CuGenDBv2

Gene ID	Sed0015287
Organism	Sechium edule (Chayote v1)
Description	Calcium-binding EF hand family protein
Genome location	LG04:47011336..47012921
RNA-Seq Expression	Sed0015287
Synteny	Sed0015287
Gene Ontology terms	GO:0005509 - calcium ion binding (molecular function)
InterPro domains	NA

Homology

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GenBank top hits

e value

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TrEMBL top hits

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A0A1S3BIQ3 uncharacterized protein LOC103490312 isoform X1

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A0A1S3BJB5 uncharacterized protein LOC103490312 isoform X3

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A0A5A7U809 Uncharacterized protein

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A0A5D3CLV7 Uncharacterized protein

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A0A6J1C333 uncharacterized protein LOC111007917

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SwissProt top hits	e value	%identity	Alignment
No hits found

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT4G38810.1 Calcium-binding EF-hand family protein

2.3e-81

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        F+  FKR  E VA+RL E+PVIVAHSENTFDGSGIRRLLSNKFE DK+L  A++++PKD+ GK+SK +L+  LD VAP A LPP+ ++ QM   +++  K
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AT4G38810.2 Calcium-binding EF-hand family protein

2.3e-81

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Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGGCTACCGGGTTGAAGCGAGATCCTATCATTATACTTCGCATCGATGGAGAAGACCTCCTTGAATTCATCAATGGCCCTGCTTACGAGCCCGAGATGGTTGACGCCTT
TTCACAAATCGAGCGATCCGGAGGATCTCTTCGTGATTACATTGTTAAAGCTTTTGAAAATCTTACTGTGGAACAAGGGATGCCTCCTCCTTCAGACCCTTGGGTTATGA
GCGATATTGTTGAACCAGCTCTCGAGTGGTGTGCGGCAAAGGAGAATTGGGACAGACCCGTCTCGCAAGAGACATTCATGTTGGAATTCAAAAGAGCTGCAGAGTGGGTA
GCTCGACGCCTAAAAGAAAAGCCTGTTATTGTCGCTCATAGTGAAAACACCTTTGATGGCAGTGGCATTCGAAGACTGTTATCCAACAAATTCGAACTCGACAAGTCACT
GAAGACGGCAGTTCAGAGTGTCCCAAAAGATAAAACTGGGAAATTGTCAAAGGAACATCTGCAGTTGGCATTGGATCTGGTTGCTCCGTTAGCTGGTTTACCGCCGCTAG
ATTCCCTCGATCAGATGGGCAAGCGGCTCGTCGACGTATTCAAGATGGTTGATGCCAACGATGGGAAAGCAGTTGAAGAAGACGAGTTCAAGAAACTATTGACTGAGATT
CTGGGAGCAGTGATGTTGCAGTTGGAAAGCAATCCAATCTCAGTTTCTTCAAATTCTGTTGTGCATGAGCCTCTTGCCTGCTCTTCTACGCTCTTGACTCCATTCTCTTA
G

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

TTAAAGGTCCCATTTCATTTTACTTCAAAAGCTATGGACCTGACCGTTCATAGAGATTACTTTTGATTTGAATTGTTTGAATTGTCAACATCTGACATCATTAGTAATCT
AGCAAATGAAGTGGATGATCTATCTATTGATAATAGTATTGATTGAATTTACTCATGATCAACACAAAAGGTAAGCAAGACTGAGTTTAAAGAAGTTCTCTCTGATCTTC
TGCTCGGCATGGCTACCGGGTTGAAGCGAGATCCTATCATTATACTTCGCATCGATGGAGAAGACCTCCTTGAATTCATCAATGGCCCTGCTTACGAGCCCGAGATGGTT
GACGCCTTTTCACAAATCGAGCGATCCGGAGGATCTCTTCGTGATTACATTGTTAAAGCTTTTGAAAATCTTACTGTGGAACAAGGGATGCCTCCTCCTTCAGACCCTTG
GGTTATGAGCGATATTGTTGAACCAGCTCTCGAGTGGTGTGCGGCAAAGGAGAATTGGGACAGACCCGTCTCGCAAGAGACATTCATGTTGGAATTCAAAAGAGCTGCAG
AGTGGGTAGCTCGACGCCTAAAAGAAAAGCCTGTTATTGTCGCTCATAGTGAAAACACCTTTGATGGCAGTGGCATTCGAAGACTGTTATCCAACAAATTCGAACTCGAC
AAGTCACTGAAGACGGCAGTTCAGAGTGTCCCAAAAGATAAAACTGGGAAATTGTCAAAGGAACATCTGCAGTTGGCATTGGATCTGGTTGCTCCGTTAGCTGGTTTACC
GCCGCTAGATTCCCTCGATCAGATGGGCAAGCGGCTCGTCGACGTATTCAAGATGGTTGATGCCAACGATGGGAAAGCAGTTGAAGAAGACGAGTTCAAGAAACTATTGA
CTGAGATTCTGGGAGCAGTGATGTTGCAGTTGGAAAGCAATCCAATCTCAGTTTCTTCAAATTCTGTTGTGCATGAGCCTCTTGCCTGCTCTTCTACGCTCTTGACTCCA
TTCTCTTAGTAATCATGTGAAACAGAGCTATTCTAAGGTAAAAAAAATGACATTTGTATAAGTTATCCTAATATTTGGAGCTTATTAACTGCAATAGAGAAAAGGACATG
CAGCCTAGGCTTGTCATTTCAAATTAGCTTAGAGTTGGCTGTTCCTTATTACAGGCTGAAAAATGATGCTCCCTTGAATTAATA

Protein sequence

Show/hide protein sequence

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ARRLKEKPVIVAHSENTFDGSGIRRLLSNKFELDKSLKTAVQSVPKDKTGKLSKEHLQLALDLVAPLAGLPPLDSLDQMGKRLVDVFKMVDANDGKAVEEDEFKKLLTEI
LGAVMLQLESNPISVSSNSVVHEPLACSSTLLTPFS

Sed0015287 (gene) of Chayote v1 genome