; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Sed0020459 (gene) of Chayote v1 genome

Gene IDSed0020459
OrganismSechium edule (Chayote v1)
DescriptionU-box domain-containing protein 1-like
Genome locationLG13:25226914..25227867
RNA-Seq ExpressionSed0020459
SyntenySed0020459
Gene Ontology termsGO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0005737 - cytoplasm (cellular component)
InterPro domainsIPR011989 - Armadillo-like helical
IPR016024 - Armadillo-type fold


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6608146.1 U-box domain-containing protein 13, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.4e-15493.12Show/hide
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KAG7031783.1 U-box domain-containing protein 13, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]4.0e-15492.81Show/hide
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XP_022940416.1 U-box domain-containing protein 1-like [Cucurbita moschata]2.0e-15392.5Show/hide
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XP_022982428.1 U-box domain-containing protein 1-like [Cucurbita maxima]1.2e-15392.5Show/hide
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XP_023524300.1 U-box domain-containing protein 1-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.3e-15292.19Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LGP7 Uncharacterized protein2.2e-14287.34Show/hide
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        IMNSD D+YSN+DSV+
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A0A1S3CR56 U-box domain-containing protein 8-like2.2e-13787.21Show/hide
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        MRSMSV TAHK IT+CI+ ARSDAHEVQEKALQNLV +TQVSPL+RNLL QVDGSI ILI LSKSS ST+QSLSLSILFNLSLN+DMKKLLASME IYHL
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        NTL+S GSPETVKLS+SLICSLAMLDKNKAKFGVAGTIQLL+RAL VP++PAAHHLLCSLAELGQFHGNCTVAVRSGAI VLI VVES SGEDLAGTAL+
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        VLGLLARFEEGLRAL+K DRIV SMVNVLKGRCMLSKEGATEILLRLFDES+ CL DAL+ PEF GVVADLSVRGS KARERA+LLMNKIMNSD DTYSN
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        ADSV+
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A0A6J1CG09 U-box domain-containing protein 1-like2.7e-14087.19Show/hide
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        MSVASFHSSSSMRSM+V TAHK IT+C++DARSD  EVQEKALQNLV ITQVSPLYRNLLAQVDG+IPILIALSKSSSS+IQSLSLSILFNLSLN+DMK+
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        LLASMETIYHLN L+S GSPETVKLSSSLICSLAMLDKNKAKFGVAGTI+LL+RAL+VPSV  AHH+LCSLAELGQFHGNCTVAVRSGAI VLI VVEST
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          EDLAGTAL VLGLLARFEEGLRALMK D IV SMVNVLKGRCMLSKEGATEILLRLFDESD CLRDAL  PEFLGVVADLSVRGS KARERAALLMNK
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        +MNSD+D YSNA SV   WY
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A0A6J1FIE4 U-box domain-containing protein 1-like9.6e-15492.5Show/hide
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A0A6J1J4T3 U-box domain-containing protein 1-like5.7e-15492.5Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O22193 U-box domain-containing protein 47.2e-1326.91Show/hide
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        + S  S+ + R +S       + + + + +S + + Q +A   L ++ + +   R ++    G+I +L+ L  S+ S  Q  +++ L NLS+N++ KK +
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        A    I  L  ++ +GS E  + S++ + SL+++++NK K G +G I  L+  L   +         +L  L     N  + V+SGA+  LID+++  +G
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          +   A+ VL  LA   EG  A+ +   I   +V V++      KE A   LL+L   S       L+      +VA LS  G+ +ARE+A  L++   
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Query:  N
        N
Subjt:  N

Q5XEZ8 U-box domain-containing protein 21.4e-1326.76Show/hide
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        S ++    + + I D +S + + Q +A   + ++ + S   R ++A+ + +IP L++L  S+   IQ+ +++ L NLS+N++ K L+A    I  L  ++
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Query:  SSGSPETVKL-SSSLICSLAMLDKNKAKFGVAGTIQLLIRALTVPSVPAAHHLLCSLAELGQFHGNCTVAVRSGAISVLIDVVESTSGEDLAGTALIVLG
         +G  E  K  S++ + SL+++++ K + G AG I+ L+  L   S+        +L  L   H N T  + +GA+  L+++++   G  +   A++VL 
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Query:  LLARFEEGLRALMKIDRIVYSMVNVLKGRCMLSKEGATEILLRLFDESDGCLRDALRFPEFLGVVADLSVRGSTKARERAALLM
         LA   EG  A+ +   I   +V V++      KE AT  LL+L   S     + +R      +VA L+  G+ + +E+A  L+
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Q681N2 U-box domain-containing protein 152.2e-1426.02Show/hide
Query:  EVQEKALQNLVVITQVSPLYRNLLAQVDGSIPILIALSKSSSSTIQSLSLSILFNLSLNNDMKKLLASMETIYHLNTLVSSGSPETVKLSSSLICSLAML
        E Q ++++ + ++ + +P  R L+A   G+IP+L+ L     S IQ  +++ L NLS++   KKL+++   I ++  ++ +G+ E  + S++ + SL+ML
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Query:  DKNKAKFGVAGTIQLLIRALTVPSVPAAHHLLCSLAELGQFHGNCTVAVRSGAISVLIDVVESTSGEDLAGTALIVLGLLARFEEGLRALMKIDRIVYSM
        D+NK   G++  I  L+  L   ++      L +L  L     N   A+ +G +  L+++++      +   AL +L LLA   EG +A+ ++   + ++
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Query:  VNVLKGRCMLSKEGATEILLRLFDESDGCLRDALRFPEFLGVVADLSVRGSTKARERAALLMNKIMNSD
        V  ++     +KE AT +LL L   +   +  AL+F  +  +V +++  G+ +A+ +A  L+  I  S+
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Q8VZ40 U-box domain-containing protein 147.9e-1226.02Show/hide
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        G+IP+L+ L  S     Q  S++ L NLS+N   K  +     I  +  ++ +GS E  + +++ + SL+++D+NK   G AG IQ LI  L   +    
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Query:  HHLLCSLAELGQFHGNCTVAVRSGAISVLIDVVESTSGEDLAGTALIVLGLLARFEEGLRALMKIDRIVYSMVNVLKGRCMLSKEGATEILLRLFDESDG
             ++  L  + GN + AV+ G +  L  +++   G  +   AL +L +L+  +EG  A+ + + I   +V +++     ++E A  IL  L      
Subjt:  HHLLCSLAELGQFHGNCTVAVRSGAISVLIDVVESTSGEDLAGTALIVLGLLARFEEGLRALMKIDRIVYSMVNVLKGRCMLSKEGATEILLRLFDESDG

Query:  CLRDALRFPEFLGVVADLSVR-----GSTKARERAALLMNKIMNSD
        C+ +  R      V AD++++     G+ +A+ +AA L+  I  ++
Subjt:  CLRDALRFPEFLGVVADLSVR-----GSTKARERAALLMNKIMNSD

Q9SNC6 U-box domain-containing protein 131.6e-1226.58Show/hide
Query:  GSIPILIALSKSSSSTIQSLSLSILFNLSLNNDMKKLLASMETIYHLNTLVSSGSPETVKLSSSLICSLAMLDKNKAKFGVAGTIQLLIRALTVPSVPAA
        G+IP+L+ L  +  S IQ  S++ L NLS+  + K  + S   I  +  ++  GS E  + +++ + SL+++D+NK   G  G I  L+  L   +    
Subjt:  GSIPILIALSKSSSSTIQSLSLSILFNLSLNNDMKKLLASMETIYHLNTLVSSGSPETVKLSSSLICSLAMLDKNKAKFGVAGTIQLLIRALTVPSVPAA

Query:  HHLLCSLAELGQFHGNCTVAVRSGAISVLIDVVESTSGEDLAGTALIVLGLLARFEEGLRALMKIDRIVYSMVNVLKGRCMLSKEGATEILLRLFDESDG
             +L  L  + GN   A+R+G I  L  ++ +  G  +   AL +L +L+   EG +A++     V S+V  ++     ++E A  +L+ L      
Subjt:  HHLLCSLAELGQFHGNCTVAVRSGAISVLIDVVESTSGEDLAGTALIVLGLLARFEEGLRALMKIDRIVYSMVNVLKGRCMLSKEGATEILLRLFDESDG

Query:  CLRDALRFPEFLGVVADLSVRGSTKARERAALLMNKI
         L +A +    +G + DL+  G+ + + +AA L+ +I
Subjt:  CLRDALRFPEFLGVVADLSVRGSTKARERAALLMNKI

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G23140.1 RING/U-box superfamily protein with ARM repeat domain5.1e-1426.91Show/hide
Query:  VASFHSSSSMRSMSVTTAHKNITQCISDARSDAHEVQEKALQNLVVITQVSPLYRNLLAQVDGSIPILIALSKSSSSTIQSLSLSILFNLSLNNDMKKLL
        + S  S+ + R +S       + + + + +S + + Q +A   L ++ + +   R ++    G+I +L+ L  S+ S  Q  +++ L NLS+N++ KK +
Subjt:  VASFHSSSSMRSMSVTTAHKNITQCISDARSDAHEVQEKALQNLVVITQVSPLYRNLLAQVDGSIPILIALSKSSSSTIQSLSLSILFNLSLNNDMKKLL

Query:  ASMETIYHLNTLVSSGSPETVKLSSSLICSLAMLDKNKAKFGVAGTIQLLIRALTVPSVPAAHHLLCSLAELGQFHGNCTVAVRSGAISVLIDVVESTSG
        A    I  L  ++ +GS E  + S++ + SL+++++NK K G +G I  L+  L   +         +L  L     N  + V+SGA+  LID+++  +G
Subjt:  ASMETIYHLNTLVSSGSPETVKLSSSLICSLAMLDKNKAKFGVAGTIQLLIRALTVPSVPAAHHLLCSLAELGQFHGNCTVAVRSGAISVLIDVVESTSG

Query:  EDLAGTALIVLGLLARFEEGLRALMKIDRIVYSMVNVLKGRCMLSKEGATEILLRLFDESDGCLRDALRFPEFLGVVADLSVRGSTKARERAALLMNKIM
          +   A+ VL  LA   EG  A+ +   I   +V V++      KE A   LL+L   S       L+      +VA LS  G+ +ARE+A  L++   
Subjt:  EDLAGTALIVLGLLARFEEGLRALMKIDRIVYSMVNVLKGRCMLSKEGATEILLRLFDESDGCLRDALRFPEFLGVVADLSVRGSTKARERAALLMNKIM

Query:  N
        N
Subjt:  N

AT2G23140.2 RING/U-box superfamily protein with ARM repeat domain5.1e-1426.91Show/hide
Query:  VASFHSSSSMRSMSVTTAHKNITQCISDARSDAHEVQEKALQNLVVITQVSPLYRNLLAQVDGSIPILIALSKSSSSTIQSLSLSILFNLSLNNDMKKLL
        + S  S+ + R +S       + + + + +S + + Q +A   L ++ + +   R ++    G+I +L+ L  S+ S  Q  +++ L NLS+N++ KK +
Subjt:  VASFHSSSSMRSMSVTTAHKNITQCISDARSDAHEVQEKALQNLVVITQVSPLYRNLLAQVDGSIPILIALSKSSSSTIQSLSLSILFNLSLNNDMKKLL

Query:  ASMETIYHLNTLVSSGSPETVKLSSSLICSLAMLDKNKAKFGVAGTIQLLIRALTVPSVPAAHHLLCSLAELGQFHGNCTVAVRSGAISVLIDVVESTSG
        A    I  L  ++ +GS E  + S++ + SL+++++NK K G +G I  L+  L   +         +L  L     N  + V+SGA+  LID+++  +G
Subjt:  ASMETIYHLNTLVSSGSPETVKLSSSLICSLAMLDKNKAKFGVAGTIQLLIRALTVPSVPAAHHLLCSLAELGQFHGNCTVAVRSGAISVLIDVVESTSG

Query:  EDLAGTALIVLGLLARFEEGLRALMKIDRIVYSMVNVLKGRCMLSKEGATEILLRLFDESDGCLRDALRFPEFLGVVADLSVRGSTKARERAALLMNKIM
          +   A+ VL  LA   EG  A+ +   I   +V V++      KE A   LL+L   S       L+      +VA LS  G+ +ARE+A  L++   
Subjt:  EDLAGTALIVLGLLARFEEGLRALMKIDRIVYSMVNVLKGRCMLSKEGATEILLRLFDESDGCLRDALRFPEFLGVVADLSVRGSTKARERAALLMNKIM

Query:  N
        N
Subjt:  N

AT3G46510.1 plant U-box 131.1e-1326.58Show/hide
Query:  GSIPILIALSKSSSSTIQSLSLSILFNLSLNNDMKKLLASMETIYHLNTLVSSGSPETVKLSSSLICSLAMLDKNKAKFGVAGTIQLLIRALTVPSVPAA
        G+IP+L+ L  +  S IQ  S++ L NLS+  + K  + S   I  +  ++  GS E  + +++ + SL+++D+NK   G  G I  L+  L   +    
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Query:  HHLLCSLAELGQFHGNCTVAVRSGAISVLIDVVESTSGEDLAGTALIVLGLLARFEEGLRALMKIDRIVYSMVNVLKGRCMLSKEGATEILLRLFDESDG
             +L  L  + GN   A+R+G I  L  ++ +  G  +   AL +L +L+   EG +A++     V S+V  ++     ++E A  +L+ L      
Subjt:  HHLLCSLAELGQFHGNCTVAVRSGAISVLIDVVESTSGEDLAGTALIVLGLLARFEEGLRALMKIDRIVYSMVNVLKGRCMLSKEGATEILLRLFDESDG

Query:  CLRDALRFPEFLGVVADLSVRGSTKARERAALLMNKI
         L +A +    +G + DL+  G+ + + +AA L+ +I
Subjt:  CLRDALRFPEFLGVVADLSVRGSTKARERAALLMNKI

AT3G54850.1 plant U-box 145.6e-1326.02Show/hide
Query:  GSIPILIALSKSSSSTIQSLSLSILFNLSLNNDMKKLLASMETIYHLNTLVSSGSPETVKLSSSLICSLAMLDKNKAKFGVAGTIQLLIRALTVPSVPAA
        G+IP+L+ L  S     Q  S++ L NLS+N   K  +     I  +  ++ +GS E  + +++ + SL+++D+NK   G AG IQ LI  L   +    
Subjt:  GSIPILIALSKSSSSTIQSLSLSILFNLSLNNDMKKLLASMETIYHLNTLVSSGSPETVKLSSSLICSLAMLDKNKAKFGVAGTIQLLIRALTVPSVPAA

Query:  HHLLCSLAELGQFHGNCTVAVRSGAISVLIDVVESTSGEDLAGTALIVLGLLARFEEGLRALMKIDRIVYSMVNVLKGRCMLSKEGATEILLRLFDESDG
             ++  L  + GN + AV+ G +  L  +++   G  +   AL +L +L+  +EG  A+ + + I   +V +++     ++E A  IL  L      
Subjt:  HHLLCSLAELGQFHGNCTVAVRSGAISVLIDVVESTSGEDLAGTALIVLGLLARFEEGLRALMKIDRIVYSMVNVLKGRCMLSKEGATEILLRLFDESDG

Query:  CLRDALRFPEFLGVVADLSVR-----GSTKARERAALLMNKIMNSD
        C+ +  R      V AD++++     G+ +A+ +AA L+  I  ++
Subjt:  CLRDALRFPEFLGVVADLSVR-----GSTKARERAALLMNKIMNSD

AT5G42340.1 Plant U-Box 151.6e-1526.02Show/hide
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        E Q ++++ + ++ + +P  R L+A   G+IP+L+ L     S IQ  +++ L NLS++   KKL+++   I ++  ++ +G+ E  + S++ + SL+ML
Subjt:  EVQEKALQNLVVITQVSPLYRNLLAQVDGSIPILIALSKSSSSTIQSLSLSILFNLSLNNDMKKLLASMETIYHLNTLVSSGSPETVKLSSSLICSLAML

Query:  DKNKAKFGVAGTIQLLIRALTVPSVPAAHHLLCSLAELGQFHGNCTVAVRSGAISVLIDVVESTSGEDLAGTALIVLGLLARFEEGLRALMKIDRIVYSM
        D+NK   G++  I  L+  L   ++      L +L  L     N   A+ +G +  L+++++      +   AL +L LLA   EG +A+ ++   + ++
Subjt:  DKNKAKFGVAGTIQLLIRALTVPSVPAAHHLLCSLAELGQFHGNCTVAVRSGAISVLIDVVESTSGEDLAGTALIVLGLLARFEEGLRALMKIDRIVYSM

Query:  VNVLKGRCMLSKEGATEILLRLFDESDGCLRDALRFPEFLGVVADLSVRGSTKARERAALLMNKIMNSD
        V  ++     +KE AT +LL L   +   +  AL+F  +  +V +++  G+ +A+ +A  L+  I  S+
Subjt:  VNVLKGRCMLSKEGATEILLRLFDESDGCLRDALRFPEFLGVVADLSVRGSTKARERAALLMNKIMNSD


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTCTGTTGCATCTTTCCATTCATCCTCATCCATGAGGTCCATGAGTGTTACGACTGCACATAAGAACATAACACAGTGTATATCCGATGCTCGGTCAGACGCTCACGA
AGTTCAGGAAAAGGCTCTTCAAAACTTGGTTGTCATTACCCAGGTTAGCCCCTTATACAGGAACTTGCTTGCTCAAGTAGATGGATCAATTCCAATTCTTATTGCTCTCT
CCAAATCTTCCTCCTCTACCATCCAATCTCTCTCATTGTCTATTCTCTTCAATCTGTCTCTGAACAATGACATGAAAAAGCTTCTTGCGTCGATGGAAACCATCTACCAT
CTCAATACGCTCGTATCCTCGGGCTCTCCCGAAACCGTAAAGTTGTCTTCCTCGTTGATTTGCAGCCTTGCAATGCTGGATAAGAACAAGGCTAAGTTTGGGGTAGCAGG
GACCATTCAGCTGTTGATTAGAGCACTTACAGTCCCTAGTGTACCTGCTGCTCATCACCTTCTATGCTCTTTAGCTGAGCTAGGCCAGTTTCATGGGAACTGCACTGTGG
CTGTTCGATCGGGAGCCATCTCGGTTCTTATCGATGTAGTGGAGAGTACTAGCGGAGAGGATCTTGCTGGTACCGCTCTCATTGTTCTTGGTCTCTTGGCTAGATTTGAG
GAGGGGTTGAGAGCTTTGATGAAAATTGATCGGATCGTTTATTCGATGGTTAATGTGTTGAAAGGTAGGTGTATGTTGAGTAAAGAAGGTGCAACCGAGATTCTTTTGCG
ATTGTTCGACGAAAGTGATGGTTGTTTGAGAGATGCGTTGAGGTTCCCAGAGTTTTTGGGCGTCGTTGCTGATTTGTCAGTGAGAGGATCTACAAAAGCCAGAGAAAGAG
CTGCCCTACTTATGAACAAGATCATGAATAGTGATTTGGATACATATTCAAATGCTGATTCAGTGTGGTATTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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LNTLVSSGSPETVKLSSSLICSLAMLDKNKAKFGVAGTIQLLIRALTVPSVPAAHHLLCSLAELGQFHGNCTVAVRSGAISVLIDVVESTSGEDLAGTALIVLGLLARFE
EGLRALMKIDRIVYSMVNVLKGRCMLSKEGATEILLRLFDESDGCLRDALRFPEFLGVVADLSVRGSTKARERAALLMNKIMNSDLDTYSNADSVWY