGAEIETLKKSNAGTNKAASSGTSLNTRKLDDETENLTHEKVPTELKKAIIQARTDKKLTQSQ
        MAGIGP+SQDWEPIV+RKKAPNAAAKKDEKAVNAARR+GAEIETL+KSNAGTNKAASS TSLNTRKLDDETENLTH++VPTELKKAI+QART+KKLTQSQ
Subjt:  MAGIGPLSQDWEPIVMRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRSGAEIETLKKSNAGTNKAASSGTSLNTRKLDDETENLTHEKVPTELKKAIIQARTDKKLTQSQ

Query:  LAQLINEKPQIIQEYESGKAIPNQQIISKLERALGTKLRGKK
        LAQLINEKPQIIQEYESGKAIPNQQII+KLERALGTKLRGKK
Subjt:  LAQLINEKPQIIQEYESGKAIPNQQIISKLERALGTKLRGKK

XP_022148069.1 multiprotein-bridging factor 1a [Momordica charantia]9.5e-6392.96Show/hide
Query:  MAGIGPLSQDWEPIVMRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRSGAEIETLKKSNAGTNKAASSGTSLNTRKLDDETENLTHEKVPTELKKAIIQARTDKKLTQSQ
        M+GIGP+SQDWEP+V+RKKAPNAAAKKDEKAVNAARRSGAEIETLKKSNAGTNKAASS TSLNTRKLDDETENLTH++VPTELKKAI+QARTDKKLTQSQ
Subjt:  MAGIGPLSQDWEPIVMRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRSGAEIETLKKSNAGTNKAASSGTSLNTRKLDDETENLTHEKVPTELKKAIIQARTDKKLTQSQ

Query:  LAQLINEKPQIIQEYESGKAIPNQQIISKLERALGTKLRGKK
        LAQLINEKPQ+IQEYESGKAIPNQQII+KLERALGTKLRGKK
Subjt:  LAQLINEKPQIIQEYESGKAIPNQQIISKLERALGTKLRGKK

XP_022930773.1 multiprotein-bridging factor 1a [Cucurbita moschata]1.9e-6394.37Show/hide
Query:  MAGIGPLSQDWEPIVMRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRSGAEIETLKKSNAGTNKAASSGTSLNTRKLDDETENLTHEKVPTELKKAIIQARTDKKLTQSQ
        M+GIGP+SQDWEP+V+RKKAPNAAAKKDEKAVNAARR+GAEIETLKKSNAGTNKAASSGTSLNTRKLDDETENL+HEKVPTELKKAI+QARTDKKLTQSQ
Subjt:  MAGIGPLSQDWEPIVMRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRSGAEIETLKKSNAGTNKAASSGTSLNTRKLDDETENLTHEKVPTELKKAIIQARTDKKLTQSQ

Query:  LAQLINEKPQIIQEYESGKAIPNQQIISKLERALGTKLRGKK
        LAQLINEKPQIIQEYESGKAIPNQQII+KLERALGTKLRGKK
Subjt:  LAQLINEKPQIIQEYESGKAIPNQQIISKLERALGTKLRGKK

XP_022952433.1 multiprotein-bridging factor 1b-like [Cucurbita moschata]3.6e-6292.96Show/hide
Query:  MAGIGPLSQDWEPIVMRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRSGAEIETLKKSNAGTNKAASSGTSLNTRKLDDETENLTHEKVPTELKKAIIQARTDKKLTQSQ
        MAGIGP+SQDWEPIV+RKKAPNAAAKKDEKAVNAARR+GAEIETL+KSNAGTNKAASS TSLNTRKLDDETENLTH++VPTELKKAI+QART+KKLTQSQ
Subjt:  MAGIGPLSQDWEPIVMRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRSGAEIETLKKSNAGTNKAASSGTSLNTRKLDDETENLTHEKVPTELKKAIIQARTDKKLTQSQ

Query:  LAQLINEKPQIIQEYESGKAIPNQQIISKLERALGTKLRGKK
        LAQLINEKPQIIQEYESGKAIPNQQII+KLERALGTKLRGKK
Subjt:  LAQLINEKPQIIQEYESGKAIPNQQIISKLERALGTKLRGKK

