; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Sed0016491 (gene) of Chayote v1 genome

Gene IDSed0016491
OrganismSechium edule (Chayote v1)
Description50S ribosomal protein L21
Genome locationLG07:43052627..43056717
RNA-Seq ExpressionSed0016491
SyntenySed0016491
Gene Ontology termsGO:0006412 - translation (biological process)
GO:0005737 - cytoplasm (cellular component)
GO:0005840 - ribosome (cellular component)
GO:0003723 - RNA binding (molecular function)
GO:0003735 - structural constituent of ribosome (molecular function)
InterPro domainsIPR001787 - Ribosomal protein L21
IPR018258 - Ribosomal protein L21, conserved site
IPR028909 - Ribosomal protein L21-like
IPR036164 - L21-like superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6607629.1 50S ribosomal protein L21, chloroplastic, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]4.2e-9185.19Show/hide
Query:  MASLTLSLCSNFATHCRVSTKQNLPSST----SNSNHELFNFAISTSSSSLKLSSSPIPSSRSAFPFVLKSSESEAAVIESEPAASQTLEIPSEEAAKRE
        MASLTL+LCS+FA+HCR+STK N PSST    SNS+++ FNFA+STSSSS KLSSS + SS SA PF+LKSSESEAAVIESEPAASQT+E+PSEEA KRE
Subjt:  MASLTLSLCSNFATHCRVSTKQNLPSST----SNSNHELFNFAISTSSSSLKLSSSPIPSSRSAFPFVLKSSESEAAVIESEPAASQTLEIPSEEAAKRE

Query:  EIFAVVMIGSRQYIVFPGRYIHTQRLKGANVNDKITLNKVLLVGTKTQTYIGKPVVTNAAVHAVVEEQGLDDKVIVFKYKKKKNYRRNIGHRQPNSRIRI
        EIFAVVMIGSRQYIVFPGRYIHTQRLKGANVNDKITLNKVLLVGTKT+ YIGKP+VTNAAVHAVVEEQGLD KVIVFKYKKKKNYRRNIGHRQPN+RIRI
Subjt:  EIFAVVMIGSRQYIVFPGRYIHTQRLKGANVNDKITLNKVLLVGTKTQTYIGKPVVTNAAVHAVVEEQGLDDKVIVFKYKKKKNYRRNIGHRQPNSRIRI

Query:  TEITGYQDYPAATLES
        TEI+GYQDYPA+TLES
Subjt:  TEITGYQDYPAATLES

XP_022926213.1 50S ribosomal protein L21, chloroplastic-like [Cucurbita moschata]1.4e-9186.11Show/hide
Query:  MASLTLSLCSNFATHCRVSTKQNLPSST----SNSNHELFNFAISTSSSSLKLSSSPIPSSRSAFPFVLKSSESEAAVIESEPAASQTLEIPSEEAAKRE
        MASLTLSLCS+FA+HCR+STKQN PSST    SNS ++ FNFA+STSSSS KLSSS + SS SA PF+LKSSESEAAVIESEPAASQT+E+PSEEA KRE
Subjt:  MASLTLSLCSNFATHCRVSTKQNLPSST----SNSNHELFNFAISTSSSSLKLSSSPIPSSRSAFPFVLKSSESEAAVIESEPAASQTLEIPSEEAAKRE

Query:  EIFAVVMIGSRQYIVFPGRYIHTQRLKGANVNDKITLNKVLLVGTKTQTYIGKPVVTNAAVHAVVEEQGLDDKVIVFKYKKKKNYRRNIGHRQPNSRIRI
        EIFAVVMIGSRQYIVFPGRYIHTQRLKGANVNDKITLNKVLLVGTKT+ YIGKP+VTNAAVHAVVEEQGLD KVIVFKYKKKKNYRRNIGHRQPN+RIRI
Subjt:  EIFAVVMIGSRQYIVFPGRYIHTQRLKGANVNDKITLNKVLLVGTKTQTYIGKPVVTNAAVHAVVEEQGLDDKVIVFKYKKKKNYRRNIGHRQPNSRIRI

