; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Sed0020121 (gene) of Chayote v1 genome

Gene IDSed0020121
OrganismSechium edule (Chayote v1)
Descriptionpolcalcin Ole e 3
Genome locationLG01:29911403..29911657
RNA-Seq ExpressionSed0020121
SyntenySed0020121
Gene Ontology termsGO:0012505 - endomembrane system (cellular component)
GO:0016020 - membrane (cellular component)
GO:0005509 - calcium ion binding (molecular function)
InterPro domainsIPR002048 - EF-hand domain
IPR011992 - EF-hand domain pair
IPR018247 - EF-Hand 1, calcium-binding site


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004140303.1 polcalcin Ole e 3 [Cucumis sativus]3.4e-3696.43Show/hide
Query:  MADDPQDQAERERIFKRFDANGDGKISSAELGESLKTLGSVTADEVQRMMAEIDTDGDGFISFEEFTEFARANRGLVKDVAKIF
        MADDPQDQAERERIFKRFDANGDGKISSAELGE+LKTLGSVTADEVQRMMAEIDTDGDGFIS+EEFT+FARANRGLVKDVAKIF
Subjt:  MADDPQDQAERERIFKRFDANGDGKISSAELGESLKTLGSVTADEVQRMMAEIDTDGDGFISFEEFTEFARANRGLVKDVAKIF

XP_016902555.1 PREDICTED: polcalcin Ole e 3 [Cucumis melo]7.6e-3695.24Show/hide
Query:  MADDPQDQAERERIFKRFDANGDGKISSAELGESLKTLGSVTADEVQRMMAEIDTDGDGFISFEEFTEFARANRGLVKDVAKIF
        MADDPQDQAERERIFKRFDANGDGKISS+ELGE+LKTLGSVTADEVQRMMAEIDTDGDGFIS+EEFT+FARANRGLVKDVAKIF
Subjt:  MADDPQDQAERERIFKRFDANGDGKISSAELGESLKTLGSVTADEVQRMMAEIDTDGDGFISFEEFTEFARANRGLVKDVAKIF

XP_022141635.1 polcalcin Bet v 4 [Momordica charantia]1.4e-3491.67Show/hide
Query:  MADDPQDQAERERIFKRFDANGDGKISSAELGESLKTLGSVTADEVQRMMAEIDTDGDGFISFEEFTEFARANRGLVKDVAKIF
        MADDPQD+ ER+RIFKRFDANGDGKIS+AELGE+LKTLGSVTADEVQRMMAEIDTDGDGFIS+EEFT+FARANRGLVKDVAKIF
Subjt:  MADDPQDQAERERIFKRFDANGDGKISSAELGESLKTLGSVTADEVQRMMAEIDTDGDGFISFEEFTEFARANRGLVKDVAKIF

XP_031392869.1 polcalcin Ole e 3 [Punica granatum]2.7e-3390.48Show/hide
Query:  MADDPQDQAERERIFKRFDANGDGKISSAELGESLKTLGSVTADEVQRMMAEIDTDGDGFISFEEFTEFARANRGLVKDVAKIF
        MADDPQ+ AERERIFKRFDANGDGKISSAELG++LKTLGSVTA+EVQRMMAEIDTDGDGFIS EEFT+FARANRGL+KDVAKIF
Subjt:  MADDPQDQAERERIFKRFDANGDGKISSAELGESLKTLGSVTADEVQRMMAEIDTDGDGFISFEEFTEFARANRGLVKDVAKIF

XP_038875780.1 polcalcin Ole e 3 [Benincasa hispida]1.7e-3594.05Show/hide
Query:  MADDPQDQAERERIFKRFDANGDGKISSAELGESLKTLGSVTADEVQRMMAEIDTDGDGFISFEEFTEFARANRGLVKDVAKIF
        MADDPQDQAERERIFKRFDANGDGKIS++ELGE+LKTLGSVTADEVQRMMAEIDTDGDGFIS+EEFT+FARANRGLVKDVAKIF
Subjt:  MADDPQDQAERERIFKRFDANGDGKISSAELGESLKTLGSVTADEVQRMMAEIDTDGDGFISFEEFTEFARANRGLVKDVAKIF

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KQB8 Uncharacterized protein1.7e-3696.43Show/hide
Query:  MADDPQDQAERERIFKRFDANGDGKISSAELGESLKTLGSVTADEVQRMMAEIDTDGDGFISFEEFTEFARANRGLVKDVAKIF
        MADDPQDQAERERIFKRFDANGDGKISSAELGE+LKTLGSVTADEVQRMMAEIDTDGDGFIS+EEFT+FARANRGLVKDVAKIF
Subjt:  MADDPQDQAERERIFKRFDANGDGKISSAELGESLKTLGSVTADEVQRMMAEIDTDGDGFISFEEFTEFARANRGLVKDVAKIF

