; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Sed0019995 (gene) of Chayote v1 genome

Gene IDSed0019995
OrganismSechium edule (Chayote v1)
Description40S ribosomal protein S14
Genome locationLG01:16581494..16585790
RNA-Seq ExpressionSed0019995
SyntenySed0019995
Gene Ontology termsGO:0000028 - ribosomal small subunit assembly (biological process)
GO:0000462 - maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) (biological process)
GO:0006412 - translation (biological process)
GO:0044038 - cell wall macromolecule biosynthetic process (biological process)
GO:0071555 - cell wall organization (biological process)
GO:0005887 - integral component of plasma membrane (cellular component)
GO:0022627 - cytosolic small ribosomal subunit (cellular component)
GO:0003735 - structural constituent of ribosome (molecular function)
GO:0008963 - phospho-N-acetylmuramoyl-pentapeptide-transferase activity (molecular function)
GO:0048027 - mRNA 5'-UTR binding (molecular function)
GO:0070181 - small ribosomal subunit rRNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001971 - Ribosomal protein S11
IPR018102 - Ribosomal S11, conserved site
IPR036967 - Ribosomal protein S11 superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6573353.1 hypothetical protein SDJN03_27240, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]3.1e-7799.34Show/hide
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KAG6583920.1 hypothetical protein SDJN03_19852, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.8e-8596.51Show/hide
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KAG7012516.1 40S ribosomal protein S14-2, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]4.0e-9395.14Show/hide
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XP_004147409.1 40S ribosomal protein S14-2 [Cucumis sativus]3.1e-7799.34Show/hide
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XP_038893713.1 40S ribosomal protein S14-2-like [Benincasa hispida]6.8e-7798.68Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LGP6 Uncharacterized protein1.1e-7599.33Show/hide
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A0A1S3B9H6 40S ribosomal protein S14-2-like1.5e-7799.34Show/hide
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A0A6J1GTR2 40S ribosomal protein S14-2-like1.5e-7799.34Show/hide
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A0A6J1J4Y9 40S ribosomal protein S14-21.1e-7599.33Show/hide
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A0A6J1KQN4 40S ribosomal protein S14-2-like1.5e-7799.34Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
P19950 40S ribosomal protein S142.1e-7394.63Show/hide
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P19951 40S ribosomal protein S143.3e-7494.08Show/hide
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P42036 40S ribosomal protein S14-31.2e-7391.95Show/hide
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Q9CAX6 40S ribosomal protein S14-25.6e-7492.62Show/hide
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Q9SIH0 40S ribosomal protein S14-14.7e-7391.28Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G36160.1 Ribosomal protein S11 family protein3.4e-7491.28Show/hide
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AT3G11510.1 Ribosomal protein S11 family protein4.0e-7592.62Show/hide
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AT3G52580.1 Ribosomal protein S11 family protein8.9e-7591.95Show/hide
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ATCG00750.1 ribosomal protein S113.1e-1132.19Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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TGGCTCGAGGAGGAAGACTAGGGAACCGAAGGAAGAGACTGTTACACTTGGACCTGCTGTGAGGGAAGGCGAGCATGTATTTGGCGTGGCTCACATTTTTGCCTCATTTA
ATGATACGTTTATTCACGTGACTGATCTTTCAGGGAGGGAAACACTTGTCCGTGTCACAGGTGGAATGAAGGTGAAAGCTGACAGAGATGAATCCTCCCCATACGCAGCT
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mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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ATGATACGTTTATTCACGTGACTGATCTTTCAGGGAGGGAAACACTTGTCCGTGTCACAGGTGGAATGAAGGTGAAAGCTGACAGAGATGAATCCTCCCCATACGCAGCT
ATGCTTGCTGCACAGGATGTTTCTCAGAGATGCAAGGAACTGGGCATCACTGCCCTTCATATTAAACTGCGTGCCACCGGAGGAAACAAGACCAAGACACCAGGCCCAGG
TGCTCAGTCTGCACTCCGTGCTCTTGCTCGATCTGGAATGAGGATTGGTCGTATTGAGGACGTGACTCCCATTCCAACAGACAGCACTCGCCGTAAGGGTGGACGAAGAG
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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