| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAG6575671.1 30S ribosomal protein 2, chloroplastic, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia] | 3.0e-104 | 82.56 | Show/hide |
Query: MASISSVLSSTNFIHSSKKPIEIPQKSPKQFFKPTPFHRRQTL------LQISAAKRPTRLFAVAEAAVAAQDSTSVAARKLYVGNIPRNVNNEELTRIV
MASISS+L+ N IHSS KP EIPQ QF +P FH R TL LQ SA KR TRLFAVAE AV+ QD +SVAARKLY+GNIPRNV NEELTRIV
Subjt: MASISSVLSSTNFIHSSKKPIEIPQKSPKQFFKPTPFHRRQTL------LQISAAKRPTRLFAVAEAAVAAQDSTSVAARKLYVGNIPRNVNNEELTRIV
Query: EEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNDTEVGGRTIKVNVTEKPLVNTVVDMSLLQAEESQFIDSPFKVYVGNLSSTVSTETLKN
EEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANA IEKLNDTEVGGRTIKVN+TEKPLVNT VDMSLLQA+ESQFIDSP+KVYVGN+SSTVSTETLKN
Subjt: EEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNDTEVGGRTIKVNVTEKPLVNTVVDMSLLQAEESQFIDSPFKVYVGNLSSTVSTETLKN
Query: LFAEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVETAVSSFNNAVLEGQAIRVNKA
F+EKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVE A+SSFNNA+LEGQ IRVNKA
Subjt: LFAEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVETAVSSFNNAVLEGQAIRVNKA
|
|
| XP_022954328.1 30S ribosomal protein 2, chloroplastic-like isoform X1 [Cucurbita moschata] | 1.4e-104 | 82.95 | Show/hide |
Query: MASISSVLSSTNFIHSSKKPIEIPQKSPKQFFKPTPFHRRQTL------LQISAAKRPTRLFAVAEAAVAAQDSTSVAARKLYVGNIPRNVNNEELTRIV
MASISS+L+ N IHSS KP EIPQ QF +P FH R TL LQ SA KR TRLFAVAEAAV+ QD +SVAARKLY+GNIPRNV NEELTRIV
Subjt: MASISSVLSSTNFIHSSKKPIEIPQKSPKQFFKPTPFHRRQTL------LQISAAKRPTRLFAVAEAAVAAQDSTSVAARKLYVGNIPRNVNNEELTRIV
Query: EEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNDTEVGGRTIKVNVTEKPLVNTVVDMSLLQAEESQFIDSPFKVYVGNLSSTVSTETLKN
EEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANA IEKLNDTEVGGRTIKVN+TEKPLVNT VDMSLLQA+ESQFIDSP+KVYVGN+SSTVSTETLKN
Subjt: EEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNDTEVGGRTIKVNVTEKPLVNTVVDMSLLQAEESQFIDSPFKVYVGNLSSTVSTETLKN
Query: LFAEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVETAVSSFNNAVLEGQAIRVNKA
F+EKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVE A+SSFNNA+LEGQ IRVNKA
Subjt: LFAEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVETAVSSFNNAVLEGQAIRVNKA
|
|
| XP_022954329.1 30S ribosomal protein 2, chloroplastic-like isoform X2 [Cucurbita moschata] | 1.4e-104 | 82.95 | Show/hide |
Query: MASISSVLSSTNFIHSSKKPIEIPQKSPKQFFKPTPFHRRQTL------LQISAAKRPTRLFAVAEAAVAAQDSTSVAARKLYVGNIPRNVNNEELTRIV
MASISS+L+ N IHSS KP EIPQ QF +P FH R TL LQ SA KR TRLFAVAEAAV+ QD +SVAARKLY+GNIPRNV NEELTRIV
Subjt: MASISSVLSSTNFIHSSKKPIEIPQKSPKQFFKPTPFHRRQTL------LQISAAKRPTRLFAVAEAAVAAQDSTSVAARKLYVGNIPRNVNNEELTRIV
Query: EEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNDTEVGGRTIKVNVTEKPLVNTVVDMSLLQAEESQFIDSPFKVYVGNLSSTVSTETLKN
EEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANA IEKLNDTEVGGRTIKVN+TEKPLVNT VDMSLLQA+ESQFIDSP+KVYVGN+SSTVSTETLKN
Subjt: EEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNDTEVGGRTIKVNVTEKPLVNTVVDMSLLQAEESQFIDSPFKVYVGNLSSTVSTETLKN
Query: LFAEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVETAVSSFNNAVLEGQAIRVNKA
F+EKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVE A+SSFNNA+LEGQ IRVNKA
Subjt: LFAEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVETAVSSFNNAVLEGQAIRVNKA
|
|
| XP_022991923.1 30S ribosomal protein 2, chloroplastic-like [Cucurbita maxima] | 1.0e-104 | 82.95 | Show/hide |
Query: MASISSVLSSTNFIHSSKKPIEIPQKSPKQFFKPTPFHRRQTL------LQISAAKRPTRLFAVAEAAVAAQDSTSVAARKLYVGNIPRNVNNEELTRIV
MASISS+L+ N IHSS KP EIPQ QF +P FH R TL LQ SA KR TRLFAVAEAAV+ QD +SVAARKLY+GNIPRNV NEELTRIV
Subjt: MASISSVLSSTNFIHSSKKPIEIPQKSPKQFFKPTPFHRRQTL------LQISAAKRPTRLFAVAEAAVAAQDSTSVAARKLYVGNIPRNVNNEELTRIV
Query: EEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNDTEVGGRTIKVNVTEKPLVNTVVDMSLLQAEESQFIDSPFKVYVGNLSSTVSTETLKN
EEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANA IEKLNDTEVGGRTIKVN+TEKPLVNT VDMSLLQA+ESQFIDSP+KVYVGN+SSTVSTETLKN
Subjt: EEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNDTEVGGRTIKVNVTEKPLVNTVVDMSLLQAEESQFIDSPFKVYVGNLSSTVSTETLKN
Query: LFAEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVETAVSSFNNAVLEGQAIRVNKA
F+EKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVE A+SSFNNA+LEGQ IRVNKA
Subjt: LFAEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVETAVSSFNNAVLEGQAIRVNKA
|
|
| XP_023548333.1 30S ribosomal protein 2, chloroplastic-like [Cucurbita pepo subsp. pepo] | 2.6e-103 | 82.17 | Show/hide |
Query: MASISSVLSSTNFIHSSKKPIEIPQKSPKQFFKPTPFHRRQTL------LQISAAKRPTRLFAVAEAAVAAQDSTSVAARKLYVGNIPRNVNNEELTRIV
MASISS+L+ N I SS KP EIPQ QF +P FH R TL LQ SA KR TRLFAVAEAAV+ QD +SVAARKLY+GNIPRNV NEELTRIV
Subjt: MASISSVLSSTNFIHSSKKPIEIPQKSPKQFFKPTPFHRRQTL------LQISAAKRPTRLFAVAEAAVAAQDSTSVAARKLYVGNIPRNVNNEELTRIV
Query: EEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNDTEVGGRTIKVNVTEKPLVNTVVDMSLLQAEESQFIDSPFKVYVGNLSSTVSTETLKN
EEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANA IEKLNDTEVGGRTIKVN+TEKPLVNT VDMSLLQA+ESQFIDSP+KVYVGN+SSTVST+TLKN
Subjt: EEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNDTEVGGRTIKVNVTEKPLVNTVVDMSLLQAEESQFIDSPFKVYVGNLSSTVSTETLKN
Query: LFAEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVETAVSSFNNAVLEGQAIRVNKA
F+EKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVE A+SSFNNA+LEGQ IRVNKA
Subjt: LFAEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVETAVSSFNNAVLEGQAIRVNKA
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A5A7UYL6 30S ribosomal protein 2 | 2.9e-100 | 80.71 | Show/hide |
Query: MASISSVLSSTNFIHSSKKPIEIPQKSPKQFFKPTPFHRRQTLLQIS--AAKRPTRLFAVAEAAVAAQDSTSVAARKLYVGNIPRNVNNEELTRIVEEHG
MASISS+L+ TN IH+SKKP EI Q QF +P FH LL+IS AA+ PTRLFAVAEA A Q ++SVA RKLY+GNIPRNVNNEELTRIV+EHG
Subjt: MASISSVLSSTNFIHSSKKPIEIPQKSPKQFFKPTPFHRRQTLLQIS--AAKRPTRLFAVAEAAVAAQDSTSVAARKLYVGNIPRNVNNEELTRIVEEHG
Query: AVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNDTEVGGRTIKVNVTEKPLVNTVVDMSLLQAEESQFIDSPFKVYVGNLSSTVSTETLKNLFAE
AVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTV+DANAAIEKLN+TEVGGR IKVN+TEKP+VNT VD+S+LQAEESQFIDSP+KVYVGN+SSTVSTETLKN F+E
Subjt: AVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNDTEVGGRTIKVNVTEKPLVNTVVDMSLLQAEESQFIDSPFKVYVGNLSSTVSTETLKNLFAE
Query: KGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVETAVSSFNNAVLEGQAIRVNKA
KGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVE A+SSFNNA+LEGQ IRVNKA
Subjt: KGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVETAVSSFNNAVLEGQAIRVNKA
|
|
| A0A6J1DHV7 30S ribosomal protein 2, chloroplastic | 8.9e-102 | 79.92 | Show/hide |
Query: MASISSVLSSTNFIHSSKKPIEIPQKSPKQFFKPTPFHRR------QTLLQISAAKRPTRLFAVAEAAVAAQDSTSVAARKLYVGNIPRNVNNEELTRIV
MAS+SS+LS N IHSS KP E P K QF +P FHRR ++LQ SAAK RLFAVAEAAV AQD +S AAR+LY+GNIPRNV+NE+LTRIV
Subjt: MASISSVLSSTNFIHSSKKPIEIPQKSPKQFFKPTPFHRR------QTLLQISAAKRPTRLFAVAEAAVAAQDSTSVAARKLYVGNIPRNVNNEELTRIV
Query: EEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNDTEVGGRTIKVNVTEKPLVNTV-VDMSLLQAEESQFIDSPFKVYVGNLSSTVSTETLK
EEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANA IEKLN+TEV GRTIKVN+TEKPLV T VD+SLLQAEESQFIDSP+KVYVGN+SSTVSTETLK
Subjt: EEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNDTEVGGRTIKVNVTEKPLVNTV-VDMSLLQAEESQFIDSPFKVYVGNLSSTVSTETLK
Query: NLFAEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVETAVSSFNNAVLEGQAIRVNKA
LF+EKG VLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVETA+SSFNNA+LEGQAIRVNKA
Subjt: NLFAEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVETAVSSFNNAVLEGQAIRVNKA
|
|
| A0A6J1GQT6 30S ribosomal protein 2, chloroplastic-like isoform X1 | 6.6e-105 | 82.95 | Show/hide |
Query: MASISSVLSSTNFIHSSKKPIEIPQKSPKQFFKPTPFHRRQTL------LQISAAKRPTRLFAVAEAAVAAQDSTSVAARKLYVGNIPRNVNNEELTRIV
MASISS+L+ N IHSS KP EIPQ QF +P FH R TL LQ SA KR TRLFAVAEAAV+ QD +SVAARKLY+GNIPRNV NEELTRIV
Subjt: MASISSVLSSTNFIHSSKKPIEIPQKSPKQFFKPTPFHRRQTL------LQISAAKRPTRLFAVAEAAVAAQDSTSVAARKLYVGNIPRNVNNEELTRIV
Query: EEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNDTEVGGRTIKVNVTEKPLVNTVVDMSLLQAEESQFIDSPFKVYVGNLSSTVSTETLKN
EEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANA IEKLNDTEVGGRTIKVN+TEKPLVNT VDMSLLQA+ESQFIDSP+KVYVGN+SSTVSTETLKN
Subjt: EEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNDTEVGGRTIKVNVTEKPLVNTVVDMSLLQAEESQFIDSPFKVYVGNLSSTVSTETLKN
Query: LFAEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVETAVSSFNNAVLEGQAIRVNKA
F+EKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVE A+SSFNNA+LEGQ IRVNKA
Subjt: LFAEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVETAVSSFNNAVLEGQAIRVNKA
|
|
| A0A6J1GSN8 30S ribosomal protein 2, chloroplastic-like isoform X2 | 6.6e-105 | 82.95 | Show/hide |
Query: MASISSVLSSTNFIHSSKKPIEIPQKSPKQFFKPTPFHRRQTL------LQISAAKRPTRLFAVAEAAVAAQDSTSVAARKLYVGNIPRNVNNEELTRIV
MASISS+L+ N IHSS KP EIPQ QF +P FH R TL LQ SA KR TRLFAVAEAAV+ QD +SVAARKLY+GNIPRNV NEELTRIV
Subjt: MASISSVLSSTNFIHSSKKPIEIPQKSPKQFFKPTPFHRRQTL------LQISAAKRPTRLFAVAEAAVAAQDSTSVAARKLYVGNIPRNVNNEELTRIV
Query: EEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNDTEVGGRTIKVNVTEKPLVNTVVDMSLLQAEESQFIDSPFKVYVGNLSSTVSTETLKN
EEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANA IEKLNDTEVGGRTIKVN+TEKPLVNT VDMSLLQA+ESQFIDSP+KVYVGN+SSTVSTETLKN
Subjt: EEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNDTEVGGRTIKVNVTEKPLVNTVVDMSLLQAEESQFIDSPFKVYVGNLSSTVSTETLKN
Query: LFAEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVETAVSSFNNAVLEGQAIRVNKA
F+EKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVE A+SSFNNA+LEGQ IRVNKA
Subjt: LFAEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVETAVSSFNNAVLEGQAIRVNKA
|
|
| A0A6J1JXN0 30S ribosomal protein 2, chloroplastic-like | 5.0e-105 | 82.95 | Show/hide |
Query: MASISSVLSSTNFIHSSKKPIEIPQKSPKQFFKPTPFHRRQTL------LQISAAKRPTRLFAVAEAAVAAQDSTSVAARKLYVGNIPRNVNNEELTRIV
MASISS+L+ N IHSS KP EIPQ QF +P FH R TL LQ SA KR TRLFAVAEAAV+ QD +SVAARKLY+GNIPRNV NEELTRIV
Subjt: MASISSVLSSTNFIHSSKKPIEIPQKSPKQFFKPTPFHRRQTL------LQISAAKRPTRLFAVAEAAVAAQDSTSVAARKLYVGNIPRNVNNEELTRIV
Query: EEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNDTEVGGRTIKVNVTEKPLVNTVVDMSLLQAEESQFIDSPFKVYVGNLSSTVSTETLKN
EEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANA IEKLNDTEVGGRTIKVN+TEKPLVNT VDMSLLQA+ESQFIDSP+KVYVGN+SSTVSTETLKN
Subjt: EEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNDTEVGGRTIKVNVTEKPLVNTVVDMSLLQAEESQFIDSPFKVYVGNLSSTVSTETLKN
Query: LFAEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVETAVSSFNNAVLEGQAIRVNKA
F+EKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVE A+SSFNNA+LEGQ IRVNKA
Subjt: LFAEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVETAVSSFNNAVLEGQAIRVNKA
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| P19684 33 kDa ribonucleoprotein, chloroplastic | 4.6e-31 | 40.64 | Show/hide |
Query: DSTSVAARKLYVGNIPRNVNNEELTRIVEEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNDTEVGGRTIKVNVTEKPLVNTVVDMSL-LQ
+S SV +LYVGN+P ++ + +L+ I E G V E++YD+ + RSR FAFVTM +V++A AI + ++VGGRT+KVN E P MS ++
Subjt: DSTSVAARKLYVGNIPRNVNNEELTRIVEEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNDTEVGGRTIKVNVTEKPLVNTVVDMSL-LQ
Query: AEESQFIDSPFKVYVGNLSSTVSTETLKNLFAEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVETAVSSFNNAVLEGQAIRVNKA
+ F+DSP K+YV NLS ++++ L++ FA++ +SAKV + +S G+GF+TFSS E + +A+ + N LEG+ +R+N A
Subjt: AEESQFIDSPFKVYVGNLSSTVSTETLKNLFAEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVETAVSSFNNAVLEGQAIRVNKA
|
|
| P28644 28 kDa ribonucleoprotein, chloroplastic | 4.8e-28 | 43.26 | Show/hide |
Query: KLYVGNIPRNVNNEELTRIVEEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNDTEVGGRTIKVNVTEKPLVNTVVDMSLLQAEESQFIDS
KL+VGN+P +V++E+L I + G VE AEV+Y++ + RSR F FVTM TV++A A+E LN ++ GR + VN S +A F +
Subjt: KLYVGNIPRNVNNEELTRIVEEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNDTEVGGRTIKVNVTEKPLVNTVVDMSLLQAEESQFIDS
Query: PFKVYVGNLSSTVSTETLKNLFAEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVETAVSSFNNAVLEGQAIRVNKA
+VYVGNL V T L+ LF+E GKV+SA+V T +S G+GFVT SSE EV A+++ + L+G+A+RVN A
Subjt: PFKVYVGNLSSTVSTETLKNLFAEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVETAVSSFNNAVLEGQAIRVNKA
|
|
| P82277 30S ribosomal protein 2, chloroplastic | 1.1e-69 | 69.07 | Show/hide |
Query: AEAAVAAQDSTSVAARKLYVGNIPRNVNNEELTRIVEEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNDTEVGGRTIKVNVTEKPLVNTV
+ ++ A+ S AR+LYVGNIPRN+NN+EL IVEEHGA+E AEVMYDKYSGRSRRF FVTMKTV+DANA IEKLNDTE+GGR IKVN+TEKPL
Subjt: AEAAVAAQDSTSVAARKLYVGNIPRNVNNEELTRIVEEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNDTEVGGRTIKVNVTEKPLVNTV
Query: VDMSLLQAEESQFIDSPFKVYVGNLSSTVSTETLKNLFAEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVETAVSSFNNAVLEGQAIRVNKA
+D++ QAE+SQF++SP+KVY+GNL+ TV+ E LK+ F+EKGKVL AKV R PGTSKS+G+GFV+FSSEEEVE A+ + NN+VLEGQ IRVNKA
Subjt: VDMSLLQAEESQFIDSPFKVYVGNLSSTVSTETLKNLFAEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVETAVSSFNNAVLEGQAIRVNKA
|
|
| Q39061 RNA-binding protein CP33, chloroplastic | 6.1e-31 | 39.11 | Show/hide |
Query: KLYVGNIPRNVNNEELTRIVEEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNDTEVGGRTIKVNVTEKPL-VNTVVDMSLLQAEESQFID
+LYVGN+P + + EL++I E G V +++YDK + RSR F FVTM ++++A A++ N +++GGRT+KVN E P V + ++ ++D
Subjt: KLYVGNIPRNVNNEELTRIVEEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNDTEVGGRTIKVNVTEKPL-VNTVVDMSLLQAEESQFID
Query: SPFKVYVGNLSSTVSTETLKNLFAEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVETAVSSFNNAVLEGQAIRVNKA
SP KVY GNL ++++ LK+ F ++ VL AKV T +S G+GF++F S E V++A+++ N +EG+A+R+N A
Subjt: SPFKVYVGNLSSTVSTETLKNLFAEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVETAVSSFNNAVLEGQAIRVNKA
|
|
| Q8VYM4 30S ribosomal protein 2, chloroplastic | 2.1e-68 | 68.39 | Show/hide |
Query: EAAVAAQDSTSVAARKLYVGNIPRNVNNEELTRIVEEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNDTEVGGRTIKVNVTEKPLVNTVV
E AA D +S AAR++Y+GNIPR V NE+LT++VEEHGAVEK +VMYDKYSGRSRRF F TMK+V+DANA +EKLN V GR IKVN+TEKP+ ++
Subjt: EAAVAAQDSTSVAARKLYVGNIPRNVNNEELTRIVEEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNDTEVGGRTIKVNVTEKPLVNTVV
Query: DMSLLQAEESQFIDSPFKVYVGNLSSTVSTETLKNLFAEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVETAVSSFNNAVLEGQAIRVNKA
D+S+LQ+E+S F+DSP+KVYVGNL+ TV+ E L+NLF+EKGKV+SAKVSRVPGTSKS+G+GFVTFSSEE+VE A+ + NN++LEGQ IRVNKA
Subjt: DMSLLQAEESQFIDSPFKVYVGNLSSTVSTETLKNLFAEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVETAVSSFNNAVLEGQAIRVNKA
|
|
| Arabidopsis top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AT1G60000.1 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 3.3e-32 | 41.97 | Show/hide |
Query: EAAVAAQDSTSVAARKLYVGNIPRNVNNEELTRIVEEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNDTEVGGRTIKVNVTEKPLVNTVV
+ A A D + KLY GN+P NV++ L +I+++ E EV+Y++ +G+SR FAFVTM V+D N I+ L+ TE GR +KVN +KP N
Subjt: EAAVAAQDSTSVAARKLYVGNIPRNVNNEELTRIVEEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNDTEVGGRTIKVNVTEKPLVNTVV
Query: DMSLLQAEESQFIDSPFKVYVGNLSSTVSTETLKNLFAEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVETAVSSFNNAVLEGQAIRVNKA
+E + ++ K++VGNLS TV++E+L F E G V+ A+V T +S GYGFV +SS+ E+ETA+ S + LEG+AIRVN A
Subjt: DMSLLQAEESQFIDSPFKVYVGNLSSTVSTETLKNLFAEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVETAVSSFNNAVLEGQAIRVNKA
|
|
| AT3G52150.1 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 1.5e-69 | 68.39 | Show/hide |
Query: EAAVAAQDSTSVAARKLYVGNIPRNVNNEELTRIVEEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNDTEVGGRTIKVNVTEKPLVNTVV
E AA D +S AAR++Y+GNIPR V NE+LT++VEEHGAVEK +VMYDKYSGRSRRF F TMK+V+DANA +EKLN V GR IKVN+TEKP+ ++
Subjt: EAAVAAQDSTSVAARKLYVGNIPRNVNNEELTRIVEEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNDTEVGGRTIKVNVTEKPLVNTVV
Query: DMSLLQAEESQFIDSPFKVYVGNLSSTVSTETLKNLFAEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVETAVSSFNNAVLEGQAIRVNKA
D+S+LQ+E+S F+DSP+KVYVGNL+ TV+ E L+NLF+EKGKV+SAKVSRVPGTSKS+G+GFVTFSSEE+VE A+ + NN++LEGQ IRVNKA
Subjt: DMSLLQAEESQFIDSPFKVYVGNLSSTVSTETLKNLFAEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVETAVSSFNNAVLEGQAIRVNKA
|
|
| AT3G52150.2 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 1.5e-69 | 68.39 | Show/hide |
Query: EAAVAAQDSTSVAARKLYVGNIPRNVNNEELTRIVEEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNDTEVGGRTIKVNVTEKPLVNTVV
E AA D +S AAR++Y+GNIPR V NE+LT++VEEHGAVEK +VMYDKYSGRSRRF F TMK+V+DANA +EKLN V GR IKVN+TEKP+ ++
Subjt: EAAVAAQDSTSVAARKLYVGNIPRNVNNEELTRIVEEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNDTEVGGRTIKVNVTEKPLVNTVV
Query: DMSLLQAEESQFIDSPFKVYVGNLSSTVSTETLKNLFAEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVETAVSSFNNAVLEGQAIRVNKA
D+S+LQ+E+S F+DSP+KVYVGNL+ TV+ E L+NLF+EKGKV+SAKVSRVPGTSKS+G+GFVTFSSEE+VE A+ + NN++LEGQ IRVNKA
Subjt: DMSLLQAEESQFIDSPFKVYVGNLSSTVSTETLKNLFAEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVETAVSSFNNAVLEGQAIRVNKA
|
|
| AT3G52380.1 chloroplast RNA-binding protein 33 | 4.3e-32 | 39.11 | Show/hide |
Query: KLYVGNIPRNVNNEELTRIVEEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNDTEVGGRTIKVNVTEKPL-VNTVVDMSLLQAEESQFID
+LYVGN+P + + EL++I E G V +++YDK + RSR F FVTM ++++A A++ N +++GGRT+KVN E P V + ++ ++D
Subjt: KLYVGNIPRNVNNEELTRIVEEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNDTEVGGRTIKVNVTEKPL-VNTVVDMSLLQAEESQFID
Query: SPFKVYVGNLSSTVSTETLKNLFAEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVETAVSSFNNAVLEGQAIRVNKA
SP KVY GNL ++++ LK+ F ++ VL AKV T +S G+GF++F S E V++A+++ N +EG+A+R+N A
Subjt: SPFKVYVGNLSSTVSTETLKNLFAEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVETAVSSFNNAVLEGQAIRVNKA
|
|
| AT5G50250.1 chloroplast RNA-binding protein 31B | 7.6e-29 | 39.89 | Show/hide |
Query: KLYVGNIPRNVNNEELTRIVEEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNDTEVGGRTIKVNVTEKPLVNTVVDMSLLQAEESQFIDS
KL+VGN+P +V+++ L + E+ G VE +EV+Y++ + +SR F FVTM TV++A A+EK N EV GR + VN + + D+
Subjt: KLYVGNIPRNVNNEELTRIVEEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNDTEVGGRTIKVNVTEKPLVNTVVDMSLLQAEESQFIDS
Query: PFKVYVGNLSSTVSTETLKNLFAEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVETAVSSFNNAVLEGQAIRVNKA
F++YVGNL V + L+ LF+E GKV+ A+V T +S G+GFV S+E EV A+++ + LEG+AI+VN A
Subjt: PFKVYVGNLSSTVSTETLKNLFAEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVETAVSSFNNAVLEGQAIRVNKA
|
|