A0A1S4E3J8 polcalcin Ole e 33.7e-3695.24Show/hide
Query:  MADDPQDQAERERIFKRFDANGDGKISSAELGESLKTLGSVTADEVQRMMAEIDTDGDGFISFEEFTEFARANRGLVKDVAKIF
        MADDPQDQAERERIFKRFDANGDGKISS+ELGE+LKTLGSVTADEVQRMMAEIDTDGDGFIS+EEFT+FARANRGLVKDVAKIF
Subjt:  MADDPQDQAERERIFKRFDANGDGKISSAELGESLKTLGSVTADEVQRMMAEIDTDGDGFISFEEFTEFARANRGLVKDVAKIF

A0A5A7V407 Polcalcin Ole e 33.7e-3695.24Show/hide
Query:  MADDPQDQAERERIFKRFDANGDGKISSAELGESLKTLGSVTADEVQRMMAEIDTDGDGFISFEEFTEFARANRGLVKDVAKIF
        MADDPQDQAERERIFKRFDANGDGKISS+ELGE+LKTLGSVTADEVQRMMAEIDTDGDGFIS+EEFT+FARANRGLVKDVAKIF
Subjt:  MADDPQDQAERERIFKRFDANGDGKISSAELGESLKTLGSVTADEVQRMMAEIDTDGDGFISFEEFTEFARANRGLVKDVAKIF

A0A6J1CIN1 polcalcin Bet v 47.0e-3591.67Show/hide
Query:  MADDPQDQAERERIFKRFDANGDGKISSAELGESLKTLGSVTADEVQRMMAEIDTDGDGFISFEEFTEFARANRGLVKDVAKIF
        MADDPQD+ ER+RIFKRFDANGDGKIS+AELGE+LKTLGSVTADEVQRMMAEIDTDGDGFIS+EEFT+FARANRGLVKDVAKIF
Subjt:  MADDPQDQAERERIFKRFDANGDGKISSAELGESLKTLGSVTADEVQRMMAEIDTDGDGFISFEEFTEFARANRGLVKDVAKIF

A0A7N0TTI6 Uncharacterized protein1.0e-3389.29Show/hide
Query:  MADDPQDQAERERIFKRFDANGDGKISSAELGESLKTLGSVTADEVQRMMAEIDTDGDGFISFEEFTEFARANRGLVKDVAKIF
        MADD QDQAERERIFKRFDANGDGKISS+ELGE+LK+LGSVTADEVQRMM EIDTDGDGFIS++EFTEFA+ANRGLVKDVAK+F
Subjt:  MADDPQDQAERERIFKRFDANGDGKISSAELGESLKTLGSVTADEVQRMMAEIDTDGDGFISFEEFTEFARANRGLVKDVAKIF

SwissProt top hitse value%identityAlignment
O81092 Polcalcin Ole e 31.4e-3589.29Show/hide
Query:  MADDPQDQAERERIFKRFDANGDGKISSAELGESLKTLGSVTADEVQRMMAEIDTDGDGFISFEEFTEFARANRGLVKDVAKIF
        MADDPQ+ AE ERIFKRFDANGDGKISS+ELGE+LKTLGSVT +E+QRMMAEIDTDGDGFISFEEFT FARANRGLVKDVAKIF
Subjt:  MADDPQDQAERERIFKRFDANGDGKISSAELGESLKTLGSVTADEVQRMMAEIDTDGDGFISFEEFTEFARANRGLVKDVAKIF

O81701 Polcalcin Aln g 42.8e-3385.88Show/hide
Query:  MADD-PQDQAERERIFKRFDANGDGKISSAELGESLKTLGSVTADEVQRMMAEIDTDGDGFISFEEFTEFARANRGLVKDVAKIF
        MADD PQDQAE ERIFK FDANGDGKIS++ELG++LKTLGSVT DEV+ MMAEIDTDGDGFISF+EFT FARANRGLVKDVAKIF
Subjt:  MADD-PQDQAERERIFKRFDANGDGKISSAELGESLKTLGSVTADEVQRMMAEIDTDGDGFISFEEFTEFARANRGLVKDVAKIF

Q39419 Polcalcin Bet v 42.5e-3485.88Show/hide
Query:  MADD-PQDQAERERIFKRFDANGDGKISSAELGESLKTLGSVTADEVQRMMAEIDTDGDGFISFEEFTEFARANRGLVKDVAKIF
        MADD PQD+AERERIFKRFDANGDGKIS+AELGE+LKTLGS+T DEV+ MMAEIDTDGDGFISF+EFT+F RANRGL+KDVAKIF
Subjt:  MADD-PQDQAERERIFKRFDANGDGKISSAELGESLKTLGSVTADEVQRMMAEIDTDGDGFISFEEFTEFARANRGLVKDVAKIF

Q84V36 Polcalcin Che a 32.8e-3385.37Show/hide
Query:  DDPQDQAERERIFKRFDANGDGKISSAELGESLKTLGSVTADEVQRMMAEIDTDGDGFISFEEFTEFARANRGLVKDVAKIF
        D PQD A+RERIFKRFD NGDGKISS+ELG++LKTLGSVT DEV+RMMAEIDTDGDGFISF+EFT+FARANRGLVKDV+KIF
Subjt:  DDPQDQAERERIFKRFDANGDGKISSAELGESLKTLGSVTADEVQRMMAEIDTDGDGFISFEEFTEFARANRGLVKDVAKIF

