; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Sed0017523 (gene) of Chayote v1 genome

Gene IDSed0017523
OrganismSechium edule (Chayote v1)
Descriptionmini zinc finger protein 2
Genome locationLG11:34225521..34226297
RNA-Seq ExpressionSed0017523
SyntenySed0017523
Gene Ontology termsGO:0006355 - regulation of transcription, DNA-templated (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0000976 - transcription regulatory region sequence-specific DNA binding (molecular function)
GO:0003700 - DNA-binding transcription factor activity (molecular function)
InterPro domainsIPR006456 - ZF-HD homeobox protein, Cys/His-rich dimerisation domain


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004148693.1 mini zinc finger protein 2 [Cucumis sativus]4.8e-3483.87Show/hide
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XP_016902406.1 PREDICTED: mini zinc finger protein 2 [Cucumis melo]9.3e-3886.6Show/hide
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XP_022134197.1 mini zinc finger protein 2-like [Momordica charantia]7.4e-3581.44Show/hide
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        MRKRQVV++R  EEPSR T ASSFTV SVRYGECQKNHAAGVGG+AVDGCREFMASGDEGT+  LTCAAC CHRNFH+RQVG EV CD S+ PSNGT
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XP_022989831.1 mini zinc finger protein 2-like [Cucurbita maxima]1.6e-3483.33Show/hide
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XP_038890678.1 mini zinc finger protein 2-like [Benincasa hispida]1.8e-3684.54Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KVJ7 Transcription factor2.3e-3483.87Show/hide
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A0A1S4E2E9 mini zinc finger protein 24.5e-3886.6Show/hide
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A0A5D3CUT9 Mini zinc finger protein 24.5e-3886.6Show/hide
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A0A6J1BYZ4 mini zinc finger protein 2-like3.6e-3581.44Show/hide
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A0A6J1JL94 mini zinc finger protein 2-like8.0e-3583.33Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
B8BIU8 Mini zinc finger protein 19.7e-2270Show/hide
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        VRY ECQ+NHAA +GGHAVDGCREFMASG EGT AAL CAAC CHR+FH+R+V    A CD S+  S+GT
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Q2Q493 Mini zinc finger protein 32.0e-2259.57Show/hide
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        M+KRQVV+K   +  S  T+ SS + +VRY ECQKNHAA +GG+AVDGCREFMASG +    ALTCAAC CHRNFH+R+V  EV C++S   +N
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Q2RB28 Mini zinc finger protein 19.7e-2270Show/hide
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Q9CA51 Mini zinc finger protein 13.9e-2358.76Show/hide
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        M+KRQ+V+K   R S   S  T  SS + S     VRY ECQKNHAA +GG+AVDGCREFMA+G EGT  AL CAAC CHRNFH+++V  EV C++S
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Q9LJW5 Mini zinc finger protein 24.4e-3070.71Show/hide
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        MRKRQVV++R S EEPSR  + ASS TV +VRYGECQKNHAA VGG+AVDGCREFMAS G+EGT AALTCAAC CHR+FH+R++  EV CD ++ PS G
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G18835.1 mini zinc finger1.4e-2359.57Show/hide
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AT1G74660.1 mini zinc finger 12.8e-2458.76Show/hide
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AT1G75240.1 homeobox protein 336.7e-1856.52Show/hide
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        S+ PS  +++++   +VRY EC KNHAA VGG   DGC EFM SG+EGT  AL CAAC CHRNFH++++
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AT2G18350.1 homeobox protein 248.7e-1858.06Show/hide
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        RY ECQKNHAA  GGH VDGC EFM+SG+EGT  +L CAAC CHR+FH++++      +F++
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AT3G28917.1 mini zinc finger 23.1e-3170.71Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAGGAAGCGCCAAGTTGTGGTTAAAAGATTATCAGAAGAACCCTCAAGAGAGACTGTGGCTTCATCTTTCACAGTGAGTGTTAGGTATGGGGAGTGTCAAAAGAACCA
TGCCGCCGGTGTCGGAGGGCACGCTGTCGATGGGTGTCGGGAATTCATGGCGAGTGGCGATGAAGGGACGACCGCTGCACTAACTTGCGCTGCATGCAGCTGCCACCGGA
ACTTCCATAAAAGACAAGTTGGAAATGAGGTAGCCTGTGATTTCTCTACATCTCCCTCAAATGGAACTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ACACAACCTTTCAAATTTGTGATATTTCATCTTTTTTTCAACCAAAAATTGCAGCTTTTCTTCCTATAAAACAAGACCTAACTAATTACAACAGCAACAAAGAAACTTTT
TTTTTTAGGGATCAAAGAAAATGAGGAAGCGCCAAGTTGTGGTTAAAAGATTATCAGAAGAACCCTCAAGAGAGACTGTGGCTTCATCTTTCACAGTGAGTGTTAGGTAT
GGGGAGTGTCAAAAGAACCATGCCGCCGGTGTCGGAGGGCACGCTGTCGATGGGTGTCGGGAATTCATGGCGAGTGGCGATGAAGGGACGACCGCTGCACTAACTTGCGC
TGCATGCAGCTGCCACCGGAACTTCCATAAAAGACAAGTTGGAAATGAGGTAGCCTGTGATTTCTCTACATCTCCCTCAAATGGAACTTGAAGATTACACATAATACTAT
GACTTCAATGTCTTTTTTAGGGTTTCATTTTTTTTTTTTTTTTGGGTGCTGAATATACAAATTTTCTATTCATGGGATTGAGAGTGGAGATTCACCTTGTTGTGTTGCTT
GATTTTTTTTTTTTTTTTTTGGTGTTGGGCCTGAGCTTGACTTGAACTGAAATTAATAATTATGTGTTTTGAACAAACTTGTGTATTTTGGGTTCTTGATGAAAGAAGCA
AGAACAAGAGAAATGAGTGTTTTCTTTTATTATTATTTTTTTTTTTCAGTTCATTTGAGGATTAAAAGTTATGTAAATATTTTCCATCATATCTCTTTTAAATTGTGTTT
GTATGAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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