; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Sed0015396 (gene) of Chayote v1 genome

Gene IDSed0015396
OrganismSechium edule (Chayote v1)
DescriptionVQ motif-containing protein 22-like
Genome locationLG07:6649261..6650177
RNA-Seq ExpressionSed0015396
SyntenySed0015396
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR008889 - VQ
IPR039609 - VQ motif-containing protein 15/22


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0044998.1 VQ motif-containing protein 22-like [Cucumis melo var. makuwa]5.4e-6972.51Show/hide
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KAG6600438.1 VQ motif-containing protein 22, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.7e-6768.18Show/hide
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XP_008451884.1 PREDICTED: VQ motif-containing protein 22-like [Cucumis melo]1.6e-6872.04Show/hide
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XP_023529552.1 VQ motif-containing protein 22-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]3.8e-6767.27Show/hide
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XP_038900813.1 VQ motif-containing protein 22 [Benincasa hispida]2.8e-7070.32Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3BTN7 VQ motif-containing protein 22-like7.6e-6972.04Show/hide
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A0A5A7TQ26 VQ motif-containing protein 22-like2.6e-6972.51Show/hide
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A0A5D3CX65 VQ motif-containing protein 22-like7.6e-6972.04Show/hide
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A0A6J1FXJ7 VQ motif-containing protein 22-like2.4e-6767.73Show/hide
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A0A6J1J579 VQ motif-containing protein 22-like2.3e-6566.21Show/hide
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        TGGPT   ASSISPNF LGF GI QSNF  PP+A       Y Q PQFYHS+PQPF+FPAA HGG+FLQR+        GVAGDGFLM+SAVSSQIP  G
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          +ADSSN+ + GNG  LF
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q9LIE6 VQ motif-containing protein 222.7e-1534.34Show/hide
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        M+   +W QFY+ N      T  +   TAS  ++     D T+  + L+P  GR  +P RRR RASRRTPTTLLNTDT+NFRAMVQQ+TGGP        
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          T  F+ + S + S G +      +N  P A  QPPQ      +P++F  +++    +     +     ++     +   + G G+A SS E    N
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G35830.1 VQ motif-containing protein1.9e-0839.42Show/hide
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        S S  +L F +  IS      T   PP   P   P                  P   + R  R+R RASRR PTT+L TDT+NFRAMVQ+FTG P  PF+
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Query:  SSIS
           S
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AT3G22160.1 VQ motif-containing protein1.9e-1634.34Show/hide
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Query:  --TPPFASSISPNFSLGFAGIRQSNFNAPPSAYQQPPQFYHSNPQPFVFPAAVHGGEFLQRLGGVAGDGFLMDSAVSSQIPAAGRGAADSSNEGHGGN
          T  F+ + S + S G +      +N  P A  QPPQ      +P++F  +++    +     +     ++     +   + G G+A SS E    N
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AT4G15120.1 VQ motif-containing protein2.5e-1637.11Show/hide
Query:  SGSGDWLQFYHQNISTTAATPPSDQPTASPMISVDRVSDATAGSTGLNPGG-RAGRPVRRRPRASRRTPTTLLNTDTTNFRAMVQQFTGGPTP-PFASSI
        + + DW QFY+     T AT      T +          AT+  + L+P   R  +P RRR RASRRTPTTL NTDT NFRAMVQQFTGGP+   F SS 
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Query:  SPNFSL----GFAGIRQSNFNAPPSAYQQPPQFYHSNPQPFVFPAAVHGGEFLQRLGGVAGDGFLMDSAVSSQIPAAGRGAADSSNEGHGGNGG
        S  FSL      AG+  S +       Q          +P++F ++ +    L     VA DGF+                A+ S EG GG GG
Subjt:  SPNFSL----GFAGIRQSNFNAPPSAYQQPPQFYHSNPQPFVFPAAVHGGEFLQRLGGVAGDGFLMDSAVSSQIPAAGRGAADSSNEGHGGNGG

AT4G39720.1 VQ motif-containing protein1.1e-0847.56Show/hide
Query:  PPSDQPTASPMISVD-RVSDATAGSTGLNPGGRAG--RPVRRRPRASRRTPTTLLNTDTTNFRAMVQQFTGGPTPPFASSIS
        P + QP   P+  +D R S AT   + L P    G  +  ++R RASRR PTT+L TDT+NFRAMVQ+FTG P PP  ++ S
Subjt:  PPSDQPTASPMISVD-RVSDATAGSTGLNPGGRAG--RPVRRRPRASRRTPTTLLNTDTTNFRAMVQQFTGGPTPPFASSIS

