; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Sed0020636 (gene) of Chayote v1 genome

Gene IDSed0020636
OrganismSechium edule (Chayote v1)
DescriptionRetrotransposon protein
Genome locationLG13:8154403..8155714
RNA-Seq ExpressionSed0020636
SyntenySed0020636
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR027806 - Harbinger transposase-derived nuclease domain


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0035620.1 retrotransposon protein [Cucumis melo var. makuwa]3.7e-12557.7Show/hide
Query:  MDPDKTIAVLTILYTWQNQFLLLANLVMNYNPRTKNYSSFFRHHFRQMIFFSMIRQSDLACRETTRMNRSCFEILCDMLRTHGGLRGTDYIDVEEMVAMF
        MD  +  +++      Q Q LL+  L+ N   R  +     RH  RQ+ +F MI  SDL CR++TRM+R CF ILC +LRT  GL  T+ +DVEEMVAMF
Subjt:  MDPDKTIAVLTILYTWQNQFLLLANLVMNYNPRTKNYSSFFRHHFRQMIFFSMIRQSDLACRETTRMNRSCFEILCDMLRTHGGLRGTDYIDVEEMVAMF

Query:  LHIMAHDVKNHVVRRIFTRSGETVSRHFQSILTAVMRCHDILFKKPEPIQPSCTDSRWKWFENCLGGLDGTHIELQVPVENRASFRNRKGIITTNVLAVC
        LHI+AHDVKN V++R F RSGET+SRHF  +L AV+R H+ L KKP+P+   CTD RW+WFENCLG LDGT+I++ VP  +RA +R RKG + TNVL VC
Subjt:  LHIMAHDVKNHVVRRIFTRSGETVSRHFQSILTAVMRCHDILFKKPEPIQPSCTDSRWKWFENCLGGLDGTHIELQVPVENRASFRNRKGIITTNVLAVC

Query:  APSGEFIYVLAGWEGSAADSRVLRDALSRNNGFQVPHGYYYLCDAGYPNADGFLAPYRGERYHLSDWRG-SNPPRNPREFFNKAHSSARNIIERAFGALK
           G+F+YVLAGWEGSAADSR+LRDALSR N  +VP GYYYL DAGYPNA+GFLAPYRG+RYHL +WRG  N P   +EFFN  HSSARN+IERAFG LK
Subjt:  APSGEFIYVLAGWEGSAADSRVLRDALSRNNGFQVPHGYYYLCDAGYPNADGFLAPYRGERYHLSDWRG-SNPPRNPREFFNKAHSSARNIIERAFGALK

Query:  NRWAILRHKSYYPPKVQVKIITACCLLHNLICREMGSTIGLEILGENDATLYQEDMDDTPTINFVETSPLWTAFRDSMAQRMF
         RWAILR KSYYP +VQ + I ACCLLHNLI REM +    + + E D+T      DD   I+++ETS  W+ +RD++A+ MF
Subjt:  NRWAILRHKSYYPPKVQVKIITACCLLHNLICREMGSTIGLEILGENDATLYQEDMDDTPTINFVETSPLWTAFRDSMAQRMF

KAA0046727.1 retrotransposon protein [Cucumis melo var. makuwa]1.3e-12557.96Show/hide
Query:  MDPDKTIAVLTILYTWQNQFLLLANLVMNYNPRTKNYSSFFRHHFRQMIFFSMIRQSDLACRETTRMNRSCFEILCDMLRTHGGLRGTDYIDVEEMVAMF
        MD  +  +++      Q Q LL+  L+ N   R  +     RH  RQ+ +F MI  SDL CR++TRM+R CF ILC +LRT  GL  T+ +DVEEMVAMF
Subjt:  MDPDKTIAVLTILYTWQNQFLLLANLVMNYNPRTKNYSSFFRHHFRQMIFFSMIRQSDLACRETTRMNRSCFEILCDMLRTHGGLRGTDYIDVEEMVAMF

Query:  LHIMAHDVKNHVVRRIFTRSGETVSRHFQSILTAVMRCHDILFKKPEPIQPSCTDSRWKWFENCLGGLDGTHIELQVPVENRASFRNRKGIITTNVLAVC
        LHI+AHDVKN V++R F RSGET+SRHF  +L AV+R HD L KKP+P+   CTD RW+WFENCLG LDGT+I++ VP  +RA +R RKG + TNVL VC
Subjt:  LHIMAHDVKNHVVRRIFTRSGETVSRHFQSILTAVMRCHDILFKKPEPIQPSCTDSRWKWFENCLGGLDGTHIELQVPVENRASFRNRKGIITTNVLAVC

Query:  APSGEFIYVLAGWEGSAADSRVLRDALSRNNGFQVPHGYYYLCDAGYPNADGFLAPYRGERYHLSDWRG-SNPPRNPREFFNKAHSSARNIIERAFGALK
           G+F+YVLAGWEGSAADSR+LRDALSR N  +VP GYYYL DAGYPNA+GFLAPYRG+RYHL +WRG  N P   +EFFN  HSSARN+IERAFG LK
Subjt:  APSGEFIYVLAGWEGSAADSRVLRDALSRNNGFQVPHGYYYLCDAGYPNADGFLAPYRGERYHLSDWRG-SNPPRNPREFFNKAHSSARNIIERAFGALK

Query:  NRWAILRHKSYYPPKVQVKIITACCLLHNLICREMGSTIGLEILGENDATLYQEDMDDTPTINFVETSPLWTAFRDSMAQRMF
         RWAILR KSYYP +VQ + I ACCLLHNLI REM +    + + E D+T      DD   I+++ETS  W+ +RD++A+ MF
Subjt:  NRWAILRHKSYYPPKVQVKIITACCLLHNLICREMGSTIGLEILGENDATLYQEDMDDTPTINFVETSPLWTAFRDSMAQRMF

KAA0047510.1 retrotransposon protein [Cucumis melo var. makuwa]1.2e-12357.18Show/hide
Query:  MDPDKTIAVLTILYTWQNQFLLLANLVMNYNPRTKNYSSFFRHHFRQMIFFSMIRQSDLACRETTRMNRSCFEILCDMLRTHGGLRGTDYIDVEEMVAMF
        MD  +  +++      Q Q LL+  L+ N   R  +     RH  RQ+ +F MI  SDL CRE+TRM+R CF ILC +LRT  GL  T+ +DVEEMVAMF
Subjt:  MDPDKTIAVLTILYTWQNQFLLLANLVMNYNPRTKNYSSFFRHHFRQMIFFSMIRQSDLACRETTRMNRSCFEILCDMLRTHGGLRGTDYIDVEEMVAMF

Query:  LHIMAHDVKNHVVRRIFTRSGETVSRHFQSILTAVMRCHDILFKKPEPIQPSCTDSRWKWFENCLGGLDGTHIELQVPVENRASFRNRKGIITTNVLAVC
        LHI+AHDVKN V++R F RSGET+S HF  +L AV+R H+ L KKP+P+   CTD RW+WFENCLG LDGT+I++ VP  +RA +R RKG + TNVL VC
Subjt:  LHIMAHDVKNHVVRRIFTRSGETVSRHFQSILTAVMRCHDILFKKPEPIQPSCTDSRWKWFENCLGGLDGTHIELQVPVENRASFRNRKGIITTNVLAVC

Query:  APSGEFIYVLAGWEGSAADSRVLRDALSRNNGFQVPHGYYYLCDAGYPNADGFLAPYRGERYHLSDWRG-SNPPRNPREFFNKAHSSARNIIERAFGALK
           G+F+YVLAGWEGSAADSR+LRDALSR NG +VP GYYYL DAGYPN +GFLAPYRG+RYHL +W G  N P   +EFFN  H SARN+IERAFG LK
Subjt:  APSGEFIYVLAGWEGSAADSRVLRDALSRNNGFQVPHGYYYLCDAGYPNADGFLAPYRGERYHLSDWRG-SNPPRNPREFFNKAHSSARNIIERAFGALK

Query:  NRWAILRHKSYYPPKVQVKIITACCLLHNLICREMGSTIGLEILGENDATLYQEDMDDTPTINFVETSPLWTAFRDSMAQRMF
         RWAILR KSYYP +VQ + I ACCLLHNLI REM +    + + E D+T      DD   I+++ETS  W+ +RD +A+ MF
Subjt:  NRWAILRHKSYYPPKVQVKIITACCLLHNLICREMGSTIGLEILGENDATLYQEDMDDTPTINFVETSPLWTAFRDSMAQRMF

KAA0048361.1 retrotransposon protein [Cucumis melo var. makuwa]6.9e-12457.44Show/hide
Query:  MDPDKTIAVLTILYTWQNQFLLLANLVMNYNPRTKNYSSFFRHHFRQMIFFSMIRQSDLACRETTRMNRSCFEILCDMLRTHGGLRGTDYIDVEEMVAMF
        MD  +  +++      Q Q LL+  L+ N   R  +     RH  RQ+ +F MI  SDL CR++TRM+R CF ILC +LRT  GL  T+ +DVEEMVAMF
Subjt:  MDPDKTIAVLTILYTWQNQFLLLANLVMNYNPRTKNYSSFFRHHFRQMIFFSMIRQSDLACRETTRMNRSCFEILCDMLRTHGGLRGTDYIDVEEMVAMF

Query:  LHIMAHDVKNHVVRRIFTRSGETVSRHFQSILTAVMRCHDILFKKPEPIQPSCTDSRWKWFENCLGGLDGTHIELQVPVENRASFRNRKGIITTNVLAVC
        LHI+AHDVKN V++R F RSGET+SRHF  +L AV+R H+ L KKP+P+   CTD RWKWFENCLG LDGT+I++ VP  +RA +R RKG + TNVL VC
Subjt:  LHIMAHDVKNHVVRRIFTRSGETVSRHFQSILTAVMRCHDILFKKPEPIQPSCTDSRWKWFENCLGGLDGTHIELQVPVENRASFRNRKGIITTNVLAVC

Query:  APSGEFIYVLAGWEGSAADSRVLRDALSRNNGFQVPHGYYYLCDAGYPNADGFLAPYRGERYHLSDWRG-SNPPRNPREFFNKAHSSARNIIERAFGALK
           G+F+YVLAGWEG AADSR+LRDALSR N  +VP GYYYL DAGY NA+GFLAPYRG+RYHL +WRG  N P   +EFFN  HSSARN+IERAFG LK
Subjt:  APSGEFIYVLAGWEGSAADSRVLRDALSRNNGFQVPHGYYYLCDAGYPNADGFLAPYRGERYHLSDWRG-SNPPRNPREFFNKAHSSARNIIERAFGALK

Query:  NRWAILRHKSYYPPKVQVKIITACCLLHNLICREMGSTIGLEILGENDATLYQEDMDDTPTINFVETSPLWTAFRDSMAQRMF
         RWAILR KSYYP +VQ + I ACCLLHNLI REM +    + + E D+T      DD   I+++ETS  W+ +RD++A+ MF
Subjt:  NRWAILRHKSYYPPKVQVKIITACCLLHNLICREMGSTIGLEILGENDATLYQEDMDDTPTINFVETSPLWTAFRDSMAQRMF

KAA0051057.1 retrotransposon protein [Cucumis melo var. makuwa]1.5e-12356.92Show/hide
Query:  MDPDKTIAVLTILYTWQNQFLLLANLVMNYNPRTKNYSSFFRHHFRQMIFFSMIRQSDLACRETTRMNRSCFEILCDMLRTHGGLRGTDYIDVEEMVAMF
        MD  +  +++      Q Q LL+  L+ N   R  +     RH  RQ+ +F MI  SDL C ++TRM+R CF ILC +LRT  GL  T+ +DVEEMVAMF
Subjt:  MDPDKTIAVLTILYTWQNQFLLLANLVMNYNPRTKNYSSFFRHHFRQMIFFSMIRQSDLACRETTRMNRSCFEILCDMLRTHGGLRGTDYIDVEEMVAMF

Query:  LHIMAHDVKNHVVRRIFTRSGETVSRHFQSILTAVMRCHDILFKKPEPIQPSCTDSRWKWFENCLGGLDGTHIELQVPVENRASFRNRKGIITTNVLAVC
        LHI+ HDVKN V++R F RSGET+SRHF  +L AV+R H+ L KKP+P+   CTD RW+WFENCLG LDGT+I++ VP  +RA +R RKG + TNVL VC
Subjt:  LHIMAHDVKNHVVRRIFTRSGETVSRHFQSILTAVMRCHDILFKKPEPIQPSCTDSRWKWFENCLGGLDGTHIELQVPVENRASFRNRKGIITTNVLAVC

Query:  APSGEFIYVLAGWEGSAADSRVLRDALSRNNGFQVPHGYYYLCDAGYPNADGFLAPYRGERYHLSDWRG-SNPPRNPREFFNKAHSSARNIIERAFGALK
           G+F+YVLAGWEGSAADSR+LRDALSR N  +VP GYYYL DAGYPNA+GFLAPYRG+RYHL +WRG  N P   +EFFN  HS ARN+IERAFG LK
Subjt:  APSGEFIYVLAGWEGSAADSRVLRDALSRNNGFQVPHGYYYLCDAGYPNADGFLAPYRGERYHLSDWRG-SNPPRNPREFFNKAHSSARNIIERAFGALK

Query:  NRWAILRHKSYYPPKVQVKIITACCLLHNLICREMGSTIGLEILGENDATLYQEDMDDTPTINFVETSPLWTAFRDSMAQRMF
         RWAILR KSYYP +VQ + I ACCLLHNLI REM +    + + E D+T      DD   I+++ETS  W+ +RD++A+ MF
Subjt:  NRWAILRHKSYYPPKVQVKIITACCLLHNLICREMGSTIGLEILGENDATLYQEDMDDTPTINFVETSPLWTAFRDSMAQRMF

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A5A7TWH8 Retrotransposon protein5.7e-12457.18Show/hide
Query:  MDPDKTIAVLTILYTWQNQFLLLANLVMNYNPRTKNYSSFFRHHFRQMIFFSMIRQSDLACRETTRMNRSCFEILCDMLRTHGGLRGTDYIDVEEMVAMF
        MD  +  +++      Q Q LL+  L+ N   R  +     RH  RQ+ +F MI  SDL CRE+TRM+R CF ILC +LRT  GL  T+ +DVEEMVAMF
Subjt:  MDPDKTIAVLTILYTWQNQFLLLANLVMNYNPRTKNYSSFFRHHFRQMIFFSMIRQSDLACRETTRMNRSCFEILCDMLRTHGGLRGTDYIDVEEMVAMF

Query:  LHIMAHDVKNHVVRRIFTRSGETVSRHFQSILTAVMRCHDILFKKPEPIQPSCTDSRWKWFENCLGGLDGTHIELQVPVENRASFRNRKGIITTNVLAVC
        LHI+AHDVKN V++R F RSGET+S HF  +L AV+R H+ L KKP+P+   CTD RW+WFENCLG LDGT+I++ VP  +RA +R RKG + TNVL VC
Subjt:  LHIMAHDVKNHVVRRIFTRSGETVSRHFQSILTAVMRCHDILFKKPEPIQPSCTDSRWKWFENCLGGLDGTHIELQVPVENRASFRNRKGIITTNVLAVC

Query:  APSGEFIYVLAGWEGSAADSRVLRDALSRNNGFQVPHGYYYLCDAGYPNADGFLAPYRGERYHLSDWRG-SNPPRNPREFFNKAHSSARNIIERAFGALK
           G+F+YVLAGWEGSAADSR+LRDALSR NG +VP GYYYL DAGYPN +GFLAPYRG+RYHL +W G  N P   +EFFN  H SARN+IERAFG LK
Subjt:  APSGEFIYVLAGWEGSAADSRVLRDALSRNNGFQVPHGYYYLCDAGYPNADGFLAPYRGERYHLSDWRG-SNPPRNPREFFNKAHSSARNIIERAFGALK

Query:  NRWAILRHKSYYPPKVQVKIITACCLLHNLICREMGSTIGLEILGENDATLYQEDMDDTPTINFVETSPLWTAFRDSMAQRMF
         RWAILR KSYYP +VQ + I ACCLLHNLI REM +    + + E D+T      DD   I+++ETS  W+ +RD +A+ MF
Subjt:  NRWAILRHKSYYPPKVQVKIITACCLLHNLICREMGSTIGLEILGENDATLYQEDMDDTPTINFVETSPLWTAFRDSMAQRMF

A0A5A7TXW1 Retrotransposon protein6.1e-12657.96Show/hide
Query:  MDPDKTIAVLTILYTWQNQFLLLANLVMNYNPRTKNYSSFFRHHFRQMIFFSMIRQSDLACRETTRMNRSCFEILCDMLRTHGGLRGTDYIDVEEMVAMF
        MD  +  +++      Q Q LL+  L+ N   R  +     RH  RQ+ +F MI  SDL CR++TRM+R CF ILC +LRT  GL  T+ +DVEEMVAMF
Subjt:  MDPDKTIAVLTILYTWQNQFLLLANLVMNYNPRTKNYSSFFRHHFRQMIFFSMIRQSDLACRETTRMNRSCFEILCDMLRTHGGLRGTDYIDVEEMVAMF

Query:  LHIMAHDVKNHVVRRIFTRSGETVSRHFQSILTAVMRCHDILFKKPEPIQPSCTDSRWKWFENCLGGLDGTHIELQVPVENRASFRNRKGIITTNVLAVC
        LHI+AHDVKN V++R F RSGET+SRHF  +L AV+R HD L KKP+P+   CTD RW+WFENCLG LDGT+I++ VP  +RA +R RKG + TNVL VC
Subjt:  LHIMAHDVKNHVVRRIFTRSGETVSRHFQSILTAVMRCHDILFKKPEPIQPSCTDSRWKWFENCLGGLDGTHIELQVPVENRASFRNRKGIITTNVLAVC

Query:  APSGEFIYVLAGWEGSAADSRVLRDALSRNNGFQVPHGYYYLCDAGYPNADGFLAPYRGERYHLSDWRG-SNPPRNPREFFNKAHSSARNIIERAFGALK
           G+F+YVLAGWEGSAADSR+LRDALSR N  +VP GYYYL DAGYPNA+GFLAPYRG+RYHL +WRG  N P   +EFFN  HSSARN+IERAFG LK
Subjt:  APSGEFIYVLAGWEGSAADSRVLRDALSRNNGFQVPHGYYYLCDAGYPNADGFLAPYRGERYHLSDWRG-SNPPRNPREFFNKAHSSARNIIERAFGALK

Query:  NRWAILRHKSYYPPKVQVKIITACCLLHNLICREMGSTIGLEILGENDATLYQEDMDDTPTINFVETSPLWTAFRDSMAQRMF
         RWAILR KSYYP +VQ + I ACCLLHNLI REM +    + + E D+T      DD   I+++ETS  W+ +RD++A+ MF
Subjt:  NRWAILRHKSYYPPKVQVKIITACCLLHNLICREMGSTIGLEILGENDATLYQEDMDDTPTINFVETSPLWTAFRDSMAQRMF

A0A5A7U476 Retrotransposon protein3.3e-12457.44Show/hide
Query:  MDPDKTIAVLTILYTWQNQFLLLANLVMNYNPRTKNYSSFFRHHFRQMIFFSMIRQSDLACRETTRMNRSCFEILCDMLRTHGGLRGTDYIDVEEMVAMF
        MD  +  +++      Q Q LL+  L+ N   R  +     RH  RQ+ +F MI  SDL CR++TRM+R CF ILC +LRT  GL  T+ +DVEEMVAMF
Subjt:  MDPDKTIAVLTILYTWQNQFLLLANLVMNYNPRTKNYSSFFRHHFRQMIFFSMIRQSDLACRETTRMNRSCFEILCDMLRTHGGLRGTDYIDVEEMVAMF

Query:  LHIMAHDVKNHVVRRIFTRSGETVSRHFQSILTAVMRCHDILFKKPEPIQPSCTDSRWKWFENCLGGLDGTHIELQVPVENRASFRNRKGIITTNVLAVC
        LHI+AHDVKN V++R F RSGET+SRHF  +L AV+R H+ L KKP+P+   CTD RWKWFENCLG LDGT+I++ VP  +RA +R RKG + TNVL VC
Subjt:  LHIMAHDVKNHVVRRIFTRSGETVSRHFQSILTAVMRCHDILFKKPEPIQPSCTDSRWKWFENCLGGLDGTHIELQVPVENRASFRNRKGIITTNVLAVC

Query:  APSGEFIYVLAGWEGSAADSRVLRDALSRNNGFQVPHGYYYLCDAGYPNADGFLAPYRGERYHLSDWRG-SNPPRNPREFFNKAHSSARNIIERAFGALK
           G+F+YVLAGWEG AADSR+LRDALSR N  +VP GYYYL DAGY NA+GFLAPYRG+RYHL +WRG  N P   +EFFN  HSSARN+IERAFG LK
Subjt:  APSGEFIYVLAGWEGSAADSRVLRDALSRNNGFQVPHGYYYLCDAGYPNADGFLAPYRGERYHLSDWRG-SNPPRNPREFFNKAHSSARNIIERAFGALK

Query:  NRWAILRHKSYYPPKVQVKIITACCLLHNLICREMGSTIGLEILGENDATLYQEDMDDTPTINFVETSPLWTAFRDSMAQRMF
         RWAILR KSYYP +VQ + I ACCLLHNLI REM +    + + E D+T      DD   I+++ETS  W+ +RD++A+ MF
Subjt:  NRWAILRHKSYYPPKVQVKIITACCLLHNLICREMGSTIGLEILGENDATLYQEDMDDTPTINFVETSPLWTAFRDSMAQRMF

A0A5A7U9H2 Retrotransposon protein7.4e-12456.92Show/hide
Query:  MDPDKTIAVLTILYTWQNQFLLLANLVMNYNPRTKNYSSFFRHHFRQMIFFSMIRQSDLACRETTRMNRSCFEILCDMLRTHGGLRGTDYIDVEEMVAMF
        MD  +  +++      Q Q LL+  L+ N   R  +     RH  RQ+ +F MI  SDL C ++TRM+R CF ILC +LRT  GL  T+ +DVEEMVAMF
Subjt:  MDPDKTIAVLTILYTWQNQFLLLANLVMNYNPRTKNYSSFFRHHFRQMIFFSMIRQSDLACRETTRMNRSCFEILCDMLRTHGGLRGTDYIDVEEMVAMF

Query:  LHIMAHDVKNHVVRRIFTRSGETVSRHFQSILTAVMRCHDILFKKPEPIQPSCTDSRWKWFENCLGGLDGTHIELQVPVENRASFRNRKGIITTNVLAVC
        LHI+ HDVKN V++R F RSGET+SRHF  +L AV+R H+ L KKP+P+   CTD RW+WFENCLG LDGT+I++ VP  +RA +R RKG + TNVL VC
Subjt:  LHIMAHDVKNHVVRRIFTRSGETVSRHFQSILTAVMRCHDILFKKPEPIQPSCTDSRWKWFENCLGGLDGTHIELQVPVENRASFRNRKGIITTNVLAVC

Query:  APSGEFIYVLAGWEGSAADSRVLRDALSRNNGFQVPHGYYYLCDAGYPNADGFLAPYRGERYHLSDWRG-SNPPRNPREFFNKAHSSARNIIERAFGALK
           G+F+YVLAGWEGSAADSR+LRDALSR N  +VP GYYYL DAGYPNA+GFLAPYRG+RYHL +WRG  N P   +EFFN  HS ARN+IERAFG LK
Subjt:  APSGEFIYVLAGWEGSAADSRVLRDALSRNNGFQVPHGYYYLCDAGYPNADGFLAPYRGERYHLSDWRG-SNPPRNPREFFNKAHSSARNIIERAFGALK

Query:  NRWAILRHKSYYPPKVQVKIITACCLLHNLICREMGSTIGLEILGENDATLYQEDMDDTPTINFVETSPLWTAFRDSMAQRMF
         RWAILR KSYYP +VQ + I ACCLLHNLI REM +    + + E D+T      DD   I+++ETS  W+ +RD++A+ MF
Subjt:  NRWAILRHKSYYPPKVQVKIITACCLLHNLICREMGSTIGLEILGENDATLYQEDMDDTPTINFVETSPLWTAFRDSMAQRMF

A0A5D3BDX0 Retrotransposon protein1.8e-12557.7Show/hide
Query:  MDPDKTIAVLTILYTWQNQFLLLANLVMNYNPRTKNYSSFFRHHFRQMIFFSMIRQSDLACRETTRMNRSCFEILCDMLRTHGGLRGTDYIDVEEMVAMF
        MD  +  +++      Q Q LL+  L+ N   R  +     RH  RQ+ +F MI  SDL CR++TRM+R CF ILC +LRT  GL  T+ +DVEEMVAMF
Subjt:  MDPDKTIAVLTILYTWQNQFLLLANLVMNYNPRTKNYSSFFRHHFRQMIFFSMIRQSDLACRETTRMNRSCFEILCDMLRTHGGLRGTDYIDVEEMVAMF

Query:  LHIMAHDVKNHVVRRIFTRSGETVSRHFQSILTAVMRCHDILFKKPEPIQPSCTDSRWKWFENCLGGLDGTHIELQVPVENRASFRNRKGIITTNVLAVC
        LHI+AHDVKN V++R F RSGET+SRHF  +L AV+R H+ L KKP+P+   CTD RW+WFENCLG LDGT+I++ VP  +RA +R RKG + TNVL VC
Subjt:  LHIMAHDVKNHVVRRIFTRSGETVSRHFQSILTAVMRCHDILFKKPEPIQPSCTDSRWKWFENCLGGLDGTHIELQVPVENRASFRNRKGIITTNVLAVC

Query:  APSGEFIYVLAGWEGSAADSRVLRDALSRNNGFQVPHGYYYLCDAGYPNADGFLAPYRGERYHLSDWRG-SNPPRNPREFFNKAHSSARNIIERAFGALK
           G+F+YVLAGWEGSAADSR+LRDALSR N  +VP GYYYL DAGYPNA+GFLAPYRG+RYHL +WRG  N P   +EFFN  HSSARN+IERAFG LK
Subjt:  APSGEFIYVLAGWEGSAADSRVLRDALSRNNGFQVPHGYYYLCDAGYPNADGFLAPYRGERYHLSDWRG-SNPPRNPREFFNKAHSSARNIIERAFGALK

Query:  NRWAILRHKSYYPPKVQVKIITACCLLHNLICREMGSTIGLEILGENDATLYQEDMDDTPTINFVETSPLWTAFRDSMAQRMF
         RWAILR KSYYP +VQ + I ACCLLHNLI REM +    + + E D+T      DD   I+++ETS  W+ +RD++A+ MF
Subjt:  NRWAILRHKSYYPPKVQVKIITACCLLHNLICREMGSTIGLEILGENDATLYQEDMDDTPTINFVETSPLWTAFRDSMAQRMF

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q17QR8 Putative nuclease HARBI11.3e-1130Show/hide
Query:  LGGLDGTHIELQVPVENRASFRNRKGIITTNVLAVCAPSGEFIYVLAGWEGSAADSRVL-RDALSRNNGFQVPHGYYYLCDAGYPNADGFLAPYRGERYH
        +G +D  H+ ++ P     S+ NRKG+ + N L VC   G  + V   W GS  D  VL + +LS      +    + L D+ +     FL  +     H
Subjt:  LGGLDGTHIELQVPVENRASFRNRKGIITTNVLAVCAPSGEFIYVLAGWEGSAADSRVL-RDALSRNNGFQVPHGYYYLCDAGYPNADGFLAPYRGERYH

Query:  LSDWRGSNPPRNPREF-FNKAHSSARNIIERAFGALKNRWAIL---RHKSYYPPKVQVKIITACCLLHNL
        +        P  P E+ +N AHS+  ++IE+ F  L +R+  L   +    Y P+    II ACC+LHN+
Subjt:  LSDWRGSNPPRNPREF-FNKAHSSARNIIERAFGALKNRWAIL---RHKSYYPPKVQVKIITACCLLHNL

Q6AZB8 Putative nuclease HARBI13.1e-1028.32Show/hide
Query:  NCLGGLDGTHIELQVPVENRASFRNRKGIITTNVLAVCAPSGEFIYVLAGWEGSAADSRVLRDALSRNNGFQVPHGYYYLCDAGYPNADGFLAPYRGERY
        N  G +D  HI ++ P  + +S+ N+KG  + N   VC   G  +     W GS  D  V + +               L +    + +G+L      RY
Subjt:  NCLGGLDGTHIELQVPVENRASFRNRKGIITTNVLAVCAPSGEFIYVLAGWEGSAADSRVLRDALSRNNGFQVPHGYYYLCDAGYPNADGFLAPYRGERY

Query:  HLSDWRGS--NPPRNPREF-FNKAHSSARNIIERAFGALKNRWAIL-RHKSY--YPPKVQVKIITACCLLHNL
         L  W  +    P +P ++ +N AH++   I++R F A++ R+  L   K Y  Y P+    II ACC+LHN+
Subjt:  HLSDWRGS--NPPRNPREF-FNKAHSSARNIIERAFGALKNRWAIL-RHKSY--YPPKVQVKIITACCLLHNL

Q96MB7 Putative nuclease HARBI15.7e-1230Show/hide
Query:  LGGLDGTHIELQVPVENRASFRNRKGIITTNVLAVCAPSGEFIYVLAGWEGSAADSRVL-RDALSRNNGFQVPHGYYYLCDAGYPNADGFLAPYRGERYH
        +G +D  H+ ++ P     S+ NRKG+ + N L VC   G  + V   W GS  D  VL + +LS      +    + L D+ +     FL  +     H
Subjt:  LGGLDGTHIELQVPVENRASFRNRKGIITTNVLAVCAPSGEFIYVLAGWEGSAADSRVL-RDALSRNNGFQVPHGYYYLCDAGYPNADGFLAPYRGERYH

Query:  LSDWRGSNPPRNPREF-FNKAHSSARNIIERAFGALKNRWAIL---RHKSYYPPKVQVKIITACCLLHNL
        +        P  P E+ +N AHS+  ++IE+ F  L +R+  L   +    Y P+    II ACC+LHN+
Subjt:  LSDWRGSNPPRNPREF-FNKAHSSARNIIERAFGALKNRWAIL---RHKSYYPPKVQVKIITACCLLHNL

Q9M2U3 Protein ALP1-like1.5e-1725.23Show/hide
Query:  RMNRSCFEILCDMLRTHGGLRGTDYID-------VEEMVAMFLHIMAHDVKNHVVRRIFTRSGETVSRHFQSILTAV--MRCHDILFKKPEPIQPSCTDS
        +++R  F+ +C +++     +  ++ D       + + VA+ L  +       V+   F  +  TVS+     + ++     H + +       PS  D 
Subjt:  RMNRSCFEILCDMLRTHGGLRGTDYID-------VEEMVAMFLHIMAHDVKNHVVRRIFTRSGETVSRHFQSILTAV--MRCHDILFKKPEPIQPSCTDS

Query:  RWKWFE------NCLGGLDGTHIELQVPV---ENRASFRNRKGIITTNVLAVCAPSGEFIYVLAGWEGSAADSRVLRDA--------LSRNNGFQVPHG-
            FE      NC G +D THI + +P     N+      K    T + AV  P   F+ V+AGW GS  D  VL+++          R NG ++P   
Subjt:  RWKWFE------NCLGGLDGTHIELQVPV---ENRASFRNRKGIITTNVLAVCAPSGEFIYVLAGWEGSAADSRVLRDA--------LSRNNGFQVPHG-

Query:  -----YYYLCDAGYPNADGFLAPYRGERYHLSDWRGSNPPRNPREFFNKAHSSARNIIERAFGALKNRWAILRHKSYYPPKVQV-KIITACCLLHNLICR
              Y + D+G+P     L PY+G+           P   P+  FNK HS A    + A   LK+RW I+    + P + ++ +II  CCLLHN+I  
Subjt:  -----YYYLCDAGYPNADGFLAPYRGERYHLSDWRGSNPPRNPREFFNKAHSSARNIIERAFGALKNRWAILRHKSYYPPKVQV-KIITACCLLHNLICR

Query:  EMGSTIGLEILGENDATLYQE
            T+  + L +     Y++
Subjt:  EMGSTIGLEILGENDATLYQE

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G43722.1 unknown protein1.2e-4137.88Show/hide
Query:  IRQSDLACRETTRMNRSCFEILCDMLRTHGGLRGTDYIDVEEMVAMFLHIMAHDVKNHVVRRIFTRSGETVSRHFQSILTA--VMRCHDI-------LFK
        ++Q   AC +  RM+  CF  LC+ML+T+  L+ T  I +EE VAMFL I  H+     V   F R+ ETV R F+ +LTA  ++ C  I       L++
Subjt:  IRQSDLACRETTRMNRSCFEILCDMLRTHGGLRGTDYIDVEEMVAMFLHIMAHDVKNHVVRRIFTRSGETVSRHFQSILTA--VMRCHDI-------LFK

Query:  KPEPIQPSCTDSR-WKWFENCLGGLDGTHIELQVPVENRASFRNRKGIITTNVLAVCAPSGEFIYVLAGWEGSAADSRVLRDALSRNNGFQVPHG-YYYL
         PE +Q    D R W +F   +G +DGTH+ ++V  + +  + NR    + N++A+C     F Y+  G  GS  D+ VL+ A   ++ F +P    YYL
Subjt:  KPEPIQPSCTDSR-WKWFENCLGGLDGTHIELQVPVENRASFRNRKGIITTNVLAVCAPSGEFIYVLAGWEGSAADSRVLRDALSRNNGFQVPHG-YYYL

Query:  CDAGYPNADGFLAPYRGE-----RYHLSDWRGSNPPRNPREFFNKAHSSARNIIERAFGALKNR
         D+GYPN  G LAPYR       RYH+S +     PRN  E FN+ H+S R++IER F   KN+
Subjt:  CDAGYPNADGFLAPYRGE-----RYHLSDWRGSNPPRNPREFFNKAHSSARNIIERAFGALKNR

AT4G10890.1 unknown protein2.2e-1139.13Show/hide
Query:  DSRVLRDALSRNNGFQVPH---GYYYLCDAGYPNADGFLAPYRGERYHLSDWRGSNPPRNPREFFNKAHSSARNIIERAFGALKNRWAILRH
        D++VL+   +RN  F  PH     YYL ++ YP   G+L P+R   YHL  +    PP   +E FN+ H   R++I+R FG  K +W IL H
Subjt:  DSRVLRDALSRNNGFQVPH---GYYYLCDAGYPNADGFLAPYRGERYHLSDWRGSNPPRNPREFFNKAHSSARNIIERAFGALKNRWAILRH

AT5G28950.1 unknown protein3.2e-1842.61Show/hide
Query:  WKWFENCLGGLDGTHIELQVPVENRASFRNRKGIITTNVLAVCAPSGEFIYVLAGWEGSAADSRVLRDALSRN-NGFQVP---HGYYYLCDAGYPNADGF
        + +F++C+G +D THI   V  +   SFRNRKG I+ N+LA C    EF+YVL+GWEGSA DS+VL DAL+RN N   VP        + +    N D  
Subjt:  WKWFENCLGGLDGTHIELQVPVENRASFRNRKGIITTNVLAVCAPSGEFIYVLAGWEGSAADSRVLRDALSRN-NGFQVP---HGYYYLCDAGYPNADGF

Query:  LAPYRGERYHLSDWR
        L     +R + + WR
Subjt:  LAPYRGERYHLSDWR

AT5G35695.1 CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Putative harbinger transposase-derived nuclease (InterPro:IPR006912)5.4e-2646.21Show/hide
Query:  FIYVLAGWEGSAADSRVLRDALSRNNGFQVPHGYYYLCDAGYPNADGFLAPYRGERYHLSDWRGS-NPPRNPREFFNKAHSSARNIIERAFGALKNRWAI
        FIYVL+GWEGSA DSRVL DAL +          +YL D G+ N   FLAP+RG RYHL ++ G    P  P E FN  H S RN+IER FG  K+R+AI
Subjt:  FIYVLAGWEGSAADSRVLRDALSRNNGFQVPHGYYYLCDAGYPNADGFLAPYRGERYHLSDWRGS-NPPRNPREFFNKAHSSARNIIERAFGALKNRWAI

Query:  LRHKSYYPPKVQVKIITACCLLHNLICREMGS
         +    +  K Q  ++  C  LHN + +E  S
Subjt:  LRHKSYYPPKVQVKIITACCLLHNLICREMGS

AT5G41980.1 CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Putative harbinger transposase-derived nuclease (InterPro:IPR006912)2.9e-5639.73Show/hide
Query:  CRETTRMNRSCFEILCDMLRTHGGLRGTDYIDVEEMVAMFLHIMAHDVKNHVVRRIFTRSGETVSRHFQSILTAVMRCHDILFKKPEPIQPSCT-DSRWK
        C E  RM++  F  LCD+L+T G LR T+ I +E  +A+FL I+ H+++   V+ +F  SGET+SRHF ++L AV+      F   +P   S T ++   
Subjt:  CRETTRMNRSCFEILCDMLRTHGGLRGTDYIDVEEMVAMFLHIMAHDVKNHVVRRIFTRSGETVSRHFQSILTAVMRCHDILFKKPEPIQPSCT-DSRWK

Query:  WFENCLGGLDGTHIELQVPVENRASFRNRKGIITTNVLAVCAPSGEFIYVLAGWEGSAADSRVLRDALSRNNGFQVPHGYYYLCDAGYPNADGFLAPYRG
        +F++C+G +D  HI + V V+ +  FRN  G++T NVLA  +    F YVLAGWEGSA+D +VL  AL+R N  QVP G YY+ D  YPN  GF+APY G
Subjt:  WFENCLGGLDGTHIELQVPVENRASFRNRKGIITTNVLAVCAPSGEFIYVLAGWEGSAADSRVLRDALSRNNGFQVPHGYYYLCDAGYPNADGFLAPYRG

Query:  ERYHLSDWRGSNPPRNPREFFNKAHSSARNIIERAFGALKNRWAILRHKSYYPPKVQVKIITACCLLHNLICREMGSTIGLEILGENDATLYQEDMD
                  +N     +E FN+ H      I R FGALK R+ IL     YP + QVK++ A C LHN +  E    +   +  E       ED +
Subjt:  ERYHLSDWRGSNPPRNPREFFNKAHSSARNIIERAFGALKNRWAILRHKSYYPPKVQVKIITACCLLHNLICREMGSTIGLEILGENDATLYQEDMD


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGATCCCGATAAAACTATAGCAGTTTTAACAATACTCTACACATGGCAGAACCAGTTTCTTCTTCTTGCGAATCTTGTAATGAACTACAACCCTAGGACCAAAAACTA
TAGCTCTTTCTTTAGACACCATTTTCGCCAAATGATCTTTTTCTCGATGATAAGACAAAGCGATTTAGCTTGTCGTGAGACAACTAGAATGAATCGTAGCTGCTTTGAAA
TTTTGTGCGACATGCTAAGGACCCACGGTGGTCTTCGAGGTACGGATTACATCGACGTGGAGGAAATGGTAGCCATGTTTCTACATATCATGGCTCATGATGTTAAGAAC
CATGTCGTTCGAAGAATATTTACAAGATCCGGTGAAACAGTGTCGCGACACTTTCAATCTATCCTTACTGCTGTTATGCGTTGTCATGACATTTTGTTCAAGAAACCCGA
ACCTATCCAACCATCATGCACCGATAGTAGATGGAAGTGGTTTGAGAATTGTCTAGGTGGATTGGATGGTACTCATATAGAGTTACAAGTCCCAGTTGAAAATCGTGCCT
CCTTTAGAAATAGGAAGGGTATCATCACAACGAACGTTCTTGCGGTATGCGCTCCAAGCGGAGAGTTCATATACGTACTAGCTGGGTGGGAGGGATCAGCAGCTGACTCT
AGAGTTCTTAGGGATGCTTTATCTCGTAACAATGGATTTCAAGTCCCTCATGGATACTATTACCTTTGTGATGCGGGTTATCCAAATGCTGATGGATTCCTAGCTCCCTA
TAGAGGCGAACGTTATCATCTATCGGATTGGAGGGGTAGCAATCCACCACGGAATCCAAGAGAGTTTTTTAATAAGGCACACTCCTCGGCACGAAATATAATAGAAAGAG
CGTTCGGTGCATTAAAAAATCGTTGGGCTATTCTGCGACACAAGTCTTACTATCCTCCAAAAGTGCAAGTGAAGATCATAACAGCTTGTTGTCTCCTACATAATTTAATA
TGTAGGGAGATGGGCTCTACGATTGGTTTAGAGATATTAGGGGAGAACGATGCTACACTATACCAAGAGGATATGGACGATACCCCAACGATTAATTTCGTCGAAACATC
GCCTCTTTGGACTGCATTTCGAGATTCCATGGCCCAAAGAATGTTTGACATAGGCCAAAACTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGATCCCGATAAAACTATAGCAGTTTTAACAATACTCTACACATGGCAGAACCAGTTTCTTCTTCTTGCGAATCTTGTAATGAACTACAACCCTAGGACCAAAAACTA
TAGCTCTTTCTTTAGACACCATTTTCGCCAAATGATCTTTTTCTCGATGATAAGACAAAGCGATTTAGCTTGTCGTGAGACAACTAGAATGAATCGTAGCTGCTTTGAAA
TTTTGTGCGACATGCTAAGGACCCACGGTGGTCTTCGAGGTACGGATTACATCGACGTGGAGGAAATGGTAGCCATGTTTCTACATATCATGGCTCATGATGTTAAGAAC
CATGTCGTTCGAAGAATATTTACAAGATCCGGTGAAACAGTGTCGCGACACTTTCAATCTATCCTTACTGCTGTTATGCGTTGTCATGACATTTTGTTCAAGAAACCCGA
ACCTATCCAACCATCATGCACCGATAGTAGATGGAAGTGGTTTGAGAATTGTCTAGGTGGATTGGATGGTACTCATATAGAGTTACAAGTCCCAGTTGAAAATCGTGCCT
CCTTTAGAAATAGGAAGGGTATCATCACAACGAACGTTCTTGCGGTATGCGCTCCAAGCGGAGAGTTCATATACGTACTAGCTGGGTGGGAGGGATCAGCAGCTGACTCT
AGAGTTCTTAGGGATGCTTTATCTCGTAACAATGGATTTCAAGTCCCTCATGGATACTATTACCTTTGTGATGCGGGTTATCCAAATGCTGATGGATTCCTAGCTCCCTA
TAGAGGCGAACGTTATCATCTATCGGATTGGAGGGGTAGCAATCCACCACGGAATCCAAGAGAGTTTTTTAATAAGGCACACTCCTCGGCACGAAATATAATAGAAAGAG
CGTTCGGTGCATTAAAAAATCGTTGGGCTATTCTGCGACACAAGTCTTACTATCCTCCAAAAGTGCAAGTGAAGATCATAACAGCTTGTTGTCTCCTACATAATTTAATA
TGTAGGGAGATGGGCTCTACGATTGGTTTAGAGATATTAGGGGAGAACGATGCTACACTATACCAAGAGGATATGGACGATACCCCAACGATTAATTTCGTCGAAACATC
GCCTCTTTGGACTGCATTTCGAGATTCCATGGCCCAAAGAATGTTTGACATAGGCCAAAACTAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MDPDKTIAVLTILYTWQNQFLLLANLVMNYNPRTKNYSSFFRHHFRQMIFFSMIRQSDLACRETTRMNRSCFEILCDMLRTHGGLRGTDYIDVEEMVAMFLHIMAHDVKN
HVVRRIFTRSGETVSRHFQSILTAVMRCHDILFKKPEPIQPSCTDSRWKWFENCLGGLDGTHIELQVPVENRASFRNRKGIITTNVLAVCAPSGEFIYVLAGWEGSAADS
RVLRDALSRNNGFQVPHGYYYLCDAGYPNADGFLAPYRGERYHLSDWRGSNPPRNPREFFNKAHSSARNIIERAFGALKNRWAILRHKSYYPPKVQVKIITACCLLHNLI
CREMGSTIGLEILGENDATLYQEDMDDTPTINFVETSPLWTAFRDSMAQRMFDIGQN