XP_023532017.1 multiprotein-bridging factor 1a [Cucurbita pepo subsp. pepo]8.6e-6495.07Show/hide
Query:  MAGIGPLSQDWEPIVMRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRSGAEIETLKKSNAGTNKAASSGTSLNTRKLDDETENLTHEKVPTELKKAIIQARTDKKLTQSQ
        M+GIGP+SQDWEP+V+RKKAPNAAAKKDEKAVNAARRSGAEIETLKKSNAGTNKAASSGTSLNTRKLDDETENL+HEKVPTELKKAI+QARTDKKLTQSQ
Subjt:  MAGIGPLSQDWEPIVMRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRSGAEIETLKKSNAGTNKAASSGTSLNTRKLDDETENLTHEKVPTELKKAIIQARTDKKLTQSQ

Query:  LAQLINEKPQIIQEYESGKAIPNQQIISKLERALGTKLRGKK
        LAQLINEKPQIIQEYESGKAIPNQQII+KLERALGTKLRGKK
Subjt:  LAQLINEKPQIIQEYESGKAIPNQQIISKLERALGTKLRGKK

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A6J1D2X2 multiprotein-bridging factor 1a4.6e-6392.96Show/hide
Query:  MAGIGPLSQDWEPIVMRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRSGAEIETLKKSNAGTNKAASSGTSLNTRKLDDETENLTHEKVPTELKKAIIQARTDKKLTQSQ
        M+GIGP+SQDWEP+V+RKKAPNAAAKKDEKAVNAARRSGAEIETLKKSNAGTNKAASS TSLNTRKLDDETENLTH++VPTELKKAI+QARTDKKLTQSQ
Subjt:  MAGIGPLSQDWEPIVMRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRSGAEIETLKKSNAGTNKAASSGTSLNTRKLDDETENLTHEKVPTELKKAIIQARTDKKLTQSQ

Query:  LAQLINEKPQIIQEYESGKAIPNQQIISKLERALGTKLRGKK
        LAQLINEKPQ+IQEYESGKAIPNQQII+KLERALGTKLRGKK
Subjt:  LAQLINEKPQIIQEYESGKAIPNQQIISKLERALGTKLRGKK

A0A6J1EWB8 multiprotein-bridging factor 1a9.2e-6494.37Show/hide
Query:  MAGIGPLSQDWEPIVMRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRSGAEIETLKKSNAGTNKAASSGTSLNTRKLDDETENLTHEKVPTELKKAIIQARTDKKLTQSQ
        M+GIGP+SQDWEP+V+RKKAPNAAAKKDEKAVNAARR+GAEIETLKKSNAGTNKAASSGTSLNTRKLDDETENL+HEKVPTELKKAI+QARTDKKLTQSQ
Subjt:  MAGIGPLSQDWEPIVMRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRSGAEIETLKKSNAGTNKAASSGTSLNTRKLDDETENLTHEKVPTELKKAIIQARTDKKLTQSQ

Query:  LAQLINEKPQIIQEYESGKAIPNQQIISKLERALGTKLRGKK
        LAQLINEKPQIIQEYESGKAIPNQQII+KLERALGTKLRGKK
Subjt:  LAQLINEKPQIIQEYESGKAIPNQQIISKLERALGTKLRGKK

A0A6J1GKJ7 multiprotein-bridging factor 1b-like1.7e-6292.96Show/hide
Query:  MAGIGPLSQDWEPIVMRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRSGAEIETLKKSNAGTNKAASSGTSLNTRKLDDETENLTHEKVPTELKKAIIQARTDKKLTQSQ
        MAGIGP+SQDWEPIV+RKKAPNAAAKKDEKAVNAARR+GAEIETL+KSNAGTNKAASS TSLNTRKLDDETENLTH++VPTELKKAI+QART+KKLTQSQ
Subjt:  MAGIGPLSQDWEPIVMRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRSGAEIETLKKSNAGTNKAASSGTSLNTRKLDDETENLTHEKVPTELKKAIIQARTDKKLTQSQ

Query:  LAQLINEKPQIIQEYESGKAIPNQQIISKLERALGTKLRGKK
        LAQLINEKPQIIQEYESGKAIPNQQII+KLERALGTKLRGKK
Subjt:  LAQLINEKPQIIQEYESGKAIPNQQIISKLERALGTKLRGKK

A0A6J1HZG6 multiprotein-bridging factor 1b-like1.1e-6191.55Show/hide
Query:  MAGIGPLSQDWEPIVMRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRSGAEIETLKKSNAGTNKAASSGTSLNTRKLDDETENLTHEKVPTELKKAIIQARTDKKLTQSQ
        MAGIGP+SQDWEP+V+RKKAPNAAAKKDEKAVNAARR+GAEIET +KSNAGTNKAASS TSLNTRKLDDETENLTH++VPTELKKAI+QART+KKLTQSQ
Subjt:  MAGIGPLSQDWEPIVMRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRSGAEIETLKKSNAGTNKAASSGTSLNTRKLDDETENLTHEKVPTELKKAIIQARTDKKLTQSQ