AT5G65170.1 VQ motif-containing protein4.3e-0837.84Show/hide
Query:  FYHQNISTTAATPPSDQPTASPMISVDRVSDATAGSTGLNPGGRAGRPVRRRPRASRRTPTTLLNTDTTNFRAMVQQFTGGPTPPFA--SSISPNFSLGF
        F+   +     T P+   T SP+ SV          T    G    R  ++R R SRR PTT+L TDT+NFRAMVQ+FTG P+ PF   SS  P      
Subjt:  FYHQNISTTAATPPSDQPTASPMISVDRVSDATAGSTGLNPGGRAGRPVRRRPRASRRTPTTLLNTDTTNFRAMVQQFTGGPTPPFA--SSISPNFSLGF

Query:  AGIRQSNFNAP
         G   S+ + P
Subjt:  AGIRQSNFNAP


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTCCGGTTCCGGCGATTGGCTTCAATTTTACCACCAAAACATTTCTACCACGGCGGCGACACCGCCTTCCGATCAACCCACCGCCTCCCCAATGATCTCCGTCGATCG
AGTTTCTGACGCCACCGCCGGTTCGACCGGCTTGAACCCGGGAGGTCGAGCGGGCAGGCCGGTTCGCCGCCGGCCCAGGGCGTCTCGGCGGACTCCGACGACGTTGCTCA
ACACGGACACGACTAATTTCAGAGCGATGGTTCAACAGTTCACCGGCGGTCCGACGCCGCCGTTCGCCTCGTCGATTTCCCCCAATTTTTCGCTAGGGTTCGCCGGGATT
CGTCAATCGAATTTCAACGCGCCGCCGTCTGCTTACCAACAACCGCCGCAGTTCTACCATTCGAACCCCCAGCCGTTCGTGTTTCCGGCCGCCGTTCACGGCGGCGAATT
TCTGCAGAGGCTGGGCGGAGTCGCTGGAGACGGATTTCTGATGGATAGTGCGGTTTCTTCTCAAATTCCTGCCGCCGGCCGAGGTGCTGCAGATTCCTCCAACGAGGGCC
ATGGCGGTAACGGCGGAATACTGTTCTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GCCATTCATTCTCACCAGAAAATCACAGCAACAAAAAAAAAACCAATAAAGAAAAAAAAAACAGAACAATTTTCTTTACTTTTGGCTGTGAGCCAATCAAACCATGTCCG
GTTCCGGCGATTGGCTTCAATTTTACCACCAAAACATTTCTACCACGGCGGCGACACCGCCTTCCGATCAACCCACCGCCTCCCCAATGATCTCCGTCGATCGAGTTTCT
GACGCCACCGCCGGTTCGACCGGCTTGAACCCGGGAGGTCGAGCGGGCAGGCCGGTTCGCCGCCGGCCCAGGGCGTCTCGGCGGACTCCGACGACGTTGCTCAACACGGA
CACGACTAATTTCAGAGCGATGGTTCAACAGTTCACCGGCGGTCCGACGCCGCCGTTCGCCTCGTCGATTTCCCCCAATTTTTCGCTAGGGTTCGCCGGGATTCGTCAAT
CGAATTTCAACGCGCCGCCGTCTGCTTACCAACAACCGCCGCAGTTCTACCATTCGAACCCCCAGCCGTTCGTGTTTCCGGCCGCCGTTCACGGCGGCGAATTTCTGCAG
AGGCTGGGCGGAGTCGCTGGAGACGGATTTCTGATGGATAGTGCGGTTTCTTCTCAAATTCCTGCCGCCGGCCGAGGTGCTGCAGATTCCTCCAACGAGGGCCATGGCGG
TAACGGCGGAATACTGTTCTGATGTCGGCGAAAGAACTCCGATGCCGGCGCCGACGCCGGCGTCGATGATTTACCTGAGAATTTTTGGGGGATTTGTAGAAATTTTTAGG
GGTTTTGGATTTCTGATTATTTGTACTCATGATGGAGAAGGTGAAGGTGAGGCTGAAAACTATAATATATTTTTATTTGTTTATACATTAATTTTTAGATTTTTCTGTTT
TTTTTCTTGGGTGGGATGGGAACATAGCGAAAATAAT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MSGSGDWLQFYHQNISTTAATPPSDQPTASPMISVDRVSDATAGSTGLNPGGRAGRPVRRRPRASRRTPTTLLNTDTTNFRAMVQQFTGGPTPPFASSISPNFSLGFAGI
RQSNFNAPPSAYQQPPQFYHSNPQPFVFPAAVHGGEFLQRLGGVAGDGFLMDSAVSSQIPAAGRGAADSSNEGHGGNGGILF