; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Sed0017401 (gene) of Chayote v1 genome

Gene IDSed0017401
OrganismSechium edule (Chayote v1)
Description40S ribosomal protein S8
Genome locationLG03:45342481..45345503
RNA-Seq ExpressionSed0017401
SyntenySed0017401
Gene Ontology termsGO:0000462 - maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) (biological process)
GO:0006412 - translation (biological process)
GO:0022627 - cytosolic small ribosomal subunit (cellular component)
GO:0003735 - structural constituent of ribosome (molecular function)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6598870.1 40S ribosomal protein S8, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]2.2e-11194.98Show/hide
Query:  MGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNFSWGSEAVTRKTRLLDVVYNASNNELVRTQTLVKS
        MGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTK+SSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGN+SWGSEAVTRK+R+LDVVYNASNNELVRTQTLVKS
Subjt:  MGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNFSWGSEAVTRKTRLLDVVYNASNNELVRTQTLVKS

Query:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDVGRKKKIAASAKKEEEGDAATEEVKKSNHVQRKIEKRQQERKLDPHIEEQFTGGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE
        AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVD+GRKKK  ASAKKEEEGDA TEEVKKSNHVQRKIEKRQQ+RKLDPHIEEQF+ GRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE
Subjt:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDVGRKKKIAASAKKEEEGDAATEEVKKSNHVQRKIEKRQQERKLDPHIEEQFTGGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE

Query:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA
        LEFYMKKLQRKKGKGAGAA
Subjt:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA

XP_004148331.1 40S ribosomal protein S8 [Cucumis sativus]1.3e-11195.43Show/hide
Query:  MGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNFSWGSEAVTRKTRLLDVVYNASNNELVRTQTLVKS
        MGISRDSMHKRR TGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGN+SWGSEAVTRKTRLLDVVYNASNNELVRTQTLVKS
Subjt:  MGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNFSWGSEAVTRKTRLLDVVYNASNNELVRTQTLVKS

Query:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDVGRKKKIAASAKKEEEGDAATEEVKKSNHVQRKIEKRQQERKLDPHIEEQFTGGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE
        AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVD+GRKKK +AS KKEEEGDA TEEVKKSNHVQRKIEKRQQ+RKLDPHIEEQF+ GRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE
Subjt:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDVGRKKKIAASAKKEEEGDAATEEVKKSNHVQRKIEKRQQERKLDPHIEEQFTGGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE

Query:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA
        LEFYMKKLQRKKGKGAGAA
Subjt:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA

XP_008451649.1 PREDICTED: 40S ribosomal protein S8-like [Cucumis melo]7.6e-11295.43Show/hide
Query:  MGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNFSWGSEAVTRKTRLLDVVYNASNNELVRTQTLVKS
        MGISRDSMHKRR TGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGN+SWGSEAVTRKTR+LDVVYNASNNELVRTQTLVKS
Subjt:  MGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNFSWGSEAVTRKTRLLDVVYNASNNELVRTQTLVKS

Query:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDVGRKKKIAASAKKEEEGDAATEEVKKSNHVQRKIEKRQQERKLDPHIEEQFTGGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE
        AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVD+GRKKK +ASAKKEEEGDA TEEVKKSNHVQRKIEKRQQ+RKLDPHIEEQF+ GRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE
Subjt:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDVGRKKKIAASAKKEEEGDAATEEVKKSNHVQRKIEKRQQERKLDPHIEEQFTGGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE

Query:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA
        LEFYMKKLQRKKGKGAGAA
Subjt:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA

XP_022929761.1 40S ribosomal protein S8-like [Cucurbita moschata]1.7e-11194.98Show/hide
Query:  MGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNFSWGSEAVTRKTRLLDVVYNASNNELVRTQTLVKS
        MGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTK+SSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGN+SWGSEAVTRK+R+LDVVYNASNNELVRTQTLVKS
Subjt:  MGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNFSWGSEAVTRKTRLLDVVYNASNNELVRTQTLVKS

Query:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDVGRKKKIAASAKKEEEGDAATEEVKKSNHVQRKIEKRQQERKLDPHIEEQFTGGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE
        AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVD+GRKKK  ASAKKEEEGDA TEEVKKSNHVQRKIEKRQQ+RKLDPHIEEQF+ GRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE
Subjt:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDVGRKKKIAASAKKEEEGDAATEEVKKSNHVQRKIEKRQQERKLDPHIEEQFTGGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE

Query:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA
        LEFYMKKLQRKKGKGAGAA
Subjt:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA

XP_038891236.1 40S ribosomal protein S8 [Benincasa hispida]5.8e-11295.89Show/hide
Query:  MGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNFSWGSEAVTRKTRLLDVVYNASNNELVRTQTLVKS
        MGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGN+SWGSEAVTRKTR+LDVVYNASNNELVRTQTLVKS
Subjt:  MGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNFSWGSEAVTRKTRLLDVVYNASNNELVRTQTLVKS

Query:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDVGRKKKIAASAKKEEEGDAATEEVKKSNHVQRKIEKRQQERKLDPHIEEQFTGGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE
        AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVD+GRKKK  ASAKK+EEGDAATEEVKKSNHVQRKIEKRQQ+RKLDPHIEEQF  GRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE
Subjt:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDVGRKKKIAASAKKEEEGDAATEEVKKSNHVQRKIEKRQQERKLDPHIEEQFTGGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE

Query:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA
        LEFYMKKLQRKKGKGAGAA
Subjt:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LJA0 40S ribosomal protein S86.3e-11295.43Show/hide
Query:  MGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNFSWGSEAVTRKTRLLDVVYNASNNELVRTQTLVKS
        MGISRDSMHKRR TGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGN+SWGSEAVTRKTRLLDVVYNASNNELVRTQTLVKS
Subjt:  MGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNFSWGSEAVTRKTRLLDVVYNASNNELVRTQTLVKS

Query:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDVGRKKKIAASAKKEEEGDAATEEVKKSNHVQRKIEKRQQERKLDPHIEEQFTGGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE
        AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVD+GRKKK +AS KKEEEGDA TEEVKKSNHVQRKIEKRQQ+RKLDPHIEEQF+ GRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE
Subjt:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDVGRKKKIAASAKKEEEGDAATEEVKKSNHVQRKIEKRQQERKLDPHIEEQFTGGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE

Query:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA
        LEFYMKKLQRKKGKGAGAA
Subjt:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA

A0A1S3BRZ4 40S ribosomal protein S83.7e-11295.43Show/hide
Query:  MGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNFSWGSEAVTRKTRLLDVVYNASNNELVRTQTLVKS
        MGISRDSMHKRR TGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGN+SWGSEAVTRKTR+LDVVYNASNNELVRTQTLVKS
Subjt:  MGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNFSWGSEAVTRKTRLLDVVYNASNNELVRTQTLVKS

Query:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDVGRKKKIAASAKKEEEGDAATEEVKKSNHVQRKIEKRQQERKLDPHIEEQFTGGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE
        AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVD+GRKKK +ASAKKEEEGDA TEEVKKSNHVQRKIEKRQQ+RKLDPHIEEQF+ GRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE
Subjt:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDVGRKKKIAASAKKEEEGDAATEEVKKSNHVQRKIEKRQQERKLDPHIEEQFTGGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE

Query:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA
        LEFYMKKLQRKKGKGAGAA
Subjt:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA

A0A5D3BT12 40S ribosomal protein S83.7e-11295.43Show/hide
Query:  MGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNFSWGSEAVTRKTRLLDVVYNASNNELVRTQTLVKS
        MGISRDSMHKRR TGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGN+SWGSEAVTRKTR+LDVVYNASNNELVRTQTLVKS
Subjt:  MGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNFSWGSEAVTRKTRLLDVVYNASNNELVRTQTLVKS

Query:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDVGRKKKIAASAKKEEEGDAATEEVKKSNHVQRKIEKRQQERKLDPHIEEQFTGGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE
        AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVD+GRKKK +ASAKKEEEGDA TEEVKKSNHVQRKIEKRQQ+RKLDPHIEEQF+ GRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE
Subjt:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDVGRKKKIAASAKKEEEGDAATEEVKKSNHVQRKIEKRQQERKLDPHIEEQFTGGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE

Query:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA
        LEFYMKKLQRKKGKGAGAA
Subjt:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA

A0A6J1EP23 40S ribosomal protein S88.2e-11294.98Show/hide
Query:  MGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNFSWGSEAVTRKTRLLDVVYNASNNELVRTQTLVKS
        MGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTK+SSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGN+SWGSEAVTRK+R+LDVVYNASNNELVRTQTLVKS
Subjt:  MGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNFSWGSEAVTRKTRLLDVVYNASNNELVRTQTLVKS

Query:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDVGRKKKIAASAKKEEEGDAATEEVKKSNHVQRKIEKRQQERKLDPHIEEQFTGGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE
        AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVD+GRKKK  ASAKKEEEGDA TEEVKKSNHVQRKIEKRQQ+RKLDPHIEEQF+ GRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE
Subjt:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDVGRKKKIAASAKKEEEGDAATEEVKKSNHVQRKIEKRQQERKLDPHIEEQFTGGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE

Query:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA
        LEFYMKKLQRKKGKGAGAA
Subjt:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA

A0A6J1K537 40S ribosomal protein S88.2e-11294.98Show/hide
Query:  MGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNFSWGSEAVTRKTRLLDVVYNASNNELVRTQTLVKS
        MGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTK+SSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGN+SWGSEAVTRK+R+LDVVYNASNNELVRTQTLVKS
Subjt:  MGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNFSWGSEAVTRKTRLLDVVYNASNNELVRTQTLVKS

Query:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDVGRKKKIAASAKKEEEGDAATEEVKKSNHVQRKIEKRQQERKLDPHIEEQFTGGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE
        AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVD+GRKKK  ASAKKEEEGDA TEEVKKSNHVQRKIEKRQQ+RKLDPHIEEQF+ GRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE
Subjt:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDVGRKKKIAASAKKEEEGDAATEEVKKSNHVQRKIEKRQQERKLDPHIEEQFTGGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE

Query:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA
        LEFYMKKLQRKKGKGAGAA
Subjt:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA

SwissProt top hitse value%identityAlignment
O81361 40S ribosomal protein S81.4e-10388.18Show/hide
Query:  MGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNFSWGSEAVTRKTRLLDVVYNASNNELVRTQTLVKS
        MGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSS+K++RRIRVRGGNVKWRA RLDTGNFSWGSEAVTRKTRLLDVVYNASNNELVRTQTLVKS
Subjt:  MGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNFSWGSEAVTRKTRLLDVVYNASNNELVRTQTLVKS

Query:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDVGRKKKIAASAK-KEEEGDAATEEVKKSNHVQRKIEKRQQERKLDPHIEEQFTGGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGK
        AIVQVDAAPFKQWYLQHYGV++GRKKK AA+ K   EEG+A TEE KKSNHV  K+EKRQQ R LD HIEEQF GG+L+ACISSRPGQCG+ADG ILEGK
Subjt:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDVGRKKKIAASAK-KEEEGDAATEEVKKSNHVQRKIEKRQQERKLDPHIEEQFTGGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGK

Query:  ELEFYMKKLQRKKGKGAGAA
        ELEFYMKKLQRKKGKGAGAA
Subjt:  ELEFYMKKLQRKKGKGAGAA

P49199 40S ribosomal protein S89.7e-10286.43Show/hide
Query:  MGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNFSWGSEAVTRKTRLLDVVYNASNNELVRTQTLVKS
        MGISRDSMHKRRATGGK+KAWRKKRKYELGRQPANTKLSS+K++RR+RVRGGNVKWRA RLDTGN+SWGSEAVTRKTR+LDVVYNASNNELVRTQTLVKS
Subjt:  MGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNFSWGSEAVTRKTRLLDVVYNASNNELVRTQTLVKS

Query:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDVGRKKKIAASAKKEEEG---DAATEEVKKSNHVQRKIEKRQQERKLDPHIEEQFTGGRLMACISSRPGQCGRADGYILE
        AIVQVDAAPFKQWYL HYGVD+GRKKK A +AKK+ EG   +A TEE KKSNHV RK+EKRQQ R LD HIEEQF  GRL+ACISSRPGQCGRADGYILE
Subjt:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDVGRKKKIAASAKKEEEG---DAATEEVKKSNHVQRKIEKRQQERKLDPHIEEQFTGGRLMACISSRPGQCGRADGYILE

Query:  GKELEFYMKKLQRKKGKGAGA
        GKELEFYMKKLQRKKGKGA A
Subjt:  GKELEFYMKKLQRKKGKGAGA

Q08069 40S ribosomal protein S81.1e-10084.62Show/hide
Query:  MGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNFSWGSEAVTRKTRLLDVVYNASNNELVRTQTLVKS
        MGISRDSMHKRRATGGK+KAWRKKRKYELGRQPANTKLSS+K++RR+RVRGGNVKWRA RLDTGN+SWGSEAVTRKTR+LDVVYNASNNELVRTQTLVKS
Subjt:  MGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNFSWGSEAVTRKTRLLDVVYNASNNELVRTQTLVKS

Query:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDVGRKKKIAASAKKEEEG---DAATEEVKKSNHVQRKIEKRQQERKLDPHIEEQFTGGRLMACISSRPGQCGRADGYILE
        AIVQVDAAPFKQWYL HYGVD+GRKKK  A+ K   EG   +AA EE KKSNHV RK+EKR++ R LDPHIEEQF  GRL+ACISSRPGQCGRADGYILE
Subjt:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDVGRKKKIAASAKKEEEG---DAATEEVKKSNHVQRKIEKRQQERKLDPHIEEQFTGGRLMACISSRPGQCGRADGYILE

Query:  GKELEFYMKKLQRKKGKGAGA
        GKELEFYMKKLQRKKGK A A
Subjt:  GKELEFYMKKLQRKKGKGAGA

Q93VG5 40S ribosomal protein S8-15.5e-9781.9Show/hide
Query:  MGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNFSWGSEAVTRKTRLLDVVYNASNNELVRTQTLVKS
        MGISRDS+HKRRATGGK+K WRKKRKYE+GRQPANTKLSS+K++RRIRVRGGNVKWRA RLDTGN+SWGSEA TRKTR+LDVVYNASNNELVRT+TLVKS
Subjt:  MGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNFSWGSEAVTRKTRLLDVVYNASNNELVRTQTLVKS

Query:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDVGRKKKIAASAKKE-EEGD----AATEEVKKSNHVQRKIEKRQQERKLDPHIEEQFTGGRLMACISSRPGQCGRADGYI
        AIVQVDAAPFKQWYL HYGV++GRKKK A+S KK+ EEG+    AA EEVKKSNH+ RKI  RQ+ R LD HIE+QF  GRL+ACISSRPGQCGRADGYI
Subjt:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDVGRKKKIAASAKKE-EEGD----AATEEVKKSNHVQRKIEKRQQERKLDPHIEEQFTGGRLMACISSRPGQCGRADGYI

Query:  LEGKELEFYMKKLQRKKGKGA
        LEGKELEFYMKK+Q+KKGKGA
Subjt:  LEGKELEFYMKKLQRKKGKGA

Q9FIF3 40S ribosomal protein S8-24.2e-9783.11Show/hide
Query:  MGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNFSWGSEAVTRKTRLLDVVYNASNNELVRTQTLVKS
        MGISRDS+HKRRATGGK+K WRKKRKYELGRQPANTKLSS+K++RRIRVRGGNVKWRA RLDTGNFSWGSEAVTRKTR+LDV YNASNNELVRTQTLVKS
Subjt:  MGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNFSWGSEAVTRKTRLLDVVYNASNNELVRTQTLVKS

Query:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDVGRKKKIAASAKKEEEGDAATEEVKKSNHVQRKIEKRQQERKLDPHIEEQFTGGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE
        AIVQVDAAPFKQ YLQHYGVD+GRKKK  A           TEEVKKSNHVQRK+E RQ+ R LD H+EEQF+ GRL+ACI+SRPGQCGRADGYILEGKE
Subjt:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDVGRKKKIAASAKKEEEGDAATEEVKKSNHVQRKIEKRQQERKLDPHIEEQFTGGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE

Query:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA
        LEFYMKKLQ+KKGK AGAA
Subjt:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT5G20290.1 Ribosomal protein S8e family protein3.9e-9881.9Show/hide
Query:  MGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNFSWGSEAVTRKTRLLDVVYNASNNELVRTQTLVKS
        MGISRDS+HKRRATGGK+K WRKKRKYE+GRQPANTKLSS+K++RRIRVRGGNVKWRA RLDTGN+SWGSEA TRKTR+LDVVYNASNNELVRT+TLVKS
Subjt:  MGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNFSWGSEAVTRKTRLLDVVYNASNNELVRTQTLVKS

Query:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDVGRKKKIAASAKKE-EEGD----AATEEVKKSNHVQRKIEKRQQERKLDPHIEEQFTGGRLMACISSRPGQCGRADGYI
        AIVQVDAAPFKQWYL HYGV++GRKKK A+S KK+ EEG+    AA EEVKKSNH+ RKI  RQ+ R LD HIE+QF  GRL+ACISSRPGQCGRADGYI
Subjt:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDVGRKKKIAASAKKE-EEGD----AATEEVKKSNHVQRKIEKRQQERKLDPHIEEQFTGGRLMACISSRPGQCGRADGYI

Query:  LEGKELEFYMKKLQRKKGKGA
        LEGKELEFYMKK+Q+KKGKGA
Subjt:  LEGKELEFYMKKLQRKKGKGA

AT5G59240.1 Ribosomal protein S8e family protein3.0e-9883.11Show/hide
Query:  MGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNFSWGSEAVTRKTRLLDVVYNASNNELVRTQTLVKS
        MGISRDS+HKRRATGGK+K WRKKRKYELGRQPANTKLSS+K++RRIRVRGGNVKWRA RLDTGNFSWGSEAVTRKTR+LDV YNASNNELVRTQTLVKS
Subjt:  MGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNFSWGSEAVTRKTRLLDVVYNASNNELVRTQTLVKS

Query:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDVGRKKKIAASAKKEEEGDAATEEVKKSNHVQRKIEKRQQERKLDPHIEEQFTGGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE
        AIVQVDAAPFKQ YLQHYGVD+GRKKK  A           TEEVKKSNHVQRK+E RQ+ R LD H+EEQF+ GRL+ACI+SRPGQCGRADGYILEGKE
Subjt:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDVGRKKKIAASAKKEEEGDAATEEVKKSNHVQRKIEKRQQERKLDPHIEEQFTGGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE

Query:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA
        LEFYMKKLQ+KKGK AGAA
Subjt:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGGTATTTCTCGGGATTCTATGCACAAGAGGCGTGCCACTGGAGGCAAGAAGAAGGCTTGGAGGAAGAAGAGAAAGTATGAGCTGGGAAGGCAACCTGCCAACACCAA
GCTATCAAGTGACAAGTCAATCAGGAGGATTAGAGTTCGTGGGGGAAATGTGAAGTGGCGTGCCTTTAGGCTCGATACTGGAAACTTCTCATGGGGTAGTGAGGCTGTGA
CCCGAAAGACCCGTCTTCTTGATGTGGTCTATAATGCCTCTAACAATGAGCTTGTCCGCACTCAAACTTTGGTGAAGAGTGCTATTGTTCAAGTTGATGCAGCACCATTT
AAGCAGTGGTATCTTCAGCATTATGGAGTGGATGTTGGACGGAAGAAGAAGATCGCAGCATCTGCTAAGAAGGAAGAGGAAGGTGATGCTGCCACTGAGGAAGTGAAGAA
GAGCAACCATGTCCAGCGCAAAATAGAGAAACGTCAGCAGGAACGTAAGCTCGATCCACATATTGAAGAACAATTCACCGGCGGTCGTTTGATGGCTTGTATCTCTTCAA
GACCGGGTCAATGTGGCCGAGCAGATGGATATATCTTGGAAGGCAAGGAGCTTGAATTCTACATGAAGAAGCTCCAAAGGAAGAAGGGAAAAGGAGCTGGTGCTGCCTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CATGATTTAATGCGTTTTGTTCTTTTCAAGATTTCTTCTTTGATTGCTGTGTTTTTTTGCTCACAGTTTCAGAATTTTGCTTGAATGTGAAATGCTAGAGTGATTTTTTG
TTCTTTATGTTCTTGGTGATTTACCATTTTAATTTAATTTTTATTGACATTCTGGATATATAATTTGCAATTTTTCACTATTTAGGTATTGATTTTCAGCTTTAGAATGT
AATTTTAGCATTATAAATTTTCCAGAGATCATTCTTATAGCAGTACCGGTTTCTGAGGTAATTGTTAAATTGATAGTTCAAATGAAATTGTTAAATAGTTCTTAGTACTT
TGTGATATTTGGAGCTTTAAGAGAGGTTTGAATTTGTTTGAAATTATTTTTGTAGTTCTTTTAAATCAGTTCATTGTAAATTTAATTTGTTTGCTAAAAAAGTTTGGTCA
TGGTTCATGTTCCCAAACGAAACTAAGCTGCCTAAGCCTTGTGATCTGCAGAAGCATCCTTGCCCGAGTAAAAAGAGTACTTGAATTCTAGTAAATATTTGGCCGAGTTG
AGAATAATAATTATGAAGTAAAATAAGTAGAAAATAGAGGTTTATTATAATTTCTTCAGGAGTTTGTTCCCAAGGGGTGGTACAGTGGTCGAAAACTTGGGCTTTGATGG
TATGATTCCTTCAAATTCTCAGGTTCGTGACTCACCTGTGACATTACTCCTTCGATGTCTCCCGGTGTTTGGCCTAGGGACGGGAATTGTTACCCTGGTTTCAAAAAAAA
ATTCTTTAGGAACCCCCTAGACCGTTCTTCACGTCAAGAGCTTTTGCCCGGTCAAGATGGGTATTTCTCGGGATTCTATGCACAAGAGGCGTGCCACTGGAGGCAAGAAG
AAGGCTTGGAGGAAGAAGAGAAAGTATGAGCTGGGAAGGCAACCTGCCAACACCAAGCTATCAAGTGACAAGTCAATCAGGAGGATTAGAGTTCGTGGGGGAAATGTGAA
GTGGCGTGCCTTTAGGCTCGATACTGGAAACTTCTCATGGGGTAGTGAGGCTGTGACCCGAAAGACCCGTCTTCTTGATGTGGTCTATAATGCCTCTAACAATGAGCTTG
TCCGCACTCAAACTTTGGTGAAGAGTGCTATTGTTCAAGTTGATGCAGCACCATTTAAGCAGTGGTATCTTCAGCATTATGGAGTGGATGTTGGACGGAAGAAGAAGATC
GCAGCATCTGCTAAGAAGGAAGAGGAAGGTGATGCTGCCACTGAGGAAGTGAAGAAGAGCAACCATGTCCAGCGCAAAATAGAGAAACGTCAGCAGGAACGTAAGCTCGA
TCCACATATTGAAGAACAATTCACCGGCGGTCGTTTGATGGCTTGTATCTCTTCAAGACCGGGTCAATGTGGCCGAGCAGATGGATATATCTTGGAAGGCAAGGAGCTTG
AATTCTACATGAAGAAGCTCCAAAGGAAGAAGGGAAAAGGAGCTGGTGCTGCCTAAATTTTGTTATCGAGTTATTTTCGGCCGGTGTTTAACGTTCCATTTTCTTCTAAC
AAAGACATCTGCTCTGTTGCAGCTGAGATGAAACGGCTATTTTGGAACTTCAGCTTTGCTGGTAATATTTGTTCAATTATAACTGTAGTCGTTTTCATGATAACAGATTG
TTTATTAGCTCAAGTTTTTCAAGTTACAATTTTTTCTTAGTCTATTTATGTAAGCGGATTAGTTTGGTTTGATCTAGAATTCACACAAGTACAAATGGATTCAAGGTCTC
ACTTGAGCATTTTTGTTATGCTTCCTAATTATAATTTATAGAGATTTCCTTACACTTTTAGTCCTTTCTATGTAGCTTTTCAATTGGTGAAGAATAATTGGATTGTAGTA
TTTTTATATGAAGTGGTCAGAAGTGTTGGACACAGATTATT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNFSWGSEAVTRKTRLLDVVYNASNNELVRTQTLVKSAIVQVDAAPF
KQWYLQHYGVDVGRKKKIAASAKKEEEGDAATEEVKKSNHVQRKIEKRQQERKLDPHIEEQFTGGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKELEFYMKKLQRKKGKGAGAA