; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Sed0021780 (gene) of Chayote v1 genome

Gene IDSed0021780
OrganismSechium edule (Chayote v1)
DescriptionInterleukin-2 receptor subunit beta like
Genome locationLG08:30612813..30613639
RNA-Seq ExpressionSed0021780
SyntenySed0021780
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6586352.1 hypothetical protein SDJN03_19085, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]3.7e-4967.28Show/hide
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XP_022938304.1 uncharacterized protein LOC111444439 [Cucurbita moschata]1.3e-4967.9Show/hide
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XP_022965990.1 uncharacterized protein LOC111465710 [Cucurbita maxima]6.3e-4967.9Show/hide
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XP_023536962.1 uncharacterized protein LOC111798189 [Cucurbita pepo subsp. pepo]2.2e-4967.9Show/hide
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XP_038890730.1 homeobox protein MOX-2 [Benincasa hispida]2.9e-4669.33Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LL60 Uncharacterized protein1.2e-4265.66Show/hide
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A0A1S3CDF1 uncharacterized protein LOC1034996071.7e-4466.67Show/hide
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A0A5D3BFQ4 Uncharacterized protein1.7e-4466.67Show/hide
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A0A6J1FDP2 uncharacterized protein LOC1114444396.2e-5067.9Show/hide
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A0A6J1HQB7 uncharacterized protein LOC1114657103.1e-4967.9Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G01430.1 BEST Arabidopsis thaliana protein match is: NHL domain-containing protein (TAIR:AT5G14890.1)8.3e-0757.14Show/hide
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        SS    FRYD LSYSLNFD+G   GH  D FP R++S R  A
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AT5G11070.1 unknown protein1.0e-0442.86Show/hide
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        H   HS S   DF YDPLSY+LNF+   D   A D     NF++RLP SP   T +   ++I+
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AT5G14890.1 NHL domain-containing protein7.1e-0643.55Show/hide
Query:  FISRLGRH--------GRRHSSASADFRYDPLSYSLNFDEGYDEGHAGDAFPLRNFSSRLPA
        FI R GR+        G  +      FRYD  SYSLNFD+G   GH  D FP R++S R  A
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AT5G35090.1 unknown protein5.4e-1437.5Show/hide
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        SL++KLKS  C++GC      +HH+             + S+      G  T+S    R  S+S E   +        +  +G HG+     +ADF YDP
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Query:  LSYSLNFDEGYDEGHAGDAFPLRNFSSRLPASPPKA
         SY+LNFD+G DE    D FPLRNFS+RLP SPP +
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AT5G62865.1 unknown protein3.0e-0439.42Show/hide
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        SNH      S D GD      R+S   R+ S     P  KT     FI R  R  RR     AS  F+YDPLSYSLNFD+  +E        LR+FS+R 
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Query:  PASP
         + P
Subjt:  PASP


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGACAAAACTACCCTCAAGGCCAGTGCCCTTGTACGCATCATTTGTAGCCCTATCATTTTGCCATTCACAAGCCGGAATATATAAAGCCGCTCTAACCGCACCATCATT
ATTATTCGGTTTTGAGAAATCATCAATGGACGATGGCAAAGAACACAGAGGAAATTCCTCGCCGTCGTCGTCTCTGAAGGAGAAGCTCAAATCCACTCTCTGTCTTTCCG
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AGATCTCGCGAGAGTCCGGACGCTAAGACCGATTGGCGTCCGCATTTCATCTCCCGCCTCGGCCGCCATGGACGCCGTCACTCCTCTGCCTCCGCCGATTTCCGTTACGA
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CCACATCCAATACACAGAGGGAGATGATCGCGGCGTTTAGCTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGACAAAACTACCCTCAAGGCCAGTGCCCTTGTACGCATCATTTGTAGCCCTATCATTTTGCCATTCACAAGCCGGAATATATAAAGCCGCTCTAACCGCACCATCATT
ATTATTCGGTTTTGAGAAATCATCAATGGACGATGGCAAAGAACACAGAGGAAATTCCTCGCCGTCGTCGTCTCTGAAGGAGAAGCTCAAATCCACTCTCTGTCTTTCCG
GCTGCCTCTTCATGCACCGGAGTAACCACCACGAACTCCGGCAGAGTTCCTCCGACGTCGGCGATGCCACCGGACGCCTCACCCGAAGCTCCTCCGCCAGGGACAAATCC
AGATCTCGCGAGAGTCCGGACGCTAAGACCGATTGGCGTCCGCATTTCATCTCCCGCCTCGGCCGCCATGGACGCCGTCACTCCTCTGCCTCCGCCGATTTCCGTTACGA
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CCACATCCAATACACAGAGGGAGATGATCGCGGCGTTTAGCTAATTTTCATCGAATTCCAGGTTTAATTGTCGTCCGATTGTTGAGCGGAAGCGATCCAAAGGTAAATTT
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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RSRESPDAKTDWRPHFISRLGRHGRRHSSASADFRYDPLSYSLNFDEGYDEGHAGDAFPLRNFSSRLPASPPKATSNTQREMIAAFS