; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Sed0015800 (gene) of Chayote v1 genome

Gene IDSed0015800
OrganismSechium edule (Chayote v1)
Description50S ribosomal protein L29, chloroplastic-like
Genome locationLG13:6865355..6868277
RNA-Seq ExpressionSed0015800
SyntenySed0015800
Gene Ontology termsGO:0006412 - translation (biological process)
GO:0005840 - ribosome (cellular component)
GO:0003735 - structural constituent of ribosome (molecular function)
InterPro domainsIPR001854 - Ribosomal protein L29/L35
IPR036049 - Ribosomal protein L29/L35 superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6577307.1 50S ribosomal protein L29, chloroplastic, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]2.1e-6989.29Show/hide
Query:  MINLSISSPSSISLPPKILSSTSKSSFNGAQIRFPLSFRVPPKTACTGGRNSSAVMMAKKDEELKKIRAKSTEEINEEVVDLKGELLMLRLQKSARNEFK
        M+NLSI+SPSS+++P K LSSTSKSSFNG QIRFP SFRVPPK ACTGGRNS  VMMAK++EELK IRAK+TEEINEEVVDLKGELLMLRLQKSARNEFK
Subjt:  MINLSISSPSSISLPPKILSSTSKSSFNGAQIRFPLSFRVPPKTACTGGRNSSAVMMAKKDEELKKIRAKSTEEINEEVVDLKGELLMLRLQKSARNEFK

Query:  SSEFRRMRKRIARMLTVKREREIEEGVGKRLSRKLDRKWKKSIVVRPPPSLKKLREEEAAAEAAEKSA
        SSEFRRMRKRIARMLTVKREREIEEGVGKRLSRKLDRKWK+SIVVRPPPSLKKLREEE AAEAAEKSA
Subjt:  SSEFRRMRKRIARMLTVKREREIEEGVGKRLSRKLDRKWKKSIVVRPPPSLKKLREEEAAAEAAEKSA

XP_022941582.1 50S ribosomal protein L29, chloroplastic-like [Cucurbita moschata]1.6e-6989.88Show/hide
Query:  MINLSISSPSSISLPPKILSSTSKSSFNGAQIRFPLSFRVPPKTACTGGRNSSAVMMAKKDEELKKIRAKSTEEINEEVVDLKGELLMLRLQKSARNEFK
        MINLSI+SPSS+S P K LSSTSKSSFNG QIRFP SFRVPPKTA TGGRNSS VMMAK++EELK+IR K+TEEINEEV+DLKGELLMLRLQKSARNEFK
Subjt:  MINLSISSPSSISLPPKILSSTSKSSFNGAQIRFPLSFRVPPKTACTGGRNSSAVMMAKKDEELKKIRAKSTEEINEEVVDLKGELLMLRLQKSARNEFK

Query:  SSEFRRMRKRIARMLTVKREREIEEGVGKRLSRKLDRKWKKSIVVRPPPSLKKLREEEAAAEAAEKSA
        SSEFRRMRKRIARMLTVKREREIEEGVGKRLSRKLDRKWK+SIVVRPPPSLKKLREEEAAAE AEKSA
Subjt:  SSEFRRMRKRIARMLTVKREREIEEGVGKRLSRKLDRKWKKSIVVRPPPSLKKLREEEAAAEAAEKSA

XP_022977189.1 50S ribosomal protein L29, chloroplastic-like [Cucurbita maxima]3.6e-6989.29Show/hide
Query:  MINLSISSPSSISLPPKILSSTSKSSFNGAQIRFPLSFRVPPKTACTGGRNSSAVMMAKKDEELKKIRAKSTEEINEEVVDLKGELLMLRLQKSARNEFK
        M+NLSI+SPSS+S P K LSSTSKSSFNG QIRFP SFRVPPKTA TGGRNSS VMMAK++EELK+IR K+TEEINEEV+DLKGELLMLRLQKSARNEFK
Subjt:  MINLSISSPSSISLPPKILSSTSKSSFNGAQIRFPLSFRVPPKTACTGGRNSSAVMMAKKDEELKKIRAKSTEEINEEVVDLKGELLMLRLQKSARNEFK

Query:  SSEFRRMRKRIARMLTVKREREIEEGVGKRLSRKLDRKWKKSIVVRPPPSLKKLREEEAAAEAAEKSA
        SSEFRRMRKRIARMLTVKREREIEEGVGKRLSRKLDRKWK+SIVVRPPPSLKKLREEEAAAE AEKSA
Subjt:  SSEFRRMRKRIARMLTVKREREIEEGVGKRLSRKLDRKWKKSIVVRPPPSLKKLREEEAAAEAAEKSA

XP_022985118.1 50S ribosomal protein L29, chloroplastic-like [Cucurbita maxima]2.1e-6989.88Show/hide
Query:  MINLSISSPSSISLPPKILSSTSKSSFNGAQIRFPLSFRVPPKTACTGGRNSSAVMMAKKDEELKKIRAKSTEEINEEVVDLKGELLMLRLQKSARNEFK
        MINLSI+SPSS+++P K LSSTSKSSFNG QIRFP SFRVPPK AC GGRNS  VMMAK++EELK IRAK+TEEINEEVVDLKGELLMLRLQKSARNEFK
Subjt:  MINLSISSPSSISLPPKILSSTSKSSFNGAQIRFPLSFRVPPKTACTGGRNSSAVMMAKKDEELKKIRAKSTEEINEEVVDLKGELLMLRLQKSARNEFK

Query:  SSEFRRMRKRIARMLTVKREREIEEGVGKRLSRKLDRKWKKSIVVRPPPSLKKLREEEAAAEAAEKSA
        SSEFRRMRKRIARMLTVKREREIEEGVGKRLSRKLDRKWKKSIVVRPPPSLKKLREEE AAEAAEKSA
Subjt:  SSEFRRMRKRIARMLTVKREREIEEGVGKRLSRKLDRKWKKSIVVRPPPSLKKLREEEAAAEAAEKSA

XP_038903244.1 50S ribosomal protein L29, chloroplastic [Benincasa hispida]6.6e-7191.07Show/hide
Query:  MINLSISSPSSISLPPKILSSTSKSSFNGAQIRFPLSFRVPPKTACTGGRNSSAVMMAKKDEELKKIRAKSTEEINEEVVDLKGELLMLRLQKSARNEFK
        MINLSI+SPS++S+P K+L+STSKSSFNG QIRFP SFRVPPKTACTGGRNSS VMMAK++EELK+IRAKSTEEI EEVVDLKGELLMLRLQKSARNEFK
Subjt:  MINLSISSPSSISLPPKILSSTSKSSFNGAQIRFPLSFRVPPKTACTGGRNSSAVMMAKKDEELKKIRAKSTEEINEEVVDLKGELLMLRLQKSARNEFK

Query:  SSEFRRMRKRIARMLTVKREREIEEGVGKRLSRKLDRKWKKSIVVRPPPSLKKLREEEAAAEAAEKSA
        SSEFRRMRKRIARMLTVKREREIEEGVGKRLSRKLDRKWKKSIVVRPPPSLKKLREEEAAAE AEKSA
Subjt:  SSEFRRMRKRIARMLTVKREREIEEGVGKRLSRKLDRKWKKSIVVRPPPSLKKLREEEAAAEAAEKSA

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A6J1C3N4 50S ribosomal protein L29, chloroplastic2.6e-6586.9Show/hide
Query:  MINLSISSPSSISLPPKILSSTSKSSFNGAQIRFPLSFRVPPKTACTGGRNSSAVMMAKKDEELKKIRAKSTEEINEEVVDLKGELLMLRLQKSARNEFK
        MINLSI+SPS++SLP  +LSSTSKSSF G QIR P S RV  KT C G RNSS VMMAK++EELK+IRAK+TEEINEEVVDLKGELLMLRLQKSARNEFK
Subjt:  MINLSISSPSSISLPPKILSSTSKSSFNGAQIRFPLSFRVPPKTACTGGRNSSAVMMAKKDEELKKIRAKSTEEINEEVVDLKGELLMLRLQKSARNEFK

Query:  SSEFRRMRKRIARMLTVKREREIEEGVGKRLSRKLDRKWKKSIVVRPPPSLKKLREEEAAAEAAEKSA
        SSEFRRMRKRIARMLTVKREREIEEGVGKRLSRKLDRKWKKSIVVRPPPSLKKLREEEAAAE AEKSA
Subjt:  SSEFRRMRKRIARMLTVKREREIEEGVGKRLSRKLDRKWKKSIVVRPPPSLKKLREEEAAAEAAEKSA

A0A6J1EMX4 50S ribosomal protein L29, chloroplastic-like8.1e-6788.1Show/hide
Query:  MINLSISSPSSISLPPKILSSTSKSSFNGAQIRFPLSFRVPPKTACTGGRNSSAVMMAKKDEELKKIRAKSTEEINEEVVDLKGELLMLRLQKSARNEFK
        M+NLSI+SPSS+++P K LSSTSKSSFNG QIRFP S RVPPK ACTGGRNS  VMMAK++EELK IRAK+TEEINEEVVDLKGELLMLRLQKSARNEFK
Subjt:  MINLSISSPSSISLPPKILSSTSKSSFNGAQIRFPLSFRVPPKTACTGGRNSSAVMMAKKDEELKKIRAKSTEEINEEVVDLKGELLMLRLQKSARNEFK

Query:  SSEFRRMRKRIARMLTVKREREIEEGVGKRLSRKLDRKWKKSIVVRPPPSLKKLREEEAAAEAAEKSA
        SSEFRRMRKRIARMLTVKREREIEEGVGKRLSRKLDRKWKKSIVVRPPPSLKKLREEE   EAAEKSA
Subjt:  SSEFRRMRKRIARMLTVKREREIEEGVGKRLSRKLDRKWKKSIVVRPPPSLKKLREEEAAAEAAEKSA

A0A6J1FMW5 50S ribosomal protein L29, chloroplastic-like7.8e-7089.88Show/hide
Query:  MINLSISSPSSISLPPKILSSTSKSSFNGAQIRFPLSFRVPPKTACTGGRNSSAVMMAKKDEELKKIRAKSTEEINEEVVDLKGELLMLRLQKSARNEFK
        MINLSI+SPSS+S P K LSSTSKSSFNG QIRFP SFRVPPKTA TGGRNSS VMMAK++EELK+IR K+TEEINEEV+DLKGELLMLRLQKSARNEFK
Subjt:  MINLSISSPSSISLPPKILSSTSKSSFNGAQIRFPLSFRVPPKTACTGGRNSSAVMMAKKDEELKKIRAKSTEEINEEVVDLKGELLMLRLQKSARNEFK

Query:  SSEFRRMRKRIARMLTVKREREIEEGVGKRLSRKLDRKWKKSIVVRPPPSLKKLREEEAAAEAAEKSA
        SSEFRRMRKRIARMLTVKREREIEEGVGKRLSRKLDRKWK+SIVVRPPPSLKKLREEEAAAE AEKSA
Subjt:  SSEFRRMRKRIARMLTVKREREIEEGVGKRLSRKLDRKWKKSIVVRPPPSLKKLREEEAAAEAAEKSA

A0A6J1IQR3 50S ribosomal protein L29, chloroplastic-like1.7e-6989.29Show/hide
Query:  MINLSISSPSSISLPPKILSSTSKSSFNGAQIRFPLSFRVPPKTACTGGRNSSAVMMAKKDEELKKIRAKSTEEINEEVVDLKGELLMLRLQKSARNEFK
        M+NLSI+SPSS+S P K LSSTSKSSFNG QIRFP SFRVPPKTA TGGRNSS VMMAK++EELK+IR K+TEEINEEV+DLKGELLMLRLQKSARNEFK
Subjt:  MINLSISSPSSISLPPKILSSTSKSSFNGAQIRFPLSFRVPPKTACTGGRNSSAVMMAKKDEELKKIRAKSTEEINEEVVDLKGELLMLRLQKSARNEFK

Query:  SSEFRRMRKRIARMLTVKREREIEEGVGKRLSRKLDRKWKKSIVVRPPPSLKKLREEEAAAEAAEKSA
        SSEFRRMRKRIARMLTVKREREIEEGVGKRLSRKLDRKWK+SIVVRPPPSLKKLREEEAAAE AEKSA
Subjt:  SSEFRRMRKRIARMLTVKREREIEEGVGKRLSRKLDRKWKKSIVVRPPPSLKKLREEEAAAEAAEKSA

A0A6J1JCM6 50S ribosomal protein L29, chloroplastic-like1.0e-6989.88Show/hide
Query:  MINLSISSPSSISLPPKILSSTSKSSFNGAQIRFPLSFRVPPKTACTGGRNSSAVMMAKKDEELKKIRAKSTEEINEEVVDLKGELLMLRLQKSARNEFK
        MINLSI+SPSS+++P K LSSTSKSSFNG QIRFP SFRVPPK AC GGRNS  VMMAK++EELK IRAK+TEEINEEVVDLKGELLMLRLQKSARNEFK
Subjt:  MINLSISSPSSISLPPKILSSTSKSSFNGAQIRFPLSFRVPPKTACTGGRNSSAVMMAKKDEELKKIRAKSTEEINEEVVDLKGELLMLRLQKSARNEFK

Query:  SSEFRRMRKRIARMLTVKREREIEEGVGKRLSRKLDRKWKKSIVVRPPPSLKKLREEEAAAEAAEKSA
        SSEFRRMRKRIARMLTVKREREIEEGVGKRLSRKLDRKWKKSIVVRPPPSLKKLREEE AAEAAEKSA
Subjt:  SSEFRRMRKRIARMLTVKREREIEEGVGKRLSRKLDRKWKKSIVVRPPPSLKKLREEEAAAEAAEKSA

SwissProt top hitse value%identityAlignment
B8HMR2 50S ribosomal protein L299.4e-0433.33Show/hide
Query:  ELKKIRAKSTEEINEEVVDLKGELLMLRLQKSARNEFKSSEFRRMRKRIARMLTVKREREIEE
        ++K +   S  E+  +++DLK +L  LRLQK+ R E K  +F+ +R ++A+++T++R+R++ +
Subjt:  ELKKIRAKSTEEINEEVVDLKGELLMLRLQKSARNEFKSSEFRRMRKRIARMLTVKREREIEE

P82248 50S ribosomal protein L29, chloroplastic8.4e-3758.39Show/hide
Query:  SSISLPPKILSSTSKSSFNGAQ---IRFPLSFRVPPKTACTGGRNSSAVMMAKKDEELKKIRAKSTEEINEEVVDLKGELLMLRLQKSARNEFKSSEFRR
        S ++ PPK    T KSSF+G +   +    S R+  +T       SS V+M KK++ELK++R K+ E++NEE++ LKGEL MLRLQ+SAR  FK S+F R
Subjt:  SSISLPPKILSSTSKSSFNGAQ---IRFPLSFRVPPKTACTGGRNSSAVMMAKKDEELKKIRAKSTEEINEEVVDLKGELLMLRLQKSARNEFKSSEFRR

Query:  MRKRIARMLTVKREREIEEGVGKRLSRKLDRKWKKSIVVRPPPSLKKLREEEAAAEAAEKS
        MRKR+ARMLTVKREREIE+GVGKRLSRKLD+ WK+SIVVRPPPSLKKL+E+  A   AEK+
Subjt:  MRKRIARMLTVKREREIEEGVGKRLSRKLDRKWKKSIVVRPPPSLKKLREEEAAAEAAEKS

Q9FJP3 50S ribosomal protein L29, chloroplastic1.9e-4463.1Show/hide
Query:  MINLSISSPSSISLPPKILSS--TSKSSFNGAQIRFPLSFRVP-PKTACTGGRNSSAVMMAKKDEELKKIRAKSTEEINEEVVDLKGELLMLRLQKSARN
        M++LSI++P + ++  +  +S  ++ SSF+G +I+  +S RVP   T  +     S VMM+K++ ELK+IR+K+TE++ EEVVDLKGEL MLRLQKSARN
Subjt:  MINLSISSPSSISLPPKILSS--TSKSSFNGAQIRFPLSFRVP-PKTACTGGRNSSAVMMAKKDEELKKIRAKSTEEINEEVVDLKGELLMLRLQKSARN

Query:  EFKSSEFRRMRKRIARMLTVKREREIEEGVGKRLSRKLDRKWKKSIVVRPPPSLKKLREEEAAAEAAE
        EFKSS+FRRM+K++ARMLTVKREREI+EG+ KRLSRKLDR+WKKSIV RPPPSLKKL+EEEAA EAAE
Subjt:  EFKSSEFRRMRKRIARMLTVKREREIEEGVGKRLSRKLDRKWKKSIVVRPPPSLKKLREEEAAAEAAE

Q9SWI6 50S ribosomal protein L29, chloroplastic5.1e-3472.22Show/hide
Query:  RNSSAVMMAKKDEELKKIRAKSTEEINEEVVDLKGELLMLRLQKSARNEFKSSEFRRMRKRIARMLTVKREREIEEGVGKRLSRKLDRKWKKSIVVRPPP
        R ++ V MAK+++EL++IRA +TE++ EEVVDLKGEL +LRL++SAR EFK+SEF RMRKRIARMLTVKREREIE+G+ KRLSRKLDRKWK+SIVVRPPP
Subjt:  RNSSAVMMAKKDEELKKIRAKSTEEINEEVVDLKGELLMLRLQKSARNEFKSSEFRRMRKRIARMLTVKREREIEEGVGKRLSRKLDRKWKKSIVVRPPP

Query:  SLKKLREE
        SL+  +EE
Subjt:  SLKKLREE

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT5G65220.1 Ribosomal L29 family protein1.3e-4563.1Show/hide
Query:  MINLSISSPSSISLPPKILSS--TSKSSFNGAQIRFPLSFRVP-PKTACTGGRNSSAVMMAKKDEELKKIRAKSTEEINEEVVDLKGELLMLRLQKSARN
        M++LSI++P + ++  +  +S  ++ SSF+G +I+  +S RVP   T  +     S VMM+K++ ELK+IR+K+TE++ EEVVDLKGEL MLRLQKSARN
Subjt:  MINLSISSPSSISLPPKILSS--TSKSSFNGAQIRFPLSFRVP-PKTACTGGRNSSAVMMAKKDEELKKIRAKSTEEINEEVVDLKGELLMLRLQKSARN

Query:  EFKSSEFRRMRKRIARMLTVKREREIEEGVGKRLSRKLDRKWKKSIVVRPPPSLKKLREEEAAAEAAE
        EFKSS+FRRM+K++ARMLTVKREREI+EG+ KRLSRKLDR+WKKSIV RPPPSLKKL+EEEAA EAAE
Subjt:  EFKSSEFRRMRKRIARMLTVKREREIEEGVGKRLSRKLDRKWKKSIVVRPPPSLKKLREEEAAAEAAE


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGATAAACCTTTCAATTTCATCGCCTTCGAGCATTTCTCTCCCTCCAAAAATTCTCAGCTCCACCTCCAAATCCTCCTTCAATGGCGCTCAAATCCGTTTCCCGTTATC
GTTTCGCGTTCCCCCAAAAACGGCATGCACCGGCGGCCGCAATTCGTCGGCGGTAATGATGGCGAAGAAGGATGAGGAATTGAAGAAAATCAGAGCGAAGAGCACTGAGG
AAATCAACGAAGAGGTCGTCGATCTTAAGGGCGAGCTTCTTATGCTTCGGCTTCAGAAATCGGCTCGCAATGAGTTCAAGTCCAGCGAATTCCGCCGTATGCGTAAACGG
ATTGCTCGGATGCTAACTGTAAAACGCGAACGAGAGATCGAAGAGGGAGTGGGGAAAAGGCTGTCAAGAAAGCTAGACAGGAAGTGGAAGAAGAGTATTGTGGTCAGACC
ACCTCCATCTTTGAAGAAGTTGCGAGAGGAAGAAGCAGCAGCTGAAGCAGCTGAGAAATCTGCTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GTTCTAAAAAAGAAGGTTTTTTAGGGGTAGTTTTCGTAAATGGAGACAATGAAAAAGGGCAAAAAAGGAACAGAAAAAAAAGAAGCGCAAGAGAGCTTATCTTCATCTTC
AATGGCATGCTGAGCTTTCTTCATCCAACAAAAAGCGCTGTGACTGAACAAAACCACACACAGACTCCGCAAAGATGATAAACCTTTCAATTTCATCGCCTTCGAGCATT
TCTCTCCCTCCAAAAATTCTCAGCTCCACCTCCAAATCCTCCTTCAATGGCGCTCAAATCCGTTTCCCGTTATCGTTTCGCGTTCCCCCAAAAACGGCATGCACCGGCGG
CCGCAATTCGTCGGCGGTAATGATGGCGAAGAAGGATGAGGAATTGAAGAAAATCAGAGCGAAGAGCACTGAGGAAATCAACGAAGAGGTCGTCGATCTTAAGGGCGAGC
TTCTTATGCTTCGGCTTCAGAAATCGGCTCGCAATGAGTTCAAGTCCAGCGAATTCCGCCGTATGCGTAAACGGATTGCTCGGATGCTAACTGTAAAACGCGAACGAGAG
ATCGAAGAGGGAGTGGGGAAAAGGCTGTCAAGAAAGCTAGACAGGAAGTGGAAGAAGAGTATTGTGGTCAGACCACCTCCATCTTTGAAGAAGTTGCGAGAGGAAGAAGC
AGCAGCTGAAGCAGCTGAGAAATCTGCTTGATCCAACCAGATATGTTTTCAAACATAATTGTAGCTTTATGAGTTGTTCTTTTCTTAAAAAAAAAACTAAAAAAAAGAGT
ATGAAGTTGTTGAGAATGCTATTTAAACAACGTTCTAGATTTTTTGTTTTTATTTTTCCTGAAAAAATCTGATAAATTGGAAATAGATTTTGAGGGGATCATGTTGAATT
CTTATTCTTTCATGTCTACGCCTTTTATCTGAGATAAACCAAAGCAAACTCGAATCCCCTCAAGCCCAAATTGAAGAACTCTTTGTTTACCATATCAGGGGAATTGAATG
GAATGAGAATGTTAGGTTAAAC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MINLSISSPSSISLPPKILSSTSKSSFNGAQIRFPLSFRVPPKTACTGGRNSSAVMMAKKDEELKKIRAKSTEEINEEVVDLKGELLMLRLQKSARNEFKSSEFRRMRKR
IARMLTVKREREIEEGVGKRLSRKLDRKWKKSIVVRPPPSLKKLREEEAAAEAAEKSA