; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Sed0020162 (gene) of Chayote v1 genome

Gene IDSed0020162
OrganismSechium edule (Chayote v1)
DescriptionHomeobox-leucine zipper protein like
Genome locationLG07:15100056..15102957
RNA-Seq ExpressionSed0020162
SyntenySed0020162
Gene Ontology termsGO:0006357 - regulation of transcription by RNA polymerase II (biological process)
GO:0045893 - positive regulation of transcription, DNA-templated (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0000981 - DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific (molecular function)
GO:0043565 - sequence-specific DNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR000047 - Helix-turn-helix motif
IPR001356 - Homeobox domain
IPR009057 - Homeobox-like domain superfamily
IPR017970 - Homeobox, conserved site


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7031239.1 Homeobox-leucine zipper protein ATHB-40 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.4e-8381.4Show/hide
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XP_022943109.1 homeobox-leucine zipper protein ATHB-40-like [Cucurbita moschata]3.1e-8380.93Show/hide
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XP_023512650.1 homeobox-leucine zipper protein ATHB-40-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]7.7e-8280Show/hide
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XP_038877287.1 homeobox-leucine zipper protein ATHB-40-like [Benincasa hispida]1.7e-8482.33Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KWL3 Homeobox domain-containing protein1.1e-7674.43Show/hide
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A0A1S3BY52 homeobox-leucine zipper protein ATHB-401.6e-8077.52Show/hide
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A0A6J1C5L6 homeobox-leucine zipper protein ATHB-40-like3.3e-7876.55Show/hide
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A0A6J1FTB2 homeobox-leucine zipper protein ATHB-40-like1.5e-8380.93Show/hide
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A0A6J1J034 homeobox-leucine zipper protein ATHB-40-like4.1e-8179.53Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
A2XDK5 Homeobox-leucine zipper protein HOX122.2e-2645.83Show/hide
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        V++ C LE E+LKLKE+L++V +EK +L              G  +  P SSS S +   P   G+FG
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O23208 Homeobox-leucine zipper protein ATHB-402.4e-4652.73Show/hide
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        FY +PE+S I + EW + YI
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Q10QF2 Homeobox-leucine zipper protein HOX122.2e-2645.83Show/hide
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        KAR+RR++    EA AA          AKKR+L++EQ   LE +F  E KLE+ RK +LA+ELGLD +QVAVWFQNRRAR K+K +EEE+  L+  H++V
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        V++ C LE E+LKLKE+L++V +EK +L              G  +  P SSS S +   P   G+FG
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Q9LVR0 Homeobox-leucine zipper protein ATHB-533.7e-3449.73Show/hide
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        +C+LE++ILKL EQLSE   E  +L   ER +  P +SSSS L       PT          ++ +YM +++ +  ME W   Y+
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Q9ZU70 Homeobox-leucine zipper protein ATHB-211.3e-3955.68Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G18550.1 homeobox protein 219.2e-4155.68Show/hide
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AT2G46680.1 homeobox 72.2e-1846.22Show/hide
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        +R+ ++EQ+  LE  F SE +LE  +K +LA ELGL PRQVA+WFQN+RARWK+K+LE E       Y NL    ES+  EK  L +E+ +LKE   +  
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Query:  KEKERLIMGERADGPLSSS
        +E+ER   G++A   LSS+
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AT3G01470.1 homeobox 14.8e-2155.67Show/hide
Query:  KKRKLTEEQVHLLETNFGSEHKLESERKDRLASELGLDPRQVAVWFQNRRARWKNKKLEEEYCNLKKI-------HESVVVEKCRLENEILKLKEQL
        KKR+LT EQVHLLE +F +E+KLE ERK +LA +LGL PRQVAVWFQNRRARWK K+LE +Y  LK         ++S+V++  +L +E+  L E+L
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AT4G36740.1 homeobox protein 401.7e-4752.73Show/hide
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        QNRRARWKNK+LEEEY  LK  H++VVV+KCRLE+E+++LKEQL +  +E +RL   ER +G   SS+SP+  +               +G+ G  ++ +
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        FY +PE+S I + EW + YI
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AT5G66700.1 homeobox 532.6e-3549.73Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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GGCGAGACGACGTCGTAAGAAGAACAAAGGATCGGAAGCGGAGGCGGCAGCGAAGAAGCGGAAGCTGACAGAGGAGCAAGTTCATCTTTTGGAGACAAATTTTGGGAGTG
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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