Query:  TEITGYQDYPAATLES
        TEI+GYQDYPA+TLES
Subjt:  TEITGYQDYPAATLES

XP_022981606.1 50S ribosomal protein L21, chloroplastic-like [Cucurbita maxima]4.2e-9186.11Show/hide
Query:  MASLTLSLCSNFATHCRVSTKQNLPSST----SNSNHELFNFAISTSSSSLKLSSSPIPSSRSAFPFVLKSSESEAAVIESEPAASQTLEIPSEEAAKRE
        MASLTLSLCS+FA+HCRVSTKQN PSST    SNS+++ FNFA+STSSSS KLSSS + SS SA PF+LKSSESEAAVIESE AASQT+E+PSEEA KRE
Subjt:  MASLTLSLCSNFATHCRVSTKQNLPSST----SNSNHELFNFAISTSSSSLKLSSSPIPSSRSAFPFVLKSSESEAAVIESEPAASQTLEIPSEEAAKRE

Query:  EIFAVVMIGSRQYIVFPGRYIHTQRLKGANVNDKITLNKVLLVGTKTQTYIGKPVVTNAAVHAVVEEQGLDDKVIVFKYKKKKNYRRNIGHRQPNSRIRI
        EIFAVVMIGSRQYIVFPGRYIHTQRLKGANVNDKITLNKVLLVGTKT+ YIGKP+VTNAAVHAVVEEQGLD KVIVFKYKKKKNYRRNIGHRQPN+RIRI
Subjt:  EIFAVVMIGSRQYIVFPGRYIHTQRLKGANVNDKITLNKVLLVGTKTQTYIGKPVVTNAAVHAVVEEQGLDDKVIVFKYKKKKNYRRNIGHRQPNSRIRI

Query:  TEITGYQDYPAATLES
        TEI+GYQDYPA+TLES
Subjt:  TEITGYQDYPAATLES

XP_023521316.1 50S ribosomal protein L21, chloroplastic-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]9.4e-9185.19Show/hide
Query:  MASLTLSLCSNFATHCRVSTKQNLPSST----SNSNHELFNFAISTSSSSLKLSSSPIPSSRSAFPFVLKSSESEAAVIESEPAASQTLEIPSEEAAKRE
        MASLTLSLCS+FA+HCR+S KQN PSST    SNS+++ FNFA+STSSSSLKLSSS + SS  A PF+LKSSESEAAVIESEPAASQT+E+PSEEA KRE
Subjt:  MASLTLSLCSNFATHCRVSTKQNLPSST----SNSNHELFNFAISTSSSSLKLSSSPIPSSRSAFPFVLKSSESEAAVIESEPAASQTLEIPSEEAAKRE

Query:  EIFAVVMIGSRQYIVFPGRYIHTQRLKGANVNDKITLNKVLLVGTKTQTYIGKPVVTNAAVHAVVEEQGLDDKVIVFKYKKKKNYRRNIGHRQPNSRIRI
        EIFAVVMIGSRQYIVFPGRYIHTQRLKGANVNDKITLNKVLLVGTKT+ YIGKP+VTNAAVHAVVEEQGLD KVIVFKYKKKKNYRRNIGHRQPN+RIRI
Subjt:  EIFAVVMIGSRQYIVFPGRYIHTQRLKGANVNDKITLNKVLLVGTKTQTYIGKPVVTNAAVHAVVEEQGLDDKVIVFKYKKKKNYRRNIGHRQPNSRIRI

Query:  TEITGYQDYPAATLES
        TEI+GYQ YPA+TLES
Subjt:  TEITGYQDYPAATLES

XP_038899803.1 50S ribosomal protein L21, chloroplastic [Benincasa hispida]6.1e-9086.11Show/hide
Query:  MASLTLSLCSNFATHCRVSTKQNLPSST----SNSNHELFNFAISTSSSSLKLSSSPIPSSRSAFPFVLKSSESEAAVIESEPAASQTLEIPSEEAAKRE
        MASLTLSLC+NF+THCR+STK NLPSST    SNS+H  FNF +S+S S    SS  IPSSR AF F+LKSSESEAAVI+SEPAASQTLEIPSE+A KRE
Subjt:  MASLTLSLCSNFATHCRVSTKQNLPSST----SNSNHELFNFAISTSSSSLKLSSSPIPSSRSAFPFVLKSSESEAAVIESEPAASQTLEIPSEEAAKRE

Query:  EIFAVVMIGSRQYIVFPGRYIHTQRLKGANVNDKITLNKVLLVGTKTQTYIGKPVVTNAAVHAVVEEQGLDDKVIVFKYKKKKNYRRNIGHRQPNSRIRI
        EIFAVVMIGSRQYIVFPGRYIHTQRLKGANVNDKITLNKVLLVGTKTQTYIGKPVVTNAAVHAVVEEQGLDDKVIVFKYKKKKNYRRNIGHRQPN+RIRI
Subjt:  EIFAVVMIGSRQYIVFPGRYIHTQRLKGANVNDKITLNKVLLVGTKTQTYIGKPVVTNAAVHAVVEEQGLDDKVIVFKYKKKKNYRRNIGHRQPNSRIRI

Query:  TEITGYQDYPAATLES
        TEI+GYQDYPA TLES
Subjt:  TEITGYQDYPAATLES

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A5A7U3C6 50S ribosomal protein L211.1e-8180.56Show/hide
Query:  MASLTLSLCSNFATHCRVSTKQNLPSST----SNSNHELFNFAISTSSSSLKLSSSPIPSSRSAFPFVLKSSESEAAVIESEPAASQTLEIPSEEAAKRE
        MASLTLSLC+NF+  CR+ST  +LP ST    S+SNH   +F +STSSSSLKLS     SSRSAF F+L SS+SE AVI+S+P ASQ LEIPS++   RE
Subjt:  MASLTLSLCSNFATHCRVSTKQNLPSST----SNSNHELFNFAISTSSSSLKLSSSPIPSSRSAFPFVLKSSESEAAVIESEPAASQTLEIPSEEAAKRE

Query:  EIFAVVMIGSRQYIVFPGRYIHTQRLKGANVNDKITLNKVLLVGTKTQTYIGKPVVTNAAVHAVVEEQGLDDKVIVFKYKKKKNYRRNIGHRQPNSRIRI
        EIFAVVMIGSRQYIVFPGRYIHTQRLKGANVNDKITLNKVLLVGTKTQTYIGKPVVTNAAVHAVVEEQGLDDKVIVFKYKKKKNYRRNIGHRQPN+RIRI
Subjt:  EIFAVVMIGSRQYIVFPGRYIHTQRLKGANVNDKITLNKVLLVGTKTQTYIGKPVVTNAAVHAVVEEQGLDDKVIVFKYKKKKNYRRNIGHRQPNSRIRI

Query:  TEITGYQDYPAATLES
        TEI+GYQDYPA TLES
Subjt:  TEITGYQDYPAATLES

A0A6J1CPA7 50S ribosomal protein L21, chloroplastic8.0e-8883.33Show/hide
Query:  MASLTLSLCSNFATHCRVSTKQNLPSST----SNSNHELFNFAISTSSSSLKLSSSPIPSSRSAFPFVLKSSESEAAVIESEPAASQTLEIPSEEAAKRE
        MASLTLSLC+ FATHCR+S+KQNLPSST    SNS+H+ FN A+S SSSS        PSSR+  PFVL+SSESEAAVIESEPAASQ +E+P E+A KRE
Subjt:  MASLTLSLCSNFATHCRVSTKQNLPSST----SNSNHELFNFAISTSSSSLKLSSSPIPSSRSAFPFVLKSSESEAAVIESEPAASQTLEIPSEEAAKRE

Query:  EIFAVVMIGSRQYIVFPGRYIHTQRLKGANVNDKITLNKVLLVGTKTQTYIGKPVVTNAAVHAVVEEQGLDDKVIVFKYKKKKNYRRNIGHRQPNSRIRI
        EIFAVVMIGSRQYIVFPGRYIHTQRLKGANVNDKITLNKVLLVGTKT TYIGKPVVTNAAVHA+VEEQGLDDKVIVFKYKKKKNYRRNIGHRQPN+RIRI
Subjt:  EIFAVVMIGSRQYIVFPGRYIHTQRLKGANVNDKITLNKVLLVGTKTQTYIGKPVVTNAAVHAVVEEQGLDDKVIVFKYKKKKNYRRNIGHRQPNSRIRI

Query:  TEITGYQDYPAATLES
        TEI+GYQDYPAATLES
Subjt:  TEITGYQDYPAATLES

A0A6J1EHE5 50S ribosomal protein L21, chloroplastic-like7.0e-9286.11Show/hide
Query:  MASLTLSLCSNFATHCRVSTKQNLPSST----SNSNHELFNFAISTSSSSLKLSSSPIPSSRSAFPFVLKSSESEAAVIESEPAASQTLEIPSEEAAKRE
        MASLTLSLCS+FA+HCR+STKQN PSST    SNS ++ FNFA+STSSSS KLSSS + SS SA PF+LKSSESEAAVIESEPAASQT+E+PSEEA KRE
Subjt:  MASLTLSLCSNFATHCRVSTKQNLPSST----SNSNHELFNFAISTSSSSLKLSSSPIPSSRSAFPFVLKSSESEAAVIESEPAASQTLEIPSEEAAKRE

Query:  EIFAVVMIGSRQYIVFPGRYIHTQRLKGANVNDKITLNKVLLVGTKTQTYIGKPVVTNAAVHAVVEEQGLDDKVIVFKYKKKKNYRRNIGHRQPNSRIRI
        EIFAVVMIGSRQYIVFPGRYIHTQRLKGANVNDKITLNKVLLVGTKT+ YIGKP+VTNAAVHAVVEEQGLD KVIVFKYKKKKNYRRNIGHRQPN+RIRI
Subjt:  EIFAVVMIGSRQYIVFPGRYIHTQRLKGANVNDKITLNKVLLVGTKTQTYIGKPVVTNAAVHAVVEEQGLDDKVIVFKYKKKKNYRRNIGHRQPNSRIRI

Query:  TEITGYQDYPAATLES
        TEI+GYQDYPA+TLES
Subjt:  TEITGYQDYPAATLES

A0A6J1F5X0 50S ribosomal protein L21, chloroplastic-like3.9e-8282.08Show/hide
Query:  MASLTLSLCSNFATHCRVSTKQNLPSSTSNSNHELFNFAISTSSSSLKLSSSPIPSSRSAFPFVLKSSESEAAVIESEPAASQTLEIPSEEAAKREEIFA
        MASLTLSLC+NFATHCRVSTKQN P ST               SSS KLS    PSSR A  FVLKSSESEAAVI+SEPAASQ +E+PSE+A KREEIFA
Subjt:  MASLTLSLCSNFATHCRVSTKQNLPSSTSNSNHELFNFAISTSSSSLKLSSSPIPSSRSAFPFVLKSSESEAAVIESEPAASQTLEIPSEEAAKREEIFA

Query:  VVMIGSRQYIVFPGRYIHTQRLKGANVNDKITLNKVLLVGTKTQTYIGKPVVTNAAVHAVVEEQGLDDKVIVFKYKKKKNYRRNIGHRQPNSRIRITEIT
        VVMIGSRQYIVFPGRYIHTQRLKGANVNDKITLNKVLLVGTKTQ YIGKP+VTNAAVHAVVEEQGL+ KVIVFKYKKKKNYRRNIGHRQPN+RIRITEI+
Subjt:  VVMIGSRQYIVFPGRYIHTQRLKGANVNDKITLNKVLLVGTKTQTYIGKPVVTNAAVHAVVEEQGLDDKVIVFKYKKKKNYRRNIGHRQPNSRIRITEIT

Query:  GYQDYPAATLES
        GYQDYPAATLES
Subjt:  GYQDYPAATLES

A0A6J1IX10 50S ribosomal protein L21, chloroplastic-like2.0e-9186.11Show/hide
Query:  MASLTLSLCSNFATHCRVSTKQNLPSST----SNSNHELFNFAISTSSSSLKLSSSPIPSSRSAFPFVLKSSESEAAVIESEPAASQTLEIPSEEAAKRE
        MASLTLSLCS+FA+HCRVSTKQN PSST    SNS+++ FNFA+STSSSS KLSSS + SS SA PF+LKSSESEAAVIESE AASQT+E+PSEEA KRE
Subjt:  MASLTLSLCSNFATHCRVSTKQNLPSST----SNSNHELFNFAISTSSSSLKLSSSPIPSSRSAFPFVLKSSESEAAVIESEPAASQTLEIPSEEAAKRE

Query:  EIFAVVMIGSRQYIVFPGRYIHTQRLKGANVNDKITLNKVLLVGTKTQTYIGKPVVTNAAVHAVVEEQGLDDKVIVFKYKKKKNYRRNIGHRQPNSRIRI
        EIFAVVMIGSRQYIVFPGRYIHTQRLKGANVNDKITLNKVLLVGTKT+ YIGKP+VTNAAVHAVVEEQGLD KVIVFKYKKKKNYRRNIGHRQPN+RIRI
Subjt:  EIFAVVMIGSRQYIVFPGRYIHTQRLKGANVNDKITLNKVLLVGTKTQTYIGKPVVTNAAVHAVVEEQGLDDKVIVFKYKKKKNYRRNIGHRQPNSRIRI

Query:  TEITGYQDYPAATLES
        TEI+GYQDYPA+TLES
Subjt:  TEITGYQDYPAATLES

SwissProt top hitse value%identityAlignment
A0LPF7 50S ribosomal protein L211.2e-1642.16Show/hide
Query:  IFAVVMIGSRQYIVFPGRYIHTQRLKGANVNDKITLNKVLLVGTKTQTYIGKPVVTNAAVHAVVEEQGLDDKVIVFKYKKKKNYRRNIGHRQPNSRIRIT
        ++AV+  G RQY V PG+ +  ++L G  V DK+TL++VLL    T   +G+PV+ N AV   + EQG   K+++FK+K++K+YR+  GHRQ  + +R+ 
Subjt:  IFAVVMIGSRQYIVFPGRYIHTQRLKGANVNDKITLNKVLLVGTKTQTYIGKPVVTNAAVHAVVEEQGLDDKVIVFKYKKKKNYRRNIGHRQPNSRIRIT

Query:  EI
        EI
Subjt:  EI

B8E0B4 50S ribosomal protein L212.5e-1749.02Show/hide
Query:  IFAVVMIGSRQYIVFPGRYIHTQRLKGANVNDKITLNKVLLVGTKTQTYIGKPVVTNAAVHAVVEEQGLDDKVIVFKYKKKKNYRRNIGHRQPNSRIRIT
        +F VV  G +QY V  G  ++ ++LK ANV D++ L+KVLLVG + +  IG+P V  A V A V  Q    KVIVFK+K+KK+YRR  GHRQP +++ I 
Subjt:  IFAVVMIGSRQYIVFPGRYIHTQRLKGANVNDKITLNKVLLVGTKTQTYIGKPVVTNAAVHAVVEEQGLDDKVIVFKYKKKKNYRRNIGHRQPNSRIRIT

Query:  EI
        EI
Subjt:  EI

P24613 50S ribosomal protein L21, chloroplastic2.2e-5084.75Show/hide
Query:  REEIFAVVMIGSRQYIVFPGRYIHTQRLKGANVNDKITLNKVLLVGTKTQTYIGKPVVTNAAVHAVVEEQGLDDKVIVFKYKKKKNYRRNIGHRQPNSRI
        REEIFAVV+IGSRQYIV PGR+I+TQRLKGA VNDKI LNKVLLVGTK  TYIG P+VTNAAVHAVVEEQ LDDKVIVFKYKKKKNYRRNIGHRQP +RI
Subjt:  REEIFAVVMIGSRQYIVFPGRYIHTQRLKGANVNDKITLNKVLLVGTKTQTYIGKPVVTNAAVHAVVEEQGLDDKVIVFKYKKKKNYRRNIGHRQPNSRI

Query:  RITEITGYQDYPAATLES
        +IT ITGY+DYPA+TLE+
Subjt:  RITEITGYQDYPAATLES

P51412 50S ribosomal protein L21, chloroplastic3.0e-5560Show/hide
Query:  ASLTLSLCSNFATHCRVSTKQNLPSSTSNSNHELFNFAISTSSSSLKLSSSPIPSSRSAFPFVLKSSESEAAVIESEP--------AASQTLEIPSEEAA
        +S TLSLCS F+ HC V+++++     S S   L N A   +     LS S   +SR+AF    K +ES   V+E+EP          S   E+ +EE A
Subjt:  ASLTLSLCSNFATHCRVSTKQNLPSSTSNSNHELFNFAISTSSSSLKLSSSPIPSSRSAFPFVLKSSESEAAVIESEP--------AASQTLEIPSEEAA

Query:  KREEIFAVVMIGSRQYIVFPGRYIHTQRLKGANVNDKITLNKVLLVGTKTQTYIGKPVVTNAAVHAVVEEQGLDDKVIVFKYKKKKNYRRNIGHRQPNSR
        KREEIFAV+M+G RQYIVFPGRY++TQRLK ANV+D+I LNKVLLVGTKT TYIGKPVVTNA VHAVVE QGL+DKV+VFKYK KK YRRNIGHRQPN+R
Subjt:  KREEIFAVVMIGSRQYIVFPGRYIHTQRLKGANVNDKITLNKVLLVGTKTQTYIGKPVVTNAAVHAVVEEQGLDDKVIVFKYKKKKNYRRNIGHRQPNSR

Query:  IRITEITGYQDYPAA
        IRIT ITGY++YPA+
Subjt:  IRITEITGYQDYPAA

Q8L9A0 50S ribosomal protein L21, mitochondrial2.9e-2652.14Show/hide
Query:  PSEEAAK-REEIFAVVMIGSRQYIVFPGRYIHTQRLKGANVNDKITLNKVLLVGTKTQTYIGKPVVTNAAVHAVVEEQGLDDKVIVFKYKKKKNYRRNIG
        PSE   K  E +FA+V IGS Q+ V  G  I T++LK  ++NDK+ L KVLL+G+ +QT IG+P++ +A VHAVVEE  LD+KV++FK K++KNYRR  G
Subjt:  PSEEAAK-REEIFAVVMIGSRQYIVFPGRYIHTQRLKGANVNDKITLNKVLLVGTKTQTYIGKPVVTNAAVHAVVEEQGLDDKVIVFKYKKKKNYRRNIG

Query:  HRQPNSRIRITEITGYQ
        HRQ  +++RIT+I G +
Subjt:  HRQPNSRIRITEITGYQ

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G35680.1 Ribosomal protein L212.1e-5660Show/hide
Query:  ASLTLSLCSNFATHCRVSTKQNLPSSTSNSNHELFNFAISTSSSSLKLSSSPIPSSRSAFPFVLKSSESEAAVIESEP--------AASQTLEIPSEEAA
        +S TLSLCS F+ HC V+++++     S S   L N A   +     LS S   +SR+AF    K +ES   V+E+EP          S   E+ +EE A
Subjt:  ASLTLSLCSNFATHCRVSTKQNLPSSTSNSNHELFNFAISTSSSSLKLSSSPIPSSRSAFPFVLKSSESEAAVIESEP--------AASQTLEIPSEEAA

Query:  KREEIFAVVMIGSRQYIVFPGRYIHTQRLKGANVNDKITLNKVLLVGTKTQTYIGKPVVTNAAVHAVVEEQGLDDKVIVFKYKKKKNYRRNIGHRQPNSR
        KREEIFAV+M+G RQYIVFPGRY++TQRLK ANV+D+I LNKVLLVGTKT TYIGKPVVTNA VHAVVE QGL+DKV+VFKYK KK YRRNIGHRQPN+R
Subjt:  KREEIFAVVMIGSRQYIVFPGRYIHTQRLKGANVNDKITLNKVLLVGTKTQTYIGKPVVTNAAVHAVVEEQGLDDKVIVFKYKKKKNYRRNIGHRQPNSR

Query:  IRITEITGYQDYPAA
        IRIT ITGY++YPA+
Subjt:  IRITEITGYQDYPAA

AT4G30930.1 Ribosomal protein L212.1e-2752.14Show/hide
Query:  PSEEAAK-REEIFAVVMIGSRQYIVFPGRYIHTQRLKGANVNDKITLNKVLLVGTKTQTYIGKPVVTNAAVHAVVEEQGLDDKVIVFKYKKKKNYRRNIG
        PSE   K  E +FA+V IGS Q+ V  G  I T++LK  ++NDK+ L KVLL+G+ +QT IG+P++ +A VHAVVEE  LD+KV++FK K++KNYRR  G
Subjt:  PSEEAAK-REEIFAVVMIGSRQYIVFPGRYIHTQRLKGANVNDKITLNKVLLVGTKTQTYIGKPVVTNAAVHAVVEEQGLDDKVIVFKYKKKKNYRRNIG

Query:  HRQPNSRIRITEITGYQ
        HRQ  +++RIT+I G +
Subjt:  HRQPNSRIRITEITGYQ


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCGTCTCTAACCCTTTCTCTCTGCTCAAATTTCGCCACTCATTGCCGAGTCTCAACCAAGCAGAATCTTCCTTCTTCAACCTCTAATTCCAACCATGAATTGTTCAA
TTTCGCCATCTCCACTTCATCTTCTTCCCTGAAACTCTCTTCCTCTCCCATTCCTTCTTCCCGCTCTGCATTTCCCTTCGTCCTCAAGTCCTCCGAGTCCGAAGCGGCCG
TAATCGAGTCCGAGCCCGCCGCTTCTCAAACCCTAGAAATCCCCTCGGAAGAGGCGGCCAAGCGCGAGGAAATCTTTGCTGTAGTTATGATTGGATCCCGCCAGTATATA
GTCTTTCCAGGACGTTATATCCATACACAGAGGCTGAAAGGAGCTAACGTCAATGATAAGATAACTCTGAACAAGGTTTTGCTTGTGGGAACCAAAACTCAGACATACAT
TGGAAAACCAGTAGTAACTAATGCTGCTGTTCATGCTGTTGTCGAGGAGCAGGGATTAGATGACAAGGTCATTGTCTTCAAGTACAAGAAAAAGAAAAACTACCGAAGAA
ACATTGGACACCGTCAGCCGAATTCGCGAATTAGGATAACGGAAATCACTGGATATCAAGACTATCCAGCAGCCACACTTGAGTCGTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GAAATGGATAGGATAGGCCCTGAAGTTCAAAACCAGCAGAACCATGGCTAAAAACCAAACCAATCACAGTTATGATCTTTCATCGTTACTAGACCAAAGAGGACCTTTGA
AAGGGCTCATCCATGGCGTCTCTAACCCTTTCTCTCTGCTCAAATTTCGCCACTCATTGCCGAGTCTCAACCAAGCAGAATCTTCCTTCTTCAACCTCTAATTCCAACCA
TGAATTGTTCAATTTCGCCATCTCCACTTCATCTTCTTCCCTGAAACTCTCTTCCTCTCCCATTCCTTCTTCCCGCTCTGCATTTCCCTTCGTCCTCAAGTCCTCCGAGT
CCGAAGCGGCCGTAATCGAGTCCGAGCCCGCCGCTTCTCAAACCCTAGAAATCCCCTCGGAAGAGGCGGCCAAGCGCGAGGAAATCTTTGCTGTAGTTATGATTGGATCC
CGCCAGTATATAGTCTTTCCAGGACGTTATATCCATACACAGAGGCTGAAAGGAGCTAACGTCAATGATAAGATAACTCTGAACAAGGTTTTGCTTGTGGGAACCAAAAC
TCAGACATACATTGGAAAACCAGTAGTAACTAATGCTGCTGTTCATGCTGTTGTCGAGGAGCAGGGATTAGATGACAAGGTCATTGTCTTCAAGTACAAGAAAAAGAAAA
ACTACCGAAGAAACATTGGACACCGTCAGCCGAATTCGCGAATTAGGATAACGGAAATCACTGGATATCAAGACTATCCAGCAGCCACACTTGAGTCGTAGAAACAATTT
CTGATGAATTGATCAGCACCTTGGAAATTTTATCCTTATTTCTTGCTCCCCCTTTTTGTATGTAAGTTCTTGTGAATCAAATGTTTCAATCTGAGTTCTTTCAAAGTCTC
TCAGGAAATCCCTAATGATTTTTCTGCCAAATTTTCATGGATTCCTAGAAATTTACCAATTTGTAGCTTAATATTAAATGACATCTTAAAATATGATATCTTTATCTTTC
TTTTAAATCAATTATCTTTTCATTTTTTTC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MASLTLSLCSNFATHCRVSTKQNLPSSTSNSNHELFNFAISTSSSSLKLSSSPIPSSRSAFPFVLKSSESEAAVIESEPAASQTLEIPSEEAAKREEIFAVVMIGSRQYI
VFPGRYIHTQRLKGANVNDKITLNKVLLVGTKTQTYIGKPVVTNAAVHAVVEEQGLDDKVIVFKYKKKKNYRRNIGHRQPNSRIRITEITGYQDYPAATLES