; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Sed0015568 (gene) of Chayote v1 genome

Gene IDSed0015568
OrganismSechium edule (Chayote v1)
Descriptioncucumber peeling cupredoxin-like
Genome locationLG07:5755745..5757516
RNA-Seq ExpressionSed0015568
SyntenySed0015568
Gene Ontology termsGO:0046658 - anchored component of plasma membrane (cellular component)
GO:0009055 - electron transfer activity (molecular function)
InterPro domainsIPR003245 - Phytocyanin domain
IPR008972 - Cupredoxin
IPR039391 - Phytocyanin


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0058749.1 cucumber peeling cupredoxin-like [Cucumis melo var. makuwa]3.3e-4257.99Show/hide
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        TVH+VGD+TGWT   +  FYS+WAA KTF +G+S+QFNF TN H VLE  TK+ FDAC+F N+DNDIERTGPV + L+E GMHYFVCT+ +HC  GQKL+
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NP_001267496.1 cucumber peeling cupredoxin-like precursor [Cucumis sativus]6.7e-4357.51Show/hide
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         L+E GMHYFVCT+ +HC  GQKLSINVV  A+   + P    PP+++P      PSS  P S+  PPSPSSSNA+MA+L +T  + +VM+ F
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XP_008461124.1 PREDICTED: cucumber peeling cupredoxin-like [Cucumis melo]4.8e-4958.03Show/hide
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        L+E GMHYFVCT+ +HC  GQKL+INVV   +G P SP  P           ++PSSPSPP S+  PPSPSSSNA+MA+L +T  + +VM+ F
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XP_022151423.1 cucumber peeling cupredoxin-like [Momordica charantia]2.7e-3655.45Show/hide
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        MAG  + LV G +A V  QQAAAQTVHVVGDATGWT  Q  A FYS WAA + FV GDSL F F TN H VLE  TK+ FDACS +N   ++  TGP T 
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         L   G+HY++CT+  HCL GQKLSI V  T  G   SP++PRPP AT           P  +PSS SPP+     + P PSSS+AVMAS+ VT LSAIV
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        MS
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XP_038896386.1 cucumber peeling cupredoxin-like [Benincasa hispida]1.1e-3753.97Show/hide
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        VG V GL+A+VFL  A AQTVH VG  TGWT   +    FYS WAANK F VGDSL+FNF TN H V E  +K+ FD+C+FN  D+DI R GP T  L +
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          MHYFVCT+  HC +GQKLSINVV  A+G P SPSSP PP+      T+ P          PPSPSSSN++ A+L ++  SAI+M+ F
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3CDJ1 cucumber peeling cupredoxin-like2.3e-4958.03Show/hide
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        MAG  V  V GL+AVVF+  A AQTVH+VGD+TGWT   +  FYS+WAA KTF +G+S+QFNF TN H VLE  TK+ FDAC+F N+DNDIERTGPV + 
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        L+E GMHYFVCT+ +HC  GQKL+INVV   +G P SP  P           ++PSSPSPP S+  PPSPSSSNA+MA+L +T  + +VM+ F
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A0A5A7UZ00 Cucumber peeling cupredoxin-like1.6e-4257.99Show/hide
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        INVV   +G P SP  P           ++PSSPSPP S+  PPSPSSSNA+MA+L +T  + +VM+ F
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A0A5D3CF84 Cucumber peeling cupredoxin-like2.3e-4958.03Show/hide
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        L+E GMHYFVCT+ +HC  GQKL+INVV   +G P SP  P           ++PSSPSPP S+  PPSPSSSNA+MA+L +T  + +VM+ F
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A0A6J1DC50 cucumber peeling cupredoxin-like1.3e-3655.45Show/hide
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         L   G+HY++CT+  HCL GQKLSI V  T  G   SP++PRPP AT           P  +PSS SPP+     + P PSSS+AVMAS+ VT LSAIV
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        MS
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Q96403 Stellacyanin3.2e-4357.51Show/hide
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        MA   V  V GL+AVVFL  A AQ TVH+VGD TGW+   + NFYSQWAA KTF VGDSLQFNF  N H+V E +TKQ FDAC+F N+DND+ERT PV +
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         L+E GMHYFVCT+ +HC  GQKLSINVV  A+   + P    PP+++P      PSS  P S+  PPSPSSSNA+MA+L +T  + +VM+ F
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O82081 Uclacyanin 11.3e-1235.83Show/hide
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        MA R + ++  +LA   +    A T H +G  +GWT  + A+  + WAA +TF VGD+L F++    H V+E  TK  FD+C       +F N ++ +  
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               L  PG  YF+C +  HC  G KL +NVVPTA+  PT+P  +  P    P+P ++ P  P  P  P P  SPSSS  + +S
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P29602 Cucumber peeling cupredoxin2.0e-3760Show/hide
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        INVV   +     P S  PP++   PP + P SPS
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P42849 Umecyanin4.0e-1443Show/hide
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        VG    W       FY  WA  KTF VGD L+F+F    H V    TK  FD C   N  + +  T PV  +L   G  Y++CT+  HC +GQKLSINVV
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Q07488 Blue copper protein1.1e-1134.76Show/hide
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        L +VF         + VGD T WT  +   FY+ WA  KTF VGD L+F+F    H V    ++  F+ C      + +    PV  +L   G  YF+CT
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        +  HC  GQKLSI VV         P A   P   S+P     TP  A  T TPS  S     TP   ++S+   A+  V  +SA+V
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Q96316 Uclacyanin-32.4e-1140.56Show/hide
Query:  VGDATGWTNQITANFYSQWAANKTFVVGDSLQFNFVTNTHSVLEQDTKQLFDACSFNNNDNDIERTGPVTKVLEEPGMHYFVCTISSHCLMGQKLSINVV
        VGD +GWT+ +    Y+ W   KTF VGD+L+F +   +HSV   D K  +D C  +    +    G     L   G  +F+C    HC  G KL++ V+
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Query:  PTASGPPTSPSSPRPPAATPAPPTLTPSSP-SPPSLPTPPSPS
          A  P T PSSP    +TP+ P  TPS+P SPPS P+PPSPS
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G32300.1 uclacyanin 19.1e-1435.83Show/hide
Query:  MAGRRVGLVFGLLAVVFLQQAAAQTVHVVGDATGWTNQITANFYSQWAANKTFVVGDSLQFNFVTNTHSVLEQDTKQLFDAC-------SFNNNDNDIER
        MA R + ++  +LA   +    A T H +G  +GWT  + A+  + WAA +TF VGD+L F++    H V+E  TK  FD+C       +F N ++ +  
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Query:  TGPVTKVLEEPGMHYFVCTISSHCLMGQKLSINVVPTASGPPTSP-SSPRPPAATPAPPTLTPSSPSPPSLPTPP-SPSSSNAVMAS
               L  PG  YF+C +  HC  G KL +NVVPTA+  PT+P  +  P    P+P ++ P  P  P  P P  SPSSS  + +S
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AT2G44790.1 uclacyanin 21.6e-1034.52Show/hide
Query:  VGLVFGLLAVVFLQQAAAQTVHVVGDATGWTNQITANFYSQWAANKTFVVGDSLQFNF-VTNTHSVLEQDTKQLFDACSFNNNDNDIERTGPVTKVLEEP
        V     LL V+ +   A    + +     WT  +    YS WA  KTF VGD L+F +  ++T  V+++      DA S   N +D    G     L+  
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Query:  GMHYFVCTISSHCLM--GQKLSINVVPTASGPPTSPSSPRPPAATPAPPTLTPSSPSPPSLPTPPSPS
        G++YF+C+   HC    G KL++NVV  ++GPP +P+   PP++TP  PT TP SP     PTP +P+
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AT3G20570.1 early nodulin-like protein 99.4e-1133.67Show/hide
Query:  FGLLAVVFLQQAAAQTVHVVGDATGWTNQITANFYSQWAANKTFVVGDSLQFNFVTNTHSVLEQDTKQLFDACSFNNNDNDIER--TGPVTKVLEEPGMH
        FGLL  + +   A      VG ATGWT    +  YSQWA    F +GDSL F + +N  SVL Q T+  +D+C   N D+   +   G  +  L   G +
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Query:  YFVCTISSHCLMGQKLSINVVPTASGPPTSPSSPRPPA------ATPAPPT-----LTPSSPSPPSLPTPPSPSSSNAVMASLCVTLLSAIVMSLF
        YF+     +C   +KL + V+   SG   + SSP  PA      + P+PP      +TP+     S  TP S +SS + +A+L   L +A+  +LF
Subjt:  YFVCTISSHCLMGQKLSINVVPTASGPPTSPSSPRPPA------ATPAPPT-----LTPSSPSPPSLPTPPSPSSSNAVMASLCVTLLSAIVMSLF

AT3G60280.1 uclacyanin 31.7e-1240.56Show/hide
Query:  VGDATGWTNQITANFYSQWAANKTFVVGDSLQFNFVTNTHSVLEQDTKQLFDACSFNNNDNDIERTGPVTKVLEEPGMHYFVCTISSHCLMGQKLSINVV
        VGD +GWT+ +    Y+ W   KTF VGD+L+F +   +HSV   D K  +D C  +    +    G     L   G  +F+C    HC  G KL++ V+
Subjt:  VGDATGWTNQITANFYSQWAANKTFVVGDSLQFNFVTNTHSVLEQDTKQLFDACSFNNNDNDIERTGPVTKVLEEPGMHYFVCTISSHCLMGQKLSINVV

Query:  PTASGPPTSPSSPRPPAATPAPPTLTPSSP-SPPSLPTPPSPS
          A  P T PSSP    +TP+ P  TPS+P SPPS P+PPSPS
Subjt:  PTASGPPTSPSSPRPPAATPAPPTLTPSSP-SPPSLPTPPSPS

AT5G20230.1 blue-copper-binding protein7.7e-1334.76Show/hide
Query:  LAVVFLQQAAAQTVHVVGDATGWTNQITANFYSQWAANKTFVVGDSLQFNFVTNTHSVLEQDTKQLFDACSFNNNDNDIERTGPVTKVLEEPGMHYFVCT
        L +VF         + VGD T WT  +   FY+ WA  KTF VGD L+F+F    H V    ++  F+ C      + +    PV  +L   G  YF+CT
Subjt:  LAVVFLQQAAAQTVHVVGDATGWTNQITANFYSQWAANKTFVVGDSLQFNFVTNTHSVLEQDTKQLFDACSFNNNDNDIERTGPVTKVLEEPGMHYFVCT

Query:  ISSHCLMGQKLSINVV---------PTASGPPTSPSSPRPPAATP--APPTLTPSSPSPPSLPTPPSPSSSNAVMASLCVTLLSAIV
        +  HC  GQKLSI VV         P A   P   S+P     TP  A  T TPS  S     TP   ++S+   A+  V  +SA+V
Subjt:  ISSHCLMGQKLSINVV---------PTASGPPTSPSSPRPPAATP--APPTLTPSSPSPPSLPTPPSPSSSNAVMASLCVTLLSAIV


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCCGGCCGCCGAGTTGGTTTGGTTTTTGGTTTACTTGCGGTGGTTTTTCTTCAACAAGCCGCCGCTCAGACGGTTCATGTTGTCGGCGACGCCACCGGTTGGACCAA
TCAGATAACCGCTAATTTCTATTCCCAATGGGCTGCTAATAAAACCTTCGTCGTTGGCGATTCCCTACAATTTAACTTTGTAACCAACACACACAGTGTACTAGAACAAG
ATACGAAACAATTGTTCGATGCTTGTAGTTTCAATAACAACGACAACGATATCGAGAGGACAGGTCCGGTAACGAAGGTACTCGAGGAACCGGGCATGCATTACTTTGTC
TGCACCATCAGCTCGCATTGTTTGATGGGCCAAAAGTTATCCATCAATGTCGTGCCCACTGCTAGTGGTCCTCCGACGTCCCCCTCGTCTCCACGACCTCCTGCAGCGAC
ACCAGCACCGCCTACATTGACACCATCGTCTCCTTCACCACCATCATTGCCTACACCACCATCACCATCCTCCTCTAATGCAGTGATGGCAAGCCTTTGTGTCACTTTGT
TATCCGCCATTGTTATGAGCTTGTTTTACATATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AAAAGAATCAAGTTCCTCAAACATCAACCTTTATAATATAATCCATTGATTTGCTGATCCGAGATGGCCGGCCGCCGAGTTGGTTTGGTTTTTGGTTTACTTGCGGTGGT
TTTTCTTCAACAAGCCGCCGCTCAGACGGTTCATGTTGTCGGCGACGCCACCGGTTGGACCAATCAGATAACCGCTAATTTCTATTCCCAATGGGCTGCTAATAAAACCT
TCGTCGTTGGCGATTCCCTACAATTTAACTTTGTAACCAACACACACAGTGTACTAGAACAAGATACGAAACAATTGTTCGATGCTTGTAGTTTCAATAACAACGACAAC
GATATCGAGAGGACAGGTCCGGTAACGAAGGTACTCGAGGAACCGGGCATGCATTACTTTGTCTGCACCATCAGCTCGCATTGTTTGATGGGCCAAAAGTTATCCATCAA
TGTCGTGCCCACTGCTAGTGGTCCTCCGACGTCCCCCTCGTCTCCACGACCTCCTGCAGCGACACCAGCACCGCCTACATTGACACCATCGTCTCCTTCACCACCATCAT
TGCCTACACCACCATCACCATCCTCCTCTAATGCAGTGATGGCAAGCCTTTGTGTCACTTTGTTATCCGCCATTGTTATGAGCTTGTTTTACATATGAGATTGTTGATTT
GTTGAGCAATAATTTAGTTTATGTTTATGGACGTTTGTTGAGAGTTGGAGATTTGTGAGTGGTTATATTTCATTTGTTTTCAAATAAATTTATATTTTTTTTTGTC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAGRRVGLVFGLLAVVFLQQAAAQTVHVVGDATGWTNQITANFYSQWAANKTFVVGDSLQFNFVTNTHSVLEQDTKQLFDACSFNNNDNDIERTGPVTKVLEEPGMHYFV
CTISSHCLMGQKLSINVVPTASGPPTSPSSPRPPAATPAPPTLTPSSPSPPSLPTPPSPSSSNAVMASLCVTLLSAIVMSLFYI