; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Sed0016219 (gene) of Chayote v1 genome

Gene IDSed0016219
OrganismSechium edule (Chayote v1)
DescriptionRAB6-interacting golgin
Genome locationLG10:12481500..12484809
RNA-Seq ExpressionSed0016219
SyntenySed0016219
Gene Ontology termsGO:0005794 - Golgi apparatus (cellular component)
InterPro domainsIPR007033 - RAB6-interacting golgin


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004143305.1 uncharacterized protein LOC101209289 [Cucumis sativus]1.2e-6184.71Show/hide
Query:  QQLQLMLASSGNLSFSSKEDEEMSKSALSGFREKEEEIERMRLELQNKLQARLGRVHDESRRLASIRQELEAIAGDPTRKEIVQIRKKIDALNKDLKPLG
        QQLQ ML +S NLSFSSKED+EMSKSAL+ FREKEEEI+RMR EL NKLQ RLGRV +ESRRL+S+R+ELEAI GDP RKEI QIRKKIDALNK+LKPLG
Subjt:  QQLQLMLASSGNLSFSSKEDEEMSKSALSGFREKEEEIERMRLELQNKLQARLGRVHDESRRLASIRQELEAIAGDPTRKEIVQIRKKIDALNKDLKPLG

Query:  ITCQKKEKEYKDALDAFNEKNNEKVQLISKLMEMVGESEKLRMKKLEELSKHVDNTS
        +TCQKKEKEYKDALD+FNEKNNEKVQLISKLMEMVGESEKLR+K+LEELSKHVDNTS
Subjt:  ITCQKKEKEYKDALDAFNEKNNEKVQLISKLMEMVGESEKLRMKKLEELSKHVDNTS

XP_008462544.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103500877 [Cucumis melo]1.8e-6285.35Show/hide
Query:  QQLQLMLASSGNLSFSSKEDEEMSKSALSGFREKEEEIERMRLELQNKLQARLGRVHDESRRLASIRQELEAIAGDPTRKEIVQIRKKIDALNKDLKPLG
        QQLQ ML +SGNLSFSSKED+EMSKSAL+ FREKEEEI+RMR EL NKLQ RLGRV +ESRRL+S+R+ELEAI GDP RKEI QIRKKIDALNK+LKPLG
Subjt:  QQLQLMLASSGNLSFSSKEDEEMSKSALSGFREKEEEIERMRLELQNKLQARLGRVHDESRRLASIRQELEAIAGDPTRKEIVQIRKKIDALNKDLKPLG

Query:  ITCQKKEKEYKDALDAFNEKNNEKVQLISKLMEMVGESEKLRMKKLEELSKHVDNTS
        +TCQKKEKEYKDALD+FNEKNNEKVQLISKLMEMVGESEKLR+K+LEELSKHVDNTS
Subjt:  ITCQKKEKEYKDALDAFNEKNNEKVQLISKLMEMVGESEKLRMKKLEELSKHVDNTS

XP_022143816.1 uncharacterized protein LOC111013636 [Momordica charantia]1.5e-6186.62Show/hide
Query:  QQLQLMLASSGNLSFSSKEDEEMSKSALSGFREKEEEIERMRLELQNKLQARLGRVHDESRRLASIRQELEAIAGDPTRKEIVQIRKKIDALNKDLKPLG
        Q  QLML +SGNLSFSSKEDEEMSKSALS FREKEEEIERMR+++Q+KLQARLGRV +E+RRL+SIR+ELEAI GDPTRKEI QIRKKIDA+NK+LKPLG
Subjt:  QQLQLMLASSGNLSFSSKEDEEMSKSALSGFREKEEEIERMRLELQNKLQARLGRVHDESRRLASIRQELEAIAGDPTRKEIVQIRKKIDALNKDLKPLG

Query:  ITCQKKEKEYKDALDAFNEKNNEKVQLISKLMEMVGESEKLRMKKLEELSKHVDNTS
         TCQKKEKEYKDALDAFNEKNNEKVQLISKLMEMVGESE+LRMK+LEELSKHVDNTS
Subjt:  ITCQKKEKEYKDALDAFNEKNNEKVQLISKLMEMVGESEKLRMKKLEELSKHVDNTS

XP_023543803.1 uncharacterized protein LOC111803564 [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.3e-6084.71Show/hide
Query:  QQLQLMLASSGNLSFSSKEDEEMSKSALSGFREKEEEIERMRLELQNKLQARLGRVHDESRRLASIRQELEAIAGDPTRKEIVQIRKKIDALNKDLKPLG
        QQLQ+ML +SGNLSFSSKEDEEMSKSALS FREKEEEIERMR ELQ KLQARLGRV +ESRRLASIR+ELE I GDPTRKEI QIRK+ID LNK+LKPLG
Subjt:  QQLQLMLASSGNLSFSSKEDEEMSKSALSGFREKEEEIERMRLELQNKLQARLGRVHDESRRLASIRQELEAIAGDPTRKEIVQIRKKIDALNKDLKPLG

Query:  ITCQKKEKEYKDALDAFNEKNNEKVQLISKLMEMVGESEKLRMKKLEELSKHVDNTS
          CQKKEKEYKDALDAFNEKNNEKVQ ISKLMEMVGESE++R+K+LEELSKHVDN +
Subjt:  ITCQKKEKEYKDALDAFNEKNNEKVQLISKLMEMVGESEKLRMKKLEELSKHVDNTS

XP_038882826.1 uncharacterized protein LOC120073968 isoform X1 [Benincasa hispida]1.5e-6185.35Show/hide
Query:  QQLQLMLASSGNLSFSSKEDEEMSKSALSGFREKEEEIERMRLELQNKLQARLGRVHDESRRLASIRQELEAIAGDPTRKEIVQIRKKIDALNKDLKPLG
        QQLQ ML +S +LSFSSKED++MSKSAL+ FREKEEEI+RMR +L NKLQ RLGRV +ESRRLASIR+EL+AIAGDP RKEI QIRKKIDALNK+LKPLG
Subjt:  QQLQLMLASSGNLSFSSKEDEEMSKSALSGFREKEEEIERMRLELQNKLQARLGRVHDESRRLASIRQELEAIAGDPTRKEIVQIRKKIDALNKDLKPLG

Query:  ITCQKKEKEYKDALDAFNEKNNEKVQLISKLMEMVGESEKLRMKKLEELSKHVDNTS
        ITCQKKEKEYKDALDAFNEKNNEKVQLISKLMEMVGESEKLR+K+LEELSKHVDNTS
Subjt:  ITCQKKEKEYKDALDAFNEKNNEKVQLISKLMEMVGESEKLRMKKLEELSKHVDNTS

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KHE9 RAB6-interacting golgin5.6e-6284.71Show/hide
Query:  QQLQLMLASSGNLSFSSKEDEEMSKSALSGFREKEEEIERMRLELQNKLQARLGRVHDESRRLASIRQELEAIAGDPTRKEIVQIRKKIDALNKDLKPLG
        QQLQ ML +S NLSFSSKED+EMSKSAL+ FREKEEEI+RMR EL NKLQ RLGRV +ESRRL+S+R+ELEAI GDP RKEI QIRKKIDALNK+LKPLG
Subjt:  QQLQLMLASSGNLSFSSKEDEEMSKSALSGFREKEEEIERMRLELQNKLQARLGRVHDESRRLASIRQELEAIAGDPTRKEIVQIRKKIDALNKDLKPLG

Query:  ITCQKKEKEYKDALDAFNEKNNEKVQLISKLMEMVGESEKLRMKKLEELSKHVDNTS
        +TCQKKEKEYKDALD+FNEKNNEKVQLISKLMEMVGESEKLR+K+LEELSKHVDNTS
Subjt:  ITCQKKEKEYKDALDAFNEKNNEKVQLISKLMEMVGESEKLRMKKLEELSKHVDNTS

A0A1S3CIS0 RAB6-interacting golgin8.6e-6385.35Show/hide
Query:  QQLQLMLASSGNLSFSSKEDEEMSKSALSGFREKEEEIERMRLELQNKLQARLGRVHDESRRLASIRQELEAIAGDPTRKEIVQIRKKIDALNKDLKPLG
        QQLQ ML +SGNLSFSSKED+EMSKSAL+ FREKEEEI+RMR EL NKLQ RLGRV +ESRRL+S+R+ELEAI GDP RKEI QIRKKIDALNK+LKPLG
Subjt:  QQLQLMLASSGNLSFSSKEDEEMSKSALSGFREKEEEIERMRLELQNKLQARLGRVHDESRRLASIRQELEAIAGDPTRKEIVQIRKKIDALNKDLKPLG

Query:  ITCQKKEKEYKDALDAFNEKNNEKVQLISKLMEMVGESEKLRMKKLEELSKHVDNTS
        +TCQKKEKEYKDALD+FNEKNNEKVQLISKLMEMVGESEKLR+K+LEELSKHVDNTS
Subjt:  ITCQKKEKEYKDALDAFNEKNNEKVQLISKLMEMVGESEKLRMKKLEELSKHVDNTS

A0A6J1CRG0 RAB6-interacting golgin7.3e-6286.62Show/hide
Query:  QQLQLMLASSGNLSFSSKEDEEMSKSALSGFREKEEEIERMRLELQNKLQARLGRVHDESRRLASIRQELEAIAGDPTRKEIVQIRKKIDALNKDLKPLG
        Q  QLML +SGNLSFSSKEDEEMSKSALS FREKEEEIERMR+++Q+KLQARLGRV +E+RRL+SIR+ELEAI GDPTRKEI QIRKKIDA+NK+LKPLG
Subjt:  QQLQLMLASSGNLSFSSKEDEEMSKSALSGFREKEEEIERMRLELQNKLQARLGRVHDESRRLASIRQELEAIAGDPTRKEIVQIRKKIDALNKDLKPLG

Query:  ITCQKKEKEYKDALDAFNEKNNEKVQLISKLMEMVGESEKLRMKKLEELSKHVDNTS
         TCQKKEKEYKDALDAFNEKNNEKVQLISKLMEMVGESE+LRMK+LEELSKHVDNTS
Subjt:  ITCQKKEKEYKDALDAFNEKNNEKVQLISKLMEMVGESEKLRMKKLEELSKHVDNTS

A0A6J1I5J6 RAB6-interacting golgin6.2e-6183.23Show/hide
Query:  NPEAQQLQLMLASSGNLSFSSKEDEEMSKSALSGFREKEEEIERMRLELQNKLQARLGRVHDESRRLASIRQELEAIAGDPTRKEIVQIRKKIDALNKDL
        NP+ QQLQLML +SGN SFSSK+DEEMSKSALS FREKEEEIERMR E+Q KLQARLGRV +E+RRLASIR+ELEAIA DP RKEI QIRK+IDA+NK+L
Subjt:  NPEAQQLQLMLASSGNLSFSSKEDEEMSKSALSGFREKEEEIERMRLELQNKLQARLGRVHDESRRLASIRQELEAIAGDPTRKEIVQIRKKIDALNKDL

Query:  KPLGITCQKKEKEYKDALDAFNEKNNEKVQLISKLMEMVGESEKLRMKKLEELSKHVDNTS
        KPLG TCQKKEKEYKDALDAFNEKN+EKVQL+SKLMEMVGESE+LR+++LEELSKHVDNTS
Subjt:  KPLGITCQKKEKEYKDALDAFNEKNNEKVQLISKLMEMVGESEKLRMKKLEELSKHVDNTS

A0A6J1IS07 RAB6-interacting golgin8.1e-6185.81Show/hide
Query:  QQLQLMLASSGNLSFSSKEDEEMSKSALSGFREKEEEIERMRLELQNKLQARLGRVHDESRRLASIRQELEAIAGDPTRKEIVQIRKKIDALNKDLKPLG
        QQLQ+ML +SGNLSFSSKEDEEMSKSALS FREKEEEIERMR ELQ KLQARLGRV +ESRRLASIR+ELE I GDPTRKEI QIRK+ID LNK+LKPLG
Subjt:  QQLQLMLASSGNLSFSSKEDEEMSKSALSGFREKEEEIERMRLELQNKLQARLGRVHDESRRLASIRQELEAIAGDPTRKEIVQIRKKIDALNKDLKPLG

Query:  ITCQKKEKEYKDALDAFNEKNNEKVQLISKLMEMVGESEKLRMKKLEELSKHVDN
          CQKKEKEYKDALDAFNEKNNEKVQ ISKLMEMVGESE++R+K+LEELSKHVDN
Subjt:  ITCQKKEKEYKDALDAFNEKNNEKVQLISKLMEMVGESEKLRMKKLEELSKHVDN

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G36410.1 Family of unknown function (DUF662)3.3e-4661.85Show/hide
Query:  PNPNPNPNPNPEAQQLQLMLASSGNLSFS---SKEDEEMSKSALSGFREKEEEIERMRLELQNKLQARLGRVHDESRRLASIRQELEAIAGDPTRKEIVQ
        P P   P P P+ QQ   M+  +G+LSFS   S+EDEEM++SALS FR KE+EIE+ R+E++ ++QA+LGRV  E++RL++IR+ELE++A DP RKE+  
Subjt:  PNPNPNPNPNPEAQQLQLMLASSGNLSFS---SKEDEEMSKSALSGFREKEEEIERMRLELQNKLQARLGRVHDESRRLASIRQELEAIAGDPTRKEIVQ

Query:  IRKKIDALNKDLKPLGITCQKKEKEYKDALDAFNEKNNEKVQLISKLMEM---VGESEKLRMKKLEELSKHVD
        +RKKID++NK+LKPLG T QKKE+EYK+ALD FNEKN EKVQLI+KLMEM   VGESEKLRM KLEELSK ++
Subjt:  IRKKIDALNKDLKPLGITCQKKEKEYKDALDAFNEKNNEKVQLISKLMEM---VGESEKLRMKKLEELSKHVD

AT2G36410.2 Family of unknown function (DUF662)1.7e-4762.35Show/hide
Query:  PNPNPNPNPNPEAQQLQLMLASSGNLSFS---SKEDEEMSKSALSGFREKEEEIERMRLELQNKLQARLGRVHDESRRLASIRQELEAIAGDPTRKEIVQ
        P P   P P P+ QQ   M+  +G+LSFS   S+EDEEM++SALS FR KE+EIE+ R+E++ ++QA+LGRV  E++RL++IR+ELE++A DP RKE+  
Subjt:  PNPNPNPNPNPEAQQLQLMLASSGNLSFS---SKEDEEMSKSALSGFREKEEEIERMRLELQNKLQARLGRVHDESRRLASIRQELEAIAGDPTRKEIVQ

Query:  IRKKIDALNKDLKPLGITCQKKEKEYKDALDAFNEKNNEKVQLISKLMEMVGESEKLRMKKLEELSKHVD
        +RKKID++NK+LKPLG T QKKE+EYK+ALD FNEKN EKVQLI+KLME+VGESEKLRM KLEELSK ++
Subjt:  IRKKIDALNKDLKPLGITCQKKEKEYKDALDAFNEKNNEKVQLISKLMEMVGESEKLRMKKLEELSKHVD

AT2G36410.3 Family of unknown function (DUF662)2.5e-4661.76Show/hide
Query:  PNPNPNPNPNPEAQQLQLMLASSGNLSFS---SKEDEEMSKSALSGFREKEEEIERMRLELQNKLQARLGRVHDESRRLASIRQELEAIAGDPTRKEIVQ
        P P   P P P+ QQ   M+  +G+LSFS   S+EDEEM++SALS FR KE+EIE+ R+E++ ++QA+LGRV  E++RL++IR+ELE++A DP RKE+  
Subjt:  PNPNPNPNPNPEAQQLQLMLASSGNLSFS---SKEDEEMSKSALSGFREKEEEIERMRLELQNKLQARLGRVHDESRRLASIRQELEAIAGDPTRKEIVQ

Query:  IRKKIDALNKDLKPLGITCQKKEKEYKDALDAFNEKNNEKVQLISKLMEMVGESEKLRMKKLEELSKHVD
        +RKKID++NK+LKPLG T QKK  EYK+ALD FNEKN EKVQLI+KLME+VGESEKLRM KLEELSK ++
Subjt:  IRKKIDALNKDLKPLGITCQKKEKEYKDALDAFNEKNNEKVQLISKLMEMVGESEKLRMKKLEELSKHVD

AT3G09980.1 Family of unknown function (DUF662)1.3e-4763.98Show/hide
Query:  PEAQQLQLMLASSGNLSFS---SKEDEEMSKSALSGFREKEEEIERMRLELQNKLQARLGRVHDESRRLASIRQELEAIAGDPTRKEIVQIRKKIDALNK
        P     QL    SG++SFS   SKEDEEMS++ALS FR KEEEIE+ ++E++ ++QA+LGRV +E++RLA IR+ELE +A DP RKE+  +RKKID++NK
Subjt:  PEAQQLQLMLASSGNLSFS---SKEDEEMSKSALSGFREKEEEIERMRLELQNKLQARLGRVHDESRRLASIRQELEAIAGDPTRKEIVQIRKKIDALNK

Query:  DLKPLGITCQKKEKEYKDALDAFNEKNNEKVQLISKLMEMVGESEKLRMKKLEELSKHVDN
        +LKPLG T QKKE+EYK+AL+AFNEKN EKVQLI++LME+VGESEK+RMKKLEELSK++D+
Subjt:  DLKPLGITCQKKEKEYKDALDAFNEKNNEKVQLISKLMEMVGESEKLRMKKLEELSKHVDN

AT3G52920.2 Family of unknown function (DUF662)2.1e-4566.44Show/hide
Query:  NLSFS---SKEDEEMSKSALSGFREKEEEIERMRLELQNKLQARLGRVHDESRRLASIRQELEAIAGDPTRKEIVQIRKKIDALNKDLKPLGITCQKKEK
        +LSFS   SKEDEEM++SALS FR KE+EIE+ ++E++ +++A+LGRV +E+RRLASIR+ELE +A DP RKE+  +RKKID++NK+LKPLG T QKKE+
Subjt:  NLSFS---SKEDEEMSKSALSGFREKEEEIERMRLELQNKLQARLGRVHDESRRLASIRQELEAIAGDPTRKEIVQIRKKIDALNKDLKPLGITCQKKEK

Query:  EYKDALDAFNEKNNEKVQLISKLMEMVGESEKLRMKKLEELSKHVDNTS
        EYK+ALD FNEKN EKVQLI+KLME+VGESEKLR+KKL+ELS+ +D  S
Subjt:  EYKDALDAFNEKNNEKVQLISKLMEMVGESEKLRMKKLEELSKHVDNTS


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGGAAGGAAAGGGAAGAAGGAGAAGAGTTTGGTAATGAAGGGAAAGAAGGAAGCAAATTGTGTGAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGATGGAGCCAAATCCAAA
TCCAAATCCAAATCCAAATCCAAATCCAGAGGCACAGCAGCTCCAATTGATGCTAGCGAGCTCTGGGAATCTGAGTTTCAGTAGCAAAGAAGATGAAGAAATGTCGAAAT
CGGCGCTTTCGGGATTTAGGGAAAAGGAAGAGGAGATCGAGCGGATGAGACTCGAACTTCAAAACAAGCTCCAAGCCAGACTCGGGCGAGTCCACGATGAATCCCGCCGT
TTGGCTTCCATCCGCCAGGAGCTTGAAGCAATAGCCGGGGATCCAACCAGGAAAGAAATTGTTCAAATTCGCAAGAAAATCGATGCATTAAACAAGGATTTGAAGCCTCT
AGGAATCACATGCCAAAAAAAGGAAAAGGAATACAAAGATGCCCTTGATGCTTTTAATGAAAAGAACAATGAGAAAGTGCAGTTAATATCAAAACTAATGGAGATGGTTG
GTGAAAGTGAAAAGCTCAGGATGAAGAAGTTGGAAGAACTGAGTAAGCATGTGGATAACACTTCCTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGGAAGGAAAGGGAAGAAGGAGAAGAGTTTGGTAATGAAGGGAAAGAAGGAAGCAAATTGTGTGAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGATGGAGCCAAATCCAAA
TCCAAATCCAAATCCAAATCCAAATCCAGAGGCACAGCAGCTCCAATTGATGCTAGCGAGCTCTGGGAATCTGAGTTTCAGTAGCAAAGAAGATGAAGAAATGTCGAAAT
CGGCGCTTTCGGGATTTAGGGAAAAGGAAGAGGAGATCGAGCGGATGAGACTCGAACTTCAAAACAAGCTCCAAGCCAGACTCGGGCGAGTCCACGATGAATCCCGCCGT
TTGGCTTCCATCCGCCAGGAGCTTGAAGCAATAGCCGGGGATCCAACCAGGAAAGAAATTGTTCAAATTCGCAAGAAAATCGATGCATTAAACAAGGATTTGAAGCCTCT
AGGAATCACATGCCAAAAAAAGGAAAAGGAATACAAAGATGCCCTTGATGCTTTTAATGAAAAGAACAATGAGAAAGTGCAGTTAATATCAAAACTAATGGAGATGGTTG
GTGAAAGTGAAAAGCTCAGGATGAAGAAGTTGGAAGAACTGAGTAAGCATGTGGATAACACTTCCTAATTTAATTTTTCTTAATTCACTCTTTTCTTAGTCAGCTTTGTG
TTTTGTGCTCTACTTTTACTCTAGGTATATGTCTGTATGTGTGTTTTCATTTTAACTACTCTTATATTTTATTTCATTGTGGTTTAGTTTACTTCACTAAACATTCATAA
TTTAGGGTAACTATATGTGTATTGCTTTTAACTATACAACATATATATTTTTTTTAACTTTTATACTTGTATAGATGGATATAAATGTAGAACATAACTACCGAATGAGT
CAGTGGCGCAATGGTTTCAGTGTTTAGTTGTAAACCAGTTCAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MGRKGKKEKSLVMKGKKEANCVKREREREREMEPNPNPNPNPNPNPEAQQLQLMLASSGNLSFSSKEDEEMSKSALSGFREKEEEIERMRLELQNKLQARLGRVHDESRR
LASIRQELEAIAGDPTRKEIVQIRKKIDALNKDLKPLGITCQKKEKEYKDALDAFNEKNNEKVQLISKLMEMVGESEKLRMKKLEELSKHVDNTS