; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Sed0017032 (gene) of Chayote v1 genome

Gene IDSed0017032
OrganismSechium edule (Chayote v1)
DescriptionTLC domain-containing protein
Genome locationLG08:34109068..34114311
RNA-Seq ExpressionSed0017032
SyntenySed0017032
Gene Ontology termsGO:0006508 - proteolysis (biological process)
GO:0055088 - lipid homeostasis (biological process)
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GO:0005783 - endoplasmic reticulum (cellular component)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0004190 - aspartic-type endopeptidase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR006634 - TRAM/LAG1/CLN8 homology domain


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6573446.1 TLC domain-containing protein 4-B, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]7.5e-14194.55Show/hide
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XP_038894770.1 TLC domain-containing protein 4-like [Benincasa hispida]1.2e-14195.62Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S4E2B6 transmembrane protein 56-like1.1e-14094.16Show/hide
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A0A5D3E1H6 Transmembrane protein 56-like1.1e-14094.16Show/hide
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A0A6J1EH94 transmembrane protein 56-like1.8e-14094.53Show/hide
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A0A6J1K6A0 transmembrane protein 56-like4.0e-14094.55Show/hide
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A0A6J1KGK7 transmembrane protein 56-like1.8e-14094.53Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q5XIY2 TLC domain-containing protein 4-B9.0e-1224.17Show/hide
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        V G  +  +L +  ++ ++S++  + Y  L   +  +WN+R +ST+HA+ + +  LY +++ D  ++    G        L    + I+ GY   DL L+
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           + ++G + +V HH  +  A  Y +  G    +    LISE++TP +N RWF +     R+   ++ NGI +   + + RI +    +  V+ + Y  
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          +   +   + + +  V L ++N++W  KI +G  K I+
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Q6GLX2 TLC domain-containing protein 4-A3.4e-1124.4Show/hide
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        D LI Y  V G  L  +L++  ++  +      +Y  L+  ++ EW++R +ST HA+ +    LY + + D  +     G             + I+ GY
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         + DL L+   +  +     V HH     +  Y +  G    +    LISE++TP +N RWF D  G  RS    L+NG+ +   + + RI +    +  
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        V+  +  +  I++ +   +       VL ++N+ W  KI +G  K +  +
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Q6PGS5 TLC domain-containing protein 4-B2.5e-1428.37Show/hide
Query:  LTKIQRVEWNNRGMSTIHAIYISIMSLYFVFWSDLFSDQRHAGFVTFQSSTLSTFTLGISVGYFLADLGLIVWLYPSLGGMEYVVHHSLSGLAVAYSVFS
        L+  Q++EWN+R +S+ HA+ +    LY + + D  +     G        +    + ++ GY ++DL LI++ +  +G   +V HH L+ L   Y V  
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Query:  GEGQL--YTYMVLISEITTPEINMRWFLDTAG-MKRSCAYLINGIVIFFAWLVARILLFGYTFYHVYLHY-DQVIKMHVIGYILVFGVPTV-LGMMNLMW
        GEG L  +    LI+E +TP +N RWF +  G  K S   ++NG+++  ++ + RI +    +  V+  +  +      +G    + + +V L +MN+MW
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Query:  FGKIVKGLMKTISKR
          KI KG  K +  R
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Q8CGF5 TLC domain-containing protein 48.7e-1527.91Show/hide
Query:  YLGLTKIQRVEWNNRGMSTIHAIYISIMSLYFVFWSDLFSDQRHAGFVTFQSSTLSTFTLGISVGYFLADLGLIVWLYPSLGGMEYVVHHSLSGLAVAYS
        Y  L+  +++EWN+R +ST H++ + I  LY  F+ +        G  T+ +  ++T     + GY ++DL +I++ +  +G   +++HH  +GL   Y 
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        V +     Y     L++E+++P +N RWF +     K S A +INGI++   + + RI+     ++ +Y  Y  +  I+   +   +      +L +MN+
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Query:  MWFGKIVKGLMKTIS
        MW  KI KG +K IS
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Q96MV1 TLC domain-containing protein 45.6e-1428.21Show/hide
Query:  LVYDLTQLVSNSSIKSYLGLTKIQRVEWNNRGMSTIHAIYISIMSLY-FVFWSDLFSDQRHAGFVTFQSSTLSTFTLGISVGYFLADLGLIVWLYPSLGG
        L Y ++   S      +  L+  +++EWN+R +ST H++ + I  LY F+F     +D    G       +L+   + I+ GY ++DL +I+  +  +G 
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Query:  MEYVVHHSLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWFLDTAGM-KRSCAYLINGIVIFFAWLVARI--LLFGYTFYHVYLHYDQVIKMHVIG
          +++HH  S  A    + +G         L++E+++P +N RWF +     K S A +INGI++   + + RI  +L  Y F +     +  I++ V+ 
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Query:  YILVFGVPTVLGMMNLMWFGKIVKGLMKTISKRR
         +       VL +MN+MW  KI KG +K IS  R
Subjt:  YILVFGVPTVLGMMNLMWFGKIVKGLMKTISKRR

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G31300.1 TRAM, LAG1 and CLN8 (TLC) lipid-sensing domain containing protein5.4e-11372.69Show/hide
Query:  SLKTVMAIKSYQSQADALVKHYLLADRLIPYTSVLGGMLACKLVYDLTQLVSNSSIKSYLGLTKIQRVEWNNRGMSTIHAIYISIMSLYFVFWSDLFSDQ
        SL+T+ AIKSY  QA  LVK+YLLAD  IPYTSVL G+  CK+VYDL   +SNS  K+Y+ LTKIQR+EWNNRG+ST+HAI+IS MSLYFVFWSDLFSD+
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Query:  RHAGFVTFQSSTLSTFTLGISVGYFLADLGLIVWLYPSLGGMEYVVHHSLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWFLDTAGMKRSCAYLI
         H   V F+SS LS+  LGIS+GYFLADLG+I W YPSLGG+EY+VHHSLSG+AVAYS+FSGEGQLYTYMVLISEITTPEIN+RW+LDTAGMK+S AY++
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        NG+ IF AWLVARILLF Y FYHVYLHY+QV++MH+ GY+LVFGVP  LG+MNL+WFGKIV+G+ KT++KR
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AT1G31300.2 TRAM, LAG1 and CLN8 (TLC) lipid-sensing domain containing protein5.4e-11372.69Show/hide
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        SL+T+ AIKSY  QA  LVK+YLLAD  IPYTSVL G+  CK+VYDL   +SNS  K+Y+ LTKIQR+EWNNRG+ST+HAI+IS MSLYFVFWSDLFSD+
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Query:  RHAGFVTFQSSTLSTFTLGISVGYFLADLGLIVWLYPSLGGMEYVVHHSLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWFLDTAGMKRSCAYLI
         H   V F+SS LS+  LGIS+GYFLADLG+I W YPSLGG+EY+VHHSLSG+AVAYS+FSGEGQLYTYMVLISEITTPEIN+RW+LDTAGMK+S AY++
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Query:  NGIVIFFAWLVARILLFGYTFYHVYLHYDQVIKMHVIGYILVFGVPTVLGMMNLMWFGKIVKGLMKTISKR
        NG+ IF AWLVARILLF Y FYHVYLHY+QV++MH+ GY+LVFGVP  LG+MNL+WFGKIV+G+ KT++KR
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AT4G10360.1 TRAM, LAG1 and CLN8 (TLC) lipid-sensing domain containing protein1.4e-6347.41Show/hide
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        ++ + +L+   S+  G L CK+VYDLT+ +S      Y  L    R+EWNNRG ST HA++ S+ S+YF+  SD F +  H   V   ++ LS   +GIS
Subjt:  YLLADRLIPYTSVLGGMLACKLVYDLTQLVSNSSIKSYLGLTKIQRVEWNNRGMSTIHAIYISIMSLYFVFWSDLFSDQRHAGFVTFQSSTLSTFTLGIS

Query:  VGYFLADLGLIVWLYPSLGGMEYVVHHSLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWFLDTAGMKRSCAYLINGIVIFFAWLVARILLFGYTF
        +GYFLADL +I W +P+LGG+EYV HH LS  A+  SV SG+ Q Y ++VL+SE TTP +N+RW+LD +G K S AY +NGI +F  WLVAR+LLF + F
Subjt:  VGYFLADLGLIVWLYPSLGGMEYVVHHSLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWFLDTAGMKRSCAYLINGIVIFFAWLVARILLFGYTF

Query:  YHVYLHYDQVIKMHVIGYILVFGVPTVLGMMNLMWFGKIVKGLMKTISKRR
         H+YLH+ QV ++  +G+  +  +P  L +MNL+WF KI KGL+KT+SK +
Subjt:  YHVYLHYDQVIKMHVIGYILVFGVPTVLGMMNLMWFGKIVKGLMKTISKRR

AT4G19645.1 TRAM, LAG1 and CLN8 (TLC) lipid-sensing domain containing protein5.8e-10771.27Show/hide
Query:  MAIKSYQSQADALVKHYLLADRLIPYTSVLGGMLACKLVYDLTQLVSNSSIKSYLGLTKIQRVEWNNRGMSTIHAIYISIMSLYFVFWSDLFSDQRHAGF
        M IKSYQ+QA+  V+HYLLAD  +PYTSVL G+  CKLVYDLT+L S+  +KSY  LTKI+R+EWNNRG+ST+HAI+IS M+LYF F+SDLFSDQR    
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Query:  VT-FQSSTLSTFTLGISVGYFLADLGLIVWLYPSLGGMEYVVHHSLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWFLDTAGMKRSCAYLINGIV
        +T F++S LSTF LG+SVGYFLADLG+I WLYPSLGG EY++HH LSG AVAYS+FSGE QLYTYMVLISE+TTPEIN+RW+LD AG+KRS AYL+NG+ 
Subjt:  VT-FQSSTLSTFTLGISVGYFLADLGLIVWLYPSLGGMEYVVHHSLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWFLDTAGMKRSCAYLINGIV

Query:  IFFAWLVARILLFGYTFYHVYLHYDQVIKMHVIGYILVFGVPTVLGMMNLMWFGKIVKGLMKTISKRR
        IFFAWL ARILLF Y FYHVY HYDQVI+MH  GY+LVF VP  L +MNL+WFGKIVKGL KT+ KR+
Subjt:  IFFAWLVARILLFGYTFYHVYLHYDQVIKMHVIGYILVFGVPTVLGMMNLMWFGKIVKGLMKTISKRR

AT4G19645.2 TRAM, LAG1 and CLN8 (TLC) lipid-sensing domain containing protein5.8e-10771.27Show/hide
Query:  MAIKSYQSQADALVKHYLLADRLIPYTSVLGGMLACKLVYDLTQLVSNSSIKSYLGLTKIQRVEWNNRGMSTIHAIYISIMSLYFVFWSDLFSDQRHAGF
        M IKSYQ+QA+  V+HYLLAD  +PYTSVL G+  CKLVYDLT+L S+  +KSY  LTKI+R+EWNNRG+ST+HAI+IS M+LYF F+SDLFSDQR    
Subjt:  MAIKSYQSQADALVKHYLLADRLIPYTSVLGGMLACKLVYDLTQLVSNSSIKSYLGLTKIQRVEWNNRGMSTIHAIYISIMSLYFVFWSDLFSDQRHAGF

Query:  VT-FQSSTLSTFTLGISVGYFLADLGLIVWLYPSLGGMEYVVHHSLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWFLDTAGMKRSCAYLINGIV
        +T F++S LSTF LG+SVGYFLADLG+I WLYPSLGG EY++HH LSG AVAYS+FSGE QLYTYMVLISE+TTPEIN+RW+LD AG+KRS AYL+NG+ 
Subjt:  VT-FQSSTLSTFTLGISVGYFLADLGLIVWLYPSLGGMEYVVHHSLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWFLDTAGMKRSCAYLINGIV

Query:  IFFAWLVARILLFGYTFYHVYLHYDQVIKMHVIGYILVFGVPTVLGMMNLMWFGKIVKGLMKTISKRR
        IFFAWL ARILLF Y FYHVY HYDQVI+MH  GY+LVF VP  L +MNL+WFGKIVKGL KT+ KR+
Subjt:  IFFAWLVARILLFGYTFYHVYLHYDQVIKMHVIGYILVFGVPTVLGMMNLMWFGKIVKGLMKTISKRR


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCAAGATCTTTGAAGACTGTAATGGCTATTAAGTCTTACCAAAGTCAAGCTGATGCATTAGTGAAGCACTACTTATTAGCAGACCGTTTGATCCCATACACCTCTGT
CCTCGGAGGCATGCTTGCTTGTAAATTGGTCTATGATCTTACTCAATTAGTTAGCAATTCTTCCATCAAGAGTTATCTGGGTCTTACAAAAATCCAACGAGTTGAGTGGA
ATAACCGCGGCATGTCCACTATTCATGCAATCTATATCTCAATTATGTCATTGTACTTCGTTTTCTGGTCAGATCTCTTCTCTGACCAGCGTCATGCTGGCTTTGTTACC
TTTCAAAGTTCAACATTGTCTACTTTCACATTGGGGATTTCAGTTGGATACTTCTTGGCAGATCTTGGATTGATTGTTTGGCTGTACCCTTCTTTAGGTGGGATGGAGTA
TGTTGTGCATCATTCTCTTTCTGGACTAGCAGTAGCATATTCTGTTTTTTCTGGAGAAGGGCAACTCTATACATATATGGTCCTCATTTCGGAGATTACGACTCCTGAGA
TTAATATGAGATGGTTTCTTGATACAGCTGGTATGAAGAGGTCCTGTGCATATCTGATTAATGGCATTGTAATATTTTTTGCGTGGCTGGTTGCTCGCATATTGCTGTTT
GGTTACACATTCTATCATGTTTACCTGCACTATGATCAGGTAATTAAAATGCATGTAATTGGATATATTTTGGTATTTGGAGTGCCAACAGTTCTAGGTATGATGAACTT
GATGTGGTTCGGGAAGATCGTCAAGGGATTAATGAAAACTATATCGAAAAGGCGATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AATAAATAAAGAGTGCTAAAAGTTGATAAATTCATCGGCCAAGGCGCGAAGTTATCATATTTCTTGGGTCATTACTACAAGAATTGGATTGAAAATTCAATTCAATCCAC
AAGAACACGACGTCCCATCTCTGGACACTCAAATCCATTGCTGATTAGCAAAACCCCACTTGCAATTTCACCATTTTCCCCTTATTGATATTGTTCGCAATTTCTCTTCA
TCTTGTCGCGATTACCCTTTTAGAATCTTGCGGTTGGAGATTCCTAACGCTTCACATTGATTAAACCTCACGGTTCTTCATCTTTTGCACCACCCGTCGGTTGTTGCATT
TCCCTTTACACATTACCTTATTTTGTTCATCTTTGAAAAAGGGCGAACCCCAAATCTTCTGCATCTCACTCGTGATCTGGGGTTTTCATTTTTGAGCGATGCAACATGGA
GTGCGGGAGCACATAGTTAATTCAGTCTAAGGTACAGCGATTTTCCGAAGGTTATGTAGTGAAACAAAACAATGGCAAGATCTTTGAAGACTGTAATGGCTATTAAGTCT
TACCAAAGTCAAGCTGATGCATTAGTGAAGCACTACTTATTAGCAGACCGTTTGATCCCATACACCTCTGTCCTCGGAGGCATGCTTGCTTGTAAATTGGTCTATGATCT
TACTCAATTAGTTAGCAATTCTTCCATCAAGAGTTATCTGGGTCTTACAAAAATCCAACGAGTTGAGTGGAATAACCGCGGCATGTCCACTATTCATGCAATCTATATCT
CAATTATGTCATTGTACTTCGTTTTCTGGTCAGATCTCTTCTCTGACCAGCGTCATGCTGGCTTTGTTACCTTTCAAAGTTCAACATTGTCTACTTTCACATTGGGGATT
TCAGTTGGATACTTCTTGGCAGATCTTGGATTGATTGTTTGGCTGTACCCTTCTTTAGGTGGGATGGAGTATGTTGTGCATCATTCTCTTTCTGGACTAGCAGTAGCATA
TTCTGTTTTTTCTGGAGAAGGGCAACTCTATACATATATGGTCCTCATTTCGGAGATTACGACTCCTGAGATTAATATGAGATGGTTTCTTGATACAGCTGGTATGAAGA
GGTCCTGTGCATATCTGATTAATGGCATTGTAATATTTTTTGCGTGGCTGGTTGCTCGCATATTGCTGTTTGGTTACACATTCTATCATGTTTACCTGCACTATGATCAG
GTAATTAAAATGCATGTAATTGGATATATTTTGGTATTTGGAGTGCCAACAGTTCTAGGTATGATGAACTTGATGTGGTTCGGGAAGATCGTCAAGGGATTAATGAAAAC
TATATCGAAAAGGCGATGAGAAACATATTCTTCTGGTTCATATCTCTTCTTCCTCACTTTTCTTGGTCTTTTTCTAAACATCTGCTCATGAGTTAAGGAGAAAAAGGAAT
TTGATGCTATATAGTGTGTGCGTTGTAAATGGTTCAAAATAACTTAAGAACTTGTAAACATTTTAGCGTCTTCTTCCTCTTTGTCAGATTTATGTACCAATTCATTTTTT
TCTCTATAGTTCTTTTTCCTTTTTTTACAACAATGCATACAGATGGAAGAAATGTGAGGATACTGCAGCAATTATTTTTTTGTATTCTGTTATGGTATTTGTTCTCCCTT
CCTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MARSLKTVMAIKSYQSQADALVKHYLLADRLIPYTSVLGGMLACKLVYDLTQLVSNSSIKSYLGLTKIQRVEWNNRGMSTIHAIYISIMSLYFVFWSDLFSDQRHAGFVT
FQSSTLSTFTLGISVGYFLADLGLIVWLYPSLGGMEYVVHHSLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWFLDTAGMKRSCAYLINGIVIFFAWLVARILLF
GYTFYHVYLHYDQVIKMHVIGYILVFGVPTVLGMMNLMWFGKIVKGLMKTISKRR