; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Sed0017701 (gene) of Chayote v1 genome

Gene IDSed0017701
OrganismSechium edule (Chayote v1)
DescriptionRAB GTPase homolog A1F
Genome locationLG05:7533422..7535359
RNA-Seq ExpressionSed0017701
SyntenySed0017701
Gene Ontology termsGO:0005768 - endosome (cellular component)
GO:0003924 - GTPase activity (molecular function)
GO:0005525 - GTP binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001806 - Small GTPase
IPR005225 - Small GTP-binding protein domain
IPR027417 - P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_008455938.1 PREDICTED: ras-related protein RABA1f [Cucumis melo]9.3e-11093.55Show/hide
Query:  MGAYRTDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNMLSRFTRNEFSLETKSTIGVEFATRSIHVDDKIVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALIVYDVTRHVT
        MGAYR DDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSN+LSRFTRNEFSLETKSTIGVEFATRSI VDDKIVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALIVYDVTRHVT
Subjt:  MGAYRTDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNMLSRFTRNEFSLETKSTIGVEFATRSIHVDDKIVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALIVYDVTRHVT

Query:  FENVERWLKELRGHTDHNIVIMLVGNKADLRHLRAVSTDEAEAFAERERIYFMETSALESLNVENSFTEVLTQTYRVVSRKILDIGDDPTVLPKGKTVDI
        FENVERWLKELR HTDHNIVIMLVGNKADLRHLRAVST++A+AFAERER YFMETSALES NVENSFTEVLTQTYRVVSRKILDIGDDPTV PKG+T+DI
Subjt:  FENVERWLKELRGHTDHNIVIMLVGNKADLRHLRAVSTDEAEAFAERERIYFMETSALESLNVENSFTEVLTQTYRVVSRKILDIGDDPTVLPKGKTVDI

Query:  GSKDDVSAMKRAGCCSS
        GSKDDVSA+K+AGCCSS
Subjt:  GSKDDVSAMKRAGCCSS

XP_022140351.1 ras-related protein RABA1f-like [Momordica charantia]1.2e-10993.55Show/hide
Query:  MGAYRTDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNMLSRFTRNEFSLETKSTIGVEFATRSIHVDDKIVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALIVYDVTRHVT
        MGAYR DDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSN+LSRFTRNEFSLETKSTIGVEFATRSI VDDKIVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALIVYDVTRHVT
Subjt:  MGAYRTDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNMLSRFTRNEFSLETKSTIGVEFATRSIHVDDKIVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALIVYDVTRHVT

Query:  FENVERWLKELRGHTDHNIVIMLVGNKADLRHLRAVSTDEAEAFAERERIYFMETSALESLNVENSFTEVLTQTYRVVSRKILDIGDDPTVLPKGKTVDI
        FENVERWLKELRGHTD NIVIMLVGNKADLRHLRAVST++A+AFAERER YFMETSALES NVENSFTEVLTQTYRVVSRKILDIG+DPTVLPKG T+DI
Subjt:  FENVERWLKELRGHTDHNIVIMLVGNKADLRHLRAVSTDEAEAFAERERIYFMETSALESLNVENSFTEVLTQTYRVVSRKILDIGDDPTVLPKGKTVDI

Query:  GSKDDVSAMKRAGCCSS
        GSKDDVSA+K+AGCCSS
Subjt:  GSKDDVSAMKRAGCCSS

XP_022944131.1 ras-related protein RABA1f-like [Cucurbita moschata]2.9e-11194.47Show/hide
Query:  MGAYRTDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNMLSRFTRNEFSLETKSTIGVEFATRSIHVDDKIVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALIVYDVTRHVT
        MGAYR DDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSN+LSRFTRNEFSLETKSTIGVEFATRSI VDDKIVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALIVYDVTRHVT
Subjt:  MGAYRTDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNMLSRFTRNEFSLETKSTIGVEFATRSIHVDDKIVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALIVYDVTRHVT

Query:  FENVERWLKELRGHTDHNIVIMLVGNKADLRHLRAVSTDEAEAFAERERIYFMETSALESLNVENSFTEVLTQTYRVVSRKILDIGDDPTVLPKGKTVDI
        FENVERWLKELRGHTDHNIVIMLVGNKADLRHLRAVST++A+AFAERER YFMETSALES NVENSFTEVLTQTYRVVSRKILDIGDDPTVLPKG+T+DI
Subjt:  FENVERWLKELRGHTDHNIVIMLVGNKADLRHLRAVSTDEAEAFAERERIYFMETSALESLNVENSFTEVLTQTYRVVSRKILDIGDDPTVLPKGKTVDI

Query:  GSKDDVSAMKRAGCCSS
        GSKDDVSA+K+AGCCSS
Subjt:  GSKDDVSAMKRAGCCSS

XP_022986376.1 ras-related protein RABA1f-like [Cucurbita maxima]1.4e-11094.01Show/hide
Query:  MGAYRTDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNMLSRFTRNEFSLETKSTIGVEFATRSIHVDDKIVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALIVYDVTRHVT
        MGAYR DDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSN+LSRFTRNEFSLETKSTIGVEFATRSI VDDKIVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALIVYDVTRHVT
Subjt:  MGAYRTDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNMLSRFTRNEFSLETKSTIGVEFATRSIHVDDKIVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALIVYDVTRHVT

Query:  FENVERWLKELRGHTDHNIVIMLVGNKADLRHLRAVSTDEAEAFAERERIYFMETSALESLNVENSFTEVLTQTYRVVSRKILDIGDDPTVLPKGKTVDI
        FENVERWLKELRGHTDHNIVIMLVGNKADLRHLRAVS ++A+AFAERER YFMETSALES NVENSFTEVLTQTYRVVSRKILDIGDDPTVLPKG+T+DI
Subjt:  FENVERWLKELRGHTDHNIVIMLVGNKADLRHLRAVSTDEAEAFAERERIYFMETSALESLNVENSFTEVLTQTYRVVSRKILDIGDDPTVLPKGKTVDI

Query:  GSKDDVSAMKRAGCCSS
        GSKDDVSA+K+AGCCSS
Subjt:  GSKDDVSAMKRAGCCSS

XP_031736627.1 ras-related protein RABA1f [Cucumis sativus]1.4e-11094.01Show/hide
Query:  MGAYRTDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNMLSRFTRNEFSLETKSTIGVEFATRSIHVDDKIVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALIVYDVTRHVT
        MGAYR DDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSN+LSRFTRNEFSLETKSTIGVEFATRSI VDDKIVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALIVYDVTRHVT
Subjt:  MGAYRTDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNMLSRFTRNEFSLETKSTIGVEFATRSIHVDDKIVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALIVYDVTRHVT

Query:  FENVERWLKELRGHTDHNIVIMLVGNKADLRHLRAVSTDEAEAFAERERIYFMETSALESLNVENSFTEVLTQTYRVVSRKILDIGDDPTVLPKGKTVDI
        FENVERWLKELR HTDHNIVIMLVGNKADLRHLRAVST++A+AFAERER YFMETSALES NVENSFTEVLTQTYRVVSRKILDIGDDPTVLPKG+T+DI
Subjt:  FENVERWLKELRGHTDHNIVIMLVGNKADLRHLRAVSTDEAEAFAERERIYFMETSALESLNVENSFTEVLTQTYRVVSRKILDIGDDPTVLPKGKTVDI

Query:  GSKDDVSAMKRAGCCSS
        GSKDDVSA+K+AGCCSS
Subjt:  GSKDDVSAMKRAGCCSS

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LN26 Uncharacterized protein6.9e-11194.01Show/hide
Query:  MGAYRTDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNMLSRFTRNEFSLETKSTIGVEFATRSIHVDDKIVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALIVYDVTRHVT
        MGAYR DDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSN+LSRFTRNEFSLETKSTIGVEFATRSI VDDKIVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALIVYDVTRHVT
Subjt:  MGAYRTDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNMLSRFTRNEFSLETKSTIGVEFATRSIHVDDKIVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALIVYDVTRHVT

Query:  FENVERWLKELRGHTDHNIVIMLVGNKADLRHLRAVSTDEAEAFAERERIYFMETSALESLNVENSFTEVLTQTYRVVSRKILDIGDDPTVLPKGKTVDI
        FENVERWLKELR HTDHNIVIMLVGNKADLRHLRAVST++A+AFAERER YFMETSALES NVENSFTEVLTQTYRVVSRKILDIGDDPTVLPKG+T+DI
Subjt:  FENVERWLKELRGHTDHNIVIMLVGNKADLRHLRAVSTDEAEAFAERERIYFMETSALESLNVENSFTEVLTQTYRVVSRKILDIGDDPTVLPKGKTVDI

Query:  GSKDDVSAMKRAGCCSS
        GSKDDVSA+K+AGCCSS
Subjt:  GSKDDVSAMKRAGCCSS

A0A5D3CEB7 Ras-related protein RABA1f4.5e-11093.55Show/hide
Query:  MGAYRTDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNMLSRFTRNEFSLETKSTIGVEFATRSIHVDDKIVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALIVYDVTRHVT
        MGAYR DDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSN+LSRFTRNEFSLETKSTIGVEFATRSI VDDKIVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALIVYDVTRHVT
Subjt:  MGAYRTDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNMLSRFTRNEFSLETKSTIGVEFATRSIHVDDKIVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALIVYDVTRHVT

Query:  FENVERWLKELRGHTDHNIVIMLVGNKADLRHLRAVSTDEAEAFAERERIYFMETSALESLNVENSFTEVLTQTYRVVSRKILDIGDDPTVLPKGKTVDI
        FENVERWLKELR HTDHNIVIMLVGNKADLRHLRAVST++A+AFAERER YFMETSALES NVENSFTEVLTQTYRVVSRKILDIGDDPTV PKG+T+DI
Subjt:  FENVERWLKELRGHTDHNIVIMLVGNKADLRHLRAVSTDEAEAFAERERIYFMETSALESLNVENSFTEVLTQTYRVVSRKILDIGDDPTVLPKGKTVDI

Query:  GSKDDVSAMKRAGCCSS
        GSKDDVSA+K+AGCCSS
Subjt:  GSKDDVSAMKRAGCCSS

A0A6J1G637 ras-related protein RABA1f-like1.4e-11194.47Show/hide
Query:  MGAYRTDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNMLSRFTRNEFSLETKSTIGVEFATRSIHVDDKIVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALIVYDVTRHVT
        MGAYR DDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSN+LSRFTRNEFSLETKSTIGVEFATRSI VDDKIVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALIVYDVTRHVT
Subjt:  MGAYRTDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNMLSRFTRNEFSLETKSTIGVEFATRSIHVDDKIVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALIVYDVTRHVT

Query:  FENVERWLKELRGHTDHNIVIMLVGNKADLRHLRAVSTDEAEAFAERERIYFMETSALESLNVENSFTEVLTQTYRVVSRKILDIGDDPTVLPKGKTVDI
        FENVERWLKELRGHTDHNIVIMLVGNKADLRHLRAVST++A+AFAERER YFMETSALES NVENSFTEVLTQTYRVVSRKILDIGDDPTVLPKG+T+DI
Subjt:  FENVERWLKELRGHTDHNIVIMLVGNKADLRHLRAVSTDEAEAFAERERIYFMETSALESLNVENSFTEVLTQTYRVVSRKILDIGDDPTVLPKGKTVDI

Query:  GSKDDVSAMKRAGCCSS
        GSKDDVSA+K+AGCCSS
Subjt:  GSKDDVSAMKRAGCCSS

A0A6J1I4T0 ras-related protein RABA1f-like1.4e-11194.47Show/hide
Query:  MGAYRTDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNMLSRFTRNEFSLETKSTIGVEFATRSIHVDDKIVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALIVYDVTRHVT
        MGAYR DDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSN+LSRFTRNEFSLETKSTIGVEFATRSI VDDKIVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALIVYDVTRHVT
Subjt:  MGAYRTDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNMLSRFTRNEFSLETKSTIGVEFATRSIHVDDKIVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALIVYDVTRHVT

Query:  FENVERWLKELRGHTDHNIVIMLVGNKADLRHLRAVSTDEAEAFAERERIYFMETSALESLNVENSFTEVLTQTYRVVSRKILDIGDDPTVLPKGKTVDI
        FENVERWLKELRGHTDHNIVIMLVGNKADLRHLRAVST++A+AFAERER YFMETSALES NVENSFTEVLTQTYRVVSRKILDIGDDPTVLPKG+T+DI
Subjt:  FENVERWLKELRGHTDHNIVIMLVGNKADLRHLRAVSTDEAEAFAERERIYFMETSALESLNVENSFTEVLTQTYRVVSRKILDIGDDPTVLPKGKTVDI

Query:  GSKDDVSAMKRAGCCSS
        GSKDDVSA+K+AGCCSS
Subjt:  GSKDDVSAMKRAGCCSS

A0A6J1JAX5 ras-related protein RABA1f-like6.9e-11194.01Show/hide
Query:  MGAYRTDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNMLSRFTRNEFSLETKSTIGVEFATRSIHVDDKIVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALIVYDVTRHVT
        MGAYR DDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSN+LSRFTRNEFSLETKSTIGVEFATRSI VDDKIVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALIVYDVTRHVT
Subjt:  MGAYRTDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNMLSRFTRNEFSLETKSTIGVEFATRSIHVDDKIVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALIVYDVTRHVT

Query:  FENVERWLKELRGHTDHNIVIMLVGNKADLRHLRAVSTDEAEAFAERERIYFMETSALESLNVENSFTEVLTQTYRVVSRKILDIGDDPTVLPKGKTVDI
        FENVERWLKELRGHTDHNIVIMLVGNKADLRHLRAVS ++A+AFAERER YFMETSALES NVENSFTEVLTQTYRVVSRKILDIGDDPTVLPKG+T+DI
Subjt:  FENVERWLKELRGHTDHNIVIMLVGNKADLRHLRAVSTDEAEAFAERERIYFMETSALESLNVENSFTEVLTQTYRVVSRKILDIGDDPTVLPKGKTVDI

Query:  GSKDDVSAMKRAGCCSS
        GSKDDVSA+K+AGCCSS
Subjt:  GSKDDVSAMKRAGCCSS

SwissProt top hitse value%identityAlignment
O49513 Ras-related protein RABA1e1.3e-9879.63Show/hide
Query:  MGAYRTDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNMLSRFTRNEFSLETKSTIGVEFATRSIHVDDKIVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALIVYDVTRHVT
        MGAYR DDDYDYLFK+VLIGDSGVGKSN+LSRFTRNEFS+E+KSTIGVEFATRS+HVD+KI+KAQ+WDTAGQERYRAITSAYYRGAVGAL+VYD+TRH+T
Subjt:  MGAYRTDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNMLSRFTRNEFSLETKSTIGVEFATRSIHVDDKIVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALIVYDVTRHVT

Query:  FENVERWLKELRGHTDHNIVIMLVGNKADLRHLRAVSTDEAEAFAERERIYFMETSALESLNVENSFTEVLTQTYRVVSRKILDIGDDPTVLPKGKTVDI
        FENVERWLKELR HTD N+VIMLVGNKADLRHLRAV T+EA +F+ERE ++FMETSAL++ NVE +FT VLTQ YRV+SRK LD   DP  LPKG+T+DI
Subjt:  FENVERWLKELRGHTDHNIVIMLVGNKADLRHLRAVSTDEAEAFAERERIYFMETSALESLNVENSFTEVLTQTYRVVSRKILDIGDDPTVLPKGKTVDI

Query:  GSKDDVSAMKRAGCCS
        G+KDDV+A+K +GCCS
Subjt:  GSKDDVSAMKRAGCCS

Q40521 Ras-related protein Rab11B8.2e-10182.87Show/hide
Query:  GAYRTDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNMLSRFTRNEFSLETKSTIGVEFATRSIHVDDKIVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALIVYDVTRHVTF
        G YR +DDYDYLFK+VLIGDSGVGKSN+LSRF+RNEF+LE+KSTIGVEFATRSI VDDKIVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGAL+VYD+TRHVTF
Subjt:  GAYRTDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNMLSRFTRNEFSLETKSTIGVEFATRSIHVDDKIVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALIVYDVTRHVTF

Query:  ENVERWLKELRGHTDHNIVIMLVGNKADLRHLRAVSTDEAEAFAERERIYFMETSALESLNVENSFTEVLTQTYRVVSRKILDIGDDPTVLPKGKTVDIG
        ENVERWLKELR HTD NIVIMLVGNKADLRHLRAVST++A+AFAERE  +FMETSALESLNVEN+FTEVLT+ Y+VV RK L++GDDP  LPKG+T+++G
Subjt:  ENVERWLKELRGHTDHNIVIMLVGNKADLRHLRAVSTDEAEAFAERERIYFMETSALESLNVENSFTEVLTQTYRVVSRKILDIGDDPTVLPKGKTVDIG

Query:  SKDDVSAMKRAGCCSS
         KDDVSA+K+ GCCSS
Subjt:  SKDDVSAMKRAGCCSS

Q9FJH0 Ras-related protein RABA1f3.2e-10586.18Show/hide
Query:  MGAYRTDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNMLSRFTRNEFSLETKSTIGVEFATRSIHVDDKIVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALIVYDVTRHVT
        M AYR DD+YDYLFKVVLIGDSGVGKSN+LSRFTRNEFSLE+KSTIGVEFATRSIHVDDKIVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGAL+VYDVTRHVT
Subjt:  MGAYRTDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNMLSRFTRNEFSLETKSTIGVEFATRSIHVDDKIVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALIVYDVTRHVT

Query:  FENVERWLKELRGHTDHNIVIMLVGNKADLRHLRAVSTDEAEAFAERERIYFMETSALESLNVENSFTEVLTQTYRVVSRKILDIGDDPTVLPKGKTVDI
        FENVERWLKELR HTD NIVIM VGNKADLRHLRAVST++A+AFAERE  +FMETSALES+NVEN+FTEVL+Q YRVVSRK LDIGDDP  LPKG+T+++
Subjt:  FENVERWLKELRGHTDHNIVIMLVGNKADLRHLRAVSTDEAEAFAERERIYFMETSALESLNVENSFTEVLTQTYRVVSRKILDIGDDPTVLPKGKTVDI

Query:  GSKDDVSAMKRAGCCSS
        GSKDDVSA+K+ GCCS+
Subjt:  GSKDDVSAMKRAGCCSS

Q9LK99 Ras-related protein RABA1g2.5e-10283.87Show/hide
Query:  MGAYRTDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNMLSRFTRNEFSLETKSTIGVEFATRSIHVDDKIVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALIVYDVTRHVT
        M AYR DDDYD+L+KVVLIGDSGVGKSN+LSRFTRNEFSLE+KSTIGVEFATRSIHVD+KIVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGAL+VYDVTRHVT
Subjt:  MGAYRTDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNMLSRFTRNEFSLETKSTIGVEFATRSIHVDDKIVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALIVYDVTRHVT

Query:  FENVERWLKELRGHTDHNIVIMLVGNKADLRHLRAVSTDEAEAFAERERIYFMETSALESLNVENSFTEVLTQTYRVVSRKILDIGDDPTVLPKGKTVDI
        FENVERWLKELR HT+ NIVIMLVGNKADLRHLRAVST++A+AFAERE  +FMETSALE+LNVEN+FTEVL+Q YRV S+K LDIGDD T LPKG+++++
Subjt:  FENVERWLKELRGHTDHNIVIMLVGNKADLRHLRAVSTDEAEAFAERERIYFMETSALESLNVENSFTEVLTQTYRVVSRKILDIGDDPTVLPKGKTVDI

Query:  GSKDDVSAMKRAGCCSS
        GSKDDVS +K+ GCCSS
Subjt:  GSKDDVSAMKRAGCCSS

Q9S810 Ras-related protein RABA1i4.9e-9879.82Show/hide
Query:  MGAYRTDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNMLSRFTRNEFSLETKSTIGVEFATRSIHVDDKIVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALIVYDVTRHVT
        MGAYR +DDYDYLFKVVL GDSGVGKSN+LSRFTRN+FS ++++TIGVEFATRSI  DDKIVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGAL+VYDVTRHVT
Subjt:  MGAYRTDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNMLSRFTRNEFSLETKSTIGVEFATRSIHVDDKIVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALIVYDVTRHVT

Query:  FENVERWLKELRGHTDHNIVIMLVGNKADLRHLRAVSTDEAEAFAERERIYFMETSALESLNVENSFTEVLTQTYRVVSRKILDIGDDP-TVLPKGKTVD
        FENVERWLKELR HTD NIVIMLVGNKADLRHLRA+ST+EA+AFAERE  +FMETSALE++NV+N+FTEVLTQ YRVVS+K L+ GDDP T LPKG+ ++
Subjt:  FENVERWLKELRGHTDHNIVIMLVGNKADLRHLRAVSTDEAEAFAERERIYFMETSALESLNVENSFTEVLTQTYRVVSRKILDIGDDP-TVLPKGKTVD

Query:  IGSKDDVSAMKRAGCCSS
        +G +DD+SA+K+ GCCS+
Subjt:  IGSKDDVSAMKRAGCCSS

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G28550.1 RAB GTPase homolog A1I3.5e-9979.82Show/hide
Query:  MGAYRTDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNMLSRFTRNEFSLETKSTIGVEFATRSIHVDDKIVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALIVYDVTRHVT
        MGAYR +DDYDYLFKVVL GDSGVGKSN+LSRFTRN+FS ++++TIGVEFATRSI  DDKIVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGAL+VYDVTRHVT
Subjt:  MGAYRTDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNMLSRFTRNEFSLETKSTIGVEFATRSIHVDDKIVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALIVYDVTRHVT

Query:  FENVERWLKELRGHTDHNIVIMLVGNKADLRHLRAVSTDEAEAFAERERIYFMETSALESLNVENSFTEVLTQTYRVVSRKILDIGDDP-TVLPKGKTVD
        FENVERWLKELR HTD NIVIMLVGNKADLRHLRA+ST+EA+AFAERE  +FMETSALE++NV+N+FTEVLTQ YRVVS+K L+ GDDP T LPKG+ ++
Subjt:  FENVERWLKELRGHTDHNIVIMLVGNKADLRHLRAVSTDEAEAFAERERIYFMETSALESLNVENSFTEVLTQTYRVVSRKILDIGDDP-TVLPKGKTVD

Query:  IGSKDDVSAMKRAGCCSS
        +G +DD+SA+K+ GCCS+
Subjt:  IGSKDDVSAMKRAGCCSS

AT2G33870.1 RAB GTPase homolog A1H2.3e-9879.36Show/hide
Query:  MGAYRTDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNMLSRFTRNEFSLETKSTIGVEFATRSIHVDDKIVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALIVYDVTRHVT
        MG Y+ +DDYDYLFKVVL GDSGVGKSN+LSRFTRN+FS +++STIGVEFATRSI VDDKIVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGAL+VYDVTRHVT
Subjt:  MGAYRTDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNMLSRFTRNEFSLETKSTIGVEFATRSIHVDDKIVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALIVYDVTRHVT

Query:  FENVERWLKELRGHTDHNIVIMLVGNKADLRHLRAVSTDEAEAFAERERIYFMETSALESLNVENSFTEVLTQTYRVVSRKILDIGDDP-TVLPKGKTVD
        FENVERWLKELR HTD N VIMLVGNKADL HLRA+ST+E + FAERE  +FMETSALE++NVEN+FTEVLTQ YRVVS+K LD GDDP T LPKG+ ++
Subjt:  FENVERWLKELRGHTDHNIVIMLVGNKADLRHLRAVSTDEAEAFAERERIYFMETSALESLNVENSFTEVLTQTYRVVSRKILDIGDDP-TVLPKGKTVD

