; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Sed0019713 (gene) of Chayote v1 genome

Gene IDSed0019713
OrganismSechium edule (Chayote v1)
Descriptioninactive protein RESTRICTED TEV MOVEMENT 2-like
Genome locationLG01:63170534..63172563
RNA-Seq ExpressionSed0019713
SyntenySed0019713
Gene Ontology termsGO:0016020 - membrane (cellular component)
InterPro domainsIPR002068 - Alpha crystallin/Hsp20 domain
IPR008978 - HSP20-like chaperone
IPR045045 - Small heat shock protein RTM2-like


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6605846.1 Inactive protein RESTRICTED TEV MOVEMENT 2, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]7.1e-2647.26Show/hide
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XP_022153773.1 inactive protein RESTRICTED TEV MOVEMENT 2-like [Momordica charantia]2.6e-2856.8Show/hide
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XP_022995333.1 uncharacterized protein LOC111490909 [Cucurbita maxima]4.2e-2647.95Show/hide
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XP_023534144.1 uncharacterized protein LOC111795792 [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.1e-2647.95Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0L1N9 SHSP domain-containing protein1.1e-2157Show/hide
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A0A5A7T9W8 Circumsporozoite protein-like8.2e-2055Show/hide
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A0A6J1DIF9 inactive protein RESTRICTED TEV MOVEMENT 2-like1.3e-2856.8Show/hide
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A0A6J1H377 inactive protein RESTRICTED TEV MOVEMENT 2-like6.9e-2747.95Show/hide
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A0A6J1K7M4 uncharacterized protein LOC1114909092.0e-2647.95Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
D5K211 Inactive protein RESTRICTED TEV MOVEMENT 22.6e-1030.77Show/hide
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D9UBX4 Inactive protein RESTRICTED TEV MOVEMENT 22.6e-1030.77Show/hide
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D9UBX6 Inactive protein RESTRICTED TEV MOVEMENT 22.6e-1030.77Show/hide
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D9UC01 Inactive protein RESTRICTED TEV MOVEMENT 24.4e-1030.77Show/hide
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Q9M670 Protein RESTRICTED TEV MOVEMENT 22.6e-1030.77Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G27140.1 HSP20-like chaperones superfamily protein9.9e-1843.75Show/hide
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AT3G10680.1 HSP20-like chaperones superfamily protein1.4e-0830.34Show/hide
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        PT   F+P  +         L + LPGF ++QI ++    TR V+I G++P     + RFS+ +++P  CD   +S  +    L I  P
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AT5G04890.1 HSP20-like chaperones superfamily protein1.8e-1130.77Show/hide
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AT5G20970.1 HSP20-like chaperones superfamily protein1.3e-1231.97Show/hide
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          TP      +   + +G  P+
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCAATCAAACATGAGCAGCCAACTTTTGAAGATTTTGAACCTCTAGTAGAGACTTTGGAAGAGGATGGTTGCAGCTCTCTCGCCTTATACCTTCCTGGTTTCAGCAA
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AACTGCAATAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCAATCAAACATGAGCAGCCAACTTTTGAAGATTTTGAACCTCTAGTAGAGACTTTGGAAGAGGATGGTTGCAGCTCTCTCGCCTTATACCTTCCTGGTTTCAGCAA
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AACTGCAATAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAIKHEQPTFEDFEPLVETLEEDGCSSLALYLPGFSKEQIRVQIISSTRKVKISGEQPCINNAQQRFSKKFQIPPNCDTDNISVRYKGDTLHIRLPLRPESKPPLITTPT
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