; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Sed0020473 (gene) of Chayote v1 genome

Gene IDSed0020473
OrganismSechium edule (Chayote v1)
Descriptionprotein RALF-like 33
Genome locationLG04:32800343..32801083
RNA-Seq ExpressionSed0020473
SyntenySed0020473
Gene Ontology termsGO:0019722 - calcium-mediated signaling (biological process)
GO:0005576 - extracellular region (cellular component)
InterPro domainsIPR008801 - Rapid ALkalinization Factor


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6593968.1 Protein RALF-like 33, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.7e-4275.78Show/hide
Query:  MEIARVSSLFAAIAILAAHFLLSSATAVDFSGDHNLLSVPAKSKRRGSIAEYLLAGDDGGGSAFGSEFEMDSEINRRILAATRHISYDALEKNTVPCSRR
        MEI+RV S  AA AI+AAHFLLSSA AVDFSG   LL VPA+SK RGSIAE  LAGDD   SAFG EFEMDSEINRRILAA+R++SY AL++N+VPCSRR
Subjt:  MEIARVSSLFAAIAILAAHFLLSSATAVDFSGDHNLLSVPAKSKRRGSIAEYLLAGDDGGGSAFGSEFEMDSEINRRILAATRHISYDALEKNTVPCSRR

Query:  GASYYNCRPGAEANPYRRSCSAIDRCRS
        GASYYNC+PGA+ANPYRR C+AI RCRS
Subjt:  GASYYNCRPGAEANPYRRSCSAIDRCRS

XP_022138421.1 protein RALF-like 33 [Momordica charantia]8.0e-4578.12Show/hide
Query:  MEIARVSSLFAAIAILAAHFLLSSATAVDFSGDHNLLSVPAKSKRRGSIAEYLLAGDDGGGSAFGSEFEMDSEINRRILAATRHISYDALEKNTVPCSRR
        MEI+RVSSL AA AI AAH LLSSATA DFSGDH LL VPAKS+ RGSIAE LLAGDD G   FG+EFEMDSEINRRILA  R+ISY AL++N+VPCSRR
Subjt:  MEIARVSSLFAAIAILAAHFLLSSATAVDFSGDHNLLSVPAKSKRRGSIAEYLLAGDDGGGSAFGSEFEMDSEINRRILAATRHISYDALEKNTVPCSRR

Query:  GASYYNCRPGAEANPYRRSCSAIDRCRS
        GASYYNC+PGA+ANPY R CSAI RCRS
Subjt:  GASYYNCRPGAEANPYRRSCSAIDRCRS

XP_022930438.1 protein RALF-like 33 [Cucurbita moschata]3.7e-4275Show/hide
Query:  MEIARVSSLFAAIAILAAHFLLSSATAVDFSGDHNLLSVPAKSKRRGSIAEYLLAGDDGGGSAFGSEFEMDSEINRRILAATRHISYDALEKNTVPCSRR
        MEI+RV S  AA AI+AAHFLLSSA AVDFSG   LL VPA+SK RGSIAE  LAGDD   SAFG EFEMDSEINRRILA++R++SY AL++N+VPCSRR
Subjt:  MEIARVSSLFAAIAILAAHFLLSSATAVDFSGDHNLLSVPAKSKRRGSIAEYLLAGDDGGGSAFGSEFEMDSEINRRILAATRHISYDALEKNTVPCSRR

Query:  GASYYNCRPGAEANPYRRSCSAIDRCRS
        GASYYNC+PGA+ANPYRR C+AI RCRS
Subjt:  GASYYNCRPGAEANPYRRSCSAIDRCRS

XP_023000591.1 protein RALF-like 33 [Cucurbita maxima]7.5e-4375.78Show/hide
Query:  MEIARVSSLFAAIAILAAHFLLSSATAVDFSGDHNLLSVPAKSKRRGSIAEYLLAGDDGGGSAFGSEFEMDSEINRRILAATRHISYDALEKNTVPCSRR
        MEI+RV S  AA AI+AAHFLLSSA  VDFSGD  LL VPA+SK RGSIAE  LAGDD   SAFG EFEMDSEINRRILAA+R++SY AL++N+VPCSRR
Subjt:  MEIARVSSLFAAIAILAAHFLLSSATAVDFSGDHNLLSVPAKSKRRGSIAEYLLAGDDGGGSAFGSEFEMDSEINRRILAATRHISYDALEKNTVPCSRR

Query:  GASYYNCRPGAEANPYRRSCSAIDRCRS
        GASYYNC+PGA+ANPYRR C+AI RCRS
Subjt:  GASYYNCRPGAEANPYRRSCSAIDRCRS

XP_038875155.1 protein RALF-like 33 [Benincasa hispida]8.9e-4477.34Show/hide
Query:  MEIARVSSLFAAIAILAAHFLLSSATAVDFSGDHNLLSVPAKSKRRGSIAEYLLAGDDGGGSAFGSEFEMDSEINRRILAATRHISYDALEKNTVPCSRR
        M I+RVSSL AA+AILAAHFL+SSATAVDFSGDH LL VP KS+ RGSIAE  LAG+D   SAFG EF MDSEINRRILA TR+ISY AL +N VPCSRR
Subjt:  MEIARVSSLFAAIAILAAHFLLSSATAVDFSGDHNLLSVPAKSKRRGSIAEYLLAGDDGGGSAFGSEFEMDSEINRRILAATRHISYDALEKNTVPCSRR

Query:  GASYYNCRPGAEANPYRRSCSAIDRCRS
        GASYYNCRPGA+ANPY R C+AI RCRS
Subjt:  GASYYNCRPGAEANPYRRSCSAIDRCRS

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A6J1C9N4 protein RALF-like 333.9e-4578.12Show/hide
Query:  MEIARVSSLFAAIAILAAHFLLSSATAVDFSGDHNLLSVPAKSKRRGSIAEYLLAGDDGGGSAFGSEFEMDSEINRRILAATRHISYDALEKNTVPCSRR
        MEI+RVSSL AA AI AAH LLSSATA DFSGDH LL VPAKS+ RGSIAE LLAGDD G   FG+EFEMDSEINRRILA  R+ISY AL++N+VPCSRR
Subjt:  MEIARVSSLFAAIAILAAHFLLSSATAVDFSGDHNLLSVPAKSKRRGSIAEYLLAGDDGGGSAFGSEFEMDSEINRRILAATRHISYDALEKNTVPCSRR

Query:  GASYYNCRPGAEANPYRRSCSAIDRCRS
        GASYYNC+PGA+ANPY R CSAI RCRS
Subjt:  GASYYNCRPGAEANPYRRSCSAIDRCRS

A0A6J1EV64 protein RALF-like 331.8e-4275Show/hide
Query:  MEIARVSSLFAAIAILAAHFLLSSATAVDFSGDHNLLSVPAKSKRRGSIAEYLLAGDDGGGSAFGSEFEMDSEINRRILAATRHISYDALEKNTVPCSRR
        MEI+RV S  AA AI+AAHFLLSSA AVDFSG   LL VPA+SK RGSIAE  LAGDD   SAFG EFEMDSEINRRILA++R++SY AL++N+VPCSRR
Subjt:  MEIARVSSLFAAIAILAAHFLLSSATAVDFSGDHNLLSVPAKSKRRGSIAEYLLAGDDGGGSAFGSEFEMDSEINRRILAATRHISYDALEKNTVPCSRR

Query:  GASYYNCRPGAEANPYRRSCSAIDRCRS
        GASYYNC+PGA+ANPYRR C+AI RCRS
Subjt:  GASYYNCRPGAEANPYRRSCSAIDRCRS

A0A6J1H3W7 protein RALF-like 334.4e-4171.88Show/hide
Query:  MEIARVSSLFAAIAILAAHFLLSSATAVDFSGDHNLLSVPAKSKRRGSIAEYLLAGDDGGGSAFGSEFEMDSEINRRILAATRHISYDALEKNTVPCSRR
        M I+RVS+L AA A+LAAHFL+ SA A+DFSGD+ +L  P KS+ RGSIAE  LAG+D   S FG EFEMDSEINRRILA TR+ISY AL +N VPCSRR
Subjt:  MEIARVSSLFAAIAILAAHFLLSSATAVDFSGDHNLLSVPAKSKRRGSIAEYLLAGDDGGGSAFGSEFEMDSEINRRILAATRHISYDALEKNTVPCSRR

Query:  GASYYNCRPGAEANPYRRSCSAIDRCRS
        GASYYNCRPGA+ANPY R CSAI RCRS
Subjt:  GASYYNCRPGAEANPYRRSCSAIDRCRS

A0A6J1KG89 protein RALF-like 333.6e-4375.78Show/hide
Query:  MEIARVSSLFAAIAILAAHFLLSSATAVDFSGDHNLLSVPAKSKRRGSIAEYLLAGDDGGGSAFGSEFEMDSEINRRILAATRHISYDALEKNTVPCSRR
        MEI+RV S  AA AI+AAHFLLSSA  VDFSGD  LL VPA+SK RGSIAE  LAGDD   SAFG EFEMDSEINRRILAA+R++SY AL++N+VPCSRR
Subjt:  MEIARVSSLFAAIAILAAHFLLSSATAVDFSGDHNLLSVPAKSKRRGSIAEYLLAGDDGGGSAFGSEFEMDSEINRRILAATRHISYDALEKNTVPCSRR

Query:  GASYYNCRPGAEANPYRRSCSAIDRCRS
        GASYYNC+PGA+ANPYRR C+AI RCRS
Subjt:  GASYYNCRPGAEANPYRRSCSAIDRCRS

A0A6J1KVY0 protein RALF-like 332.6e-4172.31Show/hide
Query:  MEIARVSSLFAAIAILAAHFLLSSATAVDFSGDHNLLSVPAKSKRRGSIAEYLLAG--DDGGGSAFGSEFEMDSEINRRILAATRHISYDALEKNTVPCS
        M I+RVS+L AA A+LAAHFL+SSATA+DFSGD+ +L  P KS+ RGSI E  LAG  DD G   FG EFEMDSEINRRILA TR+ISY AL +N VPCS
Subjt:  MEIARVSSLFAAIAILAAHFLLSSATAVDFSGDHNLLSVPAKSKRRGSIAEYLLAG--DDGGGSAFGSEFEMDSEINRRILAATRHISYDALEKNTVPCS

Query:  RRGASYYNCRPGAEANPYRRSCSAIDRCRS
        RRGASYYNCRPGA+ANPY R CSAI RCRS
Subjt:  RRGASYYNCRPGAEANPYRRSCSAIDRCRS

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q8L9P8 Protein RALF-like 339.3e-2861.74Show/hide
Query:  IAILAAHFLLSSATAVDFSGDHNLLSVPAKSKRRGSIAEYLLAGDDGGGSAFGSEFEMDSEINRRILAATRHISYDALEKNTVPCSRRGASYYNCRPGAE
        IAIL  HFL ++ T+   SGD     VP +SK  G+IAE  L       S    EFEMDSEINRRILA T++ISY AL +NTVPCSRRGASYYNCR GA+
Subjt:  IAILAAHFLLSSATAVDFSGDHNLLSVPAKSKRRGSIAEYLLAGDDGGGSAFGSEFEMDSEINRRILAATRHISYDALEKNTVPCSRRGASYYNCRPGAE

Query:  ANPYRRSCSAIDRCR
        ANPY R CSAI RCR
Subjt:  ANPYRRSCSAIDRCR

Q945T0 Rapid alkalinization factor1.4e-2354.24Show/hide
Query:  IAILAAHFLLSSATAVDFSGDHNLLSVPAKSKR--RGSIAEYLLAGDDGGGSAFGSEFEMDSEINRRILAATRHISYDALEKNTVPCSRRGASYYNCRPG
        + +L   F +S A A D SG ++ + +PA+S    +GSI E +         A   EFE+DSE NRRILA  ++ISY AL+KN+VPCSRRGASYYNC+PG
Subjt:  IAILAAHFLLSSATAVDFSGDHNLLSVPAKSKR--RGSIAEYLLAGDDGGGSAFGSEFEMDSEINRRILAATRHISYDALEKNTVPCSRRGASYYNCRPG

Query:  AEANPYRRSCSAIDRCRS
        A+ANPY R CSAI RCRS
Subjt:  AEANPYRRSCSAIDRCRS

Q9LUS7 Rapid alkalinization factor 239.3e-2854.62Show/hide
Query:  SSLFAAIAILAAH--FLLSSATAVDFSGDHNLLSVPAKSKRRGSIAEYLLA---GDDG----GGSAFGSEFEMDSEINRRILAATRHISYDALEKNTVPC
        +++FA + ILA H   +  S+ + +F+GD      P +++ RG+IAE  ++   GD G    GG   G EFEMDSEINRRILA  R+ISY AL +NT+PC
Subjt:  SSLFAAIAILAAH--FLLSSATAVDFSGDHNLLSVPAKSKRRGSIAEYLLA---GDDG----GGSAFGSEFEMDSEINRRILAATRHISYDALEKNTVPC

Query:  SRRGASYYNCRPGAEANPYRRSCSAIDRCR
        SRRGASYYNCR GA+ANPY R CSAI RCR
Subjt:  SRRGASYYNCRPGAEANPYRRSCSAIDRCR

Q9MA62 Protein RALF-like 222.3e-1848Show/hide
Query:  SLFAAIAILAAHFLLSSATAVDFSGDHNLLSVPAKSKR-----RGSIAEYLLAGDDGGGSAFGSEFEMDSEINRRILAATRHISYDALEKNTVPCSRRGA
        +++A IAILA   ++S+  +    GD +L  V A S        GSIAE +         A   E E DS+I+RRILA  ++ISY A+ +N+VPCSRRGA
Subjt:  SLFAAIAILAAHFLLSSATAVDFSGDHNLLSVPAKSKR-----RGSIAEYLLAGDDGGGSAFGSEFEMDSEINRRILAATRHISYDALEKNTVPCSRRGA

Query:  SYYNCRPGAEANPYRRSCSAIDRCR
        SYYNC+ GA+ANPY R CS I RCR
Subjt:  SYYNCRPGAEANPYRRSCSAIDRCR

Q9SRY3 Protein RALF-like 12.4e-2046.88Show/hide
Query:  SLFAAIAILAAHFLLSSATAVDFSGDHNLLSVPAKSKRRGSIAEYLLAGDDGGG------SAFGS-EFEMDSEINRRILAATRHISYDALEKNTVPCSRR
        +LF  + IL    + S      F+ D             G +A +   GD+G G         G+ E EMDSEINRRILA T++ISY +L++N+VPCSRR
Subjt:  SLFAAIAILAAHFLLSSATAVDFSGDHNLLSVPAKSKRRGSIAEYLLAGDDGGG------SAFGS-EFEMDSEINRRILAATRHISYDALEKNTVPCSRR

Query:  GASYYNCRPGAEANPYRRSCSAIDRCRS
        GASYYNC+ GA+ANPY R CS I RCRS
Subjt:  GASYYNCRPGAEANPYRRSCSAIDRCRS

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G02900.1 rapid alkalinization factor 11.7e-2146.88Show/hide
Query:  SLFAAIAILAAHFLLSSATAVDFSGDHNLLSVPAKSKRRGSIAEYLLAGDDGGG------SAFGS-EFEMDSEINRRILAATRHISYDALEKNTVPCSRR
        +LF  + IL    + S      F+ D             G +A +   GD+G G         G+ E EMDSEINRRILA T++ISY +L++N+VPCSRR
Subjt:  SLFAAIAILAAHFLLSSATAVDFSGDHNLLSVPAKSKRRGSIAEYLLAGDDGGG------SAFGS-EFEMDSEINRRILAATRHISYDALEKNTVPCSRR

Query:  GASYYNCRPGAEANPYRRSCSAIDRCRS
        GASYYNC+ GA+ANPY R CS I RCRS
Subjt:  GASYYNCRPGAEANPYRRSCSAIDRCRS

AT2G33775.1 ralf-like 191.9e-1563.93Show/hide
Query:  EFEMDSEINRRILAATR-HISYDALEKNTVPCSRRGASYYNCRPGAEANPYRRSCSAIDRC
        ++ MDSE NRR LAA R +ISY AL KN VPCSRRG SYY+C+    ANPYRR CS I  C
Subjt:  EFEMDSEINRRILAATR-HISYDALEKNTVPCSRRGASYYNCRPGAEANPYRRSCSAIDRC

AT3G05490.1 ralf-like 221.6e-1948Show/hide
Query:  SLFAAIAILAAHFLLSSATAVDFSGDHNLLSVPAKSKR-----RGSIAEYLLAGDDGGGSAFGSEFEMDSEINRRILAATRHISYDALEKNTVPCSRRGA
        +++A IAILA   ++S+  +    GD +L  V A S        GSIAE +         A   E E DS+I+RRILA  ++ISY A+ +N+VPCSRRGA
Subjt:  SLFAAIAILAAHFLLSSATAVDFSGDHNLLSVPAKSKR-----RGSIAEYLLAGDDGGGSAFGSEFEMDSEINRRILAATRHISYDALEKNTVPCSRRGA

Query:  SYYNCRPGAEANPYRRSCSAIDRCR
        SYYNC+ GA+ANPY R CS I RCR
Subjt:  SYYNCRPGAEANPYRRSCSAIDRCR

AT3G16570.1 rapid alkalinization factor 236.6e-2954.62Show/hide
Query:  SSLFAAIAILAAH--FLLSSATAVDFSGDHNLLSVPAKSKRRGSIAEYLLA---GDDG----GGSAFGSEFEMDSEINRRILAATRHISYDALEKNTVPC
        +++FA + ILA H   +  S+ + +F+GD      P +++ RG+IAE  ++   GD G    GG   G EFEMDSEINRRILA  R+ISY AL +NT+PC
Subjt:  SSLFAAIAILAAH--FLLSSATAVDFSGDHNLLSVPAKSKRRGSIAEYLLA---GDDG----GGSAFGSEFEMDSEINRRILAATRHISYDALEKNTVPC

Query:  SRRGASYYNCRPGAEANPYRRSCSAIDRCR
        SRRGASYYNCR GA+ANPY R CSAI RCR
Subjt:  SRRGASYYNCRPGAEANPYRRSCSAIDRCR

AT4G15800.1 ralf-like 336.6e-2961.74Show/hide
Query:  IAILAAHFLLSSATAVDFSGDHNLLSVPAKSKRRGSIAEYLLAGDDGGGSAFGSEFEMDSEINRRILAATRHISYDALEKNTVPCSRRGASYYNCRPGAE
        IAIL  HFL ++ T+   SGD     VP +SK  G+IAE  L       S    EFEMDSEINRRILA T++ISY AL +NTVPCSRRGASYYNCR GA+
Subjt:  IAILAAHFLLSSATAVDFSGDHNLLSVPAKSKRRGSIAEYLLAGDDGGGSAFGSEFEMDSEINRRILAATRHISYDALEKNTVPCSRRGASYYNCRPGAE

Query:  ANPYRRSCSAIDRCR
        ANPY R CSAI RCR
Subjt:  ANPYRRSCSAIDRCR


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAAATCGCACGCGTTTCTTCTCTCTTCGCAGCAATCGCCATTCTCGCCGCTCATTTCCTGCTCTCATCGGCGACGGCCGTCGATTTCTCCGGTGACCACAACCTCCT
CTCCGTTCCGGCCAAATCCAAACGCCGAGGCTCAATCGCAGAGTATCTCCTCGCCGGAGACGACGGCGGCGGTTCCGCGTTCGGATCGGAGTTCGAGATGGACTCTGAAA
TCAATCGCCGAATCCTAGCGGCGACTCGCCACATCAGCTACGACGCCTTGGAGAAGAACACCGTTCCTTGCTCTCGCCGCGGTGCTTCGTACTACAACTGCCGGCCCGGC
GCTGAGGCGAACCCGTACAGACGCAGTTGCAGCGCCATTGATCGCTGCCGGAGTTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CAAAAAATGGAAATCGCACGCGTTTCTTCTCTCTTCGCAGCAATCGCCATTCTCGCCGCTCATTTCCTGCTCTCATCGGCGACGGCCGTCGATTTCTCCGGTGACCACAA
CCTCCTCTCCGTTCCGGCCAAATCCAAACGCCGAGGCTCAATCGCAGAGTATCTCCTCGCCGGAGACGACGGCGGCGGTTCCGCGTTCGGATCGGAGTTCGAGATGGACT
CTGAAATCAATCGCCGAATCCTAGCGGCGACTCGCCACATCAGCTACGACGCCTTGGAGAAGAACACCGTTCCTTGCTCTCGCCGCGGTGCTTCGTACTACAACTGCCGG
CCCGGCGCTGAGGCGAACCCGTACAGACGCAGTTGCAGCGCCATTGATCGCTGCCGGAGTTAAATCCTCACTCGATTCTTTTTCTTTTATGAAGTTAGATTCAAATCGCC
GTATTCTAACGGTTAATTCGTCGTGTTTATACTGGTTATACATACCGATTTGAATAATAAGATGAAGATCCGTACTGATGATTATGATTGAAATTGAAAACGTTGTTTCT
GGAAACGTTTGTTATCGTTTGCCATTAGTAATTCAGTGGTAGGAGGGCACACAGTGTTTGTTTTAATTTCTGGTGGATCGTGCTAATCTTTTCCAGGTGCCATTATTTGA
GTTCTTCATTTGTTCATCATCCTTTTTTCCTATTTTATATTATTTTGAATTTTTATTTTTGTCAAAGAAATATTTGGACAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MEIARVSSLFAAIAILAAHFLLSSATAVDFSGDHNLLSVPAKSKRRGSIAEYLLAGDDGGGSAFGSEFEMDSEINRRILAATRHISYDALEKNTVPCSRRGASYYNCRPG
AEANPYRRSCSAIDRCRS