; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Sed0020902 (gene) of Chayote v1 genome

Gene IDSed0020902
OrganismSechium edule (Chayote v1)
DescriptionGlucan endo-1,3-beta-D-glucosidase
Genome locationLG04:2860814..2867670
RNA-Seq ExpressionSed0020902
SyntenySed0020902
Gene Ontology termsGO:0005975 - carbohydrate metabolic process (biological process)
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GO:0008422 - beta-glucosidase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR012946 - X8 domain
IPR044788 - Carbohydrate-binding X8 domain-containing protein, plant


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7024045.1 PLASMODESMATA CALLOSE-BINDING PROTEIN 3 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.6e-14680.8Show/hide
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KGN66453.2 hypothetical protein Csa_007420 [Cucumis sativus]2.2e-13580.86Show/hide
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XP_022968747.1 mucin-2 [Cucurbita maxima]5.5e-13981.61Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0M1B6 Hydrolase, hydrolyzing O-glycosyl compounds1.0e-13580.86Show/hide
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A0A1S3BQE9 glucan endo-1,3-beta-glucosidase 41.2e-13480.58Show/hide
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A0A5A7U6N8 Glucan endo-1,3-beta-glucosidase 41.2e-13480.58Show/hide
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A0A6J1HC94 mucin-27.0e-14082.47Show/hide
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A0A6J1HUD2 mucin-22.7e-13981.61Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O65399 Glucan endo-1,3-beta-glucosidase 17.7e-1949.5Show/hide
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        +
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Q93V72 PLASMODESMATA CALLOSE-BINDING PROTEIN 48.3e-2143.24Show/hide
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         + TP+    TPT+  P T  PTT T PTT +P      +G P  G+P T  NTG P+S+ G  T   S + P ++   + + GL
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Q9FNQ2 PLASMODESMATA CALLOSE-BINDING PROTEIN 11.9e-1742.94Show/hide
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Query:  MTPSVPMVTPTTTAPITVPPTTVTNPTTSSPFGTGMPENGSPPTVFNTGNPDSSIGSTTGFGSEIPPSSSTTISMAA
               VTP TT P    PTT T P +    GT  P +G+P      GN   S G TTG G  I P  +T  S  A
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Q9FZ86 PLASMODESMATA CALLOSE-BINDING PROTEIN 31.7e-1847.2Show/hide
Query:  SGQSWCVARSGASEMALQSALDYACGSGLADCSQIQQGGSCYNPNTLENHSSFAFNSYFQ-KNPSPTSCDFGGSAMVTNSNPSTGSCIYSLSSSSS---S
        S  +WCV + G SE  LQ  LDYACG+G ADC  I Q G C+NPNT+++H S+A NS+FQ K  S  +CDF G+A  + S+PS  +C +  S+S S   +
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        P + TPS  + T T T P T+ P+T
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Q9M069 Glucan endo-1,3-beta-glucosidase 75.0e-1846Show/hide
Query:  SPPASTNAPTVSGQSWCVARSGASEMALQSALDYACGSGLADCSQIQQGGSCYNPNTLENHSSFAFNSYFQKNP-SPTSCDFGGSAMVTNSNPSTGSCIY
        S  + T +  V+   WCV + GA+   LQ++LD+ACG G+ DC  IQ GG+C+ PN + +H+++A N YFQK+P  PT CDF  +A VT+ NPS  +C+Y
Subjt:  SPPASTNAPTVSGQSWCVARSGASEMALQSALDYACGSGLADCSQIQQGGSCYNPNTLENHSSFAFNSYFQKNP-SPTSCDFGGSAMVTNSNPSTGSCIY

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G09460.1 Carbohydrate-binding X8 domain superfamily protein4.6e-5148.83Show/hide
Query:  TTMRDMANSPTTIFPTTPDTSSPTIITVPATNPITVTPSSPAATPVSIPLTTPITVPANSPVPLTNPVAPPVTVPGAQPITNPVTTYP--APSGGSPVVT
        TT  D+ N P T+FPT P T++PT  T P   P+T+TP++PA T   +P  T I  P  +P P+     P +T P   P+TNPVT YP   PSG  PV  
Subjt:  TTMRDMANSPTTIFPTTPDTSSPTIITVPATNPITVTPSSPAATPVSIPLTTPITVPANSPVPLTNPVAPPVTVPGAQPITNPVTTYP--APSGGSPVVT

Query:  PVTNPVPVSPPASTNAPTVSGQSWCVARSGASEMALQSALDYACGSGLADCSQIQQGGSCYNPNTLENHSSFAFNSYFQKNPSPTSCDFGGSAMVTNSNP
        PV     V+PP  +N+P+VSGQSWCVA+ GAS+++LQ ALDYAC  G+ADCSQ+QQGG+CY+P +L++H+SFAFNSY+QKNPSP SCDFGG+A + N+NP
Subjt:  PVTNPVPVSPPASTNAPTVSGQSWCVARSGASEMALQSALDYACGSGLADCSQIQQGGSCYNPNTLENHSSFAFNSYFQKNPSPTSCDFGGSAMVTNSNP

Query:  STGSCIYSLSSSSSSPASMTPSVPMVTPTTTAPITVPPTTVTNPTTSSPFGTGMPENGSPPTVFNTGNP-------DSSIGSTTGFGSEIPPSSSTTIS
        STGSCIY   SS+S+P  MT      TP+T   +  PP T    T   P G G+   G+PP +FN  NP        SS G   G+G +  P+ +   S
Subjt:  STGSCIYSLSSSSSSPASMTPSVPMVTPTTTAPITVPPTTVTNPTTSSPFGTGMPENGSPPTVFNTGNP-------DSSIGSTTGFGSEIPPSSSTTIS

AT1G29380.1 Carbohydrate-binding X8 domain superfamily protein2.9e-2136Show/hide
Query:  IPLTTPITVPANSPVP-LTNPVAPPVTVPGAQPITNPVTTYP-----APSGGSPVVTPVTNP-----------------------------------VPV
        IP+  P     ++  P +T P  P +T PG    T P   YP      P+GG P +   T P                                      
Subjt:  IPLTTPITVPANSPVP-LTNPVAPPVTVPGAQPITNPVTTYP-----APSGGSPVVTPVTNP-----------------------------------VPV

Query:  SPPASTNAPTVSGQSWCVARSGASEMALQSALDYACGSGLADCSQIQQGGSCYNPNTLENHSSFAFNSYFQKNPSPTSCDFGGSAMVTNSNPSTGSCIYS
                   SGQ WC+A++ AS  +LQ ALDYACG G ADC QIQQG +CY PNT+ +H+SFAFNSY+QK+P   SC+FGG+A +T+++PS GSC +S
Subjt:  SPPASTNAPTVSGQSWCVARSGASEMALQSALDYACGSGLADCSQIQQGGSCYNPNTLENHSSFAFNSYFQKNPSPTSCDFGGSAMVTNSNPSTGSCIYS

Query:  LSS---SSSSPASMTPSVPMVTPTTT--APITVPPTTVTNPTTSSPFGTGMPENGSPPTVFNTGNPDSSIGSTTG
         SS   S+S P+ M+P      P++T   PIT P T +T   +  PFG   P  G P +  +  +   SI +  G
Subjt:  LSS---SSSSPASMTPSVPMVTPTTT--APITVPPTTVTNPTTSSPFGTGMPENGSPPTVFNTGNPDSSIGSTTG

AT1G69295.1 plasmodesmata callose-binding protein 45.9e-2243.24Show/hide
Query:  TVSGQSWCVARSGASEMALQSALDYACGSGLADCSQIQQGGSCYNPNTLENHSSFAFNSYFQKNPSP-TSCDFGGSAMVTNSNPSTGSCIYSLSSSSSSP
        T S  ++C+ + G +E  LQ A+DYACG+G ADC+QIQ  G+CY PNT++NH   A NSY+QK  S   +CDF G+A  + + PST S   + SSSS +P
Subjt:  TVSGQSWCVARSGASEMALQSALDYACGSGLADCSQIQQGGSCYNPNTLENHSSFAFNSYFQKNPSP-TSCDFGGSAMVTNSNPSTGSCIYSLSSSSSSP

Query:  ASMTPSVPMVTPTTTAPITVPPTTVTNPTTSSPFG----TGMPENGSPPTVFNTGNPDSSIGSTTGFGSEIPPSSSTTISMAAGL
         + TP+    TPT+  P T  PTT T PTT +P      +G P  G+P T  NTG P+S+ G  T   S + P ++   + + GL
Subjt:  ASMTPSVPMVTPTTTAPITVPPTTVTNPTTSSPFG----TGMPENGSPPTVFNTGNPDSSIGSTTGFGSEIPPSSSTTISMAAGL

AT2G30933.1 Carbohydrate-binding X8 domain superfamily protein4.2e-2847.06Show/hide
Query:  TTPITVPANSPVPLTNPVAPPVTVPGAQPITNPVTTYP-APSGGSPVVTPVTNPVPVSPPASTNAPTVSG-QSWCVARSGASEMALQSALDYACGSGLAD
        T  IT P      +T P+A         P T P T  P + S  S V T      P++ P+S +     G QSWCVAR   ++MALQ+ALDYACG G AD
Subjt:  TTPITVPANSPVPLTNPVAPPVTVPGAQPITNPVTTYP-APSGGSPVVTPVTNPVPVSPPASTNAPTVSG-QSWCVARSGASEMALQSALDYACGSGLAD

Query:  CSQIQQGGSCYNPNTLENHSSFAFNSYFQKNPSPTSCDFGGSAMVTNSNPSTGSCIYSLSSSSSSPASMT
        CS+IQ+GG+CYNPN+L  H+SFAFNSY+QKNP P+SC+F G+A+  +++PS GSC +  +S+S S  ++T
Subjt:  CSQIQQGGSCYNPNTLENHSSFAFNSYFQKNPSPTSCDFGGSAMVTNSNPSTGSCIYSLSSSSSSPASMT

AT2G30933.2 Carbohydrate-binding X8 domain superfamily protein5.1e-2648.34Show/hide
Query:  TTPITVPANSPVPLTNPVAPPVTVPGAQPITNPVTTYP-APSGGSPVVTPVTNPVPVSPPASTNAPTVSG-QSWCVARSGASEMALQSALDYACGSGLAD
        T  IT P      +T P+A         P T P T  P + S  S V T      P++ P+S +     G QSWCVAR   ++MALQ+ALDYACG G AD
Subjt:  TTPITVPANSPVPLTNPVAPPVTVPGAQPITNPVTTYP-APSGGSPVVTPVTNPVPVSPPASTNAPTVSG-QSWCVARSGASEMALQSALDYACGSGLAD

Query:  CSQIQQGGSCYNPNTLENHSSFAFNSYFQKNPSPTSCDFGGSAMVTNSNPS
        CS+IQ+GG+CYNPN+L  H+SFAFNSY+QKNP P+SC+F G+A+  +++PS
Subjt:  CSQIQQGGSCYNPNTLENHSSFAFNSYFQKNPSPTSCDFGGSAMVTNSNPS


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTGGTTTCCATTTGTTTCCAAAAAAACATTTGGAGGGTTTTGTTGCTTAGCGTTGGGTGAACCTTTTTCTCTGTTTCTGAATGTTTTTGCTTCTGCTATTATTGCAGG
TAGTAGATTTGGCGAGTCGCATTCGAAAGTGGAGTATCGGACAACAATGCGCGACATGGCCAACTCGCCGACAACAATTTTCCCGACAACCCCAGATACCTCATCGCCGA
CAATCATCACCGTTCCGGCTACCAACCCCATCACAGTCACTCCGTCCAGCCCGGCTGCCACTCCGGTGTCCATTCCTTTAACGACACCCATCACAGTCCCGGCTAACTCT
CCAGTGCCGCTCACCAATCCGGTTGCCCCGCCGGTAACTGTCCCCGGAGCACAGCCGATAACAAACCCGGTGACCACTTATCCAGCTCCCTCAGGGGGTTCTCCGGTGGT
AACACCGGTCACAAACCCGGTTCCGGTTTCTCCACCGGCGTCGACGAATGCACCCACAGTTTCAGGACAGAGCTGGTGCGTTGCAAGGTCTGGCGCATCAGAGATGGCTC
TTCAGTCGGCGTTGGACTACGCTTGTGGCTCTGGATTAGCCGACTGTTCTCAAATTCAGCAAGGTGGAAGCTGTTACAACCCGAATACACTTGAAAACCACTCCTCTTTT
GCGTTCAATAGCTATTTTCAGAAGAACCCTTCTCCTACAAGCTGCGACTTTGGAGGATCTGCCATGGTTACCAACTCCAATCCAAGCACTGGCTCCTGCATTTATTCATT
ATCATCATCCTCTTCGTCGCCGGCATCCATGACCCCGTCGGTTCCAATGGTGACACCGACGACAACAGCTCCGATCACCGTCCCACCAACTACAGTTACAAACCCAACAA
CGTCCTCACCTTTCGGGACCGGCATGCCAGAAAATGGATCTCCTCCCACAGTCTTTAACACAGGCAATCCAGATTCGAGTATAGGCAGCACGACAGGCTTTGGAAGCGAG
ATCCCTCCAAGCTCAAGCACCACGATATCCATGGCGGCTGGATTAAGACCCTTTACTTATTGCATCGCTCTGACTATGTTCTTGATCACTCGAAGAATCACTCTGGACTG
GTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ACATTTTTTTCGACTAATACAGTTTCTGTTAAAGCAAAAATTTGAAGGATTTTGTCCGGAAGGAGTGACAAAGTAGTTGAAGAACTTGGACTTTGACTAGGTTTCAAGTT
CGAGACCCATATATGACATTACTCTTTCGATGTCTCCCAGTACCCGAGATAGGGACGAATGTGGTTTCCATTTGTTTCCAAAAAAACATTTGGAGGGTTTTGTTGCTTAG
CGTTGGGTGAACCTTTTTCTCTGTTTCTGAATGTTTTTGCTTCTGCTATTATTGCAGGTAGTAGATTTGGCGAGTCGCATTCGAAAGTGGAGTATCGGACAACAATGCGC
GACATGGCCAACTCGCCGACAACAATTTTCCCGACAACCCCAGATACCTCATCGCCGACAATCATCACCGTTCCGGCTACCAACCCCATCACAGTCACTCCGTCCAGCCC
GGCTGCCACTCCGGTGTCCATTCCTTTAACGACACCCATCACAGTCCCGGCTAACTCTCCAGTGCCGCTCACCAATCCGGTTGCCCCGCCGGTAACTGTCCCCGGAGCAC
AGCCGATAACAAACCCGGTGACCACTTATCCAGCTCCCTCAGGGGGTTCTCCGGTGGTAACACCGGTCACAAACCCGGTTCCGGTTTCTCCACCGGCGTCGACGAATGCA
CCCACAGTTTCAGGACAGAGCTGGTGCGTTGCAAGGTCTGGCGCATCAGAGATGGCTCTTCAGTCGGCGTTGGACTACGCTTGTGGCTCTGGATTAGCCGACTGTTCTCA
AATTCAGCAAGGTGGAAGCTGTTACAACCCGAATACACTTGAAAACCACTCCTCTTTTGCGTTCAATAGCTATTTTCAGAAGAACCCTTCTCCTACAAGCTGCGACTTTG
GAGGATCTGCCATGGTTACCAACTCCAATCCAAGCACTGGCTCCTGCATTTATTCATTATCATCATCCTCTTCGTCGCCGGCATCCATGACCCCGTCGGTTCCAATGGTG
ACACCGACGACAACAGCTCCGATCACCGTCCCACCAACTACAGTTACAAACCCAACAACGTCCTCACCTTTCGGGACCGGCATGCCAGAAAATGGATCTCCTCCCACAGT
CTTTAACACAGGCAATCCAGATTCGAGTATAGGCAGCACGACAGGCTTTGGAAGCGAGATCCCTCCAAGCTCAAGCACCACGATATCCATGGCGGCTGGATTAAGACCCT
TTACTTATTGCATCGCTCTGACTATGTTCTTGATCACTCGAAGAATCACTCTGGACTGGTGAACTCATAGATTTCTTCTCCTTGAACTGTTCATGAAAGGCCTCGCATTT
CATCGATTCAGAAAGCGCCACCCAGTTCTCTTACACACCATGAGTGCAATTTTTGGAGGAGAAAATGAACCAGAGGTGAGTTTGAAAATGAACCTGCTTGAGCTTTTGTT
TCTGTAAAGATCAAAGATATGTTAGTGATAGCTACTTGGAACACTTTGAGACTGTAATATATGTATGTTAGGTTTTGGGAGTATTGTTAGGATTTGTATTGATGTTTATT
TACTTTAATGGCGATCACAGTGCATTAGAATTATTTTATTATTATTATTATTTATAATTGTGAGCGTTCGAGTTTGCAACTATTATTACGAGACATCTTACTCTATTATA
TTTGATTGTCAAAGAAATTC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MWFPFVSKKTFGGFCCLALGEPFSLFLNVFASAIIAGSRFGESHSKVEYRTTMRDMANSPTTIFPTTPDTSSPTIITVPATNPITVTPSSPAATPVSIPLTTPITVPANS
PVPLTNPVAPPVTVPGAQPITNPVTTYPAPSGGSPVVTPVTNPVPVSPPASTNAPTVSGQSWCVARSGASEMALQSALDYACGSGLADCSQIQQGGSCYNPNTLENHSSF
AFNSYFQKNPSPTSCDFGGSAMVTNSNPSTGSCIYSLSSSSSSPASMTPSVPMVTPTTTAPITVPPTTVTNPTTSSPFGTGMPENGSPPTVFNTGNPDSSIGSTTGFGSE
IPPSSSTTISMAAGLRPFTYCIALTMFLITRRITLDW