CuGenDBv2

Gene ID	Sed0021639
Organism	Sechium edule (Chayote v1)
Description	transcription initiation factor TFIID subunit 15b
Genome location	LG01:8872501..8877494
RNA-Seq Expression	Sed0021639
Synteny	Sed0021639
Gene Ontology terms	GO:0006413 - translational initiation (biological process) GO:0003743 - translation initiation factor activity (molecular function) GO:0004497 - monooxygenase activity (molecular function) GO:0005506 - iron ion binding (molecular function) GO:0016705 - oxidoreductase activity, acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen (molecular function) GO:0020037 - heme binding (molecular function)
InterPro domains	NA

Homology

Show/hide homology

GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

XP_008457317.1 PREDICTED: transcription initiation factor TFIID subunit 15b isoform X1 [Cucumis melo]

6.4e-185

79.68

Show/hide

Query:  MSGMYEQGGDAAP-------------------YGGGG-----------GGYGGGGRGGGGGGGRGYGGR---GGGSYGGRGGGGG------GGGYQGGDR
        MSGMY+QGGDAAP                   YGGGG           GGYGGGGRGGGGGGGRGYGGR   GGG YGGRGGGGG      GGGYQGGDR
Subjt:  MSGMYEQGGDAAP-------------------YGGGG-----------GGYGGGGRGGGGGGGRGYGGR---GGGSYGGRGGGGG------GGGYQGGDR

Query:  GGRGGGRGGGGGGGRGGSGRDGDWVCPNPGCGNLNFARRSECNKCSTPAPGGASDR-SGGGGGYNRGGADGGYGGNRNGRGGSFHGGRSGTHDGGRNEGG
        GGRG GR  GGGGGRGGSGRDGDWVCPNPGCGNLNFARR ECNKC  P+PGGASDR  GGGGGYNRGG D GYGG+RNGRGGSFHGGRSGTHDGGRNEGG
Subjt:  GGRGGGRGGGGGGGRGGSGRDGDWVCPNPGCGNLNFARRSECNKCSTPAPGGASDR-SGGGGGYNRGGADGGYGGNRNGRGGSFHGGRSGTHDGGRNEGG

Query:  NRGGNSYGGHHGGEDSGYGQVPPSSAPQSGGIGGGSYPPSYHGVNADYGTDAVPPPTSYSGTTYPPTYGGPTGGYGGDSLGDG---GSRGGPSAGYDGGY
        +RGGNSYGGH GGEDSGYGQVPPSSAP SGG+  GSYPPSYHG +ADYGTDAVPPP SYSGTTYPPTYGGPTGGYGGDSLGDG     RGGPS GYDGGY
Subjt:  NRGGNSYGGHHGGEDSGYGQVPPSSAPQSGGIGGGSYPPSYHGVNADYGTDAVPPPTSYSGTTYPPTYGGPTGGYGGDSLGDG---GSRGGPSAGYDGGY

Query:  NAGGRGGGYNAGGRGGGGYNASGGRGGGGYNAGGGRGGGYGSTPAVDPAEVKQCDGNCDDSCDNSRIYVSNLPLDVTVDELKELFCGIGQIGRIKQKRGY
        NAGGR GGYNAGGR            GG YNA GGRGGGYGST A +PA+VKQCD NCDDSCDNSRIYVSNLP DVT+DEL+ELF GIGQIGRIKQKRGY
Subjt:  NAGGRGGGYNAGGRGGGGYNASGGRGGGGYNAGGGRGGGYGSTPAVDPAEVKQCDGNCDDSCDNSRIYVSNLPLDVTVDELKELFCGIGQIGRIKQKRGY

Query:  KDQWPWNIKIYTDDMGNNKGDACVSYEDPSAAHAAGSFYSDYDLRGHKINIAMAAKSAPRAPPTHNHGGGGRGGYGGGGGDRRRDSYRDGGSGPDRHQHG
        KDQWPWNIKIYTD+MGNNKGDACVSYEDPSAAH+AG FY++YDLRG+ IN+AMA KSAPRAPPT+NHGGGGRGGY GGGGDRRRDSYRDGGSGPDRHQHG
Subjt:  KDQWPWNIKIYTDDMGNNKGDACVSYEDPSAAHAAGSFYSDYDLRGHKINIAMAAKSAPRAPPTHNHGGGGRGGYGGGGGDRRRDSYRDGGSGPDRHQHG

Query:  GNRSRPY
        GNRSRPY
Subjt:  GNRSRPY

XP_016902120.1 PREDICTED: transcription initiation factor TFIID subunit 15b isoform X2 [Cucumis melo]

2.9e-185

84.07

Show/hide

Query:  MSGMYEQGGDAAP-YG--GGGGGYGGGGRG---GGGGGGRGYGGRGG-GSY--GGRGGGGGGGGYQGGDRGGRGGGRGGGGGGGRGGSGRDGDWVCPNPG
        MSGMY+QGGDAAP YG  GGGGGYGGGG G   GGGGGG GYGG+GG G Y  GGRGGGGGGGGYQGGDRGGRG GR  GGGGGRGGSGRDGDWVCPNPG
Subjt:  MSGMYEQGGDAAP-YG--GGGGGYGGGGRG---GGGGGGRGYGGRGG-GSY--GGRGGGGGGGGYQGGDRGGRGGGRGGGGGGGRGGSGRDGDWVCPNPG

Query:  CGNLNFARRSECNKCSTPAPGGASDR-SGGGGGYNRGGADGGYGGNRNGRGGSFHGGRSGTHDGGRNEGGNRGGNSYGGHHGGEDSGYGQVPPSSAPQSG
        CGNLNFARR ECNKC  P+PGGASDR  GGGGGYNRGG D GYGG+RNGRGGSFHGGRSGTHDGGRNEGG+RGGNSYGGH GGEDSGYGQVPPSSAP SG
Subjt:  CGNLNFARRSECNKCSTPAPGGASDR-SGGGGGYNRGGADGGYGGNRNGRGGSFHGGRSGTHDGGRNEGGNRGGNSYGGHHGGEDSGYGQVPPSSAPQSG

Query:  GIGGGSYPPSYHGVNADYGTDAVPPPTSYSGTTYPPTYGGPTGGYGGDSLGDG---GSRGGPSAGYDGGYNAGGRGGGYNAGGRGGGGYNASGGRGGGGY
        G+  GSYPPSYHG +ADYGTDAVPPP SYSGTTYPPTYGGPTGGYGGDSLGDG     RGGPS GYDGGYNAGGR GGYNAGGR            GG Y
Subjt:  GIGGGSYPPSYHGVNADYGTDAVPPPTSYSGTTYPPTYGGPTGGYGGDSLGDG---GSRGGPSAGYDGGYNAGGRGGGYNAGGRGGGGYNASGGRGGGGY

Query:  NAGGGRGGGYGSTPAVDPAEVKQCDGNCDDSCDNSRIYVSNLPLDVTVDELKELFCGIGQIGRIKQKRGYKDQWPWNIKIYTDDMGNNKGDACVSYEDPS
        NA GGRGGGYGST A +PA+VKQCD NCDDSCDNSRIYVSNLP DVT+DEL+ELF GIGQIGRIKQKRGYKDQWPWNIKIYTD+MGNNKGDACVSYEDPS
Subjt:  NAGGGRGGGYGSTPAVDPAEVKQCDGNCDDSCDNSRIYVSNLPLDVTVDELKELFCGIGQIGRIKQKRGYKDQWPWNIKIYTDDMGNNKGDACVSYEDPS

Query:  AAHAAGSFYSDYDLRGHKINIAMAAKSAPRAPPTHNHGGGGRGGYGGGGGDRRRDSYRDGGSGPDRHQHGGNRSRPY
        AAH+AG FY++YDLRG+ IN+AMA KSAPRAPPT+NHGGGGRGGY GGGGDRRRDSYRDGGSGPDRHQHGGNRSRPY
Subjt:  AAHAAGSFYSDYDLRGHKINIAMAAKSAPRAPPTHNHGGGGRGGYGGGGGDRRRDSYRDGGSGPDRHQHGGNRSRPY

XP_022948284.1 transcription initiation factor TFIID subunit 15b-like [Cucurbita moschata]

8.4e-185

81.25

Show/hide

Query:  MSGMYEQGGDAAP-----------------YGGGGGGYG--------GGGRGGGGGGGRGYGGR-GGGSYGGRGGGGGGGGYQGGDRGGRGGGRGGGGGG
        MSGMY+QGGDAAP                 YGGGGGGYG        GGG  GGGGGGRGYGGR GGG YGGR GGGGGGGYQGGDRGGRGGGR  GGGG
Subjt:  MSGMYEQGGDAAP-----------------YGGGGGGYG--------GGGRGGGGGGGRGYGGR-GGGSYGGRGGGGGGGGYQGGDRGGRGGGRGGGGGG

Query:  GRGGSGRDGDWVCPNPGCGNLNFARRSECNKCSTPAPGGASDRSGGG--GGYNRGGADGGYGGNRNGRGGSFHGGRSGTHDGGRNEGGNRGGNSYGGHHG
        GRGGSGRDGDWVCPNPGC N+NFARR ECNKC TP+PGGASDRSGGG  GGYNRGGADGGYGGNRNGRGGS+HGGRSG HDGGR EGGNRGGNSYGGH G
Subjt:  GRGGSGRDGDWVCPNPGCGNLNFARRSECNKCSTPAPGGASDRSGGG--GGYNRGGADGGYGGNRNGRGGSFHGGRSGTHDGGRNEGGNRGGNSYGGHHG

Query:  GEDSGYGQVPPSSAPQSGGIGGGSYPPSYHGVNADYGTDAVPPPTSYSGTTYPPTYGGPTGGYGGDSLGDGGS---RGGPSAGYDGGYNAGGRGGGYNAG
        GEDSGY QVPPSSAP SGG+ GGSYPPSY G +ADYGTDAVPPP SYSGTTYPPTYGGPTGGYG D +GDG S   RGGPSAGYDG YNAGG+GGGYNA 
Subjt:  GEDSGYGQVPPSSAPQSGGIGGGSYPPSYHGVNADYGTDAVPPPTSYSGTTYPPTYGGPTGGYGGDSLGDGGS---RGGPSAGYDGGYNAGGRGGGYNAG

Query:  GRGGGGYNASGGRGGGGYNAGGGRGGGYGSTPAVDPAEVKQCDGNCDDSCDNSRIYVSNLPLDVTVDELKELFCGIGQIGRIKQKRGYKDQWPWNIKIYT
                  GGRGGG YNAGGGRGGGYGSTPA +PA+VKQCD +CDDSCDNSRIYVSNLP DVT+DEL+ELF GIGQIGRIKQKRGYKDQWPWNIKIYT
Subjt:  GRGGGGYNASGGRGGGGYNAGGGRGGGYGSTPAVDPAEVKQCDGNCDDSCDNSRIYVSNLPLDVTVDELKELFCGIGQIGRIKQKRGYKDQWPWNIKIYT

Query:  DDMGNNKGDACVSYEDPSAAHAAGSFYSDYDLRGHKINIAMAAKSAPRAPPTHNHGGGGRGGY-GGGGGDRRRDSYRDGGSGPDRHQHGGNRSRPY
        D+MGNNKGDACVSYEDPSAAH+AG FY++YDLRGH IN+AMA KSAPRA PT+NHGGGGRGGY GGGGGDRRRDSYRDGGSGPDRHQHGGNRSRPY
Subjt:  DDMGNNKGDACVSYEDPSAAHAAGSFYSDYDLRGHKINIAMAAKSAPRAPPTHNHGGGGRGGY-GGGGGDRRRDSYRDGGSGPDRHQHGGNRSRPY

XP_022997960.1 transcription initiation factor TFIID subunit 15b [Cucurbita maxima]

9.0e-187

81.62

Show/hide

Query:  MSGMYEQGGDAAP------------YGGGG-----------GGYGGGGR--GGGGGGGRGYGGR-GGGSYGGRGGGGGGGGYQGGDRGGRGGGRGGGGGG
        MSGMY+QGGDAAP            YGGGG           GGYGGGGR  GGGGGGGRGYGGR GGG YGGR GGGGGGGYQGGDRGGRGGGR  GGGG
Subjt:  MSGMYEQGGDAAP------------YGGGG-----------GGYGGGGR--GGGGGGGRGYGGR-GGGSYGGRGGGGGGGGYQGGDRGGRGGGRGGGGGG

Query:  GRGGSGRDGDWVCPNPGCGNLNFARRSECNKCSTPAPGGASDRS--GGGGGYNRGGADGGYGGNRNGRGGSFHGGRSGTHDGGRNEGGNRGGNSYGGHHG
        GRGGSGRDGDWVCPNPGC N+NFARR ECNKC TP+PGGASDRS  GGGGGYNRGGADGGYGGNRNGRGGS+HGGRSG HDGGR EGGNRGGNSYGGH G
Subjt:  GRGGSGRDGDWVCPNPGCGNLNFARRSECNKCSTPAPGGASDRS--GGGGGYNRGGADGGYGGNRNGRGGSFHGGRSGTHDGGRNEGGNRGGNSYGGHHG

Query:  GEDSGYGQVPPSSAPQSGGIGGGSYPPSYHGVNADYGTDAVPPPTSYSGTTYPPTYGGPTGGYGGDSLGDGGS---RGGPSAGYDGGYNAGGRGGGYNAG
        GEDSGY QVPPSSAP SGG+ GGSYPPS+HG +A+YGTDAVPPP SYSG+TYPPTYGGPTGGYGGD +GDG S   RGGPSAGYDG YNAGG+GGGYNA 
Subjt:  GEDSGYGQVPPSSAPQSGGIGGGSYPPSYHGVNADYGTDAVPPPTSYSGTTYPPTYGGPTGGYGGDSLGDGGS---RGGPSAGYDGGYNAGGRGGGYNAG

Query:  GRGGGGYNASGGRGGGGYNAGGGRGGGYGSTPAVDPAEVKQCDGNCDDSCDNSRIYVSNLPLDVTVDELKELFCGIGQIGRIKQKRGYKDQWPWNIKIYT
                  GGRGGG YNAGGGRGGGYGSTPA +PA+VKQCD +CDDSCDNSRIYVSNLP DVT+DEL+ELF GIGQIGRIKQKRGYKDQWPWNIKIYT
Subjt:  GRGGGGYNASGGRGGGGYNAGGGRGGGYGSTPAVDPAEVKQCDGNCDDSCDNSRIYVSNLPLDVTVDELKELFCGIGQIGRIKQKRGYKDQWPWNIKIYT

Query:  DDMGNNKGDACVSYEDPSAAHAAGSFYSDYDLRGHKINIAMAAKSAPRAPPTHNHGGGGRGGYGGGGGDRRRDSYRDGGSGPDRHQHGGNRSRPY
        D+MGNNKGDACVSYEDPSAAH+AG FY++YDLRGH IN+AMA KSAPRA PT+NHGGGGRGGYGGGGGDRRRDSYRDGGSGPDRHQHGGNRSRPY
Subjt:  DDMGNNKGDACVSYEDPSAAHAAGSFYSDYDLRGHKINIAMAAKSAPRAPPTHNHGGGGRGGYGGGGGDRRRDSYRDGGSGPDRHQHGGNRSRPY

XP_023523000.1 transcription initiation factor TFIID subunit 15b-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]

1.5e-186

81.36

Show/hide

Query:  MSGMYEQGGDAAP-----------------YGGGG---------GGYGGGGR--GGGGGGGRGYGGR-GGGSYGGRGGGGGGGGYQGGDRGGRGGGRGGG
        MSGMY+QGGDAAP                 YGGGG         GGYGGGGR  GGGGGGGRGYGGR GGG YGGR GGGGGGGYQGGDRGGRGGGR  G
Subjt:  MSGMYEQGGDAAP-----------------YGGGG---------GGYGGGGR--GGGGGGGRGYGGR-GGGSYGGRGGGGGGGGYQGGDRGGRGGGRGGG

Query:  GGGGRGGSGRDGDWVCPNPGCGNLNFARRSECNKCSTPAPGGASDRS---GGGGGYNRGGADGGYGGNRNGRGGSFHGGRSGTHDGGRNEGGNRGGNSYG
        GGGGRGGSGRDGDWVCPNPGC N+NFARR ECNKC TP+PGGASDRS   GGGGGYNRGGADGGYGGNRNGRGGS+HGGRSG HDGGR EGGNRGGNSYG
Subjt:  GGGGRGGSGRDGDWVCPNPGCGNLNFARRSECNKCSTPAPGGASDRS---GGGGGYNRGGADGGYGGNRNGRGGSFHGGRSGTHDGGRNEGGNRGGNSYG

Query:  GHHGGEDSGYGQVPPSSAPQSGGIGGGSYPPSYHGVNADYGTDAVPPPTSYSGTTYPPTYGGPTGGYGGDSLGDGGS---RGGPSAGYDGGYNAGGRGGG
        GH GGEDSG+ QVPPSSAP SGG+ GGSYPPSY G +ADYGTDAVPPP SYSGTTYPPTYGGPTGGYGGD LGDG S   RGGPSAGYDG YNAGG+GGG
Subjt:  GHHGGEDSGYGQVPPSSAPQSGGIGGGSYPPSYHGVNADYGTDAVPPPTSYSGTTYPPTYGGPTGGYGGDSLGDGGS---RGGPSAGYDGGYNAGGRGGG

Query:  YNAGGRGGGGYNASGGRGGGGYNAGGGRGGGYGSTPAVDPAEVKQCDGNCDDSCDNSRIYVSNLPLDVTVDELKELFCGIGQIGRIKQKRGYKDQWPWNI
        YNA           GGRGGG YNAGGGRGGGYGSTPA +PA+VKQCD +CDDSCDNSRIYVSNLP DVT+DEL+ELF GIGQIGRIKQKRGYKDQWPWNI
Subjt:  YNAGGRGGGGYNASGGRGGGGYNAGGGRGGGYGSTPAVDPAEVKQCDGNCDDSCDNSRIYVSNLPLDVTVDELKELFCGIGQIGRIKQKRGYKDQWPWNI

Query:  KIYTDDMGNNKGDACVSYEDPSAAHAAGSFYSDYDLRGHKINIAMAAKSAPRAPPTHNHGGGGRGGYGGGGGDRRRDSYRDGGSGPDRHQHGGNRSRPY
        KIYTD+MGNNKGDACVSYEDPSAAH+AG FY++YDLRGH IN+AMA KSAPRA PT+NHGGGGRGGYGGGGGDRRRDSYRDGGSGPDRHQHGGNRSRPY
Subjt:  KIYTDDMGNNKGDACVSYEDPSAAHAAGSFYSDYDLRGHKINIAMAAKSAPRAPPTHNHGGGGRGGYGGGGGDRRRDSYRDGGSGPDRHQHGGNRSRPY

TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A1S3C4S9 transcription initiation factor TFIID subunit 15b isoform X1

3.1e-185

79.68

Show/hide

Query:  MSGMYEQGGDAAP-------------------YGGGG-----------GGYGGGGRGGGGGGGRGYGGR---GGGSYGGRGGGGG------GGGYQGGDR
        MSGMY+QGGDAAP                   YGGGG           GGYGGGGRGGGGGGGRGYGGR   GGG YGGRGGGGG      GGGYQGGDR
Subjt:  MSGMYEQGGDAAP-------------------YGGGG-----------GGYGGGGRGGGGGGGRGYGGR---GGGSYGGRGGGGG------GGGYQGGDR

Query:  GGRGGGRGGGGGGGRGGSGRDGDWVCPNPGCGNLNFARRSECNKCSTPAPGGASDR-SGGGGGYNRGGADGGYGGNRNGRGGSFHGGRSGTHDGGRNEGG
        GGRG GR  GGGGGRGGSGRDGDWVCPNPGCGNLNFARR ECNKC  P+PGGASDR  GGGGGYNRGG D GYGG+RNGRGGSFHGGRSGTHDGGRNEGG
Subjt:  GGRGGGRGGGGGGGRGGSGRDGDWVCPNPGCGNLNFARRSECNKCSTPAPGGASDR-SGGGGGYNRGGADGGYGGNRNGRGGSFHGGRSGTHDGGRNEGG

Query:  NRGGNSYGGHHGGEDSGYGQVPPSSAPQSGGIGGGSYPPSYHGVNADYGTDAVPPPTSYSGTTYPPTYGGPTGGYGGDSLGDG---GSRGGPSAGYDGGY
        +RGGNSYGGH GGEDSGYGQVPPSSAP SGG+  GSYPPSYHG +ADYGTDAVPPP SYSGTTYPPTYGGPTGGYGGDSLGDG     RGGPS GYDGGY
Subjt:  NRGGNSYGGHHGGEDSGYGQVPPSSAPQSGGIGGGSYPPSYHGVNADYGTDAVPPPTSYSGTTYPPTYGGPTGGYGGDSLGDG---GSRGGPSAGYDGGY

Query:  NAGGRGGGYNAGGRGGGGYNASGGRGGGGYNAGGGRGGGYGSTPAVDPAEVKQCDGNCDDSCDNSRIYVSNLPLDVTVDELKELFCGIGQIGRIKQKRGY
        NAGGR GGYNAGGR            GG YNA GGRGGGYGST A +PA+VKQCD NCDDSCDNSRIYVSNLP DVT+DEL+ELF GIGQIGRIKQKRGY
Subjt:  NAGGRGGGYNAGGRGGGGYNASGGRGGGGYNAGGGRGGGYGSTPAVDPAEVKQCDGNCDDSCDNSRIYVSNLPLDVTVDELKELFCGIGQIGRIKQKRGY

Query:  KDQWPWNIKIYTDDMGNNKGDACVSYEDPSAAHAAGSFYSDYDLRGHKINIAMAAKSAPRAPPTHNHGGGGRGGYGGGGGDRRRDSYRDGGSGPDRHQHG
        KDQWPWNIKIYTD+MGNNKGDACVSYEDPSAAH+AG FY++YDLRG+ IN+AMA KSAPRAPPT+NHGGGGRGGY GGGGDRRRDSYRDGGSGPDRHQHG
Subjt:  KDQWPWNIKIYTDDMGNNKGDACVSYEDPSAAHAAGSFYSDYDLRGHKINIAMAAKSAPRAPPTHNHGGGGRGGYGGGGGDRRRDSYRDGGSGPDRHQHG

Query:  GNRSRPY
        GNRSRPY
Subjt:  GNRSRPY

A0A1S4E1L8 transcription initiation factor TFIID subunit 15b isoform X3

3.4e-184

Show/hide

Query:  MSGMYEQGGDAAP-YG--GGGGGYGGGGRG---GGGGGGRGYGGRGG-GSYGGRGGGGGGGGYQGGDRGGRGGGRGGGGGGGRGGSGRDGDWVCPNPGCG
        MSGMY+QGGDAAP YG  GGGGGYGGGG G   GGGGGG GYGG+GG G YGG GG GGGGGYQGGDRGGRG GR  GGGGGRGGSGRDGDWVCPNPGCG
Subjt:  MSGMYEQGGDAAP-YG--GGGGGYGGGGRG---GGGGGGRGYGGRGG-GSYGGRGGGGGGGGYQGGDRGGRGGGRGGGGGGGRGGSGRDGDWVCPNPGCG

Query:  NLNFARRSECNKCSTPAPGGASDR-SGGGGGYNRGGADGGYGGNRNGRGGSFHGGRSGTHDGGRNEGGNRGGNSYGGHHGGEDSGYGQVPPSSAPQSGGI
        NLNFARR ECNKC  P+PGGASDR  GGGGGYNRGG D GYGG+RNGRGGSFHGGRSGTHDGGRNEGG+RGGNSYGGH GGEDSGYGQVPPSSAP SGG+
Subjt:  NLNFARRSECNKCSTPAPGGASDR-SGGGGGYNRGGADGGYGGNRNGRGGSFHGGRSGTHDGGRNEGGNRGGNSYGGHHGGEDSGYGQVPPSSAPQSGGI

Query:  GGGSYPPSYHGVNADYGTDAVPPPTSYSGTTYPPTYGGPTGGYGGDSLGDG---GSRGGPSAGYDGGYNAGGRGGGYNAGGRGGGGYNASGGRGGGGYNA
          GSYPPSYHG +ADYGTDAVPPP SYSGTTYPPTYGGPTGGYGGDSLGDG     RGGPS GYDGGYNAGGR GGYNAGGR            GG YNA
Subjt:  GGGSYPPSYHGVNADYGTDAVPPPTSYSGTTYPPTYGGPTGGYGGDSLGDG---GSRGGPSAGYDGGYNAGGRGGGYNAGGRGGGGYNASGGRGGGGYNA

Query:  GGGRGGGYGSTPAVDPAEVKQCDGNCDDSCDNSRIYVSNLPLDVTVDELKELFCGIGQIGRIKQKRGYKDQWPWNIKIYTDDMGNNKGDACVSYEDPSAA
         GGRGGGYGST A +PA+VKQCD NCDDSCDNSRIYVSNLP DVT+DEL+ELF GIGQIGRIKQKRGYKDQWPWNIKIYTD+MGNNKGDACVSYEDPSAA
Subjt:  GGGRGGGYGSTPAVDPAEVKQCDGNCDDSCDNSRIYVSNLPLDVTVDELKELFCGIGQIGRIKQKRGYKDQWPWNIKIYTDDMGNNKGDACVSYEDPSAA

Query:  HAAGSFYSDYDLRGHKINIAMAAKSAPRAPPTHNHGGGGRGGYGGGGGDRRRDSYRDGGSGPDRHQHGGNRSRPY
        H+AG FY++YDLRG+ IN+AMA KSAPRAPPT+NHGGGGRGGY GGGGDRRRDSYRDGGSGPDRHQHGGNRSRPY
Subjt:  HAAGSFYSDYDLRGHKINIAMAAKSAPRAPPTHNHGGGGRGGYGGGGGDRRRDSYRDGGSGPDRHQHGGNRSRPY

A0A1S4E2C0 transcription initiation factor TFIID subunit 15b isoform X2

1.4e-185

84.07

Show/hide

Query:  MSGMYEQGGDAAP-YG--GGGGGYGGGGRG---GGGGGGRGYGGRGG-GSY--GGRGGGGGGGGYQGGDRGGRGGGRGGGGGGGRGGSGRDGDWVCPNPG
        MSGMY+QGGDAAP YG  GGGGGYGGGG G   GGGGGG GYGG+GG G Y  GGRGGGGGGGGYQGGDRGGRG GR  GGGGGRGGSGRDGDWVCPNPG
Subjt:  MSGMYEQGGDAAP-YG--GGGGGYGGGGRG---GGGGGGRGYGGRGG-GSY--GGRGGGGGGGGYQGGDRGGRGGGRGGGGGGGRGGSGRDGDWVCPNPG

Query:  CGNLNFARRSECNKCSTPAPGGASDR-SGGGGGYNRGGADGGYGGNRNGRGGSFHGGRSGTHDGGRNEGGNRGGNSYGGHHGGEDSGYGQVPPSSAPQSG
        CGNLNFARR ECNKC  P+PGGASDR  GGGGGYNRGG D GYGG+RNGRGGSFHGGRSGTHDGGRNEGG+RGGNSYGGH GGEDSGYGQVPPSSAP SG
Subjt:  CGNLNFARRSECNKCSTPAPGGASDR-SGGGGGYNRGGADGGYGGNRNGRGGSFHGGRSGTHDGGRNEGGNRGGNSYGGHHGGEDSGYGQVPPSSAPQSG

Query:  GIGGGSYPPSYHGVNADYGTDAVPPPTSYSGTTYPPTYGGPTGGYGGDSLGDG---GSRGGPSAGYDGGYNAGGRGGGYNAGGRGGGGYNASGGRGGGGY
        G+  GSYPPSYHG +ADYGTDAVPPP SYSGTTYPPTYGGPTGGYGGDSLGDG     RGGPS GYDGGYNAGGR GGYNAGGR            GG Y
Subjt:  GIGGGSYPPSYHGVNADYGTDAVPPPTSYSGTTYPPTYGGPTGGYGGDSLGDG---GSRGGPSAGYDGGYNAGGRGGGYNAGGRGGGGYNASGGRGGGGY

Query:  NAGGGRGGGYGSTPAVDPAEVKQCDGNCDDSCDNSRIYVSNLPLDVTVDELKELFCGIGQIGRIKQKRGYKDQWPWNIKIYTDDMGNNKGDACVSYEDPS
        NA GGRGGGYGST A +PA+VKQCD NCDDSCDNSRIYVSNLP DVT+DEL+ELF GIGQIGRIKQKRGYKDQWPWNIKIYTD+MGNNKGDACVSYEDPS
Subjt:  NAGGGRGGGYGSTPAVDPAEVKQCDGNCDDSCDNSRIYVSNLPLDVTVDELKELFCGIGQIGRIKQKRGYKDQWPWNIKIYTDDMGNNKGDACVSYEDPS

Query:  AAHAAGSFYSDYDLRGHKINIAMAAKSAPRAPPTHNHGGGGRGGYGGGGGDRRRDSYRDGGSGPDRHQHGGNRSRPY
        AAH+AG FY++YDLRG+ IN+AMA KSAPRAPPT+NHGGGGRGGY GGGGDRRRDSYRDGGSGPDRHQHGGNRSRPY
Subjt:  AAHAAGSFYSDYDLRGHKINIAMAAKSAPRAPPTHNHGGGGRGGYGGGGGDRRRDSYRDGGSGPDRHQHGGNRSRPY

A0A6J1G9F8 transcription initiation factor TFIID subunit 15b-like

4.1e-185

81.25

Show/hide

Query:  MSGMYEQGGDAAP-----------------YGGGGGGYG--------GGGRGGGGGGGRGYGGR-GGGSYGGRGGGGGGGGYQGGDRGGRGGGRGGGGGG
        MSGMY+QGGDAAP                 YGGGGGGYG        GGG  GGGGGGRGYGGR GGG YGGR GGGGGGGYQGGDRGGRGGGR  GGGG
Subjt:  MSGMYEQGGDAAP-----------------YGGGGGGYG--------GGGRGGGGGGGRGYGGR-GGGSYGGRGGGGGGGGYQGGDRGGRGGGRGGGGGG

Query:  GRGGSGRDGDWVCPNPGCGNLNFARRSECNKCSTPAPGGASDRSGGG--GGYNRGGADGGYGGNRNGRGGSFHGGRSGTHDGGRNEGGNRGGNSYGGHHG
        GRGGSGRDGDWVCPNPGC N+NFARR ECNKC TP+PGGASDRSGGG  GGYNRGGADGGYGGNRNGRGGS+HGGRSG HDGGR EGGNRGGNSYGGH G
Subjt:  GRGGSGRDGDWVCPNPGCGNLNFARRSECNKCSTPAPGGASDRSGGG--GGYNRGGADGGYGGNRNGRGGSFHGGRSGTHDGGRNEGGNRGGNSYGGHHG

Query:  GEDSGYGQVPPSSAPQSGGIGGGSYPPSYHGVNADYGTDAVPPPTSYSGTTYPPTYGGPTGGYGGDSLGDGGS---RGGPSAGYDGGYNAGGRGGGYNAG
        GEDSGY QVPPSSAP SGG+ GGSYPPSY G +ADYGTDAVPPP SYSGTTYPPTYGGPTGGYG D +GDG S   RGGPSAGYDG YNAGG+GGGYNA 
Subjt:  GEDSGYGQVPPSSAPQSGGIGGGSYPPSYHGVNADYGTDAVPPPTSYSGTTYPPTYGGPTGGYGGDSLGDGGS---RGGPSAGYDGGYNAGGRGGGYNAG

Query:  GRGGGGYNASGGRGGGGYNAGGGRGGGYGSTPAVDPAEVKQCDGNCDDSCDNSRIYVSNLPLDVTVDELKELFCGIGQIGRIKQKRGYKDQWPWNIKIYT
                  GGRGGG YNAGGGRGGGYGSTPA +PA+VKQCD +CDDSCDNSRIYVSNLP DVT+DEL+ELF GIGQIGRIKQKRGYKDQWPWNIKIYT
Subjt:  GRGGGGYNASGGRGGGGYNAGGGRGGGYGSTPAVDPAEVKQCDGNCDDSCDNSRIYVSNLPLDVTVDELKELFCGIGQIGRIKQKRGYKDQWPWNIKIYT

Query:  DDMGNNKGDACVSYEDPSAAHAAGSFYSDYDLRGHKINIAMAAKSAPRAPPTHNHGGGGRGGY-GGGGGDRRRDSYRDGGSGPDRHQHGGNRSRPY
        D+MGNNKGDACVSYEDPSAAH+AG FY++YDLRGH IN+AMA KSAPRA PT+NHGGGGRGGY GGGGGDRRRDSYRDGGSGPDRHQHGGNRSRPY
Subjt:  DDMGNNKGDACVSYEDPSAAHAAGSFYSDYDLRGHKINIAMAAKSAPRAPPTHNHGGGGRGGY-GGGGGDRRRDSYRDGGSGPDRHQHGGNRSRPY

A0A6J1KBD1 transcription initiation factor TFIID subunit 15b

4.3e-187

81.62

Show/hide

Query:  MSGMYEQGGDAAP------------YGGGG-----------GGYGGGGR--GGGGGGGRGYGGR-GGGSYGGRGGGGGGGGYQGGDRGGRGGGRGGGGGG
        MSGMY+QGGDAAP            YGGGG           GGYGGGGR  GGGGGGGRGYGGR GGG YGGR GGGGGGGYQGGDRGGRGGGR  GGGG
Subjt:  MSGMYEQGGDAAP------------YGGGG-----------GGYGGGGR--GGGGGGGRGYGGR-GGGSYGGRGGGGGGGGYQGGDRGGRGGGRGGGGGG

Query:  GRGGSGRDGDWVCPNPGCGNLNFARRSECNKCSTPAPGGASDRS--GGGGGYNRGGADGGYGGNRNGRGGSFHGGRSGTHDGGRNEGGNRGGNSYGGHHG
        GRGGSGRDGDWVCPNPGC N+NFARR ECNKC TP+PGGASDRS  GGGGGYNRGGADGGYGGNRNGRGGS+HGGRSG HDGGR EGGNRGGNSYGGH G
Subjt:  GRGGSGRDGDWVCPNPGCGNLNFARRSECNKCSTPAPGGASDRS--GGGGGYNRGGADGGYGGNRNGRGGSFHGGRSGTHDGGRNEGGNRGGNSYGGHHG

Query:  GEDSGYGQVPPSSAPQSGGIGGGSYPPSYHGVNADYGTDAVPPPTSYSGTTYPPTYGGPTGGYGGDSLGDGGS---RGGPSAGYDGGYNAGGRGGGYNAG
        GEDSGY QVPPSSAP SGG+ GGSYPPS+HG +A+YGTDAVPPP SYSG+TYPPTYGGPTGGYGGD +GDG S   RGGPSAGYDG YNAGG+GGGYNA 
Subjt:  GEDSGYGQVPPSSAPQSGGIGGGSYPPSYHGVNADYGTDAVPPPTSYSGTTYPPTYGGPTGGYGGDSLGDGGS---RGGPSAGYDGGYNAGGRGGGYNAG

Query:  GRGGGGYNASGGRGGGGYNAGGGRGGGYGSTPAVDPAEVKQCDGNCDDSCDNSRIYVSNLPLDVTVDELKELFCGIGQIGRIKQKRGYKDQWPWNIKIYT
                  GGRGGG YNAGGGRGGGYGSTPA +PA+VKQCD +CDDSCDNSRIYVSNLP DVT+DEL+ELF GIGQIGRIKQKRGYKDQWPWNIKIYT
Subjt:  GRGGGGYNASGGRGGGGYNAGGGRGGGYGSTPAVDPAEVKQCDGNCDDSCDNSRIYVSNLPLDVTVDELKELFCGIGQIGRIKQKRGYKDQWPWNIKIYT

Query:  DDMGNNKGDACVSYEDPSAAHAAGSFYSDYDLRGHKINIAMAAKSAPRAPPTHNHGGGGRGGYGGGGGDRRRDSYRDGGSGPDRHQHGGNRSRPY
        D+MGNNKGDACVSYEDPSAAH+AG FY++YDLRGH IN+AMA KSAPRA PT+NHGGGGRGGYGGGGGDRRRDSYRDGGSGPDRHQHGGNRSRPY
Subjt:  DDMGNNKGDACVSYEDPSAAHAAGSFYSDYDLRGHKINIAMAAKSAPRAPPTHNHGGGGRGGYGGGGGDRRRDSYRDGGSGPDRHQHGGNRSRPY

SwissProt top hits

e value

%identity

Alignment

Q92804 TATA-binding protein-associated factor 2N

4.4e-11

46.69

Show/hide

Query:  RGGGGGGGGYQGGDRGGRGGGRGGGGGGGRGGSGRDGDWVCPNPGCGNLNFARRSECNKCSTPAP------GGASDRSGGGG--GY----NRGGADGGYG
        RGGG GGG      R GRGG RG GG  GRGG  + GDWVCPNP CGN+NFARR+ CN+C+ P P      GG     G GG  GY     RGG  GGYG
Subjt:  RGGGGGGGGYQGGDRGGRGGGRGGGGGGGRGGSGRDGDWVCPNPGCGNLNFARRSECNKCSTPAP------GGASDRSGGGG--GY----NRGGADGGYG

Query:  GNRNG--------RGGSFHGGRSGTHDGGRNEGGNRGGNSYGGHHGGEDSGYGQVPPSSAPQSGGIGGGSYPPSYHGVNADYGTDAVPPPTSYSGTTYPP
        G+R+G         GG + G RSG   GG   GG  GG+  GG+ G    GYG          G  GGG     Y G    YG D       Y G     
Subjt:  GNRNG--------RGGSFHGGRSGTHDGGRNEGGNRGGNSYGGHHGGEDSGYGQVPPSSAPQSGGIGGGSYPPSYHGVNADYGTDAVPPPTSYSGTTYPP

Query:  TYGGPTGGYGGDSLGDGGSRGGPSAGYDGGYNAGGRGGGYNAGGRGGGGYNASGGRGGGGYNAGGGRGGGYG
         YGG  GGYGGD  G GG RGG       G   G RGGG   GG   GGY   G R GGGY  GG RGGGYG
Subjt:  TYGGPTGGYGGDSLGDGGSRGGPSAGYDGGYNAGGRGGGYNAGGRGGGGYNASGGRGGGGYNAGGGRGGGYG

Q94KD0 Transcription initiation factor TFIID subunit 15b

9.6e-91

57.56

Show/hide

Query:  MSGMYEQ-GGDAAPYGG-GGGGYGGGGRGGGGGGGRGYGGR---GGGSYGGRGGGGGGGGYQGGDRGGRGGGRGGG--GGGGRGGSGRDGDWVCPNPGCG
        M+GMY Q GG  AP    GG GYGGG  GG GGG  GYGGR   GGGSYGGRGG GGGGG   G+RGG GGG  GG  GG G GG GRDGDW CPNP CG
Subjt:  MSGMYEQ-GGDAAPYGG-GGGGYGGGGRGGGGGGGRGYGGR---GGGSYGGRGGGGGGGGYQGGDRGGRGGGRGGG--GGGGRGGSGRDGDWVCPNPGCG

Query:  NLNFARRSECNKCSTPAPGGASDRSG--GGGGYNRGGADGGYGGNRNGRGGSFHGGRSGTHDGGRNEGGNRGGNSYGGHHGGEDSGYGQVPPSSAPQSGG
        N+NFARR ECNKC   AP G S  +   GGGGY+RGG D   GG R GR  S   GRS  ++  R +GG+R G SYG     E+  YGQ PP +A     
Subjt:  NLNFARRSECNKCSTPAPGGASDRSG--GGGGYNRGGADGGYGGNRNGRGGSFHGGRSGTHDGGRNEGGNRGGNSYGGHHGGEDSGYGQVPPSSAPQSGG

Query:  IGGGSYPPSYHGVNADYGTDAVPPPTSYSGTTYPPTYGGPTGGYGGDSLGDGGSRGGPSAGYDGGYNAGGRGGGYNAGGRGGGGYNASGGRGGGGYNAGG
         G GSYPP        YG +AVPPPTSYSG   PP+YGGP GGYG D+   GG RGG S GYDGG          +A  R    Y  +            
Subjt:  IGGGSYPPSYHGVNADYGTDAVPPPTSYSGTTYPPTYGGPTGGYGGDSLGDGGSRGGPSAGYDGGYNAGGRGGGYNAGGRGGGGYNASGGRGGGGYNAGG

Query:  GRGGGYGSTPAVDPAEVKQCDGNCDDSCDNSRIYVSNLPLDVTVDELKELFCGIGQIGRIKQKRGYKDQWPWNIKIYTDDMGNNKGDACVSYEDPSAAHA
                       +VKQCD +CDD+CDN+RIY+SNLP DVT DELK+LF GIGQ+GRIKQKRGYKDQWP+NIKIYTD+ GN KGDAC++YEDPSAAH+
Subjt:  GRGGGYGSTPAVDPAEVKQCDGNCDDSCDNSRIYVSNLPLDVTVDELKELFCGIGQIGRIKQKRGYKDQWPWNIKIYTDDMGNNKGDACVSYEDPSAAHA

Query:  AGSFYSDYDLRGHKINIAMAAKSAPRAPPTHNHG---GGGRGGYGGGGGDRRRDSYRDGGSGPDRHQHGGNRSRPY
        AG F+++Y++RG+KI++ MA KSAPRAP     G   GGG GGYGGGGGDRRRD+Y    SGPDR+ HGGNRSRPY
Subjt:  AGSFYSDYDLRGHKINIAMAAKSAPRAPPTHNHG---GGGRGGYGGGGGDRRRDSYRDGGSGPDRHQHGGNRSRPY

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT5G58470.1 TBP-associated factor 15B

6.8e-92

57.56

Show/hide

Query:  MSGMYEQ-GGDAAPYGG-GGGGYGGGGRGGGGGGGRGYGGR---GGGSYGGRGGGGGGGGYQGGDRGGRGGGRGGG--GGGGRGGSGRDGDWVCPNPGCG
        M+GMY Q GG  AP    GG GYGGG  GG GGG  GYGGR   GGGSYGGRGG GGGGG   G+RGG GGG  GG  GG G GG GRDGDW CPNP CG
Subjt:  MSGMYEQ-GGDAAPYGG-GGGGYGGGGRGGGGGGGRGYGGR---GGGSYGGRGGGGGGGGYQGGDRGGRGGGRGGG--GGGGRGGSGRDGDWVCPNPGCG

Query:  NLNFARRSECNKCSTPAPGGASDRSG--GGGGYNRGGADGGYGGNRNGRGGSFHGGRSGTHDGGRNEGGNRGGNSYGGHHGGEDSGYGQVPPSSAPQSGG
        N+NFARR ECNKC   AP G S  +   GGGGY+RGG D   GG R GR  S   GRS  ++  R +GG+R G SYG     E+  YGQ PP +A     
Subjt:  NLNFARRSECNKCSTPAPGGASDRSG--GGGGYNRGGADGGYGGNRNGRGGSFHGGRSGTHDGGRNEGGNRGGNSYGGHHGGEDSGYGQVPPSSAPQSGG

Query:  IGGGSYPPSYHGVNADYGTDAVPPPTSYSGTTYPPTYGGPTGGYGGDSLGDGGSRGGPSAGYDGGYNAGGRGGGYNAGGRGGGGYNASGGRGGGGYNAGG
         G GSYPP        YG +AVPPPTSYSG   PP+YGGP GGYG D+   GG RGG S GYDGG          +A  R    Y  +            
Subjt:  IGGGSYPPSYHGVNADYGTDAVPPPTSYSGTTYPPTYGGPTGGYGGDSLGDGGSRGGPSAGYDGGYNAGGRGGGYNAGGRGGGGYNASGGRGGGGYNAGG

Query:  GRGGGYGSTPAVDPAEVKQCDGNCDDSCDNSRIYVSNLPLDVTVDELKELFCGIGQIGRIKQKRGYKDQWPWNIKIYTDDMGNNKGDACVSYEDPSAAHA
                       +VKQCD +CDD+CDN+RIY+SNLP DVT DELK+LF GIGQ+GRIKQKRGYKDQWP+NIKIYTD+ GN KGDAC++YEDPSAAH+
Subjt:  GRGGGYGSTPAVDPAEVKQCDGNCDDSCDNSRIYVSNLPLDVTVDELKELFCGIGQIGRIKQKRGYKDQWPWNIKIYTDDMGNNKGDACVSYEDPSAAHA

Query:  AGSFYSDYDLRGHKINIAMAAKSAPRAPPTHNHG---GGGRGGYGGGGGDRRRDSYRDGGSGPDRHQHGGNRSRPY
        AG F+++Y++RG+KI++ MA KSAPRAP     G   GGG GGYGGGGGDRRRD+Y    SGPDR+ HGGNRSRPY
Subjt:  AGSFYSDYDLRGHKINIAMAAKSAPRAPPTHNHG---GGGRGGYGGGGGDRRRDSYRDGGSGPDRHQHGGNRSRPY

AT5G58470.2 TBP-associated factor 15B

6.8e-92

57.56

Show/hide

Query:  MSGMYEQ-GGDAAPYGG-GGGGYGGGGRGGGGGGGRGYGGR---GGGSYGGRGGGGGGGGYQGGDRGGRGGGRGGG--GGGGRGGSGRDGDWVCPNPGCG
        M+GMY Q GG  AP    GG GYGGG  GG GGG  GYGGR   GGGSYGGRGG GGGGG   G+RGG GGG  GG  GG G GG GRDGDW CPNP CG
Subjt:  MSGMYEQ-GGDAAPYGG-GGGGYGGGGRGGGGGGGRGYGGR---GGGSYGGRGGGGGGGGYQGGDRGGRGGGRGGG--GGGGRGGSGRDGDWVCPNPGCG

Query:  NLNFARRSECNKCSTPAPGGASDRSG--GGGGYNRGGADGGYGGNRNGRGGSFHGGRSGTHDGGRNEGGNRGGNSYGGHHGGEDSGYGQVPPSSAPQSGG
        N+NFARR ECNKC   AP G S  +   GGGGY+RGG D   GG R GR  S   GRS  ++  R +GG+R G SYG     E+  YGQ PP +A     
Subjt:  NLNFARRSECNKCSTPAPGGASDRSG--GGGGYNRGGADGGYGGNRNGRGGSFHGGRSGTHDGGRNEGGNRGGNSYGGHHGGEDSGYGQVPPSSAPQSGG

Query:  IGGGSYPPSYHGVNADYGTDAVPPPTSYSGTTYPPTYGGPTGGYGGDSLGDGGSRGGPSAGYDGGYNAGGRGGGYNAGGRGGGGYNASGGRGGGGYNAGG
         G GSYPP        YG +AVPPPTSYSG   PP+YGGP GGYG D+   GG RGG S GYDGG          +A  R    Y  +            
Subjt:  IGGGSYPPSYHGVNADYGTDAVPPPTSYSGTTYPPTYGGPTGGYGGDSLGDGGSRGGPSAGYDGGYNAGGRGGGYNAGGRGGGGYNASGGRGGGGYNAGG

Query:  GRGGGYGSTPAVDPAEVKQCDGNCDDSCDNSRIYVSNLPLDVTVDELKELFCGIGQIGRIKQKRGYKDQWPWNIKIYTDDMGNNKGDACVSYEDPSAAHA
                       +VKQCD +CDD+CDN+RIY+SNLP DVT DELK+LF GIGQ+GRIKQKRGYKDQWP+NIKIYTD+ GN KGDAC++YEDPSAAH+
Subjt:  GRGGGYGSTPAVDPAEVKQCDGNCDDSCDNSRIYVSNLPLDVTVDELKELFCGIGQIGRIKQKRGYKDQWPWNIKIYTDDMGNNKGDACVSYEDPSAAHA

Query:  AGSFYSDYDLRGHKINIAMAAKSAPRAPPTHNHG---GGGRGGYGGGGGDRRRDSYRDGGSGPDRHQHGGNRSRPY
        AG F+++Y++RG+KI++ MA KSAPRAP     G   GGG GGYGGGGGDRRRD+Y    SGPDR+ HGGNRSRPY
Subjt:  AGSFYSDYDLRGHKINIAMAAKSAPRAPPTHNHG---GGGRGGYGGGGGDRRRDSYRDGGSGPDRHQHGGNRSRPY

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGTCTGGTATGTACGAGCAAGGAGGAGACGCTGCTCCTTATGGCGGCGGTGGAGGTGGTTATGGCGGCGGAGGCCGAGGCGGCGGCGGCGGTGGTGGTAGAGGTTATGG
AGGACGAGGCGGCGGAAGCTACGGTGGCCGAGGAGGCGGCGGTGGCGGTGGTGGTTATCAAGGAGGAGATCGTGGAGGGCGAGGTGGTGGGCGTGGCGGCGGGGGTGGAG
GTGGTCGTGGCGGAAGCGGTAGAGATGGAGATTGGGTCTGCCCTAATCCTGGCTGTGGGAATTTGAACTTTGCTAGAAGGTCGGAGTGTAACAAGTGCAGTACACCAGCA
CCGGGGGGTGCTAGCGATCGAAGTGGGGGCGGTGGTGGTTATAATAGAGGTGGAGCTGATGGGGGCTATGGTGGTAATCGTAATGGCAGAGGTGGTAGTTTCCATGGTGG
TCGAAGTGGAACTCATGATGGAGGACGGAATGAAGGAGGAAACAGAGGTGGTAATTCTTATGGTGGTCATCATGGAGGGGAAGATAGCGGGTATGGTCAGGTTCCCCCAT
CATCAGCACCTCAGTCTGGTGGTATTGGTGGTGGCTCTTATCCACCATCGTACCATGGCGTAAATGCAGATTATGGAACAGATGCAGTTCCTCCACCTACAAGCTACAGT
GGAACTACATACCCTCCGACTTATGGTGGTCCCACTGGTGGCTATGGTGGTGATAGTCTAGGTGATGGGGGGAGTCGTGGTGGACCATCAGCTGGATATGATGGTGGCTA
TAATGCGGGTGGTAGGGGTGGTGGCTATAATGCGGGTGGAAGAGGAGGAGGAGGCTATAATGCCAGTGGTGGTAGAGGAGGAGGAGGCTATAATGCCGGCGGGGGTAGAG
GGGGTGGTTACGGAAGTACACCTGCAGTAGACCCAGCAGAGGTGAAACAGTGCGATGGAAATTGTGATGATTCGTGTGATAACTCAAGAATCTATGTCTCTAATTTGCCA
CTAGATGTGACCGTTGATGAATTGAAAGAACTATTTTGTGGCATTGGTCAAATTGGAAGAATCAAGCAGAAGAGGGGTTACAAGGATCAGTGGCCTTGGAACATAAAAAT
ATATACCGATGATATGGGAAATAACAAAGGCGATGCATGTGTATCATATGAAGATCCCTCAGCGGCACATGCTGCTGGCAGTTTCTATAGTGATTATGATTTGAGAGGCC
ATAAGATTAATATTGCAATGGCTGCCAAGTCTGCACCGAGGGCTCCACCTACACACAACCATGGTGGCGGTGGTAGGGGTGGATATGGAGGTGGTGGTGGAGATAGGCGT
AGAGATAGCTATAGGGACGGAGGCTCTGGACCCGACAGACATCAACATGGTGGAAATCGTTCTCGTCCTTACTGA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

AAATGATTCAGCCCTAAATCCCAATCCATCTTCCTTCTCTCTCTCTCTCTCGCTCTTTCGAGTTAGCCCTAAAAAGAGCCTAATGTCTGGTATGTACGAGCAAGGAGGAG
ACGCTGCTCCTTATGGCGGCGGTGGAGGTGGTTATGGCGGCGGAGGCCGAGGCGGCGGCGGCGGTGGTGGTAGAGGTTATGGAGGACGAGGCGGCGGAAGCTACGGTGGC
CGAGGAGGCGGCGGTGGCGGTGGTGGTTATCAAGGAGGAGATCGTGGAGGGCGAGGTGGTGGGCGTGGCGGCGGGGGTGGAGGTGGTCGTGGCGGAAGCGGTAGAGATGG
AGATTGGGTCTGCCCTAATCCTGGCTGTGGGAATTTGAACTTTGCTAGAAGGTCGGAGTGTAACAAGTGCAGTACACCAGCACCGGGGGGTGCTAGCGATCGAAGTGGGG
GCGGTGGTGGTTATAATAGAGGTGGAGCTGATGGGGGCTATGGTGGTAATCGTAATGGCAGAGGTGGTAGTTTCCATGGTGGTCGAAGTGGAACTCATGATGGAGGACGG
AATGAAGGAGGAAACAGAGGTGGTAATTCTTATGGTGGTCATCATGGAGGGGAAGATAGCGGGTATGGTCAGGTTCCCCCATCATCAGCACCTCAGTCTGGTGGTATTGG
TGGTGGCTCTTATCCACCATCGTACCATGGCGTAAATGCAGATTATGGAACAGATGCAGTTCCTCCACCTACAAGCTACAGTGGAACTACATACCCTCCGACTTATGGTG
GTCCCACTGGTGGCTATGGTGGTGATAGTCTAGGTGATGGGGGGAGTCGTGGTGGACCATCAGCTGGATATGATGGTGGCTATAATGCGGGTGGTAGGGGTGGTGGCTAT
AATGCGGGTGGAAGAGGAGGAGGAGGCTATAATGCCAGTGGTGGTAGAGGAGGAGGAGGCTATAATGCCGGCGGGGGTAGAGGGGGTGGTTACGGAAGTACACCTGCAGT
AGACCCAGCAGAGGTGAAACAGTGCGATGGAAATTGTGATGATTCGTGTGATAACTCAAGAATCTATGTCTCTAATTTGCCACTAGATGTGACCGTTGATGAATTGAAAG
AACTATTTTGTGGCATTGGTCAAATTGGAAGAATCAAGCAGAAGAGGGGTTACAAGGATCAGTGGCCTTGGAACATAAAAATATATACCGATGATATGGGAAATAACAAA
GGCGATGCATGTGTATCATATGAAGATCCCTCAGCGGCACATGCTGCTGGCAGTTTCTATAGTGATTATGATTTGAGAGGCCATAAGATTAATATTGCAATGGCTGCCAA
GTCTGCACCGAGGGCTCCACCTACACACAACCATGGTGGCGGTGGTAGGGGTGGATATGGAGGTGGTGGTGGAGATAGGCGTAGAGATAGCTATAGGGACGGAGGCTCTG
GACCCGACAGACATCAACATGGTGGAAATCGTTCTCGTCCTTACTGAGAAACTCAACATTGAGCATTTTATGTAATGGAAATTGTGATCTTTGTGTTTTAGTTTTGTTCC
ATGGCTGGATTCTTGAATTGGAGACCAAAGAGAGGCAGACGGATAATCTCCAAACTGCTTGTTGCTAAAGTAGATGTTGATGTTTTCAGACGTAGGTCTTTAAGGCAAAC
TAAGTTGATGAAGTGTGATGCCCTGCTGCTTCCTTATCTCTTCTGCACATTCGGTCGCTAGTCGTTAGTCGGTATATAATCTTTTTGGGGGCTCTGTGCTGAAACATTTG
TCAGCATTAACCTTGAAAATTTGTGGTTCGAGTCGGAATTTGCTATTCGAAAACGAGACTGTAACTTGTTCAAATTTCTTCTTCTTTTAAGGCTTTTTTTTGGGGTTGTG
TAAAACTATCACGAGATATATGAATTAATTTTTATTTTTTTAAGAAA

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MSGMYEQGGDAAPYGGGGGGYGGGGRGGGGGGGRGYGGRGGGSYGGRGGGGGGGGYQGGDRGGRGGGRGGGGGGGRGGSGRDGDWVCPNPGCGNLNFARRSECNKCSTPA
PGGASDRSGGGGGYNRGGADGGYGGNRNGRGGSFHGGRSGTHDGGRNEGGNRGGNSYGGHHGGEDSGYGQVPPSSAPQSGGIGGGSYPPSYHGVNADYGTDAVPPPTSYS
GTTYPPTYGGPTGGYGGDSLGDGGSRGGPSAGYDGGYNAGGRGGGYNAGGRGGGGYNASGGRGGGGYNAGGGRGGGYGSTPAVDPAEVKQCDGNCDDSCDNSRIYVSNLP
LDVTVDELKELFCGIGQIGRIKQKRGYKDQWPWNIKIYTDDMGNNKGDACVSYEDPSAAHAAGSFYSDYDLRGHKINIAMAAKSAPRAPPTHNHGGGGRGGYGGGGGDRR
RDSYRDGGSGPDRHQHGGNRSRPY

Sed0021639 (gene) of Chayote v1 genome