CuGenDBv2

Gene ID	Sed0020868
Organism	Sechium edule (Chayote v1)
Description	S5A_REDUCTASE domain-containing protein
Genome location	LG01:12854260..12868640
RNA-Seq Expression	Sed0020868
Synteny	Sed0020868
Gene Ontology terms	GO:0006629 - lipid metabolic process (biological process) GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component) GO:0016627 - oxidoreductase activity, acting on the CH-CH group of donors (molecular function)
InterPro domains	IPR001104 - 3-oxo-5-alpha-steroid 4-dehydrogenase, C-terminal IPR010721 - Protein of unknown function DUF1295

Homology

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GenBank top hits

e value

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Alignment

KAG7012146.1 hypothetical protein SDJN02_24898 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]

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A0A6J1K216 uncharacterized protein LOC111490337 isoform X1

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No hits found

Arabidopsis top hits

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AT1G18180.1 Protein of unknown function (DUF1295)

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Sequences

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CDS sequence

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TCCTCACATTGTTGCTTCTTTTCGTGAGTGGGATCCCACTACTTGAGGAATCAGCAGATAAGAAGTTTGGGAATGTGACTGAATACGTACAGTATAAAAGAACGACTAGC
CCCCTGATCCCACTGCCTACTGCAATATATGGAAACCTGCCCTCATGGTGCAAGAAGTTTTTTCTATTTGAATTTCCTTTTTACAGCCGCAATCTTTCCCGGGTGAGCTA
G

mRNA sequence

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TCACCGATCTTGTAATTTTCAGATTGGGTATCAACTATTGTTCTTTGTAATCACAGCTCTTCTCAAGTTCGACAAACTCACTGATTTCGCTGGTAGCACTAATTTTGTGA
TACTTGCTGTTTTGACTCTAGTTCTTAAAGGAAACTGGCATTTTAGACAGGTAGTTCTGTCTTTTCTTGTGGTGACATGGGGTCTTCGCCTTGGTTTTTTCTTGCTATTG
AGGATTTTGCAATGGGGAGAGGACCGGCGTTTTGATAAAATCCGTAGTAATTTGGGAAAATTAGCAGTTTTCTGGATATTTCAGGCTGTTTGGGTTTGGACCGTGAGTTT
ACCTGTCACAGTGGTCAATGCAAGTAACCACAATCCATCTCTGCGAGCTGCGGATGTATGTGGGTGGATTATGTGGTTAGTGGGTGTTGTAATCGAAGCTATAGCTGATC
AACAAAAGTTGGCATTTAAGAACTCTCCAGAAAATAGGGGGAAGTGGTGCAAAGTTGGACTTTGGAAGGTCACTCGTCATCCTAATTACTTTGGTGAGATCTTTCTTTGG
TGGGGAATCTTCGTTGCTTCCACGTCCGTTCTGAACGGTGCTGAGTGGCTTGTGATACTTGGACCAATATTCCTCACATTGTTGCTTCTTTTCGTGAGTGGGATCCCACT
ACTTGAGGAATCAGCAGATAAGAAGTTTGGGAATGTGACTGAATACGTACAGTATAAAAGAACGACTAGCCCCCTGATCCCACTGCCTACTGCAATATATGGAAACCTGC
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CACAAAGAATGACTTATGAC

Protein sequence

Show/hide protein sequence

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PLIPLPTAIYGNLPSWCKKFFLFEFPFYSRNLSRVS

Sed0020868 (gene) of Chayote v1 genome