; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Sed0017288 (gene) of Chayote v1 genome

Gene IDSed0017288
OrganismSechium edule (Chayote v1)
DescriptionSon of sevenless
Genome locationLG06:39698827..39700579
RNA-Seq ExpressionSed0017288
SyntenySed0017288
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0034449.1 Son of sevenless [Cucumis melo var. makuwa]1.3e-14783.73Show/hide
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XP_008446402.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103489158 [Cucumis melo]3.5e-14884.04Show/hide
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XP_022151227.1 uncharacterized protein LOC111019201 [Momordica charantia]4.7e-14583.73Show/hide
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XP_038891326.1 uncharacterized protein LOC120080772 [Benincasa hispida]2.5e-14684.34Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KST9 Uncharacterized protein1.6e-14683.99Show/hide
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A0A1S3BEH4 uncharacterized protein LOC1034891581.7e-14884.04Show/hide
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A0A5A7SZB6 Son of sevenless6.4e-14883.73Show/hide
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A0A6J1DCX0 uncharacterized protein LOC1110192012.3e-14583.73Show/hide
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A0A6J1GXY9 uncharacterized protein LOC1114582244.9e-14080.42Show/hide
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        ++S +PS F IEP +RFHSMSALEILRETVRILRFNSTAF+++A+ LICPVSAVFLSNV VDESIVK LT+RL+L+A+SSGLPL+PIIEHSCQRFAE+IL
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        +SAMCFPLF++LSL+SKAAVVHTVDCTYAK RFE + F  +V N+WNRLL TYAS CLAIVGCLTLFLVLLG+VC+T Y L FSPD+++ AAVIVGL+FS
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        YFSCRSSSM +SNGE DS  D+ V D STGI+
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G26650.1 unknown protein3.4e-10162.78Show/hide
Query:  HHRFHSMSALEILRETVRILRFNSTAFLLIALFLICPVSAVFLSNVFVDESIVKTLTVRLLLVARSSGLPLLPIIEHSCQRFAETILSSAMCFPLFLTLS
        H +FHS +ALEILRETVRILR+N  A +L    LICPVSA+ L N  VD+S+V  LTV+LLLVA+SSGLPL P ++HSCQ+FAET +SSAMCFP+F+T+S
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Query:  LISKAAVVHTVDCTYAKSRFEFAVFLGLVGNVWNRLLSTYASLCLAIVGCLTLFLVLLGSVCTTFYVLGFSPDVVVSAAVIVGLVFSVIFANAVIVCNIA
        L+SKAAVV++VDC+Y++   + + FL ++  +W R++ TY  +C+ IVGC T F VLL ++C++F VLGFSPD  V  A++VGL FSV+FANA+I+CN A
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Query:  IVICVLEDISGPEALLRSFVLVRGQTQVGLLIFLGSTIGTVFVEGLFEHRVKTLSYGDGSSRIWEGPLLVVMYSFVVLTDSMMSAVFYFSCR-SSSMMMS
        IVI VLED+SG  AL+R+  L++GQ QVGLL+FLGST+G  FVEGLF+HRVK +SYGDGSSR+WEGPLLV+MYSFV L DSMMSAVFYFSCR   SM  S
Subjt:  IVICVLEDISGPEALLRSFVLVRGQTQVGLLIFLGSTIGTVFVEGLFEHRVKTLSYGDGSSRIWEGPLLVVMYSFVVLTDSMMSAVFYFSCR-SSSMMMS

Query:  NGEDDSIFD
         GE   I +
Subjt:  NGEDDSIFD

AT1G69430.1 unknown protein9.9e-10967.1Show/hide
Query:  SSISPKPSHFWIEPHHRFHSMSALEILRETVRILRFNSTAFLLIALFLICPVSAVFLSNVFVDESIVKTLTVRLLLVARSSGLPLLPIIEHSCQRFAETI
        SS SP  S       H+FHSM+ALEILRETVRILR+N  AF+LIAL LICPVSA+ L N+ VD+S+V +LTVRLLLV++SSGLPLLP + +SCQ+F+ET 
Subjt:  SSISPKPSHFWIEPHHRFHSMSALEILRETVRILRFNSTAFLLIALFLICPVSAVFLSNVFVDESIVKTLTVRLLLVARSSGLPLLPIIEHSCQRFAETI

Query:  LSSAMCFPLFLTLSLISKAAVVHTVDCTYAKSRFEFAVFLGLVGNVWNRLLSTYASLCLAIVGCLTLFLVLLGSVCTTFYVLGFSPDVVVSAAVIVGLVF
        +SSAMCFPLF+TLSL+S+AAVV++VDCTY++ +     F+ ++  +W RL+ TY  +C  IV CLT F V L +VC++FYVLGFSPD     A++VGLVF
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Query:  SVIFANAVIVCNIAIVICVLEDISGPEALLRSFVLVRGQTQVGLLIFLGSTIGTVFVEGLFEHRVKTLSYGDGSSRIWEGPLLVVMYSFVVLTDSMMSAV
        SV+FANA+I+CN  IVI +LED+SGP AL+R+  L++GQTQVGLLIFLGSTIG  FVEGLFEHRVK+LSYGDGSSR+WEGPLLVVMYSFVVL D+MMSAV
Subjt:  SVIFANAVIVCNIAIVICVLEDISGPEALLRSFVLVRGQTQVGLLIFLGSTIGTVFVEGLFEHRVKTLSYGDGSSRIWEGPLLVVMYSFVVLTDSMMSAV

Query:  FYFSCRSSSM
        FYFSCRS SM
Subjt:  FYFSCRSSSM

AT4G19950.1 unknown protein2.6e-0827.68Show/hide
Query:  ILRETVRILRFNSTAFLLIALFLICPVSAVFLSNVFVDESIVKTLTVRLLLVARSSGLPLLPIIEHS-CQRFAETILSSAMCFPLFL-TLSLISKAAVVH
        ILRE+  I +++   F LI L LI P+S   L++    + I+             + +   P  + S  Q     +L    C+ +FL   SL+S AAVV 
Subjt:  ILRETVRILRFNSTAFLLIALFLICPVSAVFLSNVFVDESIVKTLTVRLLLVARSSGLPLLPIIEHS-CQRFAETILSSAMCFPLFL-TLSLISKAAVVH

Query:  TVDCTYAKSRFEFAVFLGLVGNVWNRLLSTYASLCLAIVGCLTLFLVLLGSVCTTFYVLGFSPDVV--VSAAVIVGLVFSVIFANAVIVCNIAIVICVLE
        TV   Y      F+  +  +  V  RL  T+  + L ++   T+FL+ L     T  V     +VV  V + V++ ++F V+      + ++A V+ VLE
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Query:  DISGPEALLRSFVLVRGQTQVGLLIFLGSTIGTVFVEGLFEHRVKTLSYGDG---SSRIWEGPLLVVMYSFVVLTDSMMSAVFYFSCRS
         I G  A+ +S+ L++G+T +   +     +   F+ G+F   V  +  GD     +RI  G  LV +   V L   ++ +VFY+ C+S
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AT5G61340.1 unknown protein3.6e-1023.85Show/hide
Query:  MESPSSISPKPSHFWIEPHHRFHSMSALEILRETVRILRFNSTAFLLIALFLICPVSAVFLSNVFVDESIVKTLTVRLLLVARSSGLPLL-PIIEHSCQR
        ME PS I  +  H +++ +HR  + +A+ +                        P SA  L +     S   TL +RL ++ R +G             +
Subjt:  MESPSSISPKPSHFWIEPHHRFHSMSALEILRETVRILRFNSTAFLLIALFLICPVSAVFLSNVFVDESIVKTLTVRLLLVARSSGLPLL-PIIEHSCQR

Query:  FAETILSSAMCFPLFLTLSLISKAAVVHTVDCTYAKSRFEFAVFLGLVGNVWNRLLSTYASLCLAIVGCLTLFLVLLGSVCTTFYVLGFSP-DVVVSAAV
         ++T+ SS    P  LT  L+SKA V+  +   +  S    +VF       + RLL TY      ++        L      T    GFS  +     ++
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Query:  IVGLVFSVIFANAVIVCNIAIVICVLEDISGPEALLRSFVLVRGQTQVGLLIFLGSTIGTVFVEGLFEHRVKTLSYG---DGSSRIWEGPLLVVMYSFVV
           +++S+I ANA ++ N+A+V        G   +L++ +L+RG+    + + L + +G   VE LF++RV    Y    D  S   EG  +  +Y+  +
Subjt:  IVGLVFSVIFANAVIVCNIAIVICVLEDISGPEALLRSFVLVRGQTQVGLLIFLGSTIGTVFVEGLFEHRVKTLSYG---DGSSRIWEGPLLVVMYSFVV

Query:  LTDSMMSAVFYFSCRSSSMMMSNGEDD
        + D++++ +FY SC  +    + G +D
Subjt:  LTDSMMSAVFYFSCRSSSMMMSNGEDD


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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TCTCCGCTTCAATTCCACCGCCTTTCTCCTCATTGCCCTTTTCCTCATTTGCCCCGTTTCCGCCGTTTTCCTCTCCAATGTCTTCGTCGATGAATCCATCGTCAAGACCT
TGACGGTTCGGTTGCTGTTAGTCGCCCGGTCCAGCGGCCTCCCATTGCTGCCCATCATCGAGCATTCCTGCCAGCGCTTCGCCGAGACGATCCTTTCCTCCGCCATGTGC
TTCCCTTTGTTTCTTACCCTTTCTTTGATTTCCAAGGCCGCTGTGGTTCACACCGTGGATTGCACCTATGCCAAATCGAGGTTCGAGTTCGCTGTGTTTCTGGGGTTGGT
TGGTAATGTATGGAATCGCCTTTTATCCACTTATGCTTCCCTGTGTCTTGCCATTGTGGGTTGCCTTACATTGTTCTTGGTTCTGCTTGGTTCTGTTTGCACTACCTTTT
ATGTGTTGGGATTTTCCCCTGATGTTGTTGTCTCCGCTGCTGTGATTGTGGGGCTTGTGTTCTCGGTTATATTTGCGAATGCGGTCATCGTTTGCAACATTGCTATTGTT
ATCTGTGTGTTGGAAGATATTTCGGGCCCGGAGGCTTTGCTTAGATCTTTTGTTCTTGTTAGGGGTCAGACTCAGGTGGGGCTTTTGATCTTTTTGGGATCTACCATTGG
GACTGTGTTTGTGGAGGGATTGTTTGAGCATAGGGTTAAGACATTGAGCTATGGAGATGGCTCTTCCAGGATTTGGGAAGGCCCTCTTTTGGTGGTTATGTATTCTTTTG
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GATGGATCAACGGGTATTGTTTAA
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CATCTGATTTTCCCCTATTTCTCATGGGTTTCCTTCCCTTTTCGTGGGTTCCTTCCCTTTAGCTCCACCGGATCTGATCCTTCACCAAAACAATGGAGTCCCCTTCTTCC
ATTTCACCAAAACCCTCCCATTTCTGGATCGAACCCCACCACCGATTCCACTCCATGAGCGCATTGGAGATCTTGAGAGAAACCGTTCGGATTCTCCGCTTCAATTCCAC
CGCCTTTCTCCTCATTGCCCTTTTCCTCATTTGCCCCGTTTCCGCCGTTTTCCTCTCCAATGTCTTCGTCGATGAATCCATCGTCAAGACCTTGACGGTTCGGTTGCTGT
TAGTCGCCCGGTCCAGCGGCCTCCCATTGCTGCCCATCATCGAGCATTCCTGCCAGCGCTTCGCCGAGACGATCCTTTCCTCCGCCATGTGCTTCCCTTTGTTTCTTACC
CTTTCTTTGATTTCCAAGGCCGCTGTGGTTCACACCGTGGATTGCACCTATGCCAAATCGAGGTTCGAGTTCGCTGTGTTTCTGGGGTTGGTTGGTAATGTATGGAATCG
CCTTTTATCCACTTATGCTTCCCTGTGTCTTGCCATTGTGGGTTGCCTTACATTGTTCTTGGTTCTGCTTGGTTCTGTTTGCACTACCTTTTATGTGTTGGGATTTTCCC
CTGATGTTGTTGTCTCCGCTGCTGTGATTGTGGGGCTTGTGTTCTCGGTTATATTTGCGAATGCGGTCATCGTTTGCAACATTGCTATTGTTATCTGTGTGTTGGAAGAT
ATTTCGGGCCCGGAGGCTTTGCTTAGATCTTTTGTTCTTGTTAGGGGTCAGACTCAGGTGGGGCTTTTGATCTTTTTGGGATCTACCATTGGGACTGTGTTTGTGGAGGG
ATTGTTTGAGCATAGGGTTAAGACATTGAGCTATGGAGATGGCTCTTCCAGGATTTGGGAAGGCCCTCTTTTGGTGGTTATGTATTCTTTTGTTGTCCTGACTGATTCTA
TGATGAGTGCGGTTTTTTACTTCAGCTGCAGATCTTCGAGTATGATGATGTCTAACGGCGAAGATGATTCAATTTTCGATATTGCAGTTCCGGATGGATCAACGGGTATT
GTTTAATTCGATTGTGTTGTTGTTGTAGATGGGTAAGACACATAGATCTCTTTATAGATGATACTGAAAAAGATGACAGTGTTGGTTAGGATATATGTATTTACCTTTTT
TGTTGTTGCCTTGATATGGATTTCCCCTTCTGTCAAAGTCACAAAGAAATGGGGAAGATTACATGTAATGGCTGAGGTTCGGTCCCGTCTTACATTGTTGATAGATACTT
GTTACACAAAGGATATATTGCGTCATTGATGAACATGAGTGCAAAGAAAACACATTTTTCATGAGTTGGAGCATCAAATATTAGATGTCTCTTTCATATTAGTTAGATCA
AAGAAATGCTTGGAAAACTTTTGGTTGATTAGTTTTCTATTGCAAGAGGTGTATTTTTTGTGGATCATTTGCTGTTGTTTTAGCTCCATTTGTTTATGAATTTACTCACT
TACACACATGGTTGTCAGAATGTTGAGTTTGTCCAATTGTGTCAATGTAGTGTTGTGCGGAAGAAAGTTAAAGGTGAATGGTGATCAAATTCCTTGTTCGAAC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MESPSSISPKPSHFWIEPHHRFHSMSALEILRETVRILRFNSTAFLLIALFLICPVSAVFLSNVFVDESIVKTLTVRLLLVARSSGLPLLPIIEHSCQRFAETILSSAMC
FPLFLTLSLISKAAVVHTVDCTYAKSRFEFAVFLGLVGNVWNRLLSTYASLCLAIVGCLTLFLVLLGSVCTTFYVLGFSPDVVVSAAVIVGLVFSVIFANAVIVCNIAIV
ICVLEDISGPEALLRSFVLVRGQTQVGLLIFLGSTIGTVFVEGLFEHRVKTLSYGDGSSRIWEGPLLVVMYSFVVLTDSMMSAVFYFSCRSSSMMMSNGEDDSIFDIAVP
DGSTGIV