; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Sed0019160 (gene) of Chayote v1 genome

Gene IDSed0019160
OrganismSechium edule (Chayote v1)
Descriptionphotosystem I reaction center subunit N, chloroplastic
Genome locationLG14:2583522..2585790
RNA-Seq ExpressionSed0019160
SyntenySed0019160
Gene Ontology termsGO:0015979 - photosynthesis (biological process)
GO:0030093 - chloroplast photosystem I (cellular component)
InterPro domainsIPR008796 - Photosystem I reaction centre subunit N, chloroplastic
IPR044907 - Photosystem I reaction centre subunit N superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6595132.1 Photosystem I reaction center subunit N, chloroplastic, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]2.3e-7184.39Show/hide
Query:  MATVNSSVLACSHAIAGAGSSELSSKLSATPLPSVASVSGYKLAAIMAQQARVPEAKNEGRRTTLLLLGASLFAAASASASSDSEANAGVIDDYLEKSKA
        MAT+NSSVLAC++AI+GAGS+EL+SKLSA    +   VSGYKL AI AQQARVPE+KNEGRRT LL LGASLFAA  A+ASS+S ANAGVI++YLEKSKA
Subjt:  MATVNSSVLACSHAIAGAGSSELSSKLSATPLPSVASVSGYKLAAIMAQQARVPEAKNEGRRTTLLLLGASLFAAASASASSDSEANAGVIDDYLEKSKA

Query:  NKELNDKKRLATSGANFARAYTVQFGTCKFPENFTGCQDLAKQKKVPFISDDLELECEGKDKYKCGSNVFWKW
        NKELNDKKRLATSGANFARAYTVQFG+CKFPENFTGCQDLAKQKKVPFISDDLELECEGKDKYKCGSNVFWKW
Subjt:  NKELNDKKRLATSGANFARAYTVQFGTCKFPENFTGCQDLAKQKKVPFISDDLELECEGKDKYKCGSNVFWKW

XP_022963255.1 photosystem I reaction center subunit N, chloroplastic-like isoform X1 [Cucurbita moschata]3.0e-7184.39Show/hide
Query:  MATVNSSVLACSHAIAGAGSSELSSKLSATPLPSVASVSGYKLAAIMAQQARVPEAKNEGRRTTLLLLGASLFAAASASASSDSEANAGVIDDYLEKSKA
        MAT+NSSVLAC++AI+GAGS+EL+SKLSA    +   VSGYKL AI A+QARVPEAKNEGRRT LL LGASLFAA  A+ASS+S ANAGVI++YLEKSKA
Subjt:  MATVNSSVLACSHAIAGAGSSELSSKLSATPLPSVASVSGYKLAAIMAQQARVPEAKNEGRRTTLLLLGASLFAAASASASSDSEANAGVIDDYLEKSKA

Query:  NKELNDKKRLATSGANFARAYTVQFGTCKFPENFTGCQDLAKQKKVPFISDDLELECEGKDKYKCGSNVFWKW
        NKELNDKKRLATSGANFARAYTVQFG+CKFPENFTGCQDLAKQKKVPFISDDLELECEGKDKYKCGSNVFWKW
Subjt:  NKELNDKKRLATSGANFARAYTVQFGTCKFPENFTGCQDLAKQKKVPFISDDLELECEGKDKYKCGSNVFWKW

XP_023003251.1 photosystem I reaction center subunit N, chloroplastic isoform X1 [Cucurbita maxima]1.4e-7184.97Show/hide
Query:  MATVNSSVLACSHAIAGAGSSELSSKLSATPLPSVASVSGYKLAAIMAQQARVPEAKNEGRRTTLLLLGASLFAAASASASSDSEANAGVIDDYLEKSKA
        MAT+NSSVLAC++AI+GAGS+EL+SKLSA    +   VSGYKL AI AQQARVPEAKNEGRRT LL LGASLFAA  A+ASS+S ANAGVI++YLEKSKA
Subjt:  MATVNSSVLACSHAIAGAGSSELSSKLSATPLPSVASVSGYKLAAIMAQQARVPEAKNEGRRTTLLLLGASLFAAASASASSDSEANAGVIDDYLEKSKA

Query:  NKELNDKKRLATSGANFARAYTVQFGTCKFPENFTGCQDLAKQKKVPFISDDLELECEGKDKYKCGSNVFWKW
        NKELNDKKRLATSGANFARAYTVQFG+CKFPENFTGCQDLAKQKKVPFISDDLELECEGKDKYKCGSNVFWKW
Subjt:  NKELNDKKRLATSGANFARAYTVQFGTCKFPENFTGCQDLAKQKKVPFISDDLELECEGKDKYKCGSNVFWKW

XP_023518442.1 photosystem I reaction center subunit N, chloroplastic isoform X1 [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.0e-7184.97Show/hide
Query:  MATVNSSVLACSHAIAGAGSSELSSKLSATPLPSVASVSGYKLAAIMAQQARVPEAKNEGRRTTLLLLGASLFAAASASASSDSEANAGVIDDYLEKSKA
        MAT+NSSVLAC++AI+GAGS+EL+SKLSA    +   VSGYKL AI AQQARVPEAKNEGRRT LL LGASLFAA  A+ASS+S ANAGVI++YLEKSKA
Subjt:  MATVNSSVLACSHAIAGAGSSELSSKLSATPLPSVASVSGYKLAAIMAQQARVPEAKNEGRRTTLLLLGASLFAAASASASSDSEANAGVIDDYLEKSKA

Query:  NKELNDKKRLATSGANFARAYTVQFGTCKFPENFTGCQDLAKQKKVPFISDDLELECEGKDKYKCGSNVFWKW
        NKELNDKKRLATSGANFARAYTVQFG+CKFPENFTGCQDLAKQKKVPFISDDLELECEGKDKYKCGSNVFWKW
Subjt:  NKELNDKKRLATSGANFARAYTVQFGTCKFPENFTGCQDLAKQKKVPFISDDLELECEGKDKYKCGSNVFWKW

XP_038883748.1 photosystem I reaction center subunit N, chloroplastic isoform X1 [Benincasa hispida]5.2e-7183.24Show/hide
Query:  MATVNSSVLACSHAIAGAGSSELSSKLSATPLPSVASVSGYKLAAIMAQQARVPEAKNEGRRTTLLLLGASLFAAASASASSDSEANAGVIDDYLEKSKA
        MAT+NSSVLAC++AI+GAGS++L+SKL+A P  +   V GYKL AI AQQARVPEAKNEGRRT LL LGA+LFAA  A+A+S+S ANAGVI+DYLEKSKA
Subjt:  MATVNSSVLACSHAIAGAGSSELSSKLSATPLPSVASVSGYKLAAIMAQQARVPEAKNEGRRTTLLLLGASLFAAASASASSDSEANAGVIDDYLEKSKA

Query:  NKELNDKKRLATSGANFARAYTVQFGTCKFPENFTGCQDLAKQKKVPFISDDLELECEGKDKYKCGSNVFWKW
        NKELNDKKRLATSGANFARAYTV+FGTCKFPENFTGCQDLAKQKKVPFISDDLELECEGKDKYKCGSNVFWKW
Subjt:  NKELNDKKRLATSGANFARAYTVQFGTCKFPENFTGCQDLAKQKKVPFISDDLELECEGKDKYKCGSNVFWKW

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3B240 photosystem I reaction center subunit N, chloroplastic5.6e-7182.66Show/hide
Query:  MATVNSSVLACSHAIAGAGSSELSSKLSATPLPSVASVSGYKLAAIMAQQARVPEAKNEGRRTTLLLLGASLFAAASASASSDSEANAGVIDDYLEKSKA
        MAT+NSSVLAC++AI+GAGS++L+SKL+A P  +   V GYKL AI AQQARVPEAKNEGRRT LL LGA+LFAA  A+A+S+S ANAGVI+DYLEKSKA
Subjt:  MATVNSSVLACSHAIAGAGSSELSSKLSATPLPSVASVSGYKLAAIMAQQARVPEAKNEGRRTTLLLLGASLFAAASASASSDSEANAGVIDDYLEKSKA

Query:  NKELNDKKRLATSGANFARAYTVQFGTCKFPENFTGCQDLAKQKKVPFISDDLELECEGKDKYKCGSNVFWKW
        NKELNDKKRLATSGANFARAYTV+FGTCKFPENFTGCQDLAKQKKVPFI+DDLELECEGKDKYKCGSNVFWKW
Subjt:  NKELNDKKRLATSGANFARAYTVQFGTCKFPENFTGCQDLAKQKKVPFISDDLELECEGKDKYKCGSNVFWKW

A0A5D3DQX9 Photosystem I reaction center subunit N5.6e-7182.66Show/hide
Query:  MATVNSSVLACSHAIAGAGSSELSSKLSATPLPSVASVSGYKLAAIMAQQARVPEAKNEGRRTTLLLLGASLFAAASASASSDSEANAGVIDDYLEKSKA
        MAT+NSSVLAC++AI+GAGS++L+SKL+A P  +   V GYKL AI AQQARVPEAKNEGRRT LL LGA+LFAA  A+A+S+S ANAGVI+DYLEKSKA
Subjt:  MATVNSSVLACSHAIAGAGSSELSSKLSATPLPSVASVSGYKLAAIMAQQARVPEAKNEGRRTTLLLLGASLFAAASASASSDSEANAGVIDDYLEKSKA

Query:  NKELNDKKRLATSGANFARAYTVQFGTCKFPENFTGCQDLAKQKKVPFISDDLELECEGKDKYKCGSNVFWKW
        NKELNDKKRLATSGANFARAYTV+FGTCKFPENFTGCQDLAKQKKVPFI+DDLELECEGKDKYKCGSNVFWKW
Subjt:  NKELNDKKRLATSGANFARAYTVQFGTCKFPENFTGCQDLAKQKKVPFISDDLELECEGKDKYKCGSNVFWKW

A0A6J1BT08 photosystem I reaction center subunit N, chloroplastic isoform X11.6e-7082.08Show/hide
Query:  MATVNSSVLACSHAIAGAGSSELSSKLSATPLPSVASVSGYKLAAIMAQQARVPEAKNEGRRTTLLLLGASLFAAASASASSDSEANAGVIDDYLEKSKA
        MAT+NSSVLAC++AI+GAGS+EL+SKLSA P  +   V+GYKL AI AQQARVPEAKN+GRRT LL LGA+LFAA  A+A+S+S ANAGVI++YLEKSKA
Subjt:  MATVNSSVLACSHAIAGAGSSELSSKLSATPLPSVASVSGYKLAAIMAQQARVPEAKNEGRRTTLLLLGASLFAAASASASSDSEANAGVIDDYLEKSKA

Query:  NKELNDKKRLATSGANFARAYTVQFGTCKFPENFTGCQDLAKQKKVPFISDDLELECEGKDKYKCGSNVFWKW
        NKELNDKKRLATSGANFARAYTV+FGTCKFPENFTGCQDLAKQKKVPFISDDL LECEGKDK+KCGSNVFWKW
Subjt:  NKELNDKKRLATSGANFARAYTVQFGTCKFPENFTGCQDLAKQKKVPFISDDLELECEGKDKYKCGSNVFWKW

A0A6J1HHG7 photosystem I reaction center subunit N, chloroplastic-like isoform X11.5e-7184.39Show/hide
Query:  MATVNSSVLACSHAIAGAGSSELSSKLSATPLPSVASVSGYKLAAIMAQQARVPEAKNEGRRTTLLLLGASLFAAASASASSDSEANAGVIDDYLEKSKA
        MAT+NSSVLAC++AI+GAGS+EL+SKLSA    +   VSGYKL AI A+QARVPEAKNEGRRT LL LGASLFAA  A+ASS+S ANAGVI++YLEKSKA
Subjt:  MATVNSSVLACSHAIAGAGSSELSSKLSATPLPSVASVSGYKLAAIMAQQARVPEAKNEGRRTTLLLLGASLFAAASASASSDSEANAGVIDDYLEKSKA

Query:  NKELNDKKRLATSGANFARAYTVQFGTCKFPENFTGCQDLAKQKKVPFISDDLELECEGKDKYKCGSNVFWKW
        NKELNDKKRLATSGANFARAYTVQFG+CKFPENFTGCQDLAKQKKVPFISDDLELECEGKDKYKCGSNVFWKW
Subjt:  NKELNDKKRLATSGANFARAYTVQFGTCKFPENFTGCQDLAKQKKVPFISDDLELECEGKDKYKCGSNVFWKW

A0A6J1KNN3 photosystem I reaction center subunit N, chloroplastic isoform X16.6e-7284.97Show/hide
Query:  MATVNSSVLACSHAIAGAGSSELSSKLSATPLPSVASVSGYKLAAIMAQQARVPEAKNEGRRTTLLLLGASLFAAASASASSDSEANAGVIDDYLEKSKA
        MAT+NSSVLAC++AI+GAGS+EL+SKLSA    +   VSGYKL AI AQQARVPEAKNEGRRT LL LGASLFAA  A+ASS+S ANAGVI++YLEKSKA
Subjt:  MATVNSSVLACSHAIAGAGSSELSSKLSATPLPSVASVSGYKLAAIMAQQARVPEAKNEGRRTTLLLLGASLFAAASASASSDSEANAGVIDDYLEKSKA

Query:  NKELNDKKRLATSGANFARAYTVQFGTCKFPENFTGCQDLAKQKKVPFISDDLELECEGKDKYKCGSNVFWKW
        NKELNDKKRLATSGANFARAYTVQFG+CKFPENFTGCQDLAKQKKVPFISDDLELECEGKDKYKCGSNVFWKW
Subjt:  NKELNDKKRLATSGANFARAYTVQFGTCKFPENFTGCQDLAKQKKVPFISDDLELECEGKDKYKCGSNVFWKW

SwissProt top hitse value%identityAlignment
O65107 Photosystem I reaction center subunit N, chloroplastic (Fragment)7.6e-4181.72Show/hide
Query:  SSDSEANAGVIDDYLEKSKANKELNDKKRLATSGANFARAYTVQFGTCKFPENFTGCQDLAKQKKVPFISDDLELECEGKDKYKCGSNVFWKW
        ++   A A + D+YLEKSKANKELNDKKRLATSGANFARAYTV+FG+C+FP NFTGCQDLAKQKKVPFISDDLE+ECEGK+K+KCGSNVFWKW
Subjt:  SSDSEANAGVIDDYLEKSKANKELNDKKRLATSGANFARAYTVQFGTCKFPENFTGCQDLAKQKKVPFISDDLELECEGKDKYKCGSNVFWKW

P31093 Photosystem I reaction center subunit N, chloroplastic3.9e-4569.93Show/hide
Query:  SVSGYKLAAIMAQQA------RVPEAKNEGRRTTLLLLGASLFAAASASASSDSEANAGVIDDYLEKSKANKELNDKKRLATSGANFARAYTVQFGTCKF
        SV G K AA + Q A      RV  A  + RR+ LL L A++FAA +ASA S   A A V D+YLEKSK NKELNDKKR ATSGANFARAYTVQFG+CKF
Subjt:  SVSGYKLAAIMAQQA------RVPEAKNEGRRTTLLLLGASLFAAASASASSDSEANAGVIDDYLEKSKANKELNDKKRLATSGANFARAYTVQFGTCKF

Query:  PENFTGCQDLAKQKKVPFISDDLELECEGKDKYKCGSNVFWKW
        P NFTGCQDLAKQKKVPFI+DDLE+ECEGK+K+KCGSNVFWKW
Subjt:  PENFTGCQDLAKQKKVPFISDDLELECEGKDKYKCGSNVFWKW

P49107 Photosystem I reaction center subunit N, chloroplastic8.6e-5365.17Show/hide
Query:  MATVNSSVLACSHAIAGAGSSELSSKLSATPLPSVASVSGYKLAAIM----AQQARVPEAK-NEGRRTTLLLLGASLFAAASASASSDSEANAGVIDDYL
        MA +NSSVL CS+AIAG+GS EL+ K+    L + +   G K   IM    AQ+    +   + GRR+ ++ L A+LF+ A+ SAS    ANAGVID+YL
Subjt:  MATVNSSVLACSHAIAGAGSSELSSKLSATPLPSVASVSGYKLAAIM----AQQARVPEAK-NEGRRTTLLLLGASLFAAASASASSDSEANAGVIDDYL

Query:  EKSKANKELNDKKRLATSGANFARAYTVQFGTCKFPENFTGCQDLAKQKKVPFISDDLELECEGKDKYKCGSNVFWKW
        E+SK NKELNDKKRLATSGANFARA+TVQFG+CKFPENFTGCQDLAKQKKVPFIS+D+ LECEGKDKYKCGSNVFWKW
Subjt:  EKSKANKELNDKKRLATSGANFARAYTVQFGTCKFPENFTGCQDLAKQKKVPFISDDLELECEGKDKYKCGSNVFWKW

Q9SBN5 Photosystem I reaction center subunit N, chloroplastic3.8e-2448.89Show/hide
Query:  LAAIMAQQARVPEAKNEGRRTTLL----------LLGASLFAAASASASSDSEANAGVIDDYLEKSKANKELNDKKRLATSGANFARAYTVQFGTCKFPE
        +A  M  Q    +A    R TT++          LLG  +   A+A A +   ANAGV++D L KS ANK LN+KKRLATS AN AR+ TV  GTC+FPE
Subjt:  LAAIMAQQARVPEAKNEGRRTTLL----------LLGASLFAAASASASSDSEANAGVIDDYLEKSKANKELNDKKRLATSGANFARAYTVQFGTCKFPE

Query:  NFTGCQDLAKQKKVPFISDDLELECEGKDKYKCGS
        NF GC++LA  K V +I++DL++ECEGKD   CGS
Subjt:  NFTGCQDLAKQKKVPFISDDLELECEGKDKYKCGS

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT5G64040.1 photosystem I reaction center subunit PSI-N, chloroplast, putative / PSI-N, putative (PSAN)6.1e-5465.17Show/hide
Query:  MATVNSSVLACSHAIAGAGSSELSSKLSATPLPSVASVSGYKLAAIM----AQQARVPEAK-NEGRRTTLLLLGASLFAAASASASSDSEANAGVIDDYL
        MA +NSSVL CS+AIAG+GS EL+ K+    L + +   G K   IM    AQ+    +   + GRR+ ++ L A+LF+ A+ SAS    ANAGVID+YL
Subjt:  MATVNSSVLACSHAIAGAGSSELSSKLSATPLPSVASVSGYKLAAIM----AQQARVPEAK-NEGRRTTLLLLGASLFAAASASASSDSEANAGVIDDYL

Query:  EKSKANKELNDKKRLATSGANFARAYTVQFGTCKFPENFTGCQDLAKQKKVPFISDDLELECEGKDKYKCGSNVFWKW
        E+SK NKELNDKKRLATSGANFARA+TVQFG+CKFPENFTGCQDLAKQKKVPFIS+D+ LECEGKDKYKCGSNVFWKW
Subjt:  EKSKANKELNDKKRLATSGANFARAYTVQFGTCKFPENFTGCQDLAKQKKVPFISDDLELECEGKDKYKCGSNVFWKW

AT5G64040.2 photosystem I reaction center subunit PSI-N, chloroplast, putative / PSI-N, putative (PSAN)2.2e-3560.4Show/hide
Query:  MATVNSSVLACSHAIAGAGSSELSSKLSATPLPSVASVSGYKLAAIM----AQQARVPEAK-NEGRRTTLLLLGASLFAAASASASSDSEANAGVIDDYL
        MA +NSSVL CS+AIAG+GS EL+ K+    L + +   G K   IM    AQ+    +   + GRR+ ++ L A+LF+ A+ SAS    ANAGVID+YL
Subjt:  MATVNSSVLACSHAIAGAGSSELSSKLSATPLPSVASVSGYKLAAIM----AQQARVPEAK-NEGRRTTLLLLGASLFAAASASASSDSEANAGVIDDYL

Query:  EKSKANKELNDKKRLATSGANFARAYTVQFGTCKFPENFTGCQDLAKQK
        E+SK NKELNDKKRLATSGANFARA+TVQFG+CKFPENFTGCQDLAKQK
Subjt:  EKSKANKELNDKKRLATSGANFARAYTVQFGTCKFPENFTGCQDLAKQK


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCGACCGTGAATTCCAGTGTTCTGGCCTGCAGCCACGCCATTGCAGGCGCGGGATCCTCCGAGCTCAGCTCGAAACTCAGCGCCACCCCACTGCCGTCTGTTGCGTC
GGTTTCTGGTTACAAGTTGGCTGCGATTATGGCTCAACAGGCTAGGGTTCCTGAAGCGAAGAATGAAGGAAGGAGAACTACGCTTCTTTTGCTTGGTGCTTCCCTCTTTG
CTGCAGCTTCGGCTTCGGCTTCCTCCGATTCCGAAGCTAATGCTGGAGTCATTGATGACTATCTTGAGAAGAGTAAAGCTAACAAGGAATTGAATGACAAGAAAAGGTTG
GCAACAAGTGGAGCAAACTTTGCAAGAGCATATACTGTTCAGTTTGGAACATGCAAGTTCCCAGAGAACTTCACAGGGTGCCAAGATCTTGCAAAACAAAAGAAAGTTCC
ATTTATCTCTGATGATTTGGAATTGGAGTGTGAGGGGAAAGACAAATACAAGTGTGGTTCCAATGTCTTTTGGAAATGGTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
TTCAACTTTCCCACAAGATGAACACAGCAATTGAAAGCACAATTTTGAAAGTGGGTCCTAAATTGAAGCTCTCCACTAATCACAGCCATGGCTTGCCAATTGGAAACAAG
AAAATCTCACCTTATCCACACCACAATCCCTCATCCAATTTCATCTCACACAATTCTCTCTTTTATCACATTCCCTCCCAATCCCAACTATCCGCCATTAATCCACCTTC
GAGCTTTCGAACTCGGCAATGGCGACCGTGAATTCCAGTGTTCTGGCCTGCAGCCACGCCATTGCAGGCGCGGGATCCTCCGAGCTCAGCTCGAAACTCAGCGCCACCCC
ACTGCCGTCTGTTGCGTCGGTTTCTGGTTACAAGTTGGCTGCGATTATGGCTCAACAGGCTAGGGTTCCTGAAGCGAAGAATGAAGGAAGGAGAACTACGCTTCTTTTGC
TTGGTGCTTCCCTCTTTGCTGCAGCTTCGGCTTCGGCTTCCTCCGATTCCGAAGCTAATGCTGGAGTCATTGATGACTATCTTGAGAAGAGTAAAGCTAACAAGGAATTG
AATGACAAGAAAAGGTTGGCAACAAGTGGAGCAAACTTTGCAAGAGCATATACTGTTCAGTTTGGAACATGCAAGTTCCCAGAGAACTTCACAGGGTGCCAAGATCTTGC
AAAACAAAAGAAAGTTCCATTTATCTCTGATGATTTGGAATTGGAGTGTGAGGGGAAAGACAAATACAAGTGTGGTTCCAATGTCTTTTGGAAATGGTGAAGAAGAGAAC
AATATAAAGTCTTTGTATCCATCACCACCATTCATCTTTCACTCTTCCCTTGTATCTAACTCTTAAGAAGTGTGAAATTTTATTATGTAATTTTTGGGAATGTCCCAATT
CCATGTCTTTCTTCTCTTTGAAGCCAAAAAAAAGCCAAATGAGAAAGTGGAAGGCCTAGACATATACCGAAACAATCTTTGTTACCTCCTTGAAGAACTAAGAGGTAATA
GATTCAATTCATGGTGACCATC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MATVNSSVLACSHAIAGAGSSELSSKLSATPLPSVASVSGYKLAAIMAQQARVPEAKNEGRRTTLLLLGASLFAAASASASSDSEANAGVIDDYLEKSKANKELNDKKRL
ATSGANFARAYTVQFGTCKFPENFTGCQDLAKQKKVPFISDDLELECEGKDKYKCGSNVFWKW