Q8VWY6 Polcalcin Nic t 17.4e-3483.33Show/hide
Query:  MADDPQDQAERERIFKRFDANGDGKISSAELGESLKTLGSVTADEVQRMMAEIDTDGDGFISFEEFTEFARANRGLVKDVAKIF
        MA+DPQD A+RERIFKRFD NGDGKISSAELGE+LK LGSVT++EVQ MMAE+DTDGDGFIS+EEF EFARANRGL+KDVAK+F
Subjt:  MADDPQDQAERERIFKRFDANGDGKISSAELGESLKTLGSVTADEVQRMMAEIDTDGDGFISFEEFTEFARANRGLVKDVAKIF

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G18210.1 Calcium-binding EF-hand family protein1.5e-1043.66Show/hide
Query:  DPQDQAERERIFKRFDANGDGKISSAELGESLKTLG-SVTADEVQRMMAEIDTDGDGFISFEEFTEFARAN
        D  +  E +++F +FD+NGDGKIS  ELG   K +G S T  E+ R++ E+DTD DG+I+ +EF+   R++
Subjt:  DPQDQAERERIFKRFDANGDGKISSAELGESLKTLG-SVTADEVQRMMAEIDTDGDGFISFEEFTEFARAN

AT1G24620.1 EF hand calcium-binding protein family8.2e-1255Show/hide
Query:  ERERIFKRFDANGDGKISSAELGESLKTLG-SVTADEVQRMMAEIDTDGDGFISFEEFTE
        E E +FK+FD NGDGKISS ELG  + +LG  V  +E+++ + EID  GDG+I+FEEF E
Subjt:  ERERIFKRFDANGDGKISSAELGESLKTLG-SVTADEVQRMMAEIDTDGDGFISFEEFTE

AT1G73630.1 EF hand calcium-binding protein family2.2e-1246.67Show/hide
Query:  PQDQAERERIFKRFDANGDGKISSAELGESLKTLG-SVTADEVQRMMAEIDTDGDGFISFEEFTEFARANRGLVK
        P    E +++F +FDANGDGKIS +ELG   K++G S T +E+ R++ EID D DGFI+ EEF    R++   V+
Subjt:  PQDQAERERIFKRFDANGDGKISSAELGESLKTLG-SVTADEVQRMMAEIDTDGDGFISFEEFTEFARANRGLVK

AT3G03430.1 Calcium-binding EF-hand family protein7.4e-2971.6Show/hide
Query:  DPQDQAERERIFKRFDANGDGKISSAELGESLKTLGSVTADEVQRMMAEIDTDGDGFISFEEFTEFARANRGLVKDVAKIF
        D  ++AE +RIFK+FDANGDGKIS+AELG++LK LGSVT ++++RMMAEIDTDGDG+IS++EF +FA ANRGL+KDVAKIF
Subjt:  DPQDQAERERIFKRFDANGDGKISSAELGESLKTLGSVTADEVQRMMAEIDTDGDGFISFEEFTEFARANRGLVKDVAKIF

AT5G17480.1 pollen calcium-binding protein 15.1e-3077.78Show/hide
Query:  DPQDQAERERIFKRFDANGDGKISSAELGESLKTLGSVTADEVQRMMAEIDTDGDGFISFEEFTEFARANRGLVKDVAKIF
        D  ++AE +RIFK+FDANGDGKIS+AEL E+LKTLGSVTAD+V+RMMAEIDTDGDG IS++EFT+FA ANRGL+KDVAKIF
Subjt:  DPQDQAERERIFKRFDANGDGKISSAELGESLKTLGSVTADEVQRMMAEIDTDGDGFISFEEFTEFARANRGLVKDVAKIF


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCTGATGATCCTCAAGACCAAGCTGAGCGAGAACGCATTTTCAAGCGCTTCGATGCCAATGGCGACGGTAAGATCTCTTCAGCTGAGCTTGGGGAATCCTTGAAGAC
GCTCGGCTCTGTCACTGCTGATGAAGTGCAGCGGATGATGGCAGAGATCGACACCGACGGCGACGGGTTCATCTCGTTTGAGGAGTTCACCGAATTCGCCCGTGCTAATC
GTGGATTAGTTAAGGATGTTGCAAAGATATTCTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCTGATGATCCTCAAGACCAAGCTGAGCGAGAACGCATTTTCAAGCGCTTCGATGCCAATGGCGACGGTAAGATCTCTTCAGCTGAGCTTGGGGAATCCTTGAAGAC
GCTCGGCTCTGTCACTGCTGATGAAGTGCAGCGGATGATGGCAGAGATCGACACCGACGGCGACGGGTTCATCTCGTTTGAGGAGTTCACCGAATTCGCCCGTGCTAATC
GTGGATTAGTTAAGGATGTTGCAAAGATATTCTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MADDPQDQAERERIFKRFDANGDGKISSAELGESLKTLGSVTADEVQRMMAEIDTDGDGFISFEEFTEFARANRGLVKDVAKIF