; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Sed0020175 (gene) of Chayote v1 genome

Gene IDSed0020175
OrganismSechium edule (Chayote v1)
DescriptionATP-dependent Clp protease proteolytic subunit
Genome locationLG05:23609310..23614804
RNA-Seq ExpressionSed0020175
SyntenySed0020175
Gene Ontology termsGO:0006515 - protein quality control for misfolded or incompletely synthesized proteins (biological process)
GO:0009526 - plastid envelope (cellular component)
GO:0009534 - chloroplast thylakoid (cellular component)
GO:0009840 - chloroplastic endopeptidase Clp complex (cellular component)
GO:0004176 - ATP-dependent peptidase activity (molecular function)
GO:0004252 - serine-type endopeptidase activity (molecular function)
GO:0051117 - ATPase binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001907 - ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit
IPR018215 - ClpP, Ser active site
IPR023562 - Clp protease proteolytic subunit /Translocation-enhancing protein TepA
IPR029045 - ClpP/crotonase-like domain superfamily
IPR033135 - ClpP, histidine active site


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7036637.1 ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit 5, chloroplastic [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]2.4e-15690.79Show/hide
Query:  MAHTFTYTSASSFGLNPIVSVPNSSAFSDPQKLFLPLQNFHSRKLGTLVGGGRNLKNSPVKAIYSSDFSSLDRSSRQGIWSIRDDVQIPSSPFLSTYAQG
        MAHTFTYTSASSF LN +VSVPNSS+ S+ QKLFLPL+NFHSRKLG LVGGGRNLKNSPVKAIYS +FSSLD+SSRQG+WSIRDDVQIPSSP+  TYAQG
Subjt:  MAHTFTYTSASSFGLNPIVSVPNSSAFSDPQKLFLPLQNFHSRKLGTLVGGGRNLKNSPVKAIYSSDFSSLDRSSRQGIWSIRDDVQIPSSPFLSTYAQG

Query:  QGPPPMVQERFQSVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAVNPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTIRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSA
        QGPPPMVQERFQSVISQLFQ+RI+RCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAV+PNKDI++YVNSPGGSVTAGMAIFDT+RHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSA
Subjt:  QGPPPMVQERFQSVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAVNPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTIRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSA

Query:  GTKGKRYSLPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKANLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKDYGLIDGVIMNPLKAFQPLAAAAST
        GTKGKRYSLPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEML+HKANLNGYLSYHTGQSLEKIN+DTDRDFFMSAKEA++YGLIDGVIMNPLKAFQPLAAAAST
Subjt:  GTKGKRYSLPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKANLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKDYGLIDGVIMNPLKAFQPLAAAAST

Query:  EDRP
        E+ P
Subjt:  EDRP

XP_008454281.1 PREDICTED: ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit 5, chloroplastic [Cucumis melo]4.9e-15791.78Show/hide
Query:  MAHTFTYTSASSFGLNPIVSVPNSSAFSDPQKLFLPLQNFHSRKLGTLVGGGRNLKNSPVKAIYSSDFSSLDRSSRQGIWSIRDDVQIPSSPFLSTYAQG
        MAHTF YTSASSF LN +VSVPNSS+ SD QK FLPL+ FHSRKLG LVGGGRNLKNSPVKA+YS +FSS+DR+SRQGIWSIRDDVQ+PSSP+   YAQG
Subjt:  MAHTFTYTSASSFGLNPIVSVPNSSAFSDPQKLFLPLQNFHSRKLGTLVGGGRNLKNSPVKAIYSSDFSSLDRSSRQGIWSIRDDVQIPSSPFLSTYAQG

Query:  QGPPPMVQERFQSVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAVNPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTIRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSA
        QGPPPMVQERFQSVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAV+PNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDT+RHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSA
Subjt:  QGPPPMVQERFQSVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAVNPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTIRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSA

Query:  GTKGKRYSLPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKANLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKDYGLIDGVIMNPLKAFQPLAAAAST
        GTKGKRYSLPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKANLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKDYGLIDGVIMNPLKA QPLAAAAST
Subjt:  GTKGKRYSLPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKANLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKDYGLIDGVIMNPLKAFQPLAAAAST

Query:  EDRP
        ED+P
Subjt:  EDRP

XP_022948813.1 ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit 5, chloroplastic [Cucurbita moschata]2.1e-15590.13Show/hide
Query:  MAHTFTYTSASSFGLNPIVSVPNSSAFSDPQKLFLPLQNFHSRKLGTLVGGGRNLKNSPVKAIYSSDFSSLDRSSRQGIWSIRDDVQIPSSPFLSTYAQG
        MAHTFTYTSASSF LN +VSVPNSS+ S+ QKLFLPL+NFHSRKLG  VGGGRNLKNSPVKAIYS +FSSLD+SSR+G+WSIRDDVQIPSSP+  TYAQG
Subjt:  MAHTFTYTSASSFGLNPIVSVPNSSAFSDPQKLFLPLQNFHSRKLGTLVGGGRNLKNSPVKAIYSSDFSSLDRSSRQGIWSIRDDVQIPSSPFLSTYAQG

Query:  QGPPPMVQERFQSVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAVNPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTIRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSA
        QGPPPMVQERFQSVISQLFQ+RI+RCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAV+PNKDI++YVNSPGGSVTAGMAIFDT+RHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSA
Subjt:  QGPPPMVQERFQSVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAVNPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTIRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSA

Query:  GTKGKRYSLPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKANLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKDYGLIDGVIMNPLKAFQPLAAAAST
        GTKGKRYSLPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEML+HKANLNGYLSYHTGQSLEKIN+DTDRDFFMSAKEA++YGLIDGVIMNPLKAFQPLAAAAST
Subjt:  GTKGKRYSLPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKANLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKDYGLIDGVIMNPLKAFQPLAAAAST

Query:  EDRP
        E+ P
Subjt:  EDRP

XP_022998282.1 ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit 5, chloroplastic [Cucurbita maxima]4.9e-15791.12Show/hide
Query:  MAHTFTYTSASSFGLNPIVSVPNSSAFSDPQKLFLPLQNFHSRKLGTLVGGGRNLKNSPVKAIYSSDFSSLDRSSRQGIWSIRDDVQIPSSPFLSTYAQG
        MAHTFTYTSASSF LN +VSVPNSS+ SD QKLFLPL+NFHSRKLG LVGGGRNLKNSPVKAIYS +FSSLD+SSRQG+WSIRDDVQIPSSP+  TYAQG
Subjt:  MAHTFTYTSASSFGLNPIVSVPNSSAFSDPQKLFLPLQNFHSRKLGTLVGGGRNLKNSPVKAIYSSDFSSLDRSSRQGIWSIRDDVQIPSSPFLSTYAQG

Query:  QGPPPMVQERFQSVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAVNPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTIRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSA
        QGPPPMVQERFQSVISQLFQ+RI+RCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAV+PNKDI++YVNSPGGSVTAGMAIFDT+RHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSA
Subjt:  QGPPPMVQERFQSVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAVNPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTIRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSA

Query:  GTKGKRYSLPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKANLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKDYGLIDGVIMNPLKAFQPLAAAAST
        GTKGKRYSLPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEML+HKANLNGYLSYHTGQSLEKIN+DTDRDFFMSAKEA++YGLIDGVIMNPLKAFQPLAAAAST
Subjt:  GTKGKRYSLPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKANLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKDYGLIDGVIMNPLKAFQPLAAAAST

Query:  EDRP
        E++P
Subjt:  EDRP

XP_023525499.1 ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit 5, chloroplastic-like isoform X2 [Cucurbita pepo subsp. pepo]7.8e-15589.8Show/hide
Query:  MAHTFTYTSASSFGLNPIVSVPNSSAFSDPQKLFLPLQNFHSRKLGTLVGGGRNLKNSPVKAIYSSDFSSLDRSSRQGIWSIRDDVQIPSSPFLSTYAQG
        MAHTFTYTSASSF LN +VSVPN S+ S+ QKLFLPL+NFHSRKLG  VGGGRNLKNSPVKAIYS +FSSLD+SSR+G+WSIRDDVQIPSSP+  TYAQG
Subjt:  MAHTFTYTSASSFGLNPIVSVPNSSAFSDPQKLFLPLQNFHSRKLGTLVGGGRNLKNSPVKAIYSSDFSSLDRSSRQGIWSIRDDVQIPSSPFLSTYAQG

Query:  QGPPPMVQERFQSVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAVNPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTIRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSA
        QGPPPMVQERFQSVISQLFQ+RI+RCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAV+PNKDI++YVNSPGGSVTAGMAIFDT+RHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSA
Subjt:  QGPPPMVQERFQSVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAVNPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTIRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSA

Query:  GTKGKRYSLPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKANLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKDYGLIDGVIMNPLKAFQPLAAAAST
        GTKGKRYSLPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEML+HKANLNGYLSYHTGQSLEKIN+DTDRDFFMSAKEA++YGLIDGVIMNPLKAFQPLAAAAST
Subjt:  GTKGKRYSLPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKANLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKDYGLIDGVIMNPLKAFQPLAAAAST

Query:  EDRP
        E+ P
Subjt:  EDRP

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3BY88 ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit2.4e-15791.78Show/hide
Query:  MAHTFTYTSASSFGLNPIVSVPNSSAFSDPQKLFLPLQNFHSRKLGTLVGGGRNLKNSPVKAIYSSDFSSLDRSSRQGIWSIRDDVQIPSSPFLSTYAQG
        MAHTF YTSASSF LN +VSVPNSS+ SD QK FLPL+ FHSRKLG LVGGGRNLKNSPVKA+YS +FSS+DR+SRQGIWSIRDDVQ+PSSP+   YAQG
Subjt:  MAHTFTYTSASSFGLNPIVSVPNSSAFSDPQKLFLPLQNFHSRKLGTLVGGGRNLKNSPVKAIYSSDFSSLDRSSRQGIWSIRDDVQIPSSPFLSTYAQG

Query:  QGPPPMVQERFQSVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAVNPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTIRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSA
        QGPPPMVQERFQSVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAV+PNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDT+RHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSA
Subjt:  QGPPPMVQERFQSVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAVNPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTIRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSA

Query:  GTKGKRYSLPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKANLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKDYGLIDGVIMNPLKAFQPLAAAAST
        GTKGKRYSLPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKANLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKDYGLIDGVIMNPLKA QPLAAAAST
Subjt:  GTKGKRYSLPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKANLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKDYGLIDGVIMNPLKAFQPLAAAAST

Query:  EDRP
        ED+P
Subjt:  EDRP

A0A5A7TNH0 ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit2.4e-15791.78Show/hide
Query:  MAHTFTYTSASSFGLNPIVSVPNSSAFSDPQKLFLPLQNFHSRKLGTLVGGGRNLKNSPVKAIYSSDFSSLDRSSRQGIWSIRDDVQIPSSPFLSTYAQG
        MAHTF YTSASSF LN +VSVPNSS+ SD QK FLPL+ FHSRKLG LVGGGRNLKNSPVKA+YS +FSS+DR+SRQGIWSIRDDVQ+PSSP+   YAQG
Subjt:  MAHTFTYTSASSFGLNPIVSVPNSSAFSDPQKLFLPLQNFHSRKLGTLVGGGRNLKNSPVKAIYSSDFSSLDRSSRQGIWSIRDDVQIPSSPFLSTYAQG

Query:  QGPPPMVQERFQSVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAVNPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTIRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSA
        QGPPPMVQERFQSVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAV+PNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDT+RHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSA
Subjt:  QGPPPMVQERFQSVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAVNPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTIRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSA

Query:  GTKGKRYSLPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKANLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKDYGLIDGVIMNPLKAFQPLAAAAST
        GTKGKRYSLPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKANLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKDYGLIDGVIMNPLKA QPLAAAAST
Subjt:  GTKGKRYSLPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKANLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKDYGLIDGVIMNPLKAFQPLAAAAST

Query:  EDRP
        ED+P
Subjt:  EDRP

A0A6J1DRD0 ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit3.8e-15591.45Show/hide
Query:  MAHTFTYTSASSFGLNPIVSVPNSSAFSDPQKLFLPLQNFHSRKLGTLVGGGRNLKNSPVKAIYSSDFSSLDRSSRQGIWSIRDDVQIPSSPFLSTYAQG
        MAHTF YTSASSF LN +VSVPNSS+ S+ QKLFLPL  F SRKLG LVGGGRNLKN+PVKAIYSS+FSSLDRSSRQG+WSIRDDVQIPSSP+  TYAQG
Subjt:  MAHTFTYTSASSFGLNPIVSVPNSSAFSDPQKLFLPLQNFHSRKLGTLVGGGRNLKNSPVKAIYSSDFSSLDRSSRQGIWSIRDDVQIPSSPFLSTYAQG

Query:  QGPPPMVQERFQSVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAVNPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTIRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSA
        QGPPPMVQERF SVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAV+PNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDT+RHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSA
Subjt:  QGPPPMVQERFQSVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAVNPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTIRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSA

Query:  GTKGKRYSLPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKANLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKDYGLIDGVIMNPLKAFQPLAAAAST
        GTKGKRYSLPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKANLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAK+YGLIDGVIMNPLKA QPLAAAA+T
Subjt:  GTKGKRYSLPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKANLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKDYGLIDGVIMNPLKAFQPLAAAAST

Query:  EDRP
        E  P
Subjt:  EDRP

A0A6J1GAD0 ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit9.9e-15690.13Show/hide
Query:  MAHTFTYTSASSFGLNPIVSVPNSSAFSDPQKLFLPLQNFHSRKLGTLVGGGRNLKNSPVKAIYSSDFSSLDRSSRQGIWSIRDDVQIPSSPFLSTYAQG
        MAHTFTYTSASSF LN +VSVPNSS+ S+ QKLFLPL+NFHSRKLG  VGGGRNLKNSPVKAIYS +FSSLD+SSR+G+WSIRDDVQIPSSP+  TYAQG
Subjt:  MAHTFTYTSASSFGLNPIVSVPNSSAFSDPQKLFLPLQNFHSRKLGTLVGGGRNLKNSPVKAIYSSDFSSLDRSSRQGIWSIRDDVQIPSSPFLSTYAQG

Query:  QGPPPMVQERFQSVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAVNPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTIRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSA
        QGPPPMVQERFQSVISQLFQ+RI+RCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAV+PNKDI++YVNSPGGSVTAGMAIFDT+RHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSA
Subjt:  QGPPPMVQERFQSVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAVNPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTIRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSA

Query:  GTKGKRYSLPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKANLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKDYGLIDGVIMNPLKAFQPLAAAAST
        GTKGKRYSLPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEML+HKANLNGYLSYHTGQSLEKIN+DTDRDFFMSAKEA++YGLIDGVIMNPLKAFQPLAAAAST
Subjt:  GTKGKRYSLPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKANLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKDYGLIDGVIMNPLKAFQPLAAAAST

Query:  EDRP
        E+ P
Subjt:  EDRP

A0A6J1K7I3 ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit2.4e-15791.12Show/hide
Query:  MAHTFTYTSASSFGLNPIVSVPNSSAFSDPQKLFLPLQNFHSRKLGTLVGGGRNLKNSPVKAIYSSDFSSLDRSSRQGIWSIRDDVQIPSSPFLSTYAQG
        MAHTFTYTSASSF LN +VSVPNSS+ SD QKLFLPL+NFHSRKLG LVGGGRNLKNSPVKAIYS +FSSLD+SSRQG+WSIRDDVQIPSSP+  TYAQG
Subjt:  MAHTFTYTSASSFGLNPIVSVPNSSAFSDPQKLFLPLQNFHSRKLGTLVGGGRNLKNSPVKAIYSSDFSSLDRSSRQGIWSIRDDVQIPSSPFLSTYAQG

Query:  QGPPPMVQERFQSVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAVNPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTIRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSA
        QGPPPMVQERFQSVISQLFQ+RI+RCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAV+PNKDI++YVNSPGGSVTAGMAIFDT+RHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSA
Subjt:  QGPPPMVQERFQSVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAVNPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTIRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSA

Query:  GTKGKRYSLPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKANLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKDYGLIDGVIMNPLKAFQPLAAAAST
        GTKGKRYSLPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEML+HKANLNGYLSYHTGQSLEKIN+DTDRDFFMSAKEA++YGLIDGVIMNPLKAFQPLAAAAST
Subjt:  GTKGKRYSLPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKANLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKDYGLIDGVIMNPLKAFQPLAAAAST

Query:  EDRP
        E++P
Subjt:  EDRP

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q2JIP1 ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit 21.2e-6263.87Show/hide
Query:  ERFQSVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAVNPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTIRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSAGTKGKRYS
        ER   + S+L + RII  G  VDDD+AN+IVAQ+LYL++ +P KDI +Y+NSPGGSV AGMAI+DT++HI+PDVST+C+GLAASMGAFLL+ GTKGKR +
Subjt:  ERFQSVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAVNPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTIRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSAGTKGKRYS

Query:  LPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKANLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKDYGLIDGVIMNPLKAFQPLAAAAS
        LP++RIMIHQPLGGAQG  TDI+IQA E+L  K +LN  L+YHTGQ LE+I +DTDRD FM+ ++AK+YGLID VI    K  QP  AA S
Subjt:  LPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKANLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKDYGLIDGVIMNPLKAFQPLAAAAS

Q2JV68 ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit 21.4e-6162.83Show/hide
Query:  ERFQSVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAVNPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTIRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSAGTKGKRYS
        ER   + S+L + RII  G  VDDD+AN+IVAQ+LYL++ +P KDI +Y+NSPGGSV AGMAI+DT++HI+PDVST+C+GLAASMGAFLL+ G KGKR +
Subjt:  ERFQSVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAVNPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTIRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSAGTKGKRYS

Query:  LPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKANLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKDYGLIDGVIMNPLKAFQPLAAAAS
        LP++RIMIHQPLGGAQG  TDI+IQA E+L  K +LN  L+YHTGQ LE+I +DTDRD FM+ ++AK+YGLID VI    +  QP  AA S
Subjt:  LPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKANLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKDYGLIDGVIMNPLKAFQPLAAAAS

Q3MFR5 ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit 15.4e-6666.84Show/hide
Query:  ERFQSVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAVNPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTIRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSAGTKGKRYS
        ER   + S+L + RII  G  VD ++AN+IVAQLL+LDA +P KDI +Y+NSPGGSVTAGM IFDT++HIRPDV T+C GLAASMGAFLLSAGTKGKR S
Subjt:  ERFQSVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAVNPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTIRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSAGTKGKRYS

Query:  LPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKANLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKDYGLIDGVIMNPLKAFQPLA
        LP+SRIMIHQPLGGAQG  TDI+IQA E+L+HK  LN YL+ HTGQ +E+I +DT+RDFFMS  EA+DYGLID VI       +P+A
Subjt:  LPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKANLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKDYGLIDGVIMNPLKAFQPLA

Q8YXH5 ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit 11.2e-6566.31Show/hide
Query:  ERFQSVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAVNPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTIRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSAGTKGKRYS
        ER   + S+L + RI+  G  VD ++AN+IVAQLL+LDA +P KDI +Y+NSPGGSVTAGM IFDT++HIRPDV T+C GLAASMGAFLLSAG KGKR S
Subjt:  ERFQSVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAVNPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTIRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSAGTKGKRYS

Query:  LPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKANLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKDYGLIDGVIMNPLKAFQPLA
        LP+SRIMIHQPLGGAQG  TDI+IQA E+L+HK  LN YL+ HTGQ +E+I +DT+RDFFMS  EAKDYGLID VI       +P+A
Subjt:  LPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKANLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKDYGLIDGVIMNPLKAFQPLA

Q9S834 ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit 5, chloroplastic4.8e-13179.93Show/hide
Query:  MAHTFTYTSASS--FGLNPIVSVPNSSAFSDPQKLFLPLQNFHSRKLGTLVGGGRNLKNSPVKAIYSSDFSSLDRSSRQGIWSIRDDVQIPSSPFLSTYA
        MAH    TSASS  F    + + PN S+F  P KL LP +   SRK   LV   +N KNS  KA+YS +  + +  S QG+WSIRDD+Q+PSSP+   YA
Subjt:  MAHTFTYTSASS--FGLNPIVSVPNSSAFSDPQKLFLPLQNFHSRKLGTLVGGGRNLKNSPVKAIYSSDFSSLDRSSRQGIWSIRDDVQIPSSPFLSTYA

Query:  QGQGPPPMVQERFQSVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAVNPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTIRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLL
        QGQGPPPMVQERFQS+ISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAV+P KDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDT+RHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLL
Subjt:  QGQGPPPMVQERFQSVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAVNPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTIRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLL

Query:  SAGTKGKRYSLPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKANLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKDYGLIDGVIMNPLKAFQPLAAA
        SAGTKGKRYSLPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKANLNGYL+YHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAK+YGLIDGVIMNPLKA QPLAAA
Subjt:  SAGTKGKRYSLPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKANLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKDYGLIDGVIMNPLKAFQPLAAA

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G02560.1 nuclear encoded CLP protease 53.4e-13279.93Show/hide
Query:  MAHTFTYTSASS--FGLNPIVSVPNSSAFSDPQKLFLPLQNFHSRKLGTLVGGGRNLKNSPVKAIYSSDFSSLDRSSRQGIWSIRDDVQIPSSPFLSTYA
        MAH    TSASS  F    + + PN S+F  P KL LP +   SRK   LV   +N KNS  KA+YS +  + +  S QG+WSIRDD+Q+PSSP+   YA
Subjt:  MAHTFTYTSASS--FGLNPIVSVPNSSAFSDPQKLFLPLQNFHSRKLGTLVGGGRNLKNSPVKAIYSSDFSSLDRSSRQGIWSIRDDVQIPSSPFLSTYA

Query:  QGQGPPPMVQERFQSVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAVNPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTIRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLL
        QGQGPPPMVQERFQS+ISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAV+P KDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDT+RHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLL
Subjt:  QGQGPPPMVQERFQSVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAVNPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTIRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLL

Query:  SAGTKGKRYSLPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKANLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKDYGLIDGVIMNPLKAFQPLAAA
        SAGTKGKRYSLPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKANLNGYL+YHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAK+YGLIDGVIMNPLKA QPLAAA
Subjt:  SAGTKGKRYSLPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKANLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKDYGLIDGVIMNPLKAFQPLAAA

AT1G11750.1 CLP protease proteolytic subunit 63.2e-3736.71Show/hide
Query:  KNSPVKAIYSSDFSSLDRSSRQGIWSIRDDVQIP---SSPFLSTYAQGQGPPPMVQERFQ-----SVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDA
        + +P++ I S+  S    S + G+ S      I     +P        +G PP++           + S LF+ RII  G  ++  +A  +++QL+ L +
Subjt:  KNSPVKAIYSSDFSSLDRSSRQGIWSIRDDVQIP---SSPFLSTYAQGQGPPPMVQERFQ-----SVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDA

Query:  VNPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTIRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSAGTKGKRYSLPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKANLNGY
        ++   DI+MY+N PGGS  + +AI+D +  I+P V TV  G+AAS GA LL+ G KG RY++PN+R+MIHQP  G  G   D+  Q NE +  +  ++  
Subjt:  VNPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTIRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSAGTKGKRYSLPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKANLNGY

Query:  LSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKDYGLIDGVI
         +  TGQ LEK+ Q T+RD F+SA EA ++GLIDG++
Subjt:  LSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKDYGLIDGVI

AT1G66670.1 CLP protease proteolytic subunit 35.6e-5044.44Show/hide
Query:  SSAFSDPQKLFLPLQNFHSRKLGTLVGGGRNLKNSPVKAIYSSDFSSLDRSSRQGIWSIRDDVQIPSSPFLSTYAQGQGPPPMVQERFQSVISQLFQYRI
        SS+ S+P  L  P +N     L   +   R  K S    + SS   SL +  RQ + S  D     SS  + + AQ     P  +E      + L + RI
Subjt:  SSAFSDPQKLFLPLQNFHSRKLGTLVGGGRNLKNSPVKAIYSSDFSSLDRSSRQGIWSIRDDVQIPSSPFLSTYAQGQGPPPMVQERFQSVISQLFQYRI

Query:  IRCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAVNPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTIRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSAGTKGKRYSLPNSRIMIHQPLGGA
        +  G  VDD  A+++++QLL LDA +  +DI +++NSPGGS+TAGM I+D ++  + DVSTVC+GLAASMGAFLL++G+KGKRY +PNS++MIHQPLG A
Subjt:  IRCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAVNPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTIRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSAGTKGKRYSLPNSRIMIHQPLGGA

Query:  QGGQTDIDIQANEMLHHKANLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKDYGLIDGVI
         G  T++ I+  EM++HK  LN   S  TG+   +I  DTDRD F++  EAK+YGLID VI
Subjt:  QGGQTDIDIQANEMLHHKANLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKDYGLIDGVI

AT5G23140.1 nuclear-encoded CLP protease P74.1e-4550Show/hide
Query:  ERFQSVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAVNPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTIRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSAGTKGKRYS
        ER   + S+L + RII   G ++DD ++++VAQLLYL++ NP+K I MY+NSPGG VTAG+AI+DT+++IR  +ST+C+G AASM + LL+AG KG+R S
Subjt:  ERFQSVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAVNPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTIRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSAGTKGKRYS

Query:  LPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKANLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKDYGLIDGVI
        LPN+ +MIHQP GG  G   DI I   +++     LN     HTGQ L+ +  + DRD FM+ +EAK +G+ID VI
Subjt:  LPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKANLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKDYGLIDGVI

AT5G45390.1 CLP protease P42.0e-4751.46Show/hide
Query:  VISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAVNPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTIRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSAGTKGKRYSLPNSR
        V+  L + RI+  G ++DD +A+ I++QLL LDA +P KDI +++NSPGGS++A MAI+D ++ +R DVST+ +G+AAS  + +L AGTKGKR+++PN+R
Subjt:  VISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAVNPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTIRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSAGTKGKRYSLPNSR

Query:  IMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKANLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKDYGLIDGVI
        IMIHQPLGGA G   D++IQA E++H+K N+   ++  T +S E++ +D DRD +MS  EA +YGLIDGVI
Subjt:  IMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKANLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKDYGLIDGVI


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCTCATACTTTCACCTACACTTCTGCCTCGTCTTTCGGATTAAACCCCATCGTTTCTGTTCCGAATTCGAGCGCTTTTTCCGACCCCCAGAAGCTCTTTCTACCGCT
GCAGAATTTTCATTCGAGGAAACTAGGAACATTAGTTGGAGGTGGAAGAAACCTCAAGAATTCTCCGGTCAAAGCCATCTACTCAAGCGATTTTTCATCGTTGGATCGGA
GTTCTCGCCAAGGAATTTGGTCTATAAGGGATGATGTGCAAATTCCATCTTCGCCGTTTTTATCAACTTACGCACAAGGGCAAGGTCCTCCTCCAATGGTGCAGGAACGC
TTCCAAAGTGTTATAAGCCAGCTTTTTCAATATAGAATTATTCGCTGTGGTGGAGCGGTCGATGATGATATGGCTAATATCATTGTTGCTCAACTTCTATACCTTGATGC
TGTTAATCCCAATAAGGATATTGTCATGTATGTAAATTCCCCTGGTGGATCAGTTACAGCTGGTATGGCCATTTTTGACACAATTAGGCATATACGACCGGATGTCTCTA
CTGTTTGCGTAGGACTAGCAGCCAGTATGGGAGCTTTCCTGCTTAGTGCTGGAACTAAAGGAAAAAGATACAGCTTGCCGAATTCAAGGATAATGATCCATCAGCCTCTT
GGTGGTGCTCAGGGTGGGCAGACTGACATTGATATTCAGGCAAATGAAATGTTGCATCATAAGGCCAATCTTAACGGGTATCTTTCCTACCACACTGGCCAAAGTCTCGA
GAAGATTAACCAGGACACGGATCGTGATTTCTTCATGAGCGCTAAAGAAGCCAAAGATTATGGACTCATAGATGGAGTCATCATGAATCCTCTCAAAGCTTTCCAACCTT
TAGCAGCTGCAGCTTCCACCGAAGACAGGCCGTGCGTCTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
TTTCTCTCTTCGCCGTTGTTCTTTTCGATCAAATTTTGCTCCCAACTCCCACCGGCTGCCAATTCTCGGCAGTTTCTTCCTTAATCTACTGCTTGAGCTTCGAAAATGGC
TCATACTTTCACCTACACTTCTGCCTCGTCTTTCGGATTAAACCCCATCGTTTCTGTTCCGAATTCGAGCGCTTTTTCCGACCCCCAGAAGCTCTTTCTACCGCTGCAGA
ATTTTCATTCGAGGAAACTAGGAACATTAGTTGGAGGTGGAAGAAACCTCAAGAATTCTCCGGTCAAAGCCATCTACTCAAGCGATTTTTCATCGTTGGATCGGAGTTCT
CGCCAAGGAATTTGGTCTATAAGGGATGATGTGCAAATTCCATCTTCGCCGTTTTTATCAACTTACGCACAAGGGCAAGGTCCTCCTCCAATGGTGCAGGAACGCTTCCA
AAGTGTTATAAGCCAGCTTTTTCAATATAGAATTATTCGCTGTGGTGGAGCGGTCGATGATGATATGGCTAATATCATTGTTGCTCAACTTCTATACCTTGATGCTGTTA
ATCCCAATAAGGATATTGTCATGTATGTAAATTCCCCTGGTGGATCAGTTACAGCTGGTATGGCCATTTTTGACACAATTAGGCATATACGACCGGATGTCTCTACTGTT
TGCGTAGGACTAGCAGCCAGTATGGGAGCTTTCCTGCTTAGTGCTGGAACTAAAGGAAAAAGATACAGCTTGCCGAATTCAAGGATAATGATCCATCAGCCTCTTGGTGG
TGCTCAGGGTGGGCAGACTGACATTGATATTCAGGCAAATGAAATGTTGCATCATAAGGCCAATCTTAACGGGTATCTTTCCTACCACACTGGCCAAAGTCTCGAGAAGA
TTAACCAGGACACGGATCGTGATTTCTTCATGAGCGCTAAAGAAGCCAAAGATTATGGACTCATAGATGGAGTCATCATGAATCCTCTCAAAGCTTTCCAACCTTTAGCA
GCTGCAGCTTCCACCGAAGACAGGCCGTGCGTCTAAATTCCATCCTGCTCTGTAACAACCAGTTGGATATAATTCTTGTAGACTTCAAAGAAAAAAAAAACCAACTTGTG
TAAGCAGATTTTGACTATTAACAACATGGCTTCCATGCTTTCATCTTAGCTTAAGCTTGATAAAATCCTGAAATGTTCATTGAATGACTGTTGTTTCCTTTTAGATGTTT
TATTCAAATGTCCATTGAAGTTAGTGTCCTAATAAAAAGAAATCTCCTCTCTGGTTGGTTGGGATTGGGATGGTGTGAGTGATGTTAGCCTAACACTTGGC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAHTFTYTSASSFGLNPIVSVPNSSAFSDPQKLFLPLQNFHSRKLGTLVGGGRNLKNSPVKAIYSSDFSSLDRSSRQGIWSIRDDVQIPSSPFLSTYAQGQGPPPMVQER
FQSVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAVNPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTIRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSAGTKGKRYSLPNSRIMIHQPL
GGAQGGQTDIDIQANEMLHHKANLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKDYGLIDGVIMNPLKAFQPLAAAASTEDRPCV