CuGenDBv2

Gene ID	Sed0018636
Organism	Sechium edule (Chayote v1)
Description	Protein of unknown function (DUF1218)
Genome location	LG13:25488850..25491958
RNA-Seq Expression	Sed0018636
Synteny	Sed0018636
Gene Ontology terms	GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domains	IPR009606 - Modifying wall lignin-1/2

Homology

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GenBank top hits

e value

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Alignment

XP_008466341.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103503778 [Cucumis melo]

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XP_022143257.1 uncharacterized protein LOC111013166 [Momordica charantia]

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XP_022143268.1 uncharacterized protein LOC111013177 [Momordica charantia]

1.6e-86

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XP_022937371.1 uncharacterized protein LOC111443679 [Cucurbita moschata]

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XP_038896871.1 uncharacterized protein LOC120085090 [Benincasa hispida]

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89.42

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TrEMBL top hits

e value

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A0A1S3CR11 uncharacterized protein LOC103503778

6.1e-87

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A0A5D3E6F5 Uncharacterized protein

6.1e-87

88.89

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A0A6J1CQA0 uncharacterized protein LOC111013166

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A0A6J1CQA7 uncharacterized protein LOC111013177

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88.89

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A0A6J1FA61 uncharacterized protein LOC111443679

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SwissProt top hits	e value	%identity	Alignment
No hits found

Arabidopsis top hits

e value

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Alignment

AT4G31130.1 Protein of unknown function (DUF1218)

4.2e-72

71.74

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        AL T+GLA++LL+WPT+TEQLHLTRNVH NL+T+CPTAKTGLLGGGAF+SLDS LFWLVALMLA NARED+F+E+E    +  +
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Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

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CCAAGACAAAGGCCTTGTTATCTGTCGATATCCGAGCGACCCAACTGTGGTCTTGGGTTATCTTTCCGTTCTATTTCTTCTTGGTTCTTCAATTGCAGGATACTTCTCTT
TGTTCTATCCTTACCACGGAAAATCCGTTCCTCGTGGTGCCATGTTTAAAAGCAGCAGTTTCTCTGCTTTCTTCAACATTGCTCTGTTCACAACTGGATTGGCTATAACT
TTGCTCGTATGGCCTACAGTGACCGAGCAACTTCACTTGACCCGCAATGTTCATCACAATCTCGATACAGCGTGCCCGACTGCCAAGACTGGCCTTTTGGGTGGTGGTGC
ATTTTTATCCCTTGATTCATCCCTCTTCTGGTTGGTTGCTTTGATGTTGGCTGGAAATGCTAGGGAGGACTACTTTGAAGAAATAGAGGAAAATGGAACCAATGCTGAAG
CCCTCAAGAGCAGCGCATGA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

AAAGAAACAAAAAGAAACTGTTTATTGTTTAATTCAAATATTTAAATGCGCTTCCCGAAATTAGGATAAACAATACGGAGCACTATAAATATCGGAACATTGACTCGTCT
CTTCAGTCAGTCTTTTCGATTTTTCAGGCAACTGGTAACATTCATCGAGAGATCAATGGCGGTGTCTGTCAAGATGATGTCTCTTACTGTCGCGGCTTTGGGTGTGATAT
CCTTTATCTTTGGAGTCATTGCTGAGAACAAGAAGCCTGCAGCTGGAACTCCCATCCAAGACAAAGGCCTTGTTATCTGTCGATATCCGAGCGACCCAACTGTGGTCTTG
GGTTATCTTTCCGTTCTATTTCTTCTTGGTTCTTCAATTGCAGGATACTTCTCTTTGTTCTATCCTTACCACGGAAAATCCGTTCCTCGTGGTGCCATGTTTAAAAGCAG
CAGTTTCTCTGCTTTCTTCAACATTGCTCTGTTCACAACTGGATTGGCTATAACTTTGCTCGTATGGCCTACAGTGACCGAGCAACTTCACTTGACCCGCAATGTTCATC
ACAATCTCGATACAGCGTGCCCGACTGCCAAGACTGGCCTTTTGGGTGGTGGTGCATTTTTATCCCTTGATTCATCCCTCTTCTGGTTGGTTGCTTTGATGTTGGCTGGA
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Protein sequence

Show/hide protein sequence

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LLVWPTVTEQLHLTRNVHHNLDTACPTAKTGLLGGGAFLSLDSSLFWLVALMLAGNAREDYFEEIEENGTNAEALKSSA

Sed0018636 (gene) of Chayote v1 genome