CuGenDBv2

Gene ID	Sed0019800
Organism	Sechium edule (Chayote v1)
Description	Ribulose bisphosphate carboxylase large chain
Genome location	LG13:18469486..18469973
RNA-Seq Expression	Sed0019800
Synteny	Sed0019800
Gene Ontology terms	GO:0009853 - photorespiration (biological process) GO:0019253 - reductive pentose-phosphate cycle (biological process) GO:0009507 - chloroplast (cellular component) GO:0000287 - magnesium ion binding (molecular function) GO:0004497 - monooxygenase activity (molecular function) GO:0016984 - ribulose-bisphosphate carboxylase activity (molecular function)
InterPro domains	IPR017443 - Ribulose bisphosphate carboxylase, large subunit, ferrodoxin-like N-terminal IPR033966 - RuBisCO IPR036422 - RuBisCO large subunit, N-terminal domain superfamily

Homology

Show/hide homology

GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

AAZ94659.1 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit [Cucumis sativus]

3.4e-55

97.3

Show/hide

Query:  MSCREGLMSPQTETKASVGFKAGVKDYKLTYYTPEYETKDTDILAAFRVTPQPGVPPEEAGAAVAAESSTGTWTTVWTDGLTSLDCYKGRCYGIEPVAGE
        MSCREGLMSPQTETKASVGFKAGVKDYKLTYYTPEYETKDTDILAAFRVTPQPGVPPEEAGAAVAAESSTGTWTTVWTDGLTSLD YKGRCYGIEPVAGE
Subjt:  MSCREGLMSPQTETKASVGFKAGVKDYKLTYYTPEYETKDTDILAAFRVTPQPGVPPEEAGAAVAAESSTGTWTTVWTDGLTSLDCYKGRCYGIEPVAGE

Query:  ESQFIAYVAYP
        E+Q+IAYVAYP
Subjt:  ESQFIAYVAYP

QJD26304.1 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit [Trichosanthes kirilowii]

3.4e-55

97.3

Show/hide

Query:  MSCREGLMSPQTETKASVGFKAGVKDYKLTYYTPEYETKDTDILAAFRVTPQPGVPPEEAGAAVAAESSTGTWTTVWTDGLTSLDCYKGRCYGIEPVAGE
        MSCREGLMSPQTETKASVGFKAGVKDYKLTYYTPEYETKDTDILAAFRVTPQPGVPPEEAGAAVAAESSTGTWTTVWTDGLTSLD YKGRCYGIEPVAGE
Subjt:  MSCREGLMSPQTETKASVGFKAGVKDYKLTYYTPEYETKDTDILAAFRVTPQPGVPPEEAGAAVAAESSTGTWTTVWTDGLTSLDCYKGRCYGIEPVAGE

Query:  ESQFIAYVAYP
        E+Q+IAYVAYP
Subjt:  ESQFIAYVAYP

QJD26653.1 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit [Trichosanthes rosthornii]

3.4e-55

97.3

Show/hide

Query:  MSCREGLMSPQTETKASVGFKAGVKDYKLTYYTPEYETKDTDILAAFRVTPQPGVPPEEAGAAVAAESSTGTWTTVWTDGLTSLDCYKGRCYGIEPVAGE
        MSCREGLMSPQTETKASVGFKAGVKDYKLTYYTPEYETKDTDILAAFRVTPQPGVPPEEAGAAVAAESSTGTWTTVWTDGLTSLD YKGRCYGIEPVAGE
Subjt:  MSCREGLMSPQTETKASVGFKAGVKDYKLTYYTPEYETKDTDILAAFRVTPQPGVPPEEAGAAVAAESSTGTWTTVWTDGLTSLDCYKGRCYGIEPVAGE

Query:  ESQFIAYVAYP
        E+Q+IAYVAYP
Subjt:  ESQFIAYVAYP

YP_009486138.1 ribulose-1 [Ulmus chenmoui]

1.5e-55

98.2

Show/hide

Query:  MSCREGLMSPQTETKASVGFKAGVKDYKLTYYTPEYETKDTDILAAFRVTPQPGVPPEEAGAAVAAESSTGTWTTVWTDGLTSLDCYKGRCYGIEPVAGE
        MSCREGLMSPQTETKASVGFKAGVKDYKLTYYTPEYETKDTDILAAFRVTPQPGVPPEEAGAAVAAESSTGTWTTVWTDGLTSLD YKGRCYGIEPVAGE
Subjt:  MSCREGLMSPQTETKASVGFKAGVKDYKLTYYTPEYETKDTDILAAFRVTPQPGVPPEEAGAAVAAESSTGTWTTVWTDGLTSLDCYKGRCYGIEPVAGE

Query:  ESQFIAYVAYP
        E+QFIAYVAYP
Subjt:  ESQFIAYVAYP

YP_009525194.1 ribulose bisophosphate carboxylase [Hodgsonia macrocarpa]

3.4e-55

97.3

Show/hide

Query:  MSCREGLMSPQTETKASVGFKAGVKDYKLTYYTPEYETKDTDILAAFRVTPQPGVPPEEAGAAVAAESSTGTWTTVWTDGLTSLDCYKGRCYGIEPVAGE
        MSCREGLMSPQTETKASVGFKAGVKDYKLTYYTPEYETKDTDILAAFRVTPQPGVPPEEAGAAVAAESSTGTWTTVWTDGLTSLD YKGRCYGIEPVAGE
Subjt:  MSCREGLMSPQTETKASVGFKAGVKDYKLTYYTPEYETKDTDILAAFRVTPQPGVPPEEAGAAVAAESSTGTWTTVWTDGLTSLDCYKGRCYGIEPVAGE

Query:  ESQFIAYVAYP
        E+Q+IAYVAYP
Subjt:  ESQFIAYVAYP

TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A2S0SRQ1 Ribulose bisphosphate carboxylase large chain

7.4e-56

98.2

Show/hide

Query:  MSCREGLMSPQTETKASVGFKAGVKDYKLTYYTPEYETKDTDILAAFRVTPQPGVPPEEAGAAVAAESSTGTWTTVWTDGLTSLDCYKGRCYGIEPVAGE
        MSCREGLMSPQTETKASVGFKAGVKDYKLTYYTPEYETKDTDILAAFRVTPQPGVPPEEAGAAVAAESSTGTWTTVWTDGLTSLD YKGRCYGIEPVAGE
Subjt:  MSCREGLMSPQTETKASVGFKAGVKDYKLTYYTPEYETKDTDILAAFRVTPQPGVPPEEAGAAVAAESSTGTWTTVWTDGLTSLDCYKGRCYGIEPVAGE

Query:  ESQFIAYVAYP
        E+QFIAYVAYP
Subjt:  ESQFIAYVAYP

A0A2S1FWQ7 Ribulose bisphosphate carboxylase large chain

7.4e-56

98.2

Show/hide

Query:  MSCREGLMSPQTETKASVGFKAGVKDYKLTYYTPEYETKDTDILAAFRVTPQPGVPPEEAGAAVAAESSTGTWTTVWTDGLTSLDCYKGRCYGIEPVAGE
        MSCREGLMSPQTETKASVGFKAGVKDYKLTYYTPEYETKDTDILAAFRVTPQPGVPPEEAGAAVAAESSTGTWTTVWTDGLTSLD YKGRCYGIEPVAGE
Subjt:  MSCREGLMSPQTETKASVGFKAGVKDYKLTYYTPEYETKDTDILAAFRVTPQPGVPPEEAGAAVAAESSTGTWTTVWTDGLTSLDCYKGRCYGIEPVAGE

Query:  ESQFIAYVAYP
        E+QFIAYVAYP
Subjt:  ESQFIAYVAYP

A0A346QN70 Ribulose bisphosphate carboxylase large chain

1.7e-55

97.3

Show/hide

Query:  MSCREGLMSPQTETKASVGFKAGVKDYKLTYYTPEYETKDTDILAAFRVTPQPGVPPEEAGAAVAAESSTGTWTTVWTDGLTSLDCYKGRCYGIEPVAGE
        MSCREGLMSPQTETKASVGFKAGVKDYKLTYYTPEYETKDTDILAAFRVTPQPGVPPEEAGAAVAAESSTGTWTTVWTDGLTSLD YKGRCYGIEPVAGE
Subjt:  MSCREGLMSPQTETKASVGFKAGVKDYKLTYYTPEYETKDTDILAAFRVTPQPGVPPEEAGAAVAAESSTGTWTTVWTDGLTSLDCYKGRCYGIEPVAGE

Query:  ESQFIAYVAYP
        E+Q+IAYVAYP
Subjt:  ESQFIAYVAYP

A0A6M3RTS6 Ribulose bisphosphate carboxylase large chain

1.7e-55

97.3

Show/hide

Query:  MSCREGLMSPQTETKASVGFKAGVKDYKLTYYTPEYETKDTDILAAFRVTPQPGVPPEEAGAAVAAESSTGTWTTVWTDGLTSLDCYKGRCYGIEPVAGE
        MSCREGLMSPQTETKASVGFKAGVKDYKLTYYTPEYETKDTDILAAFRVTPQPGVPPEEAGAAVAAESSTGTWTTVWTDGLTSLD YKGRCYGIEPVAGE
Subjt:  MSCREGLMSPQTETKASVGFKAGVKDYKLTYYTPEYETKDTDILAAFRVTPQPGVPPEEAGAAVAAESSTGTWTTVWTDGLTSLDCYKGRCYGIEPVAGE

Query:  ESQFIAYVAYP
        E+Q+IAYVAYP
Subjt:  ESQFIAYVAYP

A0A6M3RU72 Ribulose bisphosphate carboxylase large chain

1.7e-55

97.3

Show/hide

Query:  MSCREGLMSPQTETKASVGFKAGVKDYKLTYYTPEYETKDTDILAAFRVTPQPGVPPEEAGAAVAAESSTGTWTTVWTDGLTSLDCYKGRCYGIEPVAGE
        MSCREGLMSPQTETKASVGFKAGVKDYKLTYYTPEYETKDTDILAAFRVTPQPGVPPEEAGAAVAAESSTGTWTTVWTDGLTSLD YKGRCYGIEPVAGE
Subjt:  MSCREGLMSPQTETKASVGFKAGVKDYKLTYYTPEYETKDTDILAAFRVTPQPGVPPEEAGAAVAAESSTGTWTTVWTDGLTSLDCYKGRCYGIEPVAGE

Query:  ESQFIAYVAYP
        E+Q+IAYVAYP
Subjt:  ESQFIAYVAYP

SwissProt top hits

e value

%identity

Alignment

B2LMK1 Ribulose bisphosphate carboxylase large chain

2.0e-53

97.12

Show/hide

Query:  MSPQTETKASVGFKAGVKDYKLTYYTPEYETKDTDILAAFRVTPQPGVPPEEAGAAVAAESSTGTWTTVWTDGLTSLDCYKGRCYGIEPVAGEESQFIAY
        MSPQTETKASVGFKAGVKDYKLTYYTPEYETKDTDILAAFRVTPQPGVPPEEAGAAVAAESSTGTWTTVWTDGLTSLD YKGRCYGIEPV GEE+QFIAY
Subjt:  MSPQTETKASVGFKAGVKDYKLTYYTPEYETKDTDILAAFRVTPQPGVPPEEAGAAVAAESSTGTWTTVWTDGLTSLDCYKGRCYGIEPVAGEESQFIAY

Query:  VAYP
        VAYP
Subjt:  VAYP

O62943 Ribulose bisphosphate carboxylase large chain

2.5e-53

96.15

Show/hide

Query:  MSPQTETKASVGFKAGVKDYKLTYYTPEYETKDTDILAAFRVTPQPGVPPEEAGAAVAAESSTGTWTTVWTDGLTSLDCYKGRCYGIEPVAGEESQFIAY
        MSPQTETKASVGFKAGVKDYKLTYYTP+YETKDTDILAAFRVTPQPGVPPEEAGAAVAAESSTGTWTTVWTDGLTSLD YKGRCYGIEPVAGEE+Q+IAY
Subjt:  MSPQTETKASVGFKAGVKDYKLTYYTPEYETKDTDILAAFRVTPQPGVPPEEAGAAVAAESSTGTWTTVWTDGLTSLDCYKGRCYGIEPVAGEESQFIAY

Query:  VAYP
        VAYP
Subjt:  VAYP

P27064 Ribulose bisphosphate carboxylase large chain

1.1e-53

97.12

Show/hide

Query:  MSPQTETKASVGFKAGVKDYKLTYYTPEYETKDTDILAAFRVTPQPGVPPEEAGAAVAAESSTGTWTTVWTDGLTSLDCYKGRCYGIEPVAGEESQFIAY
        MSPQTETKASVGFKAGVKDYKLTYYTPEYETKDTDILAAFRVTPQPGVPPEEAGAAVAAESSTGTWTTVWTDGLTSLD YKGRCYGIEPVAGEE+Q+IAY
Subjt:  MSPQTETKASVGFKAGVKDYKLTYYTPEYETKDTDILAAFRVTPQPGVPPEEAGAAVAAESSTGTWTTVWTDGLTSLDCYKGRCYGIEPVAGEESQFIAY

Query:  VAYP
        VAYP
Subjt:  VAYP

P51101 Ribulose bisphosphate carboxylase large chain

2.0e-53

97.12

Show/hide

Query:  MSPQTETKASVGFKAGVKDYKLTYYTPEYETKDTDILAAFRVTPQPGVPPEEAGAAVAAESSTGTWTTVWTDGLTSLDCYKGRCYGIEPVAGEESQFIAY
        MSPQTETKASVGFKAGVKDYKLTYYTP+YETKDTDILAAFRVTPQPGVPPEEAGAAVAAESSTGTWTTVWTDGLTSLD YKGRCYGIEPV GEESQFIAY
Subjt:  MSPQTETKASVGFKAGVKDYKLTYYTPEYETKDTDILAAFRVTPQPGVPPEEAGAAVAAESSTGTWTTVWTDGLTSLDCYKGRCYGIEPVAGEESQFIAY

Query:  VAYP
        VAYP
Subjt:  VAYP

Q01873 Ribulose bisphosphate carboxylase large chain

2.0e-53

98.08

Show/hide

Query:  MSPQTETKASVGFKAGVKDYKLTYYTPEYETKDTDILAAFRVTPQPGVPPEEAGAAVAAESSTGTWTTVWTDGLTSLDCYKGRCYGIEPVAGEESQFIAY
        MSPQTETKASVGFKAGVKDYKLTYYTPEYETKDTDILAAFRVTPQPGVPPEEAGAAVAAESSTGTWTTVWTDGLTSLD YKGRCY IEPVAGEESQFIAY
Subjt:  MSPQTETKASVGFKAGVKDYKLTYYTPEYETKDTDILAAFRVTPQPGVPPEEAGAAVAAESSTGTWTTVWTDGLTSLDCYKGRCYGIEPVAGEESQFIAY

Query:  VAYP
        VAYP
Subjt:  VAYP

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

ATCG00490.1 ribulose-bisphosphate carboxylases

3.4e-53

95.19

Show/hide

Query:  MSPQTETKASVGFKAGVKDYKLTYYTPEYETKDTDILAAFRVTPQPGVPPEEAGAAVAAESSTGTWTTVWTDGLTSLDCYKGRCYGIEPVAGEESQFIAY
        MSPQTETKASVGFKAGVK+YKLTYYTPEYETKDTDILAAFRVTPQPGVPPEEAGAAVAAESSTGTWTTVWTDGLTSLD YKGRCY IEPV GEE+QFIAY
Subjt:  MSPQTETKASVGFKAGVKDYKLTYYTPEYETKDTDILAAFRVTPQPGVPPEEAGAAVAAESSTGTWTTVWTDGLTSLDCYKGRCYGIEPVAGEESQFIAY

Query:  VAYP
        VAYP
Subjt:  VAYP

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGAGTTGTAGGGAGGGACTTATGTCACCACAAACAGAGACTAAAGCAAGTGTTGGATTCAAAGCTGGTGTTAAAGATTATAAATTGACTTATTATACTCCTGAATATGA
AACCAAAGATACTGATATCTTGGCAGCATTCCGAGTAACTCCTCAACCGGGAGTTCCACCCGAGGAAGCAGGGGCCGCTGTAGCTGCTGAATCTTCTACTGGTACATGGA
CAACTGTGTGGACCGATGGGCTTACCAGTCTTGATTGTTACAAAGGCCGATGCTATGGCATCGAGCCTGTTGCTGGAGAAGAAAGTCAATTTATTGCTTATGTAGCTTAT
CCCCAGACCTTTTGA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

ATCAAATACCATGGTCTAATAACGAACCATTCTGATTAGTTGATAATATTAGTTGAGAATTTTGTGAAAAGATTCCTATAAAAGGTTTCATTAACTCCTAATTCATGTCG
AGTAGACCTTGTTGTTGCGAGAATTCTTAATTCATGAGTTGTAGGGAGGGACTTATGTCACCACAAACAGAGACTAAAGCAAGTGTTGGATTCAAAGCTGGTGTTAAAGA
TTATAAATTGACTTATTATACTCCTGAATATGAAACCAAAGATACTGATATCTTGGCAGCATTCCGAGTAACTCCTCAACCGGGAGTTCCACCCGAGGAAGCAGGGGCCG
CTGTAGCTGCTGAATCTTCTACTGGTACATGGACAACTGTGTGGACCGATGGGCTTACCAGTCTTGATTGTTACAAAGGCCGATGCTATGGCATCGAGCCTGTTGCTGGA
GAAGAAAGTCAATTTATTGCTTATGTAGCTTATCCCCAGACCTTTTGA

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MSCREGLMSPQTETKASVGFKAGVKDYKLTYYTPEYETKDTDILAAFRVTPQPGVPPEEAGAAVAAESSTGTWTTVWTDGLTSLDCYKGRCYGIEPVAGEESQFIAYVAY
PQTF

Sed0019800 (gene) of Chayote v1 genome