; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Sed0016369 (gene) of Chayote v1 genome

Gene IDSed0016369
OrganismSechium edule (Chayote v1)
DescriptionLate embryogenesis abundant protein, group 2
Genome locationLG05:26240527..26246187
RNA-Seq ExpressionSed0016369
SyntenySed0016369
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004149613.1 uncharacterized protein LOC101209149 [Cucumis sativus]3.7e-15080.3Show/hide
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XP_008461795.2 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103500312 [Cucumis melo]2.5e-15180.36Show/hide
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XP_022152674.1 uncharacterized protein LOC111020336 [Momordica charantia]5.9e-14880.9Show/hide
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XP_022934269.1 uncharacterized protein LOC111441481 [Cucurbita moschata]1.4e-14677.98Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LD21 Uncharacterized protein1.8e-15080.3Show/hide
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        I PHFH  V+CLL+L K Y +  HTRSFNSTC TS
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A0A1S3CFE9 uncharacterized protein LOC1035003121.2e-15180.36Show/hide
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A0A6J1DGR2 uncharacterized protein LOC1110203362.8e-14880.9Show/hide
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A0A6J1F239 uncharacterized protein LOC1114414817.0e-14777.98Show/hide
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A0A6J1J6W9 uncharacterized protein LOC1114819092.1e-14377.08Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G45688.1 unknown protein4.1e-0623.42Show/hide
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        YYVQSPS  SH +         S+   SP+ S    +      + E+S    S   S +  +     ++G  R   G ++        +E+G   DGD D
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Query:  EEGYYGKRRRGCWKTYFTYRNKDSNAWICLQLSWRAIFSLGIALLVFYIVTKPPSPIISVKVGEVEEFMLGEGVDKTGVGSKILTCNCTMDVIVDNHSKL
             G   R C+   F              + +  +F  G   L+ Y   KP  P I+VK    E   +  G D  GVG+ ++T N T+ ++  N    
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Query:  FGLHILPPSLHMSFGPLPIATSQGSRLYVESGTTTFQLSVGINNK-PMYGAGRDM----------EDLLESGTGLEL----------IIQLNFISNYR--
        FG+H+    + +SF  + I +    + Y    +    L   I  K P+YG+G  +          +   + G  + +           + L+F+   R  
Subjt:  FGLHILPPSLHMSFGPLPIATSQGSRLYVESGTTTFQLSVGINNK-PMYGAGRDM----------EDLLESGTGLEL----------IIQLNFISNYR--

Query:  VVWKIIRPHFHHRVEC
        V+ K+++P F+ ++EC
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AT2G41990.1 CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Late embryogenesis abundant protein, group 2 (InterPro:IPR004864)2.0e-0523.05Show/hide
Query:  YYVQSPSTLSHANSSDNRNPAESSTCHSPLRSDAFPNGHHRNPTPEASCFALSHYSSSRGSNHGTGTDNGEARLIIGRDRDRDGKQDEDEDGDGDEDEEG
        YYVQSPS      + D    +  S C S + S   P+ +H        C  + H   SR S+    +D         R+R R     +D+   GD+D+  
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Query:  YYGKRRRGCWKTYFTYRNKDSNAWICLQLSWRAIFSLGIALLVFYIVTKPPSPIISVKVGEVEEFMLGEGVDKTGVGSKILTCNCTMDVIVDNHSKLFGL
                       +RN     W+ L +    IF   +  L+ +  +K   P ++VK   V +  L  G D +GV + +L+ N T+ +   N S  F +
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Query:  HILPPSLHMSFGPLPIATSQGSRLYV-ESGTTTFQLSVGINNKPMYGAGRDMEDLLESGTGLELIIQLNFISNYRVVWKIIRPHFHHRVECLLVL
        H+    L + +  L +++ + ++  V  +G T     V  +  P+YG      D L     L +++     S   ++ +++   F+ R+ C   L
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AT3G08490.1 BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Late embryogenesis abundant protein, group 2 (TAIR:AT3G24600.1)1.3e-5251.81Show/hide
Query:  DSNAWICLQLSWRAIFSLGIALLVFYIVTKPPSPIISVKVGEVEEFMLGEGVDKTGVGSKILTCNCTMDVIVDNHSKLFGLHILPPSLHMSFGPLPIATS
        +S+ WI LQ+ WR +FSLG+ALLVFYI T+PP P IS ++G   +FML EGVD  GV +K LT NC+  +I+DN S +FGLHI PPS+   FGPL  A +
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Query:  QGSRLY-VESGTTTFQLSVGINNKPMYGAGRDMEDLLESGTGLELIIQLNFISNYRVVWKIIRPHFHHRVECLLVLGKAYRKKGHTRSFNSTC
        QG +LY +   +TTFQL +   N+ MYGAG +M D+L S  GL LI++ + IS+YRVVW II P +HH+VECLL+L    R   H       C
Subjt:  QGSRLY-VESGTTTFQLSVGINNKPMYGAGRDMEDLLESGTGLELIIQLNFISNYRVVWKIIRPHFHHRVECLLVLGKAYRKKGHTRSFNSTC

AT3G24600.1 Late embryogenesis abundant protein, group 23.5e-1326.25Show/hide
Query:  VFYIVTKPPSPIISVKVGEVEEFMLGEGVDKTGVGSKILTCNCTMDVIVDNHSKLFGLHILPPSLHMSFGPLPIATSQGSRLYVESGTTTFQL-SVGINN
        V +  + P SPI+SVK  ++  F  GEG+D+TGV +KIL+ N ++ V +D+ +  FG+H+   +  ++F  L +AT Q    Y    +    +  +    
Subjt:  VFYIVTKPPSPIISVKVGEVEEFMLGEGVDKTGVGSKILTCNCTMDVIVDNHSKLFGLHILPPSLHMSFGPLPIATSQGSRLYVESGTTTFQL-SVGINN

Query:  KPMYGAGRDMEDLLESGTGLELIIQLNFISNYRVVWKIIRPHFHHRVECLLVLGKAYRKK
         P+YGAG  +    + G  + + ++    S   ++ K+++    + V C   +  +   K
Subjt:  KPMYGAGRDMEDLLESGTGLELIIQLNFISNYRVVWKIIRPHFHHRVECLLVLGKAYRKK

AT5G42860.1 unknown protein9.7e-0824.92Show/hide
Query:  AYYVQSPSTLSHANSSDNRNPAESSTCHSPLRSDAFPNGHHRNPTPEASCFALSHYSSSRGSNHGTGTDNGEARLIIGRDRDRDGKQDEDEDGDGDEDEE
        AY+VQSPS  SH       +   +    SP+ S                    SH SSSR S       NG  R     ++     ++E    DGD ++E
Subjt:  AYYVQSPSTLSHANSSDNRNPAESSTCHSPLRSDAFPNGHHRNPTPEASCFALSHYSSSRGSNHGTGTDNGEARLIIGRDRDRDGKQDEDEDGDGDEDEE

Query:  GYYGKRRRGCWKTYFTYRNKDSNAWICLQLSWRAIFSLGIAL--LVFYIVTKPPSPIISVKVGEVEEFMLGEGVDKTGVGSKILTCNCTMDVIVDNHSKL
             RR                   C  L++   FSL  A   L+ Y   KP  P ISVK    E+  +  G D  G+G+ ++T N T+ ++  N    
Subjt:  GYYGKRRRGCWKTYFTYRNKDSNAWICLQLSWRAIFSLGIAL--LVFYIVTKPPSPIISVKVGEVEEFMLGEGVDKTGVGSKILTCNCTMDVIVDNHSKL

Query:  FGLHILPPSLHMSFGPLPIATSQGSRLY-VESGTTTFQLSVGINNKPMYGAGRDME--------DLLESGTGLELIIQ-----------LNFISNYR--V
        FG+H+    + +SF  + I +    + Y       T  ++V  +  P+YG+G  +            +   G  +I++           LNF    R  V
Subjt:  FGLHILPPSLHMSFGPLPIATSQGSRLY-VESGTTTFQLSVGINNKPMYGAGRDME--------DLLESGTGLELIIQ-----------LNFISNYR--V

Query:  VWKIIRPHFHHRVECLL
        + K+++P F+ R+ CL+
Subjt:  VWKIIRPHFHHRVECLL


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAGGCCGCCGACGAGCAAGAAGCCGTTATCTTCCACTCCTATCCATGCGCTTATTACGTCCAAAGCCCCTCCACCCTCTCCCACGCCAACAGTTCCGATAACCGAAA
CCCCGCCGAGTCATCGACCTGCCACTCGCCTCTCCGCTCCGACGCCTTCCCCAATGGCCACCACCGCAACCCTACCCCGGAAGCCTCTTGCTTTGCTCTCTCTCATTACT
CCTCCTCCCGTGGCTCGAACCACGGGACTGGGACCGACAATGGCGAGGCTCGCTTGATCATCGGTCGTGACCGTGATCGAGATGGGAAGCAGGATGAGGATGAGGATGGG
GACGGGGATGAGGACGAGGAAGGGTATTATGGGAAGAGGAGAAGAGGTTGTTGGAAGACGTATTTTACGTATAGGAATAAGGATTCTAATGCATGGATTTGCTTGCAGTT
GAGTTGGAGGGCAATTTTCAGTTTGGGAATTGCTTTGCTTGTGTTTTACATTGTCACTAAGCCTCCTTCACCCATCATTTCTGTTAAGGTGGGAGAAGTGGAAGAATTTA
TGCTAGGAGAAGGAGTGGACAAAACAGGAGTTGGAAGTAAGATCCTTACATGCAATTGCACAATGGATGTAATTGTGGATAATCACTCTAAGCTCTTTGGCCTTCACATT
CTTCCTCCATCTCTTCATATGTCTTTTGGGCCTCTCCCCATTGCTACTTCACAAGGTTCGAGATTGTATGTTGAGAGTGGAACGACAACGTTTCAATTAAGCGTGGGCAT
CAACAATAAGCCAATGTACGGTGCAGGAAGGGACATGGAAGATCTTCTTGAATCAGGAACAGGATTGGAGCTTATAATTCAACTCAATTTCATTTCCAACTATAGGGTAG
TTTGGAAAATCATAAGGCCCCACTTTCATCATCGTGTCGAATGCTTATTGGTCCTCGGAAAAGCCTACCGTAAGAAGGGTCACACCCGATCCTTCAATAGTACTTGTCTA
ACTTCTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
TTTTTATCCATCACTCTATTTTGAAAAGTTTAAGAGCCCTCCTATTATATGCTCTTCATTCCATTGTCAGAAAACTCATCTCTCCGCCGCTAATGGAGGCCGCCGACGAG
CAAGAAGCCGTTATCTTCCACTCCTATCCATGCGCTTATTACGTCCAAAGCCCCTCCACCCTCTCCCACGCCAACAGTTCCGATAACCGAAACCCCGCCGAGTCATCGAC
CTGCCACTCGCCTCTCCGCTCCGACGCCTTCCCCAATGGCCACCACCGCAACCCTACCCCGGAAGCCTCTTGCTTTGCTCTCTCTCATTACTCCTCCTCCCGTGGCTCGA
ACCACGGGACTGGGACCGACAATGGCGAGGCTCGCTTGATCATCGGTCGTGACCGTGATCGAGATGGGAAGCAGGATGAGGATGAGGATGGGGACGGGGATGAGGACGAG
GAAGGGTATTATGGGAAGAGGAGAAGAGGTTGTTGGAAGACGTATTTTACGTATAGGAATAAGGATTCTAATGCATGGATTTGCTTGCAGTTGAGTTGGAGGGCAATTTT
CAGTTTGGGAATTGCTTTGCTTGTGTTTTACATTGTCACTAAGCCTCCTTCACCCATCATTTCTGTTAAGGTGGGAGAAGTGGAAGAATTTATGCTAGGAGAAGGAGTGG
ACAAAACAGGAGTTGGAAGTAAGATCCTTACATGCAATTGCACAATGGATGTAATTGTGGATAATCACTCTAAGCTCTTTGGCCTTCACATTCTTCCTCCATCTCTTCAT
ATGTCTTTTGGGCCTCTCCCCATTGCTACTTCACAAGGTTCGAGATTGTATGTTGAGAGTGGAACGACAACGTTTCAATTAAGCGTGGGCATCAACAATAAGCCAATGTA
CGGTGCAGGAAGGGACATGGAAGATCTTCTTGAATCAGGAACAGGATTGGAGCTTATAATTCAACTCAATTTCATTTCCAACTATAGGGTAGTTTGGAAAATCATAAGGC
CCCACTTTCATCATCGTGTCGAATGCTTATTGGTCCTCGGAAAAGCCTACCGTAAGAAGGGTCACACCCGATCCTTCAATAGTACTTGTCTAACTTCTTGATGATCAAAT
TACAAATTTGATTATCAAACTAATGTTTTCC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MEAADEQEAVIFHSYPCAYYVQSPSTLSHANSSDNRNPAESSTCHSPLRSDAFPNGHHRNPTPEASCFALSHYSSSRGSNHGTGTDNGEARLIIGRDRDRDGKQDEDEDG
DGDEDEEGYYGKRRRGCWKTYFTYRNKDSNAWICLQLSWRAIFSLGIALLVFYIVTKPPSPIISVKVGEVEEFMLGEGVDKTGVGSKILTCNCTMDVIVDNHSKLFGLHI
LPPSLHMSFGPLPIATSQGSRLYVESGTTTFQLSVGINNKPMYGAGRDMEDLLESGTGLELIIQLNFISNYRVVWKIIRPHFHHRVECLLVLGKAYRKKGHTRSFNSTCL
TS