; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Sed0019175 (gene) of Chayote v1 genome

Gene IDSed0019175
OrganismSechium edule (Chayote v1)
DescriptionProtein of unknown function (DUF1068)
Genome locationLG11:1492626..1497573
RNA-Seq ExpressionSed0019175
SyntenySed0019175
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0005516 - calmodulin binding (molecular function)
InterPro domainsIPR010471 - Protein of unknown function DUF1068


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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XP_022965983.1 uncharacterized protein LOC111465703 [Cucurbita maxima]3.1e-8491.81Show/hide
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XP_038890751.1 uncharacterized protein LOC120080238 [Benincasa hispida]7.0e-8492.4Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3C6L6 uncharacterized protein LOC1034970637.5e-8492.4Show/hide
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A0A5A7VC79 DUF1068 domain-containing protein7.5e-8492.4Show/hide
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A0A6J1CQ21 uncharacterized protein LOC1110131081.1e-8594.15Show/hide
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A0A6J1FI57 uncharacterized protein LOC1114443441.1e-8592.98Show/hide
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A0A6J1HQJ7 uncharacterized protein LOC1114657031.5e-8491.81Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G05070.1 Protein of unknown function (DUF1068)1.9e-3144.58Show/hide
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        S E  +R ++ L EAK+  S YQ+EA+KC +  ETCEEARE+AE    +++KLTS WE RARQ GW
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AT2G24290.1 Protein of unknown function (DUF1068)5.4e-6671.26Show/hide
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        KLQEAV+ EH+R MN+TL EAKR ASQYQ+EAEKC  ATE CE ARERA+AL +KERK+T LWERRARQ+GWEG
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AT2G32580.1 Protein of unknown function (DUF1068)1.9e-3446.91Show/hide
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        L+  L + A      + GP LYW   +AL +  S  SC+ C+CDC   L LL I  GL+N S TDC   DP++  + EK + +LLTEELK +EA S E  
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AT4G04360.1 Protein of unknown function (DUF1068)5.2e-2942.69Show/hide
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        +EA + E   R +  L +AK+AASQYQ+EA+KC    ETCE ARE+AEA   ++R+L+ +WE RARQ GW+
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AT4G30996.1 Protein of unknown function (DUF1068)2.1e-7075.72Show/hide
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        LQEAV+ EH+R MN+TL EAKR ASQYQ+EAEKC  ATE CE ARERAEAL IKERK+TSLWE+RARQ GWEG
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTCACGCCGATCTGGGGGTTGCCTTCGGTGTTGTCTCGTGATTTTTGCTACTGTTTCTGCTTTGGCTGTTTGTGGACCGGCTTTGTATTGGAGATTCAACAAGGCTTT
GCATTTGGGCGATTCCAAAATCTCCTGTGCTCCTTGTATCTGCGATTGTCCACCCCCATTGTCCCTTTTGAAGATTGCCCCTGGTCTGGCCAATCTCTCCGTAACAGACT
GTGGAGGTAATGACCCAGATCTCAAGCATGAAATGGAAAAACAATTTGTGGATCTATTGACAGAAGAACTGAAGCTTCAAGAAGCTGTTTCTGGCGAACATACACGTCGT
ATGAACATCACGTTATTTGAGGCAAAAAGGGCAGCTTCTCAGTATCAGAGGGAGGCTGAGAAGTGCATTACTGCAACAGAAACTTGTGAAGAGGCTCGAGAACGCGCCGA
GGCATTGACGATCAAGGAGAGGAAGCTTACATCACTGTGGGAGCGACGAGCCCGCCAAATGGGTTGGGAAGGAATAAATCTGTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AGCTATTTGTCCAATGAATTCAACTGAATCAAAAGGAAAAAATGGAAACTTTTTTTTTTAATATAATTTTTTTAAAAAATATCCAATATACCGACTTATCGTAAAGAAAT
TCTAGCTACAGCCAAAGGTTTATTTGCTTTTCCCAATCTTTTCCTATTCATTTCATAGATTTCGAACTTTCACAGCTGCAATTAGATCTCACTTCCTCACTTTCTCAGTG
ACGCAAAAACACAAGCGAACAATTTTTTTTAAAAAAATCAAGAATCAAAGGGGGAAAAAAGGGTAATTGGAAGATCAAGGTGAGCAATGTCACGCCGATCTGGGGGTTGC
CTTCGGTGTTGTCTCGTGATTTTTGCTACTGTTTCTGCTTTGGCTGTTTGTGGACCGGCTTTGTATTGGAGATTCAACAAGGCTTTGCATTTGGGCGATTCCAAAATCTC
CTGTGCTCCTTGTATCTGCGATTGTCCACCCCCATTGTCCCTTTTGAAGATTGCCCCTGGTCTGGCCAATCTCTCCGTAACAGACTGTGGAGGTAATGACCCAGATCTCA
AGCATGAAATGGAAAAACAATTTGTGGATCTATTGACAGAAGAACTGAAGCTTCAAGAAGCTGTTTCTGGCGAACATACACGTCGTATGAACATCACGTTATTTGAGGCA
AAAAGGGCAGCTTCTCAGTATCAGAGGGAGGCTGAGAAGTGCATTACTGCAACAGAAACTTGTGAAGAGGCTCGAGAACGCGCCGAGGCATTGACGATCAAGGAGAGGAA
GCTTACATCACTGTGGGAGCGACGAGCCCGCCAAATGGGTTGGGAAGGAATAAATCTGTAAGTTCGAAGGCCAATCTCTTAGTTCAACTAGTCGTCGAGTTCTTCTTCCC
ACGAGATCAATAGAAGCTGGCAAGCGAAGTGCTTGGTCAGCATAATGTTCACTCTTTTCTCCATTAATTGTGTTGCACTGTTCCTGAAAACATGAAAATTCTTACATGAT
AAGACAATGTTATAGATCCCACTCTTCTGCATTTGCTATATAGTATAGTATATATACTCTTCAACTGTTATCTAGGCATTTCTGATCTGTTTACAAACTCGAATAGATCG
TATTTTCCTCTCATTGAAATAACTATGTTCTCAATTTTGGCGCCAAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MSRRSGGCLRCCLVIFATVSALAVCGPALYWRFNKALHLGDSKISCAPCICDCPPPLSLLKIAPGLANLSVTDCGGNDPDLKHEMEKQFVDLLTEELKLQEAVSGEHTRR
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