; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Sed0016229 (gene) of Chayote v1 genome

Gene IDSed0016229
OrganismSechium edule (Chayote v1)
Descriptionfasciclin-like arabinogalactan protein 7
Genome locationLG04:42927524..42929343
RNA-Seq ExpressionSed0016229
SyntenySed0016229
Gene Ontology termsGO:0009834 - plant-type secondary cell wall biogenesis (biological process)
GO:0005886 - plasma membrane (cellular component)
InterPro domainsIPR000782 - FAS1 domain
IPR036378 - FAS1 domain superfamily
IPR045003 - Fasciclin-like arabinogalactan protein, group A


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0059150.1 fasciclin-like arabinogalactan protein 7 [Cucumis melo var. makuwa]1.3e-12391.37Show/hide
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XP_004144534.1 fasciclin-like arabinogalactan protein 7 [Cucumis sativus]2.0e-12492.16Show/hide
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XP_022930610.1 fasciclin-like arabinogalactan protein 7 [Cucurbita moschata]3.3e-12291.05Show/hide
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XP_038888065.1 fasciclin-like arabinogalactan protein 7 [Benincasa hispida]1.9e-12290.98Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0K597 FAS1 domain-containing protein9.9e-12592.16Show/hide
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A0A1S3C2C3 fasciclin-like arabinogalactan protein 79.9e-12592.16Show/hide
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A0A5D3BU74 Fasciclin-like arabinogalactan protein 76.4e-12491.37Show/hide
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A0A6J1C1K1 fasciclin-like arabinogalactan protein 71.6e-12290.98Show/hide
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A0A6J1EXB2 fasciclin-like arabinogalactan protein 71.6e-12291.05Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q8LEE9 Fasciclin-like arabinogalactan protein 123.8e-3341.88Show/hide
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        +L++LT +Q   LI FH +P Y S S+F+ +S  NP+ T AG    G + LN+T    T++I SG TNT VS +V+S   +AVYQVDK+LLP+ +F    
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        P  PAPAPAP ++ +            DSP+DAS
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Q8LEJ6 Fasciclin-like arabinogalactan protein 111.6e-2336.36Show/hide
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        APAP P    N+T +L  AG F  F+  L+ST+  D    Q N ++  G+T+F P D AF++ K  +L++L+  Q   L+ FH LP   ++  F+ +S  
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        NP+ T AG    G++ LN+T     ++I +G  +  V++SV+S   +AVYQVD++LLP A+FG+ + P PAP     +    A   D   D++D+  A
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Q9SIL7 Fasciclin-like arabinogalactan protein 65.0e-2537.72Show/hide
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        P + S   APAP  +   +NLT +L     F T +  L +T+V      Q N++++G+TIF P D AF+  K  +L++LT  Q   L+L+H +P YYSLS
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        D   L   NP+ T A    GG + LN T    S  +++ +G   T++++++    P+AVY VD +LLPE +FGT   PT APAP      ++ S SDA D
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        + AA        SS K  + GI+V   L
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Q9SJ81 Fasciclin-like arabinogalactan protein 71.3e-7866.53Show/hide
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        IF    AL++ S+S   A+TASP  P+L PTPAPAPAP+ VNLT+LL+VAGPFHTFL YL ST VI+TFQNQANNTEEG+TIFVPKD AF AQK P LSN
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        LT+DQLK L+LFH LPHYYSLS+F+NLS   P+ TFAGGQYSL  TDVSGT+ I S WT TKVSSSV S+DPVAVYQV+++LLPEAIFGTD+PP PAPAP
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        AP ++  +DSPS  +D++ A S    P SSHK  N G   +L  I + ISG
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Q9ZWA8 Fasciclin-like arabinogalactan protein 91.7e-2537.15Show/hide
Query:  TVCSALLLLSSSPADAQTASPPLLSPTPAPAPAPDFVNLTDLLTVAGPFHTFLSYLQSTKVIDTFQNQANNTEEGVTIFVPKDGAFSAQKKPSLSNLTQD
        T+   LL+ +   A   TA P      PAP PA   +NLT +L   G F TF+  L  T+V      Q N++ EG+T+F P D AF   K  +L+ L+ D
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            LIL+H  P YYS+ D   LS+ NP+ T A G+    Y LN T  +  I++ +G+  T++S+S+    P+AVY VD +LLP  +FG       APAP
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                D   D+  TK A S   K  S  K +  G  L  IVL +   FLF
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G03870.1 FASCICLIN-like arabinoogalactan 91.2e-2637.15Show/hide
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        T+   LL+ +   A   TA P      PAP PA   +NLT +L   G F TF+  L  T+V      Q N++ EG+T+F P D AF   K  +L+ L+ D
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AT2G04780.1 FASCICLIN-like arabinoogalactan 79.6e-8066.53Show/hide
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        IF    AL++ S+S   A+TASP  P+L PTPAPAPAP+ VNLT+LL+VAGPFHTFL YL ST VI+TFQNQANNTEEG+TIFVPKD AF AQK P LSN
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Query:  LTQDQLKSLILFHGLPHYYSLSDFRNLSLQNPIPTFAGGQYSLNLTDVSGTIHIGSGWTNTKVSSSVHSSDPVAVYQVDKILLPEAIFGTDIPPTPAPAP
        LT+DQLK L+LFH LPHYYSLS+F+NLS   P+ TFAGGQYSL  TDVSGT+ I S WT TKVSSSV S+DPVAVYQV+++LLPEAIFGTD+PP PAPAP
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Query:  APDIAPAADSPSDASDTKAAPSSEPKPSSSHKIINWG---ILVHIVLAISG
        AP ++  +DSPS  +D++ A S    P SSHK  N G   +L  I + ISG
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AT2G04780.2 FASCICLIN-like arabinoogalactan 79.6e-8066.53Show/hide
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        IF    AL++ S+S   A+TASP  P+L PTPAPAPAP+ VNLT+LL+VAGPFHTFL YL ST VI+TFQNQANNTEEG+TIFVPKD AF AQK P LSN
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Query:  LTQDQLKSLILFHGLPHYYSLSDFRNLSLQNPIPTFAGGQYSLNLTDVSGTIHIGSGWTNTKVSSSVHSSDPVAVYQVDKILLPEAIFGTDIPPTPAPAP
        LT+DQLK L+LFH LPHYYSLS+F+NLS   P+ TFAGGQYSL  TDVSGT+ I S WT TKVSSSV S+DPVAVYQV+++LLPEAIFGTD+PP PAPAP
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        AP ++  +DSPS  +D++ A S    P SSHK  N G   +L  I + ISG
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AT2G20520.1 FASCICLIN-like arabinogalactan 63.6e-2637.72Show/hide
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        P + S   APAP  +   +NLT +L     F T +  L +T+V      Q N++++G+TIF P D AF+  K  +L++LT  Q   L+L+H +P YYSLS
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Query:  DFRNLSLQNPIPTFA----GGQYSLNLTD--VSGTIHIGSGWTNTKVSSSVHSSDPVAVYQVDKILLPEAIFGTDIPPTPAPAPAPDIAPAADSPSDASD
        D   L   NP+ T A    GG + LN T    S  +++ +G   T++++++    P+AVY VD +LLPE +FGT   PT APAP      ++ S SDA D
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Query:  TKAAPSSEPKPSSSHKIINWGILVHIVL
        + AA        SS K  + GI+V   L
Subjt:  TKAAPSSEPKPSSSHKIINWGILVHIVL

AT5G60490.1 FASCICLIN-like arabinogalactan-protein 122.7e-3441.88Show/hide
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        ME S+I  + + LLLL+++P         L  P+PA APAP    N+T +L  AG F  F+  L+ST V +    Q NN++ G+TIF P D +F+  K  
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Query:  SLSNLTQDQLKSLILFHGLPHYYSLSDFRNLSLQNPIPTFAG----GQYSLNLTDVSGTIHIGSGWTNTKVSSSVHSSDPVAVYQVDKILLPEAIFGTDI
        +L++LT +Q   LI FH +P Y S S+F+ +S  NP+ T AG    G + LN+T    T++I SG TNT VS +V+S   +AVYQVDK+LLP+ +F    
Subjt:  SLSNLTQDQLKSLILFHGLPHYYSLSDFRNLSLQNPIPTFAG----GQYSLNLTDVSGTIHIGSGWTNTKVSSSVHSSDPVAVYQVDKILLPEAIFGTDI

Query:  PPTPAPAPAPDIAPAA-----------DSPSDAS
        P  PAPAPAP ++ +            DSP+DAS
Subjt:  PPTPAPAPAPDIAPAA-----------DSPSDAS


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAATTTTCCATGATTTTCACTGTTTGTAGTGCATTGTTGCTTCTTAGCTCTTCACCTGCAGATGCCCAAACAGCCAGCCCCCCTTTACTTAGCCCGACCCCAGCACC
GGCGCCTGCCCCGGATTTCGTCAACCTTACAGATCTGCTAACTGTAGCTGGTCCATTTCACACCTTTCTCAGCTACCTGCAGTCCACCAAAGTTATTGACACCTTCCAAA
ACCAAGCCAATAACACAGAAGAAGGAGTGACCATCTTTGTCCCGAAAGACGGGGCTTTCTCGGCGCAAAAGAAACCGTCTCTCTCGAATCTCACCCAGGATCAGCTCAAG
TCGCTTATCCTATTCCATGGCTTGCCACATTACTATTCCCTTTCTGATTTCAGGAACCTCAGCCTGCAGAATCCGATCCCAACTTTTGCTGGTGGGCAATATAGTTTGAA
CCTCACAGACGTTTCAGGGACCATCCACATTGGATCAGGTTGGACTAACACAAAAGTGAGTAGCAGTGTTCATTCAAGTGATCCTGTTGCAGTTTACCAAGTTGACAAAA
TTTTGCTGCCTGAGGCGATCTTCGGAACCGATATCCCACCGACCCCAGCCCCGGCACCAGCTCCCGATATCGCTCCTGCTGCAGATTCTCCTTCGGATGCTAGTGATACA
AAGGCTGCTCCATCTTCAGAACCAAAGCCATCATCTTCCCATAAGATCATCAACTGGGGGATTTTGGTTCACATTGTTTTGGCAATTTCAGGTGGATTTTTGTTTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GAGAGTCTTCTCTTCCTTTGCTGGTCAGTATTCCTCTTATTGCCTCTTCCTTTTTGCATTGCTAATTTGATGCCTCTTTTAGCTTTGGTTTTGGCTTCTATCATTTCTCT
TGAGCTGTTCTAGATCTGGGTTTTTTCTTGGGGGTGCTGTTTGTTTAGCTGGGCTTTGTGGGATGTAGCTAAGAGGAATGTGTGTGGTGGGTGTAGCCCTGATGGGACAT
TTTGAATTGTTTGCTTGTGTTTGAAGTTGTGGGAAATGGAATTTTCCATGATTTTCACTGTTTGTAGTGCATTGTTGCTTCTTAGCTCTTCACCTGCAGATGCCCAAACA
GCCAGCCCCCCTTTACTTAGCCCGACCCCAGCACCGGCGCCTGCCCCGGATTTCGTCAACCTTACAGATCTGCTAACTGTAGCTGGTCCATTTCACACCTTTCTCAGCTA
CCTGCAGTCCACCAAAGTTATTGACACCTTCCAAAACCAAGCCAATAACACAGAAGAAGGAGTGACCATCTTTGTCCCGAAAGACGGGGCTTTCTCGGCGCAAAAGAAAC
CGTCTCTCTCGAATCTCACCCAGGATCAGCTCAAGTCGCTTATCCTATTCCATGGCTTGCCACATTACTATTCCCTTTCTGATTTCAGGAACCTCAGCCTGCAGAATCCG
ATCCCAACTTTTGCTGGTGGGCAATATAGTTTGAACCTCACAGACGTTTCAGGGACCATCCACATTGGATCAGGTTGGACTAACACAAAAGTGAGTAGCAGTGTTCATTC
AAGTGATCCTGTTGCAGTTTACCAAGTTGACAAAATTTTGCTGCCTGAGGCGATCTTCGGAACCGATATCCCACCGACCCCAGCCCCGGCACCAGCTCCCGATATCGCTC
CTGCTGCAGATTCTCCTTCGGATGCTAGTGATACAAAGGCTGCTCCATCTTCAGAACCAAAGCCATCATCTTCCCATAAGATCATCAACTGGGGGATTTTGGTTCACATT
GTTTTGGCAATTTCAGGTGGATTTTTGTTTTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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KAAPSSEPKPSSSHKIINWGILVHIVLAISGGFLF