| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| XP_022133034.1 serine/arginine-rich splicing factor SR45a isoform X1 [Momordica charantia] | 2.0e-97 | 87.24 | Show/hide |
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|
|
| XP_022926991.1 serine/arginine-rich splicing factor SR45a-like [Cucurbita moschata] | 5.8e-97 | 85.25 | Show/hide |
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| XP_022950652.1 serine/arginine-rich splicing factor SR45a [Cucurbita moschata] | 4.8e-99 | 85.08 | Show/hide |
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|
| XP_023003930.1 serine/arginine-rich splicing factor SR45a-like [Cucurbita maxima] | 2.4e-98 | 86.89 | Show/hide |
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YRG REYSP P Y GRSRRDHSRSPPYSPYGS D RYPRGSR
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| XP_038881911.1 serine/arginine-rich splicing factor SR45a [Benincasa hispida] | 2.4e-98 | 85.54 | Show/hide |
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|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A6J1BUT3 serine/arginine-rich splicing factor SR45a isoform X1 | 9.7e-98 | 87.24 | Show/hide |
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|
| A0A6J1EGF8 serine/arginine-rich splicing factor SR45a-like | 2.8e-97 | 85.25 | Show/hide |
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|
| A0A6J1GFF0 serine/arginine-rich splicing factor SR45a | 2.3e-99 | 85.08 | Show/hide |
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|
| A0A6J1INV2 serine/arginine-rich splicing factor SR45a | 2.3e-99 | 85.08 | Show/hide |
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YRG REY SPPPY GRSRRDHSRSPPYSPY GS DRRYPRGSR
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|
| A0A6J1KT61 serine/arginine-rich splicing factor SR45a-like | 1.1e-98 | 86.89 | Show/hide |
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YRG REYSP P Y GRSRRDHSRSPPYSPYGS D RYPRGSR
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| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| P62995 Transformer-2 protein homolog beta | 1.7e-19 | 43.6 | Show/hide |
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R SRS S R+ SRSRSR +RS SR RS RSRSRS+SR R S S R + N N L V GLS TERDL E FSK G
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+A +V + ++R SRGFAFV +N D A + N L+GR I V+ S KRP TPTPG Y+G ++R DY RG DRG D Y SYR
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G R + R R SP PY R R SRS YSP RRY
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|
|
| P62996 Transformer-2 protein homolog beta | 1.7e-19 | 43.6 | Show/hide |
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R SRS S R+ SRSRSR +RS SR RS RSRSRS+SR R S S R + N N L V GLS TERDL E FSK G
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+A +V + ++R SRGFAFV +N D A + N L+GR I V+ S KRP TPTPG Y+G ++R DY RG DRG D Y SYR
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G R + R R SP PY R R SRS YSP RRY
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|
|
| P62997 Transformer-2 protein homolog beta | 1.7e-19 | 43.6 | Show/hide |
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R SRS S R+ SRSRSR +RS SR RS RSRSRS+SR R S S R + N N L V GLS TERDL E FSK G
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+A +V + ++R SRGFAFV +N D A + N L+GR I V+ S KRP TPTPG Y+G ++R DY RG DRG D Y SYR
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G R + R R SP PY R R SRS YSP RRY
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|
|
| Q3ZBT6 Transformer-2 protein homolog beta | 1.7e-19 | 43.6 | Show/hide |
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R SRS S R+ SRSRSR +RS SR RS RSRSRS+SR R S S R + N N L V GLS TERDL E FSK G
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+A +V + ++R SRGFAFV +N D A + N L+GR I V+ S KRP TPTPG Y+G ++R DY RG DRG D Y SYR
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G R + R R SP PY R R SRS YSP RRY
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|
|
| Q84TH4 Serine/arginine-rich splicing factor SR45a | 1.7e-30 | 48.18 | Show/hide |
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PLR +RS S SR R R P R RS SR SRS +R +A N GN+LYVTGLS RVTERDLE+HF+KEGKV LV++P TR SRGF
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F++M + ANRC++ L+ S+L+GR ITVEK+RR+R RTPTPG YLGL+ AR Y R R R SY D YG R RS SP
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Query: -YRGPREYSP-----PPYVGRSRRDHSRSPPYSPYGSSDRRYPRGSR
YR R YSP P RRD S SP Y S R Y R R
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|
|
| Arabidopsis top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AT4G35785.1 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 6.5e-62 | 62.45 | Show/hide |
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D R+R SRSPSP + +RSRSRSRS SR R R RSRSRS RP S SR R RSRSR R N G TLYVTGLSTRVT++DLE HF+KEGKVASCFL
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V+EPRTR+SRGFAFVTM + A RC+K+LNQS+LEGRYITVE+SRRKRPRTPTPGHYLGLK++RDSD G RGR+ RDDY RRSPR
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R+YSP RSRRD S YSP+G S+RRY PRGSR
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|
|
| AT4G35785.2 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 1.0e-62 | 63.92 | Show/hide |
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D R+R SRSPSP + +RSRSRSRS SR R R RSRSRS RP SRSRGRSRSRSRGR E N G TLYVTGLSTRVT++DLE HF+KEGKVASC
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FLV+EPRTR+SRGFAFVTM + A RC+K+LNQS+LEGRYITVE+SRRKRPRTPTPGHYLGLK++RDSD G RGR+ RDDY RRSPR
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Query: PYRGPREYSPPPYVGRSRRDHSRSPPYSPYG------------SSDRRY-PRGSR
R+YSP RSRRD S YSP+G S+RRY PRGSR
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|
|
| AT4G35785.3 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 1.8e-43 | 71.92 | Show/hide |
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D R+R SRSPSP + +RSRSRSRS SR R R RSRSRS RP SRSRGRSRSRSRGR E N G TLYVTGLSTRVT++DLE HF+KEGKVASC
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FLV+EPRTR+SRGFAFVTM + A RC+K+LNQS+LEGRYITVE+
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|
|
| AT4G35785.4 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 7.0e-40 | 64.15 | Show/hide |
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D R+R SRSPSP + +RSRSRSRS SR R R RSRSRS RP SRSRGR RSRSR R N G TLYVTGLSTRVT++DL
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E HF+KEGKVASCFLV+EPRTR+SRGFAFVTM + A RC+K+LNQS+LEGRYITVE+
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|
|
| AT4G35785.5 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 7.0e-40 | 64.15 | Show/hide |
Query: DDSHRKRLSRSPSPLRAPSRSRSRSRSPSRPRSRPRSRSRSWSRP--RSRSRGR-------------SRSRSRGREENAHNTGNTLYVTGLSTRVTERDL
D R+R SRSPSP + +RSRSRSRS SR R R RSRSRS RP SRSRGR RSRSR R N G TLYVTGLSTRVT++DL
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Query: EEHFSKEGKVASCFLVVEPRTRISRGFAFVTMDNADGANRCVKHLNQSILEGRYITVEK
E HF+KEGKVASCFLV+EPRTR+SRGFAFVTM + A RC+K+LNQS+LEGRYITVE+
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