; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Sed0019193 (gene) of Chayote v1 genome

Gene IDSed0019193
OrganismSechium edule (Chayote v1)
DescriptionYqgFc domain-containing protein
Genome locationLG05:6279320..6283355
RNA-Seq ExpressionSed0019193
SyntenySed0019193
Gene Ontology termsGO:0000967 - rRNA 5'-end processing (biological process)
InterPro domainsIPR005227 - Putative pre-16S rRNA nuclease
IPR006641 - YqgF/RNase H-like domain
IPR012337 - Ribonuclease H-like superfamily
IPR037027 - YqgF/RNase H-like domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7036046.1 hypothetical protein SDJN02_02846 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.2e-7276.56Show/hide
Query:  MKYVKPLNLFRELSKRNALERGRFLGLDVGDKYVGLAVSDPDNKIASPLSVLLRKKPSMDLMAQDLQRLISELSLAGFIVGYPFDGQRRNAD--------
        MKYV+PLNLFR+L K NALERGRFLGLDVGDKYVGLAVSDPDNKIASPLSVL RKK +M LMA D QRLISELSL+GFIVGYPFDGQRRN D        
Subjt:  MKYVKPLNLFRELSKRNALERGRFLGLDVGDKYVGLAVSDPDNKIASPLSVLLRKKPSMDLMAQDLQRLISELSLAGFIVGYPFDGQRRNAD--------

Query:  -----------------AVQVKVFIDDLSKTGKLEGVKYTFWDECFTSKNVELLIKPLKFSSILSKTIVDKFAAVGILQGYLDCFNRRPDLE
                         AVQVK+FIDDL KTGKLEGVKYTFWDECFTSKNVELLIKPLK   ILSKTI+DKFAAVGILQGYLD FNRRP+LE
Subjt:  -----------------AVQVKVFIDDLSKTGKLEGVKYTFWDECFTSKNVELLIKPLKFSSILSKTIVDKFAAVGILQGYLDCFNRRPDLE

XP_022159849.1 uncharacterized protein LOC111026145 [Momordica charantia]3.7e-7486.75Show/hide
Query:  MKYVKPLNLFRELSKRNALERGRFLGLDVGDKYVGLAVSDPDNKIASPLSVLLRKKPSMDLMAQDLQRLISELSLAGFIVGYPFDGQRRNADAVQVKVFI
        MKYVKPLN+FR+L  RN LERGRFLGLDVGDKYVGLAVSDPDN IASPLSVLLRKK  M LMA+DLQRLISELSLAGFIVGYPFD QRRNADAVQVK+FI
Subjt:  MKYVKPLNLFRELSKRNALERGRFLGLDVGDKYVGLAVSDPDNKIASPLSVLLRKKPSMDLMAQDLQRLISELSLAGFIVGYPFDGQRRNADAVQVKVFI

Query:  DDLSKTGKLEGVKYTFWDECFTSKNVELLIKPLKFSSILSKTIVDKFAAVGILQGYLDCFNRRPDL
        DDL KTG LEGVKYTFWDECFTSKNVELLIKPL+   +LSKTIVDKFAAVGILQGYLD  NRRP+L
Subjt:  DDLSKTGKLEGVKYTFWDECFTSKNVELLIKPLKFSSILSKTIVDKFAAVGILQGYLDCFNRRPDL

XP_022957830.1 uncharacterized protein LOC111459253 [Cucurbita moschata]6.2e-7788.02Show/hide
Query:  MKYVKPLNLFRELSKRNALERGRFLGLDVGDKYVGLAVSDPDNKIASPLSVLLRKKPSMDLMAQDLQRLISELSLAGFIVGYPFDGQRRNADAVQVKVFI
        MKYV+PLNLFR+L K NALERGRFLGLDVGDKYVGLAVSDPDNKIASPLSVL RKK +M LMA D QRLISELSL+GFIVGYPFDGQRRNADAVQVK+FI
Subjt:  MKYVKPLNLFRELSKRNALERGRFLGLDVGDKYVGLAVSDPDNKIASPLSVLLRKKPSMDLMAQDLQRLISELSLAGFIVGYPFDGQRRNADAVQVKVFI

Query:  DDLSKTGKLEGVKYTFWDECFTSKNVELLIKPLKFSSILSKTIVDKFAAVGILQGYLDCFNRRPDLE
        DDL KTGKLEGVKYTFWDECFTSKNVELLIKPLK   ILSKTI+DKFAAVGILQGYLD FNRRP+L+
Subjt:  DDLSKTGKLEGVKYTFWDECFTSKNVELLIKPLKFSSILSKTIVDKFAAVGILQGYLDCFNRRPDLE

XP_022995255.1 uncharacterized protein LOC111490857 [Cucurbita maxima]2.8e-7788.62Show/hide
Query:  MKYVKPLNLFRELSKRNALERGRFLGLDVGDKYVGLAVSDPDNKIASPLSVLLRKKPSMDLMAQDLQRLISELSLAGFIVGYPFDGQRRNADAVQVKVFI
        MKYV+PLNLFR+L K NALERGRFLGLDVGDKYVGLAVSDPDNKIASPLSVL RKK +M LMA D QRLISELSL+GFIVGYPFDGQRRNADAVQVK+FI
Subjt:  MKYVKPLNLFRELSKRNALERGRFLGLDVGDKYVGLAVSDPDNKIASPLSVLLRKKPSMDLMAQDLQRLISELSLAGFIVGYPFDGQRRNADAVQVKVFI

Query:  DDLSKTGKLEGVKYTFWDECFTSKNVELLIKPLKFSSILSKTIVDKFAAVGILQGYLDCFNRRPDLE
        DDL KTGKLEGVKYTFWDECFTSKNVELLIKPLK   ILSKTI+DKFAAVGILQGYLD FNRRP+LE
Subjt:  DDLSKTGKLEGVKYTFWDECFTSKNVELLIKPLKFSSILSKTIVDKFAAVGILQGYLDCFNRRPDLE

XP_023533829.1 uncharacterized protein LOC111795559 [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.4e-7688.02Show/hide
Query:  MKYVKPLNLFRELSKRNALERGRFLGLDVGDKYVGLAVSDPDNKIASPLSVLLRKKPSMDLMAQDLQRLISELSLAGFIVGYPFDGQRRNADAVQVKVFI
        MKYV+PLNLFR+L K NALERGRFLGLDVGDKYVGLAVSDPDNKIASPLSVL RKK +M LMA D QRLISELSL+GFIVGYPFDGQRRNADAVQVK+FI
Subjt:  MKYVKPLNLFRELSKRNALERGRFLGLDVGDKYVGLAVSDPDNKIASPLSVLLRKKPSMDLMAQDLQRLISELSLAGFIVGYPFDGQRRNADAVQVKVFI

Query:  DDLSKTGKLEGVKYTFWDECFTSKNVELLIKPLKFSSILSKTIVDKFAAVGILQGYLDCFNRRPDLE
        DDL KTGKLEGVKYTFWDECFTSKNVELLIKPLK   ILSKTI+DKFAAVGILQ YLD FNRRP+LE
Subjt:  DDLSKTGKLEGVKYTFWDECFTSKNVELLIKPLKFSSILSKTIVDKFAAVGILQGYLDCFNRRPDLE

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KMK7 YqgFc domain-containing protein2.4e-7181.93Show/hide
Query:  MKYVKPLNLFRELSKRNALERGRFLGLDVGDKYVGLAVSDPDNKIASPLSVLLRKKPSMDLMAQDLQRLISELSLAGFIVGYPFDGQRRNADAVQVKVFI
        MKYV+PL LFR+L+KR+ALE GR LGLDVGDKYVGLAVSDPDNKIA PLSVLLRKK +MDLMAQD Q++ISE SLAGFIVGYPFD  R N DA+QVK+FI
Subjt:  MKYVKPLNLFRELSKRNALERGRFLGLDVGDKYVGLAVSDPDNKIASPLSVLLRKKPSMDLMAQDLQRLISELSLAGFIVGYPFDGQRRNADAVQVKVFI

Query:  DDLSKTGKLEGVKYTFWDECFTSKNVELLIKPLKFSSILSKTIVDKFAAVGILQGYLDCFNRRPDL
        DDL KTGKLEGVKYTFWDECFTSKNVELLIKPL     +SKTI+DKFAAVGILQGYLD FNRRP+L
Subjt:  DDLSKTGKLEGVKYTFWDECFTSKNVELLIKPLKFSSILSKTIVDKFAAVGILQGYLDCFNRRPDL

A0A1S3ATQ4 putative pre-16S rRNA nuclease isoform X12.4e-6677.71Show/hide
Query:  MKYVKPLNLFRELSKRNALERGRFLGLDVGDKYVGLAVSDPDNKIASPLSVLLRKKPSMDLMAQDLQRLISELSLAGFIVGYPFDGQRRNADAVQVKVFI
        MKYVKP  LFR+L KR+ L+  R LGLDVGDKYVGLAVSDPDNKIASPLSVLLRKK +MDLMA+D Q+LISE SLAGFIVGYPFD  R+N +A+QVK+FI
Subjt:  MKYVKPLNLFRELSKRNALERGRFLGLDVGDKYVGLAVSDPDNKIASPLSVLLRKKPSMDLMAQDLQRLISELSLAGFIVGYPFDGQRRNADAVQVKVFI

Query:  DDLSKTGKLEGVKYTFWDECFTSKNVELLIKPLKFSSILSKTIVDKFAAVGILQGYLDCFNRRPDL
        DDL KTGKLEGVKYTFWDE FTSKNVE +IKPL     +SKT++DKFAAVGILQGYLD FNRRP+L
Subjt:  DDLSKTGKLEGVKYTFWDECFTSKNVELLIKPLKFSSILSKTIVDKFAAVGILQGYLDCFNRRPDL

A0A6J1E3H7 uncharacterized protein LOC1110261451.8e-7486.75Show/hide
Query:  MKYVKPLNLFRELSKRNALERGRFLGLDVGDKYVGLAVSDPDNKIASPLSVLLRKKPSMDLMAQDLQRLISELSLAGFIVGYPFDGQRRNADAVQVKVFI
        MKYVKPLN+FR+L  RN LERGRFLGLDVGDKYVGLAVSDPDN IASPLSVLLRKK  M LMA+DLQRLISELSLAGFIVGYPFD QRRNADAVQVK+FI
Subjt:  MKYVKPLNLFRELSKRNALERGRFLGLDVGDKYVGLAVSDPDNKIASPLSVLLRKKPSMDLMAQDLQRLISELSLAGFIVGYPFDGQRRNADAVQVKVFI

Query:  DDLSKTGKLEGVKYTFWDECFTSKNVELLIKPLKFSSILSKTIVDKFAAVGILQGYLDCFNRRPDL
        DDL KTG LEGVKYTFWDECFTSKNVELLIKPL+   +LSKTIVDKFAAVGILQGYLD  NRRP+L
Subjt:  DDLSKTGKLEGVKYTFWDECFTSKNVELLIKPLKFSSILSKTIVDKFAAVGILQGYLDCFNRRPDL

A0A6J1H0B7 uncharacterized protein LOC1114592533.0e-7788.02Show/hide
Query:  MKYVKPLNLFRELSKRNALERGRFLGLDVGDKYVGLAVSDPDNKIASPLSVLLRKKPSMDLMAQDLQRLISELSLAGFIVGYPFDGQRRNADAVQVKVFI
        MKYV+PLNLFR+L K NALERGRFLGLDVGDKYVGLAVSDPDNKIASPLSVL RKK +M LMA D QRLISELSL+GFIVGYPFDGQRRNADAVQVK+FI
Subjt:  MKYVKPLNLFRELSKRNALERGRFLGLDVGDKYVGLAVSDPDNKIASPLSVLLRKKPSMDLMAQDLQRLISELSLAGFIVGYPFDGQRRNADAVQVKVFI

Query:  DDLSKTGKLEGVKYTFWDECFTSKNVELLIKPLKFSSILSKTIVDKFAAVGILQGYLDCFNRRPDLE
        DDL KTGKLEGVKYTFWDECFTSKNVELLIKPLK   ILSKTI+DKFAAVGILQGYLD FNRRP+L+
Subjt:  DDLSKTGKLEGVKYTFWDECFTSKNVELLIKPLKFSSILSKTIVDKFAAVGILQGYLDCFNRRPDLE

A0A6J1K3L4 uncharacterized protein LOC1114908571.3e-7788.62Show/hide
Query:  MKYVKPLNLFRELSKRNALERGRFLGLDVGDKYVGLAVSDPDNKIASPLSVLLRKKPSMDLMAQDLQRLISELSLAGFIVGYPFDGQRRNADAVQVKVFI
        MKYV+PLNLFR+L K NALERGRFLGLDVGDKYVGLAVSDPDNKIASPLSVL RKK +M LMA D QRLISELSL+GFIVGYPFDGQRRNADAVQVK+FI
Subjt:  MKYVKPLNLFRELSKRNALERGRFLGLDVGDKYVGLAVSDPDNKIASPLSVLLRKKPSMDLMAQDLQRLISELSLAGFIVGYPFDGQRRNADAVQVKVFI

Query:  DDLSKTGKLEGVKYTFWDECFTSKNVELLIKPLKFSSILSKTIVDKFAAVGILQGYLDCFNRRPDLE
        DDL KTGKLEGVKYTFWDECFTSKNVELLIKPLK   ILSKTI+DKFAAVGILQGYLD FNRRP+LE
Subjt:  DDLSKTGKLEGVKYTFWDECFTSKNVELLIKPLKFSSILSKTIVDKFAAVGILQGYLDCFNRRPDLE

SwissProt top hitse value%identityAlignment
A4XKC6 Putative pre-16S rRNA nuclease6.5e-1333.56Show/hide
Query:  RFLGLDVGDKYVGLAVSDPDNKIASPLSVLLRKKPSMDLMAQD----LQRLISELSLAGFIVGYP---FDGQRRNADAVQVKVFIDDLSKTGKLEGVKYT
        R L LD+G + +G+A+SDP    A P  VL       DL  +D    L ++ +E  +   ++GYP   F   +      ++     +L +  K+  +K  
Subjt:  RFLGLDVGDKYVGLAVSDPDNKIASPLSVLLRKKPSMDLMAQD----LQRLISELSLAGFIVGYP---FDGQRRNADAVQVKVFIDDLSKTGKLEGVKYT

Query:  FWDECFTSKNVELLIKPLKFSSILSKTIVDKFAAVGILQGYLDCFN
         WDE F++K VE +++    S    K +VDK AAV ILQGYLD  N
Subjt:  FWDECFTSKNVELLIKPLKFSSILSKTIVDKFAAVGILQGYLDCFN

B6IN25 Putative pre-16S rRNA nuclease2.9e-1334.69Show/hide
Query:  KRNALERGRFLGLDVGDKYVGLAVSDPDNKIASPLSVLLRKKPSMDLMAQDLQRLISELSLAGFIVGYPFDGQRRNADAVQ-VKVFIDDLSKTGKLEGV-
        K +    GR +GLD+G+K +GLAVSDP   +ASP+  + R K + D  AQ+L R + +  +   +VG P +         Q V+ F   L +  +L G  
Subjt:  KRNALERGRFLGLDVGDKYVGLAVSDPDNKIASPLSVLLRKKPSMDLMAQDLQRLISELSLAGFIVGYPFDGQRRNADAVQ-VKVFIDDLSKTGKLEGV-

Query:  -KYTFWDECFTSKNVELLIKPLKFSSILSKTIVDKFAAVGILQGYLD
         +  FWDE  ++  VE ++     +      +VDK AA  ILQG LD
Subjt:  -KYTFWDECFTSKNVELLIKPLKFSSILSKTIVDKFAAVGILQGYLD

B8I4S7 Putative pre-16S rRNA nuclease1.5e-1232.85Show/hide
Query:  RFLGLDVGDKYVGLAVSDPDNKIASPLSVLLRKKPSMDLMAQDLQRLISELSLAGFIVGYPFD-GQRRNADAVQVKVFIDDLSKTGKLEGVKYTFWDECF
        R LG+D GD  +G+A+SDP    A  L  +++ K S+      L  +I+E S+   ++GYP +    +     + + FI  +S  G+   +K   WDE  
Subjt:  RFLGLDVGDKYVGLAVSDPDNKIASPLSVLLRKKPSMDLMAQDLQRLISELSLAGFIVGYPFD-GQRRNADAVQVKVFIDDLSKTGKLEGVKYTFWDECF

Query:  TSKNVELLIKPLKFSSILSKTIVDKFAAVGILQGYLD
        T+ +    +  L   +   K IVD  +AV ILQGYLD
Subjt:  TSKNVELLIKPLKFSSILSKTIVDKFAAVGILQGYLD

B9MRK7 Putative pre-16S rRNA nuclease8.5e-1333.57Show/hide
Query:  RFLGLDVGDKYVGLAVSDPDNKIASP-LSVLLRKKPSMDLMAQDLQRLISELSLAGFIVGYPFDGQRRNADAVQVKVFIDDLSKTGKLEGVKYTFWDECF
        R L LD+G+  VG+A+SDP    A P +++ LR K     + ++L ++    ++   ++GYP      +    ++K   +   K G    V+   WDE F
Subjt:  RFLGLDVGDKYVGLAVSDPDNKIASP-LSVLLRKKPSMDLMAQDLQRLISELSLAGFIVGYPFDGQRRNADAVQVKVFIDDLSKTGKLEGVKYTFWDECF

Query:  TSKNVELLIKPLKFSSILSKTIVDKFAAVGILQGYLDCFN
        ++K VE +I   + +    K I+DK AAV ILQGYLD +N
Subjt:  TSKNVELLIKPLKFSSILSKTIVDKFAAVGILQGYLDCFN

Q1QL26 Putative pre-16S rRNA nuclease1.1e-1234.75Show/hide
Query:  ERGRFLGLDVGDKYVGLAVSDPDNKIASPLSVLLRKKPSMDLMAQDLQRLISELSLAGFIVGYP--FDGQRRNADAVQVKVFIDDLSKTGKLEGVKYTFW
        ERG  +GLD+G K +G+AVSDPD ++A+ +  L RK  + D  A  L  +  E + AGF++G P   DG      A   + F  +L+   +L  +    W
Subjt:  ERGRFLGLDVGDKYVGLAVSDPDNKIASPLSVLLRKKPSMDLMAQDLQRLISELSLAGFIVGYP--FDGQRRNADAVQVKVFIDDLSKTGKLEGVKYTFW

Query:  DECFTSKNVELLIKPLKFSSILSKTIVDKFAAVGILQGYLD
        DE  ++  VE  +  +  S      ++D+ AA+ ILQG LD
Subjt:  DECFTSKNVELLIKPLKFSSILSKTIVDKFAAVGILQGYLD

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G52905.1 Polynucleotidyl transferase, ribonuclease H-like superfamily protein2.9e-4856.89Show/hide
Query:  MKYVKPLNLFRELSKRNALERGRFLGLDVGDKYVGLAVSDPDNKIASPLSVLLRKKPSMDLMAQDLQRLISELSLAGFIVGYPFDGQRRNADAVQVKVFI
        MKYVKPL+L     K      GRFLGLDVGDKYVGLA+SDP N +ASPLSVLLRKK ++DLMA D Q L+   S++G +VGYPF       D V V +FI
Subjt:  MKYVKPLNLFRELSKRNALERGRFLGLDVGDKYVGLAVSDPDNKIASPLSVLLRKKPSMDLMAQDLQRLISELSLAGFIVGYPFDGQRRNADAVQVKVFI

Query:  DDLSKTGKLEGVKYTFWDECFTSKNVELLIKPLKFSSILSKTIVDKFAAVGILQGYLDCFNRRPDLE
        ++L KT KL+ VKYT+WDE  +SK VEL++KPL    +  KT++DK AAV ILQ YLD  NR  + E
Subjt:  DDLSKTGKLEGVKYTFWDECFTSKNVELLIKPLKFSSILSKTIVDKFAAVGILQGYLDCFNRRPDLE


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAAGTACGTGAAGCCATTGAACTTGTTTCGTGAATTGTCGAAGAGAAATGCCCTTGAGCGTGGCCGTTTTCTGGGTTTAGATGTTGGTGATAAGTATGTTGGTTTGGC
TGTGTCTGACCCAGATAATAAAATTGCTTCACCTCTTAGTGTTTTGCTTAGGAAGAAACCAAGTATGGATTTGATGGCTCAGGATCTTCAGAGATTGATCTCTGAACTCT
CATTGGCGGGGTTCATTGTTGGATACCCTTTCGATGGACAACGGCGCAACGCCGATGCTGTGCAAGTGAAAGTCTTCATTGATGACCTTAGTAAAACTGGAAAACTTGAA
GGCGTAAAATATACTTTTTGGGATGAGTGCTTTACATCAAAGAATGTGGAACTCCTGATAAAGCCATTGAAATTCTCTTCTATTTTGTCAAAGACAATAGTTGATAAGTT
TGCTGCTGTTGGAATACTTCAGGGTTACCTAGATTGTTTTAACAGAAGACCAGATTTGGAAGTAGAGTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AACCGATCCTCACCAACACAAATTGGGATTTCTTCAAAAAACGAATTTCACAGAGATTTCGAATTCGGGCTTAATTCATCGCGCTTCAATCTTCCAATCTGCAGTACCGA
TTGCACGAAACTGGAAATGATTTGTACGAATCAGCTGCTGTTGGATAACATGATTCACTGAATTAGATAGTAGCAGAAAATGAAGTACGTGAAGCCATTGAACTTGTTTC
GTGAATTGTCGAAGAGAAATGCCCTTGAGCGTGGCCGTTTTCTGGGTTTAGATGTTGGTGATAAGTATGTTGGTTTGGCTGTGTCTGACCCAGATAATAAAATTGCTTCA
CCTCTTAGTGTTTTGCTTAGGAAGAAACCAAGTATGGATTTGATGGCTCAGGATCTTCAGAGATTGATCTCTGAACTCTCATTGGCGGGGTTCATTGTTGGATACCCTTT
CGATGGACAACGGCGCAACGCCGATGCTGTGCAAGTGAAAGTCTTCATTGATGACCTTAGTAAAACTGGAAAACTTGAAGGCGTAAAATATACTTTTTGGGATGAGTGCT
TTACATCAAAGAATGTGGAACTCCTGATAAAGCCATTGAAATTCTCTTCTATTTTGTCAAAGACAATAGTTGATAAGTTTGCTGCTGTTGGAATACTTCAGGGTTACCTA
GATTGTTTTAACAGAAGACCAGATTTGGAAGTAGAGTAAGATGGATAATATGGGTTCAGACACTTTACTCCTACGGATGGAACGATTTGTTTTGAAGGTCAATTCAAAAG
GGGGGATTTTGTCGTCAATTTTATATTTGATGAGTGAACTTATCTGCTCAAAATCGAATAATTAGCTAATTGTCTCTCTTTGGATTTTTTCGATACGAAATAGAGTTTTT
ATTAGTTCAAACATGAGACTCGAATTTTTAACATCTTAGATCATAAATACATATTTAACTTTAGTTAAGTTGTGCCTCTGTTCACGGGATGAAGATAATGTACTTTTGTT
TATTTCTAAATTATTAATAGTGAC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MKYVKPLNLFRELSKRNALERGRFLGLDVGDKYVGLAVSDPDNKIASPLSVLLRKKPSMDLMAQDLQRLISELSLAGFIVGYPFDGQRRNADAVQVKVFIDDLSKTGKLE
GVKYTFWDECFTSKNVELLIKPLKFSSILSKTIVDKFAAVGILQGYLDCFNRRPDLEVE