; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Sed0021621 (gene) of Chayote v1 genome

Gene IDSed0021621
OrganismSechium edule (Chayote v1)
Descriptiongamma carbonic anhydrase-like 2, mitochondrial
Genome locationLG12:34620611..34624171
RNA-Seq ExpressionSed0021621
SyntenySed0021621
Gene Ontology termsGO:0016746 - transferase activity, transferring acyl groups (molecular function)
InterPro domainsIPR001451 - Hexapeptide repeat
IPR011004 - Trimeric LpxA-like superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6587404.1 Gamma carbonic anhydrase-like 2, mitochondrial, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]5.1e-12593.85Show/hide
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KAG7021390.1 Gamma carbonic anhydrase-like 2, mitochondrial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]3.9e-12594.26Show/hide
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XP_008464419.1 PREDICTED: gamma carbonic anhydrase-like 2, mitochondrial [Cucumis melo]7.4e-12493.44Show/hide
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XP_022933267.1 gamma carbonic anhydrase-like 2, mitochondrial [Cucurbita moschata]9.7e-12493.44Show/hide
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XP_023531879.1 gamma carbonic anhydrase-like 2, mitochondrial [Cucurbita pepo subsp. pepo]4.4e-12493.44Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3CLK0 gamma carbonic anhydrase-like 2, mitochondrial3.6e-12493.44Show/hide
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A0A5D3BH64 Gamma carbonic anhydrase-like 23.6e-12493.44Show/hide
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A0A6J1EZA5 gamma carbonic anhydrase-like 2, mitochondrial4.7e-12493.44Show/hide
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A0A6J1JI10 gamma carbonic anhydrase-like 2, mitochondrial1.8e-12392.21Show/hide
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A0A6J1L3J3 gamma carbonic anhydrase-like 2, mitochondrial1.8e-12393.03Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q94AU7 Gamma carbonic anhydrase 3, mitochondrial5.3e-3238.8Show/hide
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Q9C6B3 Gamma carbonic anhydrase 2, mitochondrial3.4e-3138.79Show/hide
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        P +  D +VAP+  + G V++  G+S+W G VLRGD+N I++G  +N+Q+  ++H A ++ +G    T I   VT+G  +++  CT+E +  +G  + L+
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        +G +VE H+++ AGS+V    RIPSGE+W GNPA+ +RKLT +E + I + A    +L++ H SE
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Q9FMV1 Gamma carbonic anhydrase-like 1, mitochondrial8.0e-10576.28Show/hide
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        R +R LT++ETLEI KLAVAIN LS ++FSEFLPYST YLEVEKFKKSLGI +
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Q9FWR5 Gamma carbonic anhydrase 1, mitochondrial1.2e-3139.34Show/hide
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        P +  +A+VAP+  + G V +  G+S+W G VLRGD+N +++G  +N+Q+  ++H A S+ +G    T I   VTIG  ++L  CT+E E  IG  + L+
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        +G +VE H ++ AG++V    RIPSGE+W GNPAR +RKLT +E   I + A   ++L++ H +E    +   L V +F+K L
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Q9SMN1 Gamma carbonic anhydrase-like 2, mitochondrial8.6e-10775.89Show/hide
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        +LAR S+ +I SA ++  +RR F+ E               ++PSPDRV WDYRGQRQIIPLGQWLPK+AVDAYVAPNVVLAGQV V DG+SVW G+VLR
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        R +R LT++ETLEI KLAVAIN LS ++FSEFLPYST YLEVEKFKKSLGI I
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G19580.1 gamma carbonic anhydrase 18.4e-3339.34Show/hide
Query:  PKIAVDAYVAPNVVLAGQVKVCDGASVWAGSVLRGDLNKITLGFCSNVQERCVIHAAWSSPTGLPAETSIERFVTIGAYSLLRSCTIEPECIIGQHSILM
        P +  +A+VAP+  + G V +  G+S+W G VLRGD+N +++G  +N+Q+  ++H A S+ +G    T I   VTIG  ++L  CT+E E  IG  + L+
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        +G +VE H ++ AG++V    RIPSGE+W GNPAR +RKLT +E   I + A   ++L++ H +E    +   L V +F+K L
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AT3G48680.1 gamma carbonic anhydrase-like 26.1e-10875.89Show/hide
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        +LAR S+ +I SA ++  +RR F+ E               ++PSPDRV WDYRGQRQIIPLGQWLPK+AVDAYVAPNVVLAGQV V DG+SVW G+VLR
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        R +R LT++ETLEI KLAVAIN LS ++FSEFLPYST YLEVEKFKKSLGI I
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AT5G63510.1 gamma carbonic anhydrase like 15.7e-10676.28Show/hide
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        ++AR SR  + S      +RR F+        TE+ K   T+SPS DRV WDYRGQRQIIPLGQWLPK+AVDAYVAPNVVLAGQV V DG+SVW G+VLR
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Query:  GDLNKITLGFCSNVQERCVIHAAWSSPTGLPAETSIERFVTIGAYSLLRSCTIEPECIIGQHSILMEGSLVETHSILEAGSVVPPGRRIPSGELWAGNPA
        GDLNKIT+GFCSNVQERCV+HAAWSSPTGLPA T I+R+VT+GAYSLLRSCTIEPECIIGQHSILMEGSLVET SILEAGSVVPPGRRIPSGELW GNPA
Subjt:  GDLNKITLGFCSNVQERCVIHAAWSSPTGLPAETSIERFVTIGAYSLLRSCTIEPECIIGQHSILMEGSLVETHSILEAGSVVPPGRRIPSGELWAGNPA

Query:  RLVRKLTSDETLEIRKLAVAINDLSKEHFSEFLPYSTAYLEVEKFKKSLGITI
        R +R LT++ETLEI KLAVAIN LS ++FSEFLPYST YLEVEKFKKSLGI +
Subjt:  RLVRKLTSDETLEIRKLAVAINDLSKEHFSEFLPYSTAYLEVEKFKKSLGITI

AT5G63510.2 gamma carbonic anhydrase like 11.2e-10068.57Show/hide
Query:  ALARFSRNAIASAAATTQLRRAFS--------TEVSK---TISPSPDRVNWDYRGQRQIIPLGQWLPKIAVDAYVAPNVVLAGQVKVCDGASVWAGSVLR
        ++AR SR  + S      +RR F+        TE+ K   T+SPS DRV WDYRGQRQIIPLGQWLPK+AVDAYVAPNVVLAGQV V DG+SVW G+VLR
Subjt:  ALARFSRNAIASAAATTQLRRAFS--------TEVSK---TISPSPDRVNWDYRGQRQIIPLGQWLPKIAVDAYVAPNVVLAGQVKVCDGASVWAGSVLR

Query:  GDLNKITLGFCSNVQERCVIHAAWSSPT---------------------------GLPAETSIERFVTIGAYSLLRSCTIEPECIIGQHSILMEGSLVET
        GDLNKIT+GFCSNVQERCV+HAAWSSPT                            LPA T I+R+VT+GAYSLLRSCTIEPECIIGQHSILMEGSLVET
Subjt:  GDLNKITLGFCSNVQERCVIHAAWSSPT---------------------------GLPAETSIERFVTIGAYSLLRSCTIEPECIIGQHSILMEGSLVET

Query:  HSILEAGSVVPPGRRIPSGELWAGNPARLVRKLTSDETLEIRKLAVAINDLSKEHFSEFLPYSTAYLEVEKFKKSLGITI
         SILEAGSVVPPGRRIPSGELW GNPAR +R LT++ETLEI KLAVAIN LS ++FSEFLPYST YLEVEKFKKSLGI +
Subjt:  HSILEAGSVVPPGRRIPSGELWAGNPARLVRKLTSDETLEIRKLAVAINDLSKEHFSEFLPYSTAYLEVEKFKKSLGITI

AT5G66510.1 gamma carbonic anhydrase 33.8e-3338.8Show/hide
Query:  PKIAVDAYVAPNVVLAGQVKVCDGASVWAGSVLRGDLNKITLGFCSNVQERCVIHAAWSSPTGLPAETSIERFVTIGAYSLLRSCTIEPECIIGQHSILM
        P +   A+VAPN  L+G V V  G+S+W G VLRGD N I++G  +N+Q+  ++H A ++ +G    T I   VTIG  ++L  CT+E E  IG  + ++
Subjt:  PKIAVDAYVAPNVVLAGQVKVCDGASVWAGSVLRGDLNKITLGFCSNVQERCVIHAAWSSPTGLPAETSIERFVTIGAYSLLRSCTIEPECIIGQHSILM

Query:  EGSLVETHSILEAGSVVPPGRRIPSGELWAGNPARLVRKLTSDETLEIRKLAVAINDLSKEHFSEFLPYSTAYLEVEKFKKSL
        +G+ VE H+++ +G++V    RIPSGE+W GNPA+ +RK+T +E +     AV  ++L++ H +E    +   L+  +FKK L
Subjt:  EGSLVETHSILEAGSVVPPGRRIPSGELWAGNPARLVRKLTSDETLEIRKLAVAINDLSKEHFSEFLPYSTAYLEVEKFKKSL


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCAGCTCTGGCTCGCTTTTCCAGGAACGCAATTGCCTCTGCGGCTGCGACTACCCAACTCCGCCGTGCTTTCTCGACGGAAGTTTCGAAGACGATCTCCCCCTCACC
GGATCGTGTCAATTGGGACTATCGAGGTCAAAGGCAGATAATCCCGCTCGGCCAGTGGCTCCCCAAAATCGCCGTCGACGCCTATGTTGCGCCCAATGTTGTCCTCGCCG
GGCAGGTCAAGGTCTGCGACGGGGCCTCCGTTTGGGCTGGCTCCGTTCTCCGCGGCGATCTCAACAAGATCACCCTTGGCTTTTGCTCCAATGTTCAGGAACGCTGCGTC
ATCCATGCTGCTTGGTCCTCCCCAACAGGTCTGCCAGCAGAGACATCCATAGAGAGATTTGTGACTATTGGCGCTTATAGTCTGTTGCGGTCTTGCACCATTGAGCCGGA
GTGCATAATTGGGCAGCACTCTATCCTCATGGAAGGTTCCCTGGTTGAGACCCACTCCATTCTCGAAGCTGGGTCTGTAGTTCCTCCAGGAAGGAGAATTCCAAGTGGAG
AACTCTGGGCAGGAAACCCAGCAAGGCTTGTCAGAAAGCTGACCAGCGATGAGACCTTGGAAATTCGTAAACTTGCTGTTGCAATTAATGACCTGAGCAAGGAACATTTC
TCCGAGTTTCTTCCTTACTCCACAGCATATTTGGAGGTCGAGAAATTCAAGAAGTCGTTGGGTATAACCATATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATATGATTACCCATCTTCGGCCCATTATAAAAAAAAGCAAAGGCAGGTGATAGCTGAATCGCCCTCTCCGACTTGTCACCGCTGAATCACAGACCACGCTCGCGCTTGTG
GCGTTAGAAATGGCAGCTCTGGCTCGCTTTTCCAGGAACGCAATTGCCTCTGCGGCTGCGACTACCCAACTCCGCCGTGCTTTCTCGACGGAAGTTTCGAAGACGATCTC
CCCCTCACCGGATCGTGTCAATTGGGACTATCGAGGTCAAAGGCAGATAATCCCGCTCGGCCAGTGGCTCCCCAAAATCGCCGTCGACGCCTATGTTGCGCCCAATGTTG
TCCTCGCCGGGCAGGTCAAGGTCTGCGACGGGGCCTCCGTTTGGGCTGGCTCCGTTCTCCGCGGCGATCTCAACAAGATCACCCTTGGCTTTTGCTCCAATGTTCAGGAA
CGCTGCGTCATCCATGCTGCTTGGTCCTCCCCAACAGGTCTGCCAGCAGAGACATCCATAGAGAGATTTGTGACTATTGGCGCTTATAGTCTGTTGCGGTCTTGCACCAT
TGAGCCGGAGTGCATAATTGGGCAGCACTCTATCCTCATGGAAGGTTCCCTGGTTGAGACCCACTCCATTCTCGAAGCTGGGTCTGTAGTTCCTCCAGGAAGGAGAATTC
CAAGTGGAGAACTCTGGGCAGGAAACCCAGCAAGGCTTGTCAGAAAGCTGACCAGCGATGAGACCTTGGAAATTCGTAAACTTGCTGTTGCAATTAATGACCTGAGCAAG
GAACATTTCTCCGAGTTTCTTCCTTACTCCACAGCATATTTGGAGGTCGAGAAATTCAAGAAGTCGTTGGGTATAACCATATGATAACCCGTCTTCTCATCTTTGCATTT
TGTTCGTTGAGGAAAATAAATACCTCCAAATCATAAACCAACTTTCAGGTTCCTTAGTTACATGTTGATTTTGCAGGCATCAGACATGGGATCAGATTTAAGATGAATGT
TTATGTTTATTTTGTTGCTCGGATTCGTTTTGGATGGTTAAAATCCACAGATTTTAATCTCCGGTTGTATGGTTTTACATGTAACATCTATATGTTTGTTCCCTATGATG
CATCTGGGTTTTAATTTTGCCTTTTCTCAGGTATTCTTCAAACTTGATTAAGAAAGTCTATAAATGTTTCAAGGAATGTGTGATGACTTTCCTTCCTTC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAALARFSRNAIASAAATTQLRRAFSTEVSKTISPSPDRVNWDYRGQRQIIPLGQWLPKIAVDAYVAPNVVLAGQVKVCDGASVWAGSVLRGDLNKITLGFCSNVQERCV
IHAAWSSPTGLPAETSIERFVTIGAYSLLRSCTIEPECIIGQHSILMEGSLVETHSILEAGSVVPPGRRIPSGELWAGNPARLVRKLTSDETLEIRKLAVAINDLSKEHF
SEFLPYSTAYLEVEKFKKSLGITI