; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Sed0020615 (gene) of Chayote v1 genome

Gene IDSed0020615
OrganismSechium edule (Chayote v1)
DescriptionCytochrome c biogenesis protein CcsA
Genome locationLG13:18719177..18720148
RNA-Seq ExpressionSed0020615
SyntenySed0020615
Gene Ontology termsGO:0017004 - cytochrome complex assembly (biological process)
GO:0020037 - heme binding (molecular function)
InterPro domainsIPR002541 - Cytochrome c assembly protein
IPR017562 - Cytochrome c-type biogenesis protein CcsA
IPR045062 - Cytochrome c-type biogenesis protein CcsA/CcmC


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
QJD26520.1 CcsA [Trichosanthes kirilowii var. japonica]1.8e-15188.27Show/hide
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YP_009751954.1 cytochrome c biogenesis protein [Cyclanthera pedata]8.5e-15489.81Show/hide
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YP_009752890.1 cytochrome c biogenesis protein [Baijiania yunnanensis]3.0e-15187.96Show/hide
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YP_009945469.1 cytochrome c heme attachment protein [Sechium edule]1.1e-15691.36Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A6H0EPI5 Cytochrome c biogenesis protein CcsA5.2e-15791.36Show/hide
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A0A6H0ER06 Cytochrome c biogenesis protein CcsA4.1e-15489.81Show/hide
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A0A6H0EUE0 Cytochrome c biogenesis protein CcsA1.5e-15187.96Show/hide
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A0A6M3RU47 Cytochrome c biogenesis protein CcsA8.6e-15288.27Show/hide
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A0A6M3S745 Cytochrome c biogenesis protein CcsA3.9e-15288.27Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
B1NWJ8 Cytochrome c biogenesis protein CcsA2.0e-12975.78Show/hide
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Q09WW9 Cytochrome c biogenesis protein CcsA2.5e-13276.23Show/hide
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Q0ZIW9 Cytochrome c biogenesis protein CcsA1.1e-13075.62Show/hide
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Q2L962 Cytochrome c biogenesis protein CcsA2.0e-12975.62Show/hide
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        MIFSTLEHILTHISFSV+SIVITIH +T  LLVDE +GLY SSEKGMI TFFCITGLLVTRWIY  H PLSDLYESL+FLSWGFS+IH+ + +K  K+  
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Query:  SVSAITAPSTIFFTQGFATSGFLTKIHQSPLLVPALQSHWLMMHVSMMVLGYASLLCGSLFSVALIVITFQKAIRIF------------------RNNVF
        ++SAITAPS I FTQGFATSG LTK+HQS +L PALQS WLMMHVSMMVLGYA+LLCGSL SVAL+VITF+KAI+I                   R+NV 
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Query:  KKHFFLPSKNYYKSQLIQQLDHWSYRIISLGFIFLSIGILSGAVWANETWGSYWNWDPKETWAFITWTIFAIYLHMRTNKNFEGVNSAIVASMGFLLIWI
           +FL SKNYY+ QL QQLD WSYRIISLGFIFL+IGILSGAVWANE WGSYWNWDPKETWAFITWT+FAIY H RTN N EGVNSA+VASMGFL+IWI
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Query:  CYFGVNLLGIGLHSYGSFTL
        CYFGVNLLGIGLHSYGSFTL
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Q2QD41 Cytochrome c biogenesis protein CcsA8.6e-14985.49Show/hide
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        MIFST EHILTHISFSVISIVITI LITLL++ET+GLY SSEKGMIATFFCITGLLVTRWIYLRHLPLSDLYESLLFLSW FSIIH+FT  KKYK H SV
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Query:  SAITAPSTIFFTQGFATSGFLTKIHQSPLLVPALQSHWLMMHVSMMVLGYASLLCGSLFSVALIVITFQKAIRIF--RNNVFKKHF--------------
        SAITAPSTI FTQGFATSGFLT++HQSPLLVPALQSHWLMMHVSMMVLGYA+LLCGSLFSVALIVITFQKAIRIF   NN+    F              
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Query:  -----FLPSKNYYKSQLIQQLDHWSYRIISLGFIFLSIGILSGAVWANETWGSYWNWDPKETWAFITWTIFAIYLHMRTNKNFEGVNSAIVASMGFLLIW
             F  SKNYYKSQLIQQLDHWSYRIISLGFIFLSIGILSGAVWANETWGSYWNWDPKETWAFITWTIFAIYLH RTNKNFEGVNSAIVASMGFL+IW
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Query:  ICYFGVNLLGIGLHSYGSFTLTSN
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
ATCG01040.1 Cytochrome C assembly protein1.9e-11466.46Show/hide
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        MIFS LEHILTHISFSV+SIV+TI+ +TLLV  DE +G + SS+KG+I TFF ITGLL+TRWIY  H PLS+LYESL+FLSW FSIIH+ +   K K+  
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Query:  SVSAITAPSTIFFTQGFATSGFLTKIHQSPLLVPALQSHWLMMHVSMMVLGYASLLCGSLFSVALIVITFQKAIRIFRNNVFKKHFFLP-----------
         ++ ITAPS IF  QGFATSG L K+ QS +LVPALQS WLMMHVSMM+LGY +LLCGSL S+AL+VITF+K    F     KK+F L            
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Query:  ----------------SKNYYKSQLIQQLDHWSYRIISLGFIFLSIGILSGAVWANETWGSYWNWDPKETWAFITWTIFAIYLHMRTNKNFEGVNSAIVA
                        S+NYY+ QLIQQLD WS+RIISLGFIFL++GILSGAVWANETWGSYWNWDPKETWAFITWTIFAIYLH++TN+N  G+NSAIVA
Subjt:  ----------------SKNYYKSQLIQQLDHWSYRIISLGFIFLSIGILSGAVWANETWGSYWNWDPKETWAFITWTIFAIYLHMRTNKNFEGVNSAIVA

Query:  SMGFLLIWICYFGVNLLGIGLHSYGSFT
         +GF+LIWICYFGVNLLGIGLHSYGSFT
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGATATTTTCAACTTTAGAGCATATATTAACTCATATATCTTTTTCGGTCATTTCAATTGTCATTACAATTCATTTGATAACCTTATTAGTCGATGAAACCCTAGGACT
CTATGCTTCGTCAGAAAAGGGTATGATAGCTACTTTTTTCTGTATAACAGGATTATTAGTTACTCGTTGGATTTATTTGAGGCATTTACCATTAAGTGATTTATATGAAT
CATTACTATTTCTCTCATGGGGTTTCTCCATTATTCATATATTTACGTCTATAAAAAAATATAAAAAACATTTTAGTGTAAGCGCAATAACCGCGCCAAGTACTATTTTT
TTTACCCAAGGTTTTGCTACTTCAGGTTTTTTAACTAAAATCCATCAATCCCCACTATTAGTCCCCGCTCTCCAATCTCATTGGTTAATGATGCACGTAAGTATGATGGT
ATTGGGTTATGCATCTCTTTTATGTGGCTCATTATTTTCAGTAGCTCTTATAGTGATTACATTTCAAAAAGCTATAAGAATTTTTAGGAACAATGTTTTTAAAAAACACT
TCTTTTTGCCTTCGAAGAATTATTATAAGTCTCAACTGATTCAACAATTAGATCATTGGAGTTATCGTATTATTAGTCTAGGGTTTATCTTTTTAAGCATAGGTATTCTT
TCAGGAGCAGTATGGGCTAATGAGACATGGGGATCATATTGGAATTGGGACCCAAAGGAAACTTGGGCATTTATTACTTGGACCATCTTCGCAATTTATTTACATATGCG
AACAAATAAAAATTTTGAAGGTGTAAATTCTGCAATTGTGGCCTCTATGGGTTTTCTTCTAATTTGGATATGCTATTTTGGGGTCAATCTATTAGGGATAGGGCTACATA
GTTATGGTTCATTTACATTAACATCTAATTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGATATTTTCAACTTTAGAGCATATATTAACTCATATATCTTTTTCGGTCATTTCAATTGTCATTACAATTCATTTGATAACCTTATTAGTCGATGAAACCCTAGGACT
CTATGCTTCGTCAGAAAAGGGTATGATAGCTACTTTTTTCTGTATAACAGGATTATTAGTTACTCGTTGGATTTATTTGAGGCATTTACCATTAAGTGATTTATATGAAT
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GTTATGGTTCATTTACATTAACATCTAATTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MIFSTLEHILTHISFSVISIVITIHLITLLVDETLGLYASSEKGMIATFFCITGLLVTRWIYLRHLPLSDLYESLLFLSWGFSIIHIFTSIKKYKKHFSVSAITAPSTIF
FTQGFATSGFLTKIHQSPLLVPALQSHWLMMHVSMMVLGYASLLCGSLFSVALIVITFQKAIRIFRNNVFKKHFFLPSKNYYKSQLIQQLDHWSYRIISLGFIFLSIGIL
SGAVWANETWGSYWNWDPKETWAFITWTIFAIYLHMRTNKNFEGVNSAIVASMGFLLIWICYFGVNLLGIGLHSYGSFTLTSN