Query:  LAQLINEKPQIIQEYESGKAIPNQQIISKLERALGTKLRGKK
        LAQLINEKPQIIQEYESGKAIPNQQII+KLERALGTKLRGKK
Subjt:  LAQLINEKPQIIQEYESGKAIPNQQIISKLERALGTKLRGKK

A0A6J1JEK2 multiprotein-bridging factor 1a9.2e-6494.37Show/hide
Query:  MAGIGPLSQDWEPIVMRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRSGAEIETLKKSNAGTNKAASSGTSLNTRKLDDETENLTHEKVPTELKKAIIQARTDKKLTQSQ
        M+GIGP+SQDWEP+V+RKKAPNAAAKKDEKAVNAARR+GAEIETLKKSNAGTNKAASSGTSLNTRKLDDETENL+HEKVPTELKKAI+QARTDKKLTQSQ
Subjt:  MAGIGPLSQDWEPIVMRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRSGAEIETLKKSNAGTNKAASSGTSLNTRKLDDETENLTHEKVPTELKKAIIQARTDKKLTQSQ

Query:  LAQLINEKPQIIQEYESGKAIPNQQIISKLERALGTKLRGKK
        LAQLINEKPQIIQEYESGKAIPNQQII+KLERALGTKLRGKK
Subjt:  LAQLINEKPQIIQEYESGKAIPNQQIISKLERALGTKLRGKK

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q5ZMC0 Endothelial differentiation-related factor 1 homolog3.0e-2754.14Show/hide
Query:  DWEPI-VMRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRSGAEIETLKKSNAGTNKAASSGTSLNTRKLDDETENLTHEKVPTELKKAIIQARTDKKLTQSQLAQLINEK
        DW+ + V+RKK P+AA  K ++AV AA+R G ++ET KK  AG NK      + NT KLD ETE L H++VP E+ K I Q R  K +TQ  LA  INEK
Subjt:  DWEPI-VMRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRSGAEIETLKKSNAGTNKAASSGTSLNTRKLDDETENLTHEKVPTELKKAIIQARTDKKLTQSQLAQLINEK

Query:  PQIIQEYESGKAIPNQQIISKLERALGTKLRGK
        PQ+I +YESG+AIPN Q++ K+ERA+G KLRGK
Subjt:  PQIIQEYESGKAIPNQQIISKLERALGTKLRGK

Q6GPQ6 Endothelial differentiation-related factor 1 homolog1.8e-2753.38Show/hide
Query:  DWEPI-VMRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRSGAEIETLKKSNAGTNKAASSGTSLNTRKLDDETENLTHEKVPTELKKAIIQARTDKKLTQSQLAQLINEK
        DW+ + V+RKK P AA  K ++A+ AA+R G E+ET KK +AG NK  +   + NT KLD ETE L H++VP E+ K I Q R  K +TQ  LA  INEK
Subjt:  DWEPI-VMRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRSGAEIETLKKSNAGTNKAASSGTSLNTRKLDDETENLTHEKVPTELKKAIIQARTDKKLTQSQLAQLINEK

Query:  PQIIQEYESGKAIPNQQIISKLERALGTKLRGK
        PQ+I +YE GKAIPN Q++ K+ER +G KLRGK
Subjt:  PQIIQEYESGKAIPNQQIISKLERALGTKLRGK

Q9LV58 Multiprotein-bridging factor 1c6.0e-2846.76Show/hide
Query:  GPLSQDWEPIVMRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRSGAEIETLKKSNAGTNKAASSGT--SLNTRKLDDETENLTHEKVPTELKKAIIQARTDKKLTQSQLA
        G ++QDWEP+V+ K    +   +D KAVNAA R+G  ++T+KK +AG+NK   S     +NT+KL++ETE    ++V  E++  I +AR +KK++Q+ LA
Subjt:  GPLSQDWEPIVMRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRSGAEIETLKKSNAGTNKAASSGT--SLNTRKLDDETENLTHEKVPTELKKAIIQARTDKKLTQSQLA

Query:  QLINEKPQIIQEYESGKAIPNQQIISKLERALGTKLRGK
        + INE+ Q++QEYE+GKA+PNQ +++K+E+ LG KLRGK
Subjt:  QLINEKPQIIQEYESGKAIPNQQIISKLERALGTKLRGK

Q9LXT3 Multiprotein-bridging factor 1b1.7e-5983.1Show/hide
Query:  MAGIGPLSQDWEPIVMRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRSGAEIETLKKSNAGTNKAASSGTSLNTRKLDDETENLTHEKVPTELKKAIIQARTDKKLTQSQ
        MAGIGP++QDWEP+V+RK+APNAAAK+DEK VNAARRSGA+IET++K NAG+NKAASSGTSLNT+KLDD+TENL+H++VPTELKKAI+QAR +KKLTQSQ
Subjt:  MAGIGPLSQDWEPIVMRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRSGAEIETLKKSNAGTNKAASSGTSLNTRKLDDETENLTHEKVPTELKKAIIQARTDKKLTQSQ

Query:  LAQLINEKPQIIQEYESGKAIPNQQIISKLERALGTKLRGKK
        LA LINEKPQ+IQEYESGKAIPNQQI+SKLERALG KLRGKK
Subjt:  LAQLINEKPQIIQEYESGKAIPNQQIISKLERALGTKLRGKK

Q9SJI8 Multiprotein-bridging factor 1a1.6e-6085.21Show/hide
Query:  MAGIGPLSQDWEPIVMRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRSGAEIETLKKSNAGTNKAASSGTSLNTRKLDDETENLTHEKVPTELKKAIIQARTDKKLTQSQ
        MAGIGP++QDWEP+V+RKK  NAAAK+DEK VNAARRSGA+IET++K NAGTNKAASSGTSLNT+ LDD+TENLTHE+VPTELKKAI+QARTDKKLTQSQ
Subjt:  MAGIGPLSQDWEPIVMRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRSGAEIETLKKSNAGTNKAASSGTSLNTRKLDDETENLTHEKVPTELKKAIIQARTDKKLTQSQ

Query:  LAQLINEKPQIIQEYESGKAIPNQQIISKLERALGTKLRGKK
        LAQ+INEKPQ+IQEYESGKAIPNQQI+SKLERALG KLRGKK
Subjt:  LAQLINEKPQIIQEYESGKAIPNQQIISKLERALGTKLRGKK

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G42680.1 multiprotein bridging factor 1A1.1e-6185.21Show/hide
Query:  MAGIGPLSQDWEPIVMRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRSGAEIETLKKSNAGTNKAASSGTSLNTRKLDDETENLTHEKVPTELKKAIIQARTDKKLTQSQ
        MAGIGP++QDWEP+V+RKK  NAAAK+DEK VNAARRSGA+IET++K NAGTNKAASSGTSLNT+ LDD+TENLTHE+VPTELKKAI+QARTDKKLTQSQ
Subjt:  MAGIGPLSQDWEPIVMRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRSGAEIETLKKSNAGTNKAASSGTSLNTRKLDDETENLTHEKVPTELKKAIIQARTDKKLTQSQ

Query:  LAQLINEKPQIIQEYESGKAIPNQQIISKLERALGTKLRGKK
        LAQ+INEKPQ+IQEYESGKAIPNQQI+SKLERALG KLRGKK
Subjt:  LAQLINEKPQIIQEYESGKAIPNQQIISKLERALGTKLRGKK

AT3G24500.1 multiprotein bridging factor 1C4.3e-2946.76Show/hide
Query:  GPLSQDWEPIVMRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRSGAEIETLKKSNAGTNKAASSGT--SLNTRKLDDETENLTHEKVPTELKKAIIQARTDKKLTQSQLA
        G ++QDWEP+V+ K    +   +D KAVNAA R+G  ++T+KK +AG+NK   S     +NT+KL++ETE    ++V  E++  I +AR +KK++Q+ LA
Subjt:  GPLSQDWEPIVMRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRSGAEIETLKKSNAGTNKAASSGT--SLNTRKLDDETENLTHEKVPTELKKAIIQARTDKKLTQSQLA

Query:  QLINEKPQIIQEYESGKAIPNQQIISKLERALGTKLRGK
        + INE+ Q++QEYE+GKA+PNQ +++K+E+ LG KLRGK
Subjt:  QLINEKPQIIQEYESGKAIPNQQIISKLERALGTKLRGK

AT3G24500.2 multiprotein bridging factor 1C9.9e-1041.46Show/hide
Query:  GPLSQDWEPIVMRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRSGAEIETLKKSNAGTNKAASSGT--SLNTRKLDDETENLTHEKVPTELK
        G ++QDWEP+V+ K    +   +D KAVNAA R+G  ++T+KK +AG+NK   S     +NT+KL++ETE    ++V  E++
Subjt:  GPLSQDWEPIVMRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRSGAEIETLKKSNAGTNKAASSGT--SLNTRKLDDETENLTHEKVPTELK

AT3G58680.1 multiprotein bridging factor 1B1.2e-6083.1Show/hide
Query:  MAGIGPLSQDWEPIVMRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRSGAEIETLKKSNAGTNKAASSGTSLNTRKLDDETENLTHEKVPTELKKAIIQARTDKKLTQSQ
        MAGIGP++QDWEP+V+RK+APNAAAK+DEK VNAARRSGA+IET++K NAG+NKAASSGTSLNT+KLDD+TENL+H++VPTELKKAI+QAR +KKLTQSQ
Subjt:  MAGIGPLSQDWEPIVMRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRSGAEIETLKKSNAGTNKAASSGTSLNTRKLDDETENLTHEKVPTELKKAIIQARTDKKLTQSQ

Query:  LAQLINEKPQIIQEYESGKAIPNQQIISKLERALGTKLRGKK
        LA LINEKPQ+IQEYESGKAIPNQQI+SKLERALG KLRGKK
Subjt:  LAQLINEKPQIIQEYESGKAIPNQQIISKLERALGTKLRGKK


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCTGGAATCGGACCGCTTTCACAGGACTGGGAACCTATTGTCATGAGGAAGAAGGCTCCCAACGCCGCCGCCAAGAAGGACGAGAAGGCTGTTAACGCCGCCCGCCG
CTCCGGCGCCGAGATCGAAACCCTAAAGAAATCTAATGCTGGAACAAATAAAGCCGCCTCCAGTGGTACCAGTTTGAATACCAGGAAGTTGGATGATGAAACAGAAAATC
TCACTCATGAAAAGGTACCAACTGAGCTGAAGAAGGCCATTATCCAGGCTCGAACTGATAAGAAGCTTACCCAGTCTCAGCTTGCTCAATTGATCAATGAGAAGCCACAA
ATCATTCAGGAGTATGAGTCTGGGAAAGCCATTCCAAACCAACAAATAATCTCCAAGCTCGAGAGGGCTCTTGGAACTAAGCTTCGTGGAAAAAAGTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCTGGAATCGGACCGCTTTCACAGGACTGGGAACCTATTGTCATGAGGAAGAAGGCTCCCAACGCCGCCGCCAAGAAGGACGAGAAGGCTGTTAACGCCGCCCGCCG
CTCCGGCGCCGAGATCGAAACCCTAAAGAAATCTAATGCTGGAACAAATAAAGCCGCCTCCAGTGGTACCAGTTTGAATACCAGGAAGTTGGATGATGAAACAGAAAATC
TCACTCATGAAAAGGTACCAACTGAGCTGAAGAAGGCCATTATCCAGGCTCGAACTGATAAGAAGCTTACCCAGTCTCAGCTTGCTCAATTGATCAATGAGAAGCCACAA
ATCATTCAGGAGTATGAGTCTGGGAAAGCCATTCCAAACCAACAAATAATCTCCAAGCTCGAGAGGGCTCTTGGAACTAAGCTTCGTGGAAAAAAGTAGGGCCCTCCTTT
GGTAATATTGCTCACTCTGTACATCCTGATTCACCTCTTGGACCAGATGCATACCATGAGTTTGTGAAGCTCACGAGGCATATTCCGACAGTGGAAGGCCTGACATAGAA
CTGATTGCTGGAGGTAAACCTTACGCCCAATTGACATGTTTGATTTATTGCTCGGGGACTCGGCCTACGCCCGATCATCGGAGACTCAAGCCTACGTCTGATCCCTTTGA
TTTTTTAGTCTGAACCTTCCAGTTCTCTGTCATTTCTCATTGTTGAGAGTCCTTTTCTTTGTTCAGCCGAAGTCCGATCATTCAATTAGTTACATTACTTTTTATAGTTA
TATCTAACAATTGTATATGCATGTTCTTTACTCACTTGTTAGCCTTTG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAGIGPLSQDWEPIVMRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRSGAEIETLKKSNAGTNKAASSGTSLNTRKLDDETENLTHEKVPTELKKAIIQARTDKKLTQSQLAQLINEKPQ
IIQEYESGKAIPNQQIISKLERALGTKLRGKK