; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Sed0019979 (gene) of Chayote v1 genome

Gene IDSed0019979
OrganismSechium edule (Chayote v1)
Descriptionzinc finger protein ZAT12-like
Genome locationLG04:40108041..40108983
RNA-Seq ExpressionSed0019979
SyntenySed0019979
Gene Ontology termsGO:0010200 - response to chitin (biological process)
InterPro domainsIPR013087 - Zinc finger C2H2-type
IPR036236 - Zinc finger C2H2 superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_008461644.1 PREDICTED: zinc finger protein ZAT12-like [Cucumis melo]9.0e-7781.68Show/hide
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XP_022985423.1 zinc finger protein ZAT12-like [Cucurbita maxima]7.6e-7684.29Show/hide
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XP_023545353.1 zinc finger protein ZAT12-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]9.9e-7682.63Show/hide
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XP_023553550.1 zinc finger protein ZAT12-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]4.5e-7683.77Show/hide
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XP_038892761.1 zinc finger protein ZAT12-like [Benincasa hispida]4.8e-7885.26Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3CF73 zinc finger protein ZAT12-like4.4e-7781.68Show/hide
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A0A6J1FVF5 zinc finger protein ZAT12-like2.4e-7583.94Show/hide
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A0A6J1GYC8 zinc finger protein ZAT12-like6.3e-7683.16Show/hide
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A0A6J1JDK2 zinc finger protein ZAT12-like3.7e-7684.29Show/hide
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A0A6J1JZD8 zinc finger protein ZAT12-like1.1e-7582.63Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q42410 Zinc finger protein ZAT121.2e-2643.86Show/hide
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        T ANCLMLLSR               +V+     RVF CKTC ++F SFQALGGHRASHKKP        N+D  +S L   +K  +H C ICG+EF +G
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        QALGGHMRRHR  +         R  AL P P      +KK++   R+ CLDL+L   +N +  L+LG+++
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Q681X4 Zinc finger protein ZAT52.3e-2240.09Show/hide
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        MA CL++L+R +V  +         H + SS NSS    V+ECKTCNR FSSFQALGGHRASHKKPR                    +G NS    S S+
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        L S          K HECSICG EF  GQALGGHMRRHR A T ++        S  S     +  + +      + L LDLNL   E+D   SKF  + 
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           + +++DC +
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Q9LFG0 Zinc finger protein ZAT181.2e-2041.48Show/hide
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        MKR+R D E       +   LM+LSRS V           S  N ++    FECKTCNRKF SFQALGGHRASHKKP+++  D       N       + 
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          H+C+IC   F  GQALGGHMR+HR T+++T         ++ P      P+  + + +  I  LDLNLTP END
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Q9LX85 Zinc finger protein ZAT89.5e-2140.53Show/hide
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        R  ++E +  T A CLMLLSR                       RVF CKTC ++FSSFQALGGHRASHKK  ++ +   +  GS S+     K KT   
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        H C ICG+EF +GQALGGHMRRHR+      TL+T +           P  +    +KK++   R+ CLDL+   S  + K L+LG++IS
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Q9SLD4 Zinc finger protein ZAT118.9e-2744.75Show/hide
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        MKRER D E       +A CLM+L+++S+      + H ES + N       FECKTCN++FSSFQALGGHRASHKKP++          SN   G+   
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Query:  PKTHECSICGLEFAIGQALGGHMRRHRATTLLTSNRHDDRNSALSPPPRSQPPLVKKTNGAGRILCLDLNLTPSENDSKFL
           H+CSIC   F  GQALGGHMRRHR++  +         S +SP   S  P++K+   + RIL LDLNLTP END +++
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G28200.1 C2H2-type zinc finger family protein1.6e-2340.09Show/hide
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        MA CL++L+R +V  +         H + SS NSS    V+ECKTCNR FSSFQALGGHRASHKKPR                    +G NS    S S+
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Query:  LGSPIK------PKTHECSICGLEFAIGQALGGHMRRHR-ATTLLTSNRHDDRNSALSPPPRSQPPLVKKTNGAGRILCLDLNLTPSEND---SKF--LQ
        L S          K HECSICG EF  GQALGGHMRRHR A T ++        S  S     +  + +      + L LDLNL   E+D   SKF  + 
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Query:  LGKSISMLDCFF
           + +++DC +
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AT2G28710.1 C2H2-type zinc finger family protein9.4e-3244.32Show/hide
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        M+R R D+E I  MANCL+LLS++    T S               RVF CKTCN++F SFQALGGHRASH++   +       +G        +KP  H
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        EC ICG EFA+GQALGGHMR+HR  +              S  P + P  +KK+ G    R+LCLDLNLTP EN+   L+LG+ I
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AT2G37430.1 C2H2 and C2HC zinc fingers superfamily protein6.3e-2844.75Show/hide
Query:  MKRER-DLESI---TTMANCLMLLSRSSVTATTSAD-HFESSSVNSSSPIRVFECKTCNRKFSSFQALGGHRASHKKPRIVGADGGNSDGSNSSLGSPIK
        MKRER D E       +A CLM+L+++S+      + H ES + N       FECKTCN++FSSFQALGGHRASHKKP++          SN   G+   
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Query:  PKTHECSICGLEFAIGQALGGHMRRHRATTLLTSNRHDDRNSALSPPPRSQPPLVKKTNGAGRILCLDLNLTPSENDSKFL
           H+CSIC   F  GQALGGHMRRHR++  +         S +SP   S  P++K+   + RIL LDLNLTP END +++
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AT3G46080.1 C2H2-type zinc finger family protein6.7e-2240.53Show/hide
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        R  ++E +  T A CLMLLSR                       RVF CKTC ++FSSFQALGGHRASHKK  ++ +   +  GS S+     K KT   
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Query:  HECSICGLEFAIGQALGGHMRRHRAT-----TLLTSNRHDDRNSALSPPPRSQPPLVKKTNGAGRILCLDLNLTPSENDSKFLQLGKSIS
        H C ICG+EF +GQALGGHMRRHR+      TL+T +           P  +    +KK++   R+ CLDL+   S  + K L+LG++IS
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AT5G59820.1 C2H2-type zinc finger family protein8.2e-2843.86Show/hide
Query:  TMANCLMLLSRSSVTATTSADHFESSSVNSSSPIRVFECKTCNRKFSSFQALGGHRASHKKPRIVGADGGNSDGSNSSLGSPIKPKTHECSICGLEFAIG
        T ANCLMLLSR               +V+     RVF CKTC ++F SFQALGGHRASHKKP        N+D  +S L   +K  +H C ICG+EF +G
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Query:  QALGGHMRRHRATTLLTSNRHDDRNSALSPPPRSQPPLVKKTNGAGRILCLDLNLTPSENDSKFLQLGKSI
        QALGGHMRRHR  +         R  AL P P      +KK++   R+ CLDL+L   +N +  L+LG+++
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAAGAGAGAGAGAGATCTCGAGAGCATAACAACCATGGCGAACTGCTTGATGTTACTTTCTCGCAGCAGCGTTACGGCCACCACTTCTGCAGATCATTTCGAATCCTC
CTCTGTTAATTCATCTTCTCCGATTCGCGTTTTCGAGTGCAAGACCTGTAATCGGAAGTTTTCGTCGTTTCAGGCCCTCGGCGGCCACCGTGCCAGTCACAAGAAGCCGC
GGATTGTCGGTGCCGACGGCGGAAACTCCGATGGATCTAACTCCTCGCTTGGATCTCCGATCAAGCCGAAGACGCACGAGTGTAGTATCTGTGGATTGGAGTTTGCGATT
GGCCAAGCGCTTGGAGGACATATGAGGAGACATAGAGCCACCACGCTGTTGACGAGTAATCGTCATGATGATCGGAATAGCGCCTTGTCTCCTCCGCCGCGTTCTCAACC
GCCTCTGGTTAAGAAGACGAACGGCGCTGGGAGGATTTTGTGCTTGGATCTGAACTTGACTCCGTCTGAGAACGATAGTAAGTTTCTGCAGCTTGGAAAGAGTATTTCCA
TGCTTGATTGTTTCTTCTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GTCATTTCCCAAATGTCAACTGGCGCTTTCTCTCTCATACACGAATATTTATAAATAAACCCAACCAATCCAGTTCAGAATTCTATTCCTTCACACAATTTGAATGAAAA
CGCCATTTCCGTTTTAGAGAGAGAATCATTTTGAGCTTCAATCATCATGAAGAGAGAGAGAGATCTCGAGAGCATAACAACCATGGCGAACTGCTTGATGTTACTTTCTC
GCAGCAGCGTTACGGCCACCACTTCTGCAGATCATTTCGAATCCTCCTCTGTTAATTCATCTTCTCCGATTCGCGTTTTCGAGTGCAAGACCTGTAATCGGAAGTTTTCG
TCGTTTCAGGCCCTCGGCGGCCACCGTGCCAGTCACAAGAAGCCGCGGATTGTCGGTGCCGACGGCGGAAACTCCGATGGATCTAACTCCTCGCTTGGATCTCCGATCAA
GCCGAAGACGCACGAGTGTAGTATCTGTGGATTGGAGTTTGCGATTGGCCAAGCGCTTGGAGGACATATGAGGAGACATAGAGCCACCACGCTGTTGACGAGTAATCGTC
ATGATGATCGGAATAGCGCCTTGTCTCCTCCGCCGCGTTCTCAACCGCCTCTGGTTAAGAAGACGAACGGCGCTGGGAGGATTTTGTGCTTGGATCTGAACTTGACTCCG
TCTGAGAACGATAGTAAGTTTCTGCAGCTTGGAAAGAGTATTTCCATGCTTGATTGTTTCTTCTGAAATTTTACAGTACATATTCAACCAGATCGATCAGGATCATGAGT
TTTTGTTTCTTTTTTTTTTTGCCTTCTTTTTCTTTTTTGATACTGTAATCTACATCTCTTTGTTTGTTTACAACTATACACACATATACATACATCCAGATCTTCATATA
CTCCGTTCTGGTCGGTTCTTCAATTTATGGAATATTTCATGTGAAAAACTGCTTTAGATCAAT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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