Query:  IGSKDDVSAMKRAGCCSS
        +GS+DDVSA+K++GCC++
Subjt:  IGSKDDVSAMKRAGCCSS

AT3G15060.1 RAB GTPase homolog A1G1.8e-10383.87Show/hide
Query:  MGAYRTDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNMLSRFTRNEFSLETKSTIGVEFATRSIHVDDKIVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALIVYDVTRHVT
        M AYR DDDYD+L+KVVLIGDSGVGKSN+LSRFTRNEFSLE+KSTIGVEFATRSIHVD+KIVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGAL+VYDVTRHVT
Subjt:  MGAYRTDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNMLSRFTRNEFSLETKSTIGVEFATRSIHVDDKIVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALIVYDVTRHVT

Query:  FENVERWLKELRGHTDHNIVIMLVGNKADLRHLRAVSTDEAEAFAERERIYFMETSALESLNVENSFTEVLTQTYRVVSRKILDIGDDPTVLPKGKTVDI
        FENVERWLKELR HT+ NIVIMLVGNKADLRHLRAVST++A+AFAERE  +FMETSALE+LNVEN+FTEVL+Q YRV S+K LDIGDD T LPKG+++++
Subjt:  FENVERWLKELRGHTDHNIVIMLVGNKADLRHLRAVSTDEAEAFAERERIYFMETSALESLNVENSFTEVLTQTYRVVSRKILDIGDDPTVLPKGKTVDI

Query:  GSKDDVSAMKRAGCCSS
        GSKDDVS +K+ GCCSS
Subjt:  GSKDDVSAMKRAGCCSS

AT4G18430.1 RAB GTPase homolog A1E9.3e-10079.63Show/hide
Query:  MGAYRTDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNMLSRFTRNEFSLETKSTIGVEFATRSIHVDDKIVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALIVYDVTRHVT
        MGAYR DDDYDYLFK+VLIGDSGVGKSN+LSRFTRNEFS+E+KSTIGVEFATRS+HVD+KI+KAQ+WDTAGQERYRAITSAYYRGAVGAL+VYD+TRH+T
Subjt:  MGAYRTDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNMLSRFTRNEFSLETKSTIGVEFATRSIHVDDKIVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALIVYDVTRHVT

Query:  FENVERWLKELRGHTDHNIVIMLVGNKADLRHLRAVSTDEAEAFAERERIYFMETSALESLNVENSFTEVLTQTYRVVSRKILDIGDDPTVLPKGKTVDI
        FENVERWLKELR HTD N+VIMLVGNKADLRHLRAV T+EA +F+ERE ++FMETSAL++ NVE +FT VLTQ YRV+SRK LD   DP  LPKG+T+DI
Subjt:  FENVERWLKELRGHTDHNIVIMLVGNKADLRHLRAVSTDEAEAFAERERIYFMETSALESLNVENSFTEVLTQTYRVVSRKILDIGDDPTVLPKGKTVDI

Query:  GSKDDVSAMKRAGCCS
        G+KDDV+A+K +GCCS
Subjt:  GSKDDVSAMKRAGCCS

AT5G60860.1 RAB GTPase homolog A1F2.3e-10686.18Show/hide
Query:  MGAYRTDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNMLSRFTRNEFSLETKSTIGVEFATRSIHVDDKIVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALIVYDVTRHVT
        M AYR DD+YDYLFKVVLIGDSGVGKSN+LSRFTRNEFSLE+KSTIGVEFATRSIHVDDKIVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGAL+VYDVTRHVT
Subjt:  MGAYRTDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNMLSRFTRNEFSLETKSTIGVEFATRSIHVDDKIVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALIVYDVTRHVT

Query:  FENVERWLKELRGHTDHNIVIMLVGNKADLRHLRAVSTDEAEAFAERERIYFMETSALESLNVENSFTEVLTQTYRVVSRKILDIGDDPTVLPKGKTVDI
        FENVERWLKELR HTD NIVIM VGNKADLRHLRAVST++A+AFAERE  +FMETSALES+NVEN+FTEVL+Q YRVVSRK LDIGDDP  LPKG+T+++
Subjt:  FENVERWLKELRGHTDHNIVIMLVGNKADLRHLRAVSTDEAEAFAERERIYFMETSALESLNVENSFTEVLTQTYRVVSRKILDIGDDPTVLPKGKTVDI

Query:  GSKDDVSAMKRAGCCSS
        GSKDDVSA+K+ GCCS+
Subjt:  GSKDDVSAMKRAGCCSS


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGGGGCGTACAGAACCGACGACGATTACGATTATTTGTTCAAGGTGGTGCTGATCGGCGATTCCGGGGTTGGGAAATCCAATATGCTGTCTCGTTTCACCAGAAATGA
ATTCAGCCTCGAAACCAAATCCACCATCGGCGTTGAGTTTGCTACCCGTAGTATTCACGTTGACGATAAGATCGTCAAGGCTCAAATTTGGGACACTGCCGGCCAAGAAA
GATATAGAGCGATCACGAGCGCGTACTACCGAGGTGCGGTGGGGGCATTGATAGTGTACGACGTGACACGACACGTGACATTCGAGAACGTGGAGAGATGGCTGAAGGAA
CTAAGAGGACACACTGATCACAACATAGTGATAATGCTGGTGGGGAACAAGGCAGACTTGCGCCACCTGAGGGCAGTGTCAACAGACGAGGCAGAGGCGTTCGCAGAGAG
AGAAAGAATATATTTCATGGAAACATCGGCACTCGAATCATTAAACGTCGAGAATTCATTCACCGAAGTCCTCACACAAACCTACCGAGTCGTTAGCAGGAAAATTCTTG
ACATCGGAGACGACCCGACCGTCCTCCCAAAGGGAAAGACCGTTGACATTGGCTCCAAAGATGATGTCTCTGCCATGAAGAGGGCTGGTTGCTGTTCTTCATAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
TAATAATATCCCACTTTTTTTAAAAAATTATGGGGGCGTACAGAACCGACGACGATTACGATTATTTGTTCAAGGTGGTGCTGATCGGCGATTCCGGGGTTGGGAAATCC
AATATGCTGTCTCGTTTCACCAGAAATGAATTCAGCCTCGAAACCAAATCCACCATCGGCGTTGAGTTTGCTACCCGTAGTATTCACGTTGACGATAAGATCGTCAAGGC
TCAAATTTGGGACACTGCCGGCCAAGAAAGATATAGAGCGATCACGAGCGCGTACTACCGAGGTGCGGTGGGGGCATTGATAGTGTACGACGTGACACGACACGTGACAT
TCGAGAACGTGGAGAGATGGCTGAAGGAACTAAGAGGACACACTGATCACAACATAGTGATAATGCTGGTGGGGAACAAGGCAGACTTGCGCCACCTGAGGGCAGTGTCA
ACAGACGAGGCAGAGGCGTTCGCAGAGAGAGAAAGAATATATTTCATGGAAACATCGGCACTCGAATCATTAAACGTCGAGAATTCATTCACCGAAGTCCTCACACAAAC
CTACCGAGTCGTTAGCAGGAAAATTCTTGACATCGGAGACGACCCGACCGTCCTCCCAAAGGGAAAGACCGTTGACATTGGCTCCAAAGATGATGTCTCTGCCATGAAGA
GGGCTGGTTGCTGTTCTTCATAACAAGTGAAAACTTTTGAGAGATTGGGATTTGGAACTCAATGTGGGTTTTGGTGATGTTTTTCTTTTTATGATATGGTTTTGTGTTTT
TGTTGGAAATGTTTAATGATGTGAGTGGCAGGTCAATGCATAAATTTATAGTGCTCTTTTGTTTAGGCAGGAATTTGATGGAGAGGGTTAGAAGAAGAATTCTATTGGGA
GGAAAGATATGGAAAAATGTAACAATATTATTTATTTATTGAATGGAATAAGC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MGAYRTDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNMLSRFTRNEFSLETKSTIGVEFATRSIHVDDKIVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALIVYDVTRHVTFENVERWLKE
LRGHTDHNIVIMLVGNKADLRHLRAVSTDEAEAFAERERIYFMETSALESLNVENSFTEVLTQTYRVVSRKILDIGDDPTVLPKGKTVDIGSKDDVSAMKRAGCCSS