CuGenDBv2

Gene ID	Sed0021084
Organism	Sechium edule (Chayote v1)
Description	AB hydrolase-1 domain-containing protein
Genome location	LG08:38799156..38803640
RNA-Seq Expression	Sed0021084
Synteny	Sed0021084
Gene Ontology terms	GO:0016787 - hydrolase activity (molecular function)
InterPro domains	IPR000073 - Alpha/beta hydrolase fold-1 IPR029058 - Alpha/Beta hydrolase fold

Homology

Show/hide homology

GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

KAG6583891.1 hypothetical protein SDJN03_19823, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]

5.4e-167

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XP_022139824.1 uncharacterized protein LOC111010645 isoform X2 [Momordica charantia]

1.1e-167

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XP_022927236.1 uncharacterized protein LOC111434144 isoform X1 [Cucurbita moschata]

4.9e-168

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XP_023001441.1 uncharacterized protein LOC111495573 isoform X1 [Cucurbita maxima]

4.9e-168

86.63

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XP_038896062.1 phospholipase YtpA [Benincasa hispida]

1.4e-167

86.05

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        MA L SIH IS F+PKI T KPI RANAEL   QKM   FKL++EQ+RIFHELP+GLQMEVI+QKGS KSA+S+  NV+RPPLIF+HGSYHAAW WAEHW
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TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A6J1CE22 uncharacterized protein LOC111010645 isoform X2

5.3e-168

86.63

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A0A6J1EGL6 uncharacterized protein LOC111434144 isoform X2

3.4e-167

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A0A6J1EH45 uncharacterized protein LOC111434144 isoform X1

2.4e-168

86.34

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A0A6J1KGJ4 uncharacterized protein LOC111495573 isoform X2

4.5e-167

86.63

Show/hide

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A0A6J1KIM1 uncharacterized protein LOC111495573 isoform X1

2.4e-168

86.63

Show/hide

Query:  MAALASIHPISLFRPKIGTRKPIFRANAELCGTQKMGASFKLRDEQSRIFHELPTGLQMEVILQKGSAKSAESVAGNVKRPPLIFVHGSYHAAWCWAEHW
        MA LASIHPISL RPKI T KP FR NA+L    KM   FKL+DEQ+RIFHELP+GLQMEVI+QKGSAKSAES A NV+RPPL+FVHGSYHAAW WAEHW
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Query:  LPFFSASGFDCYAISFLGQGESDAPSASVAGTLQTHASDIADFIHRSFSTPPVLLGHSFGGLIVQYYIANCQNEYLSGADKLFPRLTGAVLVCSVPPSGN
        LPFFSASGFDCYAIS LGQGESDAPSASVAGTLQTHASDIADFIH SFS PPVLLGHSFGGLIVQYYIAN + +  S  ++LFPRLTGAVLVCSVPPSGN
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        SGLV RYLFTKPIAAFKVTLSLA KAFQTSLPLCKETFFSATMED LV RYQELMKESSRMPLFDLRKLNASLPVPSLP+SC+EVLVLGASDDFIVD+EG
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        LNETGRFYSVTPICIQGVAHDMMLDCSW KGA+AILTWLN LGS
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SwissProt top hits

e value

%identity

Alignment

Q6IE26 Epoxide hydrolase 4

8.0e-04

32.35

Show/hide

Query:  AGNVKRPPLIFVHGSYHAAWCWAEHWLPFFSASGFDCYAISFLGQGESDAPSASVAGTLQTHASDIADFIHRSFSTPPVLLGHSFGGLIVQYYIANCQNE
        AG   +P ++ +HG     + W  H L  F  S +   A+   G GESDAP+   +  L    +DI D +     +  VL+GH +GG+I  + IA C  E
Subjt:  AGNVKRPPLIFVHGSYHAAWCWAEHWLPFFSASGFDCYAISFLGQGESDAPSASVAGTLQTHASDIADFIHRSFSTPPVLLGHSFGGLIVQYYIANCQNE

Query:  YL
         +
Subjt:  YL

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT5G38360.1 alpha/beta-Hydrolases superfamily protein

1.8e-80

65.18

Show/hide

Query:  AELCGTQKMGASFKLRDEQSRIFHELPTGLQMEVILQKGSAKSAESVAGNVKRPPLIFVHGSYHAAWCWAEHWLPFFSASGFDCYAISFLGQGESDAPSA
        A L  + +    + L+  Q+R+ H+LP+GL+MEVI Q+ S    E+       PPL+FVHGSYHAAWCWAE+WLPFFS+SGFD YA+S LGQGESD P  
Subjt:  AELCGTQKMGASFKLRDEQSRIFHELPTGLQMEVILQKGSAKSAESVAGNVKRPPLIFVHGSYHAAWCWAEHWLPFFSASGFDCYAISFLGQGESDAPSA

Query:  SVAGTLQTHASDIADFIHRSF-STPPVLLGHSFGGLIVQYYIANCQNEYLSGADKLFPRLTGAVLVCSVPPSGNSGLVLRYLFTKPIAAFKVTLSLAAKA
        +VAGTLQTHASDIADFI  +  S+PPVL+GHSFGGLIVQYY+AN  N+   G +  FP L+GAV+VCSVPPSGNSGLVLRYLF+KP+AAFKVTLSLAAK 
Subjt:  SVAGTLQTHASDIADFIHRSF-STPPVLLGHSFGGLIVQYYIANCQNEYLSGADKLFPRLTGAVLVCSVPPSGNSGLVLRYLFTKPIAAFKVTLSLAAKA

Query:  FQTSLPLCKETFFSATMEDHLVLR
        FQ S+PLC+ETFFS  M+D LV R
Subjt:  FQTSLPLCKETFFSATMEDHLVLR

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGTATACTATTATTTTAAATATACGAGAGTCAAATATCAATTTCCGGGTAGAGCAAACATCAATGAATGTATTCACGAAGCCACCTTATTTCCGTAAAATAAAAGAAAG
AAAGAAAAAATTATCTTTCCTAAATACGGAAAATGAAATAGGAATTGCAACCAAAGTGGAAAGTGCAATTGAAGTGAAAGTGAAGAAACAAATTCTGGCATTCATGGCTG
CTCTTGCCTCCATCCATCCCATCTCCTTGTTTCGACCCAAAATTGGGACTCGAAAACCCATTTTTAGGGCAAATGCGGAGCTTTGTGGAACCCAGAAAATGGGGGCGTCA
TTCAAGCTAAGGGATGAGCAGAGCCGTATTTTCCACGAGCTCCCAACTGGCCTTCAAATGGAGGTCATTCTGCAAAAGGGTTCGGCGAAATCGGCCGAATCAGTGGCTGG
AAATGTGAAACGCCCTCCTCTGATCTTTGTCCATGGAAGCTACCACGCTGCTTGGTGTTGGGCTGAGCATTGGCTTCCATTCTTTTCGGCTTCTGGCTTCGATTGCTATG
CCATCAGCTTCTTGGGTCAGGGTGAAAGTGATGCACCATCTGCATCTGTTGCTGGTACTCTCCAGACACACGCGAGTGATATTGCTGATTTCATTCATAGAAGTTTTAGT
ACACCGCCCGTGTTGCTTGGGCACTCATTTGGAGGGCTCATTGTGCAGTATTACATAGCAAACTGCCAAAATGAGTATCTTTCAGGTGCAGATAAATTGTTTCCAAGGCT
TACTGGAGCTGTTCTTGTGTGTTCTGTACCTCCCTCCGGCAACAGTGGGCTCGTATTGCGCTATCTCTTTACCAAACCCATTGCTGCTTTTAAGGTGACACTCAGTTTGG
CTGCAAAGGCCTTTCAAACATCTCTTCCTCTTTGCAAGGAGACATTTTTCTCTGCAACAATGGAGGATCATCTCGTTTTGCGATATCAAGAGCTAATGAAAGAAAGCTCA
AGGATGCCATTATTTGATCTGAGGAAGTTGAATGCATCTCTTCCAGTTCCTTCTCTGCCCGAGTCTTGCATTGAAGTACTAGTGCTGGGTGCAAGTGATGATTTCATTGT
GGATTCTGAAGGATTGAATGAAACAGGCAGGTTTTACAGTGTGACACCAATCTGTATACAAGGGGTTGCTCATGACATGATGTTGGATTGTTCCTGGCACAAAGGTGCAG
AAGCTATTCTAACATGGCTCAATTATTTGGGATCATAA

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AGTTTTGAGTCACCCTACGCAGCTCAAGTATTTTCATGAGACATGTCATTCAAA

Protein sequence

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RMPLFDLRKLNASLPVPSLPESCIEVLVLGASDDFIVDSEGLNETGRFYSVTPICIQGVAHDMMLDCSWHKGAEAILTWLNYLGS

Sed0021084 (gene) of Chayote v1 genome