CuGenDBv2

Gene ID	Sed0019219
Organism	Sechium edule (Chayote v1)
Description	Protein of unknown function (DUF1218)
Genome location	LG05:30459772..30465056
RNA-Seq Expression	Sed0019219
Synteny	Sed0019219
Gene Ontology terms	GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domains	IPR009606 - Modifying wall lignin-1/2

Homology

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GenBank top hits

e value

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XP_008466341.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103503778 [Cucumis melo]

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XP_022937371.1 uncharacterized protein LOC111443679 [Cucurbita moschata]

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XP_022940215.1 uncharacterized protein LOC111445903 [Cucurbita moschata]

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XP_023524395.1 uncharacterized protein LOC111788301 [Cucurbita pepo subsp. pepo]

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XP_038896871.1 uncharacterized protein LOC120085090 [Benincasa hispida]

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TrEMBL top hits

e value

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A0A1S3CR11 uncharacterized protein LOC103503778

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A0A5D3E6F5 Uncharacterized protein

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A0A6J1FA61 uncharacterized protein LOC111443679

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A0A6J1FGG0 uncharacterized protein LOC111443681

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A0A6J1FPY1 uncharacterized protein LOC111445903

2.7e-87

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SwissProt top hits	e value	%identity	Alignment
No hits found

Arabidopsis top hits

e value

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AT4G31130.1 Protein of unknown function (DUF1218)

2.6e-74

73.91

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        A+ T+GLA++LL+WPT+TEQLHLTRNVH +LET+CPTAKTGLLGGGAF+SLDS LFWL+ALMLA NARED+FDE++    +  +
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Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGGCCGTGTCTGTCAAGATGATGTCGCTTACTGTCGCAGCTTTGGGTGTGATATCCTTTATATTTGGAGTCATTGCTGAGAACAAGAAGCCTGCATCTGGAACTCCCAT
CCAAGGAAAAGGCCTTGTTATCTGTCAATATCCGAGCGACCCAACGGTGGTCTTGGGATATCTTTCCGTTGTATTTCTTCTTGCTTCATCAGTTGCAGGATACTTCTCTT
TGTTCTATCCTTATAAAGGAAAATCCGTTCCTCGAGGTGCCATTTTTAAGAGCAGCAGTTTCTCTGTTTTCTTCAACATCGCTGTGTTCACAACTGGATTGGCTATAACT
TTGCTCGTATGGCCTACGGTCACCGAGCAACTTCATTTGACCCGCAACGTTCATTACGATCTCGAGACAGCATGCCCGACTGCTAAGACTGGTCTTCTGGGTGGTGGTGC
GTTTCTATCCCTCGATTCATCGCTCTTCTGGTTGATTGCTCTGATGTTGGCTGGAAATGCTCGAGAGGACTACTTCGACGAAATACAGGAAAATGGAACCAATGCTGAAG
CTATTCAGAGCAGCCCATGA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

CCGAAATTAGGGTAGATTCCAGTATATACAAAAAACGATACTGATCACTATAAATATCGGAACGCATCAATTCATCCTTCACAGTCTTTGCCTGAAAATCCAAAATCGAG
CGAAAGCGGGAACGAAGGCGATTTTCCTGTTCTTCAATTCCTCAGGTGACTGTTAACATTTATCTCGACAACAATGGCCGTGTCTGTCAAGATGATGTCGCTTACTGTCG
CAGCTTTGGGTGTGATATCCTTTATATTTGGAGTCATTGCTGAGAACAAGAAGCCTGCATCTGGAACTCCCATCCAAGGAAAAGGCCTTGTTATCTGTCAATATCCGAGC
GACCCAACGGTGGTCTTGGGATATCTTTCCGTTGTATTTCTTCTTGCTTCATCAGTTGCAGGATACTTCTCTTTGTTCTATCCTTATAAAGGAAAATCCGTTCCTCGAGG
TGCCATTTTTAAGAGCAGCAGTTTCTCTGTTTTCTTCAACATCGCTGTGTTCACAACTGGATTGGCTATAACTTTGCTCGTATGGCCTACGGTCACCGAGCAACTTCATT
TGACCCGCAACGTTCATTACGATCTCGAGACAGCATGCCCGACTGCTAAGACTGGTCTTCTGGGTGGTGGTGCGTTTCTATCCCTCGATTCATCGCTCTTCTGGTTGATT
GCTCTGATGTTGGCTGGAAATGCTCGAGAGGACTACTTCGACGAAATACAGGAAAATGGAACCAATGCTGAAGCTATTCAGAGCAGCCCATGAAACTTGTTTGTTTAGTT
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Protein sequence

Show/hide protein sequence

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LLVWPTVTEQLHLTRNVHYDLETACPTAKTGLLGGGAFLSLDSSLFWLIALMLAGNAREDYFDEIQENGTNAEAIQSSP

Sed0019219 (gene) of Chayote v1 genome