; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Sed0016405 (gene) of Chayote v1 genome

Gene IDSed0016405
OrganismSechium edule (Chayote v1)
DescriptionUnknown protein
Genome locationLG09:1756126..1758551
RNA-Seq ExpressionSed0016405
SyntenySed0016405
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
OMO95367.1 hypothetical protein COLO4_15946 [Corchorus olitorius]4.0e-1153.75Show/hide
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        DS  LE   DRD    S +L    +GG+S+K EK+RR VQWNDNNG +L E+  FEPS V   SDS++ED SDAC+C++M
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OMO97763.1 hypothetical protein CCACVL1_04459 [Corchorus capsularis]4.5e-1051.25Show/hide
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        D   LE   DRD    S +L    +GG+S+K EK+RR VQWNDNNG +L E+  FEPS V   SDS++ED SDAC+C+++
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XP_004247761.1 uncharacterized protein LOC101261364 [Solanum lycopersicum]4.5e-1056.52Show/hide
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        ++ D S AL  S +GG+SKK+ K +R VQWND NG +LTEV  FEP   S ASDS DED SD+C+C +M
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XP_021291475.1 uncharacterized protein LOC110422037 [Herrania umbratica]5.8e-1049.43Show/hide
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        N+   ++G  K ED  DG     S +L    +GG+S+K EK+RR VQWND NG +L EV  FEPS V   SDS+DED SD+C+C++M
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XP_022138680.1 uncharacterized protein LOC111009782 [Momordica charantia]4.0e-1965.56Show/hide
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        MAVNRHF S+G EK ED         S+AL    RGGISKKL+K RR VQWNDNNGR+LTEV VFE    SY SDSED D+SDACMC VM
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1R3JKS0 Uncharacterized protein2.0e-1153.75Show/hide
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        DS  LE   DRD    S +L    +GG+S+K EK+RR VQWNDNNG +L E+  FEPS V   SDS++ED SDAC+C++M
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A0A1R3JSC6 Uncharacterized protein2.2e-1051.25Show/hide
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        D   LE   DRD    S +L    +GG+S+K EK+RR VQWNDNNG +L E+  FEPS V   SDS++ED SDAC+C+++
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A0A3Q7I8S6 Uncharacterized protein2.2e-1056.52Show/hide
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        ++ D S AL  S +GG+SKK+ K +R VQWND NG +LTEV  FEP   S ASDS DED SD+C+C +M
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A0A5D2F1L5 Uncharacterized protein2.8e-1057.14Show/hide
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        ED + S +L    +GGIS K EK+ R VQWND NG EL EV VFEPS V   SDS+DED  SD+C+C +M
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A0A6J1CA45 uncharacterized protein LOC1110097822.0e-1965.56Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G55475.1 unknown protein6.7e-0435.82Show/hide
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        ++ L SSLR   S   E   + ++ VQW D  G+EL E+  FEPS      D  D D+   C+C+++
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AT2G33390.1 unknown protein3.6e-1046.38Show/hide
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        E+   S  L    +GG+S+  +K +R VQWND  G  L EV V+EPS V   SD+ED+D SD+C+C +M
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCAAAGACATTAATGGCTGTGAATAGGCATTTTGATTCTTTAGGTCTTGAGAAATTTGAGGATCGAGATGGATCGATTGCATTATTTTCGTCTCTTCGAGGTGGGAT
TTCGAAGAAACTCGAAAAATCGAGGCGAAACGTGCAGTGGAATGATAACAATGGACGTGAGTTAACAGAGGTATTTGTGTTTGAACCAAGTTATGTAAGCTATGCAAGCG
ACTCGGAAGACGAAGATCAATCGGATGCGTGTATGTGTCTTGTAATGTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CCAAGAGTCTCAGTGAAGCTCAATTTAATCGTCGCCGTCGCCGGTAACTATACCGACGAATATTCCGGCGACTGAACTTCCCGATAAGATTTCAGCCAACGCAGAGTTGA
TAACCTAAAAACTCAACGGGCATCGTTTTTCATTCGATTGAAACGGTTATTCTCTGAATTCGAAACCGCTTTATCCATTATTTGTTTTACGTTATTTCTTCTTCGATTTC
TGAAATTGATGGGTACTTTGTTTGTTTCGTAGTTCATTCTTCTGCTATATTATTCTCTGTCACTTTCTTGGAAAATCCCAGTTGTTGATTTTTTCGTTTCAATTCATTTT
TTAACATTGAACCCTAAATTGGAATTTTAGGGATTTTAGAGTTCATGTTTGGTTAAATATTGGATTTATGGCATTCTGGTTACTTTGATTTTCTTGTTTGTTTTCTGTGG
ATGATGATTTGAAGCTTTGCTTGAAGTAATTTGTGGATTGGAAAATATGGCAAAGACATTAATGGCTGTGAATAGGCATTTTGATTCTTTAGGTCTTGAGAAATTTGAGG
ATCGAGATGGATCGATTGCATTATTTTCGTCTCTTCGAGGTGGGATTTCGAAGAAACTCGAAAAATCGAGGCGAAACGTGCAGTGGAATGATAACAATGGACGTGAGTTA
ACAGAGGTATTTGTGTTTGAACCAAGTTATGTAAGCTATGCAAGCGACTCGGAAGACGAAGATCAATCGGATGCGTGTATGTGTCTTGTAATGTAAATTATGCATCCGAA
GTGGCCAAAGTGAGCTTGGATCAACCGTACTCGACTAACAAGTTAGAGATTCGAATCTCCCAAATGTTTCTGATTTCATCTTTATATCTGCTGTGTCACTTTCGTTTCTA
AATCAGAACTTTTTTACATAAGGTATAATGGGAGGATCATTAAGAAGTTTCCCAACAACAATGTCGAGAAATTTGAACTTAATTAAAAAGGGTAGCAATATTTTTTACAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAKTLMAVNRHFDSLGLEKFEDRDGSIALFSSLRGGISKKLEKSRRNVQWNDNNGRELTEVFVFEPSYVSYASDSEDEDQSDACMCLVM