; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Sed0021463 (gene) of Chayote v1 genome

Gene IDSed0021463
OrganismSechium edule (Chayote v1)
DescriptionType-2 metallothionein
Genome locationLG04:26694396..26695489
RNA-Seq ExpressionSed0021463
SyntenySed0021463
Gene Ontology termsGO:0046872 - metal ion binding (molecular function)
InterPro domainsIPR000347 - Metallothionein, family 15, plant


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
BAD26571.1 type-2 metallothionein [Citrullus lanatus]2.5e-2880Show/hide
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KAG6596409.1 Metallothionein-like protein type 2, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]3.3e-2880Show/hide
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WP_197429621.1 hypothetical protein, partial [Myroides odoratus]5.6e-2878.75Show/hide
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XP_022949247.1 metallothionein-like protein type 2 [Cucurbita moschata]5.6e-2880Show/hide
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XP_038906044.1 metallothionein-like protein type 2 [Benincasa hispida]2.1e-2778.75Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A6J1F8X2 metallothionein-like protein type 2 B1.7e-2777.5Show/hide
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A0A6J1GBI9 metallothionein-like protein type 22.7e-2880Show/hide
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A0A6J1I8Z4 metallothionein-like protein type 22.7e-2880Show/hide
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A0A6J1J2S1 metallothionein-like protein type 2 B8.7e-2776.25Show/hide
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Q6I674 Type-2 metallothionein1.2e-2880Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
P30564 Metallothionein-like protein type 22.0e-2059.52Show/hide
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P94029 Metallothionein-like protein 2A3.1e-2157.14Show/hide
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Q19LA2 Metallothionein type 2b9.9e-2057.47Show/hide
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Q39459 Metallothionein-like protein 29.9e-2057.83Show/hide
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Q41657 Metallothionein-like protein type 27.6e-2058.02Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G09390.1 metallothionein 2A2.7e-2054.22Show/hide
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AT5G02380.1 metallothionein 2B3.6e-1749.4Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTCGTGCTGTGGTGGAAACTGTGGGTGCGGCTCCGCCTGCCAGTGCGGAAGCGGCTGTGGAGGATGCAAGATGTTCCCTGATGAGATCAACTTCTCAGCTGACTCCAC
CGCTGCCATCCACACCTTCCTTCTCGGTCTTGCTCCTCACAACATGATATCCTTTGAGGTTGCAGAGATGGGAGCCGAGAGCGGCTGCAAATGTGGCGACAATTGCACCT
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mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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