; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Sed0015866 (gene) of Chayote v1 genome

Gene IDSed0015866
OrganismSechium edule (Chayote v1)
Descriptiontranscription factor MYB44-like
Genome locationLG10:28460114..28460962
RNA-Seq ExpressionSed0015866
SyntenySed0015866
Gene Ontology termsGO:0006355 - regulation of transcription, DNA-templated (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0000978 - RNA polymerase II proximal promoter sequence-specific DNA binding (molecular function)
GO:0000981 - DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific (molecular function)
InterPro domainsIPR001005 - SANT/Myb domain
IPR009057 - Homeobox-like domain superfamily
IPR017930 - Myb domain


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7020554.1 Transcription factor MYB44, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]3.4e-8575.34Show/hide
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XP_022144294.1 transcription factor MYB1-like [Momordica charantia]5.0e-8976.44Show/hide
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        ATIARLL GRTDNAVKNHWNSTLKRRA+E  Q LVM  IAP+N+ ++               +DPLTALTLAPPGIG     +   ++RR+ESLP GFWD
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XP_022951647.1 transcription factor MYB44-like [Cucurbita moschata]6.8e-8675.8Show/hide
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        SSSSS STSSDSSFSG  SRRP KIKGPWS +EDRIL  LV RYGPRNWSLIS YI GRSGKSCRLRWCNQLSPNVEHRPFS  ED+TIL+AHARFGNRW
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        ATIARLL GRTDNAVKNHWNSTLKRRA+    HL +  I PDN+ +A             +DPLTALTLAPPGI G V AEERR+ES PAGFWDAMRDV+
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        AREVREYMTT+F+EN E H
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XP_023002015.1 transcription factor MYB44-like [Cucurbita maxima]6.8e-8675.8Show/hide
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        SSSSS STSS +SFS K SRRP KIKGPWS +EDRIL HLV RYGPRNWSLIS YI GRSGKSCRLRWCNQLSPNVEHRPFS  ED+TIL+AHARFGNRW
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        ATIARLL GRTDNAVKNHWNSTLKRRA++   HL M  I PDN+ +A             +DPLTALTLAPPGI G V AEERR+ES PAGFWDAMRDV+
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        AREVREYMTT+F+EN E H
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XP_038885826.1 transcription factor MYB25-like [Benincasa hispida]4.6e-9078.22Show/hide
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        SSSSSDSTSSDSSFSGK  RRP KIKGPWS +EDRILT LVARYGPRNWSLIS YI GRSGKSCRLRWCNQLSPNVEHRPFSP ED+TIL+AHARFGNRW
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        ATIARLL GRTDNAVKNHWNSTLKRRA+E  Q LVM  IAP+N+ + N                 DPLTALTLAPPGIG   + TAEERRVE+ PAGFWD
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Query:  AMRDVIAREVREYMTTSFMENPELH
        AMRDVIAREVREYMTT+FMENPE H
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LKY3 Uncharacterized protein2.8e-8574.68Show/hide
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        +SSSSDSTSSDSSFSGK  RRP KIKGPWS +EDRILT LV RYG RNWSLIS YI GRSGKSCRLRWCNQLSPNVEHRPFSP ED+TIL+AHARFGNRW
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Query:  ATIARLLSGRTDNAVKNHWNSTLKRRAKEP--HQHLVMHAIAPD-----NNIHAN--------------------DPLTALTLAPPGIGSV---TAEERR
        ATIARLL GRTDNAVKNHWNSTLKRRA+E   HQ LVM  I P+     NN + N                    DPLTALTLAPPGIG V    AEERR
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        VES PAGFWDAMRDVIAREVREYMTT+FMENPE
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A0A5A7SVX1 Transcription factor MYB44-like6.2e-8574.14Show/hide
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        +SSSSDSTSSDSSFSGK  RRP KIKGPWS +EDRILT LV RYG RNWSLIS YI GRSGKSCRLRWCNQLSPNVEHRPFSP ED+TIL+AHARFGNRW
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Query:  ATIARLLSGRTDNAVKNHWNSTLKRRAKE-PHQHLVMHAIAPD------NNIHA----------------NDPLTALTLAPPGIGSV----TAEERRVES
        ATIARLL GRTDNAVKNHWNSTLKRRA+E   Q LVM  I P+      NN +A                +DPLTALTLAPPGIG V      +ERRVES
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         PAGFWDAMRDVIAREVREYMTT+FMENPE H
Subjt:  LPAGFWDAMRDVIAREVREYMTTSFMENPELH

A0A6J1CRX2 transcription factor MYB1-like2.4e-8976.44Show/hide
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        ATIARLL GRTDNAVKNHWNSTLKRRA+E  Q LVM  IAP+N+ ++               +DPLTALTLAPPGIG     +   ++RR+ESLP GFWD
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        AMRDVIAREVREYMTT+FMENPELH
Subjt:  AMRDVIAREVREYMTTSFMENPELH

A0A6J1GI94 transcription factor MYB44-like3.3e-8675.8Show/hide
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        SSSSS STSSDSSFSG  SRRP KIKGPWS +EDRIL  LV RYGPRNWSLIS YI GRSGKSCRLRWCNQLSPNVEHRPFS  ED+TIL+AHARFGNRW
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Query:  ATIARLLSGRTDNAVKNHWNSTLKRRAKEPHQHLVMHAIAPDNNIHA-------------NDPLTALTLAPPGI-GSVTAEERRVESLPAGFWDAMRDVI
        ATIARLL GRTDNAVKNHWNSTLKRRA+    HL +  I PDN+ +A             +DPLTALTLAPPGI G V AEERR+ES PAGFWDAMRDV+
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        AREVREYMTT+F+EN E H
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A0A6J1KMR9 transcription factor MYB44-like3.3e-8675.8Show/hide
Query:  SSSSSDSTSSDSSFSGKASRRPAKIKGPWSEDEDRILTHLVARYGPRNWSLISPYIHGRSGKSCRLRWCNQLSPNVEHRPFSPAEDDTILSAHARFGNRW
        SSSSS STSS +SFS K SRRP KIKGPWS +EDRIL HLV RYGPRNWSLIS YI GRSGKSCRLRWCNQLSPNVEHRPFS  ED+TIL+AHARFGNRW
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Query:  ATIARLLSGRTDNAVKNHWNSTLKRRAKEPHQHLVMHAIAPDNNIHA-------------NDPLTALTLAPPGI-GSVTAEERRVESLPAGFWDAMRDVI
        ATIARLL GRTDNAVKNHWNSTLKRRA++   HL M  I PDN+ +A             +DPLTALTLAPPGI G V AEERR+ES PAGFWDAMRDV+
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Query:  AREVREYMTTSFMENPELH
        AREVREYMTT+F+EN E H
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O04192 Transcription factor MYB251.8e-3353.85Show/hide
Query:  VSSSSSDSTSSDSSFSGKASRRPAKIKGPWSEDEDRILTHLVARYGPRNWSLISPYIHGRSGKSCRLRWCNQLSPNVEHRPFSPAEDDTILSAHARFGNR
        V +  ++   SD++  GK     +K+KGPW  ++D  LT LV   GPRNW+LIS  I GRSGKSCRLRWCNQL P ++ +PFS  E+  I+SA A  GN+
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        W+ IA+LL GRTDNA+KNHWNS L+R+  E
Subjt:  WATIARLLSGRTDNAVKNHWNSTLKRRAKE

O23160 Transcription factor MYB735.7e-4370.54Show/hide
Query:  SGKASRRPAKIKGPWSEDEDRILTHLVARYGPRNWSLISPYIHGRSGKSCRLRWCNQLSPNVEHRPFSPAEDDTILSAHARFGNRWATIARLLSGRTDNA
        S    +   +IKGPWS +ED +L  LV ++GPRNWSLIS  I GRSGKSCRLRWCNQLSP VEHR FS  ED+TI+ AHARFGN+WATI+RLL+GRTDNA
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Query:  VKNHWNSTLKRR
        +KNHWNSTLKR+
Subjt:  VKNHWNSTLKRR

Q42575 Transcription factor MYB11.5e-3559.48Show/hide
Query:  SSFSGKASR-RPAKIKGPWSEDEDRILTHLVARYGPRNWSLISPYIHGRSGKSCRLRWCNQLSPNVEHRPFSPAEDDTILSAHARFGNRWATIARLLSGR
        + F G + R R  ++KGPWS++ED +L+ LV R G RNWS I+  I GRSGKSCRLRWCNQL+PN+    F+  ED  I++AHA  GN+WA IA+LL GR
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Query:  TDNAVKNHWNSTLKRR
        TDNA+KNHWNS L+RR
Subjt:  TDNAVKNHWNSTLKRR

Q9FDW1 Transcription factor MYB441.5e-4376.7Show/hide
Query:  KIKGPWSEDEDRILTHLVARYGPRNWSLISPYIHGRSGKSCRLRWCNQLSPNVEHRPFSPAEDDTILSAHARFGNRWATIARLLSGRTDNAVKNHWNSTL
        +IKGPWS +ED  L  LV +YGPRNW++IS  I GRSGKSCRLRWCNQLSP VEHRPFS  ED+TI  AHA+FGN+WATIARLL+GRTDNAVKNHWNSTL
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Query:  KRR
        KR+
Subjt:  KRR

Q9SN12 Transcription factor MYB775.1e-4475.73Show/hide
Query:  KIKGPWSEDEDRILTHLVARYGPRNWSLISPYIHGRSGKSCRLRWCNQLSPNVEHRPFSPAEDDTILSAHARFGNRWATIARLLSGRTDNAVKNHWNSTL
        ++KGPWS++ED  L  +V +YGPRNWS IS  I GRSGKSCRLRWCNQLSP VEHRPFSP ED+TI++A A+FGN+WATIARLL+GRTDNAVKNHWNSTL
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Query:  KRR
        KR+
Subjt:  KRR

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G23290.1 myb domain protein 706.2e-4572.32Show/hide
Query:  SGKASRRPAKIKGPWSEDEDRILTHLVARYGPRNWSLISPYIHGRSGKSCRLRWCNQLSPNVEHRPFSPAEDDTILSAHARFGNRWATIARLLSGRTDNA
        SG   +   +IKGPWS +ED +L  LV ++GPRNWSLIS  I GRSGKSCRLRWCNQLSP VEHR F+  EDDTI+ AHARFGN+WATIARLL+GRTDNA
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Query:  VKNHWNSTLKRR
        +KNHWNSTLKR+
Subjt:  VKNHWNSTLKRR

AT3G50060.1 myb domain protein 773.6e-4575.73Show/hide
Query:  KIKGPWSEDEDRILTHLVARYGPRNWSLISPYIHGRSGKSCRLRWCNQLSPNVEHRPFSPAEDDTILSAHARFGNRWATIARLLSGRTDNAVKNHWNSTL
        ++KGPWS++ED  L  +V +YGPRNWS IS  I GRSGKSCRLRWCNQLSP VEHRPFSP ED+TI++A A+FGN+WATIARLL+GRTDNAVKNHWNSTL
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Query:  KRR
        KR+
Subjt:  KRR

AT3G55730.1 myb domain protein 1097.4e-3859.68Show/hide
Query:  SSSDSTSSDSSFSGKASRRPAKIKGPWSEDEDRILTHLVARYGPRNWSLISPYIHGRSGKSCRLRWCNQLSPNVEHRPFSPAEDDTILSAHARFGNRWAT
        ++ DS+       G    R +K+KGPWS +ED +LT LV + GPRNWSLI+  I GRSGKSCRLRWCNQL P ++ +PFS  ED  I+SAHA  GN+WA 
Subjt:  SSSDSTSSDSSFSGKASRRPAKIKGPWSEDEDRILTHLVARYGPRNWSLISPYIHGRSGKSCRLRWCNQLSPNVEHRPFSPAEDDTILSAHARFGNRWAT

Query:  IARLLSGRTDNAVKNHWNSTLKRR
        IA+LL+GRTDNA+KNHWNSTL+R+
Subjt:  IARLLSGRTDNAVKNHWNSTLKRR

AT4G37260.1 myb domain protein 734.0e-4470.54Show/hide
Query:  SGKASRRPAKIKGPWSEDEDRILTHLVARYGPRNWSLISPYIHGRSGKSCRLRWCNQLSPNVEHRPFSPAEDDTILSAHARFGNRWATIARLLSGRTDNA
        S    +   +IKGPWS +ED +L  LV ++GPRNWSLIS  I GRSGKSCRLRWCNQLSP VEHR FS  ED+TI+ AHARFGN+WATI+RLL+GRTDNA
Subjt:  SGKASRRPAKIKGPWSEDEDRILTHLVARYGPRNWSLISPYIHGRSGKSCRLRWCNQLSPNVEHRPFSPAEDDTILSAHARFGNRWATIARLLSGRTDNA

Query:  VKNHWNSTLKRR
        +KNHWNSTLKR+
Subjt:  VKNHWNSTLKRR

AT5G67300.1 myb domain protein r11.1e-4476.7Show/hide
Query:  KIKGPWSEDEDRILTHLVARYGPRNWSLISPYIHGRSGKSCRLRWCNQLSPNVEHRPFSPAEDDTILSAHARFGNRWATIARLLSGRTDNAVKNHWNSTL
        +IKGPWS +ED  L  LV +YGPRNW++IS  I GRSGKSCRLRWCNQLSP VEHRPFS  ED+TI  AHA+FGN+WATIARLL+GRTDNAVKNHWNSTL
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Query:  KRR
        KR+
Subjt:  KRR


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGTGAGCTCTTCTTCTTCCGATTCCACGTCGTCGGATTCCTCCTTCTCCGGCAAGGCCTCTCGCCGGCCGGCCAAGATTAAAGGGCCATGGAGTGAGGATGAGGACCG
GATACTGACCCACCTCGTGGCTCGATATGGCCCCAGGAACTGGTCCTTGATTAGCCCTTACATCCACGGCCGGTCCGGCAAATCCTGCCGCCTCCGCTGGTGTAACCAGT
TGAGCCCCAATGTGGAGCACCGCCCGTTTTCTCCCGCCGAGGATGACACCATTTTGTCCGCTCATGCCCGGTTCGGGAACCGCTGGGCCACCATTGCCCGCTTGCTCTCC
GGCCGGACCGACAATGCCGTTAAGAATCACTGGAACTCCACGCTCAAGCGCCGGGCCAAGGAGCCGCACCAGCATTTAGTAATGCACGCAATTGCCCCTGACAACAATAT
TCATGCCAATGACCCGTTGACCGCCTTGACTCTTGCCCCGCCGGGGATCGGCAGCGTCACAGCGGAGGAGCGGCGAGTTGAGAGTTTGCCGGCAGGGTTTTGGGATGCAA
TGAGGGATGTGATTGCGAGGGAGGTGAGAGAGTACATGACCACATCGTTTATGGAAAATCCAGAGCTTCACTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATAATGGTGAGCTCTTCTTCTTCCGATTCCACGTCGTCGGATTCCTCCTTCTCCGGCAAGGCCTCTCGCCGGCCGGCCAAGATTAAAGGGCCATGGAGTGAGGATGAGGA
CCGGATACTGACCCACCTCGTGGCTCGATATGGCCCCAGGAACTGGTCCTTGATTAGCCCTTACATCCACGGCCGGTCCGGCAAATCCTGCCGCCTCCGCTGGTGTAACC
AGTTGAGCCCCAATGTGGAGCACCGCCCGTTTTCTCCCGCCGAGGATGACACCATTTTGTCCGCTCATGCCCGGTTCGGGAACCGCTGGGCCACCATTGCCCGCTTGCTC
TCCGGCCGGACCGACAATGCCGTTAAGAATCACTGGAACTCCACGCTCAAGCGCCGGGCCAAGGAGCCGCACCAGCATTTAGTAATGCACGCAATTGCCCCTGACAACAA
TATTCATGCCAATGACCCGTTGACCGCCTTGACTCTTGCCCCGCCGGGGATCGGCAGCGTCACAGCGGAGGAGCGGCGAGTTGAGAGTTTGCCGGCAGGGTTTTGGGATG
CAATGAGGGATGTGATTGCGAGGGAGGTGAGAGAGTACATGACCACATCGTTTATGGAAAATCCAGAGCTTCACTAACGAAAGCTGTATTAAATTCTTGTTGATATAACC
AACAGGCCCAACATGAACAGTAATTCAACGCCATCAATATTAACTTAGTGACCTGAAGGTCAAAGATTCGAATCCTTCATCTGCAATTGTTGTTACCTCAAAAAAATAAA
ATTCTTGTTAGATATATAATTATGATTCATTGAAAAATAGAAAAAGGAAAGAAATTCCAACGTGGCATTACAGCCTGGC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MVSSSSSDSTSSDSSFSGKASRRPAKIKGPWSEDEDRILTHLVARYGPRNWSLISPYIHGRSGKSCRLRWCNQLSPNVEHRPFSPAEDDTILSAHARFGNRWATIARLLS
GRTDNAVKNHWNSTLKRRAKEPHQHLVMHAIAPDNNIHANDPLTALTLAPPGIGSVTAEERRVESLPAGFWDAMRDVIAREVREYMTTSFMENPELH