; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Sed0021200 (gene) of Chayote v1 genome

Gene IDSed0021200
OrganismSechium edule (Chayote v1)
DescriptionGermin-like protein
Genome locationLG06:39184826..39186356
RNA-Seq ExpressionSed0021200
SyntenySed0021200
Gene Ontology termsGO:0048046 - apoplast (cellular component)
GO:0030145 - manganese ion binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001929 - Germin
IPR006045 - Cupin 1
IPR011051 - RmlC-like cupin domain superfamily
IPR014710 - RmlC-like jelly roll fold
IPR019780 - Germin, manganese binding site


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6594416.1 Germin-like protein subfamily 1 member 7, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]8.0e-8575.69Show/hide
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XP_004134896.1 germin-like protein 8-2 [Cucumis sativus]4.7e-8575.45Show/hide
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        M +KNFV   + FA AC SI +ASDPSPLQDFCVAD+ NPV+VNGFVCK+P DV A DFF  GL   G+T N VGS VTA+NV N+ GLNTLGIS+VR+D
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        +   GIN PHTHPRATEIL V EGTLLVGFVSSNQD NRLFSKVLNKGDVFVFPEGL+HFQQNVG  NAVAIAGLSSQNPGVVTIAN+VFGS PDIPT I
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XP_008439536.1 PREDICTED: germin-like protein 8-2 [Cucumis melo]1.0e-8476.26Show/hide
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        M +KNFV   S FA AC SI +ASDPSPLQDFCVAD+ NPV+VNGFVCK+P +V A DFF  GL    +T N VGS VTAVNV N+ GLNTLGIS+VR+D
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        +   GINPPHTHPRATEIL V EGTLLVGFVSSNQD NRLFSKVLN+GDVFVFPEGL+HFQQNVG  NAVAIAGLSSQNPGVVTIAN+VFGS PDIPTDI
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        IAKAF  EAS+IA +Q KF
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XP_008439539.1 PREDICTED: putative germin-like protein 2-1 [Cucumis melo]5.4e-8172.35Show/hide
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        MA   F+  +FFAL CSIALASDPSPLQDFCVAD  NPV+VNGFVCKDP  V A DFF  GL  AG+T N VGSAVT  NV  I GLNTLGIS+VR+D+A
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        P GIN PHTHPRATEILTV EGTLLVGFV+SN + NRL +K LNKGDVFVFP GL+HFQQN+GYG AVAIA LSSQNPGV+TIAN+VFGS PDI T+I+A
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        KAF  ++++IA++Q KF
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XP_022926682.1 germin-like protein subfamily 1 member 7 [Cucurbita moschata]5.2e-8475.23Show/hide
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        MA K  +  + FA AC SIALASDPSPLQDFCVAD  NPV+VNGFVCKDP  VNANDFFA GLQ   +    VGSAV  VNV+N+ GLNTLGIS+VR+DF
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         PQGINPPHTHPRATEILT+ EGTLLVGFVSSNQD NRLFSKVL KGDVFVFPEG++HFQQNVGY NAVAIA LSSQN GV+TIAN+VFGS PDIP DI+
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        AKAF   A +IA +Q KF
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KM80 Germin-like protein2.3e-8575.45Show/hide
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        M +KNFV   + FA AC SI +ASDPSPLQDFCVAD+ NPV+VNGFVCK+P DV A DFF  GL   G+T N VGS VTA+NV N+ GLNTLGIS+VR+D
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        +   GIN PHTHPRATEIL V EGTLLVGFVSSNQD NRLFSKVLNKGDVFVFPEGL+HFQQNVG  NAVAIAGLSSQNPGVVTIAN+VFGS PDIPT I
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        IAKAF  EA++IA +Q KFP
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A0A1S3AZ03 Germin-like protein5.1e-8576.26Show/hide
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        M +KNFV   S FA AC SI +ASDPSPLQDFCVAD+ NPV+VNGFVCK+P +V A DFF  GL    +T N VGS VTAVNV N+ GLNTLGIS+VR+D
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        +   GINPPHTHPRATEIL V EGTLLVGFVSSNQD NRLFSKVLN+GDVFVFPEGL+HFQQNVG  NAVAIAGLSSQNPGVVTIAN+VFGS PDIPTDI
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        IAKAF  EAS+IA +Q KF
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A0A5A7UBA7 Germin-like protein2.6e-8172.35Show/hide
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        MA   F+  +FFAL CSIALASDPSPLQDFCVAD  NPV+VNGFVCKDP  V A DFF  GL  AG+T N VGSAVT  NV  I GLNTLGIS+VR+D+A
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        P GIN PHTHPRATEILTV EGTLLVGFV+SN + NRL +K LNKGDVFVFP GL+HFQQN+GYG AVAIA LSSQNPGV+TIAN+VFGS PDI T+I+A
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        KAF  ++++IA++Q KF
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A0A5D3CN74 Germin-like protein5.1e-8576.26Show/hide
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        M +KNFV   S FA AC SI +ASDPSPLQDFCVAD+ NPV+VNGFVCK+P +V A DFF  GL    +T N VGS VTAVNV N+ GLNTLGIS+VR+D
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        +   GINPPHTHPRATEIL V EGTLLVGFVSSNQD NRLFSKVLN+GDVFVFPEGL+HFQQNVG  NAVAIAGLSSQNPGVVTIAN+VFGS PDIPTDI
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        IAKAF  EAS+IA +Q KF
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A0A6J1EF23 Germin-like protein2.5e-8475.23Show/hide
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        MA K  +  + FA AC SIALASDPSPLQDFCVAD  NPV+VNGFVCKDP  VNANDFFA GLQ   +    VGSAV  VNV+N+ GLNTLGIS+VR+DF
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Query:  APQGINPPHTHPRATEILTVTEGTLLVGFVSSNQDNNRLFSKVLNKGDVFVFPEGLIHFQQNVGYGNAVAIAGLSSQNPGVVTIANSVFGSTPDIPTDII
         PQGINPPHTHPRATEILT+ EGTLLVGFVSSNQD NRLFSKVL KGDVFVFPEG++HFQQNVGY NAVAIA LSSQN GV+TIAN+VFGS PDIP DI+
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        AKAF   A +IA +Q KF
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
P92997 Germin-like protein subfamily 1 member 135.2e-7164.35Show/hide
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        K+ +  +  AL  S A A DPSPLQDFCVA  D+ N V VNG  CKDPK   A DFF  GL +AG+T N V S VT VNV+ I GLNT+GISLVR+D+AP
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         G NPPHTHPRATEIL + EGTL VGFVSSNQDNNRLF+KVL  GDVFVFP G+IHFQ N+G   AVA AGLSSQN GV+TIA++VFGSTP I  DI+A+
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        AF  + +++ DL+ KF
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Q9FIC9 Germin-like protein subfamily 1 member 154.0e-7166.05Show/hide
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        + +  +F+AL  +IA A DPSPLQDFCVA  D  N V VNG  CKDPK   A DFF+ GL +AG T N V S VT VNV+ I GLNTLGISLVR+D+AP 
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Query:  GINPPHTHPRATEILTVTEGTLLVGFVSSNQDNNRLFSKVLNKGDVFVFPEGLIHFQQNVGYGNAVAIAGLSSQNPGVVTIANSVFGSTPDIPTDIIAKA
        G NPPHTHPRATEIL + EGTL VGFVSSNQDNNRLF+KVLN GDVFVFP G+IHFQ N+G   AVA AGLSSQN GV+TIA++VFGSTP I  DI+A+A
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        F  + +V+ DL+ KF
Subjt:  FMAEASVIADLQGKF

Q9FID0 Germin-like protein subfamily 1 member 141.2e-7265.74Show/hide
Query:  KNFVFFSFFALACSIALASDPSPLQDFCVA--DIGNPVRVNGFVCKDPKDVNANDFFADGLQKAGNTMNFVGSAVTAVNVNNITGLNTLGISLVRVDFAP
        K+ +  +  AL  S A A+DPSPLQDFCVA  D+ N V VNG  CKDPK   A DFF  GL +AG T N V S VT VNV+ I GLNTLGISLVR+D+AP
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Query:  QGINPPHTHPRATEILTVTEGTLLVGFVSSNQDNNRLFSKVLNKGDVFVFPEGLIHFQQNVGYGNAVAIAGLSSQNPGVVTIANSVFGSTPDIPTDIIAK
         G NPPHTHPRATEIL + EGTL VGFVSSNQDNNRLF+KVLN GDVFVFP G+IHFQ N+G   AVA AGLSSQN GV+TIA++VFGSTP I  DI+A+
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Query:  AFMAEASVIADLQGKF
        AF  + +V+ DL+ KF
Subjt:  AFMAEASVIADLQGKF

Q9LEA7 Germin-like protein subfamily 1 member 86.8e-7164.45Show/hide
Query:  SFFALACSIALASDPSPLQDFCVADIGNP---VRVNGFVCKDPKDVNANDFFADGLQKAGNTMNFVGSAVTAVNVNNITGLNTLGISLVRVDFAPQGINP
        S FAL   + +ASDPSPLQDFCV  +  P   V VNG  CKDP+ V A+DFF   L + GNT N VGS VT VNVNN+ GLNTLGISLVR+D+AP G NP
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Query:  PHTHPRATEILTVTEGTLLVGFVSSNQDNNRLFSKVLNKGDVFVFPEGLIHFQQNVGYGNAVAIAGLSSQNPGVVTIANSVFGSTPDIPTDIIAKAFMAE
        PHTHPRATEIL V +GTLLVGF+SSNQD NRLF+K LN GDVFVFPEGLIHFQ N+G   AVAIA LSSQN GV+TIAN++FGS PD+  +++A+AF  +
Subjt:  PHTHPRATEILTVTEGTLLVGFVSSNQDNNRLFSKVLNKGDVFVFPEGLIHFQQNVGYGNAVAIAGLSSQNPGVVTIANSVFGSTPDIPTDIIAKAFMAE

Query:  ASVIADLQGKF
         + + +LQ +F
Subjt:  ASVIADLQGKF

Q9SFF9 Germin-like protein subfamily 1 member 76.2e-7267.94Show/hide
Query:  ALACSIALASDPSPLQDFCVA-DIGNPVRVNGFVCKDPKDVNANDFFADGLQKAGNTMNFVGSAVTAVNVNNITGLNTLGISLVRVDFAPQGINPPHTHP
        ALA S     DPSPLQDFCVA D  + V VNG  CKDPK V A DFF  GL  AGNT+N VGS VT VNV+ I GLNTLG+SLVR+DFAP G NPPHTHP
Subjt:  ALACSIALASDPSPLQDFCVA-DIGNPVRVNGFVCKDPKDVNANDFFADGLQKAGNTMNFVGSAVTAVNVNNITGLNTLGISLVRVDFAPQGINPPHTHP

Query:  RATEILTVTEGTLLVGFVSSNQDNNRLFSKVLNKGDVFVFPEGLIHFQQNVGYGNAVAIAGLSSQNPGVVTIANSVFGSTPDIPTDIIAKAFMAEASVIA
        RATEIL V EGTLLVGFV+SNQDNNRLFSKVL  GDVFVFP G+IHFQ NVG  NAVA AGL SQNPG +TIA++VFGS P I  +I+AKAF  + +V+ 
Subjt:  RATEILTVTEGTLLVGFVSSNQDNNRLFSKVLNKGDVFVFPEGLIHFQQNVGYGNAVAIAGLSSQNPGVVTIANSVFGSTPDIPTDIIAKAFMAEASVIA

Query:  DLQGKFPPN
         L+ +F  N
Subjt:  DLQGKFPPN

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G05950.1 RmlC-like cupins superfamily protein4.4e-7367.94Show/hide
Query:  ALACSIALASDPSPLQDFCVA-DIGNPVRVNGFVCKDPKDVNANDFFADGLQKAGNTMNFVGSAVTAVNVNNITGLNTLGISLVRVDFAPQGINPPHTHP
        ALA S     DPSPLQDFCVA D  + V VNG  CKDPK V A DFF  GL  AGNT+N VGS VT VNV+ I GLNTLG+SLVR+DFAP G NPPHTHP
Subjt:  ALACSIALASDPSPLQDFCVA-DIGNPVRVNGFVCKDPKDVNANDFFADGLQKAGNTMNFVGSAVTAVNVNNITGLNTLGISLVRVDFAPQGINPPHTHP

Query:  RATEILTVTEGTLLVGFVSSNQDNNRLFSKVLNKGDVFVFPEGLIHFQQNVGYGNAVAIAGLSSQNPGVVTIANSVFGSTPDIPTDIIAKAFMAEASVIA
        RATEIL V EGTLLVGFV+SNQDNNRLFSKVL  GDVFVFP G+IHFQ NVG  NAVA AGL SQNPG +TIA++VFGS P I  +I+AKAF  + +V+ 
Subjt:  RATEILTVTEGTLLVGFVSSNQDNNRLFSKVLNKGDVFVFPEGLIHFQQNVGYGNAVAIAGLSSQNPGVVTIANSVFGSTPDIPTDIIAKAFMAEASVIA

Query:  DLQGKFPPN
         L+ +F  N
Subjt:  DLQGKFPPN

AT4G14630.1 germin-like protein 94.9e-7264.45Show/hide
Query:  SFFALACSIALASDPSPLQDFCVADIGNP---VRVNGFVCKDPKDVNANDFFADGLQKAGNTMNFVGSAVTAVNVNNITGLNTLGISLVRVDFAPQGINP
        S FAL   + +ASDPSPLQDFCV  +  P   V VNG  CKDP+ V A+DFF   L + GNT N VGS VT VNVNN+ GLNTLGISLVR+D+AP G NP
Subjt:  SFFALACSIALASDPSPLQDFCVADIGNP---VRVNGFVCKDPKDVNANDFFADGLQKAGNTMNFVGSAVTAVNVNNITGLNTLGISLVRVDFAPQGINP

Query:  PHTHPRATEILTVTEGTLLVGFVSSNQDNNRLFSKVLNKGDVFVFPEGLIHFQQNVGYGNAVAIAGLSSQNPGVVTIANSVFGSTPDIPTDIIAKAFMAE
        PHTHPRATEIL V +GTLLVGF+SSNQD NRLF+K LN GDVFVFPEGLIHFQ N+G   AVAIA LSSQN GV+TIAN++FGS PD+  +++A+AF  +
Subjt:  PHTHPRATEILTVTEGTLLVGFVSSNQDNNRLFSKVLNKGDVFVFPEGLIHFQQNVGYGNAVAIAGLSSQNPGVVTIANSVFGSTPDIPTDIIAKAFMAE

Query:  ASVIADLQGKF
         + + +LQ +F
Subjt:  ASVIADLQGKF

AT5G39110.1 RmlC-like cupins superfamily protein8.8e-7465.74Show/hide
Query:  KNFVFFSFFALACSIALASDPSPLQDFCVA--DIGNPVRVNGFVCKDPKDVNANDFFADGLQKAGNTMNFVGSAVTAVNVNNITGLNTLGISLVRVDFAP
        K+ +  +  AL  S A A+DPSPLQDFCVA  D+ N V VNG  CKDPK   A DFF  GL +AG T N V S VT VNV+ I GLNTLGISLVR+D+AP
Subjt:  KNFVFFSFFALACSIALASDPSPLQDFCVA--DIGNPVRVNGFVCKDPKDVNANDFFADGLQKAGNTMNFVGSAVTAVNVNNITGLNTLGISLVRVDFAP

Query:  QGINPPHTHPRATEILTVTEGTLLVGFVSSNQDNNRLFSKVLNKGDVFVFPEGLIHFQQNVGYGNAVAIAGLSSQNPGVVTIANSVFGSTPDIPTDIIAK
         G NPPHTHPRATEIL + EGTL VGFVSSNQDNNRLF+KVLN GDVFVFP G+IHFQ N+G   AVA AGLSSQN GV+TIA++VFGSTP I  DI+A+
Subjt:  QGINPPHTHPRATEILTVTEGTLLVGFVSSNQDNNRLFSKVLNKGDVFVFPEGLIHFQQNVGYGNAVAIAGLSSQNPGVVTIANSVFGSTPDIPTDIIAK

Query:  AFMAEASVIADLQGKF
        AF  + +V+ DL+ KF
Subjt:  AFMAEASVIADLQGKF

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        + +  +F+AL  +IA A DPSPLQDFCVA  D  N V VNG  CKDPK   A DFF+ GL +AG T N V S VT VNV+ I GLNTLGISLVR+D+AP 
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        G NPPHTHPRATEIL + EGTL VGFVSSNQDNNRLF+KVLN GDVFVFP G+IHFQ N+G   AVA AGLSSQN GV+TIA++VFGSTP I  DI+A+A
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        F  + +V+ DL+ KF
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AT5G39150.1 RmlC-like cupins superfamily protein6.3e-7268.47Show/hide
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        +IA A DPSPLQDFCVA  D  N V VNG  CKDPK   A DFF+ GL +AG T N V S VT VNV+ I GLNTLGISLVR+D+AP G NPPHTHPRAT
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        EIL + EGTL VGFVSSNQDNNRLF+KVLN GDVFVFP G+IHFQ N+G   AVA AGLSSQN GV+TIA++VFGSTP I  DI+A+AF  + +V+ DL+
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         KF
Subjt:  GKF


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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TCCTGTGAGGGTGAATGGTTTTGTTTGCAAGGACCCAAAGGATGTGAATGCAAACGATTTCTTTGCTGATGGGTTGCAAAAGGCAGGGAACACAATGAACTTTGTAGGCT
CCGCTGTGACAGCAGTGAACGTCAACAACATAACTGGACTCAACACTCTAGGCATCTCTTTGGTCCGTGTAGATTTCGCCCCGCAGGGCATCAACCCACCCCACACGCAC
CCACGCGCCACCGAGATCTTGACCGTCACAGAAGGAACCCTCCTGGTCGGTTTTGTGTCGTCCAACCAAGACAACAACCGCCTCTTCTCGAAGGTCCTTAACAAAGGCGA
CGTGTTTGTTTTCCCTGAGGGGTTGATCCATTTCCAGCAGAACGTTGGGTACGGGAATGCAGTCGCCATTGCAGGGCTTAGCAGCCAAAACCCAGGCGTTGTCACAATTG
CGAATTCTGTGTTCGGGTCGACACCAGACATCCCGACTGATATTATAGCAAAGGCTTTCATGGCCGAGGCCTCCGTCATCGCTGACCTTCAAGGCAAGTTCCCACCAAAC
TAA
